| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,035,437 | T→C | 82.6% | K282R (AAG→AGG) | prfB ← | peptide chain release factor RF‑2 |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,035,437 | 0 | T | C | 82.6% | 268.6 / 43.8 | 109 | K282R (AAG→AGG) | prfB | peptide chain release factor RF‑2 |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (9/10); new base C (44/46); total (53/56) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.90e-01 | |||||||||||
Only 100 of 110 total aligned reads displayed.
GAGTCATCAAGGACATAAGAACGAATCTGGCTGCCCCAGCCGATGTCGGATTTGTTATCTTCCATCGCCTGTTTCTCGGCATTTTTCTTCTGCATCTCCAGTTCATAAAGCTTCGCTTTCATCTGCTTCATGGCCTGATCTTTGTTCTTGTGCTGGGAACGGTCGTTCTGGCACTGGGTCACGATCCCGGTCGGGATGTGGGTAATACGCACCGCAGATTCGGTACGGTTAACGTGCTGACCGCCCGCGCCGGACGTGCGATAAACGTCAATGCGCAGATCCGCCGGG > NC_000913/3035290‑3035577 | gAGTCATCAAGGACATAAGAACGAATCTGGCTGCCCCAGCCGATGTCGGATTTGTTATCTTCCATCGCCTGTTTCTCGGCATTTTTCTTCTGCATCTCCAGTTCATAAAGCTTCGCTTTCATCTGCTTCATGGCCTGATCTTTGTTCt < 1:262913/148‑1 (MQ=255) catcaAGGACATAAGAACGAATCTGGCTGCCCCAGCCGATGTCGGATTTGTTATCTTCCATCGCCTGTTTCTCGGCATTTTTCTTCTGCATCTCCAGTTCATAAAGCTTCGCTTTCATCTGCTTCATGGCCTGATCTTTGTTCTtgtg > 2:178537/1‑148 (MQ=255) catcaAGGACATAAGAACGAATCTGGCTGCCCCAGCCGATGTCGGATTTGTTATCTTCCATCGCCTGTTTCTCGGCATTTTTCTTCTGCATCTCCAGTTCATAAAGCTTCGCTTTCATCTGCTTCATGGCCTGATCTTTGTTCTtgtg > 3:231558/1‑148 (MQ=255) catcaAGGACATAAGAACGAATCTGGCTGCCCCAGCCGATGTCGGATTTGTTATCTTCCATCGCCTGTTTCTCGGCATTTTTCTTCTGCATCTCCAGTTCATAAAGCTTCGCTTTCATCTGCTTCATGGCCTGATCTTTGTTCTtgtg > 1:322536/1‑148 (MQ=255) catcaAGGACATAAGAACGAATCTGGCTGCCCCAGCCGATGTCGGATTTGTTATCTTCCATCGCCTGTTTCTCGGCATTTTTCTTCTGCATCTCCAGTTCATAAAGCTTCGCTTTCATCTGCTTCATGGCCTGATCTTTGTTCCtgtg > 2:198197/1‑148 (MQ=255) catcaAGGACATAAGAACGAATCTGGCTGCCCCAGCCGATGTCGGATTTGTTATCTTCCATCGCCTGTTTCTCGGCATTTTTCTTCTGCATCTCCAGTTCATAAAGCTTCGCTTTCATCTGCTTCATGGCCTGATCTTTGTTCCtgtg > 8:258149/1‑148 (MQ=255) catcaAGGACATAAGAACGAATCTGGCTGCCCCAGCCGATGTCGGATTTGTTAACTTCCATCGCCTGTTTCTCGGCATTTTTCTTCTGCATCTCCAGTTCATAAAGCTTCGCTTTCATCTGCTTCATGGCCTGATCTTTGTTCCtgtg > 7:21105/1‑148 (MQ=255) catcaAGGACATAAGAACGAATCTGGCTGCCCAAGCCGATGTCGGATTTGTTATCTTCCATCGCCTGTTTCTCGGCATTTTTCTTCTGCATCTCCAGTTCATAATGCTTCGCTTTCATCTGCTTCATGGCCTGATCTTTGTTCTtgtg > 2:240000/1‑148 (MQ=255) tcaAGGACATAAGAACGAATCTGGCTGCCCCAGCCGATGTCGGATTTGTTATCTTCCATCGCCTGTTTCTCGGCATTTTTCTTCTGCATCTCCAGTTCATAAAGCTTCGCTTTCATCTGCTTCATGGCCTGATCTTTGTTCTTGTGCt > 2:278246/1‑148 (MQ=255) tcaAGGACATAAGAACGAATCTGGCTGCCCCAGCCGATGTCGGATTTGTTATCTTCCATCGCCTGTTTCTCGGCATTTTTCTTCTGCATCTCCAGTTCATAAAGCTTCGCTTTCATCAGCTTCATGGCCTGATCTTTGTTCTTGTGCt > 1:253593/1‑148 (MQ=255) caAGGACATAAGAACGAATCTGGCTGCCCCAGCCGATGTCGGATTTGTTATCTTCCATCGCCTGTTTCTCGGCATTTTTCTTCTGCATCTCCAGTTCATAAAGCTTCGCTTTCATCTGCTTCATGGCCTGATCTTTGTTCCTGTGCTg > 6:336440/1‑148 (MQ=255) aGGACATAAGAACGACTCTGGCTGCCCCAGCCGATGTCGGACTTGTTATCTTCCATCGCCTGTTTCTCGGCATTTTTCTTCTGCATCTCCACTTCATAAAGCATCGCTTTCATCTGCTTCATGGCCTGAGCTTTGTTCCTGTGCTggg < 8:21105/148‑1 (MQ=255) aaGAACGAATCTGGCTGCCCCAGCCGATGTCGGATTTGTTATCTTCCATCGCCTGTTTCTCGGCATTTTTCTTCTGCATCTCCAGTTCATAAAGCTTCGCTTTCATCTGCTTCATGGCCTGATCTTTGTTCCTGTGCTGGGAACGGTc > 3:93680/1‑148 (MQ=255) aGAACGAATCTGGCTGCCCCAGCCGATGTCGGATTTGTTATCTTCCATCGCCTGTTTCTCGGCATTTTTCTTCTGCATCTCCAGTTCATAAAGCTTCGCTTTCATCTGCTTCATGGCCTGATCTTTGTTCCTGTGCTGGGAACGGTc < 3:96644/147‑1 (MQ=255) gAACGAATCTGGCTGCCCCAGCCGATGTCGGATTTGTTATCTTCCATCGCCTGTTTCTCGGCATTTTTCTTCTGCATCTCCAGTTCATAAAGCTTCGCTTTCATCTGCTTCATGGCCTGATCTTTGTTCCTGTGCTGGGAACGGTCGt < 5:336440/148‑1 (MQ=255) gAACGAATCTGGCTGCCCCAGCCGATGTCGGATTTGTTATCTTCCATCGCCTGTTTCTCGGCATTTTTCTTCTGCATCTCCAGTTCATAAAGCTTCGCTTTCATCTGCTTCATGGCCTGATCATTGTTCCTGTGCTGGGAACGGTCGt < 5:377801/148‑1 (MQ=255) aCGAATCTGGCTGCCCCAGCCGATGTCGGATTTGTTATCTTCCATCGCCTGTTTCTCGGCATTTTTCTTCTGCATCTCCAGTTCATAAAGCTTCGCTTTCATCTGCTTCATGGCCTGATCTTTGTTCTTGTGCTGGGAACGGTCGTTc < 4:231558/148‑1 (MQ=255) aCGAATCTGGCTGCCCCAGCCGATGTCGGATTTGTTATCTTCCATCGCCTGTTTCTCGGCATTTTTCTTCTGCATCTCCAGTTCATAAAGCTTCGCTTTCATCTGCTTCATGGCCTGATCTTTGTTCCTGTGCTGGGAACGGTCGTTc > 3:192260/1‑148 (MQ=255) aCGAATCTGGCTGCCCCAGCCGATGTCGGAGTTGTTATCTTCCATCGCCTGTTTCTCGGCATTTTTCTTCTGCATCTCCAGTTCATAAAGCTTCGCTTTCATCTGCTTCATGGCCTGATCTTTGTTCTTGTGCTGGGAACGGTCGTTc < 2:322536/148‑1 (MQ=255) gAATCTGGCTGCCCCAGCCGATGTCGGATTTGTTATCTTCCATCGCCTGTTTCTCGGCATTTTTCTTCTGCATCTCCAGTTCATAAAGCTTCGCTTTCATCTGCTTCATGGCCTGATCTTTGTTCCTGTGCTGGGACCGGTCGTTCTg < 3:159897/148‑1 (MQ=255) aTCTGGCTGCCCCAGCCGATGTCGGATTTGTTATCTTCCATCGCCTGTTTCTCGGCATTTTTCTTCTGCATCTCCAGTTCATAAAGCTTCGCTTTCATCTGCTTCATGGCCTGATCTTTGTTCCTGTGCTGGGAACGGTCGTTCTGGc < 7:258149/148‑1 (MQ=255) tCTGGCTGCCCCAGCCGATGTCGGATTTGTTATCTTCCATCGCCTGTTTCTCGGCATTTTTCTTCTGCATCTCCAGTTCATAAAGCTTCGCTTTCATCTGCTTCATGGCCTGATCTTTGTTCCTGTGCTGGGAACGGTCGtt < 2:337926/142‑1 (MQ=255) tCTGGCTGCCCCAGCCGATGTCGGATTTGTTATCTTCCATCGCCTGTTTCTCGGCATTTTTCTTCTGCATCTCCAGTTCATAAAGCTTCGCTTTCATCTGCTTCATGGCCTGATCTTTGTTCCTGTGCTGGGAACGGTCGtt > 1:337926/1‑142 (MQ=255) cAGCCGATGTCGGATTTGTTATCTTCCATCGCCTGTTTCTCGGCATTTTTCTTCTGCATCTCCAGTTCATAAAGCTTCGCTTTCATCTGCTTCATGGCCTGATCTTTGTTCTTGTGCTGGGAACGGTCGTTCTGGCACTGGGTCACGa < 1:178537/148‑1 (MQ=255) 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ttttCTTCTGCATCTCCAGTTCATAAAGCTTCGCTTTCATCTGCTTCATGGCCTGATCTTTGTTCCTGTGCTGGGAACGGTCGTTCTGGCACTGGGTCACGATCCCGGTCGGGATGTGGGTAATACGCACCGCAGATTCGGTACGGt > 4:237364/1‑147 (MQ=255) tttCTTCTGCATCTCCAGTTCATAAAGCTTCGCTTTCATCTGCTTCATGGCCTGATCTTTGTTCCTGTGCTGGGAACGGTCGTTCTGGCACTGGGTCACGATCCCGGTCGGGa < 5:364647/113‑1 (MQ=255) tttCTTCTGCATCTCCAGTTCATAAAGCTTCGCTTTCATCTGCTTCATGGCCTGATCTTTGTTCCTGTGCTGGGAACGGTCGTTCTGGCACTGGGTCACGATCCCGGTCGGGa > 6:364647/1‑113 (MQ=255) ttcttcTGCATCTCCAGTTCATAAAGCTTCGCTTTCATCTGCTTCATGGCCTGATCTTTGTTCCTGTGCTGGGAACGGTCGTTCTGGCACTGGGTCACGATCCCGGTCGGGATGTGGGTAATACGCACCGCAGATTCGGTACGGTTa < 6:191396/147‑1 (MQ=255) tcttctGCATCTCCAGTTCATAAAGCTTCGCTTTCATCTGCTTCATGGCCTGATCTTTGTTCCTGTGCTGGGAACGGTCGtt > 8:388557/1‑82 (MQ=255) tcttctGCATCTCCAGTTCATAAAGCTTCGCTTTCATCTGCTTCATGGCCTGATCTTTGTTCCTGTGCTGGGAACGGTCGtt < 7:388557/82‑1 (MQ=255) cttctGCATCTCCAGTTCATAAAGCTTCGCTTTCATCTGCTTCATGGCCTGATCTTTGTTCCTGTGCTGGGAACGGTCGTTCTGGCACTGGGTCACGATCCCGGTCGGGATGTGGGTa < 3:162107/118‑1 (MQ=255) cttctGCATCTCCAGTTCATAAAGCTTCGCTTTCATCTGCTTCATGGCCTGATCTTTGTTCCTGTGCTGGGAACGGTCGTTCTGGCACTGGGTCACGATCCCGGTCGGGATGTGGGTa > 4:162107/1‑118 (MQ=255) cttctGCATCTCCAGTTCATAAAGCTTCGCTTTCATCTGCTTCATGGCCTGATCTTTGTTCCTGTGCTGGGAACGGTCGTTCTGGCACTGGGTCACGATCCCGGTCGGGATGTGGGTAATACGCACCGCAGATTCGGTACGGTTAAc < 1:16030/147‑1 (MQ=255) ctGCATCTCCAGAGCATAAAGCTTCGCTTTCATCTGCATCATGGCCTGATCTTTGTTCCTGTGCTGGGCACGGTCGTTCTGGCACTGGGGCACGATCCCGGTCGGGATGTGGGTAATACGCACCGCAGATTCGGTACGGTTAACGTg < 4:192260/147‑1 (MQ=255) cATCTCCAGTTCATAAAGCTTCGCTTTCATCTGCTTCATGGCCTGATCTTTGTTCCTGTGCTGGGAACGGTCGTTCTGGCACTGGGTCACGATCCCGGTCGGGATGTGGGTAATACGCACCGCAGATTCGGTACGGTTAACGTGCTg < 5:112490/147‑1 (MQ=255) ctcCAGTTCATAAAGCTTCGCTTTCATCTGCTTCATGGCCTGATCTTTGTTCTTGTGCTGGGAACGGTCGTTCTGGc > 3:176139/1‑77 (MQ=255) ctcCAGTTCATAAAGCTTCGCTTTCATCTGCTTCATGGCCTGATCTTTGTTCTTGTGCTGGGAACGGTCGTTCTGGCACTGGGTCACGATCCCGGTCGGGATGTGGGTAATACGCACCGCAGATTCgg > 8:55009/1‑128 (MQ=255) 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cTTCATGGCCTGATCTTTGTTCCTGTGCTGGGAACGGTCGTTCTGGCACTGGGTCACGATCCCGGTCGGGATGTGGGTAATACGCACCGCAGATTCGGTACGGTTAACGTGCTGACCGCCCGCGCCGGACGTGCGATAAACGTCa < 1:175113/145‑1 (MQ=255) cTTCATGGCCTGATCTTTGTTCCTGTGCTGGGAACGGTCGTTCTGGCACTGGGTCACGATCCCGGGCGGGATGTGGGTAATACGCACCGCAGATTCGGTACGGTTAACGTGCTGACCGCCCGCGCCGGACGTGCGATAAACGTc < 3:56620/144‑1 (MQ=255) ggCCTGATCTTTGTTCCTGTGCTGGGAACGGTCGTTCTGGCACTGGGTCACGATCCCGGTCGGGATGTGGGTAATACGCACCGCAGATTCGGTACGGTTaa > 4:94379/1‑101 (MQ=255) ggCCTGATCTTTGTTCCTGTGCTGGGAACGGTCGTTCTGGCACTGGGTCACGATCCCGGTCGGGATGTGGGTAATACGCACCGCAGATTCGGTACGGTTaa < 3:94379/101‑1 (MQ=255) ggCCTGATCTTTGTTCCAGTGCTGGGAACGGTCGTTCTGGCACTGGGTCACGATCCCGGTCGGGATGTGGGTAATACGCACCGCAGATTCGGTACGGTTaa > 6:357393/1‑101 (MQ=255) gCCTGATCTTTGTTCCTGTGCTGGGAACGGTCGTTCTGGCACTGGGTCACGATCCCGGTCGGGATGTGGGTAATACGCACCGCAGATTCGGTACGGTTAACGTGCTGACCGCCCGCGCCGGACGTGCGATAAACGTCAATGCGCAGAt < 8:144241/148‑1 (MQ=255) aTCTTTGTTCTTGTGCTGGGAACGGTCGTTCTGGCACTGGGTCACGATCCCGGTCGGGATGTGGGTAATACGCACCGCAGATTCGGTACGGTTAACGTGCTGACCGCCCGCGCCGGACGTGCGATAAACGTCAATGCGCAGATccgcc > 1:180474/1‑148 (MQ=255) tCTTTGTTCCTGTGCTGGGAACGGTCGTTCTGGCACTGGGTCACGATCCCGGTCGGGATGTGGGTAAt > 6:378296/1‑68 (MQ=255) tCTTTGTTCCTGTGCTGGGAACGGTCGTTCTGGCACTGGGTCACGATCCCGGTCGGGATGTGGGTAAt < 5:378296/68‑1 (MQ=255) tCTTTGTTCCTGTGCTGGGAACGGTCGTTCTGGCACTGGGTCACGATCCCGGTCGGGATGTGGGTAATACGCCCCGCAGATTCGGTACGGTTAACGTGCTGACCGCCCGCGCCGGACGTGCGATAAACGTCAATGCGCAGATccgccg > 6:144805/1‑148 (MQ=255) | GAGTCATCAAGGACATAAGAACGAATCTGGCTGCCCCAGCCGATGTCGGATTTGTTATCTTCCATCGCCTGTTTCTCGGCATTTTTCTTCTGCATCTCCAGTTCATAAAGCTTCGCTTTCATCTGCTTCATGGCCTGATCTTTGTTCTTGTGCTGGGAACGGTCGTTCTGGCACTGGGTCACGATCCCGGTCGGGATGTGGGTAATACGCACCGCAGATTCGGTACGGTTAACGTGCTGACCGCCCGCGCCGGACGTGCGATAAACGTCAATGCGCAGATCCGCCGGG > NC_000913/3035290‑3035577 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |