Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 1,011,082 | C→A | 5.7% | S373R (AGC→AGA) | uup → | replication regulatory ABC‑F family DNA‑binding ATPase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 1,011,082 | 0 | C | A | 5.7% | 222.3 / 2.6 | 70 | S373R (AGC→AGA) | uup | replication regulatory ABC‑F family DNA‑binding ATPase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (32/34); new base A (2/2); total (34/36) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.60e-01 |
CGTTTGCTACCAGGTTAACGGTAAGCAACTGGTGAAAGATTTTTCTGCCCAGGTTCTACGTGGCGACAAAATTGCCCTGATTGGTCCGAATGGGTGCGGCAAAACCACGCTGCTAAAACTGATGCTCGGTCAGCTTCAAGCGGACAGCGGGCGTATTCACGTTGGCACCAAACTGGAAGTGGCTTATTTCGATCAGCACCGCGCGGAACTGGATCCCGATAAAACGGTGATGGATAACCTTGCCGAAGGTAAGCAAGAGGTGATGGTTAACGGCAAGCCACGCCACGTATTGG > NC_000913/1010935‑1011227 | cGTTTGCTACCAGGTTAACGGTAAGCAACTGGTGAAAGATTTTTCTGCCCAGGTTCTACGTGGCGACAAAATTGCCCTGATTGGTCCGAATGGGTGCGGCAAAACCACGCTGCTAAAACTGATGCTCGGTCAGCTTCAAGCGGACAGCg < 2:64700/149‑1 (MQ=255) tttGCTACCAGGTTAACGGTAAGCAACTGGTGAAAGATTTTTCTGCCCAGGTTCTACGTGGCGACAAAATTGCCCTGATTGGTCCGAATGGGTGCGGCAAAACCACGCTGCTAAAACTGATGCTCGGTCAGCTTCAAGCGGACAGCggg < 4:293013/149‑1 (MQ=255) tACCAGGTTAACGGTAAGCAACTGGTGAAAGATTTTTCTGCCCAGGTTCTACGTGGCGACAAAATTGCCCTGATTGGTCCGAATGGGTGCGGCAAAACCACGCTGCTAAAACTGATGCTCGGTCAGCTTCAAGCGGACAGCGGGCGTAt > 6:10344/1‑149 (MQ=255) aCCAGGTTAACGGTAAGCAACTGGTGAAAGATTTTTCTGCCCAGGTTCTACGTGGCGACAAAATTGCCCTGATTGGTCCGAATGGGTGCGGCAAAACCACGCTGCTAAAACTGATGCTCGGTCAGCTTCAAGCGGACAGCGGGCGTAtt > 1:67858/1‑149 (MQ=255) ccAGGTTAACGGTAAGCAACTGGTGAAAGATTTTTCTGCCCAGGTTCTACGGGGCGACAAAATTGCCCTGATTGGTCCGAATGGGTGCGGCAAAACCACGCTGCTAAAACTGATGCTCGGTCAGCTTCAAGCGGACAGCGGGCGTAtt < 2:32232/148‑1 (MQ=255) cAGGTTAACGGTAAGCAACTGGTGAAAGATTTTTCTGCCCAGGTTCTACGTGGCGACAAAATTGCCCTGATTGGTCCGAATGGGTGCGGCAAAACCACGCTGCTAAAACTGATGCTCGGTCAGCTTCAAGCGGACAGCGGGCGTATTCa > 5:254597/1‑149 (MQ=255) cAGGTTAACGGTAAGCAACTGGTGAAAGATTTTTCTGCCCAGGTTCTACGTGGCGACAAAATTGCCCTGATTGGTCCGAATGGGTGCGGCAAAACCACGCTGCTAAAACTGATGCTCGGTCAGCTTCAAGCGGACAGCGGGCGTATTCa > 8:234216/1‑149 (MQ=255) ttAACGGTAAGCAACTGGTGAAAGATTTTTCTGCCCAGGTTCTACGTGGCGACAAAATTGCCCTGATTGGTCCGAATGGGTGCGGCAAAACCACGCTGCTAAAACTGATGCTCGGTCAGCTTCAAGCGGACAGCGGGCGTATTCACGtt < 2:112107/149‑1 (MQ=255) aaCGGTAAGCAACTGGTGAAAGATTTTTCTGCCCAGGTTCTACGTGGCGACAAAATTGCCCTGATTGGTCCGAATGGGTGCGGCAAAACCACGCTGCTAAAACTGATGCTCGGTCAGCTTCAAGCGGACAGCGGGCGTATTCACGTTg < 8:374696/148‑1 (MQ=255) aaCGGTAAGCAACTGGTGAAAGATTTTTCTGCCCAGGTTCTACGTGGCGACAAAATTGCCCTGATTGGTCCGAATGGGTGCGGCAAAACCACGCTGCTAAAACTGATGCTCGGTCAGCTTCAAGCGGACAGCGGGCGTATTCACGTTg < 6:254597/148‑1 (MQ=255) aCGGTAAGCAACTGGTGAAAGATTTTTCTGCCCAGGTTCTACGTGGCGACAAAATTGCCCTGATTGGTCCGAATGGGTGCGGCAAAACCACGCTGCTAAAACTGATGCTCGGTCAGCTTCAAGCGGACAGCGGGCGTATTCACGTTgg < 8:426613/148‑1 (MQ=255) aGCAACTGGTGAAAGATTTTTCTGCCCAGGTTCTACGTGGCGACAAAATTGCCCTGATTGGTCCGAATGGGTGCGGCAAAACCACGCTGCTAAAACTGATGCTCGGTCAGCTTCAAGCGGACAGCGGGCGTATTCACGTTGGCACCaaa < 6:141343/149‑1 (MQ=255) gCAACTGGTGAAAGATTTTTCTGCCCAGGTTCTACGTGGCGACAAAATTGCCCTGATTGGTCCGAATGGGTGCGGCAAAACCACGCTGCTAAAACTGATGCTCGGTCAGCTTCAAGCGGACAGCg < 1:383758/125‑1 (MQ=255) gCAACTGGTGAAAGATTTTTCTGCCCAGGTTCTACGTGGCGACAAAATTGCCCTGATTGGTCCGAATGGGTGCGGCAAAACCACGCTGCTAAAACTGATGCTCGGTCAGCTTCAAGCGGACAGCg > 2:383758/1‑125 (MQ=255) cAACTGGTGAAAGATTTTTCTGCCCAGGTTCTACGTGGCGACAAAATTGCCCTGATTGGTCCGAATGGGTGCGGCAAAACCACGCTGCTAAAACTGATGCTCGGTCAGCTTCAAGCGGACAGCGGGCGTATTCACGtt > 7:343818/1‑138 (MQ=255) cAACTGGTGAAAGATTTTTCTGCCCAGGTTCTACGTGGCGACAAAATTGCCCTGATTGGTCCGAATGGGTGCGGCAAAACCACGCTGCTAAAACTGATGCTCGGTCAGCTTCAAGCGGACAGCGGGCGTATTCACGtt < 8:343818/138‑1 (MQ=255) cTGGTGAAAGATTTTTCTGCCCAGGTTCTACGTGGCGACAAAATTGCCCTGAATGGTCCGAATGGGTGCGGCAAAACCACGCTGCTAAAACTGCTGCTC‑GTCAGCATACAGCCGACAGCCCGCCTATTAACGGTGGCACCACACTTGa > 4:258055/1‑148 (MQ=255) gTGAAAGATTTTTCTGCCCAGGTTCTACGTGGCGACAAAATTGCCCTGATTGGTCCGAATGGGTGCGGCAAAACCACGCTGCTAAAACTGATGCTCGGTCAGCTTCAAGCGGACAGCGGGCGTATTCACGTTGGCACCAAACTGGAAg < 1:322746/148‑1 (MQ=255) gAAAGATTTTTCTGCCCAGGTTCTACGTGGCGACAAAATTGCCCTGATTGGTCCGAATGGGTGCGGCAAAACCACGCTGCTAAAACTGATGCTCGGTCAGCTTCAAGCGGACAGCGGGCGTATTCACGTTGGCACCAAACTGGAAGTgg > 8:141639/1‑149 (MQ=255) aaaGATTTTTCTGCCCAGGTTCTACGTGGCGACAAAATTGCCCTGATTGGTCCGAATGGGTGCGGCAAAACCACGCTGCTAAAACTGATGCTCGGTCAGCTTCAAGCGGACAGCGGGCGTATTCACGTTGGCACCAAACTGGAAGTGGc > 1:49907/1‑149 (MQ=255) aaaGATTTTTCTGCCCAGGTTCTACGTGGCGACAAAATTGCCCTGATTGGTCCGAATGGGTGCGGCAAAACCACGCTGCTAAAACTGATGCTCGGTCAGCTTCAAGCGGACAGCGGGCGTATTCACGTTGGCACCAAACTGGAAGTGGc > 5:104029/1‑149 (MQ=255) gATTTTTCTGCCCAGGTTCTACGTGGCGACAAAATTGCCCTGATTGGTCCGAATGGGTGCGGCAAAACCACGCTGCTAAAACTGATGCTCGGTCAGCTTCAAGCGGCCGGCGGGCGTATTCCCGTTGGCACCAAACTGGAAGTGGCTTa > 5:282591/1‑149 (MQ=255) aTTTTTCTGCCCAGGTTCTACGTGGCGACAAAATTGCCCTGATTGGTCCGAATGGGTGCGGCAAAACCACGCTGCTAAAACTGATGCTCGGTCAGCTTCAAGCGGACAGCGGGCGTATTCACGTTGGCACCAAACTGGAAGTGGCTTAt > 1:220617/1‑149 (MQ=255) tCTGCCCAGGTGCTACGTGGCGACAAAATTGCCCTGAGTGGTCCGAAGGGGTGCGGCAAAACCACGCTGCTAAAACTGATGCTCGGTCAGCTTCAAGCGGACAGCGGGCGTATTCACGTTGGCACCAAACTGGAAGTGGCTTATTTCg < 5:119056/148‑1 (MQ=255) cccAGGTTCTACGTGGCGACAAAATTGCCCTGATTGGTCCGAATGGGTGCGGCAAAACCACGCTGCTAAAACTGATGCTCGGTCAGCTTCAAGCGGACAGAGGGCGTATTCACGTTGGCACCAAACTGGAAGTGGCTTATTTCGATCAg > 6:64900/1‑149 (MQ=255) cccAGGTTCTACGTGGCGACAAAATTGCCCTGATTGGTCCGAATGGGTGCGGCAAAACCACGCTGCTAAAACTGATGCTCGGTCAGCTTCAAGCGGACAGAGGGCGTATTCACGTTGGCACCAAACTGGAAGTGGCTTATTTCGATCAg > 6:58977/1‑149 (MQ=255) ccAGGTTCTACGTGGCGACAAAATTGCCCTGATTGGTCCGAATGGGTGCGGCAAAACCACGCTGCTAAAACTGATGCTCGGTCAGCTTCAAGCGGACAGCGGGCGTATTCACGTTGGCACCAAACTGGAAGTGGCTTATTTCGATCAg > 5:174737/1‑148 (MQ=255) ttCTACGTGGCGACAAAATTGCCCTGATTGGTCCGAATGGGTGCGGCAAAACCACGCTGCTAAAACTGATGCTCGGTCAGCTTCAAGCGGACAGCGGGCGTATTCACGTTGGCACCAAACTGGAAGTGGCTTATTTCGATCAGCACcgc > 1:326375/1‑149 (MQ=255) tACGTGGCGACAAAATTGCCCTGATTGGTCCGAATGGGTGCGGCAACACCCCGCTGCTAAAGCTGATGCTCGGTCAGCTTCAAGCGGCCAGCGGGCGTATTCCCGTTGGCACCCAACTGGAAGTGGCTGATTTCGATCAGCCCcgcgcg > 4:65143/1‑149 (MQ=255) tACGTGGCGACAAAATTGCCCTGATTGGTCCGAATGGGTGCGGCAAAACCACGCTGCTAAAACTGATGCTCGGTCAGCTTCAAGCGGACAGCGGGCGTATTCACGTTGGCACCAAACTGGAAGTGGCTTAttt < 6:403425/133‑1 (MQ=255) tACGTGGCGACAAAATTGCCCTGATTGGTCCGAATGGGTGCGGCAAAACCACGCTGCTAAAACTGATGCTCGGTCAGCTTCAAGCGGACAGCGGGCGTATTCACGTTGGCACCAAACTGGAAGTGGCTTAttt > 5:403425/1‑133 (MQ=255) gTGGCGACAAAATTGCCCTGATTGGTCCGAATGGGTGCGGCAAAACCACGCTGCTAAAACTGATGCTCGGTCAGCTTCAAGCGGACAGCGGGCGTATTCACGTTGGCACCAAACTGGAAGTGGCTTATTTCGATCAGCACCGCGCGGaa < 6:174737/149‑1 (MQ=255) tGGCGACAAAATTGCCCTGATTGGTCCGAATGGGTGCGGCAAAACCACGCTGCTAAAACTGATGCTCGGTCAGCTTCAAGCGGACAGCGGGCGTATTCACGTTGGCACCAAACTGGAAGTGGCTTATTTCGATCAGCACcgcgcg < 6:295394/145‑1 (MQ=255) tGGCGACAAAATTGCCCTGATTGGTCCGAATGGGTGCGGCAAAACCACGCTGCTAAAACTGATGCTCGGTCAGCTTCAAGCGGACAGCGGGCGTATTCACGTTGGCACCAAACTGGAAGTGGCTTATTTCGATCAGCACcgcgcg > 5:295394/1‑145 (MQ=255) ggCGACAAAATTGCCCTGATTGGTCCGAATGGGTGCGGCAAAACCACGCTGCTAAAACTGATGCTCGGTCAGCTTCAAGCGGACAGCggg > 8:418217/1‑90 (MQ=255) ggCGACAAAATTGCCCTGATTGGTCCGAATGGGTGCGGCAAAACCACGCTGCTAAAACTGATGCTCGGTCAGCTTCAAGCGGACAGCggg < 7:418217/90‑1 (MQ=255) ccTGATTGGTCCGAATGGGTGCGGCAAAACCACGCTGCTAAAACTGATGCTCGGTCAGCTTCAAGCGGACAGCGGGCGTATTCACGTTGGCACCAAACTGGAAGTGGCTTATTTCGATCAGCACCGCGCGGAACTGGATCCCGATaaaa > 1:212875/1‑149 (MQ=255) ccTGATTGGTCCGAATGGGTGCGGCAAAACCACGCTGCTAAAACTGATGCTCGGTCAGCTTCAAGCGGACAGCGGGCGTATTCACGTTGGCACCAAACTGGAAGTGGCTTATTTCGATCAGCACCGCGCGGAACTGGATCCCGATaaaa < 7:234216/149‑1 (MQ=255) ggTCCGAATGGGTGCGGCAAAACCACGCTGCTAAAACTGATGCTCGGTCAGCTTCAAGCGGACAGCGGGCGTATTCACGTTGGCACCAAACTGGAAGTGGCTTATTTCGATCAGCACCGCGCGGAACTGGATCCCGATAAAACGGTGa < 2:67858/148‑1 (MQ=255) ggTCCGAATGGGTGCGGCAAAACCACGCTGCTAAAACTGATGCTCGGTCAGCTTCAAGCGGACAGCGGGCGTATTCACGTTGGCACCAAACTGGAAGTGGCTTATTTCGATCAGCACCGCGCGGAACTGGATCCCGATAAAACGGTGa < 2:326375/148‑1 (MQ=255) gTCCGAATGGGTGCGGCAAAACCACGCTGCTAAAACTGATGCTCGGTCAGCTTCAAGCGGACAGCGGGCGTATTCACGTTGGCACCAAACTGGAAGTGGCTTATTTCGATCAGCACCGCGCGGAACTGGATCCCGATAAAACGGTGATg > 1:48631/1‑149 (MQ=255) gTCCGAATGGGTGCGGCAAAACCACGCTGCTAAAACTGATGCTCGGTCAGCTTCAAGCGGACAGCGGGCGTATTCACGTTGGCACCAAACTGGAAGTGGCTTATTTCGATCAGCACCGCGCGGAACTGGATCCCGATAAAACGGTGATg < 5:10344/149‑1 (MQ=255) tCCGAATGGGTGCGGCAAAACCACGCTGCTAAAACTGATGCTCGGTCAGCTTCAAGCGGACAGCGGGCGTATTCACGTTGGCACCAAACTGGAAGTGGCTTATTTCGATCAGCACCGCGCGGAACTGGATCCCGATAAAACGGTGATg > 8:118741/1‑148 (MQ=255) ccGAATGGGTGCGGCAAAACCACGCTGCTAAAACTGATGCTCGGTCAGCTTCAAGCGGACAGCGGGCGTATTCACGTTGGCACCAAACTGGAAGTGGCTTATTTCGATCAGCACCGCGCGGAACTGGATCCCGATAAAACGGTGATGGa < 6:104029/149‑1 (MQ=255) ggTGCGGCAAAACCACGCTGCTAAAACTGATGCTCGGTCAGCTTCAAGCGGACAGCGGGCGTATTCACGTTGGCACCAAACTGGAAGTGGCTTATTTCGATCAGCACCGCGCGGAACTGGATCCCGATAAAACGGTGATGGATAACCtt < 7:141639/149‑1 (MQ=255) tGCGGCAAAACCACGCTGCTAAAACTGATGCTCGGTCAGCTTCAAGCGGACAGAGGGCGTATTCACGTTGGCACCAAACTGGAAGTGGCTTATTTCGATCAGCACCGCGCGGAACTGGATCCCGATAAAACGGTGATGGATAACCTTGc < 5:58977/149‑1 (MQ=255) tGCGGCAAAACCACGCTGCTAAAACTGATGCTCGGTCAGCTTCAAGCGGACAGAGGGCGTATTCACGTTGGCACCAAACTGGAAGTGGCTTATTTCGATCAGCACCGCGCGGAACTGGATCCCGATAAAACGGTGATGGATAACCTTGc < 5:64900/149‑1 (MQ=255) ggCAAAACCACGCTGCTAAAACTGATGCTCGGTCAGCTTCAAGCGGACAGCGGGCGTATTCACGTTGGCACCAAACTGGAAGTGGCTTATTTCGATCAGCACCGCGCGGAACTGGATCCCGATAAAACGGTGATGGATAACCTTGCCg > 3:335666/1‑148 (MQ=255) gCAAAACCACGCTGCTAAAACTGATGCTCGGTCAGCTTCAAGCGGACAGCGGGCGTATTCACGTTGGCACCAAACTGGAAGTGGCTTATTTCGATCAGCACCGCGCGGAACTGGATCCCGATAAAACGGTGATGGATAACCTTGCCGaa < 7:32437/149‑1 (MQ=255) gCAAAACCACGCTGCTAAAACTGATGCTCGGTCAGCTTCAAGCGGACAGCGGGCGTATTCACGTTGGCACCAAACTGGAAGTGGCTTATTTCGATCAGCACCGCGAGGAACTGGATCCCGATAAAACGGTGATGGATAACCTTGCCg > 4:232683/1‑147 (MQ=255) cAAAACCACGCTGCTAAAACTGATGCTCGGTCAGCTTCAAGTGGACAGCGGGCGTATTCACGTTGGCACCAAACTGGAAGTGGCTTATTTCGATCAGCACCGCGCGGAACTGGATCCCGATAAAACGGTGATGGATAACCTTGCCGAAg < 1:104339/149‑1 (MQ=255) aaaCCACGCTGCTAAAACTGATGCTCGGTCAGCTTCCAGCGGACAGCGGGCGTATTCACGTTGGCACCAAACTGGAAGTGGCTTATTTCGATCAGCACCGCGCGGAACTGAATCCCGATAAAACGGTGATGGATAACCTTGCCGAAgg > 1:224745/1‑148 (MQ=255) aaaCCACGCTGCTAAAACTGATGCTCGGTCAGCTTCAAGCGGACAGCGGGCGTATTCACGTTGGCACCAAACTGGAAGTGGCTTATTTCGATCAGCACCGCGCGGaa > 7:332804/1‑107 (MQ=255) aaaCCACGCTGCTAAAACTGATGCTCGGTCAGCTTCAAGCGGACAGCGGGCGTATTCACGTTGGCACCAAACTGGAAGTGGCTTATTTCGATCAGCACCGCGCGGaa < 8:332804/107‑1 (MQ=255) aCCACGCTGCTAAAACTGATGCTCGGTCAGCTTCAAGCGGACAGCGGGCGTATTCACGTTGGCACCAAACTGGAAGTGGCTTATTTCGATCAGCACCGCGCGGAACTGGATCCCGATAAAACGGTGATGGATAACCTTGCCGAAGGt > 4:237395/1‑147 (MQ=255) cACGCTGCTAAAACTGATGCTCGGTCAGCTTCAAGCGGACAGCGGGCGTATTCACGTTGGCACCAAACTGGAAGTGGCTTATTTCGATCAGCACCGCGCGGAACTGGATCCCGATAAAACGGTGATGGATAACCTTGCCGAAGGTAAg > 3:165797/1‑148 (MQ=255) cACGCTGCTAAAACTGATGCTCGGTCAGCTGCAAGCGGACAGCGGGCGTATTCACGTTGGCACCAAACTGGAAGTGGCTTAATTCGATCAGCAACGCCCGGAACTGGATCCCGATAAAACGGAGATGGATAACCTTGCCGAAGCTAAg > 6:179945/1‑148 (MQ=255) aaaCTGATGCTCGGTCAGCTTCAAGCGGACAGCGGGCGTATTCACGTTGGCACCAAACTGGAAGTGGCTTATTTCGATCAGCACCGCGCGGAACTGGATCCCGATAAAACGGTGATGGATAACCTTGCCGAAGGTAAGCAAGAGGTGAt < 7:118741/149‑1 (MQ=255) aaCTGATGCTCGGTCAGCTTCAAGCGGACAGCGGGCGTATTCACGTTGGCACCAAACTGGAAGTGGCTTATTTCGATCAGCACCGCGCGGAACTGGATCCCGATAAAACGGTGATGGATAACCTTGCCGAAGGTAAGCAAGAGGTGATg > 2:54212/1‑149 (MQ=255) aCTGATGCTCGGTCAGCTTCAAGCGGACAGCGGGCGTATTCACGTTGGCACCAAACTGGAAGTGGCTTATTTCGATCAGCACCGCGCGGAACTGGATCCCGATAAAACGGTGATGGATAACCTTGCCGAAGGTAAGCAAGAGGTGATgg > 4:224931/1‑149 (MQ=255) aTGCTCGGTCAGCTTCAAGCGGACAGCGGGCGTATTCACGTTGGCACCAAACTGGAAGTGGCTTATTTCGATCAGCACCGCGCTTAACTGGATCCCGTTAAAACGGTGATGGATAACCTTGCCGAAGGTAAGCAAGAGGTGATGGTTaa < 7:86040/149‑1 (MQ=255) ggTCAGCTTCAAGCGGACAGCGGGCGTATGCACGTTGGCACCAAACTGGAAGTGGCTTATTTCGATCAGCACCGCGCGGAACTGGATCCCGATAAAACGGTGATGGATAACCTTGCCGAAGGTAAGCAAGAGGTGATGGTTAACGGCaa < 3:65143/149‑1 (MQ=255) gCTTCAAGCGGACAGCGGGCGTATTCACGTTGGCACCAAACTGGAAGTGGCTTATTTCGATCAGCACCGCGCGGAACTGGATCCCGATAAAACGGTGATGGATAACCTTGCCGAAGGTAAGCAAGAGGTGATGGTTAACGGCAAgccac < 2:48631/149‑1 (MQ=255) cTTCAAGCGGACAGCGGGCGTATTCACGTTGGCACCAAACTGGAAGTGGCTTATTTCGATCAGCACCGCGCGGAACTGGATCCCGATAAAACGGTGATGGATAACCTTGCCGAAGGTAAGCAAGAGGTGATGGTTAACGGCAAgccacg > 8:414179/1‑149 (MQ=255) cAAGCGGACAGCGGGCGTATTCACGTTGGCACCAAACTGGAAGTGGCTTATTTCGATCAGCACCGCGCGGAACTGGATCCCGATAAAACGGTGATGGATAACCTTGCCGAAGGTAAGCAAGAGGTGATGGTTAACGGCAAgccacgcc < 4:335666/148‑1 (MQ=255) gCGGACAGCGGGCGTATTCACGTTGGCACCAAACTGGAAGTGGCTTATTTCGATCAGCACCGCGCGGAACTGGATCCCGATAAAACGGTGATGGATAACCTTGCCGAAGGTAAGCAAGAGGTGATGGTTAACGGCAAGccacgccacg > 2:352149/1‑148 (MQ=255) ggACAGCGGGCGTATTCACGTTGGCACCAAACTGGAAGTGGCTTATTTCGATCAGCACCGCGCGGAACTGGATCCCGATAAAACGGTGATGGATAACCTTGCCGAAGGTAAGCAAGAGGTGATGGTTAACGGCAAGCCACGCCACGTAt < 2:220617/149‑1 (MQ=255) gACAGCGGGCGTATTCACGTTGGCACCAAACTGGAAGTGGCTTATTTCGATCAGCACCGCGCGGAACTGGATCCCGATAAAACGGTGATGGATAACCTTGCCGCAGGTAAGCAAGAGGTGATGGTTAACGGCAAGCCACGCCACGTAtt < 2:49907/149‑1 (MQ=255) gACAGCGGGCGTATTCACGTTGGCACCAAACTGGAAGTGGCTTATTTCGATCAGCACCGCGCGGAACTGAATCCCGATAAAACGGTGATGTATAACCTTGCCGAAGGTAAGCAAGAGGTGATGGTTAACGGCAAGCCACGCCACGTAtt < 2:224745/149‑1 (MQ=255) cAGCGGGCGTATTCACGTTGGCACCAAACTGGAAGTGGCTTATTTCGATCAGCACCGCGCGGAACTGGATCCCGATAAAACGGTGATGGATAACCTTGCCGAAGGTAAGCAAGAGGTGATGGTTAACGGCAAGCCACGCCACGTATTgg < 3:224931/149‑1 (MQ=255) | CGTTTGCTACCAGGTTAACGGTAAGCAACTGGTGAAAGATTTTTCTGCCCAGGTTCTACGTGGCGACAAAATTGCCCTGATTGGTCCGAATGGGTGCGGCAAAACCACGCTGCTAAAACTGATGCTCGGTCAGCTTCAAGCGGACAGCGGGCGTATTCACGTTGGCACCAAACTGGAAGTGGCTTATTTCGATCAGCACCGCGCGGAACTGGATCCCGATAAAACGGTGATGGATAACCTTGCCGAAGGTAAGCAAGAGGTGATGGTTAACGGCAAGCCACGCCACGTATTGG > NC_000913/1010935‑1011227 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |