Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 488,165 | G→A | 5.8% | D544N (GAC→AAC) | mscK → | mechanosensitive channel protein, intermediate conductance, K+ regulated |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 488,165 | 0 | G | A | 5.8% | 221.8 / 2.4 | 69 | D544N (GAC→AAC) | mscK | mechanosensitive channel protein, intermediate conductance, K+ regulated |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (32/33); new base A (2/2); total (34/35) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.25e-01 |
AACTGGCAAAAAGCCTGGCCCGCCGTTTTTATCGCTTTCCTCGCTGGTTTGCCGCTGCTGTTGATTGCCGGGCTGATCCACTGGCGTCTGGGCTGGCTGAAAGCGTATCAACAAAAACTGGCTTCCGCTGTGGGTTCCCTGCGTAACGACAGCCAGCTCAACACACCAAAAGCGATCCTTATCGACCTGATCCGTGCGCTGCCGGTGTGCCTGATTATTCTCGCGGTTGGCCTGATTCTGTTGACCATGCAGCTCAACATCAGCGAACTGCTATGGTCGTTCAGCAAAAAACTGGC > NC_000913/488018‑488313 | aaCTGGCAAAAAGCCTGGCCCGCCGTTTTTATCGCTTTCCTCGCTGGTTTGCCGCTGCTGTTGATTGCCGGGCTGATCCACTGGCGTCTGGGCTGGCTGAAAGCGTATCAACAAAAACTGGCTTCCGCTGTGGGTTCCCTGCGTAACGa > 3:114024/1‑149 (MQ=255) aaaaaGCCTGGCCCGCCGTTTTTATCGCTTTCCTCGCTGGTTTGCCGCTGCTGTTGATTGCCGGGCTGATCCACTGGCGTCTGGGCTGGCTGAAAGCGTATCAACAAAAACTGGCTTCCGCTGTGGGTTCCCTGCGTAACGAcagccag > 6:299965/1‑149 (MQ=255) aaaaGCCTGGCCCGCCGTTTTTATCGCTTTCCTCGCTGGTTTGCCGCTGCTGTTGATTGCCGGGCTGATCCACTGGCGTCTGGGCTGGCTGAACGCGTATCAACAAAAACTGGCTTCCGCTGTGGGTTCCCTGCGTAACGAcagcaagc > 6:51/1‑149 (MQ=255) aaaGCCTGGCCCGCCGTTTTTATCGCTTTCCTCGCTGGTCTGCCGCTGCTGTTGATTGCCGGGCTGATCCACTGGCGTCTGGGCTGGCTGAAAGCGTATCAACAAAAACTGGCTTCCGCTGTGGGTTCCCTGCGTAACGACAGCCAGCt < 2:277073/149‑1 (MQ=255) tGGCCCGCCGTTTTTATCGCTTTCCTCGCTGGTTTGCCGCTGCTGTTGATTGCCGGGCTGATCCACTGGCGTCTGGGCTGGCTGAAAGCGTATCAACAAAAACTGGCTTCCGCTGTGGGTTCCCTGCGTAACGACAGCCAGCt > 7:175569/1‑143 (MQ=255) tGGCCCGCCGTTTTTATCGCTTTCCTCGCTGGTTTGCCGCTGCTGTTGATTGCCGGGCTGATCCACTGGCGTCTGGGCTGGCTGAAAGCGTATCAACAAAAACTGGCTTCCGCTGTGGGTTCCCTGCGTAACGACAGCCAGCt < 8:175569/143‑1 (MQ=255) gCCCGCCGTTTTTATCGCTTTCCTCGCTGGTTTGCCGCTGCTGTTGATTGCCGGGCTGATCCACTGGCGTCTGGGCTGGCTGAAAGCGTATCAACAAAAACTGGCTTCCGCTGTGGGTTCCCTGCGTAACGACAGCCAGCTCAacacac < 7:210783/149‑1 (MQ=255) ccgTTTTTATCGCTTTCCTCGCTGGTTTGCCGCTGCTGTTGATTGCCGGGCTGATCCACTGGCGTCTGGGCTGGCTGAAAGCGTATCAACAAAAACTGGCTTCCGCTGTGGGTTCCCTGCGTAACGACAGCCAGCTCAACACACCaaaa < 3:194256/149‑1 (MQ=255) ccgTTTTTATCGCTTTCCTCGCTGGTTTGCCGCTGCTGTTGATTGCCGGGCTGATCCACTGGCGTCTGGGCTGGCTGAAAGCGTATCAACAAAAACTGGCTTCCGCTGTGGGTTCCCTGCGTAACGACAGCCAGCTCAACACACCaa > 1:186614/1‑147 (MQ=255) cgTTTTTATCGCTTTCCTCGCTGGTTTGCCGCTGCTGTTGATTGCCGGGCTGATCCACTGGCGTCTGGGCTGGCTGAAAGCGTATCAACAAAAACTGGCTTCCGCTGTGGGTTCCCTGCGTAACGACAGCCAGCTCAACACACCAAAAg < 8:62197/149‑1 (MQ=255) gTTTTTATCGCTTTCCTCGCTGGTTTGCCGCTGCTGTTGATTGCCGGGCTGATCCACTGGCGTCTGGGCTGGCTGAAAGCGTATCAACAAAAACTGGCTTCCGCTGTGGGTTCCCTGCGTAACGACAGCCAGCTCAACACACCAAAAGc < 1:122088/149‑1 (MQ=255) tttATCGCTTTCCTCGCTGGTTTGCCGCTGCTGTTGATTGCCGGGCTGATCCACTGGCGTCTGGGCTGGCTGAAAGCGTATCAACAAAAACTGGCTTCCGCTGTGGGTTCCCTGCGTAACGACAGCCAGCTCAACACACCAAAAGCGa < 5:299965/148‑1 (MQ=255) aTCGCTTTCCTCGCTGGTTTGCCGCTGCTGTTGATTGCCGGGCTGATCCACTGGCGTCTGGGCTGGCTGAAAGCGTATCAACAAAAACTGGCTTCCGCTGTGGGTTCCCTGCGTAACGACAGCCAGCTCAACACACCAAAAGCGATCCt > 1:67967/1‑149 (MQ=255) gCTTTCCTCGCTGGTTTGCCGCTGCTGTTGATTGCCGGGCTGATCCACTGGCGTCTGGGCTGGCTGAAAGCGTATCAACAAAAACTGGCTTCCGCTGTGGGTTCCCTGCGTAACGACAGCCAGCTCAACACACCAAAAGCGATCCTTAt > 5:41455/1‑149 (MQ=255) tttCCTCGCTGGTTTGCCGCTGCTGTTGATTGCCGGGCTGATCCACTGGCGTCTGGGCTGGCTGAAAGCGTATCAACAAAAACTGGCTTCCGCTGTGGGTTACCTGCGTAACGACAGCCAGCTCAACACACCAAAAGCGATCCTTATCg > 8:288831/1‑149 (MQ=255) tCCTCGCTGGTTTGCCGCTGCTGTTGATTGCCGGGCTGATCCACTGGCGTCTGGGCTGGCTGAAAGCGTATCAACAAAAACTGGCTTCCGCTGTGGGTTCCCTGCGTAACGACAGCCAGCTCAACACACCAAAAGCGATCCTTATCGAc > 8:116700/1‑149 (MQ=255) gTTTGCCGCTGCTGTTGATTGCCGGGCTGATCCACTGGCGTCTGGGCTGGCTGAAAGCGTATCAACAAAAACTGGCTTCCGCTGTGGGTTCCCTGCGTAACGACAGCCAGCTCAACACACCAAAAGCGATCCTTATCGACCTGATCCGt < 7:20419/149‑1 (MQ=255) ttGCCGCTGCTGTTGATTGCCGGGCTGATCCACTGGCGTCTGGGCTGGCTGAAAGCGTATCAACAAAAACTGGCTTCCGCTGTGGGTTCCCTGCGTAACGACAGCCAGCTCAACACACCAAAAGCGATCCTTATCGACCTGATCCGTgc > 7:64962/1‑149 (MQ=255) gctgTTGATTGCCGGGCTGATCCACTGGCGTCTGGGCTGGCTGAAAGCGTATCAACAAAAACTGGCTTCCGCTGTGGGTTCCCTGCGTAACGACAGCCAGCTCAACACACCAAAAGCGATCCTTATCGACCTGATCCGTGCGCTGCCgg > 1:230421/1‑149 (MQ=255) ctgTTGATTGCCGGGCTGATCCACTGGCGTCTGGGCTGGCTGAAAGCGTATCAACAAAAACTGGCTTCCGCTGTGGGTTCCCTGCGTAACGACAGCCAGCTCAACACACCAAAAGCGATCCTTATCGACCTGATCCGTGCGCTGCCGgt < 4:14574/149‑1 (MQ=255) gTTGATTGCCGGGCTGATCCACTGGCGTCTGGGCTGGCTGAAAGCGTATCAACAAAAACTGGCTTCCGCTGTGGGTTCCCTGCGTAACGACAGCCAGCTAAACACACCAAAAGCGATCCTTATCGACCTGATCCGTGCGCTGCCGgggt > 8:113217/1‑149 (MQ=255) ttGATTGCCGGGCTGATCCACTGGCGTCTGGGCTGGCTGAAAGCGTATCAACAAAAACTGGCTTCCGCTGTGGGTTCCCTGCGTAACGACAGCCAGCTCAACACACCAAAAGCGATCCTTATCGACCTGATCCGTGCGCTGCCGgtgt < 1:339783/148‑1 (MQ=255) ttGATTGCCGGGCTGATCCACTGGCGTCTGGGCTGGCTGAAAGCGTATCAACAAAAACTGGCTTCCGCTGTGGGTTCCCTGCGTAACGACAGCCAGCTCAACACACCAAAAGCGATCCTTATCGACCTGATCCGTGCGCTGCCGgtg < 4:171993/147‑1 (MQ=255) aTTGCCGGGCTGATCCACTGGCGTCTGGGCTGGCTGAAAGCGTATCAACAAAAACTGGCTTCCGCTGTGGGTTCCCTGCGTAACGACAGCCAGCTCAACACACCAAAAGCGATCCTTATCGACCTGATCCGTGCGCTGCCGGTGTGCCt > 2:175051/1‑149 (MQ=255) aTTGCCGGGCTGATCCACTGGCGTCTGGGCTGGCTGAAAGCGTATCAACAAAAACTGGCTTCCGCTGTGGGTTCCCTGCGTAACGACAGCCAGCTCAACACACCAAAAGCGATCCTTATCGACCTGATCCGTGCGCTGCCGGTGTGCCt > 7:94850/1‑149 (MQ=255) tGATCCACTGGCGTCTGGGCTGGCTGAAAGCGTATCAACAAAAACTGGCTTCCGCTGTGGGTTCCCTGCGTAACGACAGCCAGCTCAACACACCAAAAGCGATCCTTATCGACCTGATCCGTGCGCTGCCGGTGTGCCTGATTATtctc > 3:286731/1‑149 (MQ=255) aTCCACTGGCGTCTGGGCTGGCTGAAAGCTTATCAACAAAAACTGGATTCCGCTGGGGGTTCCCTGCGTACCGACAGCCAGCTCAACACACCAAAAGCGATCCTTATCGACCTGATCCGTGCGCTTCCGGTGTGCCTGATTATgctc < 5:52/147‑1 (MQ=255) aTCCACTGGCGTCTGGGCTGGCTGAAAGCGTATCAACAAAAACTGGCTTCCGCTGTGGGTTCCCTGCGTAACGACAGCCAGCTCAACACACCAAAAGCGATCCTTATCGACCTGATCCGTGCGCTGCCGGTGTGCCTGATTATtctc < 7:116700/147‑1 (MQ=255) aTCCACTGGCGTCTGGGCTGGCTGAAAGCGTATCAACAAAAACTGGCTTCCGCTGTGGGTTCCCTGCGTAACGACAGCCAGCTCAACACACCAAAAGCGATCCTTATCGACCTGATCCGTGCGCTGCCGGTGTGCCTGATTATTCTcgc < 8:64962/149‑1 (MQ=255) aTCCACTGGCGTCTGGGCTGGCTGAAAGCGTATCAACAAAAACTGGCTTCCGCTGTGGGTTCCCTGCGTAACGACAGCCAGCTCAACACACCAAAAGCGATCCTTATCGACCTGATCCGTGCGCTGCCGGTGTGCCTGATTATTCTcg < 7:288831/148‑1 (MQ=255) aCTGGCGTCTGGGCTGGCTGAAAGCGTATCAACAAAAACTGGCTTCCGCTGTGGGTTCCCTGCGTAACGACAGCCAGCTCAACACACCAAAAGCGATCCTTATCGACCTGATCCGTGCGCTGCCgg < 1:1900/126‑1 (MQ=255) aCTGGCGTCTGGGCTGGCTGAAAGCGTATCAACAAAAACTGGCTTCCGCTGTGGGTTCCCTGCGTAACGACAGCCAGCTCAACACACCAAAAGCGATCCTTATCGACCTGATCCGTGCGCTGCCgg > 2:1900/1‑126 (MQ=255) gCGTCTGGGCTGGCTGAAAGCGTATCAACAAAAACTGGCTTCCGCTGTGGGTTCCCTGCGTAACGACAGCCAGCTCAACACACCAAAAGCGATCCTTATCGACCTGATCCGTGCGCTGCCGGTGTGCCTGATTATTCTCGCGGTTGGc < 8:315776/148‑1 (MQ=255) tCTGGGCTGGCTGAAAGCGTATCAACAAAAACTGGCTTCCGCTGTGGGTTCCCTGCGTAACGACAGCCAGCTCAACACACCAAAAGCGATCCTTATCGACCTGATCCGTGCGCTGCCGGTGTGCCTGATTATTCTCGCGGTTg > 4:61014/1‑143 (MQ=255) tCTGGGCTGGCTGAAAGCGTATCAACAAAAACTGGCTTCCGCTGTGGGTTCCCTGCGTAACGACAGCCAGCTCAACACACCAAAAGCGATCCTTATCGACCTGATCCGTGCGCTGCCGGTGTGCCTGATTATTCTCGCGGTTg < 3:61014/143‑1 (MQ=255) gctgAAAGCGTATCAACAAAAACTGGCTTCCGCTGTGGGTTCCCTGCGTAACGACAGCCAGCTCAACACACCAAAAGCGATCCTTATCGACCTGATCCGTGCGCTGCCGGTGTGCCTGATTATTCTCGCGGTTGGCCTGATTCTGtt < 4:116915/147‑1 (MQ=255) gctgAAAGCGTATCAACAAAAACTGGCTTCCGCTGTGGGTTCCCTGCGTAACGACAGCCAGCTCAACACACCAAAAGCGATCCTTATCGACCTGATCCGTGCGCTGCCGGTGTGCCTGATTATTCTCGCGGTTGGCCTGATTCTGtt < 2:186614/147‑1 (MQ=255) ctgAAAGCGTATCAACAAAAACTGGCTTCCGCTGTGGGTTCCCTGCGTAACGACAGCCAGCTCAACACACCAAAAGCGATCCTTATCGACCTGATCCGTGCGCTGCCGGTGTGCCTGATTATTCTCGCGGTTGGCCTGATTCTGTTGAc < 4:286731/149‑1 (MQ=255) aaaGCGTATCAACAAAAACTGGCTTCCGCTGTGGGTTCCCTGCGTAACGACAGCCAGCTCAACACACCAAAAGCGATCCTTATCGACCTGATCCGTGCGCTGCCGGTGTGCCTGATTATTCTCGCGGTTGGCCTGATTCTGTTGAcc < 6:264824/147‑1 (MQ=255) aaGCGTATCAACAAAAACTGGCTTCCGCTGTGGGTTCCCTGCGTAACGACAGCCAGCTCAACACACCAAAAGCGATCCTTATCGACCTGATCCGTGCGCTGCCGGTGTGCCTGATTATTCTCGCGGTTGGCCTGATTCTGTTGACCATg < 6:41455/149‑1 (MQ=255) aGCGTATCAACAAAAACTGGCTTCCGCTGTGGGTTCCCTGCGTAACGACAGCCAGCTCAACACACCAAAAGCGATCCTTATCGACCTGATCCGTGCGCTGCCGGTGTGCCTGATTATTCTCGCGGTTGGCCTGATTCTGTTGACCATGc < 8:203784/149‑1 (MQ=255) gTATCAACAAAAACTGGCTTCCGCTGTGGGTTCCCTGCGTAACGACAGCCAGCTCAACACACCAAAAGCGATCCTTATCGACCTGATCCGTGCGCTGCCGGTGTGCCTGATTATTCTCGCGGTTGGCCTGATTCTGTTGACCATGCAGc > 8:37046/1‑149 (MQ=255) tATCAACAAAAACTGGCTTCCGCTGTGGGTTCCCTGCGTAACGACAGCCAGCTCAACACACCAAAAGCGATCCTTATCGACCTGATCCGTGCGCTGCCGGTGTGCCTGATTATTCTCGCGGTTGGCCTGATTCTGTTGACCATGCAGCt > 7:294178/1‑149 (MQ=255) aTCAACAAAAACTGGCTTCCGCTGTGGGTTCCCTGCGTAACGACAGCCAGCTCAACACACCAAAAGCGATCCTTATCGACCTGATCCGTGCGCTGCCGGTGTGCCTGATTATTCTCGCGGTTGGCCTGATTCTGTTGACCATGCAGCt > 4:233498/1‑148 (MQ=255) aacaaAAACTGGCTTCCGCTGTGGGTTCCCTGCGTAACGACAGCCAGCTCAACACACCAAACGCGATCCTTATCGACCTGATCCGTGCGCTGCCGGTGTGCCTGATTATTCTCGCGGTTGGCCTGATTCTGTTGACCATGCAGCTCaa > 1:83583/1‑148 (MQ=255) aacaaAAACTGGCTTCCGCTGTGGGTTCCCTGCGTAACGACAGCCAGCTCAACACACCAAAAGCGATCCTTATCGACCTGATCCGTGCGCTGCCGGTGTGCCTGATTATTCTCGCGGTTGGCCTGATTCTGTTGACCATGCAGCTCaa < 1:175051/148‑1 (MQ=255) acaaAAACTGGCTTCCGCTGTGGGTTCCCTGCGTAACGACAGCCAGCTCAACACACCAAAAGCGATCCTTATCGACCTGATCCGTGCGCTGCCGGTGTGCCTGATTATTCTCGCGGTTGGCCTGATTCTGTTGACCATGCAGCTCAAc > 4:213293/1‑148 (MQ=255) acaaAAACTGGCTTCCGCTGTGGGTTCCCTGCGTAACGACAGCCAGCTCAACACACCAAAAGCGATCCTTATCGACCTGATCCGTGCGCTGCCGGTGTGCCTGATTATTCTCGCGGTTGGCCTGATTCTGTTGACCATGCAGCTCAACa > 8:255755/1‑149 (MQ=255) acaaAAACTGGCTTCCGCTGTGGGTTCCCTGCGTAACGACAGCCAGCTCAACACACCAAAAGCGATCCTTATCGACCTGATCCGTGCGCTGCCGGTGTGCCTGAGTATTCTCGCGGTTGGCCTGATTCTGTTGACCATGCAGCTCAACa > 1:329241/1‑149 (MQ=255) caaAAACTGGCTTCCGCTGTGGGTTCCCTGCGTAACGACAGCCAGCTCAACACACCAAAAGCGATCCTTATCGACCTGATCCGTGCGCTGCCGGTGTGCCTGATTATTCTCGCGGTTGGCCTGATTCTGTTGACCATGCAGCTCAACAt > 5:276518/1‑149 (MQ=255) aaaaaCTGGCTTCCGCTGTGGGTTCCCTGCGTAACGACAGCCAGCTCAACACACCAAAAGCGATCCTTATCGACCTGATCCGTGCGCTGCCGGTGTGCCTGATTATTCTCGCGGTTGGCCTGATTCTGTTGACCATGCAGCTCAACAt > 8:280013/1‑148 (MQ=255) aaaaaCTGGCTTCCGCTGTGGGTTCCCTGCGTAACGACAGCCAGCTCAACACACCAAAAGCGATCCTTATCGACCTGATCCGTGCGCTGCCGGTGTGCCTGATTATTCTCGCGGTTGGCCTGATTCTGTTGACCATGCAGCTCAACATc < 7:254603/149‑1 (MQ=255) aaCTGGCTTCCGCTGTGGGTTCCCTGCGTAACGACAGCCAGCTCAACACACCAAAAGCGATCCTTATCGACCTGa > 8:141225/1‑75 (MQ=255) aaCTGGCTTCCGCTGTGGGTTCCCTGCGTAACGACAGCCAGCTCAACACACCAAAAGCGATCCTTATCGACCTGATCCGTGCGCTGCCGGTGTGCCTGATTATTCTCGCGGTTGGCCTGATTCTGTTGACCATGCAGCTCAACATCAGc < 8:94850/149‑1 (MQ=255) ttCCGCTGTGGGTTCCCTGCGTAACGACAGCCAGCTCAACACACCAAAAGCGATCCTTATCGACCTGATCCGTGCGCTGCCGGTGTGCCTGATTATTCTCGCGGTTGGCCTGATTCTGTTGACCATGCAGCTCAACATCAGCGAACTGc > 7:31720/1‑149 (MQ=255) cGCTGTGGGTTCCCTGCGTAACGACAGCCAGCTCAACACACCAAAAGCGATCCTTATCGACCTGATCCGTGCGCTGCCGGTGTGCCTGATTATTCTCGCGGTTGGCCTGATTCTGTTGACCATGCAGCTCAACATCAGCGAACTGCTAt > 5:24173/1‑149 (MQ=255) cTGTGGGTTCCCTGCGTAACGACAGCCAGCTCAACACACCAAAAGCGATCCTTATCGACCTGATCCGTGCGCTGCCGGTGTGCCTGATTATTCTCGCGGTTGGCCTGATTCTGTTGACCATGCAGCTCAACATCAGCGAACTGCTATgg < 6:24173/149‑1 (MQ=255) cTGTGGGTTCCCTGCGTAACAACAGCCAGCTCAACACACCAAAAGCGATCCTTATCGACCTGATCCGTGCGCTGCCGGTGTGCCTGATTATTCTCGCGGTTGGCCTGATTCTGTTGACCATGCAGCTCAACATCAGCGAACTGCTATgg > 2:141960/1‑149 (MQ=255) cTGTGGGTTCCCTGCGTAACAACAGCCAGCTCAACACACCAAAAGCGATCCTTATCGACCTGATCCGTGCGCTGCCGGTGTGCCTGATTATTCTCGCGGTTGGCCTGATTCTGTTGACCATGCAGCTCAACATCAGCGAACTGCTATgg > 2:137244/1‑149 (MQ=255) tgGGATCCCTGCGTAACGACAGCCAGCTCAACACACCAAAAGCGATCCTTATCGACCTGATCCGTGCGCTGCCGGTGTGCCTGATTATTCTCGCGGTTGGCCTGATTCTGTTGACCATGCAg > 4:83042/1‑122 (MQ=255) gTTCCCTGCGTAACGACAGCCAGCTCAACACACCAAAAGCGATCCTTATCGACCTGATCCGTGCGCTGCCGGTGTGCCTGATTATTCTCGCGGTTGGCCTGATTCTGTTGACCATGCAGCTCAACATCAGCGAACTGCTATGGTCGtt > 1:62138/1‑148 (MQ=255) gTTCCCTGCGTAACGACAGCCAGCTCAACACACCAAAAGCGATCCTTATCGACCTGATCCGTGCGCTGCCGGTGTGCCTGATTATTCTCGCGGTTGGCCTGATTCTGTTGACCATGCAGCTCAACATCAGCGAACTGCTATGGTCGTTc < 4:114024/149‑1 (MQ=255) ttCCCTGCGTAACGACAGCCAGCTCAACACACCAAAAGCGATCCTTATCGACCTGATCCGTGCGCTGCCGGTGTGCCTGATTATTCTCGCGGTTGGCCTGATTCTGTTGACCATGCAGCTCAACATCAGCGAACTGCTATGGTCGTTCa < 3:233498/149‑1 (MQ=255) ttCCCTGCGTAACGACAGCCAGCTCAACACACCAAAAGCGATCCTTATCGACCTGATCCGTGCGCTGCCGGTGTGCCTGATTATTCTCGCGGTTGGCCTGATTCTGTTGACCATGCAGCTCAACATCAGCGAACTGCTATGGTCGTTCa < 8:31720/149‑1 (MQ=255) ttCCCTGCGTAACAACAGCCAGCTCAACACACCAAAAGCGATCCTTATCGACCTGATCCGTGCGCTGCCGGTGTGCCTGATTATTCTCGCGGTTGGCCTGATTCTGTTGACCATGCAGCTCAACATCAGCGAACTGCTATGGTCGTTCa < 1:141960/149‑1 (MQ=255) ttCCCTGCGTAACAACAGCCAGCTCAACACACCAAAAGCGATCCTTATCGACCTGATCCGTGCGCTGCCGGTGTGCCTGATTATTCTCGCGGTTGGCCTGATTCTGTTGACCATGCAGCTCAACATCAGCGAACTGCTATGGTCGTTCa < 1:137244/149‑1 (MQ=255) tGCGTAACGACAGCCAGCTCAACACACCAAAAGCGATCCTTATCGACCTGATCCGTGCGCTGCCGGTGTGCCTGATTATTCTCGCGGTTGGCCTGATTCTGtt < 4:295111/103‑1 (MQ=255) tGCGTAACGACAGCCAGCTCAACACACCAAAAGCGATCCTTATCGACCTGATCCGTGCGCTGCCGGTGTGCCTGATTATTCTCGCGGTTGGCCTGATTCTGtt > 3:295111/1‑103 (MQ=255) cGACAGCCAGCTCAACACACCAAAAGCGATCCTTATCGACCTGATCCGTGCGCTGCCGGTGTGCCTGATTATTCTCGCGGTTGGCCTGATTCTGTTGACCATGCAGCTCAACATCAGCGAACTGCTATGGTCGTTCAGCAAAAAACTgg < 7:37046/149‑1 (MQ=255) gACAGCCAGCTCAATACACCAAAAGCGATCCTTATCGACCTGATCCGTGCGCTTCCGGTGTGCCTGATTATTCTCGCGGTTGGCCTGATTCTGTTGACCATGCAGCTCAACATCAGCGAACTGCTATGGTCGTTCAGCAAAAAACTGGc < 5:51/149‑1 (MQ=255) | AACTGGCAAAAAGCCTGGCCCGCCGTTTTTATCGCTTTCCTCGCTGGTTTGCCGCTGCTGTTGATTGCCGGGCTGATCCACTGGCGTCTGGGCTGGCTGAAAGCGTATCAACAAAAACTGGCTTCCGCTGTGGGTTCCCTGCGTAACGACAGCCAGCTCAACACACCAAAAGCGATCCTTATCGACCTGATCCGTGCGCTGCCGGTGTGCCTGATTATTCTCGCGGTTGGCCTGATTCTGTTGACCATGCAGCTCAACATCAGCGAACTGCTATGGTCGTTCAGCAAAAAACTGGC > NC_000913/488018‑488313 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |