| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | = 3890165 | 100 (1.110) | 7 (0.080) | 7/236 | NT | 6.7% | intergenic (+20/‑71) | tnaA/tnaB | tryptophanase/L‑cysteine desulfhydrase, PLP‑dependent/tryptophan transporter of low affinity |
| ? | NC_000913 | = 3890174 | 104 (1.250) | intergenic (+29/‑62) | tnaA/tnaB | tryptophanase/L‑cysteine desulfhydrase, PLP‑dependent/tryptophan transporter of low affinity | |||||
Only 100 of 130 total aligned reads displayed.
CATATGGACTTCATTATTGAAGCCTTTAAACATGTGAAAGAGAACGCGGCGAATATTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCTAAAGGTGGCATCATGACTGATCAAGCTGAAAAAAAGCACTCTGCATTTTGGGGTGTTATGGTTATAGCAGGTACAGTAATTGGTGGAGG > NC_000913/3890020‑3890312 | caTATGGACTTCATTATTGAAGCCTTTAAACATGTGAAAGAGAACGCGGCGAATATTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATaa < 8:403405/149‑1 (MQ=255)caTATGGACTTCATTATTGAAGCCTTTAAACATGTGAAAGAGAACGCGGCGAATATTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCAATTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATaa < 4:111429/149‑1 (MQ=255) tGGACTTCATTATTGAAGCCTTTAAACATGTGAAAGAGAACGCGGCGAATATTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGa < 8:39421/148‑1 (MQ=255) tGGACTTCATTATTGAAGCCTTTAAACATGTGAAAGAGAACGCGGCGAATATTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGAt < 1:321197/149‑1 (MQ=255) gACTTCATTATTGAAGCCTTTAAACATGTGAAAGAGAACGCGGCGAATATTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATg < 1:13824/148‑1 (MQ=255) aCTTCATTATTGAAGCCTTTAAACATGTGAAAGAGAACGCGGCGAATATTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGt < 1:94648/148‑1 (MQ=255) aCTTCATTATTGAAGCCTTTAAACATGTGAAAGAGAACGCGGCGAATATTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTt > 1:167259‑M2/1‑148 (MQ=255) ttCATTATTGAAGCCTTTAAACATGTGAAAGAGAACGCGGCGAATATTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGAt < 5:370109/144‑1 (MQ=255) ttCATTATTGAAGCCTTTAAACATGTGAAAGAGAACGCGGCGAATATTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGAt > 6:370109/1‑144 (MQ=255) attattGAAGCCTTTAAACATGTGAAAGAGAACGTGGCGAATATTAAAGGATTAAACTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACATCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTAacatccttatagcca < 8:184162‑M1/149‑16 (MQ=255) ttGAAGCCTTTAAACATGTGAAAGAGAACGCGGCGAATTTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTAacatccttatagccactct < 1:328411‑M1/149‑20 (MQ=255) aaGCCTTTAAACATGTGAAAGAGAACGCGGCGAATATTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTAacatccttatagccactctgta < 8:61025‑M1/149‑23 (MQ=255) gCCTTTAAACATGTGAAAGAGAACGCGGCGAATATTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAg < 7:50695/129‑1 (MQ=255) gCCTTTAAACATGTGAAAGAGAACGCGGCGAATATTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAg > 8:50695/1‑129 (MQ=255) ccTTTAAACATGTGAAAGAGAACGCGGCGAATATTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCTCCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTAcc > 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aCATGTGAAAGAGAACGCGGCGAATATTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTACCCTACATc > 6:32901/1‑149 (MQ=255) tgtgAAAGAGAACGCGGCGAATATTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTACCCTACATCCt > 4:63267/1‑148 (MQ=255) gAAAGAGAACGCGGCGAATAATAAAGGAATAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTACACCGCACAACTTAAAGAACTTTAATTAATACTACAGATTAGCTATAAGGATGTTAGACACTCTCATACCAAACATCCTCaa > 2:307582/1‑148 (MQ=255) aaaGAGAACGCGGCGAATATTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCCCTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTACCCTACATCCTCAAt < 5:410781/148‑1 (MQ=255) aaaGAGAACGCGGCGAATATTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTACCCTAc > 4:75723/1‑139 (MQ=255) 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< 5:32901/149‑1 (MQ=255) tatTAAAGGATTAACCTTTACGTACTAAACGAAAGTATTGCGTAAATTCACCGCAAAACATAAAGAAGATTAATTAATACTAAAGAGTGGCTATAATGATCTTAGCAACTCTATAACAATAAATCCTCAATAACAAAAATAGCAttaaa > 7:225952/1‑146 (MQ=255) ttAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGCATGTTAGCCACTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCct < 6:399118/147‑1 (MQ=255) tAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTAacatccttatagccactctgtag < 3:261053‑M1/113‑24 (MQ=255) tAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTAacatccttatagccactctgtag > 4:261053‑M1/1‑90 (MQ=255) tAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTACCCTACATCCTCAAt < 2:86707/128‑1 (MQ=255) aaGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGcc < 7:49611/139‑1 (MQ=255) 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ttaatACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCTAAAGGTGGCATCATGACTGATCAAGCTGAAAAAAAGCACTCTGCATTTTGGGGTGTTATGGTTATAGCAgg < 8:127640/149‑1 (MQ=255) tactacAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCTAAAGGTGGCATCATGACTGATCAAGCTGAAAAAAAGCACTCTGCATTTTGGGGTGTTATGGTTATAGCAGGTACa < 2:137403/149‑1 (MQ=255) ctacAGAGTGGCTATAAGGATGTtagccactctgtagtattaattaaacttctttaagttttgcggtgaagtgacgcaatactttcggttcgtacgtaaaggttaatccttta > 4:261053‑M2/1‑23 (MQ=255) ctacAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCTAAAGGTGGCATCATGACTGATCAAGCTGAAAAAAAGCACTCTGCATTTTGGGGTGTTATGGTTATAGCAGGTACAg < 6:94784/148‑1 (MQ=255) ctacAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCTAAAGGTGGCATCATGACTGATCAAGCTGAAAAAAAGCACTCTGCATTTTGGGGTGTTATGGTTATAGCAGGTACAg < 2:147730/148‑1 (MQ=255) tacAGAGTGGCTATAAGGATGTtagccactctgtagtattaattaaacttctttaagttttgcggtgaagtgacgcaatactttcggttcgtacgtaaaggttaatcctttaatattcgccgcgttctctttcacatgtttaaaggctt < 8:61025‑M2/149‑128 (MQ=255) agagTGGCTATAAGGATGTtagccactctgtagtattaattaaacttctttaagttttgcggtgaagtgacgcaatactttcggttcgtacgtaaaggttaatcctttaaaattcgccgcgttctctttcacatgtttaaaggcttcaa < 1:328411‑M2/149‑131 (MQ=255) gTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCTAAAGGTGGCATCATGACTGATCAAGCTGAAAAAAAGCACTCTGCATTTTGGGGTGTTATGGTTATAGCAGGTa > 5:233319/1‑138 (MQ=255) tGGCTATAAGGATGTtagccactctgtagtattaattaaacttctttaagttttgcggtgatgtgacgcaatactttcggttcgtacgtaaagtttaatcctttaatattcgccacgttctctttcacatgtttaaaggcttcaataat < 8:184162‑M2/149‑135 (MQ=255) gCTAacatccttatagccactctgtagtattaattaaacttctttaagttttgcggtgaagtgacgcaatactttcggttcgtacgtaaaggttaatcctttaatattcgccgcgttctctttcacatgtttaaaggcttcaataatg < 1:366796‑M1/148‑145 (MQ=255) gCTAacatccttatagccactctgtagtattaattaaacttctttaagttttgcggtgaagtgacgcaatactttcggttcgtacgtaaaggttaatcctttaatattcgccgcgt < 8:269457‑M1/116‑113 (MQ=255) gCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCTAAAGGTGGCATCATGACTGATCAAGCTGAAAAAAAGCACTCTGCATTTTGGGGTGTTATGGTTATAGCAGGTACAGTAATtggtg > 6:344075/1‑147 (MQ=255) cTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCTAAAGGTGGCATCATGACTGATCAAGCTGAAAAAAAGCACTCTGCATTTTGGGGTGTTATGGTTATAGCAGGTACAGTAATTGGTGGAg < 1:186650/149‑1 (MQ=255) cTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCTAAAGGTGGCATCATGACTGACCAAGCTGAAAAAAAGCACTCTGCATTTTTGGGTGTTATGGTTATAGCAGGTACAGTAATTGGTGGAg < 3:359121/149‑1 (MQ=255) tataAGGATGTTAGCCACTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCTAAAGGTGGCATCATGACTGATCAAGCTGAAAAAAAGCACTCTGCATTTTGGGGTGTTATGGTTATAGCAGGTACAGTAATTGGTGGAgg > 5:185585/1‑149 (MQ=255) | CATATGGACTTCATTATTGAAGCCTTTAAACATGTGAAAGAGAACGCGGCGAATATTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCTAAAGGTGGCATCATGACTGATCAAGCTGAAAAAAAGCACTCTGCATTTTGGGGTGTTATGGTTATAGCAGGTACAGTAATTGGTGGAGG > NC_000913/3890020‑3890312 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |