| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,356,571 | G→A | 5.1% | R616Q (CGG→CAG) | gltB → | glutamate synthase, large subunit |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,356,571 | 0 | G | A | 5.1% | 265.0 / 2.8 | 78 | R616Q (CGG→CAG) | gltB | glutamate synthase, large subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (36/38); new base A (2/2); total (38/40) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.50e-01 | |||||||||||
GATGAAAGAGGAGCACTACCGCGCAGATACGCTGGATATCACCTTTGACGTCACTAAAACCACGCTCGAAGCGACAGTCAAAGAGCTGTGCGACAAAGCCGAAAAAATGGTACGTAGCGGCACCGTGCTGCTGGTGCTCTCCGACCGGAATATCGCTAAAGATCGCCTGCCGGTTCCAGCCCCGATGGCGGTTGGCGCGATCCAGACCCGTCTGGTCGATCAAAGCCTGCGTTGCGATGCCAACATCATCGTCGAAACCGCCAGCGCCCGCGATCCGCACCACTTCGCCGTGTT > NC_000913/3356425‑3356718 | gaTGAAAGAGGAGCACTACCGCGCAGATACGCTGGATATCACCTTTGACGTCACTAAAACCACGCTCGAAGCGACAGTCAAAGAGCTGTGCGACAAAGCCGAAAAAATGGTACGTAGCGGCACCGTGCTGCTGGTGCTCTCCGACCgg < 3:28320/148‑1 (MQ=255)gaTGAAAGAGGAGCACTACCGCGCAGATACGCTGGATATCACCTTTGACGTCACTAAAACCACGCTCGAAGCGACAGTCAAAGAGCTGTGCGACAAAGCCGAAAAAATGGTACGTAGCGGCACCGTGCTGCTGGTGCTCTCCGACCgg < 3:32352/148‑1 (MQ=255) gAAAGAGGAGCACTACCGCGCAGATACGCTGGATATCACCTTTGACGTCACTAAAACCACGCTCGAAGCGACAGTCAAAGAGCTGTGCGACAAAGCCGAAAAAATGGTACGTCGCGGCACCGTGCTGCAGGTGCTCTCCGACCGGat > 8:305378/1‑146 (MQ=255) agagGAGCACTACCGCGCAGATACGCTGGATATCACCTTTGACGTCACTAAAACCACGCTCGTAGCGACAGTCAAAGAGCTGTGCGACAAAGCCGAAAAAATGGTACGTAGCGGCACCGTGCTGCTGGTGCTCTCCGACCGGAATATc > 2:84263/1‑148 (MQ=255) agagGAGCACTACCGCGCAGATACGCTGGATATCACCTTTGACGTCACTAAAACCACGCTCGAAGCGACAGTCAAAGAGCTGTGCGACAAAGCCGAAAAAATGGTACGTAGCGGCACCGTGCTGCTGGTGCTCTCCGACCGGAATATc < 4:228307/148‑1 (MQ=255) gaggagCACTACCGCGCAGATACGCTGGATATCACCTTTGACGTCACTAAAACCACGCTCGAAGCGACAGTCAAAGAGCTGTGCGACAAAGCCGAAAAAATGGTACGTAGCGGCACCGTGCTGCTGGTGCTCTCCGACCGGAATATCg < 3:152362/148‑1 (MQ=255) gagCACTACCGCGCAGATACGCTGGATATCACCTTTGACGTCACTAAAACCACGCTCGAAGCGACAGTCAAAGAGCTGTGCGACAAAGCCGAAAAAATGGTACGTAGCGGCACCGTGCTGCTGGTGCTCTCCGACCGGAATATCGCt > 8:304915/1‑147 (MQ=255) agCACTACCGCGCAGATACGCTGGATATCACCTTTGACGTCACTAAAACCACGCTCGAAGCGACAGTCAAAGAGCTGTGCGACAAAGCCGAAAAAATGGTACGTAGCGGCACCGTGCTGCTGGTGCTCTCCGACCGGAATATCGCTaa < 3:251970/148‑1 (MQ=255) aCTACCGCGCAGATACGCTGGATATCACCTTTGACGTCACTAAAACCACGCTCGAAGCGACAGTCAAAGAGCTGTGCGACAAAGCCGAAAAAATGGTACGTAGCGGCACCGTGCTGCTGGTGCTCTCCGACCGGAATATCGCTa > 1:221923/1‑144 (MQ=255) aCTACCGCGCAGATACGCTGGATATCACCTTTGACGTCACTAAAACCACGCTCGAAGCGACAGTCAAAGAGCTGTGCGACAAAGCCGAAAAAATGGTACGTAGCGGCACCGTGCTGCTGGTGCTCTCCGACCGGAATATCGCTa > 2:129041/1‑144 (MQ=255) aCTACCGCGCAGATACGCTGGATATCACCTTTGACGTCACTAAAACAACGCTCGAAGCGACAGTCAAAGAGCTGTGCGACAAAGCCGAAAAAATGGTACGTAGCGGCAACTTGATGCTGTTGCTCTCCGACAAGAATATCGCTTAAg > 1:259939/1‑147 (MQ=255) cTACCGCGCAGATACGCTGGATATCACCTTTGACGTCACTAAAACCACGCTCGAAGCGACAGTCAAAGAGCTGTGCGACAAAGCCGAAAAAATGGTACGTAGCGGCACCGTGCTGCTGGTGCTCTCCGACCGGAATATCGCTAAAGAt < 7:106319/148‑1 (MQ=255) aCCGCGCAGATACGCTGGATATCACCTTTGACGTCACTAAAACCACGCTCGAAGCGACAGTCAAAGAGCTGTGCGACAAAGCCGAAAAAATGGTACGTAGCGGCACCGTGCTGCTGGTGCTCTCCGACCGGAATATCGCTAAAg < 2:221923/144‑1 (MQ=255) aCCGCGCAGATACGCTGGATATCACCTTTGACGTCACTAAAACCACGCTCGAAGCGACAGTCAAAGAGCTGTGCGACAAAGCCGAAAAAATGGTACGTAGCGGCACCGTGCTGCTGGTGCTCTCCGACCGGAATATCGCTAAAGATCg > 3:130664/1‑148 (MQ=255) cgcgCAGATACGCTGGATATCACCTTTGACGTCACTAAAACCACGCTCGAAGCGACAGTCAAAGAGCTGTGCGACAAAGCCGAAAAAATGGTACGTAGCGGCACCGTGCTGCTGGTGCTCTCCGACCGGAATATCGCTAAAGATCGcc > 4:18875/1‑148 (MQ=255) cgcgCAGATACGCTGGATATCACCTTTGACGTCACTAAAACCACGCTCGAAGCGACAGTCAAAGAGCTGTGCGACAAAGCCGAAAAAATGGTACGTAGCGGCACCGTGCTGCTGGTGCTCTCCGACCGGAATATCGCTAAAGATCGcc < 5:140379/148‑1 (MQ=255) gcgcAGATACGCTGGATATCACCTTTGACGTCACTAAAACCACGCTCGAAGCGACAGTCAAAGAGCTGTGCGACAAAGCCGAAAAAATGGTACGTAGCGGCACCGTGCTGCTGGTGCTCTCCGACCGGAATATCGCTAAAGATCGCCt < 1:115827/148‑1 (MQ=255) gATACGCTGGATATCACCTTTGACGTCACTAAAACCACGCTCGAAGCGACAGTCAAAGAGCTGTGCGACAAAGCCGAAAAAATGGTACGTAGCGGCACCGTGCTGCTGGTGCTCTCCGACCAGAATATCGCTAAAGATCGCCTGCCgg > 8:32252/1‑148 (MQ=255) tACGCTGGATATCACCTTTGACGTCACTAAAACCACGCTCGAAGCGACAGTCAAAGAGCTGTGCGACAAAGCCGAAAAAATGGTACGTAGCGGCACCGTGCTGCTGGTGCTCTCCGACCGGAATATCGCTAAAGATCGCCTGCCGGtt < 1:310406/148‑1 (MQ=255) tatCACCTTTGACGTCACTAAAACCACGCTCGAAGCGACAGTCAAAGAGCTGTGCGACAAAGCCGAAAAAATGGTACGTAGCGGCACCGTGCTGCTGGTGCTCTCCGACCGGAATATCGCTAAAGATCGCCTGCCGGTTCCAGCCCCg < 4:233717/148‑1 (MQ=255) ccTTTGACGTCACTAAAACCACGCTCGAAGCGACAGTCAAAGAGCTGTGCGACAAAGCCGAAAAAATGGTACGTAGCGGCACCGTGCTGCTGGTGCTCTCCGACCGGAATATCGCTAAAGATCGCCTGCCGGTTCCAGCCCCGATGGc > 2:48393/1‑148 (MQ=255) cTTTGACGTCACTAAAACCACGCTCGAAGCGACAGTCAAAGAGCTGTGCGACAAAGCCGAAAAAATGGTACGTAGCGGCACCGTGCTGCTGGTGCTCTCCGACCGGAATATCGCTAAAGATCGCCTGCCGGTTCCAGCCCCGATGGCg > 5:2549/1‑148 (MQ=255) ttGACGTCACTAAAACCACGCTCGAAGCGACAGTCAAAGAGCTGTGCGACAAAGCCGAAAAAATGGTACGTAGCGGCACCGTGCTGCTGGTGCTCTCCGACCGGAATATCGCTAAAGATCGCCTGCCGGTTCCAGCCCCGATGGCGGt > 1:38083/1‑148 (MQ=255) tGACGTCACTAAAACCACGCTCGAAGCGACAGTCAAAGAGCTGTGCGACAAAGCCGAAAAAATGGTACGTAGCGGCACCGTGCTGCTGGTGCTCTCCGACCGGAATATCGCTAAAGATCGCCTGCCGGTTCCAGCCCCGATGGCGGt < 7:305378/147‑1 (MQ=255) gACGTCACTAAAACCACGCTCGAAGCGACAGTCAAAGAGCTGTGCGACAAAGCCGAAAAAATGGTACGTAGCGGCACCGTGCTGCTGGTGCTCTCCGACCGGAATATCGCTAAAGATCGCCTGCCGGTTCCAGCCCCGATGGCGGtt < 8:23124/147‑1 (MQ=255) tCACTAAAACCACGCTCGAAGCGACAGTCAAAGAGCTGTGCGACAAAGCCGAAAAAATGGTACGTAGCGGCACCGTGCTGCTGGTGCTCTCCGACCGGAATATCGCTAAAGATCGCCTGCCGGTTCCAGCCACGATGGCGGTTGgcgc > 3:292888/1‑148 (MQ=255) tCACTAAAACCACGCTCGAAGCGACAGTCAAAGAGCTGTGCGACAAAGCCGAAAAAATGGTACGTAGCGGCACCGTGCTGCTGGTGCTCTCCGACCGGAATATCGCTAAAGATCGCCTGCCGGTTCCAGCCACGATGGAGGTTGgcgc > 6:92592/1‑148 (MQ=255) cACTAAAACCACGCTCGAAGCGACAGTCAAAGAGCTGTGCGACAAAGCCGAAAAAATGGTACGTAGCGGCACCGTGCTGCTGGTGCTCTCCGACCGGa > 6:257899/1‑98 (MQ=255) cACTAAAACCACGCTCGAAGCGACAGTCAAAGAGCTGTGCGACAAAGCCGAAAAAATGGTACGTAGCGGCACCGTGCTGCTGGTGCTCTCCGACCGGa < 5:257899/98‑1 (MQ=255) cACTAAAACCACGCTCGAAGCGACAGTCAAAGAGCTGTGCGACAAAGCCGAAAAAATGGTACGTAGCGGCACCGTGCTGCTGGTGCTCTCCGACCGGAATATCGCTAAAGATCGCCTGCCGGTTCCAGCCCCGATGGCGGTTGgcgc > 6:174285/1‑147 (MQ=255) aCTAAAACCACGCTCGTAGCGACAGGCAAAGAGCTGTGCGACAAAGCCGAAAAAATGGTACGTAGCGGCACCGTGCTGCTGGTGCTCTCCGACCGGAATATCGCTAAAGATCGCCTGCCGGTTCCAGCCCCGATGGCGGTTGGCGCGa < 1:84263/148‑1 (MQ=255) tAAAACCACGCTCGAAGCGACAGTCAAAGAGCTGTGCGACAAAGCCGAAAAAATGGTACGTAGCGGCACCGTGCTGCTGGTGCTCTCCGACCGGAATATCGCTAAAGATCGCCTGCCGGTTCCAGCCCCGATGGCGGTTGGCGCGATc > 3:294258/1‑148 (MQ=255) aaaaCCACGCTCGAAGCGACAGTCAAAGAGCTGTGCGACAAAGCCGAAAAAATGGTACGTAGCGGCACCGTGCTGCTGGTGCTCTCCGACCGGAATATCGCTAAAGATCGCCTGCCGGTTCCAGCCCCGATGGCGGTTGGCGCGATc > 2:181871/1‑147 (MQ=255) aaaaCCACGCTCGAAGCGACAGTCAAAGAGCTGTGCGACAAAGCCGAAAAAATGGTACGTAGCGGCACCGTGCTGCTGGTGCTCTCCGACCGGAATATCGCTAAAGATCGCCTGCCGGTTCCAGCCCCGATGGCGGTTGGCGCGATc > 4:94942/1‑147 (MQ=255) aaaCCACGCTCGAAGCGACAGTCAAAGAGCTGTGCGACAAAGCCGAAAAAATGGTACGTAGCGGCACCGTGCTGCTGGTGCTCTCCGACCGGAATATCGCTAAAGATCGCCTGCCGGTTCCAGCCCCGATGGCGGTTGGCGCGATcc < 3:94942/147‑1 (MQ=255) aaaCCACGCTCGAAGCGACAGTCAAAGAGCTGTGCGACAAAGCCGAAAAAATGGTACGTAGCGGCACCGTGCTGCTGGTGCTCTCCGACCGGAATATCGCTAAAGATCGCCTGCCGGTTCCAGCCCCGATGGCGGTTGGCGCGATc < 7:5048/146‑1 (MQ=255) aCCACGCTCGAAGCGACAGTCAACCAGCTGTGCGACAAAGCCGAAAACATCGTACGTAGCGGCACCGTGCTGCAGGCGCTCTCCGACCGGAATATCGCTAAAGATCGCCTGCCGGGTCCAGCCCCGATGGCGGTTGGCGCGATCCAGa < 1:138472/148‑1 (MQ=255) aCCACGCTCGAAGCGACAGTCAAAGAGCTGTGCGACAAAGCCGAAAAAATGGTACGTAGCGGCACCGTGCTGCTGGTGCTCTCCGACCGGAATATCGCTAAAGATCGCCTGCCGGTTCCa < 1:204279/120‑1 (MQ=255) aCCACGCTCGAAGCGACAGTCAAAGAGCTGTGCGACAAAGCCGAAAAAATGGTACGTAGCGGCACCGTGCTGCTGGTGCTCTCCGACCGGAATATCGCTAAAGATCGCCTGCCGGTTCCa > 2:204279/1‑120 (MQ=255) cACGCTCGAAGCGACAGTCAAAGAGCTGTGCGACAAAGCCGAAAAAATGGTACGTAGCGGCACCGTGCTGCTGGTGCTCTCCGACCGGAATATCGCTAAAGATCGCCTGCCGGTTCCAGCCCCGATGGCGGTTGGCGCGATCCAGAcc > 3:246076/1‑148 (MQ=255) cACGCTCGAAGCGACAGTCAAAGAGCTGTGCGACAAAGCCGAAAAAATGGTACGTAGCGGCACCGTGCTGCTGGTGCTCTCCGACCGGAATATCGCTAAAGATCGCCTGCCGGTTCCAGCCCCGATGGCGGTTGGCGCGATCCAGAcc > 1:213427/1‑148 (MQ=255) cGCTCTAAGCGACAGTCAAAGAGCTTTGCTACAAAGCCGAAAAAATGGTACGTAGCGTCACCGTGCTGCTGGTGCTCTCCGACCAGAATATCGCTAAAGATCGCCTGCCGGTTCCAGCACCGATGTCGGTTGGCGCGATCCAGACCCg < 2:259939/148‑1 (MQ=255) gCTCGAAGCGACAGTCAAAGAGCTGTGCGACAAAGCCGAAAAAATGGTACGTAGCGGCACCGTGCTGCTGGTGCTCTCCGACCGGAATATCGCTAAAGATCGCCTGCCGGTTCCAGCCCCGATGGCGGTTGGCGCGATCCAGACCCGt < 1:173063/148‑1 (MQ=255) cGAAGCGACAGTCAAATAGCTGTGCGACAAAGACGAAAAAATGGTACGTAGCGGCACCGTGCTGCTGGTGCTCTCCGACCGGAATATCGCTAAAGATCGCCTGCCGGTTCCAGCCCCGATGGCGGTTGGCGCGATCCAGACCCGTCTg > 5:239877/1‑148 (MQ=255) cGACAGTCAAAGAGCTGTGCGACAAAGCCGAAAAAATGGTACGTAGCGGCACCGTGCTGCTGGTGCTCTCCGACCGGAATATCGCTAAAGATCGCCTGCCGGTTCCAGCCCCGATGGCGGTTGGCGCGATCCAGACCCGTCTGGTCGa < 1:48393/148‑1 (MQ=255) gTCAAAGAGCTGTGCGACAAAGCCGAAAAAATGGTACGTAGCGGCACCGTGCTGCTGGTGCTCTCCGACCGGAATATCGCTAAAGATCGCCTGCCGGTTCCAGCCCCGATGGCGGTTGGCGCGATCCAGACCCGTCTGGTCGATCa > 2:129680/1‑146 (MQ=255) aaaGAGCTGTGCGACAAAGCCGAAAAAATGGTACGTAGCGGCACCGTGCTGCTGGTGCTCTCCGACCGGAATATCGCTAAAGATCGCCTGCCGGTTCCAGCCCCGATGGCGGTTGGCGCGATCCAGACCCGTCTGGTCGATCAAAGcc > 7:132748/1‑148 (MQ=255) atgagCTGGGCGACAAAGCCGAAAAAATGGTACGTAGCGGCACCGGGCTGCTGGTGCTCTCCGACCGGAATATCGCTAAAGTTCGCCTGCCGGTTCCAGCCCCGATGGCGGTTGGCGCGATCCAGACCCGTCTGGTCGAGCAAAGCCt < 4:292888/146‑1 (MQ=255) agagCTGTGCGACAAAGCCGAAAAAATGGTACGTAGCGGCACCGTGCTGCTGGTGCTCTCCGACCGGAATATCGCTAAAGATCGCCTGCCGGTTCCAGCCCCGATGGCGGTTGGCGCGATCCAGACCCGTCTGGTCGATCAAAGCCTg < 2:38083/148‑1 (MQ=255) gCTGTGCGACAAAGCCGAAAAAATGGTACGTAGCGGCACCGTGCTGCTGGTGCTCTCCGACCGGAATATCGCTAAAGATCGCCTGCCGGTTCCAGCCCCGATGGCGGTTGGCGCGATCCAGACCCGTCTGGTCGATCAAAGCCTGCGt < 5:174285/148‑1 (MQ=255) tgCGACAAAGCCGAAAAAATGGTACGTAGCGGCACCGTGCTGCTGGTGCTCTCCGACCGGAATATCGCTAAAGATCGCCTGCCGGTTCCAGCCCCGATGGCGGTTGGCGCGATCCAGACCCGTCTGGTCGATCAAAGCCTGCGTTg < 2:56293/146‑1 (MQ=255) tgCGACAAAGCCGAAAAAATGGTACGTAGCGGCACCGTGCTGCTGGTGCTCTCCGACCGGAATATCGCTAAAGATCGCCTGCCGGTTCCAGCCCCGATGGCGGTTGGCGCGATCCAGACCCGTCTGGTCGATCAAAGCCTGCGTTGCg < 4:246076/148‑1 (MQ=255) gCGACAAAGCCGAAACAATGGTACGTAGCGGCACCGTGCGGCTGGTGCTCTCCGACCGGAATATCGCTAAAGATCGCCTGCCGGTTCCAGCCCCGATGGCGGTTGGCGCGATCCAGACCCGTCTGGTCGATCAAAGCCTGCGTTGCGa < 6:116500/148‑1 (MQ=255) cGACAAAGCCGAAAAAATGGTACGTAGCGGCACCGTGCTGCTGGTGCTCTCCGACCGGAATATCGCTAAAGATCGCCTGCCGGTTCCAGCCCCGATGGCGGTTGGCGCGATCCAGACCCGTCTGGTCGATCAAAGCCTGCGTTGCGa < 7:304915/147‑1 (MQ=255) aCAAAGCCGAAAAAATGGTACGTAGCGGCACCGTGCTGCTGGTGCTCTCCGACCGGAATATCGCTAAAGATCGCCTGCCGGTTCCAGCCCCGATGGCGGTTGGCGCGATCCAGACCCGTCTGGTCGATCAAAGCCTGCGTTGCGATGc > 4:19902/1‑148 (MQ=255) aaaGCCGAAAAAATGGTACGTAGCGGCACCGTGCTGCTGGTGCTCTCCGACCGGAATATCGCTAAAGATCGCCTGCCGGTTCCAGCCCCGATGGCGGTTGGCGCGATCCAGACCCGTCTGGTCGATCAAAGCCTGCGTTGCGa < 5:35046/143‑1 (MQ=255) aaaGCCGAAAAAATGGTACGTAGCGGCACCGTGCTGCTGGTGCTCTCCGACCGGAATATCGCTAAAGATCGCCTGCCGGTTCCAGCCCCGATGGCGGTTGGCGCGATCCAGACCCGTCTGGTCGATCAAAGCCTGCGTTGCGa > 6:35046/1‑143 (MQ=255) gCCGAAAAAATGGTACGTAGCGGCACCGTGCTGCTGGTGCTCTCCGACCGGAATATCGCTAAAGATCGCCTGCCGGTTCCAGCCCCGATGGCGGTTGGCGCGATCCAGACCCGTCTGGTCGATCAAAGCCTGCGTTGCGATGCCAAca > 6:88788/1‑148 (MQ=255) cGAAAAAATGGTACGTAGCGGCACCGTGCTGCTGGTGCTCTCCGACCAGAATATCGCTAAAGATCGCCTGCCGGTTCCAGCCCCGATGGCGGTTGGCGCGATCCAGACCCGTCTGGTCGATCAAAGCCTGCGTTGCGATGCCAAcatc < 7:32252/148‑1 (MQ=255) gAAAAAATGGTACGTAGCGGCACCGTGCTGCTGGTGCTCTCCGACCGGAATATCGCTAAAGATCGCCTGCCGGTTCCAGCCCCGATGGCGGTTGGCGCGATCCAGACCCGTCTGGTCGATCAAAGCCTGCGTTGCGATGCCAAcatca > 4:144536/1‑148 (MQ=255) aaaaaaTGGTACGTAGCGGCACCGTGCTGCTGGTGCTCTCCGACCGGAATATCGCTAAAGATCGCCTGCCGGTTCCAGCCCCGATGGCGGTTGGCGCGATCCAGACCCGTCTGGTCGATCAAAg > 8:306685/1‑124 (MQ=255) aaaaaaTGGTACGTAGCGGCACCGTGCTGCTGGTGCTCTCCGACCGGAATATCGCTAAAGATCGCCTGCCGGTTCCAGCCCCGATGGCGGTTGGCGCGATCCAGACCCGTCTGGTCGATCAAAg < 7:306685/124‑1 (MQ=255) aaaaaaTGGTACGTAGCGGCACCGTGCTGCTGGTGCTCTCCGACCGGAATATCGCTAAAGATCGCCTGCCGGTTCCAGCCCCGATGGCGGTTGGCGCGATCCAGACCCGTCTGGTCGATCAAAGCCTGCGTTGCGATGCCAAcatcat < 2:213427/148‑1 (MQ=255) aaaaTGGTACGTAGCGGCACCGTGCTGCTGGTGCTCTCCGACCGGAATATCGCTAAAGATCGCCTGCCGGTTCCAGCCCCGATGGCGGTTGGCGCGATCCAGACCCGTCTGGTCGATCAAAGCCTGCGTTGCGATGCCAACATCAtcg < 3:101855/148‑1 (MQ=255) aaaTGGTACGTAGCGGCACCGTGCTGCTGGTGCTCTCCGACCGGAATATCGCTAAAGATCGCCTGCCGGTTCCAGCCCCGATGGCGGTTGGCGCGATCCAGACCCGTCTGGTCGATCAAAGCCTGCGTTGCGATGCCAACATCAtcgt < 3:144536/148‑1 (MQ=255) aGCGGCACCGTGCTGCTGGTGCTCTCCGACCGGAATATCGCTAAAGATCGCCTGCCGGTTCCAGCCCCGATGGCGGTTGGCGCGATCCAGACCCGTCTGGTCGAt > 6:253509/1‑105 (MQ=255) aGCGGCACCGTGCTGCTGGTGCTCTCCGACCGGAATATCGCTAAAGATCGCCTGCCGGTTCCAGCCCCGATGGCGGTTGGCGCGATCCAGACCCGTCTGGTCGAt < 5:253509/105‑1 (MQ=255) gctgGTGCTCTCCGACCGGAATATCGCTAAAGATCGCCTGCCGGTTCCAGCCCCGATGGCGGTTGGCGCGATCCAGACCCGTCTGGTCGATCAAAGCCTGCGTTGCGATGCCAACATCATCGTCGAAACCGCCAGCGCCCGCGATCCg > 3:55772/1‑148 (MQ=255) gTGCTCTCCGACCGGAATATCGCTAAAGATCGCCTGCCGGTTCCAGCCCCGATGGCGGTTGGCGCGATCCAGACCCGTCTGGTCGATCAAAGCCTGCGTTGCGATGCCAACATCATCGTCGAAACCGCCAGCGCCCGCGATCCGca < 4:55772/146‑1 (MQ=255) gTGCTCTCCGACCGGAATATCGCTAAAGATCGCCTGCCGGTTCCAGCCCCGATGGCGGTTGGCGCGATCCAGACCCGTCTGGTCGATCAAAGCCTGCGTTGCGATGCCAACATCATCGTCGAAACCGCCAGCGCCCGCGATCCGca < 1:129680/146‑1 (MQ=255) tGCTCTCCGACCGGAATATCGCTAAAGATCGCCTGCCGGTTCCAGCCCCGATGGCGGTTGGCGCGATCCAGACCCGTCTGGTCGCTCAAAGCCTGCGTTGCGATGCCAACATCATCGTCGAAACCGCCAGCGCCCGCGATCCGcacca > 1:297663/1‑148 (MQ=255) ctctCCGACCGGAATATCGCTAAAGATCGCCTGCCGGTTCCAGCCCCGATGGCGGTTGGCGCGATCCAGACCCGTCTGGTCGATCAAAGCCTGCGTTGCGATGCCAACATCATCGTCGAAACCGCCAGCGCCCGCGATCCGCACCACt < 1:129041/148‑1 (MQ=255) ctcCGACCGGAATATCGCTAAAGATCGCCTGCCGGTTCCAGCCCCGATGGCGGTTGGCGCGATCCAGACCCGTCTGGTCGATCAAAGCCTGCGTTGCGATGCCAACATCATCGTCGAAACCGCCAGCGCCCGCGATCCGc < 1:97279/140‑1 (MQ=255) ctcCGACCGGAATATCGCTAAAGATCGCCTGCCGGTTCCAGCCCCGATGGCGGTTGGCGCGATCCAGACCCGTCTGGTCGATCAAAGCCTGCGTTGCGATGCCAACATCATCGTCGAAACCGCCAGCGCCCGCGATCCGc > 2:97279/1‑140 (MQ=255) tcCGACCGGAATATCGCTAAAGATCGCCTGCCGGTTCCAGCCCCGATGGCGGTTGGCGCGATCCAGACCCGTCTGGTCGATCAAAGCCTGCGTTGCGATGCCAACATCATCGTCGAAACCGCCAGCGCCCGCGATCCGCACCACtt < 4:294258/146‑1 (MQ=255) tcCGACCGGAATATCGCTAAAGATCGCCTGCCGGTTCCAGCCCCGATGGCGGTTGGCGCGATCCAGACCCGTCTGGTCGATCAAAGCCTGCGTTGCGATGCCAACATCATCGTCGAAACCGCCAGCGCCCGCGATCCGCACCACTTCg > 1:45891/1‑148 (MQ=255) ccGACCGGAATATCGCTAAAGATCGCCTGCCGGTTCCAGCCCCGATGGCGGTTGGCGCGATCCAGACCCGTCTGGTCGATCAAAGCCTGCGTTGCGATGCCAACATCATCGTCGAAACCGCCAGCGCCCGCGATCCGCACCACTTCGc > 5:191168/1‑148 (MQ=255) cGACCGGAATATCGCTAAAGATCGCCTGCCGGTTCCAGCCCCGATGGCGGTTGGCGCGATCCAGACCCGTCTGGTCGATCAAAGCCTGCGTTGCGATGCCAACATCATCGTCGAAACCGCCAGCGCCCGCGATCCGCACCACTTCGcc < 6:2549/148‑1 (MQ=255) gACCGGAATATCGCTAAAGATCGCCTGCCGGTTCCAGCCCCGATGGCGGTTGGCGCGATCCAGACCCGTCTGGTCGATCAAAGCCTGCGTTGCGATGCCAACATCATCGTCGAAACCGCCAGCGCCCGCGATCCGCACCACTTCGCCg > 7:332701/1‑148 (MQ=255) ccGGAATATCGCTAAAGATCGCCTGCCGGTTCCAGCCCCGATGGCGGTTGGCGCGATCCAGACCCGTCTGGTCGATCAAAGCCTGCGTTGCGATGCCAACATCATCGTCGAAACCGCCAGCGCCCGCGATCCGCACCACTTCGCCgtg > 2:282966/1‑148 (MQ=255) ggAATATCGCTAAAGATCGCCTGCCGGTTCCAGCCCCGATGGCGGTTGGCGCGATCCAGACCCGTCTGGTCGATCAAAGCCTGCGTTGCGATGCCAACATCATCGTCGAAACCGCCAGCGCCCGCGATCCGCACCACTTCGCCGTGtt > 4:194517/1‑148 (MQ=255) ggAATATCGCTAAAGATCGCCTGCCGGTTCCAGCCCCGATGGCGGTTGGCGCGATCCAGACCCGTCTGGTCGATCAAAGCCTGCGTTGCGATGCCAACATCATCGTCGAAACCGCCAGCGCCCGCGATCCGCACCACTTCGCCGTGtt < 3:18875/148‑1 (MQ=255) | GATGAAAGAGGAGCACTACCGCGCAGATACGCTGGATATCACCTTTGACGTCACTAAAACCACGCTCGAAGCGACAGTCAAAGAGCTGTGCGACAAAGCCGAAAAAATGGTACGTAGCGGCACCGTGCTGCTGGTGCTCTCCGACCGGAATATCGCTAAAGATCGCCTGCCGGTTCCAGCCCCGATGGCGGTTGGCGCGATCCAGACCCGTCTGGTCGATCAAAGCCTGCGTTGCGATGCCAACATCATCGTCGAAACCGCCAGCGCCCGCGATCCGCACCACTTCGCCGTGTT > NC_000913/3356425‑3356718 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |