New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 1416622 | 73 (0.920) | 5 (0.070) | 5/246 | NT | 6.4% | coding (765/2601 nt) | recE | Rac prophage; exonuclease VIII, 5' to 3' specific dsDNA exonuclease |
? | NC_000913 | = 1416637 | 76 (1.020) | coding (750/2601 nt) | recE | Rac prophage; exonuclease VIII, 5' to 3' specific dsDNA exonuclease |
TTTTCAGCGATAATTTCCTCAATGCGTTTAGCGTGTGCCGGATGAAGGTTATAGATGTCCAGATCCATTGAACGGGCCAGTACGCCAGTGGCTACGTCGCGCGCCAGTGACGTCAGATCGTGTACGAAACCTTCGCCGCGATCGGTGAGGTTTCCGCCGCCAGCATTAGCACCGGAAGCCGTGCGAGTGATGTGTGAAACACGATTACCCTTCATCCACTCTTTTGTCAGCAGTCCTCGATCGGTGTAGTCAGCGTTCAGGTATGCTTCGAAAAAAGCAGTTATCAGTCCCAGG > NC_000913/1416491‑1416784 | ttttCAGCGATAATTTCCTCAATGCGTTTAGCGTGTGCCGGATGAAGGTTATAGATGTCCAGATCCATTGAACGGGCCAGTACGCCAGTGGCTACGTCGCGCGCCAGTGACGTCAGATCGTGTACGAAACCTTCGCCGCGATCGGTGa > 3:303757‑M2/1‑147 (MQ=255) ttttCAGCGATAATTTCCTCAATGCGTTTAGCGTGTGCCGGATGAAGGTTATAGATGTCCAGATCCATTGAACGGGCCAGTACGCCAGTGGCTACGTCGCGCGCCAGTGACGTCAAATCGTGTACGAAACCTTCGCCGCGATCGGTGag < 3:220955‑M2/149‑3 (MQ=255) gATAATTTCCTCAATGCGTTTAGCGTGTGCCGGATGAAGGTTATAGATGTCCAGATCCATTGAACGGGCCAGTACGCCAGTGGCTACGTCGCGCGCCAGTGACGTCAGATCGTGTACGAAACCTTCGCCGCGATCGGTGAGGTTTccgt > 7:150878/1‑148 (MQ=255) gATAATTTCCTCAATGCGTTTAGCGTGTGCCGGATGAAGGTTATAGATGTCCAGATCCATTGAACGGGCCAGTACGCCAGTGGCTACGTCGCGCGCCAGTGACGTCAGATCGTGTACGAAACCTTCGCCGCGATCGGTGAGGTTTccgt < 8:150878/149‑2 (MQ=255) tttCCTCAATGCGTTTAGCGTGTGCCGGATGAAGGTTATAGATGTCCAGATCCATTGAACGGGCCAGTACGCCAGTGGCTACGTCGCGCGCCAGTGACGTCAGATCGTGTACGAAACCTTCGCCGCGATCGGTGAGGTTTCcgccgc > 4:232682/1‑147 (MQ=255) ccTCAATGCGTTTAGCGTGTGCCGGATGAAGGTTATAGATGTCCAGATCCATTGAACGGGCCAGTACGCCAGTGGCTACGTCGCGCGCCAGTGACGTCAGATCGTGTACGAAACCTTCGCCGCGATCGGTGAGGTTTcc > 7:239668/1‑139 (MQ=255) ccTCAATGCGTTTAGCGTGTGCCGGATGAAGGTTATAGATGTCCAGATCCATTGAACGGGCCAGTACGCCAGTGGCTACGTCGCGCGCCAGTGACGTCAGATCGTGTACGAAACCTTCGCCGCGATCGGTGAGGTTTcc < 8:239668/139‑1 (MQ=255) cTCAATGCGTTTAGCGTGTGCCGGATGAAGGTTATAGATGTCCAGATCCATTGAACGGGCCAGTACGCCAGTGGCTACGTCGCGCGCCAGTGACGTCAGATCGTGTACGAAACCTTCGCCGCGATCGGTGAGGTTTCCGCCGCCAGCAt > 7:256252/1‑149 (MQ=255) tCAATGCGTTTAGCGTGTGCCGGATGAAGGTTATAGATGTCCAGATCCATTGAACGGGCCAGTACGCCAGTGGCTACGTCGCGCGCCAGTGACGTCAGATCGTGTACGAAACCTTCGCCGCGATCGGTGAGGTTTCCGCCGCCAGCAt > 5:163995/1‑148 (MQ=255) aaTGCGTTTAGCGTGTGCCGGATGAAGGTTATAGATGTCCAGATCCATTGAACGGGCCAGTACGCCAGTGGCTACGTCGCGCGCCAGTGACGTCAGATCGTGTACGAAACCTTCGCCGCGATCGGTGAGGTTTCCGCCGCCAGCAtt < 3:339655/147‑1 (MQ=255) aaTGCGTTTAGCGTGTGCCGGATGAAGGTTATAGATGTCCAGATCCATTGAACGGGCCAGTACGCCAGTGGCTACGTCGCGCGCCAGTGACGTCAGATCGTGTACGAAACCT‑CACCGATCGCGGCGaaggtttcgtacacgatctgac > 7:39659‑M2/1‑126 (MQ=255) aaTGCGTTTAGCGTGTGCCGGATGAAGGTTATAGATGTCCAGATCCATTGAACGGGCCAGTACGCCAGTGGCTACGTCGCGCGCCAGTGACGTCAAATCGTGTACGAAACCTTCGCCGCGATCGGTGaggtttcgtacacgatctga > 4:220955‑M2/1‑127 (MQ=255) tGCGTTTAGCGTGTGCCGGATGAAGGTTATAGATGTCCAGATCCATTGAACGGGCCAGTACGCCAGTGGCTACGTCGCGCGCCAGTGACGTCAGATCGTGTACGAAACCTTCGCCGCGATCGGTGAGGTTTCCGCCGCCAGCATTAGCa > 3:343466/1‑149 (MQ=255) tttAGCGTGTGCCGGATGAAGGTTATAGATGTCCAGATCCATTGAACGGGCCAGTACGCCAGTGGCTACGTCGCGCGCCAGTGACGTCAGATCGTGTACGAAACCTTCGCCGCGATCGGTGAGGTTTCCGCCGCCAGCATTAGCACCg > 1:137648/1‑148 (MQ=255) aGCGTGTGCCGGATGAAGGTTATAGATGTCCAGATCCATTGAACGGGCCAGTACGCCAGTGGCTACGTCGCGCGCCAGTGACGTCAGATCGTGTACGAAACCTTCGCCGCGATCGGTGAGGTTTCCGCCGCCAGCATTAGCACCGGaa < 3:232682/148‑1 (MQ=255) aGCGTGTGCCGGATGAAGGTTATAGATGTCCAGATCCATTGAACGGGCCAGTACGCCAGTGGCTACGTCGCGCGCCAGTGACGTCAGATCGTGTACGAAACCTTCGCCGCGATCGGTGAGGTTTCCGCCGCCAGCATTAGCACCGGaa < 5:325816/148‑1 (MQ=255) ccGGATGAAGGTTATAGATGTCCAGATCCATTGAACGGGCCAGTACGCCAGTGGCTACGTCGCGCGCCAGTGACGTCAGATCGTGTACGAAACCTTCGCCGCGATCGGTTAGGTTTCCGCCGCCAGCATTAGCACCGGAAGCCGTGCGa < 3:98989/149‑1 (MQ=255) cGGATGAAGGTTATAGATGTCCAGATCCATTGAATGGGCCAGTACGCCAGTGGCTACGTCGCGCGCCAGTGACGTCAGATCGTGTACGAAACCTTCGCCGCGATCGGTGAGGTTTCCGCCGCCAGCATTAGCACCGGAAGCCGTGCGAg < 2:350438/149‑1 (MQ=255) cGGATGAAGGTTATAGATGTCCAGATCCATTGAACGGGCCAGTACGCCAGTGGCTACGTCGCGCGCCAGTGACGTCAGATCGTGTACGAAACCTTCGCCGCGATCGGTGAGGTTTCCGCCGCCAGCATTAGCACCGGAAGCCGTGCGAg < 3:6643/149‑1 (MQ=255) aaGGTTATAGATGTCCAGATCCTTTGAACGGGCGAGTACGCCAGTGGCTACGTCGCGCGCCAGTGACGGCAGATCGTGTACGAAACCTTCGCCGCGATCGGTGAGGTTTCCGCCGCCAGCATTAGCACCGGAAGCCGTGCGAGTGAtgt < 5:202847/149‑1 (MQ=255) aaGGTTATAGATGTCCAGATCCATTGAACGGGCCAGTACGCCAGTGGCTACGTCGCGCGCCAGTGACGTCAGATCGTGTACGAAACCTTCGCCGCGATCGGTGAGGTTTCCGCCGCCAGCATTAGCACCGGAAGCCGTGCGAGTGAtgt > 7:105864/1‑149 (MQ=255) aGGTTATAGATGTCCAGATCCATTGAACGGGCCAGTACGCCAGTGGCTACGTCGCGCGCCAGTGACGTCAGATCGTGTACGAAACCTTCGCCGCGATCGGTGAGGTTTCCGCCGCCAGCATTAGCACCGGAAGCCGTGCGAGTGAtgtg < 8:336908/149‑1 (MQ=255) gggtataGATGTCCAGATCCATTGAACGGGCCAGTACGCCAGTGGCTACGTCGCGCGCCAGTGACGTCAGATCGTGTACGAAACCTTCGCCGCGATCGGTGAGGTTTCCGCCGCCAGCATTAGCACCGGAAGCCGTGCGAGTGAtgtgt < 7:259316/146‑1 (MQ=255) gTTATAGATGTCCAGATCCATTGAACGGGCCAGTACGCCAGTGGCTACGTCGCGCGCCAGTGACGTCAGATCGTGTACGAAACCTTCGCCGCGCTCGGTGAGGTTTCCGCCGCCAGCATTAGCACCGGAAGCCGTGCGAGTGAtgtgt > 3:72433/1‑148 (MQ=255) aGATGTCCAGATCCATTGAACGGGCCAGTACGCCAGTGGCTACGTCGCGCGCCAGTGACGTCAGATCGTGTACGAAACCTTCGCCGCGATCGGTGAGGTTTCCGCCGCCAGCATTAGCACCGGAAGCCGTGCGAGTGATGTGTGAAaca > 8:147463/1‑149 (MQ=255) gATGTCCAGATCCATTGAACGGGCCAGTACGCCAGTGGCTACGTCGCGCGCCAGTGACGTCAGATCGTGTACGAAACCTTCGCCGCGATCGGTGAGGTTTCCGCCGCCAGCATTAGCACCGGAAGCCGTGCGAGTGATGTGTGAAaca < 4:343466/148‑1 (MQ=255) gTCCAGATCCATTGAACGGGCCAGTACGCCAGTGGCTACGTCGCGCGCCAGTGACGTCAGATCGTGTACGAAACCTTCGCCGCGATCGGTGAGGTTTCCGCCGCCAGCATTAGCACCGGAAGCCGTGCGAGTGa < 6:46210/134‑1 (MQ=255) gTCCAGATCCATTGAACGGGCCAGTACGCCAGTGGCTACGTCGCGCGCCAGTGACGTCAGATCGTGTACGAAACCTTCGCCGCGATCGGTGAGGTTTCCGCCGCCAGCATTAGCACCGGAAGCCGTGCGAGTGa > 5:46210/1‑134 (MQ=255) gTCCAGATCCATTGAACGGGCCAGTACGCCAGTGGCTACGTCGCGCGCCAGTGACGTCAGATCGTGTACGAAACCTTCGCCGCGATCGGTGAGGTTTCCGCCGCCAGCATTAGCACCGGAAGCCGTGCGAGTGATGTGTGAAACACGAt > 7:129030/1‑149 (MQ=255) tCCAGATCCATTGAACGGGCCAGTACGCCAGTGGCTACGTCGCGCGCCAGTGACGTCAGATCGTGTACGAAACCTTCGCCGCGATCGGTGAGGTTTCCGCCGCCAGCATTAGCACCGGAAGCCGTGCGAGTGATGTGTGAAACACGAt < 5:124384/148‑1 (MQ=255) ccAGATCCATTGAACGGGTCAGTACGCCAGTGGCTACGTCGCGCGCCAGTGACGTCAGATCGTGTACGAAACCTTCGCCGCGATCGGAGAGGTTTCCGCCGCCAGCATTAGCACCGGAAGCCGTGCGAGTGATGTGTGAAACACGATTa > 4:315431/1‑149 (MQ=255) ccAGATCCATTGAACGGGCCAGTACGCCAGTGGCTACGTCGCGCGCCAGTGACGTCAGATCGTGTACGAAACCTTCGCCGCGATCGGTGAGGTTTCCGCCGCCAGCATTAGCACCGGAAGCCGTGCGAGTGATGTGTGAAACACGATTa > 6:53801/1‑149 (MQ=255) gATCCATTGAACGGGCCAGTACGCCAGTGGCTACGTCGCGCGCCAGTGACGTCAGATCGTGTACGAAACCTTCGCCGCGATCGGTGAGGTTTCCGCCGCCAGCATTAGCACCGGAAGCCGTGCGAGTGATGTGTGAAACACGATTAccc > 3:44717/1‑149 (MQ=255) tCCATTGAACGGGCCAGTACGCCAGTGGCTACGTCGCGCGCCAGTGACGTCAGATCGTGTACGAAACCTTCGCCGCGATCGGTGAGGTTTCCGCCGCCAGCATTAGCACCGGAAGCCGTGCGAGTGAtgt > 3:142136/1‑130 (MQ=255) tCCATTGAACGGGCCAGTACGCCAGTGGCTACGTCGCGCGCCAGTGACGTCAGATCGTGTACGAAACCTTCGCCGCGATCGGTGAGGTTTCCGCCGCCAGCATTAGCACCGGAAGCCGTGCGAGTGAtgt < 4:142136/130‑1 (MQ=255) tCCATTGAACGGGCCAGTACGCCAGTGGCTACGTCGCGCGCCAGTGACGTCAGATCGTGTACGAAACCTTCGCCGCGATCGGTGAGGTTTCCGCCGCCAGCATTAGCACCGGAAGCCGTGCGAGTGATGTGTGAAACACGATTACCCt > 4:73411/1‑148 (MQ=255) cATTGAACGGGCCAGTACGCCAGTGGCTACGTCGCGCGCCAGTGACGTCAGATCGTGTACGAAACCTTCGCCGCGATCGGTGAGGTTTCCGCCGCCAGCATTAGCACCGGAAGCCGTGCGAGTGAtgtgt > 2:175945/1‑130 (MQ=255) cATTGAACGGGCCAGTACGCCAGTGGCTACGTCGCGCGCCAGTGACGTCAGATCGTGTACGAAACCTTCGCCGCGATCGGTGAGGTTTCCGCCGCCAGCATTAGCACCGGAAGCCGTGCGAGTGAtgtgt < 1:175945/130‑1 (MQ=255) aTTGAACGGGCCAGTACGCCAGTGGCTACGTCGCGCGCCAGTGACGTCAGATCGTGTACGAAACCTTCGCCGCGATCGGTGAGGTTTCCGCCGCCAGCATTAGCACCGGAAGCCGTGCGAGTGAt < 8:111690/125‑1 (MQ=255) aTTGAACGGGCCAGTACGCCAGTGGCTACGTCGCGCGCCAGTGACGTCAGATCGTGTACGAAACCTTCGCCGCGATCGGTGAGGTTTCCGCCGCCAGCATTAGCACCGGAAGCCGTGCGAGTGAt > 7:111690/1‑125 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |