| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 2765420 = | 153 (0.900) | 3 (0.020) | 3/378 | 14.2 | 2.4% | intergenic (‑267/+93) | yfjL/yfjM | CP4‑57 putative defective prophage, DUF4297/DUF1837 polymorphic toxin family protein/CP4‑57 prophage; uncharacterized protein |
| ? | NC_000913 | = 2765411 | 124 (0.900) | intergenic (‑258/+102) | yfjL/yfjM | CP4‑57 putative defective prophage, DUF4297/DUF1837 polymorphic toxin family protein/CP4‑57 prophage; uncharacterized protein | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 156 total aligned reads displayed.
TTGCGAAAATTAAGGAGATGTTATGACACAGTCCAATCGGATCACTGCATCATCACCAGTGATCTAAATACTTCACAGCCATTCTCGGTCGCAGGTATCAAGCTTTTCAGGATTCCACAAATATTGTAACCCTGACGTCTAATTTGGTTATATAACATACTGCCCCAACTAACGTAAGGTAGGCACAGCCTTAATCAAGGTTTTGGTTTTCAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACCGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGCGATTGTAATCACACTTGATATTATAAAACACAGTTGCACGCATTATTTCCTGGTTGGTAGGGTCATATCTCGATGCTCTTTGAGCAATGTCAACATCGCGTGTTCATGGCTTTCTATATTGTTGATGCCTTGCCCATCCGGACCCCACTCCTTATAGCTCATCATGATGGCTTGTTTTGGGCTCTCTGCTCGT > NC_000913/2765173‑2765663 | tGCGAAAATTAAGGAGATGTTATGACACAGTCCAATCGGATCACTGCATCATCACCAGTGATCTAAATACTTCACAGCCATTCTCGGTCGCCGGTGTCAAACTTTTCAGGATTCCACACACCTTGTAACCCTGACGTCTAATTTGGTTATATAACATACTGCCCCAACTAACGTAAGATAGGCACAGCCGTAATCAAGGTTTGGGTTTTCAAATAGTTCAGACCTGAAAACACCAACCgcactatggcact > 2:660906/1‑251 (MQ=255) tGCGAAAATTAAGGAGATGTTATGACACAGTCCAATCGGATCACTGCATCATCACCAGTGATCTAAATACTTCACAGCCATTCTCGGTCGCAGGTATCAAGCTTTTCAGGATTAAAAAAATATTGTAACCCTGACGTCTAATTTGGTTTTATAACATACTGCCCCAACTAACGTAAGGTAGGCACAGACTTAATAAAGGGTTTGGATTTTAAATAGTTCAGAGCTGAGCACCCCAATCgcccaatggcctg > 2:206779/1‑248 (MQ=255) gCGAAAATTAAGGAGATGTTATGACACAGTCCAATCGGATCACTGCATCATCACCAGTGATCTAAATACTTCACAGCCATTCTCGGTCGCAGGTATCAAGCTTTTCAGGATTCCACAAATATTGTAACCCTGACGTCTAATTTGGTTATATAACATACTGCCCCAACTAACGTAAGGTAGGCACAGCCTTAATCAAGGTTTTGGTTTTCAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACCgcactatggcacta < 2:412981/251‑1 (MQ=255) gCGAAAATTAAGGAGATGTTATGACACAGTCCAATCGGATCACTGCATCATCACCAGTGATCTAAATACTTCACAGCCATTCTCGGTCGCAGGTATCAAGCTTTTCAGGATTCCACAAATATTGTAACCCTGACGTCTAATTTGGTAATATAACATACTGCCCCAACTAACGTAAGGTAGGCACAGCCTTAATCAAGGTTTTGGTTTTCAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACCgcactatggcacta < 1:35080/251‑1 (MQ=255) cGAAAATTAAGGAGATGTTATGACACAGTCCAATCGGATCACTGCATCATCACCAGTGATCTAAATACTTCACAGCCATTCTCGGTCGCAGGCATCAAGCTTTTCAGGATTCCACAACTATTGTAACCCTGACGTCTAATCTGGTTATATAACATACTGCCCCAACTAACGTAAGGTAGGCTCAGCCTTAATCAAGGTCTTGGTTTTCAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCACCCgcactatggcaccat > 2:968125/1‑251 (MQ=255) aaaTTAAGGAGATGTTGTGACACAGTCCAATCGGATCACTCCATCATAACCATTGTTCTAAATACTTCACATCCATTCTCGGTCGCAGTTATCAAGCTTTTCAGGTTTCCACAAATCTTTTAACCCTGACGTCTAATTTGGTTATATAACATGCTGCCCCCACTAACGAAAGGTAGGCACAGCCTTAATCAAGGTTTTGGTTTTCAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACCgaactatggcactatggg < 2:1077608/251‑2 (MQ=255) aTTAAGGAGATGTTATGACACAGTCCAATCGGATCACTGCATCATCACCAGTGATCTAAATACTTCACAGCCATTCTCGGTCGCAGGTATCAAGCTTTTCAGGATTCCACAAATATTGTAACCCTGACGTCTAATTTGGTTATATAACATACTGCCCCAACGAACGAAAGGTAGGCACAGCCTTAATCAAGGTTTTGGTTTTCAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACCgcactatggcactatggcac < 1:709980/251‑1 (MQ=255) 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aTCACTGCATCATCACCAGTGATCTAAATACTTCACAGCCATTCTCGGTCGCAGGTATCAAGCTTTTCAGGATTCCACAAATATTGTAACCCTGACGTCTAATTTGGTTATATAACATACTGCCCCAACTAACGTAAGGTAGGCACAGCCTTAATCAAGGTTTTGGTTTTCAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACCGCACtatggcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcac > 1:118762/1‑251 (MQ=255) cTGCATCATCACCAGTGATCTAAATACTTCACAGCCATTCTCGGTGGCAGGTATCAAGCTTTTCAGGAATCAAAAAATATTGTAACCCTGACGTCTAATTTGGTTATATAAAATACTTCCCCAACTAACGTAAGGTAGGCACATTCTTAATTAAGTCATTGGTTGTCAAAAAGTTCAGAGCTGAAACCGCAAACCgaaccatggcactatggcaccatagcattatggcattatgcctctatgcaaccccc > 2:543095/1‑243 (MQ=255) cTGCATCATCACCAGTGATCTAAATACTTCACAGCCATTCTCGGTCGCAGGTATCAAGCTTTTCAGGATTCCACAAATATTGTAACCCTGACGTCTAATTTGGTTATATAACATACTGCCCCAACTAACGTAAGGTAGGCACAGCCTTAATCAAGGTTTTGGTTTTCAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACCGCACTATGGCACTATGGCCCTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGcc > 2:1787548/1‑251 (MQ=255) cTGCATCATCACCAGTGATCTAAATACTTCACAGCCATTCTCGGTCGCAGGCATCAAGCTTTTCAGGATTACACAAATATTGTAACCCTGACGTCTAATTTGGTTATATAACATACTGCCCCAACTAACGTAAGGTAGGCACAGCCTTTATAGAGGCTTTGGTTTTCAAATAGTTCAGAGCTGAGACTGCCAACCGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTCTGGCACTATGGCACTATGGCACcccc > 2:482774/1‑251 (MQ=255) tGCATCATCACCAGTGATCTAAATACTTCACAGCCAGTCTCGGTCGCAGGTAGCAAGCTTTTCAGGATTCCACAAATATTGTAACCCTGACGTCTAATTTGGTTATATAACATACTGCCCCAACTACCGTAAGGTAGGCACAGCCTTAATCAAGGTTTTGGTTTTCAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACCGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCa < 1:754498/251‑1 (MQ=255) catcatCACCAGTGATCTAAATACTTCCCAGCCATTCTCGTTCGCAGGTATCAAGCTTTTCAGGATTCCACAAATATTGTAACCCTGACGTCTAATTTGGTTATATAACATACTGCCCCAACTAACGTAAGGTAGGCACAGCCTTAATCAAGGTTTTGGTTTTCAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACCGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGc < 1:970680/251‑1 (MQ=255) 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1:1472428/1‑251 (MQ=255) | TTGCGAAAATTAAGGAGATGTTATGACACAGTCCAATCGGATCACTGCATCATCACCAGTGATCTAAATACTTCACAGCCATTCTCGGTCGCAGGTATCAAGCTTTTCAGGATTCCACAAATATTGTAACCCTGACGTCTAATTTGGTTATATAACATACTGCCCCAACTAACGTAAGGTAGGCACAGCCTTAATCAAGGTTTTGGTTTTCAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACCGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGCGATTGTAATCACACTTGATATTATAAAACACAGTTGCACGCATTATTTCCTGGTTGGTAGGGTCATATCTCGATGCTCTTTGAGCAATGTCAACATCGCGTGTTCATGGCTTTCTATATTGTTGATGCCTTGCCCATCCGGACCCCACTCCTTATAGCTCATCATGATGGCTTGTTTTGGGCTCTCTGCTCGT > NC_000913/2765173‑2765663 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |