| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_000913 | = 4138728 | 54 (0.780) | 4 (0.060) | 4/244 | NT | 7.0% | coding (308/1104 nt) | gldA | glycerol dehydrogenase, NAD+ dependent; 1,2‑propanediol:NAD+ oxidoreductase |
| ? | NC_000913 | = 4138734 | 55 (0.830) | coding (302/1104 nt) | gldA | glycerol dehydrogenase, NAD+ dependent; 1,2‑propanediol:NAD+ oxidoreductase | |||||
AATGACCATATTCGGGTTATTTGGCAACAGCAGATAGCGGTCAAACTCACCCTCATCGGTGTAGATAACAGACAATGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCGCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGTGCTTTGGCAGTATCGAGGGTTTTTCCGCCACCGATACCGAGAATTGCGCCACACTGCGCAGTCTCCGCGATGCCACGCAGACGGTCGATCTCATTTTGCGAACATTCACCGCCAAACGGCGCAATTTCTACTACCAGTCCAGCA > NC_000913/4138583‑4138874 | aaTGACCATATTCGGGTTATTTGGCAACAGCAGATAGCGGTCAAACTCACCCTCATCGGTGTAGATAACAGACAATGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCGCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGt > 7:228379/1‑148 (MQ=255) cATATTCGGGTTATTTGGCAACAGCAGATAGCGGTCAATCTCTCCCTATTCGGTGTAGATAACAGACAATGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCGCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGTGCTTtg > 6:36984‑M2/1‑146 (MQ=255) cATATTCGGGTTATTTGGCAACAGCAGATAGCGGTCAAACTCACCCTCATCGGTGTAGATAACAGACAATGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCGCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGTGCTTtg > 3:18081‑M2/1‑146 (MQ=255) tatTCGGGTTATTTGGCAACAGCAGATAGCGGTCAAACTCACCCTCATCGGTGTAGATAACAGACAATGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCGCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGTGCTTtgg < 3:72567‑M2/147‑4 (MQ=255) atTCGGGTTATTTGGCAACAGCAGATAGCGGTCAAACTCACCCTCATCGGTGTAGATAACAGACAATGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCGCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGTGCTTtgg < 5:180215‑M2/146‑4 (MQ=255) atTCGGGTTATTTGGCAACAGCAGATAGCGGTCAAACTCACCCTCATCGGTGTAGATAACAGACAATGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCGCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGTGCTTtgg < 1:214615‑M2/146‑4 (MQ=255) atTCGGGTTATTTGGCAACAGCAGATAGCGGTCAAACTCACCCTCATCGGTGTAGATAACAGACAATGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCGCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGTGCTTtgg < 8:127989‑M2/146‑4 (MQ=255) ttCGGGTTATTTGGCAACAGCAGATAGCGGTCAAACTCACCCTCATCGGTGTAGATAACAGACAATGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCGCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGTGCTTtggca > 7:127989‑M2/1‑142 (MQ=255) gggTTATTTGGCAACAGCAGAAAGCGGTCAAACTCACCCTCATCGGTGTAGATAACAGACAATGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCGCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGTGCTTTGGCAGTAt > 4:296675/1‑148 (MQ=255) tGGCAACAGCAGATAGCGGTCAAACTCACCCTCATCGGTGTAGATAACAGACAATGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCGCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGTGCTTTGGCAGTATCGAGGGtt > 6:177200/1‑148 (MQ=255) cAACAGCAGATAGCGGTCAAACTCACCCTCATCGGTGTAGATAACAGACAATGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCGCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGTGCTTTGGCAGTATCGAGGGttttt < 6:180215/148‑1 (MQ=255) aaCAGCAGATAGCGGTCAAACTCACCCTCATCGGTGTAGATAACAGACAATGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCGCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGTGCTTTGGCAGTATCGAGTGTTTTTc > 7:171621/1‑148 (MQ=255) cagcagATAGCGGTCAAACTCACCCTCATCGGTGTAGATAACAGACAATGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCGCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGTGCTTtggc > 4:247567‑M2/1‑125 (MQ=255) cagcagATAGCGGTCAAACTCACCCTCATCGGTGTAGATAACAGACAATGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCGCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGTGCTTtggc < 3:247567‑M2/129‑5 (MQ=255) agcagATAGCGGTCAAACTCACCCTCATCGGTGTAGATAACAGACAATGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCGCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAAAGCACtggcacatttcatgggtgttccgg < 1:243851‑M2/148‑25 (MQ=255) aTAGCGGTCAAACTCACCCTCATCGGTGTAGATAACAGACAATGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCGCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAAAGCACtggcacatttcatgggtgttccggtagc < 1:101090‑M2/147‑29 (MQ=255) tAGCGGTCAAACTCACCCTCATCGGTGTAGATAACAGACAATGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCGCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGTGCTTTGGCAGTATCGAGGGTTTTTCCGCCACCGa > 8:147612/1‑148 (MQ=255) tAGCGGTCAAACTCACCCTCATCGGTGTAGATAACAGACAATGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCGCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAAAGCACtggcacatttcatgggtgttccggtagcga > 2:243851‑M2/1‑118 (MQ=255) gTCAAACTCACCCTCATCGGTGTAGATAACAGACAATGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCGCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGTGCTTTGGCAGTATCGAGGGTTTTTCCGCCACCGATAcc > 1:12755/1‑147 (MQ=255) cAAACTCACCCTCATCGGTGTAGATAACAGACAATGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCGCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGTGCTTTGGCAGTATCGAGGGTTTTTCCGCCACCGATAcc > 8:133018/1‑145 (MQ=255) 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ccTCATCGGTGTAGATAACAGACAATGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCGCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGTGCTTTGGCAGTATCGAGGGTTTTTCCGCCACCGATACCGAGAATTGCGcc < 8:228379/148‑1 (MQ=255) cATCGGTGTAGATAACAGACAATGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCGCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGTGCTTTGGCAGTATCGAGGGTTTTTCCGCCACCGATACCGAGAATTGCGCcaca > 7:135682/1‑148 (MQ=255) aTCGGTGTAGATAACAGACAATGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCGCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGTGCTTTGGCAGTATCGAGGGTTTTTCCGCCACCGATACCGAGAATTGCGCcac < 3:296675/146‑1 (MQ=255) ggTGTAGATAACAGACAATGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCGCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGTGCTTTGGCAGTATCGAGGGTTTTTCCGCCACCGATACCGAGAATTGCGCCACACTgc < 6:68172/148‑1 (MQ=255) tgtAGATAACAGACAATGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCGCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGTGCTTTGGCAGTATCGAGGGTTTTTCCGCCACCGATACCGAGAATTGCGCCACACTgcgc < 4:72567/148‑1 (MQ=255) 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cAaagcactggcacatttcatgggtgttccggtagcgatcgcaccgactatcgcctctaccgatgcaccgtgcagcgcattgtctgttatctacaccgatgagggtgagtttgaccgctatctgctgttgccaaataacccgaatatg > 3:18081‑M1/1‑2 (MQ=255) cAaagcactggcacatttcatgggtgttccggtagcgatcgcaccgactatcgcctctaccgatgcaccgtgcagcgcattgtctgttatctacaccgaatagggagagattgaccgctatctgctgttgccaaataacccgaatatg > 6:36984‑M1/1‑2 (MQ=255) | AATGACCATATTCGGGTTATTTGGCAACAGCAGATAGCGGTCAAACTCACCCTCATCGGTGTAGATAACAGACAATGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCGCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGTGCTTTGGCAGTATCGAGGGTTTTTCCGCCACCGATACCGAGAATTGCGCCACACTGCGCAGTCTCCGCGATGCCACGCAGACGGTCGATCTCATTTTGCGAACATTCACCGCCAAACGGCGCAATTTCTACTACCAGTCCAGCA > NC_000913/4138583‑4138874 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |