| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 1,335,035 | Δ726 bp | 100% | ymiA–yciX | ymiA, yciX | |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 1335035 | 1335760 | 726 | 120 [0] | [0] 122 | ymiA–yciX | ymiA,yciX |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 1335034 | 0 (0.000) | 111 (1.230) | 84/256 | NT | 100% | intergenic (+205/‑90) | cysB/ymiA | N‑acetylserine‑responsive cysteine regulon transcriptional activator; autorepressor/uncharacterized protein |
| ? | NC_000913 | 1335761 = | 0 (0.000) | intergenic (+303/‑70) | yciX/acnA | uncharacterized protein/aconitate hydratase 1; aconitase A | |||||
Only 100 of 122 total aligned reads displayed.
GTTTTCTCTGTCGATGCTCTTCTGGGCCGAACTCCTCTGGATCATTACTCACTGATCCTTGACCCCGCTGCGGCGGGGTTGTCATTTGCTTTGCCACAAGGTTTCTCCTCTTTTATCAATTTGGGTTGTTATCAAATCGTTACGCGATGTTTGTGTTATCTTTAATATTCACCCTGAAGAGAATCAGGGCTTCGCAACCCTGTCATTAAGGAGGAGCTATGTCGTCAACCCTACGAGAAGCCAGTAAGGACACGTTGCAGGCCAAAGATAAAACTTACCACTACTACAGCCTGC > NC_000913/1335613‑1335906 | tttgttacttatttctataccgtgcacaatatttttatccctcatatttatagggtaaattacctgtaaagtagtgtctaattacccgcctcgcaaactccagttttcaaatatctatttcaggtcaaaagattgaattattcactggg > 7:182226‑M2/149‑149 (MQ=255) acttatttctataccgtgcacaatatttttatccctcatatttatagggtaaattacctgtaaagtagtgtctaattacccgcctcgcaaactccagttttcaaatatctatttcaggtcaaaagattgaattattcactggGTTtgtg > 8:50624‑M2/143‑149 (MQ=255) cttatttctataccgtgcacaatatttttatccctcatatttatatggtaaattacctgtaaagtagtgtctaattacccgcctcgcaaactccagttttcaaatatctatttcaggtcaaaagattgaattattcactggGTTtgtg < 3:175967‑M2/7‑1 (MQ=255) cttatttctataccgtgcacaatatttttatccctcatatttatagggtaaattacctgtaaagtagtgtctaattacccgcctcgcaaactccagttttcaaatatctatttcaggtcaaaagattgaattattcactggGTTtgtg < 1:135347‑M2/7‑1 (MQ=255) atttctataccgtgcacaatatttttatccctcatatttatagggtaaattacctgtaaagtagtgtctaattacccgcctcgcaaactccagttttcaaatatctatttcaggtcaaaagattgaattattcactggGTTTGTGTTa > 7:380438‑M2/139‑148 (MQ=255) agttctataccgtgcacaatatttttatccctcatatttatagggtaaattacctgtaaagtagtgtcaaattacccgcctcccaaactccagttttcaaatatctaattcaggtcaaaagaatgaattattcactggGTTTGTGTTAt > 8:247150‑M2/139‑149 (MQ=255) ctataccgtgcacaatatttttatccctcatatttatagggtaaattacctgtaaagtagtgtctaattacccgcctcgcaaactccagttttcaaatatctatttcaggtcaaaagattgaattattcactggGTTTGTGTTATCtt < 7:254125‑M2/14‑1 (MQ=255) ctataccgtgcacaatatttttatccctcatatttatagggtaaattacctgtaaagtagtgtctaattacccgcctcgcaaactccagttttcaaatatctatttcaggtcaaaagattgaattattcactggGTTTGTGTTATCtt < 1:369071‑M2/14‑1 (MQ=255) taccgtgcacaatatttttatccctcatatttatagggtaaattacctgtaaagtagtgtctaattacccgcctcgccaactccaggtttcaaatatctatttcaggtcaaaagattgaattattcactggGTTTGTGTTATCTTTaa > 3:242642‑M2/132‑148 (MQ=255) taccgtgcacaatatttttatccctcatatttatagggtaaattacctgtaaagtagtgtctaattacccgcctcgcaaactccagttttcaaatatctatttcaggtcaaaagattgaattattcactggGTTTGTGTTATCTTTaa < 7:87097‑M2/17‑1 (MQ=255) ccgtgcacaatatttttatccctcatatttatagggtaaattacctgtaaagtagtgtctaattacccgcctcgcaaactccagttttcaaatatctatttcaggtcaaaagattgaattattcactggGTTTGTGTTATCTTTAatat > 1:176991‑M2/130‑149 (MQ=255) cgtggacaatatttttatccctcatatttatagggtaaattacctgtaaagtagtgtctaattacccgcctcgcaaactccagttttcaaatatctatttcaggtcaaaagattgaattattcactggGTTTGTGTTATCTTTAATAtt < 8:343147‑M2/21‑1 (MQ=255) tgcacaatatttttatccctcatatttatagggtaaattacctgtaaagtagtttctaattacccgcctcgcaaactccagttttcaaatatctatttcaggtcaaaagattgaattattcactggGTTTGTGTTATCTTTAATATTCa < 1:304201‑M2/23‑1 (MQ=255) 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attgaattattcactggGTTTGTGTTATCTTTAATATTCACCCTGAAGAGAATCAGGGCTTCGCAACCCTGTCATTAAGGAGGAGCTATGTCGTCAACCCTACGAGAAGCCAGTAAGGACACGTTGCAGGCCAAAGATAAAACTTACCa < 4:53462‑M2/132‑1 (MQ=255) ttgaattattcactggGTTTGTGTTATCTTTAATATTCACGCTGAAGAGAATCAGGGCTTCGCAACCCTGTCATTAAGGAGGAGCTATGTCGTCAACCCTACGAGAAGCCAGTAAGGACACGTTGCAGGCCAAAGATAAAACTTACCa < 6:200522‑M2/132‑1 (MQ=255) aattattcactggGTTTGTGTTATCTTTAATATTCACCCTGAAGAGAATCAGGGCTTCGCAACCCTGTCATTAAGGAGGAGCTATGTCGTCAACCCTACGAGAAGCCAGTAAGGACACGTTGCAGGCCAAAGATAAAACTTACCactac > 7:136505‑M2/14‑149 (MQ=255) attattcactggGTTTGTGTTATCTTTAATATTCACCCTGAAGAGAATCAGGGCTTCGCAACCCTGTCATTAAGGAGGAGCTATGTCGTCAACCCTa > 2:100102‑M2/13‑97 (MQ=255) attattcactggGTTTGTGTTATCTTTAATATTCACCCTGAAGAGAATCAGGGCTTCGCAACCCTGTCATTAAGGAGGAGCTATGTCGTCAACCCTa < 1:100102‑M2/85‑1 (MQ=255) attcactggGTTTGTGTTATCTTTAATATTCACCCTGAAGAGAATCAGGGCTTCGCAACCCTGTCATTAAGGAGGAGCTATGTCGTCAACCCTACGAGAAGCCAGTAAGGACACGTTGCAGGCCAAAGATAAAACTTACCActacta > 2:160441‑M2/10‑147 (MQ=255) actggGTTTGTGTTATCTTTAATATTCACCCTGAAGAGAATCAGGGCTTCGCAACCCTGTCATTAAGGAGGAGCTATGTCGTCAACCCTACGAGAAGCCAGTAAGGACACGTTGCAGGCCAAAGATAAAACTTACCACTACTACAGCCt > 3:160244‑M2/6‑149 (MQ=255) tggGTTTGTGTTATCTTTAATATTCACCCTGAAGAGAATCAGGGCTTCGCAACCCTGTCATTAaggag > 6:56231‑M2/4‑68 (MQ=255) tggGTTTGTGTTATCTTTAATATTCACCCTGAAGAGAATCAGGGCTTCGCAACCCTGTCATTAaggag < 5:56231‑M2/65‑1 (MQ=255) tggGTTTGTGTTATCTTTAATATTCACCCTGAAGAGAATCAGGGCTTCGCAACCCTGTCATTAaggag > 2:192594‑M2/4‑68 (MQ=255) tggGTTTGTGTTATCTTTAATATTCACCCTGAAGAGAATCAGGGCTTCGCAACCCTGTCATTAaggag < 1:198390‑M2/65‑1 (MQ=255) tggGTTTGTGTTATCTTTAATATTCACCCTGAAGAGAATCAGGGCTTCGCAACCCTGTCATTAaggag > 2:198390‑M2/4‑68 (MQ=255) gTTTGTGTTATCTTTAATATTCACCCTGAAGAGAATCAGGGCTTCGCAACCCTGTCATTAAGGAGGAGCTATGTCGTCAACCCTACGAGAAGCCAGTAAGGACACGTTGCAGGCCAAAGATAAAACTTACCACTACTACAGCCTGc < 1:21875/146‑1 (MQ=255) gTTTGTGTTATCTTTAATATTCACCCTGAAGAGAATCAGGGCTTCGCAACCCTGTCATTAAGGAGGAGCTATGTCGTCAACCCTACGAGAAGCCAGTAAGGACACGTTGCAGGCCAAAGATAAAACTTACCACTACTACAGCCTGc > 2:21875/1‑146 (MQ=255) | GTTTTCTCTGTCGATGCTCTTCTGGGCCGAACTCCTCTGGATCATTACTCACTGATCCTTGACCCCGCTGCGGCGGGGTTGTCATTTGCTTTGCCACAAGGTTTCTCCTCTTTTATCAATTTGGGTTGTTATCAAATCGTTACGCGATGTTTGTGTTATCTTTAATATTCACCCTGAAGAGAATCAGGGCTTCGCAACCCTGTCATTAAGGAGGAGCTATGTCGTCAACCCTACGAGAAGCCAGTAAGGACACGTTGCAGGCCAAAGATAAAACTTACCACTACTACAGCCTGC > NC_000913/1335613‑1335906 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |