Predicted mutation | ||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 3,854,297 | 0 | G | A | 99.4% | 552.1 / NA | 163 | E126K (GAA→AAA) | emrD | multidrug efflux system protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/1); new base A (79/82); total (79/84) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
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Only 100 of 167 total aligned reads displayed.
GGGCGGTGCAGAGCGTAATGGGCGCTTATCTGCTGACTTACGGTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGTGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGTCGGAATGTCCATTTTTATGCTGGCAACGCTGGTCGCGGTCACGACCTCCAGTTTGACGGTGTTGATTGCCGCCAGCGCGATGCAGGGGATGGGCACCGGCGTTGGCGGCGTAATGGCGCGTACTTTACCGCGAGATTTATATGAACGGA‑CACAGTTGCGCCATGCTAACAGCCTGTTAAACATGGGGATTCTCGTCAGTCCGTTGCTCGCACCGCTAATCGGCGGTCTGCTGGATACGATGTGGAACTGGCGCGCCTGTTATCTCTTTTTGTTGGTTCTTTGTGCTGGTGTGACCTTCAGTATGGCCCGCTGGATGCCGGAAACGCGTCCGGTCGATGCACCGCGCACGCGCCTGCTTACCAGTTATAAAACGCTTTTCGGTAACAGCGG > NC_000913/3854049‑3854544 | ggtcGGTGCAGAGCGTAATGGGCGCTTTTCTGCTTACTTACGGTGTCTCACAGCTGTTTTCTGGCCCGATTTCCGACCGCGTGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGGCGGAATGTCCATTTGTATGCTGGCAACGCTGGTCGCGGTCACGACCTCCAGTTTGACGGTGTTGATTGCCGCCAGCGCGATGCAGGGGATGGGCACCGGCGTTGGCGGCGTAATGGCGCGTACTTTACCGCGAGATTTATATaaa < 2:435343/248‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |