| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,130,405 | A→T | 5.5% | Y158* (TAT→TAA) | wcaD ← | putative colanic acid polymerase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,130,405 | 0 | A | T | 5.5% | 242.9 / 3.7 | 72 | Y158* (TAT→TAA) | wcaD | putative colanic acid polymerase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (33/35); new base T (2/2); total (35/37) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.60e-01 | |||||||||||
GAATCATAGCATCTGTTTTAGGCGTTTTGATACCAAACTGTTTGATGCTGAGCCAAATTGAGATTAATGCCAGAGCGAAAAATGCCGGTTCGAAATAAAGTGCTGTCGTGCGCTTGCCGCCGAATTTAATGAAATTCAGCACATAGCTGTTGCTGTAAATCAGATATTTCGAAATCGACTCCATAATACTGCTGCCACCGGTGAGGATAATTTGTGCCATCTCCACCGCCGCCAGCGCCACCACCAGCCCGACCACCAGATAAAAGAAACGTAATATCTTGCGATGGTT > NC_000913/2130263‑2130551 | gaATCATAGCATCTGTTTTAGGCGTTTTGATACCAAACTGTTTGATGCTGAGCCAAATTGAGATTAATGCCAGAGCGAAAAATGCCGGTTCGAAATAAAGTGCTGTCGTGCGCTTGCCGCCGAATTTAATGAAATTCAGCACATAGCt > 5:115621/1‑148 (MQ=255) aaTCATAGCATCTGTTTTAGGCGTTTTGATACCAAACTGTTTGATGCTGAGCCAAATTGAGATTAATGCCAGAGCGAAAAATGCCGGTTCGAAATAAAGTGCTGTCGTGCGCTTGCCGCCGAATTTAATGAAATTCAGCACATAGCTg < 7:88433/148‑1 (MQ=255) aTCATAGCATCTGTTTTAGGCGTTTTGATACCAAACTGTTTGATGCTGAGCCAAATTGAGATTAATGCCAGAGCGAAAAATGCCGGTTCGAAATAAAGTGCTGTCGTGCGCTTGCCGCCGAATTTAATGAAATTCAGCACATAGCTGt > 3:18166/1‑148 (MQ=255) aTCATAGCATCTGTTTTAGGCGTTTTGATACCAAACTGTTTGATGCCGAGCCAAATTGAGATTAATGCCAGAGCGAAAAATGCCGGTTCGAAATAAAGTGCTGTCGTGCGCTTGCCGCCGAATTTAATGAAATTCAGCACATAGCTGt > 7:1300/1‑148 (MQ=255) cATAGCATCTGTTTTAGGCGTTTTGATACCAAACTGTTTGATGCTGAGCCAAATTGAGATTAATGCCAGAGCGAAAAATGCCGGTTCGAAATAAAGTGCTGTCGTGCGCTTGCCGCCGAATTTAATGAAATTCAGCACATAGCTGTTg > 1:100029/1‑148 (MQ=255) tCTGTTTTAGGCGTTTTGATACCAAACTGTTTGATGCTGAGCCAAATTGAGATTAATGCCAGAGCGAAAAATGCCGGTTCGAAATAAAGTGCTGTCGTGCGCTTGCCGCCGAATTTAATGAAATTCAGCACATAGCTGTTGCTGTaaa > 3:125017/1‑148 (MQ=255) ttttAGGCGTTTTGATACCAAACTGTTTGATGCTGAGCCAAATTGAGATTAATGCCAGAGCGAAAAATGCCGGTTCGAAATAAAGTGCTGTCGTGCGCTTGCCGCCGAATTTAATGAAATTCAGCACATAGCTGTTGCTGTAAATc < 6:115621/146‑1 (MQ=255) ttttAGGCGTTTTGATACCAAACTGTTTGATGCTGAGCCAAATTGAGATTAATGCCAGAGCGAAAAATGCCGGTTCGAAATAAAGTGCTGTCGTGCGCTTGCCGCCGAATTTAATGAAATTCAGCACATAGCTGTTGCTGTAAATCAg < 1:102860/148‑1 (MQ=255) tttAGGCGTTTTGATACCAAACTGTTTGATGCTGAGCCAAATTGAGATTAATGCCAGAGCGAAAAATGCCGGTTCGAAATAAAGTGCTGTCGTGCGCTTGCCGCCGAATTTAATGAAATTCAGCACATAGCTGTTGCTGTAAATCAg < 8:272041/147‑1 (MQ=255) tttGATACCAAACTGTTTGATGCTGAGCCAAATTGAGATTAATGCCAGAGCGAAAAATGCCGGTTCGAAATAAAGTGCTGTCGTGCGCTTGCCGCCGAATTTAATGAAATTCAGCACTTAGCTGTTGCTGTAAATCAGATATTTCGa > 1:171271/1‑147 (MQ=255) tttGATACCAAACTGTTTGATGCTGAGCCAAATTGAGATTAATGCCAGAGCGAAAAATGCCGGTTCGAAATAAAGTGCTGTCGTGCGCTTGCCGCCGAATTTAATGAAATTCAGCACTTAGCTGTTGCTGTAAATCAGATATTTCGa > 1:166227/1‑147 (MQ=255) tttGATACCAAACTGTTTGATGCTGAGCCAAATTGAGATTAATGCCAGAGCGAAAAATGCCGGTTCGAAATAAAGTGCTGTCGTGCGCTTGCCGCCGAATTTAATGAAATTCAGCACATAGCTGTTGCTGTAAATCAg > 4:194285/1‑138 (MQ=255) tttGATACCAAACTGTTTGATGCTGAGCCAAATTGAGATTAATGCCAGAGCGAAAAATGCCGGTTCGAAATAAAGTGCTGTCGTGCGCTTGCCGCCGAATTTAATGAAATTCAGCACATAGCTGTTGCTGTAAATCAg < 3:194285/138‑1 (MQ=255) tttGATACCAAACTGTTTGATGCTGAGCCAAATTGAGATTAATGCCAGAGCGAAAAATGCCGGTTCGAAATAAAGTGCTGTCGTGCGCTTGCCGCCGAATTTAATGAAATTCAGCACATAGCTGTTGCTGTAAATCAGATATTTCGa > 6:125383/1‑147 (MQ=255) tttGATACCAAACTGTTTGATGCTGAGCCAAATTGAGATTAATGCCAGAGCGAAAAATGCCGGTTCGAAATAAAGTGCTGTCGTGCGCTTGCCGCCGAATTTAATGAAATTCAGCACATAGCTGTTGCTGTAAATCAGATATTTCGa > 4:122665/1‑147 (MQ=255) tttGATACCAAACTGTTTGATGCTGAGCCAAATTGAGATTAATGCCAGAGCGAAAAATGCCGGTTCGAAATAAAGTGCTGTCGTGCGCTTGCCGCCGAATTTAATGAAATTCAGCACATAGCTGTTGCTGTAAATCAGATATTTCGa > 5:207423/1‑147 (MQ=255) tttGATACCAAACTGTTTGATGCTGAGCCAAATTGAGATTAATGCCAGAGCGAAAAATGCCGGTTCGAAATAAAGTGCTGTCGTGCGCTTGCCGCCGAATTTAATGAAATTCAGCACATAGCTGTTGCTGTAAATCAGATATTTCGa > 4:184632/1‑147 (MQ=255) tttGATACCAAACTGTTTGATGCTGAGCCAAATTGAGAATAATGCCAGAGCGAAAAATCCCGGTTCGAAATAAAGTGCTGTCGTGCGCTTTCCGCCGAATATAATGAAATTCAGCACAAATCTGTTGCAGTAAATTAGATATATCGa > 1:208004/1‑147 (MQ=255) aTACCAAACTGTTTGATGCTGAGCCAAATTGAGATTAATGCCAGAGCGAAAAATGCCGGTTCGAAATAAAGTGCTGTCGTGCGCTTGCCGCCGAATTTAATGAAATTCAGCACTTAGCTGTTGCTGTAAATCAGATATTTCGAAATCg < 2:171271/148‑1 (MQ=255) aTACCAAACTGTTTGATGCTGAGCCAAATTGAGATTAATGCCAGAGCGAAAAATGCCGGTTCGAAATAAAGTGCTGTCGTGCGCTTGCCGCCGAATTTAATGAAATTCAGCACATAGCTGTTGCTGTAAATCAGATATTTCGAAATCg < 2:16331/148‑1 (MQ=255) tACCAAACTGTTTGATGCTGAGCCAAATTGAGATTAATGCCAGAGCGAAAAATGCCGGTTCGAAATAAAGTGCTGTCGTGCGCTTGCCGCCGAATTTAATGAAATTCAGCACTTAGCTGTTGCTGTAAATCAGATATTTCGAAATCg < 2:166227/147‑1 (MQ=255) tACCAAACTGTTTGATGCTGAGCCAAATTGAGATTAATGCCAGAGCGAAAAATGCCGGTTCGAAATAAAGTGCTGTCGTGCGCTTGCCGCCGAATTTAATGAAATTCAGCACATAGCTGTTGCTGTaa < 2:174715/128‑1 (MQ=255) tACCAAACTGTTTGATGCTGAGCCAAATTGAGATTAATGCCAGAGCGAAAAATGCCGGTTCGAAATAAAGTGCTGTCGTGCGCTTGCCGCCGAATTTAATGAAATTCAGCACATAGCTGTTGCTGTaa > 1:174715/1‑128 (MQ=255) ccAAACTGTTTGATGCTGAGCCAAATTGAGATTAATGCCAGAGCGAAAAATGCCGGTTCGAAATAAAGTGCTGTCGTGCGCTTGCCGCCGAATTTAATGAAATTCAGCACATAGCTGTTGCTGTAAATCAGATATTTCGAAATCGACt > 7:220996/1‑148 (MQ=255) ccAAACTGTTTGATGCTGAGCCAAATTGAGATTAATGCCAGAGCGAAAAATGCCGGTTCGAAATAAAGTGCTGTCGTGCGCTTGCCGCCGAATTTAATGAAATTCAGCACATAGCTGTTGCTGTAAATCAGATATTTCGAAATCGACt > 1:285974/1‑148 (MQ=255) aaaCTGTTTGATGCTGAGCCAAATTGAGATTAATGCCAGAGCTAAAAATGCCGGTTCGAAATAAAGTGCTGTCGTGCGCTTGCCGCCGAATTTAATGAAATTCAGCACATAGCTGTTGCTGTAAATCAGATATTTCGAAATCGACTcc < 8:220996/148‑1 (MQ=255) aaCTGTTTGATGCTTAGCCAAATTGAGATTAATGCCAGAGCGAAAAATGCCGGTTCGAAATAAAGTGCTGTCGTGCGCTTGCCGCCGAATTTAATGAAATTCAGCACATAGCTGTTGCTGTAAATCAGATATTTCGAAATCGACTCCa < 1:294483/148‑1 (MQ=255) aaCTGTTTGATGCTGAGCCAAATTGAGATTAATGCCAGAGCGAAAAATGCCGGTTCGAAATAAAGTGCTGTCGTGCGCTTGCCGCCGAATTTAATGAAATTCAGCACATAGCTGTTGCTGTAAATCAGATATTTCGAAATCGACTCCa < 6:191261/148‑1 (MQ=255) aCTGTTTGATGCTGAGCCAAATTGAGATTAATGCCAGAGCGAAAAATGCCGGTTCGAAATAAAGTGCTGTCGTGCGCTTGCCGCCGAATTTAATGAAATTCAGCACATAGCTGTTGCTGTAAATCAGATATTTCGAAATCGACTCCat < 5:125383/148‑1 (MQ=255) tttGATGCTGAGCCAAATTGAGATTAATGCCAGAGCGAAAAATGCCGGTTCGAAATAAAGTGCTGTCGTGCGCTTGCCGCCGAATTTAATGAAATTCAGCACATAGCTGTTGCTGTAAATCAGATATTTCGAAATCGACTCCataat < 3:298789/147‑1 (MQ=255) tttGATGCTGAGCCAAATTGAGATTAATGCCAGAGCGAAAAATGCCGGTTCGAAATAAAGTGCTGTCGTGCGCTTGCCGCCGAATTTAATGAAATTCAGCACATAGCTGTTGCTGTAAATCAGATATTTCGAAATCGACTCCataat < 4:125017/147‑1 (MQ=255) gATGCTGAGCCAAATTGAGATTAATGCCAGAGCGAAAAATGCCGGTTCGAAATAAAGTGCTGTCGTGCGCTTGCCGCCGAATTTAATGAAATTCAGCACATAGCTGTTGCTGTAAATCAGATATTTCGAAATCGACTCCATAATCct < 5:14917/147‑1 (MQ=255) aTGCTGAGCCTAATTGAGATTAATGGCAGAGCGAAAAATGCCGGTTCGAAATAAAGTGCTGTCGTGCGCTTGCCGGCGTATTTAATGAAATTCAGCACATAGCTGTTGCTGTAAATCAGATATTTCGAAATCGACTCGATAATActgc < 2:57549/148‑1 (MQ=255) cAAATTGAGATTAATGCCAGAGCGAAAAATGCCGGTTCGAAATAAAGTGCTGTCGTGCGCTAGCCGCCGAATTTAATGAAATTCAGCACATAGCTGTTGCTGTAAATCAGATATTTCGAAATCGACTCCATAATACTGCTGCCACCgg < 2:251362/148‑1 (MQ=255) aTTGAGATTAATGCCAGAGCGAAAAATGCCGGTTCGAAATAAAGTGCTGTCGTGCGCTTGCCGCCGAATTTAATGAAATTCAGCACATAGCTGTTGCTGTAAATCAGATATTTCGAAATCGACTCCataat > 4:229135/1‑131 (MQ=255) aTTGAGATTAATGCCAGAGCGAAAAATGCCGGTTCGAAATAAAGTGCTGTCGTGCGCTTGCCGCCGAATTTAATGAAATTCAGCACATAGCTGTTGCTGTAAATCAGATATTTCGAAATCGACTCCataat < 3:229135/131‑1 (MQ=255) ttGAGATTAATGCCAGAGCGAAAAATGCCGGTTCGAAATAAAGTGCTGTCGTGCGCTTGCCGCCGAATTTAATGAAATTCAGCACATAGCTGTTGCTGTAAATCAGATATTTCGAAATCGACTcc < 3:189878/125‑1 (MQ=255) ttGAGATTAATGCCAGAGCGAAAAATGCCGGTTCGAAATAAAGTGCTGTCGTGCGCTTGCCGCCGAATTTAATGAAATTCAGCACATAGCTGTTGCTGTAAATCAGATATTTCGAAATCGACTcc > 4:189878/1‑125 (MQ=255) tGAGATTAATGCCAGAGCGAAAAATGCCGGTTCGAAATAAAGTGCTGTCGTGCGCTTGCCGCCGAATTTAATGAAATTCAGCACATAGCTGTTGCTGTAAATCAGATATTTCGAAATCGACTCCATAATACTGCTGCCACCGGTGAg > 1:281520/1‑147 (MQ=255) aTGCCAGAGCGAAAAATGCCGGTTCGAAATAAAGTGCTGTCGTGCGCTTGCCGCCGAATTTAATGAAATTCAGCACATAGCTTTTGCTCTAAATCAGATATTTCGAAATCGACTCAATAATACAGCTGCCACCGGTGAGGATAATAtg > 8:69340/1‑148 (MQ=255) aTGCCAGAGCGAAAAATGCCGGTTCGAAATAAAGTGCTGTCGTGCGCTTGCCGCCGAATTTAATGAAATTCAGCACATAGCTGTTGCTGTAAATCAGATATTTCGAAATCGACTCCATAATACTGCTGCCACCGGTGAGGATAATTtg < 2:281520/148‑1 (MQ=255) tGCCAGAGCGAAAAATGCCGGTTCGAAATAAAGTGCTGTCGTGCGCTTGCCGCCGAATTTAATGAAATTCAGCACATAGCTGTTGCTGTAAATCAGATATTTCGAAATCGACTCCATAATACTGCTGCCACCGGTGAGGATAATTtgt > 2:160095/1‑148 (MQ=255) gCCAGAGCGAAAAATGCCGGTTCGAAATAAAGTGCTGTCGTGCGCTTGCCGCCGAATTTAATGAAATTCAGCACATAGCTGTTGCTGTAAATCAGATATTTCGAAATCGACTCCATAATACTGCTGCCACCGGTGAGGATAATTtgtg > 7:214810/1‑148 (MQ=255) cAGAGCGAAAAATGCCGGTTCGAAATAAAGTGCTGTCGTGCGCTTGCCGCCGAATTTAATGAAATTCAGCACATAGCTGTTGCTGTAAATCAGATATTTCGAAATCGACTCCATAATACTGCTGCCACCGGTGAGGATAATTTGTGcc < 6:207423/148‑1 (MQ=255) cAGAGCGAAAAATGCCGGTTCGAAATAAAGTGCTGTCGTGCGCTTGCCGCCGAATTTAATGAAATTCAGCACATAGCTGTTGCTGTAAATCAGATATTTCGAAATCGACTCCATAATACTGCTGCCACCGGTGAGGATAATTTGTGcc < 4:18166/148‑1 (MQ=255) gatcGAAAAATGCCGGTTCGAAATAAAGTGCTGTCGTGCGCTTGCCGCCGAATTTAATGAAATTCAGCACATAGCTGTTGCTGTAAATCAGATATTTCGAAATCGACTCCATAATACTGCTGCCACCGGAGAGGATAATTTGTGCCAt > 4:56933/4‑148 (MQ=255) gagCGAAAAATTCCGGTTCGAAATAAAGTGCTGTCGTGCGCTTGCCGCCGAATTTAATGAAATTCAGCACATAGCTGTTGCTGTAAATCAGATATTTCGAAATCGACTCCATAATACTGCTGCCACCGGTGAGGATAATTTGTGCCAt > 1:72272/1‑148 (MQ=255) gagCGAAAAATGCCGGTTCGAAATAAAGTGCTGTCGTGCGCTTGCCGCCGAATTTAATGAAATTCAGCACATAGCTGTTGCTGTAAATCAGATATTTCGAAATCGACTCCATAATACTGCTGCCACCGGTg < 8:194034/131‑1 (MQ=255) gagCGAAAAATGCCGGTTCGAAATAAAGTGCTGTCGTGCGCTTGCCGCCGAATTTAATGAAATTCAGCACATAGCTGTTGCTGTAAATCAGATATTTCGAAATCGACTCCATAATACTGCTGCCACCGGTg > 7:194034/1‑131 (MQ=255) gCGAAAAATGCCGGTTCGAAATAAAGTGCTGTCGTGCGCTTGCCGCCGAATTTAATGAAATTCAGCACATAGCTGTTGCTGTAAATCAGATATTTCGAAATCGACTCCATAATACTGCTGCCACCGGTGAGGATAATTTGTGCCAtct > 8:314192/1‑148 (MQ=255) gCGAAAAATGCCGGTTCGAAATAAAGTGCTGTCGTGCGCTTGCCGCCGAATTTAATGAAATTCAGCACATAGCTGTTGCTGTAAATCAGATATTTCGAAATCGACTCCATAATACTGCTGCCACCGGTGAGGATAATTTGTGCCAtct < 3:122665/148‑1 (MQ=255) aaaaTGCCGGTTCGAAATAAAGTGCTGTCGTGCGCTTGCCGCCGAATTTAATGAAATTCAGCACATAGCTGTTGCTGTAAATCAGATATTTCGAAATCGACTCCATAATACTGCTGCCACCGGTGAGGATAATTTGTGCCATCTCAAc > 3:168103/1‑148 (MQ=255) tCGAAATAAAGTGCTGTCGTGCGCTTGCCGCCGAATTTAATGAAATTCAGCACATAGCTGTTGCTGTAAATCAGATATTTCGAAATCGACTCCATAATACTGCTGCCACCGGTGAGGATAATTTGTGCCATCTCCACCGCCGCCAgcg > 7:198960/1‑148 (MQ=255) 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tGCGCTTGCCGCCGAATTTAATGAAATTCAGCACATAGCTGTTGCTGTAAATCAGATATTTCGAAATCGACTCCATAATACTGCTGCCACCGGTGAGGATAATTTGTGCCATCTCCACCGCCGCCAGCGCCACCACCAGCCCGaccac < 7:314192/148‑1 (MQ=255) gccgAATTTAATGAAATTCAGCACATAGCTGTTGCTGTAAATCAGATATTTCGAAATCGACTCCATAATACTGCTGCCACCGGTGAGGATAATTTGTGCCATCTCCACCGCCGCCAGCGCCACCACCAGCCCGCCCTCCAGATaa > 7:277781/1‑145 (MQ=255) cgAATTTAATGAAATTCAGCACATAGCTGTTGCTGTAAATCAGATATTTCGAAATCGACTCCATAATACTGCTGCCACCGGGGAGGATAATTTGTGCCATCTCCACCGCCGCCAGCGCCACCACCAGCCCGACCACCAGATAAAAGa > 4:47334/1‑147 (MQ=255) gAATTTAATGAAATTCAGCACATAGCTTTTGCTGTAAATCAGATATTTCGAAATCGACTCCATACTACTGCTGCCACCGGTGAGGATAATTTGTGCCATCTGCACCGCCGCCAGCGCCACCACCAGCCCGACCACCAGATAAAAGaaa < 3:177615/148‑1 (MQ=255) gAATTTAATGAAATTCAGCACATAGCTGTTGCTGTAAATCAGATATTTCGAAATCGACTCCATAATACTGCTGCCACCGGTGAGGATAATTTGTGCCa > 3:84147/1‑98 (MQ=255) gAATTTAATGAAATTCAGCACATAGCTGTTGCTGTAAATCAGATATTTCGAAATCGACTCCATAATACTGCTGCCACCGGTGAGGATAATTTGTGCCa < 4:84147/98‑1 (MQ=255) aaTGAAATTCAGCACATAGCTGTTGCTGTAAATCAGATATTTCGAAATCGACTCCATAATACTGCTGCCACCGGTGAGGATAATTTGTGCCATCTCCACCGCCGCCAGCGCCACCACCAGCCCGACCACCAGATAAAAGAAACGTaa < 7:69340/147‑1 (MQ=255) gAAATTCAGCACATAGCTGTTGCTGTAAATCAGATATTTCGAAATCGACTCCATAATACTGCTGCCACCGGTGAGGATAATTTGTGCCATCTCCACCGCCGCCAGCGCCACCACCAGCCCGACCACCAGATAAAAGAAACGTAATATc > 4:62584/1‑148 (MQ=255) gAAATTCAGCACATAGCTGTTGCTGTAAATCAGATATTTCGAAATCGACTCCATAATACTGCTGCCACCGGTGAGGATAATTTGTGCCATCTCCACCGCCGCCAGCGCCACCACCAGCCCGACCACCAGATAAAAGAAACGTAATATc > 1:188839/1‑148 (MQ=255) gAAATTCAGCAAATAGCTGTTGCTGTAAATCAGATATTTCGAAATCGACTCCATAATACTGCTGCCACCGGTGATGATAATTTGTGCCATCTCCACCGCCGCCAGCGCCACCACCAGCCCGACCACCAGATAAAAGAAACGTAATATc < 2:285974/148‑1 (MQ=255) aaaTTCAGCACATAGCTGTTGCTGTAAATCAGATATTTCGAAATCGACTCCATAATACTGCTGCCACCGGGGAGGATAATTTGTGCCATCTCCACCGCCGCCAGCGCCACCACCAGCCCGACCACCAGATAAAAGAAACGTAATATCt < 3:56933/148‑1 (MQ=255) aTTCAGCACATAGCTGTTGCTGTAAATCAGATATTTCGAAATCGACTCCATAATACTGCTGCCACCGGTGAGGATAATTTGTGCCATCTCCACCGCCGCCAGCGCCACCACCAGCCCGACCACCAGATAAAAGAAACGTAATATCtt > 7:26536/1‑147 (MQ=255) aTTCAGCACATAGCTGTTGCTGTAAATCAGATATTTCGAAATCGACTCCATAATACTGCTGCCACCGGTGAGGATAATTTGTGCCATCTCCACCGCCGCCAGCGCCACCACCAGCCCGACCACCAGATAAAAGAAACGTAATATCtt < 8:26536/147‑1 (MQ=255) cacaTAGCTGTTGCTGTAAATCAGATATTTCGAAATCGACTCCATAATACTGCTGCCACCGGTGAGGATAATTTGTGCCATCTCCACCGCCGCCAGCGCCACCACCAGCCCGACCACCAGATAAAAGAAACGTAATATCTTGCGATgg < 1:160095/148‑1 (MQ=255) cacaTAGCTGTTGCTGTAAATCAGATATTTCGAAATCGACTCCATAATACTGCTGCCACCGGTGAGGATAATTTGTGCCATCTCCACCGCCGCCAGCGCCACCACCAGCCCGACCACCAGATAAAAGAAACGTAATATCTTGCGATgg < 8:1300/148‑1 (MQ=255) cacaTAGCTGTTGCTGTAAATCAGATATTTCGAAATCGACTCCATAATACTGCTGCCACCGGTGAGGATAATTTGTGCCATCTCCACCGCCGCCAGCGCCACCACCAGCCCGACCACCAGATAAAAGAAACGTAATATCTTGCGATgg > 1:130459/1‑148 (MQ=255) acaTAGCTGTTGCTGTAAATCAGATATTTCGAAATCGACTCCATAATACTGCTGCCACCGGTGAGGATAATTTGTGCCATCTCCACCGCCGCCAGCGCCACCACCAGCCCGACCACCAGATAAAAGAAACGTAATATCTTGCGATGGt > 1:14267/1‑148 (MQ=255) acaTAGCTGTTGCTGTAAATCAGATATTTCGAAATCGACTCCATAATACTGCTGCCACCGGTGAGGATAATTTGTGCCATCTCCACCGCCGCCAGCGCCACCACCAGCCCGACCACCAGATAAAAGAAACGTAATATCTTGCGATGGt > 1:9160/1‑148 (MQ=255) caTAGCTGTTGCTGTAAATCAGATATTTCGAAATCGACTCCATAATACTGCTGCCACCGGTGAGGATAATTTGTGCCATCTCCACCGCCGCCAGCGCCACCACCAGCCCGACCACCAGATAAAAGAAACGTAATATCTTGCGATGGtt < 3:62584/148‑1 (MQ=255) | GAATCATAGCATCTGTTTTAGGCGTTTTGATACCAAACTGTTTGATGCTGAGCCAAATTGAGATTAATGCCAGAGCGAAAAATGCCGGTTCGAAATAAAGTGCTGTCGTGCGCTTGCCGCCGAATTTAATGAAATTCAGCACATAGCTGTTGCTGTAAATCAGATATTTCGAAATCGACTCCATAATACTGCTGCCACCGGTGAGGATAATTTGTGCCATCTCCACCGCCGCCAGCGCCACCACCAGCCCGACCACCAGATAAAAGAAACGTAATATCTTGCGATGGTT > NC_000913/2130263‑2130551 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |