| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 910,542 | 0 | C | T | 64.8% | 106.4 / 104.1 | 108 | E170K (GAA→AAA) | poxB | pyruvate dehydrogenase, thiamine triphosphate‑binding, FAD‑binding |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (19/19); new base T (34/36); total (53/55) | |||||||||||
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| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 108 total aligned reads displayed.
CTCTTTATGCGCCCCCGCGCAGCCGCTGCCACACATCAGGGCGATATTGCTGGAATAACGCAGCAGTTGCGCCAGTTTGCGTAACTCTTCTTCTTCCGGCGTCACGACTGGTTGTGGCGCATGATACCAGTGCATGGTTGCCCCTTCTGGCGCAGGTTTTAACGCCACGTCGCCTGGTAACACGACAACCGAAACGCCACGGTTAAGCACCGCTTTGCGCATGGCAATCGCCAGTACTTGTGGGATCTGCTCCGGGCTGGAAACCAGCTCGCAATAGTGACTACATTCGCG > NC_000913/910396‑910686 | ctctTTATGCGCCCCCGCGCAGCCGCTGCCACACATCAGGGCGATATTGCTGGAATAACGCAGCAGTTGCGCCAGTTTGCGTAACTCTTCTTCTTCCGGCGTCACGACTGGTTGTGGCGCATGATACCAGTGCATGGTTGCCCCTTCTg < 1:247405/149‑1 (MQ=255) tctTTATGCGCCCCCGCGCAGCCGCTGCCACACATCAGGGCGATATTGCTGGAATAACGCAGCAGTTGCGCCAGTTTGCGTAACTCTTCTTCTTCCGGCGTCACGACTGGTTGTGGCGCATGATACCAGTGCATGGTTGCCCCTTTTgg > 5:331251/1‑149 (MQ=255) tttATGCGCCCCCGCGCAGCCGCTGCCACACATCAGGGCGATATTGCTGGAATAACGCAGCAGTTGCGCCAGTTTGCGTAACTCTTCTTCTTCCGGCGTCACGACTGGTTGTGGCGCATGATACCAGTGCATGGTTGCCCCTTTTGgcg > 5:365085/1‑149 (MQ=255) ttATGCGCCCCCGCGCAGCCGCTGCCACACATCAGGGCGATATTGCTGGAATAACGCAGCAGTTGCGCCAGTTTGCGTAACTCTTCTTCTTCCGGCGTCACGACTGGTTGTGGCGCATGATACCAGTGCATGGTTGCCCCTTTTGgcgc < 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cAGTGCATGGTTGCCCCTTTTGGCGCAGGTTTTAACGCCACGTCGCCTGGTAACACGACAACCGAAACGCCACGGTTAAGCACCGCTTTGCGCATGGCAATCGCCAGTACTTGTGGGATCTGCTCCGGGCTGGAAACCAGCTCGCAATa < 6:223916/149‑1 (MQ=255) gCATGGTTGCCCCTTTTGGCGCAGGTTTTAACGCCACGTCGCCTGGTAACACGACAACCGAAACGCCACGGTTATGCACCGCTTTGCGCATGGCAATCGCCAGTACTTGTGGGATCTGCTCCGGGCTGGAAACCAGCTCGCAATAGTGa < 7:83758/149‑1 (MQ=255) cATGGTTGCCCCTTTTGGCGCAGGTTTTAACGCCACGTCGCCTGGTAACACGACAACCGAAACGCCACGGTTAAGCACCGCTTTGCGCATGGCAATCGCCAGTACTTGTGGGATCTGCTCCGGGCTGGAAACCAGc > 4:396190/1‑136 (MQ=255) cATGGTTGCCCCTTTTGGCGCAGGTTTTAACGCCACGTCGCCTGGTAACACGACAACCGAAACGCCACGGTTAAGCACCGCTTTGCGCATGGCAATCGCCAGTACTTGTGGGATCTGCTCCGGGCTGGAAACCAGc < 3:396190/136‑1 (MQ=255) cATGGTTGCCCCTTCTGGCGCAGGTTTTAACGCCACGTCGCCTGGTAACACGACAACCGAAACGCCACGGTTAAGCACCGCTTTGCGCATGGCAATCGCCAGTACTTGTGGGATCTGCTCCGGGCTGGAAACCAGCTCGCAATAGTGAc < 4:200121/149‑1 (MQ=255) ttGCCCCTTCTGGCGCAGGTTTTAACGCCACGTCGCCTGGTAACACGACAACCGAAACGCCACGGTTAAGCACCGCTTTGCGCATGGCAATCGCCAGTACTTGTGGGATCTGCTCCGGGCTGGAAACCAGCTCGCAATAGTGACTACAt < 8:305441/149‑1 (MQ=255) ccTTCTGGCGCAGGTTTTAACGCCACGTCGCCTGGTAACACGACAACCGAAACGCCACGGTTAAGCACCGCTTTGCGCATGGCAATCGCCAGTACTTGTGGGATCTGCTCCGGGCTGGAAACCAGCTCGCAATAGTGACTACATTcgcg < 5:12918/149‑1 (MQ=255) | CTCTTTATGCGCCCCCGCGCAGCCGCTGCCACACATCAGGGCGATATTGCTGGAATAACGCAGCAGTTGCGCCAGTTTGCGTAACTCTTCTTCTTCCGGCGTCACGACTGGTTGTGGCGCATGATACCAGTGCATGGTTGCCCCTTCTGGCGCAGGTTTTAACGCCACGTCGCCTGGTAACACGACAACCGAAACGCCACGGTTAAGCACCGCTTTGCGCATGGCAATCGCCAGTACTTGTGGGATCTGCTCCGGGCTGGAAACCAGCTCGCAATAGTGACTACATTCGCG > NC_000913/910396‑910686 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |