Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 1,769,224 | G→A | 5.2% | V51I (GTA→ATA) | ydiK → | UPF0118 family inner membrane protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 1,769,224 | 0 | G | A | 5.2% | 250.3 / 2.3 | 77 | V51I (GTA→ATA) | ydiK | UPF0118 family inner membrane protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (34/38); new base A (2/2); total (36/41) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.49e-01 |
GGTAAATGTTCGTCAGCCCAGGGATGTCGCACAAATTCTGCTTTCGGTGCTGTTTTTAGCCATCATGATTGTGGCATGTCTGTGGATTGTTCAACCCTTTATTCTCGGCTTTGCATGGGCCGGTACGGTGGTTATCGCCACCTGGCCGGTATTGTTACGTTTGCAAAAGATCATGTTTGGCCGCCGCTCTCTCGCCGTTCTGGTGATGACGCTGTTATTAGTGATGGTGTTTATCATCCCTATTGCTTTGCTGGTTAACAGTATCGTCGACGGCAGCGGCCCGCTAATTAAAGC > NC_000913/1769076‑1769369 | ggTAAATGTTCGTCAGCCCAGGGATGTCGCACAAATTCTGCTTTCGGTGCTGTTTTTAGCCATCATGATTGTGGCATGTCTGTGGATTGTTCAACCCTTTATTCTCGGCTTTGCATGGGCCGGTACGGTGGTTATCGCCACCTGGCCgg > 5:112914/1‑149 (MQ=255) gTAAATGTTCGTCAGCCCAGGGATGTCGCACAAATTCTGCTTTCGGTGCTGTTTTTAGCCATCATGATTGTGGCATGTCTGTGGATTGTTCAACCCTTTATTCTCGGCTTTGCATGGGCCGGTACGGTGGTTATCGCCACCTGGCCgg > 8:270765/1‑148 (MQ=255) gTAAATGTTCGTCAGCCCAGGGATGTCGCACAAATTCTGCTTTCGGTGCTGTTTTTAGCCATCATGATTGTGGCATGTCTGTGGATTGTTCAACCCTTTATTCTCGGCTTTGCATGGGCCGGTACGGTGGTTATCGCCACCTGGCCgg > 4:155762/1‑148 (MQ=255) gTAAATGTTCGTCAGCCCAGGGATGTCGCACAAATTCTGCTTTCGGTGCTGTTTTTAGCCATCATGATTGTGGCATGTCTGTGGATTGTTCAACCCTTTATTCTCGGCTTTGCATGGGCCGGTACGGTGGTTATCGCCACCTGGCCGGt > 5:291750/1‑149 (MQ=255) aaTGTTCGTCAGCCCAGGGATGTCGCACAAATTCTGCTTTCGGTGCTGTTTTTAGCCATCATGATTGTGGCATGTCTGTGGATTGTTCAACCCTTTATTCTCGGCTTTGCATGGGCCGGTACGGTGGTTATCGCCACCTGGCCGGTAtt < 8:350632/149‑1 (MQ=255) gTTCGTCAGCCCAGGGATGTCGCACAAATTCTGCTTTCGGTGCTGTTTTTAGCCATCATGATTGTGGCATGTCTGTGGATTGTTCAGCCCTTTATTCTCGGCTTTGCATGGGCCGGTACGGTGGTTATCGCCACCTGGCCGGTATTGt > 3:194144/1‑148 (MQ=255) gTCAGCCCAGGGATGTCGCACAAATTCTGCTTTCGGTGCTGTTTTTAGCCATCATGATTGCGGCATGTCTGTGGATTGTTCAACCCTTTATTCTCGGCTTTGCATGGGCCGGTACGGTGGTTATCGCCACCTGGCCGGTATTGTTACGt < 4:109485/149‑1 (MQ=255) aGCCCAGGGATGTCGCACAAATTCTGCTTTCGGTGCTGTTTTTAGCCATCATGATTGTGGCATGTCTGTGGATTGTTCAACCCTTTATTCTCGGCTTTGCATGGGCCGGTACGGTGGTTATCGCCACCTGGCCGGTATTGTTACGttt < 6:172493/148‑1 (MQ=255) cccAGGGATGTCGCACAAATTCTGCTTTCGGTGCTGTTTTTAGCCATCATGATTGTGGCATGTCTGTGGATTGTTCAACCCTTTATTCTCGGCTTTGCATGGGCCGGTACGGTGGTTATCGCCACCTGGCCGGTATTGTTACGTTTGc > 1:43102/1‑148 (MQ=255) aGGGATGTCGCACAAATTCTGCTTTCGGTGCTGTTTTTAGCCATCATGATTGTGGCATGTCTGTGGATTGTTCAACCCTTTATTCTCGGCTTTGCATGGGCCGGTACGGTGGTTATCGCCACCTGGCCGGTATTGTTACGTTTGCaa > 2:248036/1‑147 (MQ=255) ggATGTCGCACAAATTCTGCTTTCGGTGCTGTTTTTAGCCATCATGATTGTGGCATGTCTGTGGATTGTTCAACCCTTTATTCTCGGCTTTGCATGGGCCGGTACGGTGGTTATCGCCACCTGGCCGGTATTGTTACGTTTTCAAAAGa < 7:94010/149‑1 (MQ=255) ggATGTCGCACAAATTCTGCTTTCGGTGCTGTTTTTAGCCATCATGATTGTGGCATGTCTGTGGATTGTTCAACCCTTTATTCTCGGCTTTGCATGGGCCGGTACGGTGGTTATCGCCACCTGGCCGGTATTGTTACGTTTGCaaaa > 6:170925/1‑147 (MQ=255) aTGTCGCACAAATTCTGCTTTCGGTGCTGTTTTTAGCCATCATGATTGTGGCATGTCTGTGGATTGTTCAACCCTTTATTCTCGGCTTTGCATGGGCCGGTACGGTGGTTATCGCCACCTGGCCGGTATTGTTACGTTTGCAAAAGATc < 7:270765/149‑1 (MQ=255) tGTCGCACAAATTCTGCTTTCGGTGCTGTTTTTAGCCATCATGATTGTGGCATGTCTGTGGATTGTTCAACCCTTTATTCTCGGCTTTGCATGGGCCGGTACGGTGGTTATCGCCACCTGGCCGGTATTGTTACGTTTGCAAAAGATCa > 3:182094/1‑149 (MQ=255) tCGCACAAATTCTGCTTTCGGTGCTGTTTTTAGCCATCATGATTGTGGCATGTCTGTGGATTGTTCAACCCTTTATTCTCGGATTTGCATGGGCCGGTACGGTGGTTATCGCCACCTGGCCGGTATTGTTACGTTTGCAAAAGATCATg < 6:112914/149‑1 (MQ=255) tCGAACAAATTCTGCTTTGGGTGCTGTTTTTTGCCATCTTGATTGTGGCTTGTCTGTGTATTGTTAAACCCTTTATTCTCGGCTTTGCATGGGCCGGTAGGGTGGTTATCGCAACCGGGCCGTTATTTTTAGGTTTGCAAAAGATCAt < 2:43102/148‑1 (MQ=255) cGCACAAATTCTGCTTTCGGTGCTGTTTTTAGCCATCATGATTGTGGCATGTCTGTGGATTGTTCAACCCTTTATTCTCGGCTTTGCATGGGCCGGTACGGTGGTTATCGCCACCTGGCCGGTATTGTTACGTTTGCAAAAGATCATGt < 2:33492/149‑1 (MQ=255) gCACAAATTCTGCTTTCGGTGCTGTTTTTAGCCATCATGATTGTGGCATGTCTGTGGATTGTTCAACCCTTTATTCTCGGCTTTGCATGGGCCGGTACGGTGGTTATCGCCACCTGGCCGGTATTGTTACGTTTGCAAAAGATCATGtt > 2:317453/1‑149 (MQ=255) cacaAATTCTGCTTTCGGTGCTGTTTTTAGCCATCATGATTGTGGCATGTCTGTGGATTGTTCAACCCTTTATTCTCGGCTTTGCATGGGCCGGTACGGTGGTTATCGCCACCTGGCCGGTATTGTTACGTTTGCAAAAGATCATGttt < 5:297074/149‑1 (MQ=255) caATTTCTGCTATCGGTGCTGTTTTTAGCCATCATTATTGTCGCATGTCTGTGGATTGTTCAACCCTTTATTCTCGGCTTTGCATGGGCCGGTACGGTGGTTATCGCCACCTGGCCGGTATTGTTACGTTTGCAAAAGATCATGTTTgg < 2:289049/149‑1 (MQ=255) ggTGCTGTTTTTAGCCATCATGATTGTGGCATGTCTGTGGATTGTTCAACCCTTTATTCTCGGCTTTGCATGGGCCGGTACGGTGGTTATCGCCACCTGGCCGGTATTGTTACGTTTGCAAAAGATCATGTTTGGCCGCCGCtctctc < 6:291750/148‑1 (MQ=255) ggTGCTGTTTTTAGCCATCATGATTGTGGCATGTCTGTGGATTGTTCAACCCTTTATTCTCGGCTTTGCATGGGCCGGTACGGTGGTTATCGCCACCTGGCCGGTATTGTTACGTTTGCAAAAGATCATGTTTGGCCGCCGCTCTCTCg < 3:155762/149‑1 (MQ=255) tGCTGTTTTTAGCCATCATGATTGTGGCATGTCTGTGGATTGTTCAACCCTTTATTCTCGGCTTTGCATGGGCCGGTACGGTGGTTATCGCCACCTGGCCGATATTGTTACGTTTGCAAAAGATCATGTTTGGCCGCCGCTCTCTCGcc > 7:277270/1‑149 (MQ=255) tGCTGTTTTTAGCCATCATGATTGTGGCATGTCTGTGGATTGTTCAACCCTTTATTCTCGGCTTTGCATGGGCAGGTACGGTGGTTATCGCCACCTGGCCGATATTGTTACGTTTGCAAAAGATCATGTTTGGCAGCCGCTCTCTCGcc > 7:273259/1‑149 (MQ=255) tttttAGCCATCATGATTGTGGCATGTCTGTGGATTGTTCAACCCTTTATTCTCGGCTTTGCATGGGCAGTTACGGTGGTTATCGCCACCTGGCCGGTATTGTTAATTTTGCAAAAGATCATGTTTGGCCGCCGCTCTCTCGCCGTTc < 4:152476/148‑1 (MQ=255) ttttAGCCATCATGATTGTGGCATGTCTGTGGATTGTTCAACCCTTTATTCTCGGCTTTGCATGGGCCGGTACGGTGGTTATCGCCACCTGGCCGGTATTGTTACGTTTGCAAAAGATCATGTTTGGCCGCCGCTCTCTCGCCGTTCTg > 1:198324/1‑149 (MQ=255) tttAGCCATCATGATTGTGGCATGTCTGTGGATTGTTCAACCCTTTATTCTCGGCTTTGCATGGGCCGGTACGGTGGTTATCGCCACCTGGCCGGTATTGTTACGTTTGCAAAAGATCATGTTTGGCCGCCGCTCTCTCGCCGTTCTg < 1:317453/148‑1 (MQ=255) ccATCATGATTGTGGCATGTCTGTGGATTGTTCAACCCTTTATTCTCGGCTTTGCATGGGCCGGTACGGTGGTTATCGCCACCTGGCCGGTATTGTTACGTTTGCAAAAGATCATGTTTGGCCGCCGCtctctc > 5:190323/1‑134 (MQ=255) ccATCATGATTGTGGCATGTCTGTGGATTGTTCAACCCTTTATTCTCGGCTTTGCATGGGCCGGTACGGTGGTTATCGCCACCTGGCCGGTATTGTTACGTTTGCAAAAGATCATGTTTGGCCGCCGCtctctc < 6:190323/134‑1 (MQ=255) catcatGATTGTGGCATGTCTGTGGATTGTTCAACCCTTTATTCTCGGCTTTGCATGGGCCGGTACGGTGGTTATCGCCACCTTGCCGGTATTGTTACGTTTGCAAAAGATCATGTTTGGCCGCCGCTCTCTCGCCGTTCTGGtgatg < 6:387948/148‑1 (MQ=255) atcatGATTGTGGGATGTCTGTGGATTGTTCAACCCTTTATTCTCGGCTTTGCATGGGCCGGTACGGTGGTTATCGCCACCTGGCCGGTATTGTTACGTTTGCAAAAGATCATGTTTGGCCGCGGCTCTCTCGCCGTTCTGGtgatgag > 3:217034/1‑148 (MQ=255) atcatGATTGTGGCATGTCTGTGGATTGTTCAACCCTTTATTCTCGGCTTTGCATGGGCCGGTACGGTGGTTATCGCCACCTGGCCGGTATTGTTACGTTTGCaaa < 2:246061/106‑1 (MQ=255) atcatGATTGTGGCATGTCTGTGGATTGTTCAACCCTTTATTCTCGGCTTTGCATGGGCCGGTACGGTGGTTATCGCCACCTGGCCGGTATTGTTACGTTTGCaaa > 1:246061/1‑106 (MQ=255) atcatGATTGTGGCATGTCTGTGGATTGTTCAACCCTTTATTCTCGGCTTTGCATGGGCCGGTACGGTGGTTATCGCCACCTGGCCGGTATTGTTACGTTTGCAAAAGATCATGTTTGGCCGCCGCTCTCTCGCCGTTCTGGTGATGAc > 5:128883/1‑149 (MQ=255) aTTGTGGCATGTCTGTGGATTGTTCAACCCTTTATTCTCGGCTTTGCATGGGCCGGTACGGTGGTTATCGCCACCTGGCCGGTATTGTTACGTTTGCAAAAGATCATGTTTGGCCGCCGCTCTCTCGCCGTTCTGGtga > 8:348875/1‑139 (MQ=255) aTTGTGGCATGTCTGTGGATTGTTCAACCCTTTATTCTCGGCTTTGCATGGGCCGGTACGGTGGTTATCGCCACCTGGCCGGTATTGTTACGTTTGCAAAAGATCATGTTTGGCCGCCGCTCTCTCGCCGTTCTGGtga < 7:348875/139‑1 (MQ=255) aTTGTGGCATGTCTGTGGATTGTTAAACCCTTTATTCTCGGCTTTGCATGGGCCGGTACGGTGGTTATCGCCACCTGGCCGGTATTGTTACGTTTGCAAAAGATCATGTTTGGCCGCCGCTCTCTCGCCGTTCTGGTGATGACGCTGtt > 1:310733/1‑149 (MQ=255) gCATGTCTGTGGATTGTTCAACCCTTTATTCTCGGCTTTGCATGGGCCGGTACGGTGGTTATCGCCACCTGGCCGGTATTGTTACGTTTGCAAAAGATCATGTTTGGCCGCCGCTCTCTCGCCGTTCTGGTGATGACGCTGTTATTAg < 5:354966/148‑1 (MQ=255) aTGTCTGTGGATTGTTCAACCCTTTATTCTCGGCTTTGCATGGGCCGGTACGGTGGTTATCGCCACCTGGCCGGTATTGTTACGTTTGCAAAAGATCATGTTTGGCCGCCGCTCTCTCGCCGTTCTGGTGATGACGCTGTTATTAGTGa > 7:361978/1‑149 (MQ=255) aTGTCTGTGGATTGTTCAACCCTTTATTCTCGGCTTTGCATGGGCCGGTACGGTGGGTATCGCCACCTGGCCGGTATTGTTACGTTTGCAAAAGATCATGTTTGGCCGCCGCTCTCTCGCCGTTCTGGTGATGACGCTGTTATTAGTGa < 1:248036/149‑1 (MQ=255) gTCTGTGGATTGTTCAACCCTTTATTCTCGGCTTTGCATGGGCCGGTACGGTGGTTATCGCCACCTGGCCGGTATTGTTACGTTTGCAAAAGATCATGTTTGGCCGCCGCTCTCTCGCCGTTCTGGTGATGACGCTGTTATTAGTGATg > 3:122612/1‑149 (MQ=255) tCTGGGGATTGTTCAACCCTTTATTCTCGGCTTTGCATGGGCCGGTACGGGGGTTATCGCCACCTGGCCGGTATTGTTACGTTTGCAAAAGATCATGTTTGGCCGCCGCTCTCTCGCCGTTCTGGTGATGACGCTGTTATTAGTGATgg < 6:330542/149‑1 (MQ=255) tgtgGATTGTTCAACCCTTTATTCTCGGCTTTGCATGGGCCGGTACGGTGGTTATCGCCACCTGGCCGGTATTGTTACGTTTGCAAAAGATCATGTTTGGCCGCCGCTCTCTCGCCGTTCTGGTGATGACGCTGTTATTAGTGATGgtg > 2:163559/1‑149 (MQ=255) tgGATTGTTCAACCCTTTATTCTCGGCTTTGCATGGGCCGGTACGGTGGTTATCGCCACCTGGCCGGTATTGTTACGTTTGCAAAAGATCATGTTTGGCCGCCGCTCTCTCGCCGTTCTGGTGATGACGCTGTTATTAGTGATGgtgt < 4:122612/148‑1 (MQ=255) gTTCAACCCTTTATTCTCGGCTTTGCATGGGCCGGTACGGTGGTTATCGCCACCTGGCCGGTATTGTTACGTTTGCAAAAGATCATGTTTGGCCGCCGCTCTCTCGCCGTTCTGGTGATGACGCTGTTATTAGTGATTGTGTTTatca < 5:288308/148‑1 (MQ=255) ttCAACCCTTTATTCTCGGCTTTGCATGGGCCGGTACGGTGGTTATCGCCACCTGGCCGGTATTGTTACGTTTGCAAAAGATCATGTTTGGCCGCCGCTCTCTCGCCGTTCTGGTGATGACGCTGTTATTAGTGATGGTGTTTatcatc > 5:348222/1‑149 (MQ=255) ttCAACCCTTTATTCTCGGCTTTGCATGGGCCGGTACGGTGGTTATCGCCACCTGGCCGGTATTGTTACGTTTGCAAAAGATCATGTTTGGCCGCCGCTCTCTCGCCGTTCTGGTGAGGACGCTGTTATTAGTGATGGTGTTGatcatc > 2:373409/1‑149 (MQ=255) tCAACCCTTTATTCTCGGCTTTGCATGGGCCGGTACGGTGGTTATCGCCACCTGGCCGATATTGTTACGTTTGCAAAAGATCATGTTTGGCCGCCGCTCTCTCGCCGTTCTGGTGATGACGCTGTTATTAGTGATGGTGTTTATCATcc < 8:273259/149‑1 (MQ=255) cAACCCTTTATTCTCGGCTTTGCATGGGCCGGTACGGTGGTTATCGCCACCTGGCCGATATTGTTACGTTTGCAAAAGATCATGTTTGGCCGCCGCTCTCTCGCCGTTCTGGTGATGACGCTGTTATTAGTGATGGTGTTTATCATcc < 8:277270/148‑1 (MQ=255) aaCCCTTTATTCTCGGCTTTGCATGGGCCGGTACGGTGGTTATCGCCACCTGGCCGGTATTGTTACGTTTGCAAAAGCTCATGTTTGGCCGCCGCTCTCTCGCCGTTCTGGTGATGACGCTGTTATTAGTGATGGTGTTTATCATccc > 6:309724/1‑148 (MQ=255) aCCCTTTATTCTCGGCTTTGCATGGGCCGGTACGGTGGTTATCGCCACCTGGCCGGTATTGTTACGTTTGCAAAAGATCATGTTTGGCCGCCGCTCTCTCGCCGTTCTGGTGATGACGCTGTTATTAGTGATGGTGTTTATCATCCCTa < 7:60807/149‑1 (MQ=255) cccTTTATTCTCGGCTTTGCATGGGCCGGTACGGTGGTTATCGCCACCTGGCCGGTATTGTTACGTTTGCAAAAGATCATGTTTGGCCGCCGCTCTCTCGCCGTTCTGGTGATGACGCTGTTATTAGTGATGGTGTTTa < 8:339946/139‑1 (MQ=255) cccTTTATTCTCGGCTTTGCATGGGCCGGTACGGTGGTTATCGCCACCTGGCCGGTATTGTTACGTTTGCAAAAGATCATGTTTGGCCGCCGCTCTCTCGCCGTTCTGGTGATGACGCTGTTATTAGTGATGGTGTTTa > 7:339946/1‑139 (MQ=255) cccTTTATTCGCGGCTTTGCATGGGCCGGTACGGTGGTTATCGCCACCTGGCCGGTATTGTTACGTTTGCAAAAGATCATGTTTGGCCGCCGCTCTCTCGc < 1:250394/101‑1 (MQ=255) cccTTTATTCGCGGCTTTGCATGGGCCGGTACGGTGGTTATCGCCACCTGGCCGGTATTGTTACGTTTGCAAAAGATCATGTTTGGCCGCCGCTCTCTCGc > 2:250394/1‑101 (MQ=255) ccTTTATTCTCGGCTTTGCATGGGCCGGTACGGTGGTTATCGCCACCTGGCCGGTATTGTTACGTTTGCAAAAGATCATGTTTGGCCGCCGCTCTCTCGCCGTTCTGGTGATGACGCTGTTATTAGTGATGGTGTTTATCATCCCTAtt > 8:155214/1‑149 (MQ=255) cTTTATTCTCGGCTTTGCATGGGCCGGTACGGTGGTTATCGCCACCTGGCCGGTATTGTTACGTTTGCAAAAGATCATGTTTGGCCGCCGCTCTCTCGCCGTTCTGGTGATGACGCTGTTATTAGTGATGGTGTTTATCATCCCTAttg > 2:218301/1‑149 (MQ=255) cTTTATTCTCGGCTTTGCATGGGCCGGTACGGTGGTTATCGCCACCTGGCCGGTATTGTTACGTTTGCAAAAGATCATGTTTGGCCGCCGCTCTCTCGCCGTTCTGGTGATGACGCTGTTATTAGTGATGGTGTTTATCATCCCTAttg > 2:175792/1‑149 (MQ=255) tttATTCTCGGCTTTGCATGGGCCGGTACGGTGGTTATCGCCACCTGGCCGGTATTGTTACGTTTGCAAAAGATCATGTTTGGCCGCCGCTCTCTCGCCGTTCTGGTGATGACGCTGTTATTAGTGATGGTGTTTATCATCCCTAttgc > 6:84931/1‑149 (MQ=255) ttCTCGGCTTTGCATGGGCCGGTACGGTGGTTATCGCCACCTGGCCGGTATTGTTACGTTTGCAAAAGATCATGTTTGGCCGCCGCTCTCTCGCCGTTCTGGTGATGACGCTGTTATTAGTGATGGTGTTTATCATCCCTAttgctttg > 3:6426/1‑149 (MQ=255) tctcGGCTTTGCATGGGCCGGTACGGTGGTTATCGCCACCTGGCCGGTATTGTTACGTTTGCAAAAGATCATGTTTGGCCGCCGCTCTCTCGCCGTTCTGGTGATGACGCTGTTATTAGTGATGGTGTTTATCATCCCTAttgctttgc > 1:323127/1‑149 (MQ=255) tctcGGCTTTGCATGGGCCGGTACGGTGGTTATCGCCACCTGGCCGGTATTGTTACGTTTGCAAAAGATCATGTTTGGCCGCCGCTCTCTCGCCGTTCTGGTGATGACGCTGTTATTAGTGATGGTGTTTATCATCCCTAttg < 7:203652/143‑1 (MQ=255) tctcGGCTTTGCATGGGCCGGTACGGTGGTTATCGCCACCTGGCCGGTATTGTTACGTTTGCAAAAGATCATGTTTGGCCGCCGCTCTCTCGCCGTTCTGGTGATGACGCTGTTATTAGTGATGGTGTTTATCATCCCTAttg > 8:203652/1‑143 (MQ=255) ctcGGCTTTGCATGGGCCGGTACGGTGGTTATCGCCACCTGGCCGGTATTGTTACGTTTGCAAAAGATCAAGTTTGGCCGCCGCTCTCTCGCCGTTCTGGTGATGACGCTGTTATTAGTGATGGTGTTTATCATCCCTAttgctttgct > 1:305532/1‑149 (MQ=255) tcGGCTTTGCATGGGCCGGTACGGTGGTTATCGCCACCTGGCCGGTATTGTTACGTTTGCAAAAGATCATGTTTGGCCGCCGCTCTCTCGCCGTTGTGGTGATGACGCTGTTATTAGTGATGGTGTTTATCATCCCTATTGCTTTGCTg > 5:109039/1‑149 (MQ=255) tcGGCTTTGCATGGGCCGGTACGGTGGTTATCGCCACCTGGCCGGTATTGTTACGTTTGCAAAAGATCATGTTTGGCCGCCGCTCTCTCGCCGTTCTGGTGATGACGCTGTTATTAGTGATGGTGTTTATCATCCCTATTGCTTTGCTg > 3:283556/1‑149 (MQ=255) ggCTTTGCATGGGCCGGTACGGTGGTTATCGCCACCTGGCCGGTATTGTTACGTTTGCAAAAGATCATGTTTGGCCGCCGCTCTCTCGCCGTTCTGGTGATGACGCTGTTATTAGTGATGGTGTTTATCATCCCTATTGCTTTGCTGGt > 7:200376/1‑149 (MQ=255) gCATGGGCCGGTACGGTGGTTATCGCCACCTGGCCGGTATTGTTACGTTTGCAAAAGATCATGTTTGGCCGCCGCTCTCTCGCCGTTCTGGTGATGACGCTGTTATTAGTGATGGTGTTTATCATCCCTATTGCTTTGCTGGTTAACa < 2:198324/148‑1 (MQ=255) gCAGGGGCCGGTACGGTGGGTATCGCCACCTGGCCGGTAGTGTTACGTTTGCAAAAGATCATGTTTGGCCGCCGCTCTCTCGCCGTTCTGGTGATGACGCTGTTATTTGTGATGGTGTTTATCATCCCTATTGCTTTGCTGGTTAACa < 1:304856/148‑1 (MQ=255) ggCCGGTACGGTGGTTATCGCCACCTGGCCGGTATTGTTACGTTTGCAAAAGATCATGTTTGGCCGCCGCTCTCTCGCCGTTCTGGTGATGACGCTGTTATTAGTGATGGTGTTTATCATCCCTATTGCTTTGCTGGTTAACAGTAtc < 7:324983/148‑1 (MQ=255) gTACGGTGGTTATCGCCACCTGGCCGGTATTGTTACGTTTGCAAAAGATCATGTTTGGCCGCCGCTCTCTCGCCGTTCTGGTGATGACGCTGTTATTAGTGATGGTGTTTATCATCCCTATTGCTTTGCTGGTTAACAGTATCGTCGAc > 7:220950/1‑149 (MQ=255) ggtggtTATCGCCACCTGGCCGGTATTGTTACGTTTGCAAAAGATCATGTTTGGCCGCCGCTCTCTCGCCGTTCTGGTGATGACGCTGTTATTAGTGATGGTGTTTa < 5:163297/107‑1 (MQ=255) gtTATCGCCACCTGGCCGGTATTGTTACGTTTGCAAAAGATCATGTTTGGCCGCCGCTCTCTCGCCGTTCTGGTGATGACGCTGTTATTAGTGATGGTGTTTATCATCCCTATTGCTTTGCTGGTTAACAGTATCGTCGACGGCAGCg < 7:155214/148‑1 (MQ=255) tCGCCACCTGGCCGGTATTGTTACGTTTGCAAAAGATCATGTTTGGCCGCCGCTCTCTCGCCGTTCTGGTGATGACGCTGTTATTAGTGATGGTGTTTATCATCCCTATTGCTTTGCTGGTTAACAGTATCGTCGACGGCAGCGGccc < 4:194144/148‑1 (MQ=255) cACCTGGCCGGTATTGTTACGTTTGCAAAAGATCATGTTTGGCCGCCGCTCTCTCGCCGTTCTGGTGATGACGCTGTTATTAGTGATGGTGTTTATCATCCCTATTGCTTTGCTGGTTAACAGTATCGTCGACGGCAGCGGCCCGCTaa < 6:348222/149‑1 (MQ=255) aCCTGGCCGGTATTGTTACGTTTGCAAAAGATCATGTTTGGCCGCCGCTCTCTCGCCGTTCTGGTGATGACGCTGTTATTAGTGATGGTGTTTATCATCCCTATTGCTTTGCTGGTTAACAGTATCGTCGACGGCAGCGGCCCGCTAAt < 8:220950/149‑1 (MQ=255) ccTGGCCGGTATTGTTACGTTTGCAAAAGATCATGTTTGGCCGCCGCTCTCTCGCCGTTCTGGTGATGACGCTGTTATTAGTGATGGTGTTTATCATCCCTATTGCTTTGCTGGTTAACAGTATCGTCGACGGCAGCGGCCCGCTAAtt < 1:218301/149‑1 (MQ=255) gCCGGTATTGTTACGTTTGCAAAAGATCATGTTTGGCCGCCGCTCTCTCGCCGTTCTGGTGATGACGCTGTTATTAGTGATGGTGTTTATCATCCCTATTGCTTTGCTGGTTAACAGTATCGTCGACGGCAGCGGCCCGCTAATTaa < 4:182094/147‑1 (MQ=255) gCCGGTATTGTTACGTTTGCAAAAGATCATGTTTGGCCGCCGCTCTCTCGCCGTTCTGGTGATGACGCTGTTATTAGTGATGGTGTTTATCATCCCTATTGCTTTGCTGGTTAACAGTATCGTCGACGGCAGCGGCCCGCTAATTAAAg < 6:128883/149‑1 (MQ=255) ccGGTATTGTTACGTTTGCAAAAGATCATGTTTGGCCGCCGCTCTCTCGCCGTTCTGGTGATGACGCTGTTATTAGTGATGGTGTTTATCATCCCTATTGCTTTGCTGGTTAACAGTATCGTCGACGGCAGCGGCCCGCTAATTAAAGc < 4:6426/149‑1 (MQ=255) | GGTAAATGTTCGTCAGCCCAGGGATGTCGCACAAATTCTGCTTTCGGTGCTGTTTTTAGCCATCATGATTGTGGCATGTCTGTGGATTGTTCAACCCTTTATTCTCGGCTTTGCATGGGCCGGTACGGTGGTTATCGCCACCTGGCCGGTATTGTTACGTTTGCAAAAGATCATGTTTGGCCGCCGCTCTCTCGCCGTTCTGGTGATGACGCTGTTATTAGTGATGGTGTTTATCATCCCTATTGCTTTGCTGGTTAACAGTATCGTCGACGGCAGCGGCCCGCTAATTAAAGC > NC_000913/1769076‑1769369 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |