Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 1,408,546 | A→T | 5.7% | H166L (CAC→CTC) | ydaN → | putative Zn(II) transporter |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 1,408,546 | 0 | A | T | 5.7% | 263.2 / 2.6 | 84 | H166L (CAC→CTC) | ydaN | putative Zn(II) transporter |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (44/35); new base T (3/2); total (47/37) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.29e-01 |
TTCGACCCGACAACGCAAAGTGCTGGCGCTGGACGATGTGGTGAGCGATCTGGAAGAGGGCACGGGTCCGACCGATTGCGGGGGATGGCTGGTGGATGTGTGCGATGCGTTGACCGATCATTCCAGTGAATTTATCGAGCAGCTGCACGATAAAATTATCGACCTTGAAGATAATCTCCTTGATCAGCAAATTCCACCGCGTGGATTCCTGGCTCTGCTGCGCAAACAATTAATTGTGATGCGTCGCTATATGGCACCGCAACGTGATGTTTATGCTCGTCTTGCCAGTGAACGT > NC_000913/1408400‑1408694 | ttCGACCCGACAACGCAAAGTGCTGGCGCTGGACGATGTGGTGAGCGATCTGGAAGAGGGCACGGGTCCGACCGATTGCGGGGGATGGCTGGTGGATGTGTGCGATGCGTTGCCCGATCATTCCAGTGAATTTATCGAGCAGCTGCAc > 2:32354/1‑148 (MQ=255) ttCGACCCGACAACGCAAAGTGCTGGCGCTGGACGATGTGGTGAGCGATCTGGAAGAGGGCACGGGTCCGACCGATTGCGGGGGATGGCTGGAGGCTGTGTGCGATGCGTTGACCGATCATTCCAGTGAATTTATCTCGCATCTGCAc > 4:106870/1‑148 (MQ=255) aCCCGACAACGCAAAGTGCTGGCGCTGGACGATGTGGTGAGCGATCTGGAAGAGGGCACGGGTCCGACCGATTGCGGGGGATGGCTGGTGGATGTGTGCGATGCGTTGACCGATCATTCCAGTGAATTTATCGAGCAGCTGCACGATa > 1:183282/1‑148 (MQ=255) cccGACAACGCAAAGTGCTGGCGCTGGACGATGTGGTGAGCGATCTGGAAGAGGGCACGGGTCCGCCCGATTGCGGGGGATGGCTGGTGGATGTGTGCGATGCGTTGACCGATCATTCCAGTGAATTTATCGAGCAGCTGCACGATaa > 2:307184/1‑148 (MQ=255) ccGACAACGCAAAGTGCTGGCGCTGGACGATGTGGTGAGCGATCTGGAAGAGGGCACGGGTCCGACCGATTGCGGGGGATGGCTGGTGGATGTGTGCGATGCGTTGACCGATCATTCCAGTGAATTTATCGAGCAGCTGCACGATaaaa > 8:148802/1‑149 (MQ=255) ccGACAACGCAAAGTGCTGGCGCTGGACGATGTGGTGAGCGATCTGGAAGAGGGCACGGGTCCGACCGATTGCGGGGGATGGCTGGTGGATGTGTGCGATGCGTTGACCGATCATTCCAGTGAATTTATCGAGCAGCTGCACGATaaaa < 1:394227/149‑1 (MQ=255) cGACAACGCAAAGTGCTGGCGCTGGACGAAGTGGTGAGCGATCTGGAAGAGCGCACGGGTCCGAGCGATTGCGGCGGATGGCTCGTGGATGTGTGCGATGCGTTGACCGATCATTCCAGTGAATTTATCGAGCAGCTGCACGAGaaaa > 2:379074/1‑148 (MQ=255) cAACGCAAAGTGCTGGCGCTGGACGATGTGGTGAGCGATCTGGAAGAGGGCACGGGTCCGACCGATTGCGGGGGATGGCTGGTGGATGTGTGCGATGCGTTGACCGATCATTCCAGTGAATTTATCGTGCAGCTGCTCGATaaattcac < 7:262684/149‑6 (MQ=255) cAACGCAAAGTGCTGGCGCTGGACGATGTGGTGAGCGATCTGGAAGAGGGCACGGGTCCGACCGATTGCGGGGGATGGCTGGTGGATGTGTGCGATGCGTTGACCGATCATTCCAGTGAATTTATCGAGCAGCTGCACGATAAAATTAt < 4:141384/149‑1 (MQ=255) aaaGTGCTGGCGCTGGACGATGTGGTGAGCGATCTGGAAGAGGGCACGGGTCCGACCGATTGCGGGGGATGGCTGGTGGATGTGTGCGATGCGTTGACCGATCATTCCAGTGAATTTATCGAGCAGCTGCACGATAAAATTATCGACCt < 6:259575/149‑1 (MQ=255) aaGTGCTGGCGCTGGACGATGTGGTGAGCGATCTGGAAGAGGGCACGGGTCCGACCGATTGCGGGGGATGGCTGGTGGATGTGTGCGATGCGTTGACCGATCATTCCAGTGAATTTATCGAGCAGCTGCACGATAAAATTATCGACCtt > 5:373536/1‑149 (MQ=255) aaGTGCTGGCGCTGGACGATGTGGTGAGCGATCTGGAAGAGGGCACGGGTCCGACCGATTGCGGGGGATGGCTGGTGGATGTGTGCGATGCGTTGACCGATCATTCCAGTGAATTTATCGAGCAGCTGCACGATAAAATTATCGACCtt > 5:31229/1‑149 (MQ=255) gTGCTGGCGCTGGACGATGTGGTGAGCGATCTGGAAGAGGGCACGGGTCCGACCGATTGCGGGGGATGGCTGGTGGATGTGTGCGATGCGTTGACCGATCATTCCAGTGAATTTATCGAGCAGCTGCACGATAAAATTATCGACCTTGa < 3:165981/149‑1 (MQ=255) gTGCTGGCGCTGGACGATGTGGTGAGCGATCTGGAAGAGGGCACGGGTCCGACCGATTGCGGGGGATGGCTGGGGGATGTGTGCGATGCGTTGACCGATCATTCCAGTGAATTTATCGAGCAGCTGCACGATAAAATTATCGACCTTGa < 1:307184/149‑1 (MQ=255) tGCTGGCGCTGGACGATGTGGTGAGCGATCTGGAAGAGGGCACGGGTCCGACCGATTGCGGGGGATGGCTGGTGGATGTGTGCGATGCGTTGACCGATCATTCCAGTGAATTTATCGAGCAGCTGCACGATAAAATTATCGACCTTg > 4:219999/1‑147 (MQ=255) tGGACGATGTGGTGAGCGATCTGGAAGAGGGCACGGGTCCGACCGTTTGCGGGGGATGGCTGGTGGATGTCTGCGAAGCGTTGACCGATCATTCCAGTGATTTTATCGAGCAGCGGCACGATAATATTATCGACCTTGAAGATAAtctc < 8:105098/149‑1 (MQ=255) ggACGATGTGGTGAGCGATCTGGAAGAGGGCACGGGTCCGACCGATTGCGGGGGATGGCTGGTGGATGTGTGCGATGCGTTGACCGATCATTCCAGTGAATTTATCGAGCAGCTGCACGATAAAATTATCGACCTTGAAGATAATCTcc > 7:143140/1‑149 (MQ=255) gACGATGTGGTGAGCGATCTGGAAGAGGGCACGGGTCCGACCGATTGCGGGGGATGGCTGGTGGATGTGTGCGGTGCGTTGACCGATCATTCCAGTGAATTTATCGAGCAGCTGCACGATAAAATTATCGACCTTGAAGATAAtctc < 8:176659/147‑1 (MQ=255) gACGATGTGGTGAGCGATCTGGAAGAGGGCACGGGTCCGACCGATTGCGGGGGATGGCTGGTGGATGTGTGCGATGCGTTGACCGATCATTCCAGTGAATTTATCGAGCAGCTGCACGATAAAATTATCGACCTTGAAGATAATCTcc < 8:118801/148‑1 (MQ=255) aCGATGTGGTGAGCGATCTGGAAGAGGGCACGGGTCCGACCGATTGCGGGGGATGGCTGGTGGATGTGTGCGATGCGTTGACCGATCATTCCAGTGAATTTATCGAGCAGCTGCACGATAAAATTATCGACCTTGAAGATAATCTCCtt < 4:258109/149‑1 (MQ=255) gAGCGATCTGGAAGAGGGCACGGGTCCGACCGATTGCGGGGGATGGCTGGTGGATGTGTGCGATGCGTTGACCGATCATTCCAGTGAATTTATCGAGCAGCTGCACGATAAAATTATAGACCTTGAAGATAATCTCCTTGATCAGCaaa > 4:271140/1‑149 (MQ=255) aGCGATCTGGAAGAGGGCACGGGTCCGACCGATTGCGGGGGATGGCTGGTGGATGTGTGCGATGCGTTGACCGATCATTCCAGTGAATTTATCGAGCAGCTGCACGATAAAATTATCGACCTTGAAGATAATCTCCTTGATCAGCAAAt > 6:359018/1‑149 (MQ=255) gATCTGGAAGAGGGCACGGGTCCGACCGATTGCGGGGGATGGCTGGTGGATGTGTGCGATGCGTTGACCGATCATTCCAGTGAATTTATCGAGCAGCTGCACGATAAAATTATCGACCTTGAAGATAATCTCCTTGATCAGCAAATTc > 5:101230/1‑148 (MQ=255) aTCTGGAAGAGGGCACGGGTCCGACCGATTGCGGGGGATGGCTGGTGGATGTGTGCGATGCGTTGCCCGATCATTCCAGTGAATTTATCGAGCAGCTGCACGATAAATGTATCGACCTTGAAGATAATCTCCTTGATCAGCAAATTccc > 8:98959/1‑148 (MQ=255) aTCTGGAAGAGGGCACGGGTCCGACCGATTGCGGGGGATGGCTGGTGGATGTGTGCGATGCGTTGACCGATCATTCCAGTGAATTTATCGAGCAGCTGCACGATAAAATTATCGACCTTGAAGATAATCTCCTTGATCAGCAAATTCCa > 5:139491/1‑149 (MQ=255) tCTGGAAGAGGGCACGGGTCCGACCGATTGCGGGGGATGGCTGGTGGATGTGTGCGATGCGTTGACCGATCATTCCAGTGAATTTATCGTGCAGCTGCTCGATaaattcac < 7:12617/111‑6 (MQ=255) tCTGGAAGAGGGCACGGGTCCGACCGATTGCGGGGGATGGCTGGTGGATGTGTGCGATGCGTTGACCGATCATTCCAGTGAATTTATCGTGCAGCTGCTCGATaaattcac > 8:12617/1‑106 (MQ=255) tCTGGAAGAGGGCACGGGTCCGACCGATTGCGGGGGATGGCTGGTGGATGTGTGCGATGCGTTGACCGATCATTCCAGTGAATTTATCGAGCAGCTGCACGATAAAATTATCGACCTTGAAGATAATCTCCTTGATCAGCAAATTCCAc > 7:101546/1‑149 (MQ=255) tCTGGAAGAGGGCACGGGTCCGACCGATTGCGGGGGATGGCTGGTGGATGTGTGCGATGCGTTGACCGATCATTCCAGTGAATTTATCGAGCAGCTGCACGATAAAATTATCGACCTTGAAGATAATCTCCTTGATCAGCAAATTCCAc > 1:176970/1‑149 (MQ=255) gAAGAGGGCACGGGTCCGACCGATTGCGGGGGATGGCTGGTGGATGTGTGCGATGCGTTGACCGATCATTCCAGTGAATTTATCGAGCAGCTGCACGATAAAATTATCGACCTTGAAGATAATCTCCTTGATCAGCAAATTCCAc < 6:29069/145‑1 (MQ=255) gAAGAGGGCACGGGTCCGACCGATTGCGGGGGATGGCTGGTGGATGTGTGCGATGCGTTGACCGATCATTCCAGTGAATTTATCGAGCAGCTGCACGATAAAATTATCGACCTTGAAGATAATCTCCTTGATCAGCAAATTCCACcgcg > 4:182098/1‑149 (MQ=255) gAAGAGGGCACGGGTCCGACCGATTGCGGGGGATGGCTGGTGGATGTGTGCGATGCGTTGACCGATCATTCCAGTGAATTTATCGAGCAGCTGCACGATAAAATTATCGACCTTGAAGATAATCTCCTTGATCAGCAAATTCCACcgc < 7:68542/148‑1 (MQ=255) agagGGCAAGGTTCCTTCCGTTTGCGTGTGATGGCTTGTGTATGTGTTCGATGCGTTGACCGATCATTAAAGTTAATTTATCGAGAAGCTGCACGATAAAATTTTCGACCTTGAAGATAATCTCCTTGATCTGCAAATTCCACAGCGTg < 8:330179/149‑1 (MQ=255) ggCACGGGTCCGACCGATTGCGGGGGATGGCTGGTGGATGTGTGCGATGCGTTGACCGATCATTCCAGTGAATTTATCGAGCAGCTGCACGATAAAATTATCGACCTTGAAGATAATCTCCTTGATCAGCAAATTCCACCGCGTGGAtt > 3:315217/1‑149 (MQ=255) cACGGGTCCGACCGATTGCGGGGGATGGCTGGTGGATGTGTGCGATGCGTTGACCGATCATTCCAGTGAATTTATCGAGCAGCTGCACGATAAAATTATCGACCTTGAAGATAATCTCCTTGGTCAGCAAATTCCACCGCGTGGATTcc > 8:209586/1‑149 (MQ=255) cACGGGTCCGACCGATTGCGGGGGATGGCTGGTGGATGTGTGCGATGCGTTGACCGATCATTCCAGTGAATTTATCGAGCAGCTGCACGATAAAATTATCGACCTTGAAGATAATCTCCTTGCTCAGCAAATTCCACCGCGTGGATTcc < 7:209586/149‑1 (MQ=255) aCGGGTCCGACCGATTGCGGGGGATGGCTGGTGGATGTGTGCGATGCGTTGACCGATCATTCCAGTGAATTTATCGAGCAGCTGCACGATaaaa < 5:138459/94‑1 (MQ=255) aCGGGTCCGACCGATTGCGGGGGATGGCTGGTGGATGTGTGCGATGCGTTGACCGATCATTCCAGTGAATTTATCGAGCAGCTGCACGATaaaa > 6:138459/1‑94 (MQ=255) aCGGGTCCGACCGATTGCGGGGGATGGCTGGTGGATGTGTGCGATGCGTTGACCGATCATTCCAGTGAATTTATCGAGCAGCTGCACGATAAAATTATCGACCTTGAAGATAATCTCCTTGATCAGCAAATTCCACCGCGTGGATTCCt > 8:369984/1‑149 (MQ=255) ggTCCGACCGATTGCGGGGGATGGCTGGTGGATGTGTGCGATGCGTTGACCGATCATTCCAGTGAATTTATCGAGCAGCTGCACGATAAAATTATCGACCTTGAAGATAATCTCCTTGATCAGCAAATTCCACCGCGTGGATTCCTGGc < 3:312556/149‑1 (MQ=255) ggTCCGACCGATTGCGGGGGATGGCTGGTGGATGTGTGCGATGCGTTGACCGATCATTCCAGTGAATTTATCGAGCAGCTGCACGATAAAATTATCGACCTTGAAGATAATCTCCTTGATCAGCAAATTCCACCGCGTGGATTCCTGGc < 8:101546/149‑1 (MQ=255) tCCGACCGATTGCGGGGGATGGCTGGTGGATGTGTGCGATGCGTTGACCGATCATTCCAGTGAATTTATCGAGCAGCTGCACGATAAAATTATCGACCTTGAAGATAATCTCCTTGATCAGCAAATTCCACCGCGTGGATTCCTGGctc < 3:282177/149‑1 (MQ=255) cgaccgaTTGCGGGGGATGGCTGGTGGATGTGTGCGATGCGTTGACCGATCATTCCAGTGAATTTATCGAGCAGCTGCACGATAAAATTATCGACCTTGAAGATAATCTCCTTGATCAGCAAATTCCACCGCGTGGATTCCTGGctct < 4:333384/148‑1 (MQ=255) accgaTTGCGGGGGATGGCTGGTGGATGTGTGCGATGCGTTGACCGATCATTCCAGTGAATTTATCGAGCAGCTGCACGATAAAATTATCGACCTTGAAGATAATCTCCTTGATCAGCAAATTCCACCGCGTGGATTCCTGGCTctgct < 5:359018/149‑1 (MQ=255) cgaTTGCGGGGGATGGCTGGTGGATGTGTGCGATGCGTTGACCGATCATTCCAGTGAATTTATCGAGCAGCTGCACGATAAAATTATCGACCTTGAAGATAATCTCCTTGATCAGCAAATTCCACCGCGTGGATTCCTGGCTCtgctgc < 2:183282/149‑1 (MQ=255) cgaTTGCGGGGGATGGCTGGTGGATGTGTGCGATGCGTTGACCGATCATTCCAGTGAATTTATCGAGCAGCTGCACGATAAAATTATCGACCTTGAAGATAATCTCCTTGATCAGCAAATTCCACCGCGTGGATTCCTGGCTCtgctgc < 1:360057/149‑1 (MQ=255) gggggATGGCTGGTGGATGTGTGCGATGCGTTGACCGATCATTCCAGTGAATTTATCGAGCAGCTGCACGATAAAATTATCGACCTTGAAGATAATCTCCTTGATCAGCAAATTCCACCGCGTGGATTCCTGGCTCTGCTGCGCAAAc > 1:178383/1‑148 (MQ=255) ggATGGCTGGTGGATGTGTGCGATGCGTTGACCGATCATTCCAGTGAATTTATCGAGCAGCTGCACGATAAAATTATCGACCTTGAAGATAATCTCCTTGATCAGCAAATTCCACCGCGTGGATTCCTGGCTCTGCTGCGCAAACaatt < 4:315217/149‑1 (MQ=255) tGGCTGGTGGATGTGTGCGATGCGTTGACCGCTCATTCCAGTGAATTTATCGAGCAGCTGCACGATAAAATTATCGACCTTGAAGATAATCTCCTTGATCAGCAAATTCCACCGCGTGGATTCCTGGCTCTGCTGCGCAAACaattaat < 4:81896/149‑1 (MQ=255) tGGCTGGTGGATGTGTGCGATGCGTTGACCGATCATTCCAGTGAATTTATCGAGCAGCTGCACGATAAAATTATCGACCTTGAAGATAATCTCCTGGATCAGCAAATTCCACCGCGTTGATTCCTGGCTCTGCTGCGCAAACaattaat < 6:373536/149‑1 (MQ=255) gCTGGTGGATGTGTGCGATGCGTTGACCGATCATTCCAGTGAATTTATCGAGCAGCTGCACGATAAAATTATCGACCTTGAAGATAATCTCCTTGATCAGCAAATTCCACCGCGTGGATTCCTGGCTCTGCTGCGCAAACaattaatt < 2:176970/148‑1 (MQ=255) cTGGTGGATGTGTGCGATGCGTTGACCGATCATTCCAGTGAATTTATCGAGCAGCTGCACGATAAAATTATCGACCTTGAAGATAATCTCCTTGATCAGCAAATTCCACCGCGTGGATTCCTGGCTCTGCTGCGCAAACAATTAATtgt < 1:271469/149‑1 (MQ=255) tggtggATGTGTGCGATGCGTTGACCGATCATTCCAGTGAATTTATCGAGCAGCTGCACGATAAAATTATCGACCTTGAAGATAATCTCCTTGATCAGCAAATTCCACCGCGTGGATTCCTGGCTCTGCTGCGCAAACAATTAATtgt > 5:384144/1‑148 (MQ=255) gtgtgCGATGCGTTGACCGATCATTCCAGTGAATTTATCGAGCAGCTGCACGATAAAATTATCGACCTTGAAGATAATCTCCTTGATCAGCAAATTCCACCGCGTGGATTCCTGGCTCTGCTGCGCAAACAATTAATTGTGATTCGTct > 5:146372/1‑148 (MQ=255) gtgCGATGCGTTGACCGATCATTCCAGTGAATTTATCGAGCAGCTGCACGATAAAATTATCGACCTTGAAGATAATCTCCTTGATCAGCAAATTCCACCGCGTGGATTCCTGGCTctg > 1:1090/1‑118 (MQ=255) gtgCGATGCGTTGACCGATCATTCCAGTGAATTTATCGAGCAGCTGCACGATAAAATTATCGACCTTGAAGATAATCTCCTTGATCAGCAAATTCCACCGCGTGGATTCCTGGCTctg < 2:1090/118‑1 (MQ=255) tgCGATGCGTTGACCGATCATTCCAGTGAATTTATCGAGCAGCTGCACGATAAAATTATCGACCTTGAAGATAATCTCCTTGATCAGCAAATTCCACCGCGTGGATTCCTGGCTCTGCTGCGCAAACAATTAATTGTGATGCGTCGCta > 2:333722/1‑149 (MQ=255) tgCGATGCGTTGACCGATCATTCCAGTGAATTTATCGAGCAGCTGCACGATAAAATTATCGACCTTGAAGATAATCTCCTTGATCAGCAAATTCCACCGCGTGGATTCCTCGCTCTGCTGCGCAAACaattaatc > 4:196714/1‑134 (MQ=255) cGATGCGTTGACCGATCATTCCAGTGAATTTATCGAGCAGCTGCACGATAAAATTATCGACCTTGAAGATAATCTCCTTGATCAGCAAATTCCACCGCGTGGATTCCTGGCTCTGCTGCGCAAACAATTAATTGTGATGCGTCGCtata < 7:148802/149‑1 (MQ=255) cGATGCGTTGACCGATCATTCCAGTGAATTTATCGAGCAGCTGCACGATAAAATTATCGACCTTGAAGATAATCTCCTTGATCAGCAAATTCCACCGCGTGGATTCCTGGCTCTGCTGCGCAAACAATTAATTGTGATGCGTCGCtata < 6:31229/149‑1 (MQ=255) ttGACCGATCATTCCAGTGAATTTATCGAGCAGCTGCACGATAAAATTATCGACCTTGAAGATAATCTCCTTGATCAGCAAATTCCACCGCGTGGATTCCTGGCTCTGCTGCGCAAACAATTAATTGTGATGCGTCGCTATATGGCAcc > 5:42801/1‑149 (MQ=255) aCCGATCATTCCAGTGAATTTATCGAGAAGCTGCACGATAAAATTATCGACCTTGAAGATAATATCCTAGATCAGAAAATTCCAACGCGTGGATTACTGGCTCTGCTGCGCAAACAATTAATTGTGATTAGTCGCTATATGGCAcctc > 8:123662/1‑146 (MQ=255) cGATCATTCCAGTGAATTTATCGAGCAGCTGCACGATAAAATTATCGACCTTGAAGATAATCTCCTTGATCAGCAAATTCCACCGCGTGGATTCCTGGCTCTGCTGCGCAAACAATTAATTGTGATGCGTCGCTATATGGCACCGCAAc > 8:332556/1‑149 (MQ=255) aTCATTCCAGTGAATTTATCGAGCAGCTGCACGATAAAATTATCGACCTTGAAGATAATCTCCTTGATCAGCAAATTCCACCGCGTGGATTCCTGGCTCTGCTGCGCAAACAATTAATTGTGATGCGTCGCTATATGGCACCGCAACGt > 3:90331/1‑149 (MQ=255) aTCATTCCAGTGAATTTATCGAGCAGCTGCACGATAAAATTATCGACCTTGAAGATAATCTCCTTGATCAGCAAATTCCACCGCGTGGATTCCTGGCTCTGCTGCGCAAACAATTAATTGTGATGCGTCGCTATATGGCACCGCAACGt > 6:348177/1‑149 (MQ=255) aTCATTCCAGTGAATTTATCGAGCAGCTGCACGATAAAATTATCGACCTTGAAGATAATCTCCTAGATCAGCAAATTCCACCGCGTGGATTCCTGGCTCTGCTGCGCAAACAATTAATTGTGAAGCGTCGCTATATGGCACCGCacagt > 6:147242/1‑145 (MQ=255) tCATTCCAGTGAATTTATCGAGCAGCTGCACGATAAAATTATCGACCTTGAAGATAATCTCCTTGATCAGCAAATTCCACCGCGTGGATTCCTGGCTCTGCTGCGCAAACAATTAATTGTGATGCGTCGCTATATGGCACCGCAACGt > 1:358288/1‑148 (MQ=255) 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gTGAATTTATCGAGCAGCTGCACGATAAAATTATCGACCTTGAAGATAATCTCCTTGATCAGCAAATTCCACCGCGTGGATTCCTGGCTCTGCTGCGCAAACAATTAATTGTGATGCGTCGCTATATGGCACCGCAACGTGATGTTTAt > 1:10943/1‑149 (MQ=255) gTGAATTTATCGAGCAGCTGCACGATAAAATTATCGACCTTGAAGATAATCTCCTTGATCAGCAAATTCCACCGCGTGGATTCCTGGCTCTGCTGCGCAAACAATTAATTGTGATGCGTCGCTATATGGCACCGCAACGTGATGTTTAt > 6:97368/1‑149 (MQ=255) gTGAATTTATCGAGCAGCTGCACGATAAAATTATCGACCTTGAAGATAATCTCCTTGATCAGCAAATTCCACCGCGTGGATTCCTGGCTCTGCTGCGCAAACAATTAATTGTGATGCGTCGCTATATGGCACCGCAACGTGATGTTTAt < 6:384144/149‑1 (MQ=255) gTGAATTTATCGAGCAGCTGCACGATAAAATTATCGACCTTGAAGATAATCTCCTTGATCAGCAAATTCCACCGCGTGGATTCCTGGCTCTGCTGCGCAAACAATTAATTGTGATGCGTCGCTATATGGCACCGCAACGTGATGTTTAt > 1:63965/1‑149 (MQ=255) tGAATTTATCGAGCAGCTGCACGATAAAATTATCGACCTTGAAGATAATCTCCTTGATCAGCAAATTCCACCGCGTGGATTCCTGGCTCTGCTGCGCAAACAATTAATTGTGATGCGTCGCTATATGGCACCGCAACGTGATGTTTATg > 5:213462/1‑149 (MQ=255) attttATCGTGCAGCTGCTCGATAAAATTATCGACCTTGAAGATAATCTCCTTGATCAGCAAATTCCACCGCGTGGATTCCTGGCTCTGCTGCGCAAACAATTAATTGTGATGCGTCGCTATATGGCACCGCAACGTGATGTTTATGCt > 1:380838/3‑149 (MQ=255) aaTTTATCGAGCAGCTGCACGATAAAATTATCGACCTTGAAGATAATCTCCTTGATCAGCAAATTCCACCGCGTGGATTCCTGGCTCTGCTGCGCAAACAATTAATTGTGATGCGTCGCTATATGGCACCGCAACGTGATGTTTATGCt > 6:271052/1‑149 (MQ=255) aTTTATCGAGCAGCTGCACGATAAAATTATCGACCTTGAAGATAATCTCCTTGATCAGCAAATTCCACCGCGTGGATTCCTGGCTCTGCTGCGCAATCAATTAATTGTGATGCGTCGCTATATGGCACCGCAACGTGATGTTTATGCTc < 4:90331/149‑1 (MQ=255) tttATCGAGCAGCTGCACGATAAAATTATCGACCTTGAAGATAATCTCCTTGATCAGCAAATTCCACCGAGTGGATTCCTGGCTCTGCTGCGCAAACAATTAATTGTGATGCGTCGATATATGGCACCGCAACGTGATGTTTATGCTCg > 4:57445/1‑149 (MQ=255) tCGAGCAGCTGCACGATAAAATTATCGACCTTGAAGATAATCTCCTTGATCAGCAAATTCCACCGCGTGGATTCCTGGCTCTGCTGCGCAAACAATTAATTGTGATGCGTCGATATATGGCACCGCAACGTGATGTTTATGCTCGTCtt < 7:273527/149‑1 (MQ=255) gcagcTGCACGATAAAATTATCGACCTTGAAGATAATCTCCTTGATCAGCAAATTCCACCGCGTGGATTCCTGGCTCTGCTGCGCAAACAATTAATTGTGATGCGTCGCTATATGGCACCGCAACGTGATGTTTATGCTCGTCTTGCCa < 1:333722/149‑1 (MQ=255) agcTGCACGATAAAATTATCGACCTTGAAGATAATCTCCTTGATCAGCAAATTCCACCGCGTGGATTCCTGGCTCTGCTGCGCAAACAATTAATTGTGATGCGTCGCTATATGGCACCGCAACGTGATGTTTATGCTCGTCTTGCCAGt < 2:178383/149‑1 (MQ=255) aCGATAAAATTTTCGACCTTGAAGATACTCTCCTTGATCAGCAAATTCCACCGCGTGGATTCCTGGCTCTGCTGCGCAAACAATTAATTGTGATGCGTCGCTATATGGCACCGCAACGTGATGTTTATGCTCGTCTTGCCAGTGAACGt > 2:235665/1‑149 (MQ=255) aCGATAAAATTATCGACCTTGAAGATAATCTCCTTGATCAGCAAATTCCACCGCGTGGATTCCTGGCTCTGCTGCGCAAACAATTAATTGTGATGCGTCGCTATATGGCACCGCAACGTGATGTTTATGCTCGTCTTGCCAGTGAACGt > 7:30741/1‑149 (MQ=255) | TTCGACCCGACAACGCAAAGTGCTGGCGCTGGACGATGTGGTGAGCGATCTGGAAGAGGGCACGGGTCCGACCGATTGCGGGGGATGGCTGGTGGATGTGTGCGATGCGTTGACCGATCATTCCAGTGAATTTATCGAGCAGCTGCACGATAAAATTATCGACCTTGAAGATAATCTCCTTGATCAGCAAATTCCACCGCGTGGATTCCTGGCTCTGCTGCGCAAACAATTAATTGTGATGCGTCGCTATATGGCACCGCAACGTGATGTTTATGCTCGTCTTGCCAGTGAACGT > NC_000913/1408400‑1408694 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |