| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,625,304 | Δ1 bp | 6.8% | intergenic (+13/+31) | ydeJ → / ← dcp | inactive PncC family protein/dipeptidyl carboxypeptidase II |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,625,304 | 0 | G | . | 6.8% | 250.9 / 11.1 | 74 | intergenic (+13/+31) | ydeJ/dcp | inactive PncC family protein/dipeptidyl carboxypeptidase II |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (36/33); new base . (3/2); total (39/35) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.57e-01 | |||||||||||
GTTTGCGTGGCATATTAAAGGCCAGAACTACACTGCGGTTATGCATTTTGCTGGCGACTGCGAAACGGTATTAGCTTTAGCGGTGAGGTTTGCCCTCGCCCAGCTGCTGCAATTACTGCTATAACCAGGCTGGCCTGGCGATATC‑TCAGGCCAGCCATTGGTGGTGTTTATATGTTCAAGCCACGATGTTGCAGCATCGGCATAATCTTAGGTGCCTTACCGCGCCATTGTCGATACAGGCGTTCCAGATCTTCGCTGTTACCTCTGGAAAGGATCGCCTCGC > NC_000913/1625168‑1625450 | gTTTGCGTGGCATATTAAAGGCCAGAACTACACTGCGGTTATGCATTTTGCTGGCGACTGCGAAACGGTATTAGCTTTAGCGGTGAGGTTTGCCCTCGCCCAGCTGCTGCAATTACTGCTATAACCAGGCTGGCCTGGCGATAtc‑tc < 1:265195/147‑1 (MQ=255)gTTTGCGTGGCATATTAAAGGCCAGAACTACACTGCGGTTATGCATTTTGCTGGCGACTGCGAAACGGTATTAGCTTTAGCGGTGAGGTTTGCCCTCGCCCAGCTGCTGCAATTACTGCTATAACCAGGCTGGCCTGGCGATATC‑TCa < 8:107663/148‑1 (MQ=255)gTTTGCGTGGCATATTAAAGGCCAGAACTACACTGCGGTTATGCATTTTGCTGGCGACTGCGAAACGGTATTAGCTTTAGCGGTGAGGTTTGCCCTCGCCCAGCTGCTGCAATTACTGCTATAACCAGGCTGGCCTGGCGATATC‑TCa < 7:128359/148‑1 (MQ=255)gTTTGCGTGGCATATTAAAGGCCAGAACTACACTGCGGTTATGCATTTTGCTGGCGACTGCGAAACGGTATTAGCTTTAGCGGTGAGGTTTGCCCTCGCCCAGCTGCTGCAATTACTGCTATAACCAGGCTGGCCTGGCGATATC‑TCAg > 5:34910/1‑149 (MQ=255) tttGCGTGGCATATTAAAGGCCAGAACTACACTGCGGTTATGCATTTTGCTGGCGACTGCGAAACGGTATTAGCTTTAGCGGTGAGGTTTGCCCTCGCCCAGCTGCTGCAATTACTGCTATAACCAGGCTGGCCTGGCGATATC‑TCAgg > 6:130043/1‑149 (MQ=255) tGGCATATTAAAGGCCAGAACTACACTGCGGTTATGCATTTTGCTGGCGACTGCGAAACGGTATTAGCTTTAGCGGTGAGGTTTGCCCTCGCCCAGCTGCTGCAATTACTGCTATAACCAGGCTGGCCTGGCGATTTC‑TCAGgccagc > 8:327733/1‑148 (MQ=255) tGGCATATTAAAGGCCAGAACTACACTGCGGTTATGCATTTTGCTGGCGACTGCGAAACGGTATTAGCTTTAGCGGTGAGGTTTGCCCTCGCCCAGCTGCTGCAATTACTGCTATAACCAGGCTGGCCTGGCGATATC‑TCAGgccagc > 5:279902/1‑148 (MQ=255) gCATATTAAAGGCCAGAACTACACTGCGGTTATGCATTTTGCTGGCGACTGCGAAACGGTATTAGCTTTAGCGGTGAGGTTTGCCCTCGCCCAGCTGCTGCAATTACTGCTATAACCAGGCTGGCCTGGCGATATC‑TCAGGCCAGCCAt < 6:34910/149‑1 (MQ=255) cATATTAAAGGCCAGAACTACACTGCGGTTATGCATTTTGCTGGCGACTGCGAAACGTTATTAGCTTTAGCGGTGAGGTTTGCCCTCGCCCAGCTGCTGCAATTACTGCTATAACCAGGCTGGCCTGGCGATATC‑TCAGGCCAGCCAtt < 1:81767/149‑1 (MQ=255) atatTAAAGGCCAGAACTACACTGCGGTTATGCATTTTGCTGGCGACTGCGAAACGGTATTAGCTTTAGCGGTGAGGTTTGCCCTCGCCCAGCTGCTGCAATTACTGCTATAACCAGGCTGGCCTGGCGATATC‑TCAGGCCAGCCATtg > 4:92610/1‑149 (MQ=255) tatTAAAGGCCAGAACTACACTGCGGTTATGCATTTTGCTGGCGACTGCGAAACGGTATTAGCTTTAGCGGTGAGGTTTGCCCTCGCCCAGCTGCTGCAATTACTGCTATAACCAGGCTGGCCTGGCGATATC‑TCAGGCCAGCCATtgg < 5:130043/149‑1 (MQ=255) atTAAAGGCCAGAACTACACTGCGGTTATGCATTTTGCTGGCGACTGCGAAACGGTATTAGCTTTAGCGGTGAGGTTTGCCCTCGCCCAGCTGCTGCAATTACTGCTATAACCAGGCTGGCCTGGCGATATC‑TCAGGCCAGCCATtggt > 3:316674/1‑149 (MQ=255) atTAAAGGCCAGAACTACACTGCGGTTATGCATTTTGCTGGCGACTGCGAAACGGTATTAGCTTTAGCGGTGAGGTTTGCCCTCGCCCAGCTGCTGCAATTACTGCTATAACCAGGCTGGCCTGGCGATATC‑TCAGGCCAGCCATtggt < 1:317051/149‑1 (MQ=255) ttAATGGCCAGAAGTTAACTGCGGTTATTCATTTTGCTGGGGAGTGCGATACGGTATTAGCTTTAGCGGTGAGGTTTGCCCTCGCCCAGGTGCTGCAATTTCTGGTATATCCAGGCTGGCCTGGCGATATC‑TGAGGCCAGCCATtggtg < 4:316674/149‑1 (MQ=255) ttAAAGGCCAGAACTACACTGCGGTTATGCATTTTGCTGGCGACTGCGAAACGGTATTAGCTTTAGCGGTGAGGTTTGCCCTCGCCCAGCTGCTGCAATTACTGCTATAACCAGGCTGGCCTGGCGATATC‑TCAGGCCAGCCATtggtg > 4:303629/1‑149 (MQ=255) tAAAGGCCAGAACTACACTGCGGTTATGCATTTTGCTGGCGACTGCGAAACGGTATTAGCTTTAGCGGTGAGGTTTGCCCTCGCCCAGCTGCTGCAATTACTGCTATAACCAGGCTGGCCTGGCGCTATC‑TCAGGCCAGCCATtggtgg > 6:239488/1‑149 (MQ=255) tAAAGGCCAGAACTACACTGCGGTTATGCATTTTGCTGGCGACTGCGAAACGGTATTAGCTTTAGCGGTGAGGTTTGCCCTCGCCCAGCTGCTGCAATTACTGCTATAACCAGGCTGGCCT‑GAGATATCGCCAGgccagcctggt > 3:149574/1‑141 (MQ=255) tAAAGGCCAGAACTACACTGCGGTTATGCATTTTGCTGGCGACTGCGAAACGGTATTAGCTTTAGCGGTGAGGTTTGCCCTCGCCCAGCTGCTGCAATTACTGCTATAACCAGGCTGGCCT‑GAGATATCGCCAGgccagcctggt < 4:149574/145‑5 (MQ=255) aaaGGCCAGAACTACACTGCGGTTATGCATTTTGCTGGCGACTGCGAAACGGTATTAGCTTTAGCGGTGAGGTTTGCCCTCGCCCAGCTGCTGCAATTACTGCTATAACCAGGCTGGCCTGGCGATATC‑TCAGGCCAGCCATtggtgg < 8:323772/148‑1 (MQ=255) agcccAGAACTACACTGCGGCTATGCATTTCGCTGGCGACTGCGAAACGGTATTAGCTTTAGCGGTCAGGGCAGCCCCCGCCCAGCCGCTGCAATTACTGCTATAACCAGGCTGGCCTGGCGATATC‑TCAGGCCAGCCATTGGTGgtgt < 6:279902/146‑1 (MQ=255) gCCAGAACTACACTGCGGTTATGCATTTTGCTGGCGACTGCGAAACGGTATTAGCTTTAGCGGTGAGGTTTGCCCTCGCCCAGCTGCTGCAATTACTGCTATAACCAGGCTGGCCTGGCGATATC‑TCAGGCCAGCCATTGGTGGTGtt > 8:327112/1‑148 (MQ=255) gCCAGAACTACACTGCGGTTATGCATTTTGCTGGCGACTGCGAAACGGTATTAGCTTTAGCGGTGAGGTTTGCCCTCGCCCAGCTGCTGCAATTACTGCTATAACCAGGCTGGCCT‑GAGATATCGCCAGgccagcct > 5:163284/1‑136 (MQ=255) gCCAGAACTACACTGCGGTTATGCATTTTGCTGGCGACTGCGAAACGGTATTAGCTTTAGCGGTGAGGTTTGCCCTCGCCCAGCTGCTGCAATTACTGCTATAACCAGGCTGGCCT‑GAGATATCGCCAGgccagcct < 6:163284/137‑2 (MQ=255) cAGAACTACACTGCGGTTATGCATTTTGCTGGCGACTGCGAAACGGTATTAGCTTTAGCGGTGAGGTTTGCCCTCGCCCAGCTGCTGCAATTACTGCTATAACCAGGctggcctgg < 6:99499/116‑1 (MQ=255) cAGAACTACACTGCGGTTATGCATTTTGCTGGCGACTGCGAAACGGTATTAGCTTTAGCGGTGAGGTTTGCCCTCGCCCAGCTGCTGCAATTACTGCTATAACCAGGctggcctgg > 5:99499/1‑116 (MQ=255) cAGAACTACACTGCGGTTATGCATTTTGCTGGCGACTGCGAAACGGTATTAGCTTTAGCGGTGAGGTTTGCCCTCGCCCAGCTGCTGCAATTACTGCTATAACCAGGCTGGCCTGGCGATATC‑TCAGGCCAGCCATTGGTGGTGTTtat < 3:92610/149‑1 (MQ=255) gAACTACACTGCGGTTATGCATTTTGCTGGCGACTGCGAAACGGTATTAGCTTTAGCGGTGAGGTTTGCCCTCGCCCAGCTGCTGCAATTACTGCTATAACCAGGCTGGCCTGGCGATATC‑TCAGGCCAGCCATTGGTGGTGTTTatat < 7:327112/149‑1 (MQ=255) aaCTACACTGCGGTTATGCATTTTGCTGGCGACTGCGAAACGGTATTAGCTTTAGCGGTGAGGTTTGCCCTCGCCCAGCTGCTGCAATTACTGCTATAACCAGGCTGGCCTGGCGATATC‑TCAGGCCAGCCATTGGTGGTGTTTAtgtg > 1:89974/1‑149 (MQ=255) cTACACTGCGGTTATGCATTTTGCTGGCGACTGCGAAACGGTATTAGCTTTAGCGGTGAGGTTTGCCCTCGCCCAGCTGCTGCAATTACTGCTATAACCAGGCTGGCCTGGCGATATC‑TCAGGCCAGCCATTGGTGgtgt < 5:362703/140‑1 (MQ=255) cTACACTGCGGTTATGCATTTTGCTGGCGACTGCGAAACGGTATTAGCTTTAGCGGTGAGGTTTGCCCTCGCCCAGCTGCTGCAATTACTGCTATAACCAGGCTGGCCTGGCGATATC‑TCAGGCCAGCCATTGGTGgtgt > 6:362703/1‑140 (MQ=255) cacTGCGGTTATGCATTTTGCTGGCGACTGCGAAACGGTATTAGCTTTAGCGGTGAGGTTTGCCCTCGCCCAGCTGCTGCAATTACTGCTATAACCAGGCTGGCCTGGCGATATC‑TCAGGCCAGCCATTGGTGGTGTTTATATGTTc < 8:33000/147‑1 (MQ=255) tGCGGTTATGCATTTTGCTGGCGACTGCGAAACGGTATTAGCTTTAGCGGTGAGGTGTGCCCTCGACCAGCTGCTGCAATTACTGCTATAACCAGGCTGGCCGGGCGATATC‑TCAGGCCAGCCATTGGTGGTGTTTATATGTTCAAGc > 5:253999/1‑148 (MQ=255) ttATGCATTTTGCTGGCGACTGCGAAACGGTATTAGCTTTAGCGGTGAGGTTTGCCCTCGCCCAGCTGCTGCAATTACTGCTATAACCAGGCTGGCCTGGCGATATC‑TCAGgcc > 7:262521/1‑114 (MQ=255) ttATGCATTTTGCTGGCGACTGCGAAACGGTATTAGCTTTAGCGGTGAGGTTTGCCCTCGCCCAGCTGCTGCAATTACTGCTATAACCAGGCTGGCCTGGCGATATC‑TCAGgcc < 8:262521/114‑1 (MQ=255) ttATGCATTTTGCTGGCGACTGCGAAACGGTATTAGCTTTAGCGGTGAGGTTTGCCCTCGCCCAGCTGCTGCAATTACTGCTATAACCAGGCTGGCCTGGCGATATC‑TCAGGCCAGCCATtggtg > 5:98203/1‑125 (MQ=255) ttATGCATTTTGCTGGCGACTGCGAAACGGTATTAGCTTTAGCGGTGAGGTTTGCCCTCGCCCAGCTGCTGCAATTACTGCTATAACCAGGCTGGCCTGGCGATATC‑TCAGGCCAGCCATtggtg < 6:98203/125‑1 (MQ=255) aTTTTGCTGGCGACTGCGAAACGGTATTAGCTTTAGCGGTGAGGTTTGCCCTCGCCCAGCTGCTGCAATTACTGCTATAACCAGGCTGGCCTGGCGATATC‑TCAGGCCAGCCATTGGTGGTGTTTATATGTTCAAGCCACGATGTTg > 5:277167/1‑147 (MQ=255) aTTTTGCTGGCGACTGCGAAACGGTATTAGCTTTAGCGGTGAGGTTTGCCCTCGCCCAGCTGCTGCAATTACTGCTATAACCAGGCTGGCCTGGCGATATC‑TCAGGCCAGCCATTGGTGGTGTTTATATGTTCAAGCCACGATGTTg > 7:133034/1‑147 (MQ=255) aTTTTGCTGGCGACTGCGAAACGGTATTAGCTTTAGCGGTGAGGTTTGCCCTCGCCCAGCTGCTGCAATTACTGCTATAACCAGGCTGGCCTGGCGATATC‑TCAGGCCAGCCATTGGTGGTGTTTATATGTTCAAGCCACGATGTTg > 5:195080/1‑147 (MQ=255) cTGGCGACTGCGAAACGGTATTAGCTTTAGCGGTGAGGTTTGCCCTCGCCCAGCTGCTGCAATTACTGCTATAACCAGGCTGGCCTGGCGATATC‑TCAGGCCAGCCATTGGTGGTGTTTATATGTTCAAGCCACGATGTTGCAGCATCg > 3:226455/1‑149 (MQ=255) tGGCGACTGCGAAACGGTATTAGCTTTAGCGGTGAGGTTTGCCCTCGCCCAGCTGCTGCAATTACTGCTATAACCAGGCTGGCCTGGCGATATC‑TCAGGCCAGCCATTGGTGGTGTTTATATGTTCAAGCCACGATGTTGCAGCATCgg > 2:137960/1‑149 (MQ=255) aCTGCGAAACGGTATTAGCTTTAGCGGTGAGGTTTGCCCTCGCCCAGCTGCTGCAATTACTGCTATAACCAGGCTGGCCTGGCGATATC‑TCAGGCCAGCCATTGGTGGTGTTTATATGTTCAAGCCACGATGTTGCAGCATCGGCATaa > 6:275683/1‑149 (MQ=255) cGAAACGGTATTAGCTTTAGCGGTGAGGTTTGCCCTCGCCCAGCTGCTGCAATTACTGCTATAACCAGGCTGGCCTGGCGATATC‑TCAGGCCAGCCATTGGTGGTGTTTATATGTTCAAGCCACGATGTTGCAGCATCGGCATAATCtt < 4:192980/149‑1 (MQ=255) cGAAACGGTATTAGCTTTAGCGGTGAGGTTTGCCCTCGCCAAGCTGCTGCAATTACTGCTATAACCAGGCTGGCCTGGCGATATC‑TCAGGCCAGCCATTGGTGGTGTTTATATGTTCAAGCCACGATGTTGCAGCATCTGCATAATCt > 6:333738/1‑148 (MQ=255) gAAACGGTATTAGCTTTAGCGGTGAGGGTTGCCCTCGCCCAGCTGCTGCAATTACTGCTATAACCAGGCTGGCCTGGCGATATC‑TCAGGCCAGCCATTGGTGGTGGTTATATGTTCAAGCCACGATGTTGCAGCATCGGCATAATCTTa < 2:60956/149‑1 (MQ=255) aaCGGTATTAGCTTTAGCGGTGAGGTTTGCCCTCGCCCAGCTGCTGCAATTACTGCTATAACCAGGCTGGCCTGGCGATATC‑TCAGGCCAGCCATTGGTGGTGTTTATATGTTCAAGCCACGATGTTGCAGCATCGGCATAATCTTAgg < 4:226455/149‑1 (MQ=255) 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tAGCGGTGAGGTTTGCCCTCGCCCAGCTGCTGCAATTACTGCTATAACCAGGCTGGCCTGGCGATATC‑TCAGGCCAGCCATTGGTGGTGTTTATATGTTCAAGCCACGATGTTGCAGCATCGGCATAATCTTAGGTGCCTTACCgcgc < 5:151230/148‑1 (MQ=255) cGGGGAGGGTTGCCCTCGCCCAGCTGCTGCAATTACTGCGATAACCAGGCGGGCCGGGCGATATC‑TCAGGCCAGCCATTGGTGGTGTTTATATGTTCAAGCCACGATTTTGCAGCATCGGCATAATCTTAGGTGCCTTACCGCGCCAtt < 6:253999/149‑1 (MQ=255) gTGAGGTTTGCCCTCGCCCAGCTGCTGCAATTACTGCTATAACCAGGCTGGCCTGGCGATATC‑TCAGGCCAGCCATTGGTGGTGTTTATATGTTCAAGCCACGATGTTGCAGCATCGGCATAATCTTAGGTGCCTTACCGCGCCATTGt > 1:14969/1‑149 (MQ=255) gTGAGGTTTGCCCTCGCCCAGCTGCTGCAATTACTGCTATAACCAGGCTGGCCTGGCGATATC‑TCAGGCCAGCCATTGGTGGTGTTTATATGTTCAAGCCACGATGTTGCAGCATCGGCATAAACTTAGGTGCCTTACCGCGCCATTGt > 2:150706/1‑149 (MQ=255) ggTTTGCCCTCGCCCAGCTGCTGCAATTACTGCTATAACCAGGCTGGCCTGGCGATATC‑TCAGGCCAGCCATTGGTGGTGTTTATATGTTCAAGCCACGATGTTGCAGCATCGGCATAATCTTAGGTGCCTTACCGCGCCATTGTCGAt < 5:333738/149‑1 (MQ=255) gTTTGCCCTCGCCCAGCTGCTGCAATTACTGCTATAACCAGGCTGGCCTGGCGATATC‑TCAGGCCAGCCATTGGTGGTGTTTATATGTTCAAGCCACGATGTTGCAGCATCGGCATAATCTTAGGTGCCTTACCGCGCCATTGTCGATa < 6:277167/149‑1 (MQ=255) tGCCCTCGCCCAGCTGCTGCAATTACTGCTATAACCAGGCTGGCCTGGCGATATC‑TCAGGCCAGCCATTGGTGGTGTTTATGTGTTCAAGCCACGATGTTGCAGCATCGGCATAATCTTAGGTGCCTTACCGCGCCATTGTCGATACa < 2:89974/148‑1 (MQ=255) cccTCGCCCAGCTGCTGCAATTACTGCTATAACCAGGCTGGCCTGGCGATATC‑TCAGGCCAGCCATTGGTGGTGTTTATATGTTCAAGCCACGATGTTGCAGCATCGGCATAATCTTAGGTGCCTTACCGCGCCATTGTCGATACAGGc < 4:201977/149‑1 (MQ=255) ccTCGCCCAGCTGCTGCAATTACTGCTATAACCAGGCTGGCCTGGCGATATC‑TCAGGCCAGCCATTGGTGGTGTTTATATGTTCAAGCCACGATGTTGCAGCATCGGCATAATCTTAGGTGCCTTACCGCGCCATTGTCGATACAGGCg > 5:261018/1‑149 (MQ=255) cTCGCCCAGCTGCTGCAATTACTGCTATAACCAGGCTGGCCTGGCGATATC‑TCAGGCCAGCCATTGGTGGTGTTTATATGTTCAAGCCACGATGTTGCAGCATCGGCATAATCTTAGGTGCCTTACCGCGCCATTGTCGATACAGGCGt < 8:133034/149‑1 (MQ=255) tctcccAGCTTCTGCAATTAATTCTTTAACAAGGCTGGCCTGGCGATATC‑TCTTGACAGCCATTGGTTGTGTTTATATGTTCAAGGCACGATTTTGCAGCATCGGCATAATCTTATGTGCCTTTCCGCGCCATTGTCTATACAGGCGt < 6:321523/145‑1 (MQ=255) tCGCCCAGCTGCTGCAATTACTGCTATAACCAGGCTGGCCTGGCGATATC‑TCAGGCCAGCCATTGGTGGTGTTTATATGTTCAAGCCACGATGTTGCAGCATCGGCATAATCTTAGGTGCCTTACCGCGCCATTGTCGATACAGGCGtt > 5:326341/1‑149 (MQ=255) cccATCTGCTGCAATTACTGCTATAACCAGGCTGGCCTGGCGATATC‑TCAGGCCAGCCATTGGTGGTGTTTATATGTTCAAGCCTCGATGTTGCAGCATCGGCATAATCTTAGGTGCCTTACCGCGCCATTGTCGATACAGGCGTTCCa < 7:154660/149‑1 (MQ=255) ccAGCTGCTGCAATTACTGCTATAACCAGGCTGGCCTGGCGATTTC‑TCAGGCCAGCCATTGGTGGTGTTTATATGTTCAAGCCACGATGTTGCAGCATCGGCATAATCTTAGGTGCCTTACCGCGCCATTGTCGATACAGGCGTTCCAg < 7:327733/149‑1 (MQ=255) ccAGCTGCTGCAATTACTGCTATAACCAGGCTGGCCTGGCGATATC‑TCAGGCCAGCCATTGGTGGTGTTTATATGTTCAAGCCACGATGTTGCAGCATCGGCATAATCTTAGGTGCCTTACCGCGCCATTGTCGATACAGGCGTTc > 3:142966/1‑146 (MQ=255) ccAGCTGCTGCAATTACTGCTATAACCAGGCTGGCATGGCGATATC‑TCAGGCCAGCCATTGGTGGTGTTTATATGTTCAAGCCACGATCTTGCAGCATCGGCATAATCTTAGGTGCCTTACCGCTCCATAGTCGATACAGGCGt > 5:321523/1‑144 (MQ=255) cAGCTGCTGCAATTACTGCTATAACCAGGCTGGCCTGGCGATATC‑TCAGGCCAGCCATTGGTGGTGTTTATATGTTCAAGCCACGATGTTGCAGCATCGGCATAATCTTAGGTGCCTTACCGCGCCATTGTCGATACAGGCGTTCCAGa < 6:195080/149‑1 (MQ=255) gctgctGCAATTACTGCTATAACCAGGCTGGCCTGGCGATATC‑TCAGGCCAGCCATTGGTGGTGTTTATATGTTCAAGCCACGATGTTGCAGCATCGGCATAATCTTAGGTGCCTTACCGCGCCATTGTCGATACAGGCGTTCCAGATc < 3:322687/149‑1 (MQ=255) ttACTGCTATAACCAGGCTGGCCTGGCGATATC‑TCAGGCCAGCCATTGGTGGTGTTTATATGTTCAAGCCACGATGTTGCAGCATCGGCATAATCTTAGGTGCCTTACCGCGCCATTGTCGATACAGGCGTTCCAGATCTTCGCTGTTa > 7:94211/1‑149 (MQ=255) cTATAACCAGGCTGGCCTGGCGATATC‑TCAGGCCAGCCATTGGTGGTGTTTATATGTTCAAGCCACGATGTTGCAGCATCGGCATAATCTTAGGTGCCTTACCGCGCCATTGTCGATACAGGCGTTCCAGATCTTCGCTGTTACCTCTg < 3:303629/149‑1 (MQ=255) ataACCAGGCTGGCCTGGCGATATC‑TCAGGCCAGCCATTGGTGGTGTTTATATGTTCAAGCCACGATGTTGCAGCATCGGCATAATCTTAGGTGCCTTACCGCGCCATTGTTGATACAGGCGTTCCAGATCTTCGCTGTTACCTCTgg > 6:320647/1‑148 (MQ=255) aaCCAGGCTGGCCTGGCGATATC‑TCAGGCCAGCCATTGGTGGTGTTTATATGTTCAAGCCACGATGTTGCAGCATCgg < 6:303148/78‑1 (MQ=255) aaCCAGGCTGGCCTGGCGATATC‑TCAGGCCAGCCATTGGTGGTGTTTATATGTTCAAGCCACGATGTTGCAGCATCgg > 5:303148/1‑78 (MQ=255) caatggCTGGCCT‑GAGATATCGCCAGGCCAGCCTTTGGTGGTGTTTATATGTTCAAGCCACGATGTTGCAGCATCGGCATAATCTTAGGTGCCTTACCGCGCCATTGTCGATACAGGCGTTCCAGATCTTCGCTGTTACCTCTGGAAAg > 8:173374/5‑149 (MQ=255) ggCTGGCCTGGCGATATC‑TCAGGCCAGCCATTGGTGGTGTTTATATGTTCAAGCCACGATGTTGCAGCATCGGCATAATCTTAGGTGCCTTACCGCGCCATTGTCGATACAGGCGTTCCAGATCTTCGCTGTTACCTCTGGAAAGGATc > 4:79278/1‑149 (MQ=255) tggcGATATC‑TCAGGCCAGCCATTGGTGGTGTTTATATGTTCAAGCCACGATGTTGCAGCATCGGCATAATCTTAGGTGCCTTACCGCGCCATTGTCGATACAGGCGTTCCAGATCTTCGCTGTTACCTCTGGAAAGGATCGCCTcgc > 4:233807/1‑148 (MQ=255) | GTTTGCGTGGCATATTAAAGGCCAGAACTACACTGCGGTTATGCATTTTGCTGGCGACTGCGAAACGGTATTAGCTTTAGCGGTGAGGTTTGCCCTCGCCCAGCTGCTGCAATTACTGCTATAACCAGGCTGGCCTGGCGATATC‑TCAGGCCAGCCATTGGTGGTGTTTATATGTTCAAGCCACGATGTTGCAGCATCGGCATAATCTTAGGTGCCTTACCGCGCCATTGTCGATACAGGCGTTCCAGATCTTCGCTGTTACCTCTGGAAAGGATCGCCTCGC > NC_000913/1625168‑1625450 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |