| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,673,113 | G→A | 5.1% | A234T (GCC→ACC) | yhjC → | LysR family putative transcriptional regulator |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,673,113 | 0 | G | A | 5.1% | 262.8 / 2.8 | 78 | A234T (GCC→ACC) | yhjC | LysR family putative transcriptional regulator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (38/36); new base A (2/2); total (40/38) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.43e-01 | |||||||||||
TTCACACGCAATAGTGCGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCAGCGTTAATGGCGTCCAGTGGTTTAAGTCTGGCGGCATGTTGACGGTAAACAGTAGCGAAAACTATCTCACCGCCGGTCTTGCCGGTCTGGGGATTATTCAGATCCCGCGCATTGCCGTGCGCGAAGCCCTGCGTGCCGGGCGGCTTATTGAAGTATTACCTGGCTACCGTGCCGAGCCGCTCTCCCTTTCGCTGGTTTATCCGCAGCGTCGGGAGCTTTCCCGG > NC_000913/3672968‑3673256 | ttCACACGCAATAGTGCGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCAGCGTTAATGGCGTCCAGTGGTTTAAGTCTGGCGGCATGTTGACGGTAAACAGTAGCGAAAACTATCTCACCGCCGGTCTTGcc > 6:64640/1‑148 (MQ=255) tCACACGCAATAGTGCGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCAGCGTTAATGGCGTCCAGTGGTTTAAGTCTGGCGGCATGTTGACGGTAAACAGTAGCGAAAACTATCTCACCGCCGGTCTTGCCg > 3:30220/1‑148 (MQ=255) cGCAATAGTGCGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCAGCGTTAATGGCGTCCAGTGGTTTAAGTCTGGCGGCATGTTGACGGTAAACAGTAGCGAAAACTATCTCACCGCCGGTCTTGCCGGTCTg < 4:99065/148‑1 (MQ=255) cGCAATAGTGCGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCAGCGGTAATGGCGTCCAGTGGTTTAAGTCTGGCGGCATGTTGACGGTAAACAGTAGCGAAAACTATCTCACCGCCGGTCTTGCCGGTCTg < 3:12186/148‑1 (MQ=255) cAATAGTGCGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCAGCGTTAATGGCGTCCAGTGGTTTAAGTCTGGCGGCATGTTGACGGTAAACAGTAGCGAAAACTATCTCACCGCCGGTCTTGCCGGTCTggg > 4:10659/1‑148 (MQ=255) cAATAGTGCGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCAGCGTTAATGGCGTCCAGTGGTTTAAGTCTGGCGGCATGTTGACGGTAAACAGTAGCGAAAACTATCTCACCGCCGGTCTTGCCGGTCTggg < 4:30220/148‑1 (MQ=255) cAATAGTGCGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCAGCGTTAATGGCGTCCAGTGGTTTAAGTCTGGCGGCATGTTGACGGTAAACAGTAGCGAAAACTATCTCACCGCCGGTCTTGCCGGTCTggg < 2:37149/148‑1 (MQ=255) aTAGTGCGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCAGCGTTAATGGCGTCCAGTGGTTTAAGTCTGGCGGCATGTTGACGGTAAACAGTAGCGAAAACTATCTCACCGCCGGTCTTGCCGGTCTGGGGa > 3:124115/1‑148 (MQ=255) gTGCGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCAGCGTTAATGGCGTCCAGTGGTTTAAGTCTGGCGGCATGTTGACGGTAAACAGTAGCGAAAACTATCTCACCGCCGGTCTTGCCGGTCTGGGGatt < 1:115238/147‑1 (MQ=255) gCGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCAGCGTTAATGGCGTCCAGTGGTTTAAGTCTGGCGGCATGTTGACGGTAAACAGTAGCGAAAACTATCTCACCGCCGGTCTTGCCGGTCTGGGGattatt > 1:8558/1‑148 (MQ=255) cGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCAGCGTTAATGGCGTCCAGTGGTTTAAGTCTGGCGGCATGTTGACGGTAAACAGTAGCGAAAACTATCTCACCGCCGGTCTTGCCGGTCTGGGGattatt < 6:127683/147‑1 (MQ=255) cGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCAGCGTTAATGGCGTCCAGTGGTTTAAGTCTGGCGGCATGTTGACGGTAAACAGTAGCGAAAACTATCTCACCGCCGGTCTTGCCGGTCTGGGGattatt < 4:124115/147‑1 (MQ=255) cGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCAGCGTTAATGGCGTCCAGGGGTTTAAGTCTGGCGGCATGTTGACGGTAAACAGTAGCGAAAACTATCTCACCGCCGGTCTTGCCGGTCTGGGGATTATTc < 3:92338/148‑1 (MQ=255) gTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCAGCGTTAATGGCGTCCAGTGGTTTAAGTCTGGCGGCATGTTGACGGTAAACAGTAGCGAAAACTATCTCACCGCCGGTCTTGCCGGTCTGGGGATTATTCa < 6:179875/148‑1 (MQ=255) ataCACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCAGCGTTAATGGCGTCCAGTGGTTTAAGTCTGGCGGCATGTTGACGGTAAACAGTAGCGAAAACTATCTCACCGCCGGTCTTGCCGGTCTGGGGattatt > 8:205364/1‑143 (MQ=255) taCACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCAGCGTTAATGGCGTCCAGTGGTTTAAGTCTGGCGGCATGTTGCCGGTAAACAGTAGCGAAAACTATCTCACCGCCGGTCTTGCCGGTCTGGGGATTATTCAGATc > 3:73926/1‑148 (MQ=255) cacCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCAGCGTTAATGGCGTCCAGTGGGTTAAGTCTGGCGGCATGTTGACGGTAAACAGTAGCGAAACCTATCTCACCGCCGGTCTTGCCGGTCTGGGGATTATTCAGATcc < 2:272365/147‑1 (MQ=255) cGCCCCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCAGCGTTAATGGCGTCCAGTGGTTTAAGTCTGGCGGCATGTTGACGGTAAACAGTAGCGAAAACTATCTCACCGCCGGTCTTGCCGGTCTGGGGATTATTCAGATCCcgcg > 6:34490/1‑148 (MQ=255) gccccTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCAGCGTTAATGGCGTCCAGTGGTTTAAGTCTGGCGGCATGTTGACGGTAAACAGTAGCGAAAACTATCTCACCGCCGGTCTTGCCGGTCTGGGGATTATTCAGATCCCgcgc < 4:42710/145‑1 (MQ=255) gCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCAGCGTTAATGGCGTCCAGTGGTTTAAGTCTGGCGGCATGTTGACGGTAAACAGTAGCGAAAACTATCTCACCGCCGGTCTTGCCGGTCTGGGGATTATTCAGATCCcgcg > 2:167266/1‑147 (MQ=255) gCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCAGCGTTAATGGCGTCCAGTGGTTTAAGTCTGGCGGCATGTTGACGGTAAACAGTAGCGAAAACTATCTCACCGCCGGTCTTGCCGGTCTGGGGATTATTCAGATCCCgcgc < 7:205364/148‑1 (MQ=255) cACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCAGCGTTAATGGCGTCCAGTGGTTTAAGTCTGGCGGCATGTTGACGGTAAACAGTAGCGAAACCTATCTCACCGCCGGTCTTACCGGTCTGGGGATTATTCAGATCCCGCGCa > 1:76164/1‑148 (MQ=255) cACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCAGCGTTAATGGCGTCCAGTGGTTTAAGTCTGGCGGCATGTTGACGGTAAACAGTAGCGAAAACTATCTCACCGCCGGTCTTGCCGGTCTGGGGATTATTCAGATCCCGCGCa < 1:226628/148‑1 (MQ=255) tGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCAGCGTTAATGGCGTCCAGTGGTTTAAGTCTGGCGGCATGTTGACGGTAAACAGTAGCGAAAACTATCTCACCGCCGGTCTTGCCGGTCTGGGGATTATTCAGATCCCGCGCATTGc > 1:163377/1‑148 (MQ=255) tACATCCGTAAGGTTTTGAGGTTGCCAGCGTTAATGGCGTCCAGTGGTTTAAGTCTGGCGGCATGTTGACGGTAAACAGTAGCGAAAACTATCTCACCGCCGGTCTTGCCGGTCTGGGGATTATTCAGATCCCGCGCATTGCCGTgcg < 1:272291/148‑1 (MQ=255) ttAGGTTTTGAGGTTGCCAGCGTTAATGGCGTCCAGTGGTTTAAGTCTGGCGGCATGTTGACGGTAAACAGTAGCGAAAACTATCTCACCGCCGGTCTTACCGGTCTGGGGATTATTCAGATCCCGCGCATTGCCGTGCGCGAAGccc > 3:260398/1‑148 (MQ=255) gTTTTGAGGTTGCCAGCGTTAATGGCGTCCAGTGGTTTAAGTCTGGCGGCATGTTGACGGTAAACAGTAGCGAAAACTATCTCACCGCCGGTCTTGCCGGTCTGGGGATTATTCAGATCCCGCGCATTGCCGTGCGCGAAGCCCTGCg < 1:167266/148‑1 (MQ=255) tttGAGGTTGCCAGCGTTAATGGCGTCCAGTGGTTTAAGTCTGGCGGCATGTTGACGGTAAACAGTAGCGAAAACTATCTCACCGCCGGTCTTGCCGGTCTGGGGATTATTCAGATCCCGCGCATTGCCGTGCGCGAAGCCCTGCGTg > 7:160720/1‑148 (MQ=255) gTTGCCAGCGTTAATGGCGTCCAGTGGTTTAAGTCTGGCGGCATGTTGACGGTAAACAGTAGCGAAAACTATCTCACCGCCGGTCTTGCCGGTCTGGGGATTATTCAGATCCCGCGCATTGCCGTGCGCGAAGCCCTGCGTGCCGggc < 6:144710/148‑1 (MQ=255) aGCGTTAATGGCGTCCAGTGGTTTAAGTCTGGCGGCATGTTGACGGTAAACAGTAGCGAAAACTATCTCACCGCCGGTCTTGCCGGTCTGGGGATTATTCAGATCCCGCGCATTGCCGTGCGCGAAGCCCTGCGTGCCGGGCGGCTTa > 3:85288/1‑148 (MQ=255) gCGTTAATGGCGTCCAGTGGTTTAAGTCTGGCGGCATGTTGACGGTAAACAGTAGCGAAAACTATCTCACCGCCGGTCTTGCCGGTCTGGGGATTATTCAGATCCCGCGCATTGCCGTGCGCGAAGCCCTGCGTGCCGGGCGGCTTAt < 8:160720/148‑1 (MQ=255) gTTAATGGCGTCCAGTGGTTTAAGTCTGGCGGCATGTTGACGGTAAACAGTAGCGAAAACTATCTCACCGCCGGTCTTACCGGTCTGGGGATTATTCAGATCCCGCGCATTGCCGTGCGCGAAGCCCTGCGTGCCGGGCGGCTTATTg < 2:76164/148‑1 (MQ=255) ttAATGGCGTCCAGTGGTTTAAGTCTGGCGGCATGTTGACGGTAAACAGTATCGAAAACTATCTCACCGCCGGTCTTGCCGGTCTGGGGATTATTCAGATCCCGCGCATTGCCGTGCGCGAAGCCCTGCGTGCCGGGCGGCTTATTGa < 2:57032/148‑1 (MQ=255) ttAATGGCGTCCAGTGGTTTAAGTCTGGCGGCATGTTGACGGTAAACAGTAGCGAAAACTATCTCACCGCCGGTCTTGCCGGTCTGGGGATTATTTAGATCCCGCGCATTGCCGTGCGCGAAGCCCTGCGTGCCGGGCGGCTTATTGa < 5:64640/148‑1 (MQ=255) ttAATGGCGTCCAGTGGTTTAAGTCTGGCGGCATGTTGACGGTAAACAGTAGCGAAAACTATCTCACCGCCGGTCTTGCCGGTCTGGGGATTATTCAGATCCCGCGCATTGCCGTGCGCGAAGCCCTGCGTGCCGGGCGGCTTATTGa < 2:8558/148‑1 (MQ=255) aTGGCGTCCAGTGGTTTAAGGCTGGCGGCATGTTGACGGGAAACAGTAGCGAAAACTATCTCACCGCCGGGCTTGCCGGTCGGGGGATTATTCAGATCCCGCTCATTGCCGTGCGCGAAGCCCTGCGTGCCGGGCGGCTTATTGAAGt < 5:34490/148‑1 (MQ=255) tGGCGTCCAGTGGTTTAAGTCTGGCGGCATGTTGACGGTAAACAGTAGCGAAAACTATCTCACCGCCGGTCTTGCCGGTCTGGGGATTATTCAGATCCCGCGCATTGCCGTGCGCGAAGCCCTGCGTGCCGGGCGGCTTATTGAAGTa > 8:3149/1‑148 (MQ=255) cGTCCAGTGGTTTAAGTCTGGCGGCATGTTGACGGTAAACAGTAGCGAAAACTATCTCACCGCCGGTCTTGCCGGTCTGGGGATTATTCAGATCCCGCGCATTGCCGTGCGCGAAGCCCTGCGTGCCGGGCGGCTTATTGAAGTAtt > 4:196419/1‑147 (MQ=255) cGTCCAGTGGTTTAAGTCTGGCGGCATGTTGACGGTAAACAGTAGCGAAAACTATCTCACCGCCGGTCTTACCGGTCTGGGGATTATTCAGATCCCGCGCATTGCCGTGCGCGAAGCCCTGCGTGCCGGGCGGCTTATTGAAGTATTa < 4:260398/148‑1 (MQ=255) cGTCCAGTGGGTTAAGTCTGGCGGCATGTTGACGGAAAACCGTAGCGAAAACTATCTCACCGCCGGTCTTGCCGGTCTGGGGATTATTCAGATCCCGCGCAATGCCGTGCGCGAAGCCCTGCGTGCCGGGCGGCTTATTGAAGTATTa < 5:34372/148‑1 (MQ=255) tCCAGTGGTTTAAGTCTGGCGGCATGTTGACGGTAAACAGTAGCGAAAACTATCTCACCGCCGGTCTTGCCGGTCTGGGGATTATTCAGATCCCGCGCATTGCCGTGCGCGAAGCCCTGCGTGCCGGGCGGCTTATTGAAGTATTAcc > 1:132635/1‑148 (MQ=255) ccAGTGGTTTAAGTCTGGCGGCATGTTGACGGTAAACAGTAGCGAAAACTATCTCACCGCCGGTCTTGCCGGTCTGGGGATTATTCAGATCCCGCGCATTGCCGTGCGCGAAGCCCTGCGTGCCGGGCGGCTTATTGAAGTATTa > 4:278079/1‑145 (MQ=255) ccAGTGGTTTAAGTCTGGCGGCATGTTGACGGTAAACAGTAGCGAAAACTATCTCACCGCCGGTCTTGCCGGTCTGGGGATTATTCAGATCCCGCGCATTGCCGTGCGCGAAGCCCTGCGTGCCGGGCGGCTTATTGAAGTATTa < 3:278079/145‑1 (MQ=255) gTGGTTTAAGTCTGGCGGCATGTTGACGGTAAACAGTAGCGAAAACTATCTCACCGCCGGTCTTGCCGGTCTGGGGATTATTCAGATCCCGCGCATTGCCGTGCGCGAAGCCCTGCGTGCCGGGCGGCTTATTGAAGTATTAcc < 1:27522/144‑1 (MQ=255) gTGGTTTAAGTCTGGCGGCATGTTGACGGTAAACAGTAGCGAAAACTATCTCACCGCCGGTCTTGCCGGTCTGGGGATTATTCAGATCCCGCGCATTGCCGTGCGCGAAGCCCTGCGTGCCGGGCGGCTTATTGAAGTATTAcc > 2:27522/1‑144 (MQ=255) tGGTTTAAGTCTGGCGGCATGTTGACGGTAAACAGTAGCGAAAACTTTCTCACCGCCGGTCTTGCCGGTCTGGGGATTATTCAGATCCCGCGCATTGCCGTGCGCGAAGCCCTGCGTGCCGGGCGGCTTATTGAAGTa > 5:152170/1‑138 (MQ=255) tGGTTTAAGTCTGGCGGCATGTTGACGGTAAACAGTAGCGAAAACTATCTCACCGCCGGTCTTGCCGGTCTGGGGATTATTCAGATCCCGCGCATTGCCGTGCGCGAAGCCCTGCGTGCCggg < 8:98255/123‑1 (MQ=255) tGGTTTAAGTCTGGCGGCATGTTGACGGTAAACAGTAGCGAAAACTATCTCACCGCCGGTCTTGCCGGTCTGGGGATTATTCAGATCCCGCGCATTGCCGTGCGCGAAGCCCTGCGTGCCggg > 7:98255/1‑123 (MQ=255) tGGTTTAAGTCTGGCGGCATGTTGACGGTAAACAGTAGCGAAAACTATCTCACCGCCGGTCTTGCCGGTCTGGGGATTATTCAGATCCCGCGCATTGCCGTGCGCGAAGCCCTGCGTGCCGGGCGGCTTATTGAAGTa < 6:152170/138‑1 (MQ=255) gTCTGGCGGCATGTTGACGGTAAACAGTAGCGAAAACTATCTCACCGCCGGTCTTGCCGGTCTGGGGATTATTCAGATCCCGCGCATTGCCGTGCGCGAAGCCCTGCGTGCCGGGCGGCTTATTGAAGTATTACCTGGCTACCGTGcc > 6:15340/1‑148 (MQ=255) tGTTGACGGTAAACAGTAGCGAAAACTATCTCACCGCCGGTCTTGCCGGTCTGGGGATTATTCAGATCCCGCGCATTGCCGTGCGCGAAGCCCTGCGTGCCGGGCGGCTTATTGAAGTATTACCTGGCTACCGTGCCGAGCCGCtctc > 3:71810/1‑148 (MQ=255) gTTGACGGTAAACAGTAGCGAAAACTATCTCACCGCCGGTCTTGCCGGTCTGGGGATTATTCAGATCCCGCGCATTGCCGTGCGCGAAGCCCTGCGTGCCGGGCGGCTTATTGAAGTATTACCTGGCTACCGTGCCGAGCCGCTCTcc > 2:275578/1‑148 (MQ=255) gTTGACGGTAAACAGTAGCGAAAACTATCTCACCGCCGGTCTTGCCGGTCTGGGGATTATTCAGATCCCGCGCATTGCCGTGCGCGAAGCCCTGCGTGCCGGGCGGCTTATTGAAGTATTACCTGGCTACCGTGCCGAGCCGCTCTcc > 6:83667/1‑148 (MQ=255) aCGGTAAACAGTAGCGAAAACTATCTCACCGCCGGTCTTGCCGGTCTGGGGATTATTCAGATCCCGCGCATTGCCGTGCGCGAAGCCCTGCGTGCCGGGCGGCTTATTGAAGTATTACCTGGCTACCGTGCCGAGCCGCTCTCCCttt > 1:220386/1‑148 (MQ=255) aCGGTAAACAGTAGCGAAAACTATCTCACCGCCGGTCTTGCCGGTCTGGGGATTATTCAGATCCCGCGCATTGCCGTGCGCGAAGCCCTGCGTGCCGGGCGGCTTATTGAAGTATTACCTGGCTACCGTGCCGAGCCGCTCTCCCttt < 4:85288/148‑1 (MQ=255) cGGTAAACAGTAGCGAAAACTATCTCACCGCCGGTCTTGCCGGTCTGGGGATTATTCAGATCCCGCGCATTGCCGTGCGCGAAGCCCTGCGTGCCGGGCGGCTTATTGAAGTATTACCTGGCTACCGTGCCGAGCCGCTCTCCCTTTc > 6:195182/1‑148 (MQ=255) tAAACAGTAGCGAAAACTATCTCACCGCCGGTCTTGCCGGTCTGGGGATTATTCAGATCCCGCGCATTGCCGTGCGCGAAGCCCTGCGTGCCGGGCGGCTTATTGAAGTATTACCTGGCTACCGTGCCGAGCCGCTCTCCCTTTCGCt < 8:257376/148‑1 (MQ=255) tAAACAGTAGCGAAAACTATCTCACCGCCGGTCTTGCCGGTCTGGGGATTATTCAGATCCCGCGCATTGCCGTGCGCGAAGCCCTGCGTGCCGGGCGGCTTATTGAAGTATTACCTGGCTACCGTGCCGAGCCGCTCTCCCTTTCGCt > 6:195682/1‑148 (MQ=255) aaCAGTAGCGAAAACTATCTCACCGCCGGTCTTGCCGGTCTGGGGATTATTCAGATCCCGCGCATTGCCGTGCGCGAAGCCCTGCGTGCCGGGCGGCTTATTGAAGTATTACCTGGCTACCGTGCCGAGCCGCTCTCCCTTTCGCTgg < 3:10659/148‑1 (MQ=255) cAGTAGCGAAAACTATCTCACCGCCGGTCTTGCCGGTCTGGGGATTATTCAGATCCCGCGCATTGCCGTGCGCGAAGCCCTGCGTGCCGGGCGGCTTATTGAAGTATTACCTGGCTACCGTGCCGAGCCGCTCTCCCTTTCGCTGGtt > 6:109683/1‑148 (MQ=255) cGAAAACTATCTCACCGCCGGTCTTGCCGGTCTGGGGATTATTCAGATCCCGCGCATTGCCGTGCGCGAAGCCCTGCGTGCCGGGCGGCTTATTGAAGTATTACCTGGCTACCGTGCCGAGCCGCTCTCCCtt > 7:147997/1‑133 (MQ=255) cGAAAACTATCTCACCGCCGGTCTTGCCGGTCTGGGGATTATTCAGATCCCGCGCATTGCCGTGCGCGAAGCCCTGCGTGCCGGGCGGCTTATTGAAGTATTACCTGGCTACCGTGCCGAGCCGCTCTCCCtt < 8:147997/133‑1 (MQ=255) cGAAAACTATCTCACCGCCGGTCTTGCCGGTCTGGGGATTATTCAGATCCCGCGCATTGCCGTGCGCGAAGCCCTGCGTGCCGGGCGGCTTATTGAAGTATTACCTGGCTACCGTGCCGAGCCGCTCTCCCTTTCGCTGGTTTATCCg > 8:158961/1‑148 (MQ=255) gAAAACTATCTCACCGCCGGTCTTGCCGGTCTGGGGATTATTCAGATCCCGCGCATTGCCGTGCGCGAAGCCCTGCGTGCCGGGCGGCTTATTGAAGTATTACCTGGCTACCGTGCCGAGCCGCTCTCCCTTTCGCTGGTTTATCCGc < 2:132635/148‑1 (MQ=255) aaaCTATCTCACCGCCGGTCTTGCCGGTCTGGGGATTATTCAGATCCCGCGCATTGCCGTGCGCGAAGCCCTGCGTGCCGGGCGGCTTATTGAAGTATTACCTGGCTACCGTGCCGAGCCGCTCTCCCTTTCGCTGGTTTATCCGCAg > 3:227677/1‑148 (MQ=255) aaaCTATCTCACCGCCGGTCTTGCCGGTCTGGGGATTATTCAGATCCCGCGCATTGCCGTGCGCGAAGCACTGCGTGCCGGGCGGCTTATTGAAGTATTACCTGGCTACCGTGCCGAGCCGCTCTCCCTTTCGCTGGTTTATCCGCAg > 7:177012/1‑148 (MQ=255) aaCTATCTCACCGCCGGTCTTGCCGGTCTGGGGATTATTCAGATCCCGCGCATTGCCGTGCGCGAAGCCCTGCGTGCCGGGCGGCTTATTGAAGTATTACCTGGCTACCGTGCCGAGCCGCTCTCCCTTTCGCTGGTTTATCCGCAGc > 6:304216/1‑148 (MQ=255) aTCTCACCGCCGGTCTTGCCGGTCTGGGGATTATTCAGATCCCGCGCATTGCCGTGCGCGAAGCCCTGCGTGCCGGGCGGCTTATTGAAGTATTACCTGGCTACCGTGCCGAGCCGCTCTCCCTTTCGCTGGTTTATCCGCAGCGTCg > 8:335381/1‑148 (MQ=255) tctcACCGCCGGTCTTGCCGGTCTGGGGATTATTCAGATCCCGCGCATTGCCGTGCGCGAAGCCCTGCGTGCCGGGCGGCTTATTGAAGTATTACCTGGCTACCGTGCCGAGCCGCTCTCCCTTTCGCTGGTTTATCCGCAGCGTCg < 5:83667/147‑1 (MQ=255) gctcACCGCCGGTCTTGCCGGGCTGGGGATTATTCAGATCCCGCGCATTGCCGTGCGCGAAGCCCTGCGTGCCGGGCGGCTTATTGAAGTATTACCTGGCGACCGTGCCGAGCCGCTCTCCCTTTCGCTGGGTTATCCGCAGCGTCg < 1:235908/146‑1 (MQ=255) ctcACCGCCGGTCTTGCCGGTCTGGGGATTATTCAGATCCCGCGCATTGCCGTGCGCGAAGCCCTGCGTGCCGGGCGGCTTATTGAAGTATTACCTGGCGACCGTGCCGAGCCGCTCTCCCTTTCGCTGGTTTATCCGCAGCGTCggg > 3:245333/1‑148 (MQ=255) aCCGCCGGTCTTGCCGGTCTGGGGATTATTCAGATCCCGCGCATTGCCGTGCGCGAAGCCCTGCGTGCCGGGCGGCTTATTGAAGTATTACCTGGCTACCGTGCCGAGCCGCTCTCCCTTTCGCTGGTTTATCCGCAGCGTCGGGAGc > 8:167889/1‑148 (MQ=255) gccgGTCTTGCCGGTCTGGGGATTATTCAGATCCCGCGCATTGCCGTGCGCGAAGCCCTGCGTGCCGGGCGGCTTATTGAAGTATTACCTGGCTACCGTGCCGAGCCGCTCTCCCTTTCGCTGGTTTATCCGCAGCGTCGGGAGCttt > 1:109673/1‑148 (MQ=255) gccgGTCTTGCCGGTCTGGGGATTATTCAGATCCCGCGCATTGCAGTGCGCGAAGCCCTGCGTGCCGGGCGGCTTATTGAAGTATTACCTGGCTACCGTGCCGAGCCGCTCTCCCTTTCGCTGGTTTATTCGCAGCGTCGGGAGCttt < 2:163377/148‑1 (MQ=255) cgGTCTTGCCGGTCTGGGGATTATTCAGATCCCGCGCATTGCCGTGCGCGAAGCCCTGCGTGCCGGGCGGCTTATTGAAGTATTACCTGGCTACCGTGCCGAGCCGCTCTCCCTTTCGCTGGTTTATCCGCAGCGTCGGGAGCTTTcc < 1:85664/148‑1 (MQ=255) gTCTTGCCGGTCTGGGGATTATTCAGATCCCGCGCATTGCCGTGCGCGAAGCCCTGCGTGCCGGGCGGCTTATTGAAGTATTACCTGGCTACCGTGCCGAGCCGCTCTCCCTTTCGCTGGTTTATCCGCAGCGTCGGGAGCTTTCCCg > 7:54956/1‑148 (MQ=255) tCTTGCCGGTCGGGGGATTCTTCAGATCCCGCGCATGGCCGTGCGCGAAGCCCTGCGTGCCGGGCGGCTTATTGAAGTATTACCTGGCTACCGTGCCGAGCCGCTCTCCCTTTCGCTGGTTTATCCGCAGCGTCGGGAGCTTTCCCgg < 4:73926/148‑1 (MQ=255) tCTTGCCGGTATGGGGATTATTCAGATCCCGCGCATTGCCGTGCGCGAAGCCCTGCGTGCCGGGCGGCTTATTGAAGTATTACCTGGCTACCGTGCCGAGCCGCTCTCCCTTTCGCTGGTTTATCCGCAGCGTCGGGAGCTTTCCCgg > 2:88965/1‑148 (MQ=255) | TTCACACGCAATAGTGCGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCAGCGTTAATGGCGTCCAGTGGTTTAAGTCTGGCGGCATGTTGACGGTAAACAGTAGCGAAAACTATCTCACCGCCGGTCTTGCCGGTCTGGGGATTATTCAGATCCCGCGCATTGCCGTGCGCGAAGCCCTGCGTGCCGGGCGGCTTATTGAAGTATTACCTGGCTACCGTGCCGAGCCGCTCTCCCTTTCGCTGGTTTATCCGCAGCGTCGGGAGCTTTCCCGG > NC_000913/3672968‑3673256 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |