| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,056,777 | C→T | 6.5% | P173S (CCC→TCC) | torT → | periplasmic sensory protein associated with the TorRS two‑component regulatory system |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,056,777 | 0 | C | T | 6.5% | 187.3 / 2.7 | 61 | P173S (CCC→TCC) | torT | periplasmic sensory protein associated with the TorRS two‑component regulatory system |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (26/31); new base T (2/2); total (28/33) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.18e-01 | |||||||||||
AAGTCTGCCGGTGATCGAACTGGTAAATGCTATTGATGCTCCCCAGGTGAAAAGCCGCGTTGGTGTGCCCTGGTTTCAGATGGGCTATCAACCGGGGCGATATCTGGTGCAATGGGCGCACGGTAAACCACTGAATGTGCTGTTGATGCCCGGACCCGATAACGCCGGGGGCAGTAAGGAGATGGTCGAGGGTTTTCGCGCAGCCATTGCCGGAAGCCCGGTGCGTATTGTTGATATTGCGCTTGGTGATAACGATATTGAAATCCAGCGTAACCTGTTGCAGGAGATGCTGGAACG > NC_000913/1056629‑1056925 | aaGTCTGCCGGTGATCGAACTGGTAAATGCTATTGATGCTCCCCAGGTGAAAAGCCGCGTTGGTGTGCCCTGGTTTCAGATGGGCTATCAACCGGGGCGATATCTGGTGCAATGGGCGCACGGTAAACCACTGAATGTGCTGTTGATGc < 4:262764/149‑1 (MQ=255)aaGTCTGCCGGTGATCGAACTGGTAAATGCTATTGATGCTCCCCAGGTGAAAAGCCGCGTTGGTGTGCCCTGGTTTCAGATGGGCTATCAACCGGGGCGATATCTGGTGCAATGGGCGCACGGTAAACCACTGAATGTGCTGTTGATGc < 4:318797/149‑1 (MQ=255) gTCTGCCGGTGATCGAACTGGTAAATGCTATTGATGCTCCCCAGGTGAAAAGCCGCGTTGGTGTGCCCTGGTTTCAGATGGGCTATCAACCGGGGCGATATCTGGTGCAATGGGCGCACGGTAAACCACTGAATGTGCTGTTGATGccc > 6:9582/1‑149 (MQ=255) tGCCGGTGATCGAACTGGTAAATGCTATTGATGCTCCCCAGGTGAAAAGCCGCGTTGGTGTGCCCTGGTTTCAGATGGGCTATCAACCGGGGCGATATCTGGTGCAATGGGCGCACGGTAAACCACTGAATGTGCTGTTGATGCCCGGa > 2:12969/1‑149 (MQ=255) cGGTGATCGAACTGGTAAATGCTATTGATGCTCCCCAGGTGAAAAGCCGCGTTGGTGTGCCCTGGTTTCAGATGGGCTATCAACCGGGGCGATATCTGGTGCAATGGGCGCACGGTAAACCACTGAATGTGCTGTTGATGCCCGGAccc > 6:156316/1‑149 (MQ=255) ggTGATCGAACTGGTAAATGCTATTGATGCTCCCCAGGTGAAAAGCCGCGTTGGTGTGCCCTGGTTTCAGATGGGCTATCAACCGGGGCGATATCTGGTGCAATGGGCGCACGGTAAACCACTGAATGTGCTGTTGATGCCCGGAc > 1:33259/1‑146 (MQ=255) aaCTGGTAAATGCTATTGATGCTCCCCAGGTGAAAAGCCGCGTTGGTGTGCCCTGGTTTCAGATGGGCTATCAACCGGGGCGATATCTGGTGCAATGGGCGCACGGTAAACCACTGAATGTGCTGTTGATGCCCGGACCCGATAACGcc > 1:219828/1‑149 (MQ=255) cTGGTAAATGCTATTGATGCTCCCCAGGTGAAAAGCCGCGTTGGTGTGCCCTGGTTTCAGATGGGCTATCAACCGGGGCGATATCTGGTGCAATGGGCGCACGGTAAACCACTGAATGTGCTGTTGATGCCCGGACCCGATAACGCCgg < 3:179840/149‑1 (MQ=255) cTGGAAAATGCTATTGATGCTCCCCAGGTGAACAGCCGCGTTGGTGTGCCCTGGTTTCAGATGGGCTATCAACCGGGGCGATATCTGGTGCAATGGGCGCACGGTAAACCACTGAATGTGCTGTTGATGCCCGGACCCGATAACGCCgg < 2:399837/149‑1 (MQ=255) tAAATGCTATTGATGCTCCCCAGGTGAAAAGCCGCGTTGGTGTGCCCTGGTTGCACTTGGGCTATCAACCGGGGCGATATCTGGTGCAATGGGCGCACGGGAAACCACTGAATGTGCTGGTGATGCCCGGACCCGATAACGCCggggg < 3:2829/148‑1 (MQ=255) aaTGCTATTGATGCTCCCCAGGTGAAAAGCCGCGTTGGTGTGCCCTGGTTTCAGATGGGCTATCAACCGGGGCGATATCTGGTGCAATGGGCGCACGGTAAACCACTGAATGTGCTGTTGATGCCCGGACCCGATAACGCCGGGGGCa < 5:9582/148‑1 (MQ=255) aaTGCTATTGATGCTCCCCAGGTGAAAAGCCGCGTTGGTGTGCCCTGGTTTCAGATGGGCTATCAACCGGGGCGATATCTGGTGCAATGGGCGCACGGTAAACCACTGAATGTGCTGTTGATGCCCGGACCCGATAACGCCGGGGGCAg > 4:78458/1‑149 (MQ=255) aaTGCTATTGATGCTCCCCAGGTGAAAAGCCGCGTTGGTGTGCCCTGGTTTCAGATGGGCTATCAACCGGGGCGATATCTGGTGCAATGGGCGCACGGTAAACCACTGAATGTGCTGTTGATGCCCGGACCCGATAACGCCGGGGGCAg < 3:261234/149‑1 (MQ=255) aaTGCTATTGATGCTCCCCAGGTGAAAAGCCGCGTTGGTGTGCCCTGGTTTCAGATGGGCTATCAACCGGGGCGATATCTGGTGCAATGGGCGCACGGTAAACCACTGAATGTGCGGTTGATGCCCGGACCCGATAACGCCGGGGGCAg > 2:67610/1‑149 (MQ=255) gCTATTGATGCTCCCCAGGTGAAAAGCCGCGTTGGTGTGCCCTGGTTTCAGATGGGCTATCAACCGGGGCGATATCTGGTGCAATGGGCGCACGGTAAACCACTGAATGTGCTGTGGATGCCCGGACCCGATAACGCCGGGGGCAGt > 6:347766/1‑147 (MQ=255) cTATTGATGCTCCCCAGGTGAAAAGCAGCGTTGGTGTGCCCTGGTTTCAGATGGGCTATCAACCGGGGCGATATCTGGTGCAATGGGCGCACGGTAAACCACTGAATGTGCTGTTGATGCCAGGACCCGATAACGCCGGGGGCAGTAAg > 3:166548/1‑149 (MQ=255) tATTGATGCTCCCCAGGTGAAAAGCCGCGTTGGTGTGCCCTGGTTTCAGATGGGCTATCAACCGGGGCGATATCTGGTGCAATGGGCGCACGGTAAACCACTGAATGTGCTGTTGATGCCCGGACCCGATAACGCCGGGGGCAGTAAg > 4:352286/1‑148 (MQ=255) ttGATGCTCCCCAGGTGAAAAGCCGCGTTGGTGTGCCCTGGTTTCAGATGGGCTATCAACCGGGGCGATATCTGGTGCAATGGGCGCACGGTAAACCACTGAATGTGCTGTTGATGCCCGGACCCGATAACGCCGGGGGCAGTAAgg < 1:252720/147‑1 (MQ=255) ttGATGCTCCCCAGGTGAAAAGCCGCGTTGGTGTGCCCTGGTTTCAGATGGGCTATCAACCGGGGCGATATCTGGTGCAATGGGCGCACGGTAAACCACTGAATGTGCTGTTGATGCCCGGACCCGATAACGCCGGGGGCAGTAAGga < 1:327270/148‑1 (MQ=255) aTGCTCCCCAGGTGAAAAGCCGCGTTGGTGTGCCCTGGTTTCAGATGGGCTATCAACCGGGGCGATATCTGGTGCAATGGGCGCACGGTAAACCACTGAATGTGCTGTTGATGCCCGGACCCGATAACGCCGGGGGCAGTAAGGAGATg > 5:380190/1‑149 (MQ=255) ccccAGGTGAAAAGCCGCGTTGGTGTGCCCTGGTTTCAGATGGGCTATCAACCGGGGCGATATCTGGTGCAATGGGCGCACGGTAAACCACTGAATGTGCTGTTGATGTCCGGACCCGATAACGCCGGGGGCAGTAAGGAGATGGTc > 4:290860/1‑147 (MQ=255) ccAGGTGAAAAGCCGCGTTGGTGTGCCCTGGTTTCAGATGGGCTATCAACCGGGGCGATATCTGGTGCAATGGGCGCACGGTAAACCACTGAATGTGCTGTTGATGCCCGGACCCGATAACGCCGGGGGCAGTAAGGAGATGGTCGAgg < 6:380190/149‑1 (MQ=255) ccAGGTGAAAACCCGCGTTGGTGTGCCCTGGTTTCAGATGGGCTATCAACCGGGGCGATATCTGGTGCAATGGGCGCACGGTAAACCACTGAATGTGCTGTTGATGCCCGGACCCGATAACGCCGGGGGCAGTAAGGAGATGGTCGAgg < 5:139543/149‑1 (MQ=255) gTGAAAAGCCGCGTTGGTGTGCCCTGGTTTCAGATGGGCTATCAACCGGGGCGATATCTGGTGCAATGGGCGCACGGTAAACCACTGAATGTGCTGTTGATGCCCGGACCCGATAACGCCGGGGGCAGTAAg < 5:342673/132‑1 (MQ=255) gTGAAAAGCCGCGTTGGTGTGCCCTGGTTTCAGATGGGCTATCAACCGGGGCGATATCTGGTGCAATGGGCGCACGGTAAACCACTGAATGTGCTGTTGATGCCCGGACCCGATAACGCCGGGGGCAGTAAg > 6:342673/1‑132 (MQ=255) aaaGCCGCGTTGGTGTGCCCTGGTTTCAGATGGGCTATCAACCGGGGCGATATCTGGTGCAATGGGCGCACGGTAAACCACTGAATGTGCTGTTGATGCCCGGACCCGATAACGCCGGGGGCAGTAAGGAGATGGTCGAGGGTTTTcgc < 3:336661/149‑1 (MQ=255) gtgtGCCCTGGTTTCAGATGGGCTATCAACCGGGGCGATATCTGGTGCAATGGGCGCACGGTAAACCACTGAATGTGCTGTTGATGCCCGGACCCGATAACGCCGGGGGCAGTAAGGAGATGGTCGAGGGTTTTCGCGCAGCCATTGcc < 2:33259/149‑1 (MQ=255) tgCCCTGGTTTCAGATGGGCTATCAACCGGGGCGATATCTGGTGCAATGGGCGCACGGTAAACCACTGAATGTGCTGTTGATGCCCGGACCCGATAACGCCGGGGGCAGTAAGGAGATGGTCGAGGGTTTTCGCGCAGCCATTGCCgg > 4:362937/1‑148 (MQ=255) ccTGGTTTCAGATGGGCTATCAACCGGGGCGATATCTGGTGCAATGGGCGCACGGTAAACCACTGAATGTGCTGTTGATGCCCGGACCCGATAACGCCGGGGGCAGTAAGGAGATGGTCGAGGGTTTTCGCGCAGCCATTGCCGGAAGc > 7:356343/1‑149 (MQ=255) tGGTGTCAGATGGGCTATCAACCGGGGCGATATCTGGTGCAATGGGCGCACGGTAACCCACTGAAAGAGCTGATGATGCCCGGACCCGATAACGCACGGGGCAGTAAGGAGATGGTCGAGGGTTTACGCGCAGCCATTGACGGAAGacc > 4:160279/1‑149 (MQ=255) ggTTTCAGATGGGCTATCAACCGGGGCGATATCTGGTGCAATGGGCGCACGGTAAACCACTGAATGTGCTGTTGATGCCCGGACCCGATAACGCCGGGGGCAGTAAGGAGATGGTCGAGGGTTTTCGCGCAGCCATTGCCGGAAGCCCg > 3:99326/1‑149 (MQ=255) gTTTCAGATGGGCTATCAACCGGGGCGATATCTGGTGCAATGGGCGCACGGTAAACCACTGAATGTGCTGTTGATGCCCGGACCCGATAACGCCGGGGGCAGTAAGGAGATGGTCGAGGGTTTTCGCGCAGCCATTGCCGGAAGCCCg < 3:352286/148‑1 (MQ=255) gATGGGCTATCAACCGGGGCGATATCTGGTGCAATGGGCGCACGGTAAACCACTGAATGTGCTGTTGATGCCCGGACCCGATAACGCCGGGGGCAGTAAGGAGATGGTCGAGGGTTTTCGCGCAGCCATTGCCGGAAGCCCGGTGCGTa > 4:284461/1‑149 (MQ=255) gATGGGCTATCAACCGGGGCGATATCTGGTGCAATGGGCGCACGGTAAACCACTGAATGTGCTGTTGATGCCCGGACCCGATAACGCCGGGGGCAGTAAGGAGATGGTCGAGGGTTTTCGCGCAGCCATTGCCGGAAGCCCGGTGCGTa > 2:220676/1‑149 (MQ=255) aTGGGCTAGCAACCGGGGCGATATCTGGTGCAATGGGCGCACGGTAAACCACTGAATGTGCTGTTGATGCCCGGACCCGATAACGCCGGGGGCAGTAAGGAGATGGTCGAGGGTTTTCGAGCAGCCATTGCCGGAAGCCCGGTGCGTAt < 2:352122/149‑1 (MQ=255) aaCCGGGGCGATATCTGGTGAAATGGGCGCACGGTAAACCACTGAATGTGCTGTTGATGCCCGGACCCGATAACGCCGGGGGCAGTAAGGAGATGGTCGAGGGTTTTCGCGCAGCCATTGCCGGAAGCCCGGTGCGTATTGTTGATAtt > 5:165589/1‑149 (MQ=255) gggCGATATCTGGTGCAATGGGCGCACGGTAAACCACTGAATGTGCTGTTGATGCCCGGACCCGATAACGCCGGGGGCAGTAAGGAGATGGTCGAGGGTTTTCGCGCAGCCATTg > 2:178887/1‑115 (MQ=255) gCGATATCTGGTGCAATGGGCGCACGGTAAACCACTGAATGTGCTGGTGATGCCCGGACCCGATACCGCCGGGGGCAGTAAGGAGATGGTCGAGGGTTTTCGCGCAGCCATTGCCGGAAGCCCGGTGCGTATTGTTGATATTGCGCTTg < 3:228141/149‑1 (MQ=255) cGATATCTGGTGCAATGGGCGCACGGTAAACCACTGAATGTGCTGTTGATGTCCGGACCCGATAACGCCGGGGGCAGTAAGGAGATGGTCGAGGGTTTTCGCGCAGCCATTGCCGGAAGCCCGGTGCGTATTGTTGATATTGCGCTTgg < 3:290860/149‑1 (MQ=255) cGATATCTGGTGCAATGGGCGCACGGTAAACCACTGAATGTGCTGTTGATGCCCGGACCCGATAACGCCGGGGGCAGTAAGGAGATGGTCGAGGGTTTTCGCGCAGCCATTGCCGGAAGCCCGGTGCGTATTGTTGATATTGCGCTTgg < 5:347766/149‑1 (MQ=255) gTGCAATGGGCGCACGGTAAACCACTGAATGTGCTGTTGATGCCCGGACCCGATAACGCCGGGGGCAGTAAGGAGATGGTCGAGGGTTTTCGCGCAGCCATTGCCGGAAGCCCGGTGCGTATTGTTGATATTGCGCTTGGTGATAACGa < 1:67610/149‑1 (MQ=255) gTGCAATGGGCGCACGGTAAACCACTGAATGTGCTGTTGATGCCCGGACCCGATAACGCCGGGGGCAGTAAGGAGATGGTCGAGGGTTTTCGCGCAGCCATTGCCGGAAGCCCGGTGCGTATTGTTGATATTGCGCTTGGTGATAACGa > 8:88174/1‑149 (MQ=255) gTGCAATGGGCGCACGGTAAACCACTGAATGTGCTGTTGATGCCCGGACCCGATAACGCCGGGGGCAGTAAGGAGATGGTCGAGGGTTTTCGCGCAGCCATTGCCGGAAGCCCGGTGCGTATTGTTGATATTGCGCTTGGTGATAACGa > 1:152309/1‑149 (MQ=255) tGCAATGGGCGCACGGTAAACCACTGAATGTGCTGTTGATGCCCGGACCCGATAACGCCGGGGGCAGTAAGGAGATGGGCGAGGGTTTTCGCGCAGCCATTGCCGGACGCCCGGTGCGTATTGTTGATATTGCGCTTGGTGATAACGa > 3:222753/1‑148 (MQ=255) gCAATGGGCGCACGGTAAACCACTGAATGTGCTGTTGATGCCCGGACCCGATAACGCCGGGGGCAGTAAGGAGATGGTCGAGGGTTTTCGCGCAGCCATTGCCGGAAGCCCGGTGCGTATTGTTGatat < 1:12095/129‑1 (MQ=255) cAATGGGCGCACGGTAAACCACTGAATGTGCTGTTGATGCCCGGACCCGATAACGCCGGGGGCAGTAAGGAGATGGGCGAGGGTTTTCGCGCAGCCATTGCCGGAAGCCCGGTGCGTATTGTTGATATTGCGCTTGGTGATAACGata < 5:156316/148‑1 (MQ=255) aaTGGGCGCACGGTAAACCACTGAATGTGCTGTTGATGCCCGGACCCGATAACGCCGGGGGCAGTAAGGAGATGGTCGAGGGTTTTCGCGCAGCCATTGCCGGAAGCCCGGTGCGTATTGTTGATATTGCGCTTGGTGATAACGATAtt < 7:47360/149‑1 (MQ=255) tGGGCGCACGGTAAACCACTGAATGTGCTGTTGATGCCCGGACCCGATAACGCCGGGGGCAGTAAGGAGATGGTCGAGGGTTTTCGCGCAGCCATTGCCGGAAGCCCGGTGCGTATTGTTGATATTGCGCTTGGTGATAACGATATTg > 3:348619/1‑148 (MQ=255) ggCGCACGGTAAACCACTGAATGTGCTGTTGATGCCCGGACCCGATAACGCCGGGGGCAGTAAGGAGATGGTCGAGGGTTTTCGCGCAGCCATTGCCGGAAGCCCTGTGCGTATTGTTGATATTGCGCTTGGTGATAACGATATTGaa < 1:12969/148‑1 (MQ=255) cACGGTATACCACTGAATGTGCTGTTGATGCCCGGACCCGATATCGCCGGGGGCAGTAAGGAGATGGTCGAGGGTTTTCGCGCAGCCATTGCCGGAAGCCCGGTGCGTATTGTTGATATTGCGCTTGGTGATAACGATTTTGAAATCCa < 4:166548/149‑1 (MQ=255) cACGGTAAACCACTGAATGTGCTGTTGATGCCCGGACCCGATAACGCCGGGGGCAGTAAGGAGATGGTCGAGGGTTTTCGCGCAGCCATTGCCGGAAGCCCGGTGCGTATTGTTGATATTGCGCTTGGTGATAACGATATTGAAATCCa < 3:284461/149‑1 (MQ=255) aCGGTAAACCACTGAATGTGCTGTTGATGCCCGGACCCGATAACGCCGGGGGCAGTAAGGAGATGGTCGAGGGTTTTCGCGCAGCCATTGCCGGAAGCCCGGTGCGTATTGTTGATATTGCGCTTGGTGATAACGATATTGAAATCCAg < 2:219828/149‑1 (MQ=255) aCGGTAAACCACTGAATGTGCTGTTGATGCCCGGACCCGATAACGCCGGGGGCAGTAAGGAGATGGTCGAGGGTTTTCGCGCAGCCATTGCCGGAAGCCCGGTGCGTATTGTTGATATTGCGCTTGGTGATAACGATATTGAAATCCAg < 8:15230/149‑1 (MQ=255) cGGTAAACCACTGAATGTGCTGTTGATGCCCGGACCCGATAACGCCGGGGGCAGTAAGGAGATGGTCGAGGGTTTTCGCGCAGCCATTGCCGGAAGCCCGGTGCGTATTGTTGATATTGCGCTTGGTGATAACGATATTGAAATCCAGc > 1:95921/1‑149 (MQ=255) ggTAAACCACTGAATGTGCTGTTGATGTCCGGACCCGATAACGCCGGGGGCAGTAAGGAGATGGTCGAGGGTTTTCGCGCAGCCATTGCCGGAAGCCCGGTGCGTATTGTTGATATTGCGCTTGGTGATAACGATATTGAAATCCAGCg > 4:304800/1‑149 (MQ=255) tAAACCACTGAATGTGCTGTTGATGTCCGGACCCGATAACGCCGGGGGCAGTAAGGAGATGGTCGAGGGTTTTCGCGCAGCCATTGCCGGAAGCCCGGTGCGTATTGTTGATATTGCGCTTGGTGATAACGATATTGAAATCCAGCGTa < 3:304800/149‑1 (MQ=255) aaCCACTGAATGTGCTGTTGATGCCCGGACCCGATAACGCCGGGGGCAGTAAGGAGATGGTCGAGGGTTTTCGCGCAGCCATTGCCGGAAGCCCGGTGCGTATTGTTGATATTGCGCTTGGTGATAACGATATTGAAATCCAGCGTaa < 3:362937/148‑1 (MQ=255) cACTGAATGTGCTGTTGATGCCCGGACCCGATAACGCCGGGGGCAGTAAGGAGATGGTCGAGGGTTTTCGCGCAGCCATTGCCGGAAGCCCGGTGCGTATTGTTGATATTGCGCTTGGTGATAACGATATTGAAATCCAGCGTAACCTg < 1:220676/149‑1 (MQ=255) tgCTGTTGATGCCCGGACCCGATAACGCCGGGGGCAGTAAGGAGATGGTCGAGGGTTTTCGCGCAGCCATTGCCGGAAGCCCGGTGCGTATTGTTGATATTGCGCTTGGTGATAACGATATTGAAATCCAGCGTAACCTGTTGCAg > 1:152800/1‑146 (MQ=255) gCTGTTGATGCCCGGACCCGATAACGCCGGGGGCAGTAAGGAGATGGTCGAGGGTTTTCGCGCAGCCATTGCCGGAAGCCCGGTGCGTATTGTTGATATTGCGCTTGGTGATAACGATATTGAAATCCAGCGTAACCTGttagatctg > 5:195000/1‑141 (MQ=255) gCTGTTGATGCCCGGACCCGATAACGCCGGGGGCAGTAAGGAGATGGTCGAGGGTTTTCGCGCAGCCATTGCCGGAAGCCCGGTGCGTATTGTTGATATTGCGCTTGGTGATAACGATATTGAAATCCAGCGTAACCTGt < 6:195000/140‑1 (MQ=255) cTGTTGATGCCCGGACCCGATAACGCCGGGGGCAGTAAGGAGATGGTCGAGGGTTTTCGCGCAGCCATTGCCGGAAGCCCGGTGCGTATTGTTGATATTGCGCTTGGTGATAACGATATTGAAATCCAGCGTAACCTGTTGCAGGAGAt < 8:356343/149‑1 (MQ=255) ttGATGCCCGGACCCGATAACGCCGGGGGCAGTAAGGAGATGGTCGAGGGTTTTCGCGCAGCCATTGCCGGAAGCCCGGTGCGTATTGTTGATATTGCGCTTGGTGATAACGATATTGAAATCCAGCGTAACCTGTTGCAGGAGATg < 5:346266/147‑1 (MQ=255) tGATGCCCGGACCCGATAACGCCGGGGGCAGTAAGGAGATGGTCGAGGGTTTTCGCGCAGCCATTGCCGGAAGCCCGGTGCGTATTGTTGATATTGCGCTTGGTGATAACGATATTGAAATCCAGCGTAACCTGTTGCAGGAGATGCTg < 3:78458/149‑1 (MQ=255) cccGGACCCGATAACGCCGGGGGCAGTAAGGAGATGGTCGAGGGTTTTCGCGCAGCCATTGCCGGAAGCCCGGTGCGTATTGTTGATATTGCGCTTGGTGATAACGATATTGAAATCCAGCGTAACCTGTTGCAGGAGATGCTGGAACg < 3:358364/149‑1 (MQ=255) cccGGACCCGATAACGCCGGGGGCAGTAAGGAGATGGTCGAGGGTTTTCGCGCAGCCATTGCCGGAAGCCCGGTGCGTATTGTTGATATTGCGCTTGGTGATAACGATATTGAAATCCAGCGTAACCTGTTGCAGGAGATGCTGGAACg > 4:358364/1‑149 (MQ=255) | AAGTCTGCCGGTGATCGAACTGGTAAATGCTATTGATGCTCCCCAGGTGAAAAGCCGCGTTGGTGTGCCCTGGTTTCAGATGGGCTATCAACCGGGGCGATATCTGGTGCAATGGGCGCACGGTAAACCACTGAATGTGCTGTTGATGCCCGGACCCGATAACGCCGGGGGCAGTAAGGAGATGGTCGAGGGTTTTCGCGCAGCCATTGCCGGAAGCCCGGTGCGTATTGTTGATATTGCGCTTGGTGATAACGATATTGAAATCCAGCGTAACCTGTTGCAGGAGATGCTGGAACG > NC_000913/1056629‑1056925 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |