Missing coverage evidence... | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
* | * | ÷ | NC_000913 | 4540480 | 4540762 | 283 | 5 [4] | [4] 5 | nanC/fimB | N‑acetylnuraminic acid outer membrane channel protein/tyrosine recombinase/inversion of on/off regulator of fimA |
TTGTTACAGAACATATCACATGATATATAGATAAGATTAGTTGCATTAATGATGAGGGTTATTATTAGATTCGTATCCGATTGATAAATATATAAAGGTACATAGCATGCAAGAGCATGGCGTTTGTATGGCAACGTTATTATAATTAACAGTTGCTACTCCATTTAAGTTCACTCAGAAGAACTGGTCCACTTACGTTAGTTATTAAGCAAACGTTCGCTTTTATAAACATAATCAGGATAAAAATGTTGGATTATTGCT > NC_000913/4540651‑4540911 | ttGTTACAGAACATATCACATGATATATAGATAAGATTAGTTGCATTAATGATGAGGGTTATTATTAGATTCGTATCCGATTGATAAATATATAAAGGTACATAGCATGCAAGAGCATGGCGTTTGTATGGCAACGTTATTATAATTaa < 3:31950/149‑1 (MQ=255) ggTTATTATTAGATTCGTATCCGATTGATAAATATATAAAGGTACATAGCATGCAAGAGCATGGCGTTTGTATGGCAACGTTATTATAATTAACAGTTGCTACTCCATTTAAGTTCACTCAGAAGAACTGGTCCACTTACGTTAGttat > 2:91969/1‑149 (MQ=255) ataAAGGTACATAGCATGCAAGAGCATGGCGTTTGTATGGCAACGTTATTATAATTAACAGTTGCTACTCCATTTAAGTTCACTCag < 7:1951/87‑1 (MQ=255) ataAAGGTACATAGCATGCAAGAGCATGGCGTTTGTATGGCAACGTTATTATAATTAACAGTTGCTACTCCATTTAAGTTCACTCag > 8:1951/1‑87 (MQ=255) gagCATGGCGTTTGTATGGCAACGTTATTATAATTAACAGTTGCTACTCCATTTAAGTTCACTCAGAAGAACTGGTCCACTTACGTTAGTTATTAAGCAAACGTTCGCTTTTATAAACATAATCAGGATAAAAATGTTGGATTATTGCt < 1:91969/149‑1 (MQ=255) | TTGTTACAGAACATATCACATGATATATAGATAAGATTAGTTGCATTAATGATGAGGGTTATTATTAGATTCGTATCCGATTGATAAATATATAAAGGTACATAGCATGCAAGAGCATGGCGTTTGTATGGCAACGTTATTATAATTAACAGTTGCTACTCCATTTAAGTTCACTCAGAAGAACTGGTCCACTTACGTTAGTTATTAAGCAAACGTTCGCTTTTATAAACATAATCAGGATAAAAATGTTGGATTATTGCT > NC_000913/4540651‑4540911 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |