New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 3802387 = | 309 (2.340) | 7 (0.070) | 7/208 | 10.8 | 2.7% | coding (672/1020 nt) | waaO | UDP‑D‑galactose:(glucosyl)lipopolysaccharide‑ alpha‑1,3‑D‑galactosyltransferase |
? | NC_000913 | 3802413 = | 249 (2.360) | coding (646/1020 nt) | waaO | UDP‑D‑galactose:(glucosyl)lipopolysaccharide‑ alpha‑1,3‑D‑galactosyltransferase | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 251 total aligned reads displayed.
TGGATAAAAATAGTATCGTTGGTTACTGGGTTTATAAAGCTTTCTTTGAGTTGATAATTTAAGCTGAACTGGGTGTTATATTTAATATCAGCGAAAATAAGTTTATCCGCCAGCAACATATTTAACACATCCTGATCAGGATGTGTTA‑TTTTTTTGATTATTTCTGGCTCATTTAGCATTGCAATAGCTCGTGCAGAAACCTGCTGAGCCGCCCATTGGGCAGTATTAATCAATAAAAAACCGGAGTTAAAGTAACCTTTAGCAATTC > NC_000913/3802265‑3802532 | gATAAAAATAGTATCGTTGGTTCCGGGGTTTATAAAGCTTTCTTTGAGTTGATAATTTAAGCTGAACTGGGTGTTATATTTAATATCAGCGAAAATAAGATTATCCGCCAGCAACATATTTAACACATCCTGAGCAGGATGTGTTA‑tt < 3:426564/148‑1 (MQ=255) aaaaTAGTATCGTTGGTTACTGGGTTTATAAAGCTTTCTTTGAGTTGATAATTTAAGCTGAACTGGGTGTTATATTTAATATCAGCGAAAATAAGTTTATCCGCCAGCAACATATTTAACACATCCTGATCAGGATGTGTTA‑ttttttt < 6:117790/149‑1 (MQ=255) aaaaTAGTATCGTTGGTTACTGGGTTTATAAAGCTTTCTTTGAGTTGATAATTTAAGCTGAACTGGGTGTTATATTTAATATCAGCGAAAATAAGTTTATCCGCCAGCAACATATTTAACACATCCTGATCAGGATGTGTTA‑ttttttt < 8:376979/149‑1 (MQ=255) aaaaTAGTATCGTTGGTTACTGGGTTTATAAAGCTTTCTTTGAGTTGATAATTTAAGCTGAACTGGGTGTTATATTTAATATCAGCGAAAATAAGTTTATCCGCCAGCAACATATTTAACACATCCTGATCAGGATGTGTTA‑ttttttt < 1:311912/149‑1 (MQ=255) aaaTAGTATCGTTGGTTACTGGGTTTATAAAGCTTTCTTTGAGTTGATAATTTAAGCTGAACTGGGTGTTATATTTAATATCAGCGAAAATAAGTTTATCCGCCAGCAACATATTTAACACATCCTGATCAGGATGTGTTA‑ttttttt > 3:471003/1‑148 (MQ=255) aaaTAGTATCGTTGGTTACTGGGTTTATAAAGCTTTCTTTGAGTTGATAATTTAAGCTGAACTGGGTGTTATATTTAATATCAGCGAAAATAAGTTTATCCGCCAGCAACATATTTAACACATCCTGATCAGGATGTGTTA‑ttttttt > 4:528240/1‑148 (MQ=255) aaaTAGTATCGTTGGTTACTGGGTTTATAAAGCTTTCTTTGAGTTGATAATTTAAGCTGAACTGGGTGTTATATTTAATATCAGCGAAAATAAGTTTATCCGCCAGCAACATATTTAACACATCCTGATCAGGATGTGTTA‑ttttttt < 8:457346/148‑1 (MQ=255) aaaTAGTATCGTTGGTTACTGGGTTTATAAAGCTTTCTTTGAGTTGATAATTTAAGCTGAACTGGGTGTTATATTTAATATCAGCGAAAATAAGTTTATCCGCCAGCAACATATTTAACACATCCTGATCAGGATGTGTTA‑ttttttt > 5:146316/1‑148 (MQ=255) aTAGTATCGTTGGTTACTGGGTTTATAAAGCTTTCTTTGAGTTGATAATTTAAGCTGAACTGGGTGTTATATTTAATATCAGCGAAAATAAGTTTATCCGCCAGCAACATATTTAACACATCCTGATCAGGATGTGTTA‑TTTTTTTGat > 2:120028/1‑149 (MQ=255) tATCGTTGGTTACTGGGTTTATAAAGCTTTCTTTGAGTTGATAATTTAAGCTGAACTGGGTGTTATATTTAATATCAGCGAAAATAAGTTTATCCGCCAGCAACATATTTAACACATCCTGATCAGGATGTGTTA‑TTTTTTTGattatt > 2:439756/1‑149 (MQ=255) tCGTTGGTTACTGGGTTTATAAAGCTTTCTTTGAGTTGATAATTTAAGCTGAACTGGGTGTTATATTTAATATCAGCGAAAATAAGTTTATCCGCCAGCAACATATTTAACACATCCTGATCAGGATGTGTTA‑tttttt > 7:85747/1‑139 (MQ=255) gTTTGTTACTGGTTTTATAAAGCTTTCTTTGAGTTGATAATTTAAGCTGACCTGGGTGTTATATTTAATATCAGCGAAAATAAGTTTATCCGCCAGCAACATATTTAACACATCCTGATCAGGATGTGTTA‑TTTTTTTGATTATTTCt < 3:341418/148‑1 (MQ=255) gTTGGTTACTGGGTTTATAAAGCTTTCTTTGAGTTGATAATTTAAGCTGAACTGGGTGTTATATTTAATATCAGCGAAAATAAGTTTATCCGCCAGCAACATATTTAACACATCCTGATCAGGATGTGTTA‑TTTTTTTGATTATTTCTg > 1:50188/1‑149 (MQ=255) ttGGTTACTGGGTTTATAAAGCTTTCTTTGAGTTGATAATTTAAGCTGAACTGGGTGTTATATTTAATATCAGCGAAAATAAGTTTATCCGCCAGCAACATATTTAACACATCCTGATCAGGATGTGTTA‑TTTTTTTGATTATTTCTgg < 6:15721/149‑1 (MQ=255) ttGGTTACTGGGTTTATAAAGCTTTCTTTGAGTTGATAATTTAAGCTGAACTGGGTGTTATATTTAATATCAGCGAAAATAAGTTTATCCGCCAGCAACATATTTAACACATCCTGATCAGGATGTGTTA‑TTTTTTTGATTATTTCTgg < 1:439756/149‑1 (MQ=255) ttGGTTACTGGGTTTATAAAGCTTTCTTTGAGTTGATAATTTAAGCTGAACTGGGTGTTATATTTAATATCAGCGAAAATAAGTTTATCCGCCAGCAACATATTTAACACATCCTGATCAGGATGTGTTA‑TTTTTTTGATTATTTCTgg > 4:264325/1‑149 (MQ=255) gTTACTGGGTTTATAAAGCTTTCTTTGAGTTGATAATTTAAGCTGAACTGGGTGTTATATTTAATATCAGCGAAAATAAGTTTATCCGCCAGCAACATATTTAACACATCCTGATCAGGATGTGTTA‑ttttt > 8:282385/1‑132 (MQ=255) cagggTTTATAAAGCTTTCTTTGAGTTGATAATTTAAGCTGAACTGGGTGTTATATTTAATATCAGCGAAAATAAGTTTATCCGCCAGCAACATATTTAACACATCCTGATCAGGATGTGTTA‑TTTTTTTGATTATTTCTGGCTCAtt < 1:467300/146‑1 (MQ=255) cTGGGTGTATAAAGCTTTCTTTGAGTTGATAATTTAAGCTGAACTGGGTGTTATATTTAATATCAGCGAAAATAAGTTTATCCGCCAGCAACATATTTAACACCTCCTGATCAGGATGTGTGA‑TTTTTTTGATTATTGCTGGCTCAtt > 4:343050/1‑148 (MQ=255) tGGGTTTATAAAGCTTTCTTTGAGTTGATAATTTAAGCTGAACTGGGTGTTATATTTAATATCAGCGAAAATAAGTTTATCCGCCAGCAACATATTTAACACATCCTGATCAGGATGTGTTA‑ttttttt < 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taAAGCTTTCTTTGAGTTGATAATTTAAGCTGAACTGGGTGTTATATTTAATATCAGCGAAAATAAGTTTATCCGCCAGCAACATATTTAACACATCCTGATCAGGATGTGTTA‑TTTTTTTGATTATTTCTGGCTCAtt > 5:386041/1‑139 (MQ=255) taAAGCTTTCTTTGAGTTGATAATTTAAGCTGAACTGGGTGTTATATTTAATATCAGCGAAAATAAGTTTATCCGCCAGCAACATATTTAACACATCCTGATCAGGATGTGTTA‑TTTTTTTGATTATTTCTGGCTCATTTAGCATTGc > 4:300548/1‑148 (MQ=255) aaaGCTTTCTTTGAGTTGATAATTTAAGCTGGACTGGGTGTTATATTTAATATCAGCGAAAATAAGTTTATCCGCCAGCAACATATTTAACACATCCTGATCAGGATGTGTTA‑TTTTTTTGATTATTTCTGGCTCATTTAGCATTGCaa > 7:44197/1‑149 (MQ=255) aaaGCTTTCTTTGAGTTGATAATTTAAGCTGAACTGGGTGTTATATTTAATATCAGCGAAAATAAGTTTATCCGCCAGCAACATATTTAACACATCCTGATCAGGATGTGTTA‑ttttttt > 3:91726/1‑120 (MQ=255) aaaGCTTTCTTTGAGTTGATAATTTAAGCTGAACTGGGTGTTATATTTAATATCAGCGAAAATAAGTTTATCCGCCAGCAACATATTTAACACATCCTGATCAGGATGTGTTA‑TTTTTTTGATTATTTc > 7:110859/1‑129 (MQ=255) aaaGCTTTCTTTGAGTTGATAATTTAAGCTGAACTGGGTGTTATATTTAATATCAGCGAAAATAAGTTTATCCGCCAGCAACATATTTAACACATCCTGATCAGGATGTGTTA‑TTTTTTTGATTATTTCTGGCTCATTTAGCATTGCaa > 5:398853/1‑149 (MQ=255) atgCTTTCTTTGAGTTGATAATTTAAGCTGAACTGGGTGTTATATTTAATATCAGCGAAAATAAGTTTATCCGCCAGCAACATATTTAACACATCCTGATCAGGATGTGTTA‑TTTTTTTGATTATTTCTGGCTCATTTAGCATTGCaa < 6:94303/146‑1 (MQ=255) aaGCTTTCTTTGAGTTGATAATTTAAGCTGAACTGTGTGTTATATTTAATATCAGCGAAAATAAGTTTATCCGCCAGCAACATATTTAACACATCCTGATCAGGATGTGTTA‑TTTTTTTGATTATTTCTGGCTCATTTAGCATTGCAAt < 3:103119/149‑1 (MQ=255) aaGCTTTCTTTGAGTTGATAATTTAAGCTGAACTGGGTGTTATATTTAATATCAGCGAAAATAAGTTTATCCGCCAGCAACATATTTAACACATCCTGATCAGGATGTGTTA‑ttttttt > 8:260340/1‑119 (MQ=255) aaGCTTTCTTTGAGTTGATAATTTAAGCTGAACTGGGTGTTATATTTAATATCAGCGAAAATAAGTTTATCCGCCAGCAACATATTTAACACATCCTGATCAGGATGTGTTA‑TTTTTTTGATTATTTCTGGCTCATTTa < 8:616192/139‑1 (MQ=255) aaGCTTTCTTTGAGTTGATAATTTAAGCTGAACTGGGTGTTATATTTAATATCAGCGAAAATAAGTTTATCCGCCAGCAACATATTTAACACATCCTGATCAGGATGTGTTA‑TTTTTTTGATTATTTCTGGCTCATTTAGCATTGCaa > 5:502425/1‑148 (MQ=255) tttctttGAGTTGATAATTTAAGCTGAACTGGGTGTTATATTTAATATCAGCGAAAATAAGTTTATCCGCCAGCAACATATTTAACACATCCTGATCAGGATGTGTTA‑TTTTTTTGATTATTTCTGGCTCATTTAGCAtt > 2:534381/1‑140 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tttAATATCAGCGAAAATAAGTTTATCCGCCAGCAACATATTTAACACATCCTGATCAGGATGTGTTA‑TTTTTTTGATTATTTCTGGCTCATTTAGCATTGCAATAGCTCGTGCAGAAACCTGCTGAACCGCCCATTGGGCAGTATTaa > 7:467974/1‑149 (MQ=255) ttAATATCAGCGAAAATAAGTTTATCCGCCAGCAACATATTTAACACATCCTGATCAGGATGTGTTA‑TTTTTTTGATTATTTCTGGCTCATTTAGCATTGCAATAGCTCGTGCAGAAACCTGCTGAGCCGCCCATTGGGCAGTATTAAt > 1:204587/1‑149 (MQ=255) tAATATCAGCGAAAATAAGTTTATCCGCCAGCAACATATTTAACACATCCTGATCAGGATGTGTTA‑TTTTTTTGATTATTTCTGGCTCATTTAGCATTGTAATAGCTCGTGCAGAAACCTGCTGAGCCGCCCATTGGGCAGTATTAAt < 7:587128/148‑1 (MQ=255) tAATATCAGCGAAAATAAGTTTATCCGCCAGCAACATATTTAACACATCCTGATCAGGATGTGTTA‑TTTTTTTGATTATTTCTGGCTCATTTAGCATTGCAATAGCTCGTGCAGAAACCTGCTGAGCCGCCCATTGGGCAGTATTAAt < 6:146316/148‑1 (MQ=255) tAATATCAGCGAAAATAAGTTTATCCGCCAGCAACATATTTAACACATCCTGATCAGGATGTGTTA‑TTTTTTTGATTATTTCTGGCTCATTTAGCATTGCAATAGCTCGTGCAGAAACCTGCTGAGCCGCCCATTGGGCAGTATTAAt < 2:104286/148‑1 (MQ=255) 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aaTAAGTTTATCCGCCAGCAACATATTTAACACATCCTGATCAGGATGTGTTA‑TTTTTTTGATTATTTCTGGCTCATTTAGCATTGCAATAGCTCGTGCAGAAACCTGCTGAGCCGCCCATTGGGCAGTATTAATCAATAAAAAACCgg < 3:505776/149‑1 (MQ=255) aTAAGTTTATCCGCCAGCAACATATTTAACTCATCCTGTTCAGGTTGTGTTA‑TTTTTTTGATTATTTCTGGCTCATTTAGCATTGCAATAGCTCGTGCAGAAACCTGCTGAGCCGCCCATTGGGCAGTATTAATCAATAAAAAACCGGa < 6:582333/149‑1 (MQ=255) aTAAGTTTATCCGCCAGCAACATATTTAACACATCCTGATCAGGATGTGTTA‑TTTTTTTGATTATTTCTGGCTCATTTAGCATTGCAATAGCTCGTGCAGAAACCTGCTGAGCCGCCCATTGGGCAGTATTAATCAATAAAAAACCGGa < 2:50188/149‑1 (MQ=255) aTAACTTTAACCGCCACCAAAATAATTAACACCTCCTGATCCTGTTTTTTTATTTTTTTTTATTATTT‑TTGCTTATTTAGCATTGCAATAGCTCGTGCAGAAACCTGCTGAGCCGCCCATTGGGCAGTATTAATCAATAAAAAACCGGa < 4:291522/149‑1 (MQ=255) gTTTATCCGCCAGCAACATATTTAACACATCCTGATCAGGATGTGTTA‑TTTTTTTGATTATTTCTGGCTCATTTAGCATTGCAATAGCTCGTGCAGAAACCTGCTGAGCCGCCCATTGGGCAGTATTAATCAATAAAAAACCGGAGtt > 7:159282/1‑148 (MQ=255) tATCCGCCAGCAACATATTTAACACATCCTGATCAGGATGTGTTA‑TTTTTTTGATTATTTCTGGCTCATTTAGCATTGCAATAGCTCGTGCAGAAACCTGCTGAGCCGCCCATTGGGCAGTATTAATCAATAAAAAACCGGAGTTaaa < 8:91668/148‑1 (MQ=255) tATCCGCCAGCAACATATTTAACACATCCTGATCAGGATGTGTTA‑TTTTTTTGATTATTTCTGGCTCATTTAGCATTGCAATAGCTCGTGCAGAAACCTGCTGAGCCGCCCATTGGGCAGTATTAATCAATAAAAAACCGGAGTTaaa < 4:75248/148‑1 (MQ=255) aTCCGCCAGCAACATATTTAACACATCCTGATCAGGATGTGTTA‑TTTTTTTGATTATTTCTGGCTCATTTAGCATTGCAATAGCTCGTGCAGAAACCTGCTGAGCCGCCCATTGGGCAGTATTAATCAATAAAAAACCGGa < 5:19569/141‑1 (MQ=255) tCCGCCAGCAACATATTTAACACATCCTGATCAGGATGTGTTA‑TTTTTTTGATTATTTCTGGCTCATTTAGCATTGCAATAGCTCGTGCAGAAACCTGCTGAGCCGCCCATTGGGCAGTATTAATCAATAAAAAACCGGAGTTAAAGt > 4:204212/1‑148 (MQ=255) cgacAGCAACATATTTAACACATCCTGATCAGGATGTGTTA‑TTTTTTTGATTATTTCTGGCTCATTTAGCATTGCAATAGCTCGTGCAGAAACCTGCTGAGCCGCCCATTGGGCAGTATTAATCAATAAAAAACCGGAGTTAAAGTaa < 6:35153/145‑1 (MQ=255) gCCAGCAACATATTTAACACATCCTGATCAGGATGTGTTA‑TTTTTTTGATTATTTCTGGCTCATTTAGCATTGCAATAGCTCGTGCAGAAACCTGCTGAGCCGCCCATTGGGCAGTATTAATCAATAAAAAACCGGAGTTaaa < 5:590655/143‑1 (MQ=255) ccAGCAACATATTTAACACATCCTGATCAGGATGTGTTA‑TTTTTTTGATTATTTCTGGCTCATTTAGCATTGCAATAGCTCGTGCAGAAACCTGCTGAGCCGCCCATTGGGCAGTATTAATCAATAAAAAACCGGAGTTAAAGTAAc > 5:347162/1‑147 (MQ=255) ccAGCAACATATTTAACACATCCTGATCAGGATGTGTTA‑TTTTTTTGATTATTTCTGGCTCATTTAGCATTGCAATAGCTCGTGCAGAAACCTGCTGAGCCGCCCATTGGGCAGTATTAATCAATAAAAAACCGGAGTTAAAGTAACCt < 7:219644/149‑1 (MQ=255) gCAACATATTTTACACATCCTGATCATTATGTGTTA‑TTTTTTTGATTATTTCTGGCTCATTTAGGATTGCTATAGCTCGTGCAGATTCCTGCTGAGCCGCCCATTGGGCAGTATTAATCAATAAAAAACCGGAGTTAAAGTAACCTTTa < 8:115771/149‑1 (MQ=255) cAACATATTTAACACATCCTGATCAGGATGTGTTA‑TTTTTTTGATTATTTCTGGCTCATTTAGCATTGCAATAGCTCGTGCAGAAACCTGCTGAGCCGCCCATTGGGCAGTATTAATCAATAAAAAACCGGAGTTaaa < 2:293647/138‑1 (MQ=255) cAACATATTTAACACATCCTGATCAGGATGTGTTA‑TTTTTTTGATTATTTCTGGCTCATTTAGCATTGCAATAGCTCGTGCAGAAACCTGCTGAGCCGCCCATTGGGCAGTATTAATCAATAAAAAACCGGAGTTAAAGTCACCTTTAg > 1:577969/1‑149 (MQ=255) cAACATATTTAACACATCCTGATCAGGATGTGTTA‑TTTTTTTGATTATTTCTGGCTCATTTAGCATTGCAATAGCTCGTGCAGAAACCTGCTGAGCCGCCCATTGGGCAGTATTAATCAATAAAAAACCGGAGTTAAAGTAACCTTTAg < 6:502425/149‑1 (MQ=255) cAACATATTTAACACATCCTGATCAGGATGTGTTA‑TTTTTTTGATTATTTCTGGCTCATTTAGCATTGCAATAGCTCGTGCAGAAACCTGCTGAGCCGCCCATTGGGCAGTATTAATCAATAAAAAACCGGAGTTAAAGTAACCTTTAg < 4:236652/149‑1 (MQ=255) tatTTAACACATCCTGATCAGGATGTGTTA‑TTTTTTTGATTATTTCTGGCTCATTTAGCATTGCAATAGCTCGTGCAGAAACCTGCTGAGCCGCCCATTGGGCAGTATTAATCAATAAAAAACCGGAGTTAAAGTAACCTTTAGCAAtt < 5:238772/149‑1 (MQ=255) | TGGATAAAAATAGTATCGTTGGTTACTGGGTTTATAAAGCTTTCTTTGAGTTGATAATTTAAGCTGAACTGGGTGTTATATTTAATATCAGCGAAAATAAGTTTATCCGCCAGCAACATATTTAACACATCCTGATCAGGATGTGTTA‑TTTTTTTGATTATTTCTGGCTCATTTAGCATTGCAATAGCTCGTGCAGAAACCTGCTGAGCCGCCCATTGGGCAGTATTAATCAATAAAAAACCGGAGTTAAAGTAACCTTTAGCAATTC > NC_000913/3802265‑3802532 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |