| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 368,813 | A→T | 6.3% | Q68L (CAG→CTG) | mhpA → | 3‑(3‑hydroxyphenyl)propionate hydroxylase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 368,813 | 0 | A | T | 6.3% | 233.2 / 4.0 | 73 | Q68L (CAG→CTG) | mhpA | 3‑(3‑hydroxyphenyl)propionate hydroxylase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (37/31); new base T (2/3); total (39/34) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.59e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
GCGATCGCTGGTGCCGGCCCGGTTGGGCTGATGATGGCGAACTATCTCGGCCAGATGGGCATTGACGTGCTGGTGGTGGAGAAACTCGATAAGTTGATCGACTACCCGCGTGCGATTGGTATTGATGACGAGGCGCTGCGCACCATGCAGTCGGTCGGCCTGGTCGATGATGTTCTGCCGCACACTACGCCGTGGCACGCGATGCGTTTTCTCACCCCGAAAGGCCGCTGTTTTGCTGATATTCAGCCAATGACCGATGAATTTGGCTGGCCGCGCCGTAACGCCTTTATTCAGC > NC_000913/368665‑368959 | gCGATCGCTGGTGCCGGCCCGGTTGGGCTGATGATGGCGAACTATCTCGGCCAGATGGGCATTGACGTGCTGGTGGTGGAGAAACTCGATAAGTTGATCGACTACCCGCGTGCGATTGGTATTGATGACGAGGCGCTGCGCACCATGCa < 6:138863/149‑1 (MQ=255) gagcGCTGGTGCCGGCCCGGTTGGGCTGATGATGGCGAACTATCTCGGCCAGATGGGCATTGACGTGCTGGTGGTGGAGAAAGTCGATATGTTGATCGTCTACCCGCGTGCGATTGGTATTGATGACGAGGCGCTGCGCACCATGGAgt < 4:321850/146‑1 (MQ=255) aTCGCTGGTGCCGGCCCGGTTGGGCTGATGATGGCGAACTATCTCGGCCAGATGGGCATTGCCGTGCTGGTGGTGGAGAAACTCGATATGTTGATCGACTACCCGCGTGCGATTGGTATTGATGACGAGGCGCTGCGCACCAGGCAgtc > 5:244772/1‑149 (MQ=255) aTCGCTGGTGCCGGCCCGGTTGGGCTGATGATGGCGAACTATCTCGGCCAGATGGGCATTGACCTGCTGGTGGTGGAGATACTCGATAAGTTGATAGACTACCCGCGTGCGATTGGTATTGATGACGAGGCGCTGCGCACCATGCAgtc > 2:276471/1‑149 (MQ=255) gTGCCGGCCCGGTTGGGCTGATGATGGCGAACTATCTCGGCCAGATGGGCATTGACGTGCTGGTGGTGGAGAAACTCGATAAGTTGATCGACTACCCGCGTGCGATTGGTATTGATGACGAGGCGCTGCGCACCATGCAGTCGGTCGGc < 8:181194/149‑1 (MQ=255) gCCGGCCCGGTTGGGCTGATGATGGCGAACTATCTCGGCCAGATGGGCATTGACGTGCTGGTGGTGGAGAAACTAGATAAGTTGATCGACTACCCGCGTGCGATTGGTATTGATGACGAGTCGCTGCGCACCATGCAGTCGGTCGGCCt > 5:189344/1‑149 (MQ=255) ggTTGGGCTGATGATGGCGAACTATCTCGGCCAGATGGGCATTGACGTGCTGGTGGTGGAGAAACTCGATAAGTTGATCGACTACCCGCGTGCGATTGGTATTGATGACGAGGCGCTGCGCACCATGCAGTCGGTCGGCCTGGTCgat > 3:42171/1‑148 (MQ=255) gTTGGGCTGATGATGGCGAACTATCTCGGCCAGATGGGCATTGACGTGCTGGTGGTGGAGAAACTCGATAAGTTGATCGACTACCCGCGTGCGATTGGTATTGATGACGAGGCGCTGCGCACCATGCAGTCGGTCGGCCTGGTCgatga > 7:200422/1‑149 (MQ=255) gTTGGGCTGATGATGGCGAACTATCTCGGCCAGATGGGCATTGACGTGCTGGTGGTGGAGAAACTCGATAAGTTGATCGACTACCCGCGTGCGATTGGTATTGATGACGAGGCGCTGCGCACCATGCAGTCGGTCGGCCTGGTCgatga > 5:18752/1‑149 (MQ=255) gggCTGATGATGGCGAACTATCTCGGCCAGATGGGCATTGACGTGCTGGTGGTGGAGAAACTCGATAAGTTGATCGACTACCCGCGGGCGATTGGTATTGATGACGAGGCGCTGCGCACCATGCAGTCGGTCGGCCTGGTCGatgatg < 5:278213/148‑1 (MQ=255) gCTGATGATGGCGAACTATCTCGGCCAGATGGGCATTGACGTGCTGGTGGTGGAGAAACTCGATAAGTTGATCGACTACCCGCGTGCGATTGGTATTGATAACGAGGCGCTGCGCACCATGCAGTCGGTCGGCCTGGTCGATGATGTTc < 2:181719/149‑1 (MQ=255) gatgatGGCGAACTATCTCGGCCAGATGGGCATTGACGTGCTGGTGGTGGAGAAGCTCGATAAGTTGATCGACTACCCGCGTGCGATTGGTATTGATGACGAGGCGCTGCGCACCATGCAGTCGGTCGGCCTGGTCGATGATGTTCTGc > 6:179574/1‑149 (MQ=255) atgatgGCGAACTATCTCGGCCAGATGGGCATTGACGTGCTGGTGGTGGAGAAACTCGATAAGTTGATCGACTACCCGCGTGCGATTGGTATTGATGACGAGGCGCTGCGCACCATGCAGTCGGTCGGCCTGGTCgatg > 5:139791/1‑139 (MQ=255) atgatgGCGAACTATCTCGGCCAGATGGGCATTGACGTGCTGGTGGTGGAGAAACTCGATAAGTTGATCGACTACCCGCGTGCGATTGGTATTGATGACGAGGCGCTGCGCACCATGCAGTCGGTCGGCCTGGTCgatg < 6:139791/139‑1 (MQ=255) gCGATCTTTCTCGTCGAGATGGGCTTGGACGGTCTGGTGGTGGAGAAACTCGATTATTTGATCGACTACGCGCTTGCGATTGGTATTGATGACGTGGGGCGGCGCACCATGGTGTCGGGCGGCTTGGTCGAGTATGTTGTGGCGcact < 4:294883/148‑2 (MQ=255) gCGAACTATCTCGGCCAGATGGGCATTGACGTGCTGGTGGTGGAGAAACTCGATAAGTTGATCGACTACCCGCGTGCGATTGGTATTGATGACGAGGCGCTGCGCACCATGCAGTCGGTCGGCCTGGTCGATGATGTTCTGCCGcaca < 7:256293/148‑1 (MQ=255) gAACTATCTCGGCCAGATGGGCATTGACGTGCTGGTGGTGGAGAAACTCGATAAGTTGATCGACTACCCGCGTGCGATTGGTATTGATGACGAGGCGCTGCGCACCATGCAGTCGGTCGGCCTGGTCGATGATGTTCTGCCGCACACTa > 3:26628/1‑149 (MQ=255) aaCTATCTCGGCCAGATGGGCATTGACGTGCTGGTGGTGGAGAAACTCGATAAGTTGATCGACTACCCGCGTGCGATTGGTATTGATGACGAGGCGCTGCGCACCATGCAGTCGGTCGGCCTGGTCGATGATGTTCTGCCGCACACTAc < 2:330603/149‑1 (MQ=255) aCTATCTCGGCCAGATGGGCATTGACGTGCTGGTGGTGGAGAAACTCGATAAGTTGATCGACTACCCGCGTGCGATTGGTATTGATGACGAGGCGCTGCGCACCATGCAGTCGGTCGGCCTGGTCGATGATGTTCTGCCGCACACTACg > 7:268470/1‑149 (MQ=255) tctcGGCCAGATGGGCAGTGACGTGCTGGTGGTGGAGAAACTCGATAAGTTGATCGACTACCCGCGTGCGATTGGTATTGATGACGAGGCGCTGCGCACCATGCAGTCGGTCGGCCTGGTCGATGATGTTCTGCCGCACACTACGCCg < 5:274864/148‑1 (MQ=255) ggCCAGATGGGCATTGACGTGCTGGTGGTGGAGAAACTCGATAAGTTGATCGACTACCCGCGTGCGATTGGTATTGATGACGAGGCGCTGCGCACCATGCAGTCGGTCGGCCTGGTCGATGATGTTCTGCCGca < 3:334006/134‑1 (MQ=255) ggCCAGATGGGCATTGACGTGCTGGTGGTGGAGAAACTCGATAAGTTGATCGACTACCCGCGTGCGATTGGTATTGATGACGAGGCGCTGCGCACCATGCAGTCGGTCGGCCTGGTCGATGATGTTCTGCCGca > 4:334006/1‑134 (MQ=255) ggCCAGATGGGCATTGACGTGCTGGTGGTGGAGAAACTCGATAAGTTGATCGACTACCCGCGTGCGATTGGTATTGATGACGAGGCGCTGCGCACCATGCAGTCGGTCGGCCTGGTCGATGATGTTCTGCCGCACACTACGCCGTg < 8:266726/146‑1 (MQ=255) aGATGGGCATTGACGTGCTGGTGGTGGAGAAACTCGATAAGTTGATCGACTACCCGCGTGCGATTGGTATTGATGACGAGGCGCTGCGCACCATGCAGTCGGTCGGCCTGGTCGATGATGTTCTGCCGCACACTACGCCGTGGCAcgc > 8:361906/1‑148 (MQ=255) gATGGGCATTGACGTGCTGGTGGTGGAGAAACTCGATAAGTTGATCGACTACCCGCGTGCGATTGGTATTGATGACGAGGCGCTGCGCACCATGCAGTCGGTCGGCCTGGTCGATGATGTTCTGCCGCACACTACGCCGTGGCACGCGa > 8:139474/1‑149 (MQ=255) gggCATTGACGTGCTGGTGGTGGAGAAACTCGATAAGTTGATCGACTACCCGCGTGCGATTGGTATTGATGACGAGGCGCTGCGCACCATGCAGTCGGTCGGCCTGGTCGATGATGTTCTGCCGCACACTACGCCGTGGCACGCGATGc > 4:66183/1‑149 (MQ=255) gCATTGACGTGCTGGTGGTGGAGAAACTCGATAAGTTGATCGACTACCCGCGTGCGATTGGTATTGATGACGAGGCGCTGCGCACCATGCAGTCGGTCGGCCTGGTCGATGATGTTCTGCCGCACACTACGCCGTGGCACGCGATGCGt > 4:261747/1‑149 (MQ=255) tggtggAGAAACTCGATAAGTTGATCGACTACCCGCGTGCGATTGGTATTGATGACGAGGCGCTGCGCACCATGCAGTCGGTCGGCCTGGTCGATGATGTTCTGCCGCACACTACGCCGTGGCACGCGATGCGTTTTCTCACCCCGaaa < 1:305175/149‑1 (MQ=255) gtggAGAAACTCGATAAGTTGATCGACTACCCGCGTGCGATTGGTATTGATGACGAGGCGCTGCGCACCATGCAGTCGGTCGGCCTGGTCGATGATGTTCTGCCGCACACTACGCCGTGGCACGCGATGCGTTTTCTCACCCCGAAAgg > 8:191432/1‑149 (MQ=255) tggAGAAACTCGATAAGTTGATCGACTACCCGCGTGCGTTTGGTATTGATGACGAGGCGCTGCGCACCATGCAGTCGGTCGGCCTGGTCGATGATGTTCTGCCGCACACTACGCCGTGGCACGCGATGCGTTTTCTCACCCCGAAAGGc < 4:161587/149‑1 (MQ=255) gagaAACTCGATAAGTTGATCGACTACCCGCGTGCGATTGGTATTGATGACGAGGCGCTGCGCACCATGCAGTCGGTCGGCCTGGTCGATGATGTTCTGCCGCACACTACGCCGTGGCACGCGATGCGTTTTCTCACCCCGAAAGGCCg > 3:320203/1‑149 (MQ=255) aCTCGATAAGTTGATCGACTACCCGCGTGCGATTGGTATTGATGACGAGGCGCTGCGCACCATGCAGTCGGTCGGCCTGGTCGATGATGTTCTGCCGCACACTACGCCGTGGCACGCGATGCGTTTTCTCACCCCGAAAGGcc > 4:226718/1‑143 (MQ=255) aCTCGATAAGTTGATCGACTACCCGCGTGCGATTGGTATTGATGACGAGGCGCTGCGCACCATGCAGTCGGTCGGCCTGGTCGATGATGTTCTGCCGCACACTACGCCGTGGCACGCGATGCGTTTTCTCACCCCGAAAGGcc < 3:226718/143‑1 (MQ=255) gATAAGTTGATCGACTACCCGCGTGCGATTGGTATTGATGACGAGGCGCTGCGCACCATGCAGTCGGTCGGCCTGGTCGATGATGTTCTGCCGCACACTACGCCGTGGCACGCGATGCGTTTTCTCACCCCGAAAGGCCGCTGTTTTGc > 2:391837/1‑149 (MQ=255) gATAAGTTGATCGACTACCCGCGTGCGATTGGTATTGATGACGAGGCGCTGCGCACCATGCAGTCGGTCGGCCTGGTCGATGATGTTCTGCCGCACACTACGCCGTGGCACGCGATGCGTTTTCTCACCCCGAAAGGCCGCTGTTTTGc > 7:202803/1‑149 (MQ=255) gTTGATCGACTACCCGCGTGCGATTGGTATTGATGACGAGGCGCTGCGCACCATGCAGTCGGTCGGCCTGGTCGATGATGTTCTGCCGCACACTACGCCGTGGCACGCGATGCGTTTTCTCACCCCGAAAGGCCGCTGTTTTGCTGata > 7:308043/1‑149 (MQ=255) ttGATCGACTACCCGCGTGCGATTGGTATTGATGCCGAGGCGCTGCGCCCCATGCAGTCGGTCGGCCTGGTCGATGATGTTCTGCCGCACACTACGCCGTGGCACGCGATGCGTTTTCTCACCCCGAAAGGCCGCTGTTTTGCTGatat > 3:306286/1‑149 (MQ=255) aTCGACTACCCGCGTGCGATTGGTATTGATGACGAGGCGCTGCGCACCATGCTGTCGGTCGGCCTGGTCGATGATGTTCTGCCGCACACTACGCCGTGGCACGCGATGCGTTTTCTCACCCCGAAAGGCCGCTGTTTTGCTGATAtt > 8:123289/1‑147 (MQ=255) aTCGACTACCCGCGTGCGATTGGTATTGATGACGAGGCGCTGCGCACCATGCTGTCGGTCGGCCTGGTCGATGATGTTCTGCCGCACACTACGCCGTGGCACGCGATGCGTTTTCTCACCCCGAAAGGCCGCTGTTTTGCTGATAtt > 8:117637/1‑147 (MQ=255) aTCGACTACCCGCGTGCGATTGGTATTGATGACGAGGCGCTGCGCACCATGCTGTCGGTCGGCCTGGTCGATGATGTTCTGCCGCACACTACGCCGTGGCACGCGATGCGTTTTCTCACCCCGAAAGGCCGCTGTTTTGCTGATATTCa < 7:117637/149‑1 (MQ=255) aTCGACTACCCGCGTGCGATTGGTATTGATGACGAGGCGCTGCGCACCATGCTGTCGGTCGGCCTGGTCGATGATGTTCTGCCGCACACTACGCCGTGGCACGCGATGCGTTTTCTCACCCCGAAAGGCCGCTGTTTTGCTGATATTCa < 7:123289/149‑1 (MQ=255) aTCGACTACCCGCGTGCGATTGGTATTGATGACGAGGCGCTGCGCACCATGCAGTCGGTCGGCCTGGTCGATGATGTTCTGCCGCACACTACGCCGTGGCACGCGATGCGTTTTCTCACCCCGAAAGGCCGCTGTTTTGCTGATATTCa < 3:237050/149‑1 (MQ=255) tCGACTACCCGCGTGCGATTGGTATTGATGACGAGGCGCTGCGCACCATGCAGTCGGTCGGCCTGGTCGATGATGTTCTGCCGCACACTACGCCGTGGCACGCGATGCGTTTTCTCACCCCGAAAGGCCGCTGTTTTGCTGATATTCAg < 7:139474/149‑1 (MQ=255) gACTACCCGCGTGCGATTGGTATTGATGACGAGGCGCTGCGCACCATGCAGTCGGTCGGCCTGGTCGATGATGTTCTGCCGCACACTACGCCGTGGCACGCGATGCGTTTTCTCACCCCGAAAGGCCGCTGTTTTGCTGATATTCAGc < 3:261747/148‑1 (MQ=255) gACTACCCGCGTGCGATTGGTATTGATGACGAGGCGCTGCGCACCATGCAGTCGGTCGGCCTGGTCGATGATGTTCTGCCGCACACTACGCCGTGGCACGCGATGCGTTTTCTCACCCCGAAAGGCCGCTGTTTTGCTGATATTCAGc < 6:18752/148‑1 (MQ=255) gACTACCCGCGTGCGATTGGTATTGATGACGAGGCGCTGCGCACCATGCAGTCGGTCGGCCTGGTCGAGGATGTTCTGCCGCACCCTACGCCGTGGCACGCGATGCGGTTTCTCACCCCGAAAGGCCGCTGTTTTGCTGATATTCAGcc < 1:276471/149‑1 (MQ=255) aCCCGCGTGCGATTGGTATTGATGACGAGGCGCTGCGCACCATGCAGTCGGTCGGCCTGGTCGATGATGTTCTGCCGCACACTACGCCGTGGCACGCGATGCGTTTTCTCa > 8:109991/1‑111 (MQ=255) aCCCGCGTGCGATTGGTATTGATGACGAGGCGCTGCGCACCATGCAGTCGGTCGGCCTGGTCGATGATGTTCTGCCGCACACTACGCCGTGGCACGCGATGCGTTTTCTCa < 7:109991/111‑1 (MQ=255) cccGCGTGCGATTGGTATTGATGACGAGGCGCTGCGCACCATGCAGTCGGTCGGCCTGGTCGATGATGTTCTGCCGCACACTACGCCGTGGCACGCGATGCGTTTTCTCACCCCGAAAGGCCGCTGTTTTGCTGATAtt < 4:267755/139‑1 (MQ=255) cccGCGTGCGATTGGTATTGATGACGAGGCGCTGCGCACCATGCAGTCGGTCGGCCTGGTCGATGATGTTCTGCCGCACACTACGCCGTGGCACGCGATGCGTTTTCTCACCCCGAAAGGCCGCTGTTTTGCTGATAtt > 3:267755/1‑139 (MQ=255) cccGCGTGCGATTGGTATTGATGACGAGGCGCTGCGCACCATGCAGTCGGTCGGCCTGGTCGATGATGTTCTGCCGCACACTACGCCGTGGCACGCGATGCGTTTTCTCACCCCGAAAGGCCGCTGTTTTGCTGATATTCAGCCAAt < 7:191432/147‑1 (MQ=255) ccGCGTGCGATTGGTATTGATGACGAGGCGCTGCGCACCATGCAGTCGGTCGGCCTGGTCGATGATGTTCTGCCGCACACTACGCCGTGGCACGCGATGCGTTTTCTCACCCCGAAAGGCCGCTGTTTTGCTGATATTCAGCCAATGAc < 5:325831/149‑1 (MQ=255) ccGCGTGCGATTGGTATTGATGACGAGGCGCTGCGCACCATGCAGTCGGTCGGCCTGGTCGATGATGTTCTGCCGCACACTACGCCGTGGCACGCGATGCGTTTTCTCACCCCGAAAGGCCGCTGTTTTGCTGATATTCAGCCAATGAc < 4:42171/149‑1 (MQ=255) tGGTATTGATGACGAGGCGCTGCGCACCATGCAGTCGGTCGGCCTGGTCGATGATGTTCTGCCGCACACTACGCCGTGGCACGCGATGCGTTTTCTCACCCCGAAAGGCCGCTGTTTTGCTGATATTCAGCCAATGACCGATGAAttt < 8:200422/148‑1 (MQ=255) gTATTGATGACGAGGCGCTGCGCACCATGCAGTCGGTCGGCCTGGTCGATGATGTTCTGCCGCACACTACGCCGTGGCACGCGATGCGTTTTCTCACCCCGAAAGGCCGCTGTTTTGCTGATATTCAGCCAATGACCGATGAATTtgg < 4:320203/148‑1 (MQ=255) atgaCGAGGCGCTGCGCACCATGCAGTCGGTCGGCCTGGTCGATGATGTTCTGCCGCACACTACGCCGTGGCACGCGATGCGTTTTCTCACCCCGAAAGGCCGCTGTTTTGCTGATATTCAGCCAATGACCGATGAATTTGGCTGGCcg > 8:99297/1‑149 (MQ=255) gaCGAGGCGCTGCGCACCATGCAGTCGGTCGGCCTGGTCGATGATGTTCTGCCGCACACTACGCCGTGGCACGCGATGCGTTTTCTCACCCCGAAAGGCCGCTGTTTTGCTGATATTc > 4:258841/1‑118 (MQ=255) gaCGAGGCGCTGCGCACCATGCAGTCGGTCGGCCTGGTCGATGATGTTCTGCCGCACACTACGCCGTGGCACGCGATGCGTTTTCTCACCCCGAAAGGCCGCTGTTTTGCTGATATTc < 3:258841/118‑1 (MQ=255) gaCGAGGCGCTGCGCACCATGCAGTCGGTCGGCCTGGTCGATGATGTTCTGCCGCACACTACGCCGTGGCACGCGATGCGTTTTCTCACCCCGAAAGGCCGCTGTTTTGCTGATATTCAGCCAATGACCGATGAATTTGGCTGGCcgcg > 6:343541/1‑149 (MQ=255) cGAGGCGCTGCGCACCATGCAGTCGGTCGGCCTGGTCGATGATGTTCTGCCGCACACTACGCCGTGGCACGCGATGCGTTTTCTCACCCCGAAAGGCCGCTGTTTTGCTGATATTCAGCCAATGACCGATGAATTTGGCTGGCCGCGcc < 4:26628/149‑1 (MQ=255) gAGGCGCTGCGCACCATGCAGTCGGTCGGCCTGGTCGATGATGTTCTGCCGCACACTACGCCGTGGCACGCGATGCGTTTTCTCACCCCGAGAGGCCGCTGTTTTGCTGATATTCAGCCAATGACCGATGAATTTGGCTGGCCGCGCCg > 8:404096/1‑149 (MQ=255) gAGGCGCTGCGCACCATGCAGTCGGTCGGCCTGGTCGATGATGTTCTGCCGCACACTACGCCGTGGCACGCGATGCGTTTTCTCACCCCGAAAGGCCGCTGTTTTGCTGATATTCAGCCAATGACCGATGAATTTGGCTGGCCGCGCCg > 3:184040/1‑149 (MQ=255) gAGGCGCTGCGCACCAGGCAGTCGGTCGGCCTGGTCGATGATGTTCTGCCGCACACTACGCCGTGGCACGCGATGCGTTTTCTCACCCCGAAAGGCCGCTGTTTTGCTGATATTCAGCCAATGACCGATGAATTTGGCTGGCCGCGCCg > 5:310365/1‑149 (MQ=255) ggCGCTGCGCACCATGCAGTCGGTCGGCCTGGTCGATGATGTTCTGCCGCACACTACGCCGTGGCACGCGATGCGTTTTCTCACCCCGAAAGGCCGCTGTTTTGCTGATATTCAGCCAATGACCGATGAATTTGGCTGGCCGCGCCGt > 5:163873/1‑148 (MQ=255) gcTGCGCACCATGCAGTCGGTCGGCCTGGTCGATGATGTTCTGCCGCACACTACGCCGTGGCACGCGATGCGTTTTCTCACCCCGAAAGGCCGCTGTTTTGCTGATATTCAGCCAATGACCGATGAATTTGGCTGGCCGCGCCGTAACg > 4:301612/1‑149 (MQ=255) tGCGCACCATGCAGTCGGTCGGCCTGGTCGATGATGTTCTGCCGCACACTACGCCGTGGCACGCGATGCGTTTTCTCACCCCGAAAGGCCGCTGTTTTGCTGATATTCAGCCAATGACCGATGAATTTGGCTGGCCGCGCCGTAACGcc > 8:201522/1‑149 (MQ=255) cgcACCATGCAGTCGGTCGGCCTGGTCGATGATGTTCTGCCGCACACTACGCCGTGGCACGCGATGCGTTTTCTCACCCCGAAAGGCCGCTGTTTTGCTGATATTCAGCCAATGACCGATGAATTTGGCTGGCCGCGCCGTAACGCCtt > 2:310319/1‑149 (MQ=255) cACCATGCAGTCGGTCTGCCTGGTCGATGATGTTCTGCCTCACACTACGCCGTGGCACGCGATGCGTTTTCTCACCCCGAAAGGCAGCTGTTTTGCTGATATTCAGCCAATGACCGATGAATTTGGCTGGCCGCGCCGTAACGCCTTTa < 6:244772/149‑1 (MQ=255) cacgCAGTCGGTCGGCCTGGTCGATGATGTTCTGCCGCACACTACGCCGTGGCACGCGATGCGTTTTCTCACCCCGAAAGGCCGCTGTTTTGCTGATATTCAGCCAATGACCGATGAATTTGGCTGGCCGCGCCGTAACGCCTTTATTc < 6:310365/146‑1 (MQ=255) cATGCAGTCGGTCGGCCTGGTCGATGATGTTCTGCCGCACTCTACGCCGTGGCACGCGATGCGTTTTCTCACCCCGAAAGGCCGCTGTTTTGCTGATATTCAGCCAATGACCGATGAATTTGGCTGGCCGCGCCGTAACGCCTTTAtt > 3:112984/1‑148 (MQ=255) cATGCAGTCGGTCGGCCTGGTCGATGATGTTCTGCCGCACACTACGCCGTGGCACGCGATGCGTTTTCTCACCCCGAAAGGCCGCTGTTTTGCTGATAtt > 2:292025/1‑100 (MQ=255) cATGCAGTCGGTCGGCCTGGTCGATGATGTTCTGCCGCACACTACGCCGTGGCACGCGATGCGTTTTCTCACCCCGAAAGGCCGCTGTTTTGCTGATAtt < 1:292025/100‑1 (MQ=255) aTGCAGTCGGTCGGCCTGGTCGATGATGTTCTGCCGCACACTACGCCGTGGCACGCGATGCGTTTTCTCACCCCGAAAGGCCGCTGTTTTGCTGATATTCAGCCAATGACCGATGAATTTGGCTGGCCGCGCCGTAACGCCTTTAtt > 4:357869/1‑147 (MQ=255) cAGTCGGTCGGCCTGGTCGATGATGTTCTGCCGCACACTACGCCGTGGCACGCGATGCGTTTTCTCACCCCGAAAGGCCGCTGTTTTGCTGATATTCAGCCAATGACCGATGAATTTGGCTGGCCGCGCCGTAACGCCTTTATTCAGc < 8:268470/148‑1 (MQ=255) | GCGATCGCTGGTGCCGGCCCGGTTGGGCTGATGATGGCGAACTATCTCGGCCAGATGGGCATTGACGTGCTGGTGGTGGAGAAACTCGATAAGTTGATCGACTACCCGCGTGCGATTGGTATTGATGACGAGGCGCTGCGCACCATGCAGTCGGTCGGCCTGGTCGATGATGTTCTGCCGCACACTACGCCGTGGCACGCGATGCGTTTTCTCACCCCGAAAGGCCGCTGTTTTGCTGATATTCAGCCAATGACCGATGAATTTGGCTGGCCGCGCCGTAACGCCTTTATTCAGC > NC_000913/368665‑368959 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |