| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,044,390 | (T)6→5 | coding (192/1431 nt) | yihF → | DUF945 family protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,044,385 | 0 | T | . | 100.0% | 657.0 / NA | 142 | coding (187/1431 nt) | yihF | DUF945 family protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base . (71/71); total (71/71) | |||||||||||
Only 100 of 153 total aligned reads displayed.
GCCGTAATCTGGGGTGGTGGCACATGGTACACAGGTACGCAAATTCAGCCTGGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTACGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTCGATAACGGTGCACCCGATCTCAATATCAAGCCAGGCCAGAAAGTTGTATTTGATGTGGATGTTGAGCACGGTCCGTTGCCCATCACAATGTTAATGCATGGTAATGTCA > NC_000913/4044238‑4044529 | gCCGTAATCTGGGGTGGTGGCACATGGTACACAGGTACGCAAATTCAGCCTGGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTACGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCtt > 2:569011/1‑149 (MQ=255) ccGTAATCTGGGGTGGTGGCACATGGTACACAGGTACGCAAATTCAGCCTGGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTACGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCtt < 4:50762/148‑1 (MQ=255) cGTAATCTGGGGTGGTGGCACATGGTACACAGGTACGCAAATTCAGCCTGGTGTCGAAAAATTTATTTAAGATTTTATCGATGCTAAAATGAAAGGTGAACATGCCTACGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGTCAACGGCttgt > 4:500863/1‑147 (MQ=255) gTAATCTGGGGTGGTGGCACATGGTACACAGGTACGCAAATTCAGCCTGGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTACGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCttttt < 3:289972/149‑1 (MQ=255) gggTGGTGGCACATGGTACACAGGTACGCAAATTCAGCCTGGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTACGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGC‑TTTTTAATTccc < 1:58152/148‑1 (MQ=255) gggTGGTGGCACATGGTACACAGGTACGCAAATTCAGCCTGGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTACGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGC‑TTTTTAATTCCCg < 8:582628/149‑1 (MQ=255) gggTGGCGGCACATGGTACACAGGTACGCAAATTCAGCCTGGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTACGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCtttttaatt < 1:562818/145‑5 (MQ=255) ggtggtGGCACATGGTACACAGGTACGCAAATTCAGCCTGGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTACGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGC‑TTTTTAATTCCCGt > 3:534926/1‑149 (MQ=255) gCACATGGTACACAGGTACGCAAATTCAGCCTGGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTACGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGC‑TTTTTAATTCCCGTTTTcaaa > 1:595363/1‑149 (MQ=255) cacaTGGTACACAGGTACGCAAATTCAGCCTGGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTACGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGC‑TTTTTAATTCCCGTTTTcaaat < 6:324860/149‑1 (MQ=255) tcaTGGTACACAGGTACGCAAATTCAGCCTGGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTATAAAGAAAGGTGAACATGCCTACGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGC‑TTTTTAATTCCCGTTTTcaaatg < 5:588012/148‑1 (MQ=255) acaTGGTACACAGGTACGCAAATTCAGCCTGGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACTATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTACGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGC‑TTTTTAATTccc < 1:190671/138‑1 (MQ=255) acaTGGTACACAGGTACGCAAATTCAGCCTGGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTACGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGC‑TTTTTAATTccc > 2:190671/1‑138 (MQ=255) acaTGGTACACAGGTACGCAAATTCAGCCTGGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTACGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGC‑TTTTTAATTCCCGttt < 4:327293/142‑1 (MQ=255) acaTGGTACACAGGTACGCAAATTCAGCCTGGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTACGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGC‑TTTTTAATTCCCGTTTTcaaatg < 1:284672/149‑1 (MQ=255) aTGGTACACAGGTACGCAAATTCAGCCTGGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACAAGCCTACGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAACGC‑TTTTTAATTCACGATTTcaaatgca > 6:588012/1‑149 (MQ=255) tGGTACACAGGTACGCAAATTCAGCCTGGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTACGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGC‑TTTTTAATTCCCGTTTTcaaatgcaa < 3:210846/149‑1 (MQ=255) ggTACACAGGTACGCAAATTCAGCCTGGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTACGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGC‑TTTTTAATTCCCGTTTTcaaatgcaaa > 7:92257/1‑149 (MQ=255) tACACAGGTACGCAAATTCAGCCTGGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTACGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGAAAAAGGC‑TTTTTAATTACCGTTTTcaaatgcaaat > 6:174016/1‑148 (MQ=255) gCAAATTCAGCCTGGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGCTGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTACGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGC‑TTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTCGATaa > 1:100395/1‑149 (MQ=255) gCAAATTCAGCCTGGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTACGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCtttt < 5:230402/113‑1 (MQ=255) gCAAATTCAGCCTGGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTACGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCtttt > 6:230402/1‑113 (MQ=255) gCAAATTCAGCCTGGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTACGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGC‑TTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTCGAtta > 8:458927/1‑147 (MQ=255) aaaTTCAGCCTGGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTATGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGC‑TTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTCGATAACg > 4:275188/1‑149 (MQ=255) tCAGCCTGGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTACGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGC‑TTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTCGATAACGGTg > 4:181818/1‑148 (MQ=255) aGCCTGGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTACGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGC‑TTTTTAATTCCCGTTTTcaaatgcaaat > 1:284446/1‑129 (MQ=255) aGCCTGGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTACGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGC‑TTTTTAATTCCCGTTTTcaaatgcaaat < 2:284446/129‑1 (MQ=255) aGCCTGGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTACGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGC‑TTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTCGATAACGGTg < 2:442052/146‑1 (MQ=255) aGCCTGGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTACGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGC‑TTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTCGATAACGGTg > 1:442052/1‑146 (MQ=255) tgtCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTACGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGC‑TTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTCGATAACGGTGCACCCGAtct < 3:500863/149‑1 (MQ=255) gtCGAAAAAATTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAATAAAGGTGAACATGCCTACTATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGC‑TTTTTAATTCACCTTTTCAAATCCAAATGACATTCGATAACGGTGCACCCGAact > 8:568068/1‑148 (MQ=255) tCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTACGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCtttttaatt < 6:311369/101‑5 (MQ=255) tCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTACGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCtttttaatt > 5:311369/1‑97 (MQ=255) tCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTACGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGC‑TTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTCGAt > 5:50724/1‑130 (MQ=255) gAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTACGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGC‑TTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTCGATaa > 2:546765/1‑130 (MQ=255) gAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTACGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGC‑TTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTCGATaa < 1:546765/130‑1 (MQ=255) aaaaTTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTACGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGC‑TTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTCGATAACGGTGCACCCGATCTCAatat < 3:417122/149‑1 (MQ=255) aTTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTACGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGC‑TTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTCGATAACGGTGCACCCGATCTCAATATCaa < 5:227827/149‑1 (MQ=255) ttattaAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTACGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGC‑TTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTCGATAACGGTGCACCCGATCTCAATATCAAgc > 6:290749/1‑149 (MQ=255) ttaAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTACGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGC‑TTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTCGATAACGGTGCACCCGATCTCAATATCAAgcca < 1:569011/148‑1 (MQ=255) aaaGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGCACATGCCTACGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGC‑TTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTCGATAACGGTGCACCCGATCTCAATATCAAgccagg > 7:268350/1‑148 (MQ=255) aaGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTATGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGC‑TTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTCGATAACGGTGCACCCGATCTCAATATCAAgccaggc < 3:275188/148‑1 (MQ=255) aaGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTACGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGC‑TTTTTAATTcc < 1:503965/88‑1 (MQ=255) aaGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTACGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGC‑TTTTTAATTcc > 2:503965/1‑88 (MQ=255) aaGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTACGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGC‑TTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGAAAATGACATTAGATAACGGTGCACACGATCTCAATATCAAgccattc > 3:319496/1‑145 (MQ=255) aGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTACGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGC‑TTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTCGATAACGGTGCACCCGATCTCAATATCAAgccaggcca < 1:21561/149‑1 (MQ=255) ttttAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTACGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGC‑TTTTTAATTCCCGTTTTcaaatgcaaatg > 5:161574/1‑102 (MQ=255) ttttAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTACGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGC‑TTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTc > 4:208390/1‑108 (MQ=255) ttttAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTACGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGC‑TTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTc < 3:208390/108‑1 (MQ=255) ttAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTACGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGC‑TTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTCGATAACGGTGCACCCGATCTCAATATCAAGCCAGGCCAGAAAg > 5:109258/1‑149 (MQ=255) aagATGCTAAAAATAAAGGTTAACATGCCTACGATATGAAGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGC‑TTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTCGATAACGGTGCACCCGATCTCAATATCAAGCCAGGCCAGAAAGTTg < 6:60557/147‑1 (MQ=255) ctaTGCTAAAAACAAAGGTGAACATGCCTACGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGC‑TTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTCGATAACGGTGCACCCGATCTCAATATCAAGCCAGGCCAGAAAGTTGt < 7:484976/147‑1 (MQ=255) aTGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTACGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGC‑TTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTCGATAACGGTGCACCCGATCTCAATATCAAGCCAGGCCAGAAAGTTGTAt > 2:21690/1‑149 (MQ=255) aTGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTACGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGC‑TTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTCGATAACGGTGCACCCGATCTCAATATCAAGCCAGGCCAGAAAGTTGTAt < 3:181818/149‑1 (MQ=255) cTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTACGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGC‑TTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTCGATAACGGTGCACCCGATCTCAATATCAAGCCAGGCCAGAAAGTTGTATTTg < 3:215112/149‑1 (MQ=255) tAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTACGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGC‑TTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTCGATAACGGTGCACCCGATCTCAATATCaa < 8:215728/125‑1 (MQ=255) tAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTACGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGC‑TTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTCGATAACGGTGCACCCGATCTCAATATCAAGCCAGGCCAGaaa > 6:391520/1‑138 (MQ=255) aaaaGAAAGGTGAACATGCCTACGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGC‑TTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTCGATAACGGTGCACCCGATCTCAATATCAAGCCAGGCCAGAAAGTTGTATTTGa < 7:212827/147‑1 (MQ=255) aaaaGAAAGGTGAACATGCCTACGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGC‑TTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTCGATAACGGTGCACCCGATCTCAATATCAAGCCAGGCCAGAAAGTTGTATTTGa < 2:100395/147‑1 (MQ=255) aaaaGAAAGGTGAACATGCCTACGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGC‑TTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTCGATAACGGTGCACCCGATCTCAATATCAAGCCAGGCCAGAAAGTTGTATTAGAtg > 1:14069/1‑149 (MQ=255) aagaaagGTGAACATGCCTACGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGC‑TTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTCGATAACGGTGCACCCGATCTCAATATCAAgc > 7:605451/1‑123 (MQ=255) agaaagGTGAACATGCCTACGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGC‑TTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTCGATAACGGTGCACCCGATCTCAATATCAAGCCAGGCCAGAAAGTTGTATTTGAtgtg > 3:223649/1‑148 (MQ=255) agGTGAACATGCCTACGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGC‑TTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTCGATAACGGTGCACCCGATCTCAATATCAAGCCAGGCCAGAAAGTTGTATTTGATGTGGATGt > 8:543874/1‑149 (MQ=255) ggTGAACATGCCTACGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGC‑TTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTCGATAACGGTGCACCCGATCTCAATATCAAGCCAGGCCAGAAAGTTGTATTTGATGTGGATGtt < 3:502262/149‑1 (MQ=255) aCATGCCTACGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGC‑TTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTCGATAACGGTGCACCCGATCTCAat < 5:390477/105‑1 (MQ=255) cATGCCTACGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGC‑TTTTTAATTCCCGtttt > 8:220532/1‑62 (MQ=255) aTGCCTACGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGC‑TTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTCGATAACGGTGCACCCGATCTCAATATCAAGCCAGGCCAGAAAGTTGTATTTGATGTGGATGTTGAGCACg < 2:14069/149‑1 (MQ=255) cTACGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGC‑TTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTCGATAACGGTGCACCCGATCTCAATATCAAGCCAGGCCAGAAAGTTGTATTTGATGTgg < 4:269454/133‑1 (MQ=255) cTACGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGC‑TTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTCGATAACGGTGCACCCGATCTCAATATCAAGCCAGGCCAGAAAGTTGTATTTGATGTGGATGTTGAGCACGGTcc > 4:519276/1‑149 (MQ=255) cTACGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGC‑TTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTCGATAACGGTGCACCCGATCTCAATATCAAGCCAGGCCAGAAAGTTGTATTTGATGTGGATGTTGAGCACGGTcc < 4:212359/149‑1 (MQ=255) tACGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGC‑TTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTCGATAACGGTGCACCCGATCTCAATATCAAGCCAGGCCAGAAAg > 5:582455/1‑117 (MQ=255) tACGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGC‑TTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTCGATAACGGTGCACCCGATCTCAATATCAAGCCAGGCCAGAAAGTTGTATTTGATGTGGATGTTGAGCACGGTCCg > 3:379170/1‑149 (MQ=255) cGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGC‑TTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTCGATAACGGTGCACCCGATCTCAATATCAAGCCAGGCCAGAAAGTTGTATTTGATGTGGATGTTGAGCACGGTCCg < 7:568068/147‑1 (MQ=255) atatGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGC‑TTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTCGATAACGGTGCACCCGATCTCAATATCAAGCCAGGCCAGAAAGtt < 5:354812/115‑1 (MQ=255) atatGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGC‑TTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTCGATAACGGTGCACCCGATCTCAATATCAAGCCAGGCCAGAAAGtt > 6:354812/1‑115 (MQ=255) tGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGC‑TTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTCGATAACGGTGCACCCGATCTCAATATCAAGCCAGGCCAGAAAGTTGTATTTGATGTGGATGTTGAGCACGGTCCGTTGccc < 5:290749/148‑1 (MQ=255) aCGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGC‑TTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTCGATAACGGTGCACCCGATCTCAATATCAAGCCAGGCCAGAAAGTTGTATTTGATGTGGATGTTGAGCACGGTCCGTTGCCCATc < 3:519276/149‑1 (MQ=255) cGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGC‑TTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTCGATAACGGTGCACCCGATCTCAATATCAAGCCAGGCCAGAAAGTTGTATTTGAtgt < 8:16885/120‑1 (MQ=255) cGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGC‑TTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTCGATAACGGTGCACCCGATCTCAATATCAAGCCAGGCCAGAAAGTTGTATTTGAtgt > 7:16885/1‑120 (MQ=255) gTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGC‑TTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTCGATAACGGTGCACCCGATCTCAATATCAAGCCAGGCCAGAAAGtt > 7:524828/1‑108 (MQ=255) gTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGC‑TTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTCGATAACGGTGCACCCGATCTCAATATCAAGCCAGGCCAGAAAGTTGTATTTGATGTGGATGTTGAGCACGGTCCGTTGccc < 6:561272/144‑1 (MQ=255) gTTATCAAAATTTTGACAAAGGC‑TTTTTAATTCCCGTTTTCATATGAAAATTACATTCGATAACGGTGCACCCGATCTCAATATCAAGCCAGGCCATAAAGTTGTATTTGATGTGGATGTTGAGCACGGTCCGTTGCCCATCACAATGt < 4:310505/149‑1 (MQ=255) gTTATCAAAATTTTGACAAAGGC‑TTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTCGATAACGGTGCACCCGATCTCAATATCAAGCCAGGCCAGAAAGTTGTATTTGATGTGGATGTTGAGCACGGTCCGTTGCCCATCACAATGt < 2:595363/149‑1 (MQ=255) ttATCAAAATTTTGACAAAGGC‑TTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTCGATAACGGTGCACCCGATCTCAATATCAAGCCAGGCCAGAAAGTTGTATTTGATGTGGATGTTGAGCACGGTCCGTTGCCCATCACAATGt > 6:499207/1‑148 (MQ=255) aTCAAAATTTTGACAAAGGC‑TTTTTAATTCCCGTTTTcaaatgc < 4:107883/44‑1 (MQ=255) aTCAAAATTTTGACAAAGGC‑TTTTTAATTCCCGTTTTcaaatgc > 3:107883/1‑44 (MQ=255) tCATAATTTTGACAATGGC‑TTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCATATGAGATTCGATAACGGTGCACCCGTTCTCAATATGTAGCCAGGCCAGAAAGTTGTATTTGATGTGGATGTTGAGCACGGTCCGTTGCCCATc < 2:38438/138‑1 (MQ=255) tCAAAATTTTGACAAAGGC‑TTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTCGATAACGGTGCACCCGATCTCAATATCAAGCCAGGCCAGAAAGTTGTATTTGa < 4:380570/107‑1 (MQ=255) tCAAAATTTTGACAAAGGC‑TTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTCGATAACGGTGCACCCGATCTCAATATCAAGCCAGGCCAGAAAGTTGTATTTGa > 3:380570/1‑107 (MQ=255) tCAAAATTTTGACAAAGGC‑TTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTCGATAACGGTGCACCCGATCTCAATATCAAGCCAGGCCAGAAAGTTGTATTTGATGTGGATGTTGAGCACGGTCCGTTGCCCATCACAAt < 6:533497/143‑1 (MQ=255) tCAAAATTTTGACAAAGGC‑TTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTCGATAACGGTGCACCCGATCTCAATATCAAGCCAGGCCAGAAAGTTGTATTTGATGTGGATGTTGAGCACGGTCCGTTGCCCATCACAAt > 5:533497/1‑143 (MQ=255) tCAAAATTTTGACAAAGGC‑TTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTCGATAACGGTGCACCCGATCTCAATATCAAGCCAGGCCAGAAAGTTGTATTTGATGTGGATGTTGAGCACGGTCCGTTGCCCATCACAATGTTAAt > 6:184950/1‑149 (MQ=255) tCAAAATTTTGACAAAGGC‑TTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTCGATAACGGTGCACCCGATCTCAATATCAAGCCAGGCCAGAAAGTTGTATTTGATGTGGATGTTGAGCACGGTCCGTTGCCCATCACAATGTTAAt < 6:109258/149‑1 (MQ=255) tCAAAATTTTGACAAAGGC‑TTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTCGATAACGGTGCACCCGATCTCAATATAAAGCAAGGACAGAAAGTTCTAATTGATGTGGATGTTGAGCACGGTCAGTTGCCCATc > 1:38438/1‑138 (MQ=255) aaaaTTTTGACAAAGGC‑TTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTCGATAACGGTGCACCCGATCTCAATATCAAGCCAGGCCAGAAAGTTGTATTTGATGTGGATGtt < 8:81146/115‑1 (MQ=255) ttttGACAAAGGC‑TTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTCGATAACGGTGCACCCGATCTCAATATCAAGCCAGGCCAGAAAGTTGTATTTGATGTGGATGTTGAGCACGGTCCGTTGCCCATCACAATGTTAATGCa < 4:442334/146‑1 (MQ=255) ttttGACAAAGGC‑TTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTCGATAACGGTGCACCCGATCTCAATATCAAGCCAGGCCAGAAAGTTGTATTTGATGTGGATGTTGAGCACGGTCCGTTGCCCATCACAATGTTAATGCAtag > 3:442334/1‑147 (MQ=255) gACAAAGGC‑TTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTCGATAACGGTGCACCCGATCTCAATATCAAGCCAGGCCAGAAAGTTGTATTTGATGTGGATGTTGAGCACGGTCCGTTGCCCATCACAATGTTAATGCATGGTAAt > 7:194829/1‑149 (MQ=255) aaaGGC‑TTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTCGATAACGGTGCACCCGATCTCAATATCAAGCCAGGCCAGAAAGTTGTATTTGATGTGGATGTTGAGCACGGTCCGTTGCCCATCACAATGTTAATGCATGGTAATGt > 7:294967/1‑148 (MQ=255) aaGGC‑TTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTCGATAACGGTGCACCCGATCTCAATATCAAGCCAGGCCAGAAAGTTGTATTTGATGTGGATGTTGAGCACGGTCCGTTGCCCATCACAATGTTAATGCATGGTAATGTCa > 6:229996/1‑149 (MQ=255) | GCCGTAATCTGGGGTGGTGGCACATGGTACACAGGTACGCAAATTCAGCCTGGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTACGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTCGATAACGGTGCACCCGATCTCAATATCAAGCCAGGCCAGAAAGTTGTATTTGATGTGGATGTTGAGCACGGTCCGTTGCCCATCACAATGTTAATGCATGGTAATGTCA > NC_000913/4044238‑4044529 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |