Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
MC JC | NC_000913 | 1,335,035 | Δ726 bp | ymiA–yciX | ymiA, yciX |
Missing coverage evidence... | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
* | * | ÷ | NC_000913 | 1335035 | 1335760 | 726 | 74 [0] | [0] 74 | ymiA–yciX | ymiA,yciX |
New junction evidence | |||||||||||
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seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 1335034 | 0 (0.000) | 74 (0.770) | 64/282 | 0.5 | 100% | intergenic (+205/‑90) | cysB/ymiA | N‑acetylserine‑responsive cysteine regulon transcriptional activator; autorepressor/uncharacterized protein |
? | NC_000913 | 1335761 = | 0 (0.000) | intergenic (+303/‑70) | yciX/acnA | uncharacterized protein/aconitate hydratase 1; aconitase A |
TCTCTGTCGATGCTCTTCTGGGCCGAACTCCTCTGGATCATTACTCACTGATCCTTGACCCCGCTGCGGCGGGGTTGTCATTTGCTTTGCCACAAGGTTTCTCCTCTTTTATCAATTTGGGTTGTTATCAAATCGTTACGCGATGTTTGTGTTATCTTTAATATTCACCCTGAAGAGAATCAGGGCTTCGCAACCCTGTCATTAAGGAGGAGCTATGTCGTCAACCCTACGAGAAGCCAGTAAGGACACGTTGCAGGCCAAAGATAAAACTTACCACTACTACAGCCT > NC_000913/1335617‑1335904 | ttacttatttctataccgtgcacaatatttttatccctcatatttatagggtaaattacctgtaaagtagtgtctaattacccgcctcgcaaactccagttttcgaatatctatttcaggtcaaaagattgaattattcactggGTTtg > 1:290951‑M2/145‑149 (MQ=255) acttatttgtataccgaggacaatatttttatccctcatttttatagtttaaattacctgtaaagtagtgtcttatttcccgcctcgcaaagtccagttttcaaatatctatttcaggtcaaaagattgaatttttcactggGTTtgt < 8:281770‑M2/6‑1 (MQ=255) acttatttctataccgtgcacaatatttttatccctcatatttatagggtaaattacctgtaaagtagtgtctaattacccgcctcgcaaactccagttttcaaatatctatttcaggtcaaaagattgaattattcactggGTTtgtg > 6:140057‑M2/143‑149 (MQ=255) cttatttctataccgtgcacaatatttttatccctcatatttatagggtaaattacctgtaaagtagtgtctaattacccgcctcgcaaactccagttttcaaatatctatttcaggtcaaaagattgaattattcactggGTTtgtg < 5:173388‑M2/7‑1 (MQ=255) tttctataccgtgcacaatatttttatccctcatatttatagggtaaattacctgtaaagtagtgtctaattacccgcctcgcaaactccagttttcaaatatctatttcaggtcaaaagattgaattattcactggGTTTGTGTTAt < 1:374205‑M2/11‑1 (MQ=255) ttctataccgtgcacaatatttttatccctcatatttatagggtaaattacctgtaaagtagtgtctaattacccgcctcgcaaactccagttttcaaatatctatttcaggtcaaaagattgaattattcactggGTTTGTGTTATCt > 7:318145‑M2/137‑149 (MQ=255) taccgtgcacaatatttttatccctcatatttatagggtaaattacctgtaaagtagtgtctaattacccgcctcgcaaactccagttttcaaatatctatttcaggtcaaaagattgaattattcactggGTTTGTGTTATCTTTaa < 2:394971‑M2/17‑1 (MQ=255) taccgtgcacaatatttttatccctcatatttatagggtaaattacctgtaaagtagtgtctaattacccgcctcgcaaactccagttttcaaatatctatttcaggtcaaaagattgaattattcactggGTTTGTGTTATCTTTaa > 5:399589‑M2/132‑148 (MQ=255) cgtgcacaatatttttatccctcatatttatagggtaaattacctgtaaagtagtgtctaattacccgcctcgcaaactccagttttcaaatatctatttcaggtcaaaagattgaattattcactggGTTTGTGTTATCTTTAATAtt > 6:231623‑M2/129‑149 (MQ=255) tgcacaatatttttatccctcatatttatagggtaaattacctgtaaagtagtgtctaattacccgcctcgcaaactccagttttcaaatatctatttcaggtcaaaagattgaattattcactggGTTTGTGTTATCTTTAATATTCa < 4:129478‑M2/23‑1 (MQ=255) tgcacaatatttttatccctcatatttatagggtaaattacctgtaaagtagtgtctaattacccgcctcgcaaactccagttttcaaatatctatttcaggtcaaaagattgaattattcactggGTTTGTGTTATCTTTAATATTCa < 2:327593‑M2/23‑1 (MQ=255) aatatttttatccctcatatttatagggtaaattacctgtaaagtagtgtctaattacccgcctcgcaaactccagttttcaaatatctatttcaggtcaaaagattgaattattcactggGt > 3:189417‑M2/122‑123 (MQ=255) aatatttttatccctcatatttatagggtaaattacctgtaaagtagtgtctaattacccgcctcgcaaactccagttttcaaatatctatttcaggtcaaaagattgaattattcactggGt < 4:189417‑M2/2‑1 (MQ=255) atatttttatccctcatatttatagggtaaattacctgtaaagtagtgtctaattacccgcctcgcaaactccagttttcaaatatctatttcaggtcaaaagattgaattattcactggGTTTGTGTTATCTTTAATATTCACCCTg > 1:254180‑M2/121‑148 (MQ=255) tttttatccctcatatttatagggtaaattacctgtaaagtagtgtctaattacccgcctcgcaaactccagttttcaaatatctatttcaggtcaaaagattgaattattcactggGTTTGTGTTATCTTTAATATTCACCCTGAaga < 1:186178‑M2/32‑1 (MQ=255) tttttatccctcatatttatagggtaaattacctgtaaagtagtgtctaattacccgcctcgcaaactccagttttcaaatatctatttcaggtcaaaagattgaattattcactggGTTTGTGTTATCTTTAATATTCACCCTGAaga < 2:134309‑M2/32‑1 (MQ=255) tttatccctcatatttatagggtaaattacctgtaaagtagtgtctaattacccgcctcgcaaactccagttttcaaatatctatttcaggtcaaaagattgaattattcactggGTTTGTGTTATCTTTAATATTCACCCTGAagag < 6:39717‑M2/33‑1 (MQ=255) cctcatatttatagggtaaattacctgtaaagtagtgtctaattacccgcctcgcaaactccagttttcaaatatctatttcaggtcaaaagattgaattattcactggGTTTGTGTTATCTTTAATATTCACCCTGAAGAGAATCAgg > 2:47073‑M2/110‑149 (MQ=255) cctcatatttatagggtaaattacctgtaaagtagtgtctaattacccgcctcgcaaactccagttttcaaatatctatttcaggtcaaaagattgaattattcactggGTTTGTGTTATCTTTAATATTCACCCTGAAGAGAATCAg < 6:399589‑M2/39‑1 (MQ=255) 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(MQ=255) atagggtaaattacctgtaaagtagtgtctaattacccgcctcgcaaactccagttttcaaatatctatttcaggtcaaaagattgaattattcactggGTTTGTGTTATCTTTAATATTCACCCTGAAGAGAATCAGGGCTTCGCAAc > 7:24680‑M2/100‑149 (MQ=255) gggtaaattacctgtaaagtagtgtctaattacccgcctcgcaaactccagttttcaaatatctaattcaggtcaaaagattgaattattcactggGTTTGTGTTATCTTTAATATTCACCCTGAAGAGAATCAGGGCTTCGCAACCCt < 8:263589‑M2/53‑1 (MQ=255) ggtaaattacctgtaaagtagtgtctaattacccgcctcgcaaactccagttttcaaatatctatttcaggtcaaaagattgaattattcactggGTTTGTGTTATCTTTAATATTCACCCTGAAGAGAATCAGGGCTTCGCAACCCTg > 5:14532‑M2/96‑149 (MQ=255) taaattacctgtaaagtagtgtctaattacccgcctcgcaaactccagttttcaaatatctatttcaggtcaaaagattgaattattcactggGTTTGTGTTATCTTTAATATTCACCCTGAAGAGAATCAGGGCTTCGCAACCCTGTc < 7:262443‑M2/56‑1 (MQ=255) taaattacctgtaaagtagtgtctaattacccgcctcgcaaactccagatttcaaataactatttcaggtcaaaagattgaattattcactggGTTTGTGTTATCTTTAATATTCACCCTGAAGAGAATCAGGGGTTCGCAACCCTGt > 3:32499‑M2/94‑148 (MQ=255) acctgtaaagtagtgtctaattacccgcctcgcaaactccagttttcaaatatctatttgaggtcaaaagattgaattattcactgtGTTTGTGGTATCTTTAATATTCACCCTGAAGAGAATCAGGGCTTCGCAACCCTGTCATTaa < 5:9168‑M2/61‑1 (MQ=255) cctgtaaagtagtgtctaattacccgcctcgcaaactccagttttcaaatatctatttcaggtcaaaagattgaattattcactggGTTTGTGTTATCTTTAATATTCACCCTGAAGAGAATCAGGGCTTCGCAACCCTGTCATTAag < 6:269650‑M2/62‑1 (MQ=255) ctgtaaagtagtgtctaattacccgcctcgcaaactccagttttcaaatatctatttcaggtcaaaagattgaattattcactggGTTTGTGTTATCTTTAATATTCACCCTGAAGAGAATCAGGGCTTCGCAACCCTGTCATTAag > 5:152715‑M2/86‑147 (MQ=255) tgtaaagtagtgtctaattacccgcctcgcaaactccagttttcaaatatctatttcaggtcaaaagattgaattattcactggGTTTGTGTTATCTTTAATATTCACCCTGAAGAGAATCAGGGCTTCGCAACCCTGTCATTAaggag > 3:77816‑M2/85‑149 (MQ=255) taaagtagtgtctaattacccgcctcgcaaactccagttttcaaatatctatttcaggtcaaaagattgaattattcactggGTTTGTGTTATCTTTAATATTCACCCTGAAGAGAATCAGGGCTTCGCAACCCTGTCATTAaggagg < 8:24680‑M2/66‑1 (MQ=255) 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TCTCTGTCGATGCTCTTCTGGGCCGAACTCCTCTGGATCATTACTCACTGATCCTTGACCCCGCTGCGGCGGGGTTGTCATTTGCTTTGCCACAAGGTTTCTCCTCTTTTATCAATTTGGGTTGTTATCAAATCGTTACGCGATGTTTGTGTTATCTTTAATATTCACCCTGAAGAGAATCAGGGCTTCGCAACCCTGTCATTAAGGAGGAGCTATGTCGTCAACCCTACGAGAAGCCAGTAAGGACACGTTGCAGGCCAAAGATAAAACTTACCACTACTACAGCCT > NC_000913/1335617‑1335904 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |