| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 330,848 | G→A | 5.4% | T462T (ACG→ACA) | betT → | choline transporter of high affinity |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 330,848 | 0 | G | A | 5.4% | 237.5 / 2.3 | 74 | T462T (ACG→ACA) | betT | choline transporter of high affinity |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (34/36); new base A (2/2); total (36/38) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
CCATTACTGGCCTGCTGTTTTATGTGACCTCGGCGGACTCCGGGGCGCTGGTGCTGGGGAATTTCACCTCGCAGCTTAAAGATATCAACAGCGACGCCCCCGGCTGGCTGCGCGTCTTCTGGTCGGTGGCGATTGGCCTGCTGACGCTCGGCATGCTGATGACTAACGGGATATCCGCGCTGCAAAACACCACGGTGATTATGGGGCTGCCGTTCAGCTTTGTGATCTTCTTCGTGATGGCGGGGTTGTATAAATCTCTGAAGGTAGAAGATTACCGCCGTGAAAGTGCCA > NC_000913/330703‑330993 | ccaTTACTGGCCTGCTGTTTTATGTGACCTCGGCGGACTCCGGGGCGCTGGTGCTGGGGAATTTCACCTCGCAGCGTAAAGATATCAACAGCGACGCCCCCGGCTGGCTGCGCGTCTTCTGGTCGGTGGCGATTGGCCTGCTGACGCTc < 8:313064/149‑1 (MQ=255) caTTACTGGCCTGCTGTTTTATGTGACCTCGGCGGACTCCGGGGCGCTGGTGCTGGGGAATTTCACCTCGCAGCTTAAAGATATCAACAGCGACGCCCCCGGCTGGCTGCGCGTCTTCTGGTCGGTGGCGATTGGCCTGCTGACGCTCg < 3:251960/149‑1 (MQ=255) aTTACTGGCCTGCTGTTTTATGTGACCTCGGCGGACTCCGGGGCGCTGGTGCTGGGGAATTTCACCTCGCAGCTTAAAGATATCAACAGCGACGCCCCCGGCTGGCTGCGCGTCTTCTGGTCGGTGGCGATTGGCCTGCTGACGCTCgg > 5:143492/1‑149 (MQ=255) ttACTGGCCTGCTGTTTTATGTGACCTCGGCGGACTCCGGGGCGCTGGTGCTGGGGAATTTCACCTCGCAGCTTAAAGATATCAACAGCGACGCCCCCGGCTGGCTGCGCGTCTTCTGGTCGGTGGCGATTGGCCTGCTGACGCTCgg > 1:110955/1‑148 (MQ=255) cTGGCCTGCTGTTTTATGTGACCTCGGCGGACTCCGGGGCGCTGGTGCTGGGGAATTTCACCTCGCAGCTTAAAGATATCAACAGCGACGCCCCCGGCTGGCTGCGCGTCTTCTGGTCGGTGGCGATTGGCCTGCTGACGCTCGGCATg < 2:7439/149‑1 (MQ=255) tgctgTTTTATGTGACCTCGGCGGACTCCGGGGCGCTGGTGCTGCGGAATTTCACATCGAAGCTTAAAGATATCAACAGCGACGCCCCCGGCTGGCTGCGCGTCTTAAGGTCGGTGGCGATTGGCCTGCTGACGCTCGGCATGCtgat > 3:334895/1‑148 (MQ=255) ctgTTTTATGTGACCTCGGCGGACTCCGGGGCGCTGGTGCTGGGGAATTTCACCTCGCTGCTTAAAGATATCAACAGCGACGCCCCCGGCTGGCTGCGCGTCTTCTGGTCGGTGGCGATTGGCCTGCTGACGCTCGGCATGCtgatga < 1:56982/148‑1 (MQ=255) ttttATGTGACCTCGGCGGACTCCGGGGCGCTGGTGCTGGGGAATTTCACCTCGCAGCTTAAAGATATCAACAGCGACGCCCCCGGCTGGCTGCGCGTCTTCTGGTCGGTGGCGATTGGCCTGCTGACGCTCGGCATGCTGATGACTaa > 1:133790/1‑149 (MQ=255) tATGTGACCTCGGCGGACTCCGGGTCGTTGGTGATGGTTAATATCTCATCTAATGTTTTAGTTTTCATCCGAGATGCCAACGGGTGGCTGCGCGTTTTCTTGTCGGCGGCTATTTGCGTGCTGTCGCTCGGCATGCGGATTACTAACg < 4:38472/148‑1 (MQ=255) aTGTGACCTCGGCGGACTCCGGGGCGCTGGTGCTGGGGAATTTCACCTCGCAGCTTAAAGATATCAACAGCGACGCCCCCGGCTGGCTGCGCGTCTTCTGGTCGGTGGCGATTGGCCTGCTGACGCTCGGCATGCTGATGACTAACgg < 7:264199/148‑1 (MQ=255) tgtgACCTCGGCGGACTCCGGGGCGCTGGTGCTGGGGAATTTCACCTCGCAGCTTAAAGATATCAACAGCGACGCCCCCGGCTGGCTGCGCGTCTTCTGGTCGGTGGCGATTGGCCTGCTGACGCTCGGCATGCTGATGACTAACggg < 2:133790/148‑1 (MQ=255) gtgACCTCGGCGGACTCCGGGGCGCTGGTGCTGGGGAATTTCACCTCGCAGCTTAAAGATATCAACAGCGACGCCCCCGGCTGGCTGCGCGTCTTCTGGTCGGTGGCGATTGGCCTGCTGCCGCTCGGCATGCTGATGACTAACGGGa > 3:356679/1‑148 (MQ=255) aCCTCGGCGGACTCCGGGGCGCTGGTGCTGGGGAATTTCACCTCGCAGCTTAAAGATATCAACAGCGACGCCCCCGGCTGGCTGCGCGTCTTCTGGTCGGTGGCGATTGGCCTGCTGACGCTCGGCATGCTGATGACTAACGGGatat < 2:65235/148‑1 (MQ=255) ggACTCCGGGGCGCTGGTGCTGGGGAATTTCACCTCGCAGCTTAAAGATATCAACAGCGACGCCCCCGGCTGGCTGCGCGTCTTCTGGTCGGTGGCGATTGGCCTGCTGACGCTCGGCATGCTGATGACTAACGGGATATCCGCGCTGc < 2:260682/149‑1 (MQ=255) cGGGGCGCTGGTGCTGGGGAATTTCACCTCGCAGCTTAAAGATATCAACAGCGACGCCCCCGGCTGGCTGCGCGTCTTCTGGTCGGTGGCGATTGGCCTGCTGACGCTCGGCATGCTGATGACTAACGGGATATCCGCGCTGCAAAaca < 1:43768/149‑1 (MQ=255) cGGGGCGCTGGTGCTGGGGAATTTCACCTCGCAGCTTAAAGATATCAACAGCGACGCCCCCGGCTGGCTGCGCGTCTTCTGGTCGGTGGCGATTGGCCTGCTGACGCTCGGCATGCTGATGACTAACGGGATATCCGCGCTGCAAAaca > 8:307137/1‑149 (MQ=255) cGGGGCGCTGGTGCTGGGGAATTTCACCTCGCAGCTTAAAGATATCAACAGCGACGCCCCCGGCTGGCTGCGCGTCTTCTGGTCGGTGGCGATTGGCCTGCTGACGCTCGGCATGCTGATGACTAACGGGATATCCGCGCTGCAAAac < 5:125639/148‑1 (MQ=255) gcTGGTGCTGGGGAATTTCACCTCGCAGCTTAAAGATATCAACAGCGACGCCCCCGGCTGGCTGCGCGTCTTCTGGTCTGTGGCGATTGGCCTGCTGACGATCGGCATGCTGATGACTAACGGGATATCCGCGCTGCAAAACACCACgg > 1:373441/1‑149 (MQ=255) gcTGGTGCTGGGGAATTTCACCTCGCAGCTTAAAGATATCAACAGCGACGCCCCCGGCTGGCTGCGCGTCTTCTGGTCGGTGGCGATTGGCCTGCTGACGCTCGGCATGCTGATGACTAACGGGATATCCGCGCTGc > 3:27354/1‑137 (MQ=255) gcTGGTGCTGGGGAATTTCACCTCGCAGCTTAAAGATATCAACAGCGACGCCCCCGGCTGGCTGCGCGTCTTCTGGTCGGTGGCGATTGGCCTGCTGACGCTCGGCATGCTGATGACTAACGGGATATCCGCGCTGc < 4:27354/137‑1 (MQ=255) cTGGTGCTGGGGAATTTCACCTCGCAGCTTAAAGATATCAACAGCGACGCCCCCGGCTGGCTGCGCGTCTTCTGGTCGGTGGCGATTGGCCTGCTGACGCTCGGCATGCTGATGACTAACGGGATATCCGCGCTGCAAAACACCACGGt > 7:367871/1‑149 (MQ=255) ggTGCTGGGGAATTTCACCTCGCAGCTTAAAGATATCAACAGCGACGCCCCCGGCTGGCTGCGCGTCTTCTGGTCGGTGGCGATTGGCCTGCTGACGCTCGGCATGCTGATGACTAACGGGATATCCGCGCTGCAAAACACCACGGTGa > 6:355986/1‑149 (MQ=255) ggTGCTGGGGAATTTCACCTCGCAGCTTAAAGATATCAACAGCGACGCCCCCGGCTGGCTGCGCGTCTTCTGGTCGGTGGCGATTGGCCTGCTGACGCTCGGCATGCTGATGACTAACGGGATATCCGCGCTGCAAAACACCACGGTGa > 8:51360/1‑149 (MQ=255) gTGCTGGGGAATTTCACCTCGCAGCTTAAAGATATCAACAGCGACGCCCCCGGCTGGCTGCGCGTCTTCTGGTCGGTGGCGATTGGCCTGCTGACGCTCGGCATGCTGATGACTAACGGGATATCCGCGCTGCAAAACACCACGGTGAt < 7:51360/149‑1 (MQ=255) cTGGGGAATTTCACCTCGCAGCTTAAAGATATCAACAGCGACGCCCCCGGCTGGCTGCGCGTCTTCTGGTCGGTGGCGATTGGCCTGCTGACGCTCGGCATGCTGATGACTAACGGGATATCCGCGCTGCAAAACACCACGGTGATTAt < 1:288431/149‑1 (MQ=255) tGGGGAATTTCACCTCGCAGCTTAAAGATATCAACAGCGACGCCCCCGGCTGGCTGCGCGTCTTCTGGTCGGTGGCGATTGGCCTGCTGACGCTCGGCATGCTGATGACTAACGGGATATCCGCGCTGCAAAACACCACGGTGATTATg > 5:330501/1‑149 (MQ=255) tGGGGAATTTCACCTCGCAGCTTAAAGATATCAACAGCGACGCCCCCGGCTGGCTGCGCGTCTTCTGGTCGGTGGCGATTGGCCTGCTGACGCTCGGCATGCTGATGACTAACGGGATATCCGCGCTGCAAAACACCACGGTGATTATg > 3:229924/1‑149 (MQ=255) tttCACCTCGCAGCTTAAAGATATCAACAGCGACGCCCCCGGCTGGCTGCGCGTCTTCTGGTCGGTGGCGATTGGCCTGCTGACGCTCGGCATGCTGATGACTAACGGGATATCCGCGCTGCAAAACACCACGGTGATTATGGGGCTGc < 3:265548/149‑1 (MQ=255) tttCACCTCGCAGCTTAAAGATATCAACAGCGACGCCCCCGGCTGGCTGCGCGTCTTCTGGTCGGTGGCGATTGGCCTGCTGACGCTCGGCATGCTGATGACTAACGGGATATCCGCGCTGCAAAACACCACGGTGATTATGGGGCTGc > 3:162980/1‑149 (MQ=255) tttCACCTCGCAGCTTAAAGATATCAACAGCGACGCCCCCGGCTGGCTGCGCGTCTTCTGGTCGGTGGCGATTGGCCTGCTGACGCTCGGCATGCTGATGACTAACGGGATATCCGCGCTGCAAAACACCACGGTGATTATGGGGCTGc > 4:265548/1‑149 (MQ=255) aCCTCGCAGCTTAAAGATATCAACAGCGACGCCCCCGGCTGGCTGCGCGTCTTCTGGTCGGTGGCGATTGGCCTGCTGACGCTCGGCATGCTGATGACTAACGGGATATCCGCGCTGCAAAACACCACGGTGATTATGGGGCTGCCGtt < 7:307137/149‑1 (MQ=255) gCAGCTTAAAGATATCAACAGCGACGCCCCCGGCTGGCTGCGCGTCTTCTGGTCGGTGGCGATTGGCCTGCTGACACTCGGCATGCTGATGACTAACGGGATATCCGCGCTGCAAAACACCACGGTGATTATGGGGCTGCCGTTCAGCt > 5:88780/1‑149 (MQ=255) gCAGCTTAAAGATATCAACAGCGACGCCCCCGGCTGGCTGCGCGTCTTCTGGTCGGTGGCGATTGGCCTGCTGACACTCGGCATGCTGATGACTAACGGGATATCCGCGCTGCAAAACACCACGGTGATTATGGGGCTGCCGTTCAGCt > 1:166711/1‑149 (MQ=255) gCTTAAAGATATCAACAGCGACGCCCCCGGCTGGCTGCGCGTCTTCTGGTCGGTGGCGATTGGCCTGCTGACGCTCGGCATGCTGATGACTAACGGGATATCCGCGCTGCAAAACACCACGGTGATTATGGGGCTGCCGTTCAGCTTtg < 8:361484/149‑1 (MQ=255) gCTTAAAGATATCAACAGCGACGCCCCCGGCTGGCTGCGCGTCTTCTGGTCGGTGGCGATTGGCCTGCTGACGCTCGGCATGCTGATGACTAACGGGATATCCGCGCTGCAAAACACCACGGTGATTATGGGGCTGCCGTTCAGCTTtg < 5:355986/149‑1 (MQ=255) aaaGAAATCAACAGCGACGCCCCCGGCTGGCTGCGCGTCTTCTGGTCGGTGGCGATTGGCCTGCTGACGCTCGGCATGCTGATGACTAACGGGATATCCGCGCTGCAAAACACCACGGTGATTATGGGGCTGCCGTTCAGCTTTGTGAt > 2:371738/1‑149 (MQ=255) aaGATATCAACAGCGACGGCCCCGGCTGGCTGCGCGTCTTCTGGTCGGTGGCGATTGGCCTGCTGACGCTCGGCATGCTGATGACTAACGGGATATCCGCGCTGCAAAACACCACGGTGATTATGGGGCTGCCGTTCAGCTTTGTGAtc < 4:12166/149‑1 (MQ=255) aGATATCAACAGCGACGCCCCCGGCTGGCTGCGCGTCTTCTGGTCGGTGGCGATTGGCCTGCTGACGCTCGGCATGCTGATGACTAACGGGATATCCGCGCTGCAAAACACCACGGTGATTATGGGGCTGCCGTTCAGCTTtgt > 5:298933/1‑144 (MQ=255) aGATATCAACAGCGACGCCCCCGGCTGGCTGCGCGTCTTCTGGTCGGTGGCGATTGGCCTGCTGACGCTCGGCATGCTGATGACTAACGGGATATCCGCGCTGCAAAACACCACGGTGATTATGGGGCTGCCGTTCAGCTTtgt < 6:298933/144‑1 (MQ=255) atatCAACAGCGACGCCCCCGGCTGGCTGCGCGTCTTCTGGTCGGTGGCGATTGGCCTGCTGACGCTCGGCATGCTGATGACTAACGGGATATCCGCGCTGCAAAACACCACGGTGATTATGGGGCTGCCGTTCAGCTTTGTGAtcttc < 1:27270/149‑1 (MQ=255) atatCAACAGCGACGCCCCCGGCTGGCTGCGCGTCTTCTGGTCGGTGGCGATTGGCCTGCTGACGCTCGGCATGCTGATGACTAACGGGATATCCGCGCTGCAAAACACCACGGTGATTATGGGGCTGCCGTTCAGCTTTGTGAtcttc > 3:272142/1‑149 (MQ=255) tatCAACAGCGACGCCCCCGGCTGGCTGCGCGTCTTCTGGTCGGTGGCGATTGGCCTGCTGACGCTCGGCATGCTAATGACTAACGGGATATCCGCGCTGCAAAACACCACGGTGATTATGGGGCTGCCGTTCAGCTTTGTGAtcttct > 7:340905/1‑149 (MQ=255) tCACCAGCGACGCCCCCGGCTGGCTGCGCGTCTTCTGGGCGGGGGAGATTGGCCTGCTGACGCTCGGCATGCTGATGACTAACGGGATATCCGCGCTGCAAAACACCACGGTGATTATGGGGCTGCCGTTCAGCTTTGTGATCttcttc < 2:110955/149‑1 (MQ=255) tCAACAGCGACGCCCCCGGCTGGCTGCGCGTCTTCTGGTCGGTGGCGATTGGCCTGCTGACGCTCGGCATGCTGATGACTAACGGGATATCCGCGCTGCAAAACACCACGGTGATTATGGGGCTGCCGTTCAGCTTTGTGATCttcttc < 6:143492/149‑1 (MQ=255) tCAACAGCGACGCACCCGGCTGGCTGCGCGTCTTCTGGTCGGTGGCGATTGGCCTGCTGACGCTCGGCATGCTGATGACTAACGGGATATCCGCGCTGCAAAACACCACGGTGATTATGGGGCTGCCGTTCAGCTTTGTGATCttcttc < 6:330501/149‑1 (MQ=255) aaCAGCGACGCCCCCGGCTGGCTGCGCGTCTTCTGGTCGGTGGCGATTGGCCTGCTGACGCTCGGCATGCTGATGACTAACGGGATATCCGCGCTGCAAAACACCACGGTGATTATGGGGCTGCCGTTCAGCttt > 7:94761/1‑135 (MQ=255) aaCAGCGACGCCCCCGGCTGGCTGCGCGTCTTCTGGTCGGTGGCGATTGGCCTGCTGACGCTCGGCATGCTGATGACTAACGGGATATCCGCGCTGCAAAACACCACGGTGATTATGGGGCTGCCGTTCAGCttt < 8:94761/135‑1 (MQ=255) aaCAGCGACGCCCCCGGCTGGCTGCGCGTCTTCTGGTCGGTGGCGATTGGCCTGCTGACGCTCGGCATGCTGATGACTAACGGGATATCCGCGCTGCAAAACACCACGGTGATTATGGGGCTGCCGTTCAGCTTTGTGATCTTCTTCg < 4:162980/148‑1 (MQ=255) aaCAGCGACGCCCCCGGCTGGCTGCGCGTCTTCTGGTCGGTGGCGATTGGCCTGCTGACGCTCGGCATGCTGATGACTAACGGGATATCCGCGCTGCAAAACACCACGGTGATTATGGGGCTGCCGTTCAGCTTTGTGATCTTCTTCGt > 8:125656/1‑149 (MQ=255) aaCAGCGACGCCCCCGGCTGGCTGCGCGTCTTCTGGTCGGTGGCGATTGGCCTGCTGACGCTCGGCATGCTGATGACTAACGGGATATCCGCGCTGCAAAACACCACGGTGATTATGGGGCTGCCGTTCAGCTTTGTGATCTTCTTCGt > 2:8637/1‑149 (MQ=255) aCAGCGACGCCCCCGGCTGGCTGCGCGTCTTCTGGTCGGTGGCGATTGGCCTGCTGACGCTCGGCATGCTGATGACTAACGGGATATCCGCGCTGCAAAACACCACGGTGATTATGGGGCTGCCGTTCAGCTTTGTGATCTTCTTCGt > 6:381420/1‑148 (MQ=255) cAGCGACGCCCCCGGCTGGCTGCGCGTCTTCTGGTCGGTGGCGATTGGCCTGCTGACGCTCGGCATGCTGATGACTAACGGGATATCCGCGCTGCAAAACACCACGGTGATTATGGGGCTGCCGTTCAGCTTTGTGATCTTCTTCGTGa < 5:289656/149‑1 (MQ=255) gCCCCCGGCTGGCTGCGCGTCTTCTGGTCGGTGGCGATTGGCCTGCTGACGCTCGGCATGCTGATGACTAACGGGATATCCGCGCTGCAAAACAACACGGTGATTATGGGGCTGCCGTTCAGCTTTGTGATCTTCTTCGTTATGGCggt > 4:237972/1‑148 (MQ=255) ccccGGCTGGCTGCGCGTCTTCTGGTCGGTGGCGATTGGCCTGCTGACGCTCGGCATGCTGATGACTAACGGGATATCCGCGCTGCAAAACACCACGGTGATTATGGGGCTGCCGTTCAGCTTTGTGATCTTCTTCGTGATGGCGGGGt < 1:371738/149‑1 (MQ=255) ccccGGCTGGCTGCGCGTCTTCTGGTCGGTGGCGATTGGCCTGCTGACGCTCGGCATGCTGATGACTAACGGGATATCCGCGCTGCAAAACACCACGGTGATTATGGGGCTGCCGTTCAGCTTTGTGATCTTCTTCGTGATGGCGGGGt > 7:89466/1‑149 (MQ=255) cccGGCTGGCTGCGCGTCTTCTGGTCGGTGGCGATTGGCCTGCTGACGCTCGGCATGCTTATGACTAACGGGATATCCGCGCTGCAAAACACCACGGTGATTATGGGGCTGCCGTTCAGCTTTGTGATCTTCTTCGTGATGGCGGGGtt < 8:340905/149‑1 (MQ=255) gctgCGCGTCTTCTGGTCGGTGGCGATTGGCCTGCTGACGCTCGGCATGCTGATGACTAACGGGATATCCGCGCTGCAAAACACCACGGTGATTATGGGGCTGCCGTTCAGCTTTGTGATCTTCTTCGTGATGGCGGGGTTGTATAAAt < 4:356679/149‑1 (MQ=255) gcgcGTCTTCTGGTCGGTGGCGATTGGCCTGCTGACGCTCGGCATGCTGATGACTAACGGGATATCCGCGCTGCAAAACACCACGGTGATTATGGGGCTGCCGTTCAGCTTTGGGATCTTCTTCGTGATGGCGGGGTGGTATAAAtctc < 7:125656/149‑1 (MQ=255) cgcgTCTTCTGGTCGGTGGCGATTGGCCTGCTGACACTCGGCATGCTGATGACTAACGGGATATCCGCGCTGCAAAACACCACGGTGATTATGGGTCTGCCGTTCAGCTTTGTGATCTTCTTCGTGATGGCGGGGTTGTATAAATctct < 2:166711/149‑1 (MQ=255) cgcgTCTTCTGGTCGGTGGCGATTGGCCTGCTGACACTCGGCATGCTGATGACTAACGGGATATCCGCGCTGCAAAACACCACGGTGATTATGGGGCTGCCGTTCAGCTTTGTGATCTTCTTCGTGATGGCGGGGTTGTATAAATctct < 6:88780/149‑1 (MQ=255) gTCTTCTGGTCGGTGGCGATTGGCCTGCTGACGCTCGGCATGCTGATGACTAACGGGATATCCGCGCTGCAAAACACCACGGTGATTATGGGGCTGCCGTTCAGCTTTGTGATCTTCTTCGTGATGGCGGGGTTGTATAAATCTCTGaa < 5:381420/149‑1 (MQ=255) ttctGGTCGGTGGCGATTGGCCTGCTGACGCTCGGCATGCTGATGACTAACGGGATATCCGCGCTGCAAAACACCACGGTGATTATGGGGCTGCCGTTCAGCTTTGTGATCTTCTTCGTGATGGCGGGGTTGTATAAATCTCTGAAgg > 2:163535/1‑148 (MQ=255) ctGGTCGGTGGCGATTGGCCTGCTGACGCTCGGCATGCTGATGACTAACGGGATATCCGCGCTGCAAAACACCACGGTGATTATGGGGCTGCCGTTCAGCTTTGTGATCTTCTTCGTGATGGCGGGGTTGTATAAATCTCTGAAgg > 1:261031/1‑146 (MQ=255) ctGGTCGGTGGCGATTGGCCTGCTGACGCTCGGCATGCTGATGACTAACGGGATATCCGCGCTGCAAAACACCACGGTGATTATGGGGCTGCCGTTCAGCTTTGTGATCTTCTTCGTGATGGCGGGGTTGTATAAATCTCTGAAgg < 8:367871/146‑1 (MQ=255) gTCGGTGGCGATTGGCCTGCTGACGCTCGGCATGCTGATGACTAACGGGATATCCGCGCTGCaaaa < 8:111124/66‑1 (MQ=255) gTCGGTGGCGATTGGCCTGCTGACGCTCGGCATGCTGATGACTAACGGGATATCCGCGCTGCaaaa > 7:111124/1‑66 (MQ=255) gATTGGCCTGCTGACGCTCGGCATGCTGATGACTAACGGGATATCCGCGCTGCAAAACACCACGGTGATTATGGGGCTGCCGTTCAGCTTTGTGATCTTCTTCGTGATGGCGGGGTTGTATAAATCTCTGAAGGTAGAAGATTAccgcc > 2:362562/1‑149 (MQ=255) gCCTGCTGACGCTCGGCATGCTGATGACTAACGGGATATCCGCGCTGCAAAACACCACGGTGATTATGGGGCTGCCGTTCAGCTTTGTGATCTTCTTCGTGATGGCGGGGTTGTATAAATCTCTGAAGGTAGAAGATTACCGCCGTGa > 7:175725/1‑148 (MQ=255) ccTGCTGACGCTCGGCATGCTGATGACTAACGGGATATCCGCGCTGCAAAACACCACTGTGATTATGGTGCTGCCTTTCAGCTTTGTTATCTTCTTCGTGATGGCGGGGTTGTATAAATCTCTGAAGGTAGAAGATTACCGCCGTGaaa < 3:237972/149‑1 (MQ=255) ccTGCTGACGCTCGGCATGCTGATGACTAACGGGATATCCGCGCTGCAAAACACCACGGTGATTATGGGGCTGCCGTTCAGCTTTGAGATCATCTTAGTCATGTCGGGGTTGTATAAATCTCTGAAGGTAGAAGATTACCGCCGTGaaa > 6:265685/1‑149 (MQ=255) ctgctgACGCTCGGCATGCTGATGACTAACGGGATATCCGCGCTGCAAAACACCACGGTGATTATGGGGCTGCCGTTCAGCTTTGTGATCTTCTTCGTGATGGCGGGGTTGTATAAATCTCTGAAGGTAGAAGATTACCGCCGTGAAAg > 5:221679/1‑149 (MQ=255) gctgACGCTCGGCATGCTGATGACTAACGGGATATCCGCGCTGCAAAACACCACGGTGATTATGGGGCTGCCGTTCAGCTTTGTGATCTTCTTCGTGATGGCGGGGTTGTATAAATCTCTGAAGGTAGAAGATTACCGCCGTGAAAGTg > 3:61568/1‑149 (MQ=255) ctgACGCTCGGCATGCTGATGACTAACGGGATATCCGCGCTGCAAAACACCACGGTGATTATGGGGCTGCCGTTCAGCTTTGTGATCTTCTTCGTGATGGCGGGGTTGTATAAATCTCTGAAGGTAGAAGATTACCGCCGTGAAAGTg < 1:8637/148‑1 (MQ=255) gACGCTCGGCATGCTGATGACTAACGGGATATCCGCGCTGCAAAACACCACGGTGATTATGGGGCTGCCGTTCAGCTTTGTGATCTTCTTCGTGATGGCGGGGTTGTATAAATCTCTGAAGGTAGAAGATTACCGCCGTGAAAGTGCCa > 8:261132/1‑149 (MQ=255) | CCATTACTGGCCTGCTGTTTTATGTGACCTCGGCGGACTCCGGGGCGCTGGTGCTGGGGAATTTCACCTCGCAGCTTAAAGATATCAACAGCGACGCCCCCGGCTGGCTGCGCGTCTTCTGGTCGGTGGCGATTGGCCTGCTGACGCTCGGCATGCTGATGACTAACGGGATATCCGCGCTGCAAAACACCACGGTGATTATGGGGCTGCCGTTCAGCTTTGTGATCTTCTTCGTGATGGCGGGGTTGTATAAATCTCTGAAGGTAGAAGATTACCGCCGTGAAAGTGCCA > NC_000913/330703‑330993 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |