| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,421,878 | T→C | 5.5% | Y57Y (TAT→TAC) | ulaC → | L‑ascorbate‑specific enzyme IIA component of PTS |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,421,878 | 0 | T | C | 5.5% | 232.7 / 3.4 | 72 | Y57Y (TAT→TAC) | ulaC | L‑ascorbate‑specific enzyme IIA component of PTS |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (41/27); new base C (2/2); total (43/29) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.90e-01 | |||||||||||
CCTGCAGGCTGAAGCAGAGACATGGCAGGAAGCGGTGAAAATCGGCGTTGACCTGCTGGTGGCGGCAGATGTGGTAGAGCCGCGTTACTACCAGGCGATTCTGGATGGCGTTGAACAGTTCGGTCCTTATTTCGTTATCGCTCCGGGCCTGGCAATGCCGCACGGGCGTCCGGAAGAGGGCGTTAAGAAAACCGGTTTCTCTCTGGTAACGCTGAAAAAGCCGCTGGAGTTCAACCACGATGACAACGATCCGGTGGATATCCTCATCACCATGGCG > NC_000913/4421749‑4422025 | ccTGCAGGCTGAAGCAGAGACATGGCAGGAAGCGGTGAAAATCGGCGTTGACCTGCTGGTGGCGGCAGATGTGGTAGAGCCGCGTTACTACCAGGCGATTCTGGATGGCGTTGAACAGTTCGGTCCTTATTTCGTTATCGCTCCGGGc > 5:53278/1‑148 (MQ=255)ccTGCAGGCTGAAGCAGAGACATGGCAGGAAGCGGTGAAAATCGGCGTTGACCTGCTGGTGGCGGCAGATGTGGTAGAGCCGCGTTACTACCAGGCGATTCTGGATGGCGTTGAACAGTTCGGTCCTTATTTCGTTATCGCTCCGGGc > 7:264966/1‑148 (MQ=255) gCACGCTGAAGCAGAGACATGGCAGGAAGCGCTGAAAATCGGCGTTGACCTGCTGGTGGCGGCAGATGTGGTAGAGCCGCGTTACTACCAGGCGATTCTGGATGGCGTTGAACAGTTCGGTCCTTATTTCGATATCGCTCCGGGCCTg > 8:191774/1‑148 (MQ=255) aGGCTGAAGCAGAGACATGGCAGGAAGCGGTGAAAATCGGCGTTGACCTGCTGGTGGCGGCAGATGTGGTAGAGCCGCGTTACTACCAGGCGATTCTGGATGTCGTTGAACAGTTCGGTCCTTATTTCGTTATCGCTCCGGGCCTgg > 3:84919/1‑147 (MQ=255) gAAGCAGAGACATGGCAGGAAGCGGTGAAAATCGGCGTTGACCTGCTGGTGGCGGCAGATGTGGTAGAGCCGCGTTACTACCAGGCGATTCTGGATGGCGTTGAACAGTTCGGTCCTTATTTCGTTATCGCTCCGGGCCTGGCAATGc > 5:208072/1‑148 (MQ=255) gagaCATGGCAGGAAGCGGTGAAAATCGGCGTTGACCTGCTGGTGGCGGCAGATGTGGTAGAGCCGCGTTACTACCAGGCGATTCTGGATGGCGTTGAACAGTTCGGTCCTTATTTCGTTATCGCTCCGGGCCTGGCAATGCCGCACg > 4:232412/1‑148 (MQ=255) cATGGCAGGAAGCGGTGAAAATCGGCGTTGACCTGCTGGTGGCGGCAGATGTGGTAGAGCCGCGTTACTACCAGGCGATTCTGGATGGCGTTGAACAGTTCGGTCCTTATTTCGTTATCGCTCCGGGCCTGGCAATGCCGCACGGGCg > 5:123249/1‑148 (MQ=255) tGGCAGGAAGCGGTGAAAATCGGCGTTGACCTGCTGGTGGCGGCAGATGTGGTAGAGCCGCGTTACTACCAGGCGATTCTGGATGGCGTTGAACAGTTCGGTCCTTATTTCGTTATCGCt > 7:312105/1‑120 (MQ=255) tGGCAGGAAGCGGTGAAAATCGGCGTTGACCTGCTGGTGGCGGCAGATGTGGTAGAGCCGCGTTACTACCAGGCGATTCTGGATGGCGTTGAACAGTTCGGTCCTTATTTCGTTATCGCt < 8:312105/120‑1 (MQ=255) tGGCAGGAAGCGGTGAAAATCGGCGTTGACCTGCTGGTGGCGGCAGATGTGGTAGAGCCGCGTTACTACCAGGCGATTCTGGATGGCGTTGAACAGTTCGGTCCTTATTTCGTTATCGCTCCGGGCCTGGCAATGCCGCACGGGCGTc < 2:298100/148‑1 (MQ=255) gAAGCGGTGAAAATCGGCGTTGACCTGCTGGTGGCGGCAGATGTGGTAGAGCCGCGTTACTACCAGGCGATTCTGGATGGCGTTGAACAGTTCGGTCCTTATTTCGTTATCGCTCCGGGCCTGGCAATGCCGCACGGGCGTCCGGAag < 8:264966/148‑1 (MQ=255) aGCGGTGACACTCGGCGTTGACCGGCTGGTGGCGGCAGAGGTGGTAGAGCCGCGTTCCTACCAGGCGATTCTGGATGGCGTTGCACAGTGCGGGCCTTATTTCGTTATCGCGCCGGGCCTGGCAATGCCGCACGGGCGTCCGGAagag < 5:56778/148‑1 (MQ=255) aGCGGTGAAAATCGGCGTTGACCTGCTGGTGGCGGCAGATGTGGTAGAGCCGCGTTACTACCAGGCGATTCTGGATGGCGTTGAACAGTTCGGTCCTTATTTCGTTATCGCTCCGGGCCTGGCAATGCCg < 2:247139/130‑1 (MQ=255) aGCGGTGAAAATCGGCGTTGACCTGCTGGTGGCGGCAGATGTGGTAGAGCCGCGTTACTACCAGGCGATTCTGGATGGCGTTGAACAGTTCGGTCCTTATTTCGTTATCGCTCCGGGCCTGGCAATGCCg > 1:247139/1‑130 (MQ=255) cGGGGAAAATCGGCGTTGACCTGCTGGTGGCGGCAGATGTGGTAGAGCCGCGTTACTACCAGGCGATTCTGGATGGCGTTGAACAGTTCGGTCCTTATTTCGTTATCGCTCCGGGCCTGGCAATGCCGCACGGGCGTCCGGAAGAggg < 3:20017/148‑1 (MQ=255) gTGAAAATCGGCGTTGACCTGCTGGTGGCGGCAGATGTGGTAGAGCCGCGTTACTACCAGGCGATTCTGGATGGCGTTGAACAGTTCGGTCCTTATTTCGTTATCGCTCCGGGCCTGGCAATGCCGCACGGGCGTCCGGAAGAGGGCg < 8:42746/148‑1 (MQ=255) gTGAAAATCGGCGTTGACCTGCTGGTGGCGGCAGATGTGGTAGAGCCGCGTTACTACCAGGCGATGCTGGATGGCGTTGAACAGTTCGGTCCTTATTTCGTTATCGCTCCGGGCCTGGCAATGCCGCACGGGCGTCCGGAAGAGGGCg < 8:290889/148‑1 (MQ=255) aaaaTCGGCGTTGACCTGCTGGTGGCGGCAGATGTGGTAGAGCCGCGTTACTACCAGGCGATTCTGGATGGCGTTGAACAGTTCGGTCCTTATTTCGTTATCGCTCCGGGCCTGGCAATGCCGCACGGGCGTCCGGAAGAGGGCGtt > 5:312503/1‑147 (MQ=255) ttGACCTGCTGGTGGCGGCAGATGTGGTAGAGCCGCGTTACTACCAGGCGATTCTGGATGGCGTTGTACAGTTCGGTCCTTATTTCGATATCGCTCCGGGCCTGGCAATGCCGCACGGGCGTCCGGAAGAGGGCGTTAAGAAAACCgg < 7:191774/148‑1 (MQ=255) tGACCTGCTGGTGGCGGCAGATGTGGTAGAGCCGCGTTACTACCAGGCGATTCTGGATGGCGTTGAACAGTTCGGTCCTTAt > 5:58899/1‑82 (MQ=255) tGACCTGCTGGTGGCGGCAGATGTGGTAGAGCCGCGTTACTACCAGGCGATTCTGGATGGCGTTGAACAGTTCGGTCCTTAt < 6:58899/82‑1 (MQ=255) gACCTGCTGGTGGCGGCAGATGTGGTAGAGCCGCGTTACTACCAGGCGATTCTGGATGGCGTTGAACAGTTCGGTCCTTATTTCGTTATCGCTCCGGGCCTGGCAATGCCGCACGGGCGTCCGGAAGAGGGCGTTAAGAAAACCGGtt < 6:53278/148‑1 (MQ=255) ccTGCTGGTGGCGGCAGATGTGGTAGAGCCGCGTTACTACCAGGCGATTCTGGATGGCGTTGAACAGTTCGGTCCTTATTTCGTTATCGCTCCGGGCCTGGCAATGCCGCACGGGCGTCCGGAAGAGGGCGTTAAGAAAACCGGTTtc > 5:272352/1‑148 (MQ=255) gctgGTGGCGGCAGATGTGGTAGAGCCGCGTTACTACCAGGCGATTCTGGATGGCGTTGAACAGTTCGGTCCTTATTTCGTTATCGCTCCGGGCCTGGCAATGCCGCACGGGCGTCCGGAag > 3:268719/1‑122 (MQ=255) gctgGTGGCGGCAGATGTGGTAGAGCCGCGTTACTACCAGGCGATTCTGGATGGCGTTGAACAGTTCGGTCCTTATTTCGTTATCGCTCCGGGCCTGGCAATGCCGCACGGGCGTCCGGAag < 4:268719/122‑1 (MQ=255) gctgGTGGCGGCAGATGTGGTAGAGCCGCGTTACTACCAGGCGATTCTGGATGGCGTTGAACAGTTCGGTCCTTATTTCGTTATCGCTCCGGGCCTGGCAATGCCGCACGGGCGTCCGGAAGAGGGCGTTAAGAAAACCGGTTtctct > 3:30087/1‑148 (MQ=255) ctgGTGGCGGCAGATGTGGTAGAGCCGCGTTACTACCAGGCGATTCTGGATGGCGTTGAACAGTTCGGTCCTTATTTCGTTATCGCTCCGGGCCTGGCAATGCCGCACGGGCGTCCGGAAGAGGGCGTTAAGAAAACCGGTTtctctc < 7:90990/148‑1 (MQ=255) ggtggCGGCAGATGTGGTAGAGCCGCGTTACTACCAGGCGATTCTGGATGGCGTTGAACAGTTCGGTCCTTATTTCGTTATCGCTCCGGGCCTGGCAATGCCGCCCGGGCGTCCGGAAGAGGGCGTTAAGCAACCCGGGTTCTCTCTg > 8:125720/1‑148 (MQ=255) ggtggCGGCAGATGTGGTAGAGCCGCGTTACTACCAGGCGATTCTGGATGGCGTTGAACAGTTCGGTCCTTATTTCGTTATCGCTCCGGGCCTGGCAATGCCGCACGGGCGTCCGGAAGAGGGCGTTAAGAAAACCGGTTTCTCTCTg < 6:208072/148‑1 (MQ=255) tggCGGCAGATGTGGTAGAGCCGCGTTACTACCAGGCGATTCTGGATGGCGTTGAACAGTTCGGTCCTTATTTCGTTATCGCTCCGGGcc < 5:77422/90‑1 (MQ=255) tggCGGCAGATGTGGTAGAGCCGCGTTACTACCAGGCGATTCTGGATGGCGTTGAACAGTTCGGTCCTTATTTCGTTATCGCTCCGGGcc > 6:77422/1‑90 (MQ=255) tggCGGCAGATGTGGTAGAGCCGCGTTACTACCAGGCGATTCTGGATGGCGTTGAACAGTTCGGTCCTTATTTCGTTATCGCTCCGGGCCTGGCAATGCCGCACGGGCGTCCGGAAGAGGGCGTTAAGAAAACCGGTTTCTCTCTgg > 1:210486/1‑147 (MQ=255) cggcAGATGTGGTAGAGCCGCGTTACTACCAGGCGATTCTGGATGGCGTTGAACAGTTCGGTCCTTATTTCGTTATCGCTCCGGGCCTGGCAATGCCGCACGGGCGTCCGGAAGAGGGCGTTAAGAAAACCGGTTTCTCTCTGGTAAc > 8:187560/1‑148 (MQ=255) gcAGATGTGGTAGAGCCGCGTTACTACCAGGCGATTCTGGATGGCGTTGAACAGTTCGGTCCTTATTTCGTTATCGCTCCGGGCCTGGCAATGCCGCACGGGCGTCCGGAag > 7:334528/1‑112 (MQ=255) gcAGATGTGGTAGAGCCGCGTTACTACCAGGCGATTCTGGATGGCGTTGAACAGTTCGGTCCTTATTTCGTTATCGCTCCGGGCCTGGCAATGCCGCACGGGCGTCCGGAag < 8:334528/112‑1 (MQ=255) gcAGATGTGGTAGAGCCGCGTTACTACCAGGCGATTCTGGATGGCGTTGAACAGTTCGGTCCTTATTTCGTTATCGCTCCGGGCCTGGCAATGCCGCACGGGCGTCCGGAAGAGGGCGTTAAGAAAACCGGTTTCTCTCTGGTAACGc > 8:252915/1‑148 (MQ=255) gcAGATGTGGTAGAGCCGCGTTACTACCAGGCGATTCTGGATGGCGTTGAACAGTTCGGTCCTTATTTCGTTATCGCTCCGGGCCTGGCAATGCCGCACGGGCGTCCGGAAGAGGGCGTTAAGAAAACCGGTTTCTCTCTGGTAACGc > 7:300372/1‑148 (MQ=255) tAGAGCCGCGTTACTACCAGGCGATTCTGGATGGCGTTGAACAGTTCGGTCCTTATTTCGTTATCGCTCCGGGCCTGGCAATGCCGCACGGGCGTCCGGAAGAGGGCGTTAAGAAAACCGGTTTCTCTCTGGTAACGCTGAAAAAGcc > 4:293465/1‑148 (MQ=255) agCCGCGTTACTACCAGGCGATTCTGGATGGCGTTGAACAGTTCGGTCCTTATTTCGTTATCGCTCCGGGCCTGGCAATGCCGCACGGGCGTCCGGAAGAGGGCGTTAAGAAAACCGGTTTCTCTCTGGTAACGCTGAAAAAGCCGCt < 5:116157/148‑1 (MQ=255) gCCGCGTTACTACCAGGCGATTCTGGATGGCGTTGAACAGTTCGGTCCTTATTTCGTTATCGCTCCGGGCCTGGCAATGCCGCACGGGCGTCCGGAAGAGGGCGTTAAGAAAACCGGTTTCTCTCTGGTAACGCTGa < 5:199400/137‑1 (MQ=255) gCCGCGTTACTACCAGGCGATTCTGGATGGCGTTGAACAGTTCGGTCCTTATTTCGTTATCGCTCCGGGCCTGGCAATGCCGCACGGGCGTCCGGAAGAGGGCGTTAAGAAAACCGGTTTCTCTCTGGTAACGATGa > 6:199400/1‑137 (MQ=255) acCAGGCGATTCTGGATGGCGTTGAACAGTTCGGTCCTTATTTCGTTATCGCTCCGGGCCTGGCAATGCCGCACGGGCGTCCGGAAGAGGGCGTTAAGAAACCCGGTTTCTCTCTGGTAACGCTGAAAAAGCCGCt < 5:251111/136‑1 (MQ=255) acCAGGCGATTCTGGATGGCGTTGAACAGTTCGGTCCTTATTTCGTTATCGCTCCGGGCCTGGCAATGCCGCACGGGCGTCCGGAAGAGGGCGTTAAGAAAACCGGTTTCTCTCTGGTAACGCTGAAAAAGCCGCt > 6:251111/1‑136 (MQ=255) cAGGCGATTCTGGATGGCGTTGAACAGTTCGGTCCTTATTTCGTTATCGCTCCGGGCCTGGCAATGCCGCACGGGCGTCCGGAAGAGGGCGTTAAGAAAACCGGTTTCTCTCTGGTAACGCTGAAAAAGCCGCTGGAGTTCAACCAc > 7:84714/1‑147 (MQ=255) aGGCGATTCTGGATGGCGTTGAACAGTTCGGTCCTTATTTCGTTATCTCTCCGGGCCTGGCAATGCCGCACGGGCGTCCGGAAGAGGGCGTTAAGAAAACCGGTTTCTCTCTGGTAACGCTGAAAAAGCCGCTGGAGTTCAACCACGa > 2:44337/1‑148 (MQ=255) aGGCGATTCTGGATGGCGTTGAACAGTTCGGTCCTTATTTCGTTATCGCTCCGGGCCTGGCAATGCCGCACGGGCGTCCGGAAGAGGGCGTTAAGAAAACCGGTTTCTCTCTGGTAACGCTGAAAAAGCCGCTGGAGTTCAACCACGa < 6:123249/148‑1 (MQ=255) aGGCGATTCTGGATGGCGTTGAACAGTTCGGTCCTTATTTCGTTATCGCTCCGGGCCTGGCAATGCCGCACGGGCGTCCGGAAGAGGGCGTTAAGAAAACCGGTTTCTCTCTGGTAACGCTGAAAAAGCCGCTGGAGTTCAACCACGa > 2:141785/1‑148 (MQ=255) gCGATTCTGGATGGCGTTGAACAGTTCGGTCCTTATTTCGTTATCGCTCCGGGCCTGGCAATGCCGCACGGGCGTCCGGAAGAGGGCGTTAAGAAAACCGGTTTCTCTCTGGTAACGCTGAAAAAGCCGCTGGAGTTCa > 7:65953/1‑139 (MQ=255) gCGATTCTGGATGGCGTTGAACAGTTCGGTCCTTATTTCGTTATCGCTCCGGGCCTGGCAATGCCGCACGGGCGTCCGGAAGAGGGCGTTAAGAAAACCGGTTTCTCTCTGGTAACGCTGAAAAAGCCGCTGGAGTTCa < 8:65953/139‑1 (MQ=255) ggATGGCGTTGAACAGTTCGGTCCTTATTTCGTTATCGCTCCGGGCCTGGCAATGCCGCACGGGCGTCCGGAAGAGGGCGTTAAGAAAACCGGTTTCTCTCTGGTAACGCTGAAAAAGCCGCTGGAGTTCAACCACGATGACAACGAt > 7:327356/1‑148 (MQ=255) gATGGCGTTGATCAGTTCGGTCCTTATTTCGTTATGGCTCCGGGCCTGGCAATGCCGCACGGGCGTCCTGAAGAGTGCGTTAAGTAAACCTGTTTCTCTCTGGTAACGCTGAAATAGACGCTGGAGTTCAACCACGATGACAACGAt < 4:84919/147‑1 (MQ=255) gATGGCGTTGAACAGTTCGGTCCTTATTTCGTTATCGCTCCGGTCCTGGCAATGCCGCACGGGCGTCCGGAAGAGGGCGTTAAGAAAACCGGTTTCTCTCTGGTAACGCTGAAAAAGCCGCTGGAGTTCAACCACGATGACAACGATc > 1:174786/1‑148 (MQ=255) cGTTGAACAGTTCGGTCCTTATTTCGTTATCGCTCCGGGCCTGGCAATGCCGCACGGGCGTCCGGAAGAGGGCGTTAAGAAAACCGGTTTCTCTCTGGTAACGCTGAAAAAGCCGCTGGAGTTCAACCACGATGACAACGATCCGGTg < 2:210486/148‑1 (MQ=255) tGAACAGTTCGGTCCTTATTTCGTTATCGCTCCGGGCCTGGCAATGCCGCACGGGCGTCCGGAAGAGGGCGTTAAGAAAACCGGTTTCTCTCTGGTAACGCTGAAAAAGCCGCTGGAGTTCAACCACGATGACAACGATCCGGTGGat > 2:211932/1‑148 (MQ=255) tGAACAGTTCGGTCCTTATTTCGTTATCGCTCCGGGCCTGGCAATGCCGCACGGGCGTCCGGAAGAGGGCGTTAAGAAAACCGGTTTCTCTCTGGTAACGCTGAAAAAGCCGCTGGAGTTCAACCACGATGACAACGATCCGGTGGa > 6:62875/1‑147 (MQ=255) tGAACAGTTCGGTCCTTATTTCGTTATCGCTCCGGGCCTGGCAATGCCGCACGGGCGTCCGGAAGAGGGCGTTAAGAAAACCGGTTTCTCTCTGGTAACGCTGAAAAAGCCGCTGGAGTTCAACCACGATGACAACGATCCGGTGGa > 2:207822/1‑147 (MQ=255) tGAACAGTTCGGTCCTTATTTCGTTATCGCTCCGGGCCTGGCAATGCCGCACGGGCGTCCGGAAGAGGGCGTTAAGAAAACCGGTTTCTCTCTGGTAACGCTGAAAAAGCCGCTGGAGTTCAACCACGATGACAACGATCCGGTGGa > 4:117951/1‑147 (MQ=255) aCAGTTCGGTCCTTATTTCGTTATCGCTCCGGGCCTGGCAATGCCGCACGGGCGTCCGGAAGAGGGCGTTAAGAAAACCGGTTTCTCTCTGGTAACGCTGAAAAAGCCGCTGGAGTTCAACCACGATGACAACGATCCGGTGGATATc < 8:300372/148‑1 (MQ=255) aCAGTTCGGTCCTTACTTCGTTATCGCTCCGGGCCTGGCAATGCCGCACGGGCGTCCGGAAGAGGGCGTTAAGAAAACCGGTTTCTCTCTGGTAACGCTGAAAAAGCCGCTGGAGTTCAACCACGa > 4:121921/1‑126 (MQ=255) aCAGTTCGGTCCTTACTTCGTTATCGCTCCGGGCCTGGCAATGCCGCACGGGCGTCCGGAAGAGGGCGTTAAGAAAACCGGTTTCTCTCTGGTAACGCTGAAAAAGCCGCTGGAGTTCAACCACGa < 3:121921/126‑1 (MQ=255) aCAGTTCGGTCCTTACTTCGTTATCGCTCCGGGCCTGGCAATGCCGCACGGGCGTCCGGAAGAGGGCGTTAAGAAAACCGGTTTCTCTCTGGTAACGCTGAAAAAGCCGCTGGAGTTCAACCACGa < 3:27249/126‑1 (MQ=255) aCAGTTCGGTCCTTACTTCGTTATCGCTCCGGGCCTGGCAATGCCGCACGGGCGTCCGGAAGAGGGCGTTAAGAAAACCGGTTTCTCTCTGGTAACGCTGAAAAAGCCGCTGGAGTTCAACCACGa > 4:27249/1‑126 (MQ=255) aGTTCGGTCCTTATTTCGTTATCGCTCCGGGCCTGGCAATGCCGCACGGGCGTCCGGAAGAGGGCGTTAAGAAAACCGGTTTCTCTCTGGTAACGCTGAAAAAGCCGCTGGAGTTCAACCACGATGACAACGATCCGGTGGATATCCt > 2:20456/1‑148 (MQ=255) tCGGTCCTTATTTCGTTATCGCTCCGGGCCTGGCAATGCCGCACGGGCGTCCGGAAGAGGGCGTTAAGAAAACCGGTTTCTCTCTGGTAACGCTGAAAAAGCCGCTGGAGTTTAACCACGATGACAACGATCCGGTGGATATCCtcat > 4:241533/1‑148 (MQ=255) tCGGTCCTTATTTCGTTATCGCTCCGGGCCTGGCAATGCCGCACGGGCGTCCGGAAGAGGGCGTTAAGAAAACCGGTTTCTCTCTGGTAACGCTGAAAAAGCCGCTGGAGTTCAACCACGATGACAACGATCCGGTGGATATCCtcat > 2:324640/1‑148 (MQ=255) ggTCCTTATTTCGTTATCGCTCCGGGCCTGGCAATGCCGCACGGGCGTCCGGAAGAGGGCGTTAAGAAAACCGGTTTCTCTCTGGTAACGCTGAAAAAGCCGCTGGAGTTCAACCACGATGACAACGATCCGGTGGATATCCtcatca < 3:117951/148‑1 (MQ=255) ggTCCTTATTTCGTTATCGCTCCGGGCCTGGCAATGCCGCACGGGCGTCCGGAAGAGGGCGTTAAGAAAACCGGTTTCTCTCTGGTAACGCTGAAAAAGCCGCTGGAGTTCAACCACGATGACAACGATCCGGTGGATATCCtcatca < 6:312503/148‑1 (MQ=255) gTCCTTATTTCGTTATCGCTCCGGGCCTGGCAATGCCGCACGGGCGTCCGGAAGAGGGCGTTAAGAAAACCGGTTTCTCTCTGGTAACGCTGAAAAAGCCGCTGGAGTTCAACCACGATGACAACGATCCGGTGGATATCCTCATCAc > 3:173504/1‑148 (MQ=255) gTCCTTATTTCGTTATCGCTCCGGGCCTGGCAATGCCGCACGGGCGTCCGGAAGAGGGCGTTAAGAAAACCGGTTTCTCTCTGGTAACGCTGAAAAAGCCGCTGGAGTTCAACCACGATGACAACGATCCGGTGGATATCCTCATCAc > 1:161611/1‑148 (MQ=255) cTTATTTCGTTATCGCTCCGGGCCTGGCAATGCCGCACGGGCGTCCGGAag < 7:97553/51‑1 (MQ=255) cTTATTTCGTTATCGCTCCGGGCCTGGCAATGCCGCACGGGCGTCCGGAag > 8:97553/1‑51 (MQ=255) tATTTCGTTATCGCTCCGGGCCTGGCAATGCCGCACGGGCGTCCGGAAGAGGGCGTTAAGAAAACCGGTTTCTCTCTGGTAACGCTGAAAAAGCCGCTGGAGTTCAACCACGATGACAACGATCCg < 5:201193/126‑1 (MQ=255) tATTTCGTTATCGCTCCGGGCCTGGCAATGCCGCACGGGCGTCCGGAAGAGGGCGTTAAGAAAACCGGTTTCTCTCTGGTAACGCTGAAAAAGCCGCTGGAGTTCAACCACGATGACAACGATCCg > 6:201193/1‑126 (MQ=255) tATTTCGTTATCGCTCCGGGCCTGGCAATGCCGCACGGGCGTCCGGAAGAGGGCGTTAAGAAAACCGGTTTCTCTCTGGTAACGCTGAAAAAGCCGCTGGAGTTCAACCACGATGACAACGATCCGGTGGATATCCTCATCACCATgg > 5:107025/1‑148 (MQ=255) tttCGTTATCGCTCCGGGCCTGGCAATGCCGCACGGGCGTCCGGAAGAGGGCGTTAAGAAAACCGGTTTCTCTCTGGTAACGCTGAAAAAGCCGCTGGAGTTCAACCACGATGACAACGATCCGGTGGATATCCTCATCACCATggcg > 8:43567/1‑148 (MQ=255) tttCGTTATCGCTCCGGGCCTGGCAATGCCGCACGGGCGTCCGGAAGAGGGCGTTAAGAAAACCGGTTTCTCTCTGGTAACGCTGAAAAAGCCGCTGGAGTTCAACCACGATGACAACGATCCGGTGGATATCCTCATCACCATggc < 6:272352/147‑1 (MQ=255) | CCTGCAGGCTGAAGCAGAGACATGGCAGGAAGCGGTGAAAATCGGCGTTGACCTGCTGGTGGCGGCAGATGTGGTAGAGCCGCGTTACTACCAGGCGATTCTGGATGGCGTTGAACAGTTCGGTCCTTATTTCGTTATCGCTCCGGGCCTGGCAATGCCGCACGGGCGTCCGGAAGAGGGCGTTAAGAAAACCGGTTTCTCTCTGGTAACGCTGAAAAAGCCGCTGGAGTTCAACCACGATGACAACGATCCGGTGGATATCCTCATCACCATGGCG > NC_000913/4421749‑4422025 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |