| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 4295832 = | NA (NA) | 14 (0.170) | 3/396 | 8.8 | NA | intergenic (+38/+604) | gltP/yjcO | glutamate/aspartate:proton symporter/Sel1 family TPR‑like repeat protein |
| ? | NC_000913 | = 4296394 | NA (NA) | noncoding (560/600 nt) | RIP321 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 11 REP sequences and 4 IHF sites | RIP321 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 11 REP sequences and 4 IHF sites | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Only 100 of 122 total aligned reads displayed.
TCAACGCCTGATGCGACGCTTAACGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTT‑AGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTTATGCCGCATCCGACATCAACGCCTGATGCGACGCTTAACGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑A‑‑C‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACACCCGGTATCAAACCCTTCCATACAGCTCAGGTTCAACCAGTGCAGCGCCTTTTGCTTGTTCTTCTCGATAAAACCTTCTTCACCGTTTAAGAACATCATTCCCGCCCAGTACTCGGAATAACCGGTTCGGGAAATTGCAGAGCTGCGTTTGAAATACCAGGTTGCCTTGTC > NC_000913/4296169‑4296639 | tgaagtcgtacggcggcgGTTAGCGTGTCTTGTCAGGCCAACGCCACACAGCGCACTAGCATGATCT‑GGCGTGGTTTAGTCGGTGGGGTAAGGCGTTTATGCCGAATCCGCCGTCTACGCCTGCTGCGACCATTAACGCGTCTTATCAGGCCGACGCCAGACAGCGCAATAACCTGACGTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGC‑‑CGCATCCGACATCAACGCCTGATGCGACGCTTGCcg < 2:605956/239‑1 (MQ=11) ttATCAGGCCTAGGCCAGACATCGCAATATCCTGATTT‑AGCTTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTTATTCCGCATCCGACATCAACGCCTGCTGCGCCGCTTAACGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGC‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTgg < 2:310955/251‑1 (MQ=11) ttATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTT‑AGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTTATGCCGCATCCGACATCAACGCCTGATGCGACGCTTAACGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGC‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTgg < 1:967481/251‑1 (MQ=17) aGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTT‑AGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTTATGCCGCATCCGACATCAACGCCTGATGCGACGCTTAACGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGC‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAAt > 1:831678/1‑251 (MQ=21) tACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTT‑AGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGACATCAACGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTCTCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGCTTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGC‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGATCATTTTTc > 1:401824/1‑251 (MQ=11) gccccAGACTGCGCAATAGCCTGGTTT‑GGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTTATGCCGCATCCGACATCAACGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGC‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCa < 2:919041/248‑1 (MQ=255) aCGCCCGACAGTGCAATAGCCTGAGTT‑AGCGTCATTTTGTAGGTCGAATAAGGCGTTTATGCCGCATCCGACATCAACGCCTGATGCGACGCTTAACGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGTTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGC‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCa < 1:896284/251‑1 (MQ=11) aCGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTT‑AGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTTATGCCGCATCCGACATCAACGCCTGATGCGACGCTTAACGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGC‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCa < 1:219067/251‑1 (MQ=255) aCGCCAGACAGCGCAAAAGCCTGTTTT‑CGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTTATGCCGCATCCGACATCAACGCCTGATGCGACGCTTAACGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGC‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATTTTAACCGTTGGTTAATTTTTCa < 2:347102/251‑1 (MQ=255) gaccAGACAGCGAAGTGGCCTGGTTG‑AGCGTGATTTTCGAGGTAGGATAAGGCTTTTCTGCCGCATCCGCCATCAACGCCTGATGCGACGCTTAACGCTTCTTATCAGGCCGACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGC‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCaa < 2:357666/249‑1 (MQ=11) gtaCAGCCCAATGGTCTGCTTT‑GGCGAGATTTTCTAGGACGGACAAGGCCTTACGGGCGCATCCTAAATCAAACGCTGGTGCGACGCTTACCTCGTCTTATCAGGGCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTCAGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGC‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAActc < 2:491186/249‑1 (MQ=14) gcgcAAGTGCCAGATTT‑AGGGTGGTGTTGTAGGGCGGATAAGGCGTTTATGCCGCATCCGACATCAACGCCTGATGCGACGCTTAGCGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGC‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTGcac < 2:1057521/251‑1 (MQ=14) ccgccggagcctgctttagatgtgttttttAGCTAGGTTAAAGTGTTTATACCTCTCCCAACATCAACGCCTGGGGCGACGTTTTACGCGTCTTATCCCGCCTGCGCCATGCAGCGCAATTGCCTGATTTAGCGTGCTTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGC‑‑CGCTTCCGACATCAATGCCTGATCCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCCAACTCTTcac < 2:302910/227‑1 (MQ=9) cAATAGCCTGATTT‑AGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTTATGCCGCATCCGACATCAACGCCTGATGCGACGCTTAACGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGC‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACAcc < 1:149365/251‑1 (MQ=255) cAATAGCCTGATTT‑AGCGTGATTTTGCAGGTCGGATAAGGCGTTTATGCCGCATCCGACATCAACGCCTGATGCGACGCTTAACGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGC‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTcaaccc > 1:357585/1‑247 (MQ=255) aaTAGCCTGATTT‑AGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTTATGCCGCATCCGACATCAACGCCTGATGCGACGCTTAACGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGC‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCacactc > 1:94998/1‑249 (MQ=255) aaTAGCCTGATTT‑AGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTTATGCCGCATCCGAAATCAACGCCTGATGCGACGCTTAACGCGTCTTATCAGGCCTACCCCACCCAGCGCTATAGCCTGCTTTAGCGTGATTTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGC‑‑CGCGTCCAACATCACTGCCAGAGTCATGGTCTGACGCGTCTTAGCAGGCCTCTCTTAAACGTTGGTTAATATTTCCAGCTCTTCACAccc > 2:253848/1‑251 (MQ=11) aTAGCCTGATTT‑GGCGTGATTTTGTAGATCGGATAAGGCGTTTATGCCGCATCCGACATCGACGCCTGATGCGACGCTTAACGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGATCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGC‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACACCCg < 1:193371/251‑1 (MQ=255) aTAGCC‑GATTTGAGCTTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTTATGCCGCATACGACAGCAACGCCTGATGCGACGCTTAACGCTTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGC‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACACCCg < 1:746596/251‑1 (MQ=14) ccTGATTT‑AGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTTATGCCGCATCCGACATCAACGACTGATGCGACGCTTAACGCGTCTTATCAGGCCTACGCTAGACAGCGGAATAGCCTGCATTAGCGTGATTTTGTAGGGCGGAGAAGGCGTTT‑‑ACGC‑‑CGCGTAAGAAATGAACGAGTGATACGACGCTTTCCGCGTCTTATTAGGACTATCCTAACCGTTGGATAATATTTCATAATCCTCacactaggcca > 2:42617/1‑244 (MQ=11) cTGATTT‑TGCGTGATTTGTTGTGTCGCATAAGTCGTTTATGCCGCGTCCGAGCTCAACGCCTGTTGCGGCGCTTAGCTCGTGTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGC‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACACCCGGTATc < 2:95044/251‑1 (MQ=14) cTGATTT‑AGCGTAATTTTGTATGTCGGATAAGGCGTTTATGTCGCATCCGACATCAACGCCTGATGCGACGCTTAACGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGC‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACACCCGGTATc < 1:141318/251‑1 (MQ=255) ttt‑AGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTTATGCCGCATCCGACATCAACGCCTGATGCGACGCTTAACGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGC‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTcac > 1:694200/1‑237 (MQ=255) ttt‑AGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTTATGCCGCATCCGACATCAACGCCTGATGCGACGCTTAACGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGC‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACACCCGGTATCAAAc > 1:787492/1‑251 (MQ=255) ttt‑AGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTTATGCCGCATCCGACATCAACGCCTGATGCGACGCTTAACGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGC‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGACGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTAACACCCGGTATCAAAc > 1:268554/1‑251 (MQ=255) 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tt‑AGCGTGATTTTTTAGGTCGGATAAGGCGTTTATGCCGCATACGACATCAACCCCTGATGCGACGCGTAACACGTCTTATCAGGCCTACGGCAGACAGCGCAATTGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGC‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACACCCGGTATCAAAcc < 1:560473/251‑1 (MQ=17) tt‑AGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTTATGCCGCATCCGACATCAACGCCTGATGCGACGCTTAACGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGC‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACACCCGGTATCAAAcc < 1:147161/251‑1 (MQ=255) tt‑AGCGTGATTTTGTAAGTCGGATAAGGCGTTTATGCCGCATCCTACATCAACGCCTGATGCGACGCTTAACGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGC‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACACCCGGTATCAAAcc < 1:316653/251‑1 (MQ=255) tt‑AGCGTGATTTTGGAGGTCGGGTAAGGCGTTTATGCCGCATCCGACATCAACGCCTGATGCGACGCTTAACGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGC‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACACCCGGTATCAAAcc < 2:86898/251‑1 (MQ=255) tt‑AGAGTGATTTTGTAGGTCGGTTAAGGCGTTTATTCCGCATCCGACATCAACGCCTGATGCGACGCTTAACGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGC‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACACCCGGTATCAAAcc < 2:185688/251‑1 (MQ=255) ttcgCGTGATTTTTGAGGTGGGATAAGGCGTTTATGCCGCATCCGACATCAACGCCTGATGCTACGCTTAACGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGC‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACACCCGGTATCAAAcc < 2:340513/248‑1 (MQ=255) ttttGTAGGTCGGATAAGGCGTTTATGCCGCATCCGACATCAACGCCTGATGCGACGCTTAACGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGC‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACACCCGGTATCAAACCCTTCCAttc > 1:616890/1‑249 (MQ=255) ttttGTAGGTCGGATAAGGCGTCTATGCCGCATCCGACATCAACGCCTGATGCGACGCTTAAAGCGTCTTATCAGGCCTATGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATCCAGCGTGACTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACTC‑‑CGAATCCGACATCAATGACTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGTCTATCTTATCCGTTGGTTAATCTTTCAAAATCTTCACACCCGGTATCCAACCCTTACATAc > 2:929817/1‑251 (MQ=14) ttttaaGGTCGGATAAGGCGTTTATGCCGCATCCTACATCAACGCCTGTTGCGACGCTTAACGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTTCCG‑‑C‑‑CGCATCCAACATCAATGCCTGATTCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCATTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACACCCGGTATCAAACCCTTCCATACa < 1:122406/246‑1 (MQ=17) 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cTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGC‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACACCCGGTATCAAACCCTTCCATACAGCTCAGGTTCAACCAGTGCAGCGCCTTTTGCTTGTTCTTCTCGATAAAACCTTCTTCACCGTTTaa > 1:796671/1‑251 (MQ=255) ttCAGGCCTAGGCCAGTCAGCGCAATAGCATGATATAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGC‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACACCCGGTATCAAACCCTTCCATACAGCTCAGGTTCAACCAGTGCAGCGCCTTTTGCTTGTTCTTCTCGATAAAACCTTCTTCACCGTTTAAGaa < 1:798028/250‑1 (MQ=255) accAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGC‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACACCCGGTATCAAACCCTTCCATACAGCTCAGGTTCAACCAGTGCAGCGCCTTTTGCTTGTTCTTCTCGATAAAACCTTCTTCACCGTTTAAGaa < 1:42575/249‑1 (MQ=255) 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cAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGC‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACACCCGGTATCAAACCCTTCCATACAGCTCAGGTTCAACCAGTGCAGCGCCTTTTGCTTGTTCTTCTCGATAAAACCTTCTTCACCGTTTAAGAACATCATTCCCGcc > 1:1026680/1‑251 (MQ=255) gccaTAGCCTGATCTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAATGCGTTT‑‑ACGC‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTACTTTTTCAAACTCTTCACATCCTGTATCAAACCCCTCCATACCGCCCAGGTTCAACCACTGCAGCCCCTCTTGCTTGTTCTTCTCGATAAAATCCTCTTCACCGTTTAAGCATATCATTCCCGCCACGTACTc > 2:77465/4‑251 (MQ=21) cAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGC‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGGCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACACCCGGTATCAAACCCTTCCATACAGCTCAGGTCAAACCAGTGCAGCGCCTTTTGCTTGTTCTTCTCGATAAAACCTTCTTCACCGTTTAAGAACATCATTCCCGCCCAGTACTCg > 2:757248/1‑251 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |