| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 3950444 = | 121 (1.390) | 4 (0.050) | 5/248 | NT | 3.2% | intergenic (+24/‑63) | ilvL/ilvX | ilvG operon leader peptide/uncharacterized protein |
| ? | NC_000913 | 3950470 = | 126 (1.520) | intergenic (+50/‑37) | ilvL/ilvX | ilvG operon leader peptide/uncharacterized protein | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 140 total aligned reads displayed.
CGAACAAGATGCAAGAAAAGACAAAATGACAGCCCTTCTACGAGTGATTAGCCTGGTCGTGATTAGCGTGGTGGTGATTATTATCCCACCGTGCGGGGCTGCACTTGGACGAGGAAAGGCTTAGAGATCAAGCCTTAACGAACTAAGACCCCCGCACCGAAAGGTCCGGGGGTTTTTTTTGACCTTAAAAACATAACCGAGGAGCAGACAATGAATAACAGCACAAAATTCTGTTTCTCAAGATTCAGGACGGGGAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTT > NC_000913/3950297‑3950591 | cGAACAAGATGCAAGAAAAGACAAAATGACAGCCCTTCTACGAGTGATTAGCCTGGTCGTGATTAGCGTGGTGGTGATTATTATCCCACCGTGCGGGGCTGCACTTGGACGAGGAAAGGCTTAGAGATCAAGCCTTAACGAACTAAGa < 8:162218/148‑1 (MQ=255)cGAACAAGATGCAAGAAAAGACAAAATGACAGCCCTTCTACGAGTGATTAGCCTGGTCGTGATTAGCGTGGTGGTGATTATTATCCCACCGTGCGGGGCTGCACTTGGACGAGGAAAGGCTTAGAGATCAAGCCTTAACGAACTAAGa < 5:281354/148‑1 (MQ=255)aacggtgttcacaccctgtgcccgcaacgcatgtaccacccactgtgcgccattcatagttagttccccgtcctgaatcttgagaaacagaattttgtgctgttattcattgtctgctcctcggttatgtttttaaggtcaaaaaaaAc < 4:291705‑M1/2‑1 (MQ=255) gAACAAGATGCAAGAAAAGACAAAATGACAGCCCTTCTACGAGTGATTAGCCTGGTCGTGATTAGCGTGGTGGTGATTATTATCCCACCGTGCGGGGCTGCACTTGGACGAGGAAAGGCTTAGAGATCAAGCCTTAACGAACTAAGAcc > 7:50107/1‑149 (MQ=255) gAACAAGATGCAAGAAAAGACAAAATGACAGCCCTTCTACGAGTGATTAGCCTGGTCGTGATTAGCGTGGTGGTGATTATTATCCCACCGTGCGGGGCTGCACTTGGACGAGGAAAGGCTTAGAGATCAAGCCTTAACGAACTAAGAcc > 2:185263/1‑149 (MQ=255) gAACAAGATGCAAGAAAAGACAAAATGACAGCCCTTCTACGAGTGATTAGCCTGGTCGTGATTAGCGTGGTGGTGATTATTATCCCACCGTGCGGGGCTGCACTTGGACGAGGAAAGGCTTAGAGATCAAGCCTTAACGAACTAAGAcc > 6:365087/1‑149 (MQ=255) gAACAAGATGCAAGAAAAGACAAAATGACAGCCCTTCTACGAGTGATTAGCCTGGTCGTGATTAGCGTGGTGGTGATTATTATCCCACCGTGCGGGGCTGCACTTGGACGAGGAAAGGCTTAGAGATCAAGCCTTAACGAACTAAGAc < 7:45264/148‑1 (MQ=255) gAACAAGATGCAAGAAAAGACAAAATGACAGCAATTCTACGAGTTATTAGCCTGGTCGTGATTAGCGTGGTGGTGATTATTATCCCACCGTGCGGGTCTGCACTTGGTAGAGGAAAGGCTTAGAGATCAAGCCTTAACGAACTAAGAc < 3:86484/148‑1 (MQ=255) gCAAGAAAAGACAAAATGACAGCCCTTCTACGAGTGATTAGCCTGGTCGTGATTAGCGTGGTGGTGATTATTATCCCACCGTGCGGGGCTGCACTTGGACGAGGAAAGGCTTAGAGATCAAGCCTTAACGAACTAAGACCCCCGCAcc > 2:243983/1‑148 (MQ=255) gCAAGAAAAGACAAAATGACAGCCCTTCTACGAGTGATTAGCCTGGTCGTGATTAGCGTGGTGGTGATTATTATCCCACCGTCCGGGGCTGCACTTGGACGAGGAAAGCCTTAGAGATCAAGCCTTAACGAACTAAGACCCCAGCAcc > 8:254804/1‑148 (MQ=255) gAAAAGACAAAATGCCAGCCCTTCTACGAGTGATTAGCCTGGTCGTGATTAGCGTGGTGGTGATTATTATCCCACCGTGCGGGGCTGCACTTGGACGAGGAAAGGCTTAGAGATCAAGCCTTAACGAACTAAGACCCCCGCACCGAAAg > 5:186283/1‑149 (MQ=255) gAAAAGACAAAATGACAGCCCTTCTACGAGTTATTATACTGGTCGTGATTAGCGTGGTGGTGATTATTATCCCAACGTGCGGGTCTGCACTTGGACGAGGAAAGGCTTAGAGATCAAGCATTAACGAACTAAGACCCCCGCACCGAAAg > 4:343755/1‑149 (MQ=255) gAAAAGACAAAATGACAGCCCTTCTACGAGTGATTAGCCTGGTCGTGATTAGCGTGGTGGTGATTATTATCCCACCGTGCGGGGCTGCACTTGGACGAGGAAAGGCTTAGAGATCAAGCCTTAACGAACTAAGACCCCCGCACCGAAAg > 7:49585/1‑149 (MQ=255) aaaaTGACAGCCCTTCTACGAGTGATTAGCCTGGTCGTGATTAGCGTGGTGGTGATTATTATCCCACCGTGCGGGGCTGCACTTGGACGAGGAAAGGCTTAGAGATCAAGCCTTAACGAACTAAGACCCCCGCACCGAAAGGTCCgggg > 8:186746/1‑149 (MQ=255) aaaaTGACAGCCCTTCTACGAGTGATTAGCCTGGTCGTGATTAGCGTGGTGGTGATTATTATCCCACCGTGCGGGGCTGCACTTGGACGAGGAAAGGCTTAGAGATCAAGCCTTAACGAACTAAGACCCCCGCACCGAAAGGTCCgggg > 5:123525/1‑149 (MQ=255) aaTGACAGCCCTTCTACGAGTGATTAGCCTGGTCGTGATTAGCGTGGTGGTGATTATTATCCCACCGTGCGGGGCTGCACTTGGACGAGGAAAGGCTTAGAGATCAAGCCTTAACGAACTAAGACCCCCGCACCGAAAGGTCCGGGGGt > 4:276023/1‑149 (MQ=255) ccTTCTACGAGTGATTAGCCTGGTCGTGATTAGCGTGGTGGTGATTATTATCCCACCGTGCGGGGCTGCACTTGGACGAGGAAAGGCTTAGAGATCAAGCCTTAACGAACTAAGACCCCCGCACCGAAAGGTCCGGGGGTTTTTTTTGa > 2:142678/1‑149 (MQ=255) cTTCTACGAGTGATTAGCCTGGTCGTGATTAGCGTGGTGGTGATTATTATCCCACCGTGCGGGGCTGCACTTGGACGAGGAAAGGCTTAGAGATCAAGCCTTAACGAACTAAGACCCCCGCACCGAAAGGTCCGGGGGTTTTTTTTGAc < 8:50107/149‑1 (MQ=255) cTACGAGTGATTAGCCTGGTCGTGATTAGCGTGGTGGTCATTATTATCCCACCGTGCGGGGCTGCACTTGGACGAGGAAAGGCTTAGAGATCAAGCCTTAACGAACTAAGACCCCCGCACCGAAAGGTCCGGGGGTTTTTTTTGACCt < 3:283041/148‑1 (MQ=255) 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gagaTCAAGCCTTAACGAACTAAGACCCCCGCACCGAAAGGTCCGGGGGTTTTTTTTGACCTTAAAAACATAACCGAGGAGCAGACAATGAATAACAGCACAAAATTCTGTTTCTCAAGATTCAGGACgggg > 7:312449/1‑132 (MQ=255) gagaTCAAGCCTTAACGAACTAAGACCCCCGCACCGAAAGGTCCGGGGGTTTTTTTTGACCTTAAAAACATAACCGAGGAGCAGACAATGAATAACAGCACAAAATTCTGTTTCTCAAGATTCAGGACgggg < 8:312449/132‑1 (MQ=255) gagaTCAAGCCTTAACGAACTAAGACCCCCGCACCGAAAGGTCCGGGGGTTTTTTTTGACCTTAAAAACATAACCGAGGAGCAGACAATGAATAACAGCACAAAATTCTGTTTCTCAAGATTCAGGACGGGGAACTAACTATGAATgg < 4:191940/148‑1 (MQ=255) gagaTCAAGCCTTAACGAACTAAGACCCCCGCACCGAAAGGTCCGGGGGTTTTTTTTGACCTTAAAAACATAACCGAGGAGCAGACAATGAATAACAGCACAAAATTCTGTTTCTCAAGATTCAGGACGGGGAACTAACTATGAATGgc > 2:177994/1‑149 (MQ=255) gagaTCAAGCCTTAACGAACTAAGACCCCCGCACCGAAAGGTCCGGGGGTTTTTTTTGACCTTAAAAACATAACCGAGGAGCAGACAATGAATAACAGCACAAAATTCTGTTTCTCAAGATTCAGGACGGGGAACTAACTATGAATGgc < 1:45772/149‑1 (MQ=255) cAAGCCTTAACGAACTAAGACCCCCGCACCGAAAGGTCCGGGGGTTTTTTTTGACCTTAAAAACATAACCGAGGAGCAGACAATGAATAACAGCACAAAATTCTGTTTCTCAAGATTCAGGACGGGGAACTAACTATGAATGGCGca > 5:76684/1‑147 (MQ=255) cAAGCCTTAACGAACTAAGACCCCCGCACCGAAAGGTCCGGGGGTTTTTTTTGACCTTAAAAACATAACAGAGGCCCAGCAAATGAATAACAGCACAAAATTATGTTTATAAAGATTCAGGACGGGGAACTAACTATGAATGGCGca > 1:134838/1‑147 (MQ=255) aaGCCTTAACGAACTAAGACCCCCGCACCGAAAGGTCCGGGGGTTTTTTTTGACCTTAAAAACATAACCGAGGAGCAGACAATGAATAACAGCACAAAATTCTGTTTCTCAAGATTCAGGACGGGGAACTAACTATGAATGGCGcaca < 7:379103/148‑1 (MQ=255) aGCCTTAACGAACTAAGACCCCCGCACCGAAAGGTCCGGGGGTTTTTTTTGACCTTAAAAACATAACCGAGGAGCAGACAATGAATAACAGCACAAAATTCTGTTtct > 4:70295/1‑108 (MQ=255) cTTAACGAACTAAGACCCCCGCACCGAAAGGTCCGGGGGTTTTTTTTGACCTTAAAACCATAACCGAGGAGCAGACAATGAATAACAGCACAAAATTCTTTTTCGCAAGATTCAGGACGGGGAACTAACTATGAATGGCGAACAgtggg > 8:165594/1‑149 (MQ=255) aaCGAACTAAGACCCCCGCACCGAAAGGTCCGGGGGTTTTTTTTGACCTTAAAAACATAACCGAGGAGCAGCCAATGAATAACAGCACAAAATTGTGGTTCTCAAGATTCAGGACGGGGACCTAACTATGAATGGCGCACAgtgggtgg > 1:213571/1‑149 (MQ=255) cGAACTAAGACCCCCGCACCGAAAGGTCCGGGGGTTTTTTTTGACCTTAAAAACATAACCGAGGAGCAGACAATGAATAACAGCACAAAATTCTGTTTCTCAAGATTCAGGACGGGGAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTa < 8:177191/149‑1 (MQ=255) gAACTAAGACCACCGCACCGTACTGTACGGGGGTTTTTTTTGACCTTAATTACATAACCGAGGAGCAGACAATGAATAACAGCACAAAATTCTGTTTCTCAATATTCAGGACGGGGAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTAc < 1:377812/149‑1 (MQ=255) aCTAAGACCCCCGCACCGAAAGGTCCGGGGGTTTTTTTTGACCTTAAAAACATAACCGAGGAGCAGACAATGAATAACAGCACAAAATTCTGTTTCTCAAGATTCAGGACGGGGAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACAt < 1:390927/149‑1 (MQ=255) tAAGACCCCCGCACCGAAAGGTCCGGGGGTTTTTTTTGACCTTAAAAACATAACCGAGGAGCAGACAATGAATAACAGTACAAAATTCTGTTTCTCAAGATTCAGGACGGGGAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGc > 2:229108/1‑149 (MQ=255) tAAGACCCACGCACCAAAAGGTCCGGGGGTTTTTTTTGCCCTTAAAACCATAACCGAGGAGCGCACAATGATTAACAGCCCAAAATTCTGTTATACAAGAGTATGGACGGGGACCTAACTATCATTGGCCAAAAGTGGGTGGTACATGc > 2:102615/1‑149 (MQ=255) aGACCCCCGCACCGAAAGGTCCGGGGGTTTTTTATGACCTTAAAAACATAACCGAGGAGCAGCCAATGAATAACAGCACAAAATTCTGTTTCTAAAGATTCAGGACGGGGAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGTTGGGACATGCga > 2:396668/1‑148 (MQ=255) gACCCCCGCACCGAAAGGTCCGGGGGTTTTTTTTGACCTTAAAAACATAACCGAGGAGCAGACAATGAATAACAGCACAAAATTCTGTTTCTCAAGATTCAGGACGGGGAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGtt > 6:310931/1‑149 (MQ=255) | CGAACAAGATGCAAGAAAAGACAAAATGACAGCCCTTCTACGAGTGATTAGCCTGGTCGTGATTAGCGTGGTGGTGATTATTATCCCACCGTGCGGGGCTGCACTTGGACGAGGAAAGGCTTAGAGATCAAGCCTTAACGAACTAAGACCCCCGCACCGAAAGGTCCGGGGGTTTTTTTTGACCTTAAAAACATAACCGAGGAGCAGACAATGAATAACAGCACAAAATTCTGTTTCTCAAGATTCAGGACGGGGAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTT > NC_000913/3950297‑3950591 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |