Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 3,045,803 | C→T | 6.9% | Q33Q (CAG→CAA) | ygfF ← | putative NAD(P)‑dependent oxidoreductase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 3,045,803 | 0 | C | T | 6.9% | 277.7 / 7.0 | 89 | Q33Q (CAG→CAA) | ygfF | putative NAD(P)‑dependent oxidoreductase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (40/42); new base T (3/3); total (44/45) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 2.72e-01 |
CTGCTAGCGGTTCATCGTGCTGATCGATTGCTGTAAACATCGCAACGACCTGGTTTTCGTCGCTGATATCCGCCTGGAGCACGAATGCTTTGCCACCGGCTTGCGTTATTAAGTTCATCACTTCCTGCGCCGCGTGGAGGTTTTGCTGATAATTAACCGCCACCGTATACCCTTCTTGCGCCAACAGTAATGCAGTTGCCCGCCCGATGCCGCGACTGCCACCAGTCACAAGTGCTATAGCCATTTGTTTTTCCGAGAAAAATTAATTCGTTGACGTATCTTTGAGATTG > NC_000913/3045658‑3045947 | ctgctAGCGGTTCATCGTGCTGATCGATTGCTGTAAACATCGCAACGACCTGGTTTTCGTCGCTGATATCCGCCTGGAGCACGAATGCTTTGCCACCGGCTTGCGTTATTAAGTTCATCACTTCCTGCGCCGCGTGGAGGTTTTGCTGa < 4:370020/149‑1 (MQ=255) ctAGCGGTTCATCGTGCTGATCGATTGCTGTAAACATCGCAACGACCTGGTTTTCGTCGCTGATATCCGCCTGGAGCACGAATGCTTTGCCTCCGGCTTGCGTTATTAAGTTCATCACTTCCTGCGCCGCGTGGAGGTTTTGCTGATaa < 3:393646/149‑1 (MQ=255) ctAGCGGTTCATCGTGCTGATCGATTGCTGTAAACATCGCAACGACCTGGTTTTCGTCGCTGATATCCGCCTGGAGCACGAATGCTTTGCCACCGGCTTGCGTTATTAAGTTCATCACTTCCTGCGCCGCGTGGAGGTTTTGCTGATaa > 1:175988/1‑149 (MQ=255) ctAGCGGTTCATCGTGCTGATCGATTGCTGTAAACATCGCAACGACCTGGTTTTCGTCGCTGATATCCGCCTGGAGCACGAATGCTTTGCCACCGGCTTGCGTTATAAAGTTCATCACTTCCTGCGCCGCGTGGAGGTTTTGCTGATaa < 8:322148/149‑1 (MQ=255) gTTCATCGTGCTGATCGATTGCTGTAAACATCGCAACGACCTGGTTTTCGTCGCTGATATCCGCCTGGAGCACGAATGCTTTGCCACCGGCTTGCGTTATTAAGTTCATCACTTCCTGCGCCGCGTGGAGGTTTTGCTGATAATTAAcc < 8:429242/149‑1 (MQ=255) aTCGTGCTGATCGATTGCTGTAAACATCGCAACGACCTGGTTTTCGTCGCTGATATCCGCCTGGAGCACGAATGCTTTGCCACCGGCTTGCGTTATTAAGTTCATCACTTCCTGCGCCGCGTGGAGGTTTTGCTGATAATTAACCGCCa > 3:196132/1‑149 (MQ=255) tGATCGATTGCTGTAAACATCGCAACGACCTGGTTTTCGTCGCTGATATCCGCCTGGAGCACGAATGCTTTGCCACCGGCTTGCGTTATTAAGTTCATCACTTCCTGCGCCGCGTGGAGGTTTTGCTGATAATTAACCGCCACCGtata > 6:204398/1‑149 (MQ=255) gATCGATTGCTGTAAACATCGCAACGACCTGGTTTTCGTCGCTGATATCCGCCTGGAGCACGAATGCTTTGCCACCGGCTTGCGTTATTAAGTTCATCACTTCCTGCGCCGCGTGGAGGTTTTGTTGATAATTAACCGCCACCGTATAc > 3:192258/1‑149 (MQ=255) aTCGATTGCTGTAAACATCGCAACGACCTGGTTTTCGTCGCTGATATCCGCCTGGAGCACGAATGCTTTGCCACCGGCTTGCGTTATTAAGTTCATCACTTCCTGCGCCGCGTGGAGGTTTTGCTGATAATTAACCGCCACCGTATAcc < 2:2885/149‑1 (MQ=255) aTCGATTGCTGTAAACATCGCAACGACCTGGTTTTCGTCGCTGATATCCGCCTGGAGCACGAATGCTTTGCCACCGGCTTGCGTTATTAAGTTCATCACTTCCTGCGCCGCGTGGAGGTTTTGCTGATAATTAACCGCCACCGTATAcc > 3:233214/1‑149 (MQ=255) aTCGATTGCTGTAAACATCGCAACGACCTGGTTTTCGTCGCTGATATCCGCCTGGAGCACGAATGCTTTGCCACCGGCTTGCGTTATTAAGTTCATCACTTCCTGCGCCGCGTGGAGGTTTTGCTGATAATTAACCGCCACCGTATAcc > 5:25301/1‑149 (MQ=255) aTCGATTGCTGTAAACATCGCAACGACCTGGTTTTCGTCGCTGATATCCGCCTGGAGCACGAATGCTTTGCCACCGGCTTGCGTTATTAAGTTCATCACTTCCTGCGCCGCGTGGAGGTTTTGCTGATAATTAACCGCCACCGTATAcc > 6:108373/1‑149 (MQ=255) aTCGATTGCTGTAAACATCGCAACGACCTGGTTTTCGTCGCTGATATCCGCCTGGAGCACGAATGCTTTGCCACCGGCTTGCGTTATTAAGTTCATCACTTCCTGCGCCGCGTGGAGGGTTTGCTGATAATTAACCGCCACCGtata < 7:206651/147‑1 (MQ=255) aTCGATTGCTGTAAACATCGCAACGACCTGGTATTCGTCGCTGATATCCGCCTGGAGCACGAATGCTTTGCCACCGGCTTGCGTTATTAAGTTCATCACTTCCTGCGCCGCGTGGAGGTTTTGCTGATAATTAAcc < 6:286025/136‑1 (MQ=255) tCGATTGCTGTAAACATCGCAACGACCTGGTTTTCGTCGCTGATATCCGCCTGGAGCACGAATGCATTGCCACCGGCTTGCGTTATTAAGTTCATCACTTCCTGCGCCGCGTGGAGGTTTTGCTGATAATTAACCGCCACCGTATAccc > 3:128394/1‑149 (MQ=255) ccttAAACATCGCACCGACCTGGTATTCGGCGCTGATATCCGCCTGGAGCACGAATGCTTTGCCACCGGCTTGCGTTATTAAGTTCAGCACTTCCTTCGCCGCGTTGAGGTTTTGCTGATAATTAACCTCCAACGTATACCCTTCTTg < 6:285576/145‑1 (MQ=255) cTGTAAACATCGCAACGACCTGGTTTTCGTCGCTGATATCCGCCTGGAGCACGAATGCTTTGCCACCGGCTTGCGTTATTAAGTTCATCACTTCCTGCGCCGCGTGGAGGTTTTGCTGATAATTAACCGCCACCGtata < 8:111414/139‑1 (MQ=255) cTGTAAACATCGCAACGACCTGGTTTTCGTCGCTGATATCCGCCTGGAGCACGAATGCTTTGCCACCGGCTTGCGTTATTAAGTTCATCACTTCCTGCGCCGCGTGGAGGTTTTGCTGATAATTAACCGCCACCGtata > 7:111414/1‑139 (MQ=255) cTGTAAACATCGCAACGACCTGGTTTTCGTCGCTGATATCCGCCTGGAGCACGAATGCTTTGCCACCGGCTTGCGTTATTAAGTTCATCACTTCCTGCGCCGCGTGGAGGTTTTGCTGATAATTAACCGCCACCGTATACCCTTCTTgc > 3:306169/1‑149 (MQ=255) tAAACATCGCAACGACCTGGTTTTCGTCGCTGATATCCGCCTGGAGCACGAATGCTTTGCCACCGTCTTGCGTTATTAAGTTCATAACTTCCTGCGCCGCGTGGAGGTTTTGCTTATAATTAACCGACACCGTATCCACTTCTTgcgc > 6:403307/1‑148 (MQ=255) tAAACATCGCAACGACCTGGTTTTCGTCGCTGATATCCGCCTGGAGCACGAATGCTTTGCCACCGGCTTGCGTTATTAAGTTCATCACTTCCTGCGCCGCGTGGAGGTTTTGCTGATAATTAACCGCCACCGTATACCCTTCTTgcgc > 8:231110/1‑148 (MQ=255) aaCATCGCAACGACCTGGTTTTCGTCGCTGATATCCGCCTGGAGCACGAATGCTTTGCCACCGGCTTGCGTTATTAAGTTCATCACTTCCTGCGCCGCGTGGAGGTTTTGCTGATAATTAACCGCCACCGTATACCCTTCTTGCGCCa < 4:250282/148‑1 (MQ=255) aTCGCAACGACCTGGTTTTCGTCGCTGATATCCGCCTGGAGCACGAATGCTTTGCCACCGGCTTGCGTTATTAAGTTCATCACTTCCTGCGCCGCGTGGAGGTTTTGTTGATAATTAACCGCCACCGTATACCCTTCTTGCGCCAACAg > 1:70887/1‑149 (MQ=255) aTCGCAACGACCTGGTTTTCGTCGCTGATATCCGCCTGGAGCACGAATGCTTTGCCACCGGCTTGCGTTATTAAGTTCATCACTTCCTGCGCCGCGTGGAGGTTTTGCTGATAATTAACCGCCACCGTATACCCTTCTTGCGCCAACAg < 1:137982/149‑1 (MQ=255) tCGCAACGACCTGGTTTTCGTCGCTGATATCCGCCTGGAGCACGAATGCTTTGCCACCGGCTTGCGTTATTAAGTTCATCACTTCCTGCGCCGCGTGGAGGTTTTGCTGATAATTAACCGCCACCGTATAccc > 3:218295/1‑133 (MQ=255) tCGCAACGACCTGGTTTTCGTCGCTGATATCCGCCTGGAGCACGAATGCTTTGCCACCGGCTTGCGTTATTAAGTTCATCACTTCCTGCGCCGCGTGGAGGTTTTGCTGATAATTAACCGCCACCGTATAccc < 4:218295/133‑1 (MQ=255) gCAACGACCTGGTTTTCGTCGCTGATATCCGCCTGGAGCACGAATGCTTTGCCACCGGCTTGCGTTATTAAGTTCATCACTTCCTGCGCCGCGTGGAGGTTTTGTTGATAATTAACCGCCACCGTATACCCTTCTTGCGCCAACAGTaa < 2:70887/149‑1 (MQ=255) gCAACGACCTGGTTTTCGTCGCTGATATCCGCCTGGAGCACGAATGCTTTGCCACCGGCTTGCGTTATTAAGTTCATCACTTCCTGCGCCGCGTGGAGGTTTTGCTGATAATTAACCGCCACCGTATACCCTTCTTGCGCCAACAGTaa < 5:194194/149‑1 (MQ=255) gCAACGACCTGGTTTTCGTAGCTGATATCCGCCTGGAGCAAGAATGCTTTGCCACCGGCTTGAGTTATTAAGTTCATCACTTCCTGCGCCGCGTGGAGGTTTTGCTTATAATTAACCGCCACCGTATACCCTTCTTGCGCCAACAGTa < 2:404304/148‑1 (MQ=255) aaCGACCTGGTTTTCGTCGCTGATATCCGCCTGGAGCACGAATGCTTTGCCACCGGCTTGCGTTATTAAGTTCATCACTTCCTGCGCCGCGTGGAGGTTTTGTTGATAATTAACCGCCACCGTATACCCTTCTTGCGCCAACAGTAATg < 4:192258/149‑1 (MQ=255) aaCGACCTGGTTTTCGTCGCTGATATCCGCCTGGAGCACGAATGCTTTGCCACCGGCTTGCGTTATTAAGTTCATCACTTCCTGCGCCGCGTGGAGGTTTTGCTGATAATTACCCGCCACCGGATACCCTTCTTGCGCCAACAGTAATg > 3:47240/1‑149 (MQ=255) gACCTGGTTTTCGTCGCTGATATCCGCCTGGAGCACGAATGCTTTGCCACCGGCTTGCGTTATTAAGTTCATCACTTCCTGCGCCGCGTGGAGGTTTTGCTGATAATTAACCGCCACCGTATACCCTTCTTGCGCCAACAGTAATGCAg < 5:128541/149‑1 (MQ=255) aCCTGGTTTTCGTCGCTGATATCCGCCTGGAGCACGAATGCTTTGCCACCGGCTTGCGTTATTAAGTTCATCACTTCCTGCGCCGCGTGGAGGTTTTGCTGATaa < 4:248961/105‑1 (MQ=255) aCCTGGTTTTCGTCGCTGATATCCGCCTGGAGCACGAATGCTTTGCCACCGGCTTGCGTTATTAAGTTCATCACTTCCTGCGCCGCGTGGAGGTTTTGCTGATaa > 3:248961/1‑105 (MQ=255) aCCTGGTTTTCGTCGCTGATATCCGCCTGGAGCACGAATGCTTTGCCACCGGCTTGCGTTATTAAGTTCATCACTTCCTGCGCCGCGTGGAGGTTTTGCTGATAATTAACCGCCACCGTATACCCTTCTTGCGCCAACAGTAATGCAGt < 4:233214/149‑1 (MQ=255) ccTGGTTTTCGTCGCTGATATCCGCCTGGAGCACGAATGCTTTGCCACCGGCTTGAGTGATTAAGTTCCTCACTTCCTGCGCCGCGTGGAGGTTTTGGTGATAATTACAAGACCCCGTATACCCTTCTTGCGCCAACAGTAATGCAggt > 6:404077/1‑147 (MQ=255) cTGGTTTTCGTCGCTGATATCCGCCTGGAGCACGAATGCTTTGCCACCGGCTTGCGTTATTAAGTTCATCACTTCCTGCGCCGCGTGGAGGTTTTGTTGATAATTAACCGCCACCGTATACCCTTCTTGCGCCAACAg > 8:272280/1‑138 (MQ=255) cTGGTTTTCGTCGCTGATATCCGCCTGGAGCACGAATGCTTTGCCACCGGCTTGCGTTATTAAGTTCATCACTTCCTGCGCCGCGTGGAGGTTTTGTTGATAATTAACCGCCACCGTATACCCTTCTTGCGCCAACAg < 7:272280/138‑1 (MQ=255) cTGGTTTTCGTCGCTGATATCCGCCTGGAGCACGAATGCTTTGCCACCGGCTTGCGTTATTAAGTTCATCACTTCCTGCGCCGCGTGGAGGTTTTGCTGATAATTAACCGCCACCGTATACCCTTCTTGCGCCAACAg > 6:137013/1‑138 (MQ=255) cTGGTTTTCGTCGCTGATATCCGCCTGGAGCACGAATGCTTTGCCACCGGCTTGCGTTATTAAGTTCATCACTTCCTGCGCCGCGTGGAGGTTTTGCTGATAATTAACCGCCACCGTATACCCTTCTTGCGCCAACAg < 5:137013/138‑1 (MQ=255) tGGTTTTCGTCGCTGATATCCGCCTGGAGCACGAATGCTTTGCCACCGGCTTGCGTTATTAAGTTCATCACTTCCTGCGCCGCGTGGAGGTTTTGCTGATAATTAACCGCCACCGTATACCCTTCTTGCGCCAACAGTAATGCAGTTgc > 5:200653/1‑149 (MQ=255) ggTTTTCGTCGCTGATATCCGCCTGGAGCACGAATGCTTTGCCACCGGCTTGCGTTATTAAGTTCATCACTTCCTGCGCCGCGTGGAGGTTTTGCTGATAATTAACCGCCACCGTATACCCTTCTTGCGCCAACAGTAATGCAGTTgcc > 8:319383/1‑149 (MQ=255) gTTTTCGTCGCTGATATCCGCCTGGAGCACGAATGCTTTGCCACCGGCTTGCGTTATTAAGTTCATCACTTCCTGCGCCGCGTGGAGGTTTTGCTGATAATTAACCGCCACCTTATACCCTTCTTGCGCCAACAGTAATGCAGTTgccc < 4:306169/149‑1 (MQ=255) gTTTTCGTCGCTGATATCCGCCTGGAGCACGAATGCTTTGCCACCGGCTTGCGTTATTAAGTTCATCACTTCCTGCGCCGCGTGGAGGTTTTGCTGATAATTAACCGCCACCGTATACCCTTCTTGCGCCAACAGTAATGCAGTTgc < 8:237161/147‑1 (MQ=255) ttttCGTCGCTGATATCCGCCTGGAGCACGAATGCTTTGCCACCGGCTTGCGTTATTAAGTTCATCACTTCCTGCGCCGCGTGGAGGTTTTGCTGATAATTAACCGCCACCGTATACCCTTCTTGCGCCAACAGTAATGCAGTTgcccg > 5:203160/1‑149 (MQ=255) gtcgCTGATATCCGCCTGGAGCACGAATGCTTTGCCACCGGCTTGCGTTATTAAGTTCATCACTTCCTGCGCCGCGTGGAGGTTTTGCTGATAATTAACCGCCACCGTATACCCTTCTTGCGCCAACAGTAATGCAGTTGCCCGCCCGa < 8:118731/149‑1 (MQ=255) gCTGATATCCGCCTGGAGCACGAATGCTTTGCCACCGGCTTGCGTTATTAAGTTCATCACTTCCTGCGCCGCGTGGAGGTTTTGCTGAt < 6:333222/89‑1 (MQ=255) gCTGATATCCGCCTGGAGCACGAATGCTTTGCCACCGGCTTGCGTTATTAAGTTCATCACTTCCTGCGCCGCGTGGAGGTTTTGCTGAt > 5:333222/1‑89 (MQ=255) tGATATCCGCCTGGAGCACGAATGCTTTGCCACCGGCTTGCGTTATTAAGTTCATCACTTCCTGCGCCGCGTGGAGGTTTTGCTGATAATTACCCGCCACCGTATACCCTTCTTGCGCCAACAGTAATGCAGTTGCCCGCCCGATGCcg > 6:413679/1‑149 (MQ=255) tGATATCCGCCTGGAGCACGAATGCTTAGCCACCGGCTTGCGTTATTAAGTTCATCACTTCCTGCGCCGCGTGGAGGTTTTGCTGATAATTAACCGCCACCGTATACCCTTCTTGCGCCAACAGTAATGCAGtt > 7:190098/1‑134 (MQ=255) atatCCGCCTGGAGCACGAATGCTTTGCCACCGGCTTGCGTTATTAAGTTCATCACTTCCTGCGCCGCGTGGAGGTTTTGCTGATAATTAACCGCCACCGTATACCCTTCTTGCGCCAACAGTAATGCAGTTGCCCGCCCGATGCcgcg < 7:231110/149‑1 (MQ=255) tatCCGCCTGGAGCACGAATGCTTTGCCACCGGCTTGCGTTATTAAGTTCATCACTTCCTGCGCCGCGTGGAGGTTTTGCTGATAATTAACCGCCACCGTATACCCTTCTTGCGCCAACAGTAATGCAGTTGCCCGCCCGATGCCGCGa < 8:235087/149‑1 (MQ=255) cGCCTGGAGCACGAATGCTTTGCCACCGGCTTGCGTTATTAAGTTCATCACTTCCTGCGCCGCGTGGAGGTTTTGCTGATAATTAACCGCCACCGTATACCCTTCTTGCGCCAACAGTAATGCAGTTGCCCGCCCGATGCCGCGACt < 1:387665/147‑1 (MQ=255) cGCCTGGAGCACGAATGCTTTGCCACCGGCTTGCGTTATTAAGTTCATCACTTCCTGCGCCGCGTGGAGGTTTTGCTGATAATTAACCGCCACCGTATACCCTTCTTGCGCCAACAGTAATGCAGTTGCCCGCCCGATGCCGCGACt > 2:387665/1‑147 (MQ=255) gCCTGGAGCACGAATGCTTTGCCACCGGCTTGCGTTATTAAGTTCATCACTTCCTGCGCCGCGTGGAGGTTTTGCTGATAATTAACCGCCACCGTATACCCTTCTTGCGCCAACAGTAATGCAGTTGCCCGCCCGATGCCGCGACTGc > 2:270729/1‑148 (MQ=255) gAGCACGAATGCTTTGCCACCGGCTTGCGTTATTAAGTTCATCACTTCCTGCGCCGCGTGGAGGTTTTGCTGATAATTAACCGCCACCGTATACCCTTCTTGCGCCAACAGTAATGCAGTTGCCCGCCCGATGCCGCGACTGccacca < 2:175988/148‑1 (MQ=255) aGCACGAATGCTTTGCCACCGGCTTGCGTTATTAAGTTCATCACTTCCTGCGCCGCGTGGAGGTTTTGCTGATAATTAACCGCCACCGTATACCCTTCTTGCGCCAACAGTAATGCAGTTGCCCGCCCGATGCCGCGACTGCCACCAGt < 6:203160/149‑1 (MQ=255) aCGAATGCTTTGCCACCGGCTTGCGTTATTAAGTTCATCACTTCCTGCGCCGCGTGGAGGTTTTGCTGATAATTAACCGCCACCGTATACCCTTCTTGCGCCAACAGTAATGCAGTTGCCCGCCCGATGCCGCGACTGCCACCAGTca > 8:150326/1‑148 (MQ=255) tttGCCACCGGCTTGCGTTATTAAGTTCATCACTTCCTGCGCCGCGTGGAGGTTTTGCTGATAATTAACCGCCACCGTATACCCTTCTTGCGCCAACAGTAATGCAGTTGCCCGCCCGATGCCGCGACTGCCACCAGTCACAAGTGCta > 6:168399/1‑149 (MQ=255) tttGCCACCGGCTTGCGTTATTAAGTTCATCACTTCCTGCGCCGCGTGGAGGTTTTGCTGATAATTAACCGCCACCGTATACCCTTCTTGCGCCAACAGTAATGCAGTTGCCCGCCCGATGCCGCGACTGCCACCAGTCACAAGTGCta > 1:67878/1‑149 (MQ=255) ccACCGGCTTGCGTTATTAAGTTCATCACTTCCTGCGCCGCGTGGAGGTTTTGCTGATAATTAACCGCCACCGTATACCCTTCTTGCGCCAACAGTAATGCAGTTGCCCGCCCGATGCCGCGACTGCCACCAGTCACAAGTGCTATAGc < 7:319383/149‑1 (MQ=255) cACCGGCTTGCGTTATTAAGTTCATCACTTCCTGCGCCGCGTGGAGGTTTTGCTGATAATTAACCGCCACCGTATACCCTTCTTGCGCCAACAGTAATGCAGTTGCCCGCCCGATGCCGCGACTGCCACCAGTCACAAGTGCTATAGc > 5:236538/1‑148 (MQ=255) cACCGGCTTGCGTGATTAAGTTCATCACTTCCTGCGCCGCGTGGAGGTTTTGCTGATAATTAACCGCCACCGTATACCctt > 8:357343/1‑81 (MQ=255) aCCGGCTTGCGTTATTAAGTTCATCACTTCCTGCGCCGCGTGGAGGTTTTGCTGATAATTAACCGCCACCGTATACCCTTCTTGCGCCAACAGTAATGCAGTTGCCCGCCCGATGCCGCGACTGCCACCAGTCACAAGTGCTATAGCCa > 5:69015/1‑149 (MQ=255) ggCTTGCGTTATTAAGTTCATCACTTCCTGCGCCGCGTGGAGGTTTTGCTGATAATTAACCGCCACCGTATACCCTTCTTGCGCCAACAGTAATGCAGTTGCCCGCCCGATGCCGCGACTGCCACCAGTCACAAGTGCTATAGCCAttt < 5:168399/149‑1 (MQ=255) cTTGCGTTATTAAGTTCATCACTTCCTGCGCCGCGTGGAGGTTTTGCTGATAATTAACCGCCACCGTATACCCTTCTTGCGCCAACAGTAATGCAGTTGCCCGCCCGATGCCGCGACTGCCACCAGTCACAAGTGCTATAGCCATTTGt < 6:25301/149‑1 (MQ=255) cGTTATTAAGTTCATCACTTCCTGCGCCGCGTGGAGGTTTTGCTGATAATTAACCGCCACCGTATACCCTTCTTGCGCCAACAGTAATGCAGTTGCCCGCCCGATGCCGCGa > 1:296852/1‑112 (MQ=255) cGTTATTAAGTTCATCACTTCCTGCGCCGCGTGGAGGTTTTGCTGATAATTAACCGCCACCGTATACCCTTCTTGCGCCAACAGTAATGCAGTTGCCCGCCCGATGCCGCGa < 2:296852/112‑1 (MQ=255) tattaAGTTCATCACTTCCTGCGCCGCGTGGAGGTTTTGCTGATAATTAACCGCCACCGTATACCCTTCTTGCGCCAACAGTAATGCTGTTGCCCGCCCGATGCCGCGACTTccacca < 7:71896/118‑1 (MQ=255) tattaAGTTCATCACTTCCTGCGCCGCGTGGAGGTTTTGCTGATAATTAACCGCCACCGTATACCCTTCTTGCGCCAACAGTAATGCAGTTGCCCGCCCGATGCCGCGACTGCCACCAGTCACAAGTGCTATAGCCATTTGTTTTTcc > 7:356447/1‑148 (MQ=255) tattaAGTTCATCACTTCCTGCGCCGCGTGGAGGTTTTGCTGATAATTAACCGCCACCGTATACCCTTCTTGCGCCAACAGTAATGCAGTTGCCCGCCCGATGCCGCGACTGCCACCAGTCACAAGTGCTATAGCCATTTGTTTTTcc > 3:119505/1‑148 (MQ=255) tattaAGTTCATCACTTCCTGCGCCGCGTGGAGGTTTTGCTGATAATTAACCGACACCGTATACCCTTCTTGCGCCAACAGTAATGCAGTTGCCCGCACCATGCCGCGACTGccacca > 8:71896/1‑118 (MQ=255) gTTCATCACTTCCTGCGCCGCGTGGAGGTTTTGCTGATAATTAACCGCCACCGTATACCCTTCTTGCGCCAACAGTAATGCAGTTGCCCGCCCGATGCCGCGACTGCCACCAGTCACAAGTGCTATAGCCATTTGTTTTTCCGAGaaa > 5:95549/1‑148 (MQ=255) tcaCTTCCTGCGCCGCGTGGAGGTTTTGCTGATAATTAACCGCCACCGTATACCCTTCTTGCGCCAACAGTAATGCAGTTGCCCGCCCGATGCCGCGACTGCCACCAGTCACAAGTGCTATAGCCATTTGTTTTTCCGAGAAAaattaa > 4:40459/1‑149 (MQ=255) tcaCTTCCTGCGCCGCGTGGAGGTTTTGCTGATAATTAACCGCCACCGTATACCCTTCTTGCGCCAACAGTAATGCAGTTGCCCGCCCGATGCCGCGACTGCCACCAGTCACAAGTGCTATAGCCATTTGTTTTTCCGAGAAAaattaa < 4:196132/149‑1 (MQ=255) tcaCTTCCTGCGCCGCGTGGAGGTTTTGCTGATAATTAACCGCCACCGTATACCCTTCTTGCGCCAACAGTAATGCAGTTGCCCGCCCGATGCCGCGACTGCCACCAGTCACAAGTGCTATAGCCATTTGTTTTTCCGAGAAAaattaa > 7:59287/1‑149 (MQ=255) tcaCTTCCTGCGCCGCGTGGAGGTTTTGCTGATAATTAACCGCCACCGTATACCCTTCTTGCGCCAACAGTAATGCAGTTGCCCGCCCGATGCCGCGACTGCCACCAGTCACAAGTGCTATAGCCATTTGTTTTTCCGAGAAAaattaa > 5:176934/1‑149 (MQ=255) caCTTCCTGCGCCGCGTGGAGGTTTTGCTGATAATTAACCGCCACCGTATACCCTTCTTGCGCCAACAGTAATGCAGTTGCCCGCCCGATGCCGCGACTGCCACCAGTCACAAGTGCTATAGCCATTTGTTTTTCCGAGAAAaattaat > 2:388487/1‑149 (MQ=255) aCTTCCTGCGCCGCGTGGAGGTTTTGCTGATAATTAACCGCCACCGTATACCCTTCTTGCGCCAACAGTAATGCAGTTGCCCGCCCGATGCCGCGACTGCCACCAGTCACAAGTGCTATAGCCATTTGTTTTTCCGAGAAAaattaat < 2:50602/148‑1 (MQ=255) cgcgTGGAGGTTTTGCTGATAATTAACCGCCACCGTATACCCTTCTTGCGCCAACAGTAATGCAGTTGCCCGCCCGATGCCGCGACTGCCACCAGTCACAAGTGCTATAGCCATTTGTTTTTCCGAGAAAAATTAATTCGTTGACGTAt < 6:69015/149‑1 (MQ=255) tGGAGGTTTTGCTGATAATTAACCGCCACCGTATACCCTTCTTGCGCCAACAGt > 7:60241/1‑54 (MQ=255) tGGAGGTTTTGCTGATAATTAACCGCCACCGTATACCCTTCTTGCGCCAACAGt < 8:60241/54‑1 (MQ=255) tGGAGGTTTTGCTGATAATTAACCGCCACCGTATACCCTTCTTGCGCCAACAGTAATGCAGTTGCCCGCCCGATGCCGCGACTGCCACCAGTCACAAGTGCTATAGCCATTTGTTTTTCCGAGAAAAATTAATTCGTTGACGTATCttt < 2:67878/149‑1 (MQ=255) tGGAGGTTTTGCTGATAATTAACCGCCACCGTATACCCTTCTTGCGCCAACAGTAATGCAGTTGCCCGCCCGATGCCGCGACTGCCACCAGTCACAAGTGCTATAGCCATTTGTTTTTCCGAGAAAAATTAATTCGTTGACGTATCttt < 7:150326/149‑1 (MQ=255) gAGGTTTTGCTGATAATTAACCGCCACCGTATACCCTTCTTGCGCCAACAGTAATGCAGTTGCCCGCCCGATGc > 8:141193/1‑74 (MQ=255) gAGGTTTTGCTGATAATTAACCGCCACCGTATACCCTTCTTGCGCCAACAGTAATGCAGTTGCCCGCCCGATGc < 7:141193/74‑1 (MQ=255) gAGGTTTTGCTGATAATTAACCGCCACCGTATACCCTTCTTGCGCCAACAGTAATGCAGTTGCCCGCCCGATGCCGCGACTGCCACCAGTCACAAGTGCTATAGCCATTTGTTTTTCCGAGAAAAATTAATTCGTTGACGTATCTTTga < 8:356447/149‑1 (MQ=255) gAGGTTTTGCTGATAATTAACCGCCACCGTATACCCTTCTTGCGCCAACAGTAATGCAGTTGCCCGCCCGATGCCGCGACTGCCACCAGTCACAAGTGCTATAGCCATTTGTTTTTCCGAGAAAAATTAATTCGTTGACGTATCTTTg < 1:270729/148‑1 (MQ=255) ttGCTGCTAATTAACCGCCACCGTATACCCTGCTTGCGCCAACAGTAATGCAGTTGCCCGCCCGATGCAGCGACTGCCACCAGTCACAAGTGCTATAGCCATTTGTTTTTCCGAGAAAAATTAATTCGTTGACGTATCTTTGAGATTg < 5:204398/148‑1 (MQ=255) | CTGCTAGCGGTTCATCGTGCTGATCGATTGCTGTAAACATCGCAACGACCTGGTTTTCGTCGCTGATATCCGCCTGGAGCACGAATGCTTTGCCACCGGCTTGCGTTATTAAGTTCATCACTTCCTGCGCCGCGTGGAGGTTTTGCTGATAATTAACCGCCACCGTATACCCTTCTTGCGCCAACAGTAATGCAGTTGCCCGCCCGATGCCGCGACTGCCACCAGTCACAAGTGCTATAGCCATTTGTTTTTCCGAGAAAAATTAATTCGTTGACGTATCTTTGAGATTG > NC_000913/3045658‑3045947 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |