| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,560,976 | G→T | 19.5% | intergenic (+78/‑392) | yffL → / → yffM | CPZ‑55 prophage; uncharacterized protein/CPZ‑55 prophage; uncharacterized protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,560,976 | 0 | G | T | 19.5% | 117.6 / 3.9 | 66 | intergenic (+78/‑392) | yffL/yffM | CPZ‑55 prophage; uncharacterized protein/CPZ‑55 prophage; uncharacterized protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (24/25); new base T (7/3); total (38/28) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.06e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
TATACCAGGATCGGCAGAAAGGGAGTGCAACGAATACCAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAA‑GTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGA > NC_000913/2560829‑2561120 | tataCCAGGATCGGCAGAAAGGGAGTGCAACGAATACCAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAgt > 2:177821/1‑149 (MQ=255) ccAGGATCGGCAGAAAGGGAGTGCAACGAATACCAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAgtggt < 6:6834/148‑1 (MQ=255) ccAGGATCGGCAGAAAGGGAGTGCAACGAATACCAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAgtggt < 5:208409/148‑1 (MQ=255) cAGGATCGGCAGAAAGGGAGTGCAACGAATACCAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTTGtggtgg > 3:316057/1‑149 (MQ=255) cAGGATCGGCAGAAAGGGAGTGCAACGAATACCAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAgtg < 6:25120/145‑1 (MQ=255) cAGGATCGGCAGAAAGGGAGTGCAACGAATACCAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAgtg > 5:25120/1‑145 (MQ=255) cAGGATCGGCAGAAAGGGAGTGCAACGAATACCAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGtggtgg > 7:76655/1‑149 (MQ=255) gATCGGCAGAAAGGGAGTGCAACGAATACCAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTc < 8:191677/149‑1 (MQ=255) ggCAGAAAGGGAGTGCAACGAATACCAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATTAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCaaaa < 3:5433/149‑1 (MQ=255) gCAGAAAGGGAGTGCAACGAATACCAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAgtg > 8:93477/1‑137 (MQ=255) gCAGAAAGGGAGTGCAACGAATACCAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAgtg < 7:93477/137‑1 (MQ=255) gCAGAAAGGGAGTGCAACGAATACCAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTCGGTCAAAAGTTGCCGTTACTGGTGGGTAAAAAg > 1:257371/1‑149 (MQ=255) cAGAAAGGGAGTGCAACGAATACCAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGt > 8:251890/1‑149 (MQ=255) cAGAAAGGGAGTGCAACGAATACCAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTA‑AGGTGGGTCAAAAGtt > 7:326029/1‑149 (MQ=255) cAGAAAGGGAGTGCAACGAATACCAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTA‑AGGTGGGTCAAAAGtt > 7:331972/1‑149 (MQ=255) aaaGGGAGTGCAACGAATACCAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGc < 7:212818/149‑1 (MQ=255) gAGTGCAACGAATACCAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTa < 6:230846/149‑1 (MQ=255) aGTGCAACGAATACCAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTaa < 1:177821/149‑1 (MQ=255) aGTGCAACGAATACCAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGAGCTGGGGCAAAGGTTGCGGtg > 5:381443/1‑146 (MQ=255) tGCAACGAATACCAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGTTGGGTAAAAAGTTGACTTTAAgg > 1:188193/1‑149 (MQ=255) tGCAACGAATACCAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAgg > 8:221023/1‑149 (MQ=255) cAACGAATACCAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGCGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGATATTGATGTGTAAAAATATGCAGTTAAgt > 2:272947/1‑146 (MQ=255) aaCGAATACCAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAgtggtg > 2:430705/1‑125 (MQ=255) aaCGAATACCAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAgtggtg < 1:430705/125‑1 (MQ=255) aaCGAATACCAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTgg < 6:411401/149‑1 (MQ=255) aaCGAATACCAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTgg > 5:411401/1‑149 (MQ=255) aaCGAATACCAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGCTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGCTTCAAAAGTTGACGTTAAGGTg > 6:116253/1‑148 (MQ=255) cGAATACCAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTATTGGTGGGTCAAAAGATGCCTTTAAggagtg > 8:85253/1‑144 (MQ=255) aTACCAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAATTTGCGGTGTAGTTGGGTCa > 7:204607/1‑148 (MQ=255) tACCAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTTATGTTGGGTCAAATTTTGCCGTTAAGGTGGGGCaaa > 5:20800/1‑149 (MQ=255) ccAGTTATTATTCAATCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATTAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCTGTTAAGGTGGGTCaaaa < 3:344547/148‑1 (MQ=255) ccAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAA‑g > 3:225628/1‑149 (MQ=255) cAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTATTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTATGGTGGGTCAAAA‑Gt > 5:238110/1‑149 (MQ=255) cAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGTTGTGTAAAAATTTGACGTTAAGTTGGCTAAAAT‑Gt > 5:25858/1‑149 (MQ=255) gTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAA‑GTTg < 7:221023/149‑1 (MQ=255) attattCAATCCGTACAACATGAAATAACGGAATCCGTCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAA‑GTTGcc < 4:225628/148‑1 (MQ=255) attattCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGTTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAA‑GTTGCCg > 5:52014/1‑149 (MQ=255) attCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTgg > 8:240296/1‑132 (MQ=255) attCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTgg < 7:240296/132‑1 (MQ=255) aatCAAGATGTACATCTTGAAATAAAGGACTCTGTTCGGCAATGTTAAGTCATTTTCTTTTCCTTTATTCCATGTATTCAGGTGGGTAAAAAGTTGGCGTTATTGTTGGGTAAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAA‑GTTGCCGtt < 6:52014/146‑1 (MQ=12) ttCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAA‑GTTGACGtt > 7:312791/1‑147 (MQ=255) tCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTTATGATGGGTAAAAATTTGAGGTTAAGTTAGGTACTAA‑GTTGccaatatt > 6:286746/1‑143 (MQ=255) aaGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGCCGTGCAATGCTCACGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGGCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAA‑GTTGCCGTTAAgg < 5:116253/148‑1 (MQ=255) tACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTTGTGGTGGGTAAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAA‑GTTGACGTTAAGGTgtggc > 3:122355/1‑144 (MQ=255) caacaTGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTATTGGTGGGTCAAAAGTTGCAGTTTAGGATGGTCTAAA‑GTTGCAGTGAATGTCGGTaaa > 3:244658/1‑148 (MQ=255) caTGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTATTGTTGGGTAAAAAGTTGCCGTTAAGGTGTGTCAAAA‑TTTTAAGTAAATGAGGGTCaaaatt > 7:143089/1‑147 (MQ=255) gAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGGGGGTAAAAAGTTGCCGTTAAGGGGGGGGAAAA‑GTTGCAGTATAGGTGGGGCTAAATTTga > 6:194906/1‑148 (MQ=255) gAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGATAATGGTGGGTAAAAATATGCCGTTAAGGTGGGGCAAAT‑TTTGAAGTTAACGTGTGAGAAAAGTTg > 1:164437/1‑148 (MQ=255) aTAACGGAATCCGTCGGGCATTTATCCAGCCTTTTGTATGCCATAAATAAATGAATTCAGGGGGGAAAAAATATGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCTTTAAGGTGGGTCAAAA‑GTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGa < 8:76655/149‑1 (MQ=18) atacgcagggCATTTTTGCAGCCTTTTCTATCCCATTATTAAATGAATTCAGGTGGGTTAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCATTAGATGCCTTTTAGGTGGGTCAAAA‑GTTTCCTTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGaa < 4:218419/141‑1 (MQ=19) aTCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAA‑GTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAAt < 7:107424/149‑1 (MQ=255) ggCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCaaaa < 1:340850/102‑1 (MQ=255) ggCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCaaaa > 2:340850/1‑102 (MQ=255) gCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTAAAATTTTGCCGTTTAGGTGGGTCAAAA‑TTTGGAGTTAAGGTGTGTGTAATTTTGACGAGTAAGAATTCTACAAt > 7:429969/1‑148 (MQ=25) aaTGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGATGCCGTTAGTGGGTGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAA‑GTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTaa < 7:197620/149‑1 (MQ=255) tGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTATTGGTGGGTCAAAATTTGCCTTTAAGGTGGGTCAAAA‑GTTGAAGTTAAGGTGTGGCAAAATTTTACTAGTAAGAATTCTAATATTatt > 8:315579/1‑146 (MQ=25) tGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCaaaa < 2:369083/97‑1 (MQ=255) tGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCaaaa > 1:369083/1‑97 (MQ=255) cagCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGTGTAAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTAAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAA‑GTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCt < 3:47580/147‑1 (MQ=255) gCCTTTTCATTGCCTAAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAA‑GTTGCCGTTAAGGTgg < 3:218257/106‑1 (MQ=255) tttGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAATGTTGGGTCAAAATTTGCCGTTAAGGAGTGTCAAAT‑TTTGAAGTAAACGTGTCTCAAAATTTGACAACTAAAAATACTAGTATTGAGAATACTAGGctagtg > 8:109374/1‑143 (MQ=16) ttAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTTTTGGTGGGTAAAAATTTGCAGTTAAGGGGTGTGAAAATTTTGAGGTTAAGG‑GGGGGAAAATTTTAGGAGTAAAGATTGTAAAATTAAGAATTAAAGGGGATGGGAGttta > 2:201306/1‑148 (MQ=255) aattcATGAATTCAGGTGGGCCCAAATTTGCCGTTATTGGTGGCTAAAAAGTTGCCTTTAAGGTGGGTCAAAA‑GTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTa < 8:312791/145‑1 (MQ=37) tCCAGGAATTCCGGGGGGCCCAAAGAAGCCCTTAGGGGTGGGTCAAAAGCGGCCGTTCCGGTGGGTCAAAA‑GTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGc < 7:251890/149‑1 (MQ=25) aaTTCAGGTGGCTAAAAATTTGGGTTTCTGGGTGGGTCAAATCTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAT‑GTTTCATTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATAAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTccc < 8:317555/148‑1 (MQ=25) gTCAAAAGATGCCCGTAGTGGTGCCTCCACAGCAGCCGTGACGG‑GGTCCCAAA‑TCTGCCCTTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATaga < 7:23711/149‑1 (MQ=255) tCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTTAGGGGGGTCAAAA‑GTTTGCGTGAAGGTGGGGCAAAAGTTGCCTAGGAAGGAGTCTACAATTAATAATTATACGCGACGTGAGTGTTTTTGCGTAAcggtaggtgaaa > 8:428735/1‑143 (MQ=16) tCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTTGGGAAAAA‑TTTGCCGTTAAGGTGGGTGAAATGTTTGTGAGTAAGATTTGTACAATTAAGAATACTAGGCGACTGGAGTTTTGTAGCCTAGCGGTCGGTCa > 2:161769/1‑145 (MQ=25) tCAAAAGCTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGGAGCCGTTAAGGTGGGTCAAAA‑GTTGCCCTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATaga < 7:85253/149‑1 (MQ=255) gcAAAAGTTGCCGTTAGTGTTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAA‑GTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGATGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATaga < 7:109374/148‑1 (MQ=255) ccttAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTAAAGGTGGGTCAAAA‑GGTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATagaga < 7:344057/138‑1 (MQ=255) cGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTTAGGTGGGTAAAAA‑GTTGCAGTTAAAGTGGGTCGAAAGTTGGAGAGTAAGCATTCTTCAATTTAGAATTCTAGGATACGGGACTTTTTTTGCCTCCCGGTCGGTAATagaga > 8:344057/1‑140 (MQ=25) cGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAA‑GTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGcc > 7:406915/1‑146 (MQ=255) gTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAA‑GTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTa > 4:219791/1‑147 (MQ=255) gTTAGGGTTGGTTCAAACCCTGCCGTTAAGTTGGGTCAAAA‑GTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTaga < 7:18984/149‑1 (MQ=38) cttcgtggtgGGTAAATAGTTGCGGTTAAGGTGGGTCAAAA‑GTTGCCGTTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTaga < 3:48564/145‑1 (MQ=38) | TATACCAGGATCGGCAGAAAGGGAGTGCAACGAATACCAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAA‑GTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGA > NC_000913/2560829‑2561120 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |