| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,512,774 | C→T | 7.9% | intergenic (‑68/‑268) | mntH ← / → nupC | manganese/divalent cation transporter/nucleoside (except guanosine) transporter |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,512,774 | 0 | C | T | 7.9% | 315.5 / 11.6 | 102 | intergenic (‑68/‑268) | mntH/nupC | manganese/divalent cation transporter/nucleoside (except guanosine) transporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (50/43); new base T (5/3); total (56/46) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.25e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.03e-01 | |||||||||||
Only 100 of 102 total aligned reads displayed.
TGAACGCAGGTCCCATTAATGCGAGCCTCATCTTGCGCGCCGCCCGTCCGCTGCTACTCTCAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGATTGTGGTGATTTCTCTGATAGACCAGGATTATGACTACGAAAAGATTGATGACTTGAATGTTATGGTTATGTTTAATGTTAGCACATTTACATAACTTTCAGCTTCCATACACAACATAGCAGAAATGTATGA > NC_000913/2512628‑2512918 | tGAACGCAGGTCCCATTAATGCGAGCCTCATCTTGCGCGCCGCCCGTCCGCTGCTACTCTCAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCAt < 6:78970/149‑1 (MQ=255) gCAGGTCCCATTAATGCGAGCCTCATCTTGCGCGCCGCCCGTCCGCTGCTACTCTCAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTaaa < 4:306142/149‑1 (MQ=255) aGGTCCCATTAATGCGAGCCTCATCTTGCTCGCCGCCCGTCCGCGGCTACTCTCAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATg < 8:227885/149‑1 (MQ=255) gTCCCATTAATGCGAGCCTCATCTTGCGCGCCGCCCGTCCGCTGCTACTCTCAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGa < 6:164449/149‑1 (MQ=255) tCCCATTAATGCGAGCCTCATCTTGCGCGCCGCCCGTCCGCTGCTACTCTCAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGAt > 2:93432/1‑149 (MQ=255) cccATTAATGCGAGCCTCATCTTGCGCGCCGCCCGTCCGCTGCTACTCTCAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGAtt > 1:311596/1‑149 (MQ=255) cATTAATGCGAGCCTCATCTTGCGCGCCGCCCGTCCGCTGCTACTCTCAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTGTCAAATTCATTTAAATGGATtgt > 6:162547/1‑149 (MQ=255) aTTAATGCGAGCCTCATCTTGCGCGCCGCCCGTCCGCTGCTACTCTCAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGATtgtg < 1:320334/149‑1 (MQ=255) ttAATGCGAGCCTCATCTTGCGCGCCGCCCGTCCGCTGCTACTCTCAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGATTgtgg > 5:1324/1‑149 (MQ=255) aTGCGAGCCTCATCTTGCGCGCCGCCCGTCCGCTGCTACTCTCAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGATTGTGGTGa < 2:256853/149‑1 (MQ=255) tGCGAGCCTCATCTTGCGCGCCGCCCGTCCGCTGCTACTCTCAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAGTTCATTTAAATGGATTGTGGTGAt > 7:197099/1‑149 (MQ=255) cGAGCCTCATCTTGCGCGCCGCCCGTCCGCTGCTACTCTCAACGCGATAGATCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGATTGTGGTGAttt < 5:131607/149‑1 (MQ=255) ccTCATCTTGCGCGCCGCCCGGCCGCTGCTACTCTCAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGATTGTGGTGATTTctct < 3:185433/149‑1 (MQ=255) tCATCTTGCGCGCCGCCCGTCCGCTGCTACTCTCAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGATTGTGGTGTTTTCTCTGa > 4:100279/1‑149 (MQ=255) cATCTTGCGCGCCGCCCGTCCGCTGCTACTCTCAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTGTCAAATTCATTTAAATGGATTGTGGTGATTTCTCTGa > 2:25923/1‑148 (MQ=255) aTCTTGCGCGCCGCCCGTCCGCTGCTACTCTCAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGATTGTGGTGATTTCTCTGa < 2:27813/147‑1 (MQ=255) tCTTGCGCGCCGCCCGTCCGCTGCTACTCTCAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGATTGTGGTGATTTCTCTGa > 1:333747/1‑146 (MQ=255) cgcgcCGCCCGTCCGCTGCTACTCTCAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGATTGTGGTGATTTCTCTGATAGACCAg < 7:11850/149‑1 (MQ=255) gccgccCGTCCGCTGCTACTCTCAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGATTGTGGTGATTTCTCTGATAGACCAGGAt > 4:293837/1‑149 (MQ=255) cgccCGTCCGCTGCTACTCTCAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTTATTTAAATGGATTGTGGTGATTTCTCTGATAGACCAGGATTa > 7:282510/1‑149 (MQ=255) cgccCGTCCGCTGCTACTCTCAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGATTGTGGTGATTTCTCTGATAGACCAGGATTa > 8:157319/1‑149 (MQ=255) gccCGTCCGCTGCTACTCTCAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTGTCAAATTCATTTAAATGGATTGTGGTGATTTCTCTGATAGACCAGGATTAt < 5:162547/149‑1 (MQ=255) gccCGTCCGCTGCTACTCTCAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGATTGTGGTGATTTCTCTGATAGACCAGGATTAt > 4:271819/1‑149 (MQ=255) cccGTCCGCTGCTACTCTCAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAAt < 1:133902/113‑1 (MQ=255) cccGTACGCTGATACTCTCAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCAAAAACAAAGCCTTAGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACTAGAATGATTATCAAATACATATAAAt > 2:133902/1‑113 (MQ=255) ccGTCCGCTGCTACTCTCAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGATTGTGGTGATTTCTCTGATAGACCAGGATTATGa < 3:293837/149‑1 (MQ=255) tCCGCTGCTACTCTCAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGATTGTGGTGATTTCTCTGATAGACCAGGATTATGACTa < 6:287798/149‑1 (MQ=255) tCCGCTGCTACTCTCAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGATTGTGGTGATTTCTCTGATAGACCAGGATTATGACTa > 7:246647/1‑149 (MQ=255) cGCTGCTACTCTCAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTGTCAAATTCATTTAAATGGATTGTGGTGATTTCTCTGATAGACCAGGATTATGACTAc < 1:25923/148‑1 (MQ=255) cGCTGCTACTCTCAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGATTGTGGTGATTTCTCTGATAGACCAGGATTATGACTAc < 2:167634/148‑1 (MQ=255) ctACTCTCAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTTATTTAAATGGATTGTGGTGATTTCTCTGATAGACCAGGATTATGACTACGaa > 4:288880/1‑146 (MQ=255) aCTCTCAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGATTGTGGTGATTTCTCTGATAGACCAGGATTATGACTACGAAAAGAt > 3:246043/1‑149 (MQ=255) ctctCAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTTATTTAAATGGATTGTGGTGATTTCTCTGATAGACCAGGATTATGACTACGAAAAGAtt < 6:64678/149‑1 (MQ=255) ctctCAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGATTGTGGTGATTTCTCTGATAGACCAGGATTATGACTACGAAAAGa < 8:192146/147‑1 (MQ=255) ctctCAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGATTGTGGTGATTTCTCTGATAGACCAGGATTATGACTACGAAAAGAtt > 2:93656/1‑149 (MQ=255) tctcAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGATtgtg > 7:38343/1‑106 (MQ=255) tctcAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGATtgtg < 8:38343/106‑1 (MQ=255) tctcAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGATTGTGGTGATTTCTCTGATAGACCAGGATTATGACTACTaacggaacc > 2:226714/1‑142 (MQ=255) tcAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGATTGTGGTGATTTCTCTGATAGACCAGGATTATGACTACGAAAAGATtgat > 2:337528/1‑149 (MQ=255) tcAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGATTGTGGTGATTTCTCTGATAGACCAGGATTATGACTACGAAAAGATtg < 1:98937/147‑1 (MQ=255) aCGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGATTGTGGTGATTTCTCTGATAGACCAGGATTATGACTACGAAAAGATTGATGAc > 8:228856/1‑149 (MQ=255) tCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGATTGTGGTGATTTCTCTGATAGACCAGGATTATGACTACGAAAAGATTGATGACTTGAATgtta > 3:2267/1‑149 (MQ=255) cGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGATTGTGGTGATTTCTCTGATAGACCAGGATTATGACTACGAAAAGATTGATGACTTGAATgttat > 2:147167/1‑149 (MQ=255) gTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGATTGTGGTGATTTCTCTGATAGACCAGGATTATGACTACGAAAAGATTGATGACTTGAATgttat < 4:126141/148‑1 (MQ=255) cATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGATTGTGGTGATTTCTCTGATAGACCAGGATTATGACTACGAAAAGATTGATGACTTg > 1:134168/1‑138 (MQ=255) cATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGATTGTGGTGATTTCTCTGATAGACCAGGATTATGACTACGAAAAGATTGATGACTTg < 2:134168/138‑1 (MQ=255) ttGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTTATTTAAATGGATTGTGGTGATTTCTCTGATAGACCAGGATTATGACTACGAAAAGATTGATGACTTGAATgttatggttatg > 3:53538/1‑149 (MQ=255) ttGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTAATTTAAATGTATTGTGGTGATTTCTCTGATAGACAAGGATTATGACTACGAAAAGATTGATGACTTGAATtttatggttatg > 8:313955/1‑149 (MQ=255) ctctAAAAGATAGGCTTTGCTTTGTTTCATGCTATGCGAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTATATGGATTGTGGTGATTTCTCTGATAGACCAGGATTATGACTACGAAAAGATTGTTGACTTGAATGTTATGGTTATGTTTAAt < 7:25265/149‑1 (MQ=255) ctctAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGATTGTGGTGTTTTCTCTGATAGACCAGGATTATGACTACGAAAAGATTGATGACTTGAATGTTATGGTTATGTTTaa < 3:100279/148‑1 (MQ=255) ctctAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGATTGTGGTGATTTCTCTGATAGACCAGGATTATGACTACGAAAAGATTGATGACTTGAATGTTATGGTTATGTTTAAt < 2:311596/149‑1 (MQ=255) ctctAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGATTGTGGTGATTTCTCTGATAGACCAGGATTATGACTACGAAAAGATTGATGACTTGAATGTTATGGTTATGTTTAAt > 7:28993/1‑149 (MQ=255) ctctAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGATTGTGGTGATTTCTCTGATAGACCAGGATTATGACTACGAAAAGATTGATGACTTGAATGTTATGGTTATGTTTAAt > 8:300521/1‑149 (MQ=255) tctAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGATTGTGGTGATTtctc > 2:199869/1‑86 (MQ=255) tctAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGATTGTGGTGATTtctc < 1:199869/86‑1 (MQ=255) tctAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGATTGTGGTGATTTCTCTGATAGACCAGGATTATGACTACGAAAAGATTGATGACTTGAATGTTATGGTTATGTTTAATg > 8:49210/1‑149 (MQ=255) tctAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGATTGTGGTGATTTCTCTGATAGACCAGGATTATGACTACGAAAAGATTGATGACTTGAATGTTATGGTTATGTTTAATg > 4:134454/1‑149 (MQ=255) tAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTTATTTAAATGGATTGTGGTGATTTCTCTGATAGACCAGGATTATGACTACGAAAAGATTGATGACTTGAATGTTATGGTTATGTTTAATGt > 7:268271/1‑148 (MQ=255) tAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGATTGTGGTGATTTCTCTGATAGACCAGGATTATGACTACGAAAAGATTGATGACTTGAATGTTATCGTTATGTTTAATGt > 2:171107/1‑148 (MQ=255) gaaaCATAGCAAAGGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGATTGTGGTGATTTCTCTGATAGACCAGGATTATGACTACGAAAAGATTGATGACTTGAATg > 6:213367/2‑128 (MQ=255) gaaaCATAGCAAAGGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGATTGTGGTGATTTCTCTGATAGACCAGGATTATGACTACGAAAAGATTGATGACTTGAATg < 5:213367/127‑1 (MQ=255) aaaaCATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGATTGTGGTGATT‑‑TCTGATAGACCAGGATTATGACTACGAAAAGATTGATGACTTGAATGTTATGGTTATGTTTAATGTTAg > 8:245512/1‑148 (MQ=255) aaaCATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGATTGTGGTGATTTCTCTGATAGACCAGGATTATGACTACGAAAAGATTGATGACTTGAATGTTATGGTTATGTTTAATGTTa < 1:93432/148‑1 (MQ=255) aaaCATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGATTGTGGTGATTTCTCTGATAGACCAGGATTATGACTACGAAAAGATTGATGACTTGAATGTTATGGTTATGTTTAATGTTa < 3:107999/148‑1 (MQ=255) aaaCATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGATTGTGGTGATTTCTCTGATAGACCAGGATTATGACTACGAAAAGATTGATGACTTGAATGTTATGGTTATGTTTAATGTTAg > 2:254055/1‑149 (MQ=255) aCATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGATTGTGGTGATTTCTCTGATAGACCAGGATTATGACTACGAAAAGATTGATGACTTGAATGTTATGGTTATGTTTAATGTTAGca > 8:137249/1‑149 (MQ=255) gCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGATTGTGGTGATTTCTCTGATAGACCAGGATTATGACTACGAAAAGATTGATGACTTGAATGTTATGGTTATGTTTAATGTTa > 4:188731/1‑141 (MQ=255) gCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGATTGTGGTGATTTCTCTGATAGACCAGGATTATGACTACGAAAAGATTGATGACTTGAATGTTATGGTTATGTTTAATGTTa < 3:188731/141‑1 (MQ=255) gCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGATTGTGGTGATTTCTCTGATAGACCAGGATTATGACTACGAAAAGATTGATGACTTGAATGTTATGGTTATGTTTAATGTTAGCACAttt < 8:23700/149‑1 (MQ=255) cTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGATTGTGGTGATTTCTCTGATAGACCAGGATTATGACTACGAAAAGATTGATGACTTGAATGTTATGGTTATGTTTAATGTTAGCACATTTACATAAc > 8:295489/1‑149 (MQ=255) tGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGATTGTGGTGATTTCTCTGATAGACCAGGATTATGACTACGAAAAGATTGATGACTTGAATGTTATGGTTATGTTTAATGTTAGCACATTTACATAACttt > 7:68773/1‑149 (MQ=255) gTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGATTGTGGTGATTTCTCTGATAGACCAGGATTATGACTACGAAAAGATTGATGACTTGAATGTTATGGTTATGTTTAATGTTAGCACATTTACATAACttt > 8:32664/1‑148 (MQ=255) tttCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGATTGTGGTGATTTCTCTGATAGACCAGGATTATGACTACGAAAAGATTGATGACTTGAATGTTATGGTTATGTTTAATGTTAGCACATTTACATAACttt > 1:302520/1‑147 (MQ=255) tttCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGATTGTGGTGATTTCTCTGATAGACCAGGATTATGACTACGAAAAGATTGATGACTTGAATGTTATGGTTATGTTTAATGTTAGCACATTTACATAACTTTc < 1:254055/148‑1 (MQ=255) tttCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGATTGTGGTGATTTCTCTGATAGACCAGGATTATGACTACGAAAAGATTGATGACTTGAATGTTATGGTTATGTTTAATGTTAGCACATTTACATAACTTTc < 1:337528/148‑1 (MQ=255) tatCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGAGTGTGGTTATTTCTCTGATAGACCAGGATTATGACTACGAAAAGATTGATGACTTGAATGTTATGGTTATGTTTAATGTTAGCACATTTACATAACTTTc < 4:96456/146‑1 (MQ=255) gCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGATTGTGGTGATTTCTCTGATAGACCAGGATTATGACTACGAAAAGATTGATGACTTGAATGTTATGGTTATGTTTAATGTTAGCACATTTACATAACTTTCAGCTTc > 6:66259/1‑148 (MQ=255) tATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGATTGTGGTGATTTCTCTGATAGACCAGGATTATGACTACGAAAAGATTGATGACTTGAATGTTATGGTTATGTTTAATGTTAGCACATTTACATAACTTTCAGCTTCCa > 1:279425/1‑148 (MQ=255) tATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGATTGTGGTGATTTCTCTGATAGACCAGGATTATGACTACGAAAAGATTGATGACTTGAATGTTATGGTTATGTTTAATGTTAGCACATTTACATAACTTTCAGCTTCCa > 7:290090/1‑148 (MQ=255) tATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGATTGTGGTGATTTCTCTGATAGACCAGGATTATGACTACGAAAAGATTGATGACTTGAATGTTATGGTTATGTTTAATGTTAGCACATTTACATAACTTTCAGCTTCCa > 8:176792/1‑148 (MQ=255) gCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGATTGTGGTGATTTCTCTGATAGACCAGGATTATGACTACGAAAAGATTGATGACTTGAATGTTATGGTTATGTTTAATGTTAGCACATTTACATAACttt < 2:278903/136‑1 (MQ=255) gCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGATTGTGGTGATTTCTCTGATAGACCAGGATTATGACTACGAAAAGATTGATGACTTGAATGTTATGGTTATGTTTAATGTTAGCACATTTACATAACttt > 1:278903/1‑136 (MQ=255) gCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGATTGTGGTGATTTCTCTGATAGACCAGGATTATGACTACGAAAAGATTGATGACTTGAATGTTATGGTTATGTTTAATGTTAGCACATTTACATAACTTTCAGCTTCCATaca > 8:125611/1‑149 (MQ=255) ccAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGATTGTGGTGATTTCTCTGATAGACCAGGATTATGACTACGAAAAGATTGATGACTTGAATGTTATGGTTATGTTTAATGTTAGCACATTTACATAACTTTCAGCTTCCATacac < 8:246647/149‑1 (MQ=255) aaaCGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGATTGTGGTGATTTCTCTGATAGACCAGGATTATGACTACGAAAAGATTGATGACTTGAATGTTATGGTTATGTTTAATGTTAGCACATTTACATAACTTTCAGCTTCCATACacaa > 1:150128/1‑149 (MQ=255) aaCGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGATTGTGGTGATTTCTCTGATAGACCAGGATTATGACTACGAAAAGATTGATGACTTGAATGTTATGGTTATGTTTAATGTTAGCACATTTACATAACTTTCAGCTTCCATACacaa > 1:205514/1‑148 (MQ=255) gaATGATTATCAAATTCATTTAAATGGATTGTGGTGATTTCTCTGATAGACCAGGATTATGACTACGAAAAGATTGATGACTTGAATGTTATGGTTATGTTTAATGTTAGCACATTTACATAACTTTCAGCTTCCATACACAACATAGc < 7:295489/149‑1 (MQ=255) aaTGATTATCAAATTCATTTAAATGGATTGTGGTGATTTCTCTGATAGACCAGGATTATGACTACGAAAAGATTGATGACTTGAATGTTATGGTTATGTTTAATGTTAGCACATTTACATAACTTTCAGCTTCCATACACAACATAg > 5:20115/1‑147 (MQ=255) tGATTATCAAATTCATTTAAATGGATTGTGGTGATTTCTCTGATAGACCAGGATTATGACTACGAAAAGATTGATGACTTGAATGTTATGGTTATGTTTAATGTTAGCACATTTACATAACTTTCAGCTTCCATACACAACATAGCAg > 3:20295/1‑148 (MQ=255) tGATTATCAAATTCATTTAAATGGATTGTGGTGATTTCTCTGATAGACCAGGATTATGACTACGAAAAGATTGATGACTTGAATGTTATGGTTATGTTTAATGTTAGCACATTTACATAACTTTCAGCTTCCATACACAACATAGCAg > 8:265333/1‑148 (MQ=255) tGATTATCAAATTCATTTAAATGGATTGTGGTGATTTCTCTGATAGACCAGGATTATGACTACGAAAAGATTGATGACTTGAATGTTATGGTTATGTTTAATGTTAGCACATTTACATAACTTTCAGCTTCCATACACAACATAGCAg > 1:272269/1‑148 (MQ=255) ttATCAAATTCATTTAAATGGATTGTGGTGATTTCTCTGATAGACCAGGATTATGACTACGAAAAGATTGATGACTTGAATGTTATGGTTATGTTTAATGTTAGCACATTTACATAACTTTCAGCTTCCATACACAACAt > 3:277812/1‑140 (MQ=255) ttATCAAATTCATTTAAATGGATTGTGGTGATTTCTCTGATAGACCAGGATTATGACTACGAAAAGATTGATGACTTGAATGTTATGGTTATGTTTAATGTTAGCACATTTACATAACTTTCAGCTTCCATACACAACAt < 4:277812/140‑1 (MQ=255) ttATCAAATTCATTTAAATGGATTGTGGTGATTTCTCTGATAGACCAGGATTATGACTACGAAAAGATTGATGACTTGAATGTTATGGTTATGTTTAATGTTAGCACATTTACATAACTTTCAGCTTCCATACACAACATAGCAGAAAt < 7:32664/149‑1 (MQ=255) tCAAATTTATTTAAATGGATTGTGGTGATTTCTCTGATAGACCAGGATTATGACTACGAAAAGATTGATGACTTGAATgttatggtta > 3:240715/1‑88 (MQ=255) tCAAATTTATTTAAATGGATTGTGGTGATTTCTCTGATAGACCAGGATTATGACTACGAAAAGATTGATGACTTGAATgttatggtta < 4:240715/88‑1 (MQ=255) tCAAATTCATTTAAATGGATTGTGGTGATTTCTCTGATAGACCAGGATTATGACTACGAAAAGATTGATGACTTGAATGTTATGGTTATGTTTAATGTTAGCACATTTACATAACTTTCAGCTTCCATACACAACATAGCAGAAATGTa < 2:333747/149‑1 (MQ=255) aaaTTCATTTAAATGGATTGTGGTGATTTCTCTGATAGACCAGGATTATGACTACGAAAAGATTGATGACTTGAATGTTATGGTTATGTTTAATGTTAGCACATTTACATAACTTTCAGCTTCCATACACAACATAGCAGAAATGTAt < 7:176792/148‑1 (MQ=255) aaTTTATTTAAATGGATTGTGGTGATTTCTCTGATAGACCAGGATTATGACTACGAAAAGATTGATGACTTGAATGTTATGGTTATGTTTAATGTTAGCACATTTACATAACTTTCAGCTTCCATACACAACATAGCAGAAATGTATGa < 3:288880/149‑1 (MQ=255) aaTTCATTTAAATGGATTGTGGTGATTTCTCTGATAGACCAGGATTATGACTACGAAAAGATTGATGACTTGAATGTTATGGTTATGTTTAATGTTAGCACATTTACATAACTTTCAGCTTCCATACACAACATAGCAGAAATGTATGa < 7:157319/149‑1 (MQ=255) | TGAACGCAGGTCCCATTAATGCGAGCCTCATCTTGCGCGCCGCCCGTCCGCTGCTACTCTCAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGATTGTGGTGATTTCTCTGATAGACCAGGATTATGACTACGAAAAGATTGATGACTTGAATGTTATGGTTATGTTTAATGTTAGCACATTTACATAACTTTCAGCTTCCATACACAACATAGCAGAAATGTATGA > NC_000913/2512628‑2512918 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |