New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 2325633 = | 85 (0.930) | 3 (0.040) | 3/244 | NT | 3.6% | coding (878/1323 nt) | atoE | short chain fatty acid transporter |
? | NC_000913 | 2325660 = | 83 (0.970) | coding (905/1323 nt) | atoE | short chain fatty acid transporter | |||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
GCATTCTGACGTTGATCATCGGCGCACTCGGTATCGCTTACCTTGCGATGTACTTCAGCGAACATGGCTTCAACATCACCATCAATACCGTCAACCTGATGTTTATGATTGCGGGTCTGCTGCTACATAAAACGCCAATGGCTTATATGCGTGCTATCAGCGCGGC‑AGCACGCAGTACTGCCGGTATTCTGGTGCAATTCCCCTTCTACGCTGGGATCCAACTGATGATGGAGCATTCCGGTCTGGGCGGACTCATTACCGAATTCTTCATCAATGTTGCGAACAAAGACACC > NC_000913/2325486‑2325778 | cagaactaaaaaaggtcattaccgggaaggtgtctttgttcgcaacattgatgaagaattcggtaatgagtccgcccagaccggaatgctccatcatcagttggatcccagcgtagaaggggaattgcaccagaataccggcagtacTg < 3:37238‑M1/2‑1 (MQ=255) aTTCTGACGTTGATCATCGGCGCACTCGGTATCGCTTACCTTGCGATGTACTTCAGCGAACATGGCTTCAACATCACCATCAATACCGTCAACCTGATGTTTATGATTGCGGGTCTGCTGCTACATAAAACGCCAATGGCTTATATGCg < 6:70775/149‑1 (MQ=255) actaaaaaagggcattaccgggaaggtgtctttgttcgcaacattgatgaagaattcggtaatgagtccgcccagcccggaatgctccatcatcagttggatcccagcgtagaaggggaattgcaccagaataccggcagtacTGCGTg > 6:236979‑M1/144‑149 (MQ=255) ctaaaaaaggtcattacagggaaggtgtctttgttcgcaacattgatgaagaattcggtaatgagtccgcccagacctgaatgctcaatcatcagttggatcccagcgtagaaggggaattgcaccagaaaaccggcagtacTGCGTGc < 1:160434‑M1/7‑1 (MQ=255) cTGACGTTGATCATCGGCGCACTCGGTATCGCTTACCTTGCGATGTACTTCAGCGAACATGGCTTCAACATCACCATCAATACCGTCAACCTGATGTTTATGATTGCGGGTCTGCTGCTACATAAAACGCCAATGGCTTATATGCGTg < 4:213585/148‑1 (MQ=255) taaaaaaggtcattaccgggaaggtgtctttgttcgaaacattgatgaagaattcggtaatgagtccgcccagaccggaatgctccatcatcagttggatcccagcgtagaaggggaattgcaccagaataccggcagtacTGCGTGCt < 5:11886‑M1/8‑1 (MQ=255) tGACGTTGATCATCGGCGCACTCGGTATCGCTTACCTTGCGATGTACTTCAGCGAACATGGCTTCAACATCACCATCAATACCGTCAACCTGATGTTTATGATTGCGGGTCTGCTGCTACATAAAACGCCAATGGCTTATATGCGTga > 5:204336/1‑147 (MQ=255) tGACGTTGATCATCGGCGCACTCGGTATCGCTTACCTTGCGATGTACTTCAGCGAACATGGCTTCAACATCACCATCAATACCGTCAACCTGATGTTTATGATTGCGGGTCTGCTGCTACATAAAACGCCAATGGCTTATATGCGTGc > 6:255230/1‑148 (MQ=255) aCGTTGATCATCGGCGCACTCGGTATCGCTTACCTTGCGATGTACTTCAGCGAACATGGCTTCAACATCACCATCAATACCGTCAACCTGATGTTTATGATTGCGGGTCTGCTGCTACATAAAACGCCAATGGCTTATATGCGTGCTAt < 6:230386/149‑1 (MQ=255) aCGTGGATCAGCGGCGCACTCGGTATCGCTTAGCTTGCGATGTACTTCAGCGAACATGGCTTCACAATCACCATCAATACCGTCAACCTGATGTTTATGTTTGCGGGTCTGCTGCTACATAAAACGCCAATGGCTTATATGAGTGCTAt < 3:119826/149‑1 (MQ=255) aggtcattaccgggaaggtgtctttgttcgcaacattgatgaagaattcggtaatgagtccgcccagaccggaatgctccatcatcagttggatcccagcgtagaaggggaattgcaccagaataccggcagtacTGCGTg > 1:222854‑M1/136‑141 (MQ=255) aggtcattaccgggaaggtgtctttgttcgcaacattgatgaagaattcggtaatgagtccgcccagaccggaatgctccatcatcagttggatcccagcgtagaaggggaattgcaccagaataccggcagtacTGCGTg < 2:222854‑M1/6‑1 (MQ=255) gATCATCGGCGCACTCGGTATCGCTTACCTTGCGATGTACTTCAGCGAACATGGCTTCAACATCCCCATCAATACCGTCAACCTGATGTTTATGATTGCGGGTCTGCTGCTACATAAAACGCCAATGGCTTATATGCGTGCTATCAgcg > 4:31042/1‑149 (MQ=255) tcatcGGCGCACTCGGTATCGCTTTCCTTGCGATGTACTTCAGCGAACATGGCTTCAACATCACCATCAATACCGTCAACCTGATGTTTATGATTGGGGGTCTGCTGCTACATAAAACGCCAATGGCTTATATGCGTGCTATCAgcgc < 2:378630/148‑1 (MQ=255) tcatcGGCGCACTCGGTATCGCTTACCTTGCGATGTACTTCAGCGAACATGGCTTCAACATCACCATCAATACCGTCAACCTGATGTTTATGATTGCGGGTCTGCTGCTACATAAAACGCCAATGGCTTATATGCGTGCTATCAGcgcg > 2:236563/1‑149 (MQ=255) tcatcGGCGCACTCGGTATCGCTTACCTTGCGATGTACTTCAGCGAACATGGCTTCAACATCACCATCAATACCGTCAACCTGATGTTTATGATTGCGGGTCTGCTGCTACATAAAACGCCAATGGCTTATATGCGTGCTATCAGcgcg < 2:40807/149‑1 (MQ=255) tcatcGGCGCACTCGGTATCGCTTACCTTGCGATGTACTTCAGCGAACATGGCTTCAACATCACCATCAATACCGTCAACCTGATGTTTATGATTGCGGGTCTGCTGCTACATAAAACGCCAATGGCTTATATGCGTGCTATCAGcgcg > 1:340781/1‑149 (MQ=255) tcGGCGCACTCGGTATCGCTTACCTTGCGATGTACTTCAGCGAACATGGCTTCAACATCACCATCAATACCGTCAACCTGATGTTTATGATTGCGGGTCTGCTGCTACATAAAACGCCAATGGCTTATATGCGTGCTATCAGCGCgg > 2:149974/1‑147 (MQ=255) 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ttCAACATCACCATCAATACCGTCAACCTGATGTTTATGATTGCGGGTCTGCTGCTACATAAAACGCCAATGGCTTATATGCGTGCTATCAGCGCGGC‑AGCACGCAGTACTGCCGGTATTCTGGTGCAATTCCCCTTCTACGCTGGGAt > 5:296173/1‑149 (MQ=255) ttCAACATCACCATCAATACCGTCAACCTGATGTTTATGATTGCGGGTCTGCTGCTACATAAAACGCCAATGGCTTATATGCGTGCTATCAGCGCGGC‑AGCACGCAGTACTGCCGGTATTCTGGTGCAATTCCCCTTCTACGCTGGGAt > 2:123830/1‑149 (MQ=255) cAACATCACCATCAATACCGTCAACCTGATGTTTATGATTGCGGGTCTGCTGCTACATAAAACGCCAATGGCTTATATGCGTGCTATCAGCGCGGC‑AGCACGCAGTACTGCCGGTATTCTGGTGCAATTCCCCTTCTACGCTGGGATc > 3:215580/1‑148 (MQ=255) cAACATCACCATCAATACCGTCAACCTGATGATTATGATTGCGGGTCTGCTGCTACATAAAACCCCAATGGCTTATATGCGTGCTATCAGCGCGGC‑AGCACGCAGTACTGCCGGTATTCTGGTGCAATTCCCCTACTACGCTGGGATc > 5:411589/1‑148 (MQ=255) aCATCACCATCAATACCGTCAACCTGATGTTTATGATTGCGGGTCTGCTGCTACATAAAACGCCAATGGCTTATATGCGTGCTATCAGCGAGGC‑AGCACGCAGTACTGCCGGTATTCTGTTGCAATTCACCTTCTACGCTGTGATACaa > 2:275988/1‑149 (MQ=255) 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2:8516/149‑1 (MQ=255) accagaataccggcagtacTGCGTGCTGCC‑GCGCTGATAGCACGCAGTACTGCCGGTATTCTGGTGCAATTCCCCTTCTACGCTGGGATCCAACTGATGATGGAGCATTCCGGTc < 1:102609‑M1/96‑1 (MQ=255) accagaataccggcagtacTGCGTGCTGCC‑GCGCTGATAGCACGCAGTACTGCCGGTATTCTGGTGCAATTCCCCTTCTACGCTGGGATCCAACTGATGATGGAGCATTCCGGTc > 2:102609‑M1/20‑115 (MQ=255) aaCGCCAATGGCTTATATGCGTGCTATCAGCGCGGC‑AGCACGCAGTACTGCCGGTATTCTGGTGCAATTCCCCTTCTACGCTGGGATCCAACTGATGATGGAGCATTCCGGTCTg < 4:20012/115‑1 (MQ=255) aaCGCCAATGGCTTATATGCGTGCTATCAGCGCGGC‑AGCACGCAGTACTGCCGGTATTCTGGTGCAATTCCCCTTCTACGCTGGGATCCAACTGATGATGGAGCATTCCGGTCTg > 3:20012/1‑115 (MQ=255) aaCGCCAATGGCTTATATGCGTGCTATCAGCGCGGC‑AGCACGCAGTACTGCCGGTATTCTGGTGCAATTCCCCTTCTACGCTGGGATCCAACTGATGATGGAGCATTCCGGTCTGGGCGGACTCATTACCGAATTCTTCATCACTGTTg < 2:260013/149‑1 (MQ=255) aaCGCCAATGGCTTATATGCGTGCTATCAGCGCGGC‑AGCACGCAGTACTGCCGGTATTCTGGTGCAATTCCCCTTCTACGCTGGGATCCAACTGATGATGGAGCATTCCGGTCTGGGCGGACTCATTACCGAATTCTTCATCAATGTTg > 4:342913/1‑149 (MQ=255) cGCCAATGGCTTATATGCGTGCTATCAGCGCGGC‑AGCACGCAGTACTGCCGGTATTCTGGTGCAATTCCCCTTCTACGCTGGGATCCAACTGATGATGGAGCATTCCGGTCTGGGCGGACTCATTACCGAATTCTTCATCAATGTTGCg < 5:230139/149‑1 (MQ=255) cGCCAATGGCTTATATGCGTGCTATCAGCGCGGC‑AGCACGCAGTACTGCCGGTATTCTGGTGCAATTCCCCTTCTACGCTGGGATCCAACTGATGATGGAGCATTCCGGTCTGGGCGGACTCATTACCGAATTCTTCATCAATGTTGCg < 4:310144/149‑1 (MQ=255) aaTGGCTTATATGCGTGCTATCAGCGCGGC‑AGCACGCAGTACTGCCGGTATTCTGGTGCAATTCCCCTTCTACGCTGGGATCCAACTGATGATGGAGCATTCCGGTCTGGGCGGACTCATTACCGAATTCTTCATCAATGTTGCGAACa < 5:333133/149‑1 (MQ=255) tGGCTTATATGCGTGCTATCAGCGCGGC‑AGCACGCAGTACTGCCGGTATTCTGGTGCAATTCCCCTTCTACGCTGGGATCCAACTGATGATGGAGCATTCCGGTCTGGGCGGACTCATTACCGAATTCTTCATCAATGTTGCGAACaaa < 7:256996/149‑1 (MQ=255) tGGCTTATATGCGTGCTATCAGCGCGGC‑AGCACGCAGTACTGCCGGTATTCTGGTGCAATTCCCCTTCTACGCTGGGATCCAACTGATGATGGAGCATTCCGGTCTGGGCGGACTCATTACCGAATTCTTCATCAATGTTGCGAACa > 1:102523/1‑147 (MQ=255) cggcgcatacGCGTGCCAGCACCGCGGC‑AGCACGCAGTACTGCCGGGACGCCGCCGCCCACCCCCCTCTCCGCAGGCATCCAACTCATCCTGGAGCACTCCCGTCCGGGCGGACTCATTACCGACTTCTTCATCAATCTCGCGAACaaa < 8:386310/143‑1 (MQ=255) gCTTATATGCGTGCTATCAGCGCGGC‑AGCACGCAGTACTGCCGGTATTCTGGTGCAATTCCCCTTCTACGCTGGGATCCAACTGATGATGGAGCATTCCGGTCTGGGCGGACTCATTACCGAATTCTTCATCAATGTTGCGAACAAAGa > 5:306489/1‑149 (MQ=255) gCTTATATGCGTGCTATCAGCGCGGC‑AGCACGCAGTACTGCCGGTATTCTGGTGCAATTCCCCTTCTACGCTGGGATCCAACTGATGATGGAGCATTCCGGTCTGGGCGGACTCATTACCGAATTCTTCATCAATGTTGCGAACAAAGa > 8:250181/1‑149 (MQ=255) ttATATGCGTGCTATCAGCGCGGC‑AGCACGCAGTACTGCCGGTATTCTGGTGCAATTCCCCTTCTACGCTGGGATCCAACTGATGATGGAGCATTCCGGTCTGGGCGGACTCATTACCGAATTCTTCATCAATGTTGCGAACAAAGaca > 6:353473/1‑149 (MQ=255) tataTGCGTGCTATCAGCGCGGC‑AGCACGCAGTACTGCCGGTATTCTGGTGCAATTCCCCTTCTACGCTGGGATCCAACTGATGATGGAGCATTCCGGTCTGGGCGGACTCATTACCGAATTCTTCATCAATGTTGCGAACAAAGacac > 2:311452/1‑149 (MQ=255) atatGCGTGCTATCAGCGCGGC‑AGCACGCAGTACTGCCGGTATTCTGGTGCAATTCCCCTTCTACGCTGGGATCCAACTGATGATGGAGCATTCCGGTCTGGGCGGACTCATTACCGAATTCTTCATCAATGTTGCGAACAAAGACAcc > 6:11886/1‑149 (MQ=255) | GCATTCTGACGTTGATCATCGGCGCACTCGGTATCGCTTACCTTGCGATGTACTTCAGCGAACATGGCTTCAACATCACCATCAATACCGTCAACCTGATGTTTATGATTGCGGGTCTGCTGCTACATAAAACGCCAATGGCTTATATGCGTGCTATCAGCGCGGC‑AGCACGCAGTACTGCCGGTATTCTGGTGCAATTCCCCTTCTACGCTGGGATCCAACTGATGATGGAGCATTCCGGTCTGGGCGGACTCATTACCGAATTCTTCATCAATGTTGCGAACAAAGACACC > NC_000913/2325486‑2325778 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |