| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,263,541 | T→C | 5.5% | intergenic (‑41/‑173) | lolB ← / → hemA | lipoprotein localization factor/glutamyl tRNA reductase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,263,541 | 0 | T | C | 5.5% | 230.0 / 3.3 | 73 | intergenic (‑41/‑173) | lolB/hemA | lipoprotein localization factor/glutamyl tRNA reductase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (35/34); new base C (2/2); total (37/36) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.96e-01 | |||||||||||
ATCCGGGCTTTTGCCAGGACCTTTGGGCGTGGTAACGGAACAGGCAGTGAGCACAAGAGCAGCCAGCGGTAGCAGGCGGATAAGACGAAAATCGGGCAGGGGCATAGTGATGACAAGTCCTTGAGATACGTTGCAGTTATAACCCTTAATGCTAGCGTTACCGTCCGCTATCGTCTATGTTCAAGTTGTCTTAATTGCCAGAATCTAACGGCTTTCGGCAATTACTCCAAAAGGGGGCGCTCTCTTTTATTGATCTTACGCATCCTGTATGATGCAAGCAGACTAACCCTAT > NC_000913/1263396‑1263687 | aTCCGGGCTTTTGCCAGGACCTTTGGGCGTGGTAACGGAACAGGCAGTGAGCACAAGAGCAGCCAGCGGTAGCAGGCGGATAAGACGAAAATCGGGCAGGGGCATAGTGATGACAAGTCCTTGAGATACGTTGCAGTTATAACCCTTaa < 4:128829/149‑1 (MQ=255) ttttGCCAGGACCTTTGGGCGTGGTAACGGAACAGGCAGTGAGCACAAGAGCAGCCAGCGGTAGCAGGCGGATAAGACGAAAATCGGGCAGGGGCATAGTGATGACAAGTCCTTGAGATACGTTGCAGTTATAACCCTTAATGCTAGCg > 7:61203/1‑149 (MQ=255) gCGTGGTAACGGAACAGGCAGTGAGCACAAGAGCAGCCAGCGGTAGCAGGCGGATAAGACGAAAATCGGGCAGGGGCATAGTGATGACAAGTCCTTGAGATACGTTGCAGTTATAACCCTTAATGCTAGCGTTACCGTCCGCTATCGTc > 5:128768/1‑149 (MQ=255) cGTGGTAACGGAACAGGCAGTGAGCACAAGAGCAGCCAGCGGTAGCAGGCGGATAAGACGAAAATCGGGCAGGGGCATAGTGATGACAAGTCCTTGAGATACGTTGCAGTTATAACCCTTAATGCTAGCGTTACCGTCCGCTATCGTCt < 5:359672/149‑1 (MQ=255) tGGTAACGGAACAGGCAGTGAGCACAAGAGCAGCCAGCGGTAGCAGGCGGATAAGACGAAAATCGGGCAGGGGCATAGTGATGACAAGTCCTTGAGATACGTTGCAGTTATAACCCTTAATGCTAGCGTTACCGTCCGCTATCGTCTAt < 5:155927/149‑1 (MQ=255) tAACGGAACAGGCAGTGAGCACAAGAGCAGCCAGCGGTAGCAGGCGGATAAGACGAAAATCGGGCAGGGGCATAGTGATGACAAGTCCTTGAGATACGTTGCAGGTATAACCCTTAATGCTAGCGTTACCGTCCGCTTTCGTCTTTGtt > 5:143046/1‑149 (MQ=255) aaCGGAACAGGCAGTGAGCACAAGAGCAGCCAGCGGTAGCAGGCGGATAAGACGAAAATCGGGCAGGGGCATAGTGATGACAAGTCCTTGAGATACGTTGCAGTTATAACCCTTAATGCTAGCGTTACCGTCCGCTATCGTCTATGtt > 4:2709/1‑148 (MQ=255) aCGGAACAGGCAGTGAGCACAAGAGCAGCCAGCGGTAGCAGGCGTATAAGACGAAAATCGGGCAGGGGCATAGTGATGACAAGTCCTTGAGATACGTTGCAGTTATAACCCTTAATGCTAGCGTTACCGTCCGCTATCGTCTATGTTc < 3:24894/148‑1 (MQ=255) ggAACAGGCAGTGAGCACAAGAGCAGCCAGCGGTAGCAGGCGGATAAGACGAAAATCGGGCAGGGGCATAGTGATGACAAGTCCTTGAGATACGTTGCAGTTATAACCCTTAATGCTAGCGTTACCGGCCGCTATCGTCTATGTTCAAg > 1:249708/1‑149 (MQ=255) gAACAGGCAGTGAGCACAAGAGCAGCCAGCGGTAGCAGGCGGATAAGACGAAAATCGGGCAGGGGCATAGTGATGACAAGTCCTTGAGATACGTTGCAGTTATAACCCTTAATGCTAGCGTTACCGTCCGCTATCGTCTATGTTCAAGt > 3:167131/1‑149 (MQ=255) aaCAGGCAGTGAGCACAAGAGCAGCCAGCGGTAGCAGGCGGATAAGACGAAAATCGGGCAGGGGCATAGTGATGACAAGTCCTTGAGATACGTTGCAGTTATAACCCTTAATGCTAGCGTTACCGTCCGCTATCGTCTATGTTCAAGtt < 4:167131/149‑1 (MQ=255) aaCAGGCAGTGAGCACAACAGCAGCCAGCGGTAGCAGGCGGATAAGACGAAAATCGGGCAGGGGCATAGTGATGACAAGTCCTTGAGATACGTTGCAGTTATAACCCTTAATGCTAGCGTTACCGTCCGCTATCGTCTATGTTCAAGtt < 6:82447/149‑1 (MQ=255) ggCAGTGAGCACAAGAGCAGCCAGCGGTAGCAGGCGGATAAGACGAAAATCGGGCAGGGGCATAGTGATGACAAGTCCTTGAGATACGTTGCAGTTATAACCCTTAATGCTAGCGTTACCGTCCGCTATCGTCTATGTTCAAGTTGTCt < 2:302621/149‑1 (MQ=255) tGAGCACAAGAGCAGCCAGCGGTAGCAGGCGGATAAGACGAAAATCGGGCAGGGGCATAGTGATGACAAGTCCTTGAGATACGTTGCAGTTATAACCCTTAATGCTAGCGTTACCGTCCGCTATCGTCTATGTTCAAGTTGTCTTAAtt < 1:396911/149‑1 (MQ=255) tGAGCACAAGAGCAGCCAGCGGTAGCAGGCGGATAAGACGAAAATCGGGCAGGGGCATAGTGATGACAAGTCCTTGAGATACGTTGCAGTTATAACCCTTAATGCTAGCGTTACCGTCCGCTATCGTCTATGTTCAAGTTGTCTTAAtt < 3:173226/149‑1 (MQ=255) atcacaAGAGCAGCCAGGGGTAGCAGGCGGATATGACGAAAATCGGCCAGTGGCATAGTGATGACAAGTCCTTGAGATATGTTGCAGTTATAACCCTTAATGCTTGAGTTAACGTCCGCTATCGTCTATGTTCAATTTGTCTTAATTGc < 2:103448/147‑1 (MQ=255) aGCACAAGAGCAGCCAGCGGTAGCAGGCGGATAAGACGAAAATCGGGCAGGGGCATAGTGATGACAAGTCCTTGAGATACGTTGCAGTTATAACCCTTAATGCTAGCGTTACCGTCCGCTATCGTCTATGTTCAAGTTGTCTTAATTGc > 6:163995/1‑149 (MQ=255) cacaAGAGCAGCCAGCGGTAGCAGGCGGATAAGACGAAAATCGGGCAGGGGCATAGTGATGACAAGTCCTTGAGATACGTTGCAGTTATAACCCTTAATGCTAGCGTTACCGTCCGCTATCGTCTATGTTCAAGTTGTCTTAATTGCCa < 7:304568/149‑1 (MQ=255) cacaAGAGCAGCCAGCGGTAGCAGGCGGATAAGACGAAAATCGGGCAGGGGCATAGTGATGACAAGTCCTTGAGATACGTTGCAGTTATAACCCTTAATGCTAGCGTTACCGTCCGCTATCGTCTATGTTCAAGTTGTCTTAATTGCCa < 7:309383/149‑1 (MQ=255) acaAGAGCAGCCAGCGGTAGCAGGCGGATAAGACGAAAATCGGGCAGGGGCATAGTGATGACAAGTCCTTGAGATACGTTGCAGTTATAACCCTTAATGCTAGCGTTACCGTCCGCTATCGTCTATGTTCAAGTTGTCTTAATTGc > 1:95606/1‑146 (MQ=255) acaAGAGCAGCCAGCGGTAGCAGGCGGATAAGACGAAAATCGGGCAGGGGCATAGTGATGACAAGTCCTTGAGATACGTTGCAGTTATAACCCTTAATGCTAGCGTTACCGTCCGCTATCGTCTATGTTCAAGTTGTCTTAATTGCCAg < 3:357595/149‑1 (MQ=255) aaGAGCAGCCAGCGGTAGCAGGCGGATAAGACGAAAATCGGGCAGGGGCATAGTGATGACAAGTCCTTGAGATACGTTGCAGTTATAACCCTTAATGCTAGCGTTACCGTCCGCTATCGTCTATGTTCAAGTTGTCTTAATTGCCAGaa > 5:324345/1‑149 (MQ=255) aaGAGCAGCCAGCGGTAGCAGGCGGATAAGACGAAAATCGGGCAGGGGCATAGTGATGACAAGTCCTTGAGATACGTTGCAGTTATAACCCTTAATGCTAGCGTTACCGTCCGCTATCGTCTATGTTCAAGTTGTCTTAATTGCCAGaa > 3:213706/1‑149 (MQ=255) aaGAGCAGCCAGCGGTAGCAGGCGGATAAGACGAAAATCGGGCAGGGGCATAGTGATGACAAGTCCTTGAGATACGTTGCAGTTATAACCCTTAATGCTAGCGTTACCGTCCGCTATCGTCTATGTTCAAGTTGTCTTAATTGCCAGaa > 8:386128/1‑149 (MQ=255) gagCAGCCAGCGGTAGCAGGCGGATAAGACGAAAATCGGGCAGGGGCATAGTGATGACAAGTCCTTGAGATACGTTGCAGTTATAACCCTTAATGCTAGCGTTACCGTCCGCTATCGTCTATGTTCAAGTTGTCTTAATTGCCAGAATc > 6:119671/1‑149 (MQ=255) gagCAGCCAGCGGTAGCAGGCGGATAAGACGAAAATCGGGCAGGGGCATAGTGATGACAAGTCCTTGAGATACGTTGCAGTTATAACCCTTAATGCTAGCGTTACCGTCCGCTATCGTCTATGTTCAAGTTGTCTTAATTGCCAGAATc > 3:90444/1‑149 (MQ=255) cagccagcGGTAGCAGGCGGATAAGACGAAAATCGGGCAGGGGCATAGTGATGACAAGTCCTTGAGATACGTTGCAGTTATAACCCTTAATGCTAGCGTTACCGTCCGCTATCATCTATGTTCAAGTTGTCTTAATTGCCAGAATCTaa > 2:178412/1‑149 (MQ=255) cGGTAGCAGGCGGATAAGACGAAAATCGGGCAGGGGCATAGTGATGACAAGTCCTTGAGATACGTTGCAGTTATAACCCTTAATGCTAGCGTTACCGTCCGCTATCGTCTATGTTCAAGTTGTCTTAATTGCCAGAATCTAACGGCttt < 5:163995/149‑1 (MQ=255) ggTAGCAGGCGGATAAGACGAAAATCGGGCAGGGGCATAGTGATGACAAGTCCTTGAGATACGTTGCAGTTATAACCCTTAATGCTAGCGTTACCGTCCGCTATCGTCTATGTTCAAGTTGTCTTAATTGCCAGAATCTAACGGCTTTc > 1:285575/1‑149 (MQ=255) ggTAGCAGGCGGATAAGACGAAAATCGGGCAGGGGCATAGTGATGACAAGTCCTTGAGATACGTTGCAGTTATAACCCTTAATGCTAGCGTTACCGTCCGCTATCGTCTATGTTCAAGTTGTCTTAATTGCCAGAATCTAACGGCTTTc < 5:119671/149‑1 (MQ=255) tAGCAGGCGGATAAGACGAAAATCGGGCAGGGGCATAGTGATGACAAGTCCTTGAGATACGTTGCAGTTATAACCCTTAATGCTAGCGTTACCGTCCGCTATCGTCTATGTTCAAGTTGTCTTAATTGCCAGAATCTAACGGCTTTCgg < 4:250801/149‑1 (MQ=255) tAGCAGGCGGATAAGACGAAAATCGGGCAGGGGCATAGTGATGACAAGTCCTTGAGATACGTTGCAGTTATAACCCTTAATGCTAGCGTTACCGTCCGCTATCGTCTATGTTCAAGTTGTCTTAATTGCCAGAATCTAACGGCTTTCgg < 8:61203/149‑1 (MQ=255) gACGAAAATCGGGCAGGGGCATAGTGATGACAAGTCCTTGAGATACGTTGCAGTTATAACCCTTAATGCTAGCGTTACCGTCCGCTATCGTCTATGTTCAAGTTGTCTTAATTGCCAGAATCTAACGGCTTTCGGCAATTACTCCaa > 6:368494/1‑147 (MQ=255) gACGAAAATCGGGCAGGGGCATAGTGATGACAAGTCCTTGAGATACGTTGCAGTTATAACCCTTAATGCTAGCGTTACCGTCCGCTATCGTCTATGTTCAAGTTGTCTTAATTGCCAGAATCTAACGGCTTTCGGCAATTACTCCaa > 1:360328/1‑147 (MQ=255) gACGAAAATCGGGCAGGGGCATAGTGATGAAAAGTACTTTAGATACGTTGCAGTTATAACCCTTAATGCTAGAGTTACAGTCCGCTATCGTCTATGTTCAAGTGGTCTTAATTGCCAGAATCTAAAGGCTTTAGGCAATTaagcgca > 6:376389/1‑141 (MQ=255) cGAAAATCGGGCAGGGGCATAGTGATGACAAGTCCTTGAGATACGTTGCAGTTATAACCCTTAATGCTAGCGTTACCGTCCGCTATCGTCTATGTTCAAGTTGTCTTAATTGCCAGAATCTAACGGCTTTCGGCAATTACTCCAAAAgg > 8:392764/1‑149 (MQ=255) cGAAAATCGGGCAGAGGCATAGTGATGACAAGTCCTTGTGATACGTTGCAGTTATAACCCTTAATGCTAGCGTTACCGTCCGCTATCGTCTATGTTCAAGTTGTCTTAATTGCCAGAATCTAACGGCTTTCGGCAATTACTCCAAAAgg < 8:163508/149‑1 (MQ=255) gAAAATCGGGCAGGGGCATAGTGATGACAAGTCCTTGAGATACGTTGCAGTTATAACCCTTAATGCTAGCGTTACCGTCCGCTATCGTCTATGTTCAAGTTGTCTTAATTGCCAGAATCTAACGGCTTTCGGCAATTACTCCAAAAgg < 6:23348/148‑1 (MQ=255) gAAAATCGGGCAGGGGCATAGTGATGACAAGTCCTTGAGATACGTTGCAGTTATAACCCTTAATGCTAGCGTTACCGTCCGCTATCGTCTATGTTCAAGTTGTCTTAATTGCCAGAATCTAACGGCTTTCGGCAATTACTCCAAAAgg > 5:23348/1‑148 (MQ=255) gggCAGGGGCATAGTGATGACAAGTCCTTGAGATACGTTGCAGTTATAACCCTTAATGCTAGCGTTACCGTCCGCTATCGTCTATGTTCAAGTTGTCTTAATTGCCAGAATCTAACGGCTTTCGGCAATTACTCCAAAAGGGGGCGctc > 8:52994/1‑149 (MQ=255) gggCAGGGGCATAGTGATGACAAGTCCTTGAGATACGTTGCAGTTATAACCCTTAATGCTAGCGTTACCGTCCGCTATCGTCTATGTTCAAGTTGTCTTAATTGCCAGAATCTAACGGCTTTCGGCAATTACTCCAAAAGGGGGCGctc > 8:59300/1‑149 (MQ=255) cAGGGGCATAGTGATGACAAGTCCTTGAGATACGTTGCAGTTATAACCCCTAATGCTAGCGTTACCGTCCGCTATCGTCTATGTTCAAGTTGTCTTAATTGCCAGAATCTAACGGCTTTCGGCAAt > 7:205863/1‑126 (MQ=255) cAGGGGCATAGTGATGACAAGTCCTTGAGATACGTTGCAGTTATAACCCCTAATGCTAGCGTTACCGTCCGCTATCGTCTATGTTCAAGTTGTCTTAATTGCCAGAATCTAACGGCTTTCGGCAAt < 6:1320/126‑1 (MQ=255) cAGGGGCATAGTGATGACAAGTCCTTGAGATACGTTGCAGTTATAACCCCTAATGCTAGCGTTACCGTCCGCTATCGTCTATGTTCAAGTTGTCTTAATTGCCAGAATCTAACGGCTTTCGGCAAt < 8:205863/126‑1 (MQ=255) cAGGGGCATAGTGATGACAAGTCCTTGAGATACGTTGCAGTTATAACCCCTAATGCTAGCGTTACCGTCCGCTATCGTCTATGTTCAAGTTGTCTTAATTGCCAGAATCTAACGGCTTTCGGCAAt > 5:1320/1‑126 (MQ=255) gCATAGTGATGACAAGTCCTTGAGATACGTTGCAGTTATAACCCTTAATGCTAGCGTTACCGTCCGCTATCGTCTATGTTCAAGTTGTCTTAATTGCCAGAATCTAACGGCTTTCGGCAATTACTCCAAAAGGGGGCGCTCTCTTTTAt < 5:368494/149‑1 (MQ=255) cATAGTGATGACAAGTCCTTGAGATACGTTGCAGTTATAACCCTTAATGCTAGCGTTACCGTCCGCTATCGTCTATGTTCAAGTTGTCTTAATTGCCAGAATCTAACGGCTTTCGGCAATTACTCCAAAAGGGGGCGCTCTCTTTTAtt < 1:299476/149‑1 (MQ=255) cATAGTGATGACAAGTCCTTGAGATACGTTGCAGTTATAACCCTTAATGCTAGCGTTACCGTCCGCTATCGTCTAAGTTCAAGTTGTCTTAATTGCCAGAATCTAACGGCTTTCCTCAATTACTCCAAAATGGGTCGCTCTCTTTTAtt > 5:108901/1‑149 (MQ=255) aTAGTGATGACAAGTCCTTGAGATACGTTGCAGTTATAACCCTTAATGCTAGCGTTACCGTCCGCTATCGTCTATGTTCAAGTTGTCTTAATTGCCAGAATCTAACCGCTTTCGGCAATTACTCCAAAAGGGGGCGCTCTCTTTTAtt > 6:14190/1‑148 (MQ=255) gTGATGACAAGTCCTTGAGATACGTTGCAGTTATAACCCTTAATGCTAGCGTTACCGTCCGCTATCGTCTATGTTCAAGTTGTCTTAATTGCCAGAATCTAACGGCTTTCGGCAATTACTCCAAAAGGGGGCGCTCTCTTTTATTGAt < 2:249708/148‑1 (MQ=255) atgaCAAGTCCTTGAGATACGTTGCAGTTATAACCCTTAATGCTAGCGTTACCGTCCGCTATCGTCTATGTTc > 4:253304/1‑73 (MQ=255) atgaCAAGTCCTTGAGATACGTTGCAGTTATAACCCTTAATGCTAGCGTTACCGTCCGCTATCGTCTATGTTc < 3:253304/73‑1 (MQ=255) tgaCAAGTCCTTGAGATACGTTGCAGTTATAACCCTTAATGCTAGCGTTACCGTCCGCTATCGTCTATGTTCAAGTTGTCTTAATTGCCAGAATCTAACGGCTTTCGGCAATTACTCCAAAAGGGGGCGCTCTCTTTTATTGATCTTAc < 3:2709/149‑1 (MQ=255) gaCAAGTCCTTGAGATACGTTGCAGTTATAACCCTTAATGCTAGCGTTACCGTCCGCTATCGTCTATGtt > 8:901/1‑70 (MQ=255) aGTCCTTGAGATACGGTGCAGTTATAACCCTTAATGCTAGCGTTACCGTCCGCTATCGTCTATGTTCAAGTTGTCTTAATTGCCAGAATCTAACGGCTTTCGGCAATTACTCCAAAAGGGGGCGCTCTCTTTTATTGATCTTACGCATc < 8:120056/149‑1 (MQ=255) gTCCTTGAGATACGTTGCAGTTATAACCCTTAATGCTAGCGTTACCGTCCGCTATCGTCTATGTTCAAGTTGTCTTAATTGCCAGAATCTAACGGCTTTCGGCAATTACTCCAAAAGGGGGCGCTCTCTTTTATTGATCTTACGCATcc > 2:179695/1‑149 (MQ=255) tCCTTGAGATACGTTGCAGTTATAACCCTTAATGCTAGCGTTACCGTCCGCTATCGTCTATGTTCAAGTTGTCTTAATTGCCAGAATCTAACGGCTTTCGGCAATTACTCCAAAAGGGGGCGCTCTCTTTTATTGATCTTACGCATCCt < 6:324345/149‑1 (MQ=255) 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agaTACGTTGCAGTTATAACCCTTAATGCTAGCGTTACCGTCCGCTATCGTCTATGTTCAAGTTGTCTTAATTGCCAGAATCTAACGGCTTTCGGCAATTACTCCAAAAGGGGGCGCTCTCTTTTATTGATCTTACGCATCCTGTatga < 4:213706/149‑1 (MQ=255) gaTACGTTGCAGTTATAACCCTTAATGCTAGCGTTACCGTCCGCTATCGTCTATGTTCAAGTTGTCTTAATTGCCAGAATCTAACGGCTTTCGGCAATTACTCCAAAAGGGGGCGCTCTCTTTTATTGATCTTACGCATCCTGTatgat > 7:374619/1‑149 (MQ=255) tGCAGTTATAACCCTTAATGCTAGCGTTACCGTCCGCTATCGTCTATGTTCAAGTTGTCTTAATTGCCAGaa > 3:219188/1‑72 (MQ=255) tGCAGTTATAACCCTTAATGCTAGCGTTACCGTCCGCTATCGTCTATGTTCAAGTTGTCTTAATTGCCAGaa < 4:219188/72‑1 (MQ=255) aGTTATAACCCTTAATGCTAGCGTTACCGTCCGCTATCGTCTATGTTCAAGTTGTCTTAATTGCCAGAATCTAACGGCTTTCGGCAATTACTCCAAAAGGGGGCGCTCTCTTTTATTGATCTTACGCATCCTGTATGATGCAAGCAGAc < 2:360328/149‑1 (MQ=255) gTTATAACCCTTAATGCTAGCGTTACCGTCCGCTATCGTCTATGTTCAAGTTGTCTTAATTGCCAGAATCTAACGGCTTTCGGCAATTACTCCAAAAGGGGGCGCTCTCTTTTATTGATCTTACGCATCCTGTat < 3:124416/135‑1 (MQ=255) gTTATAACCCTTAATGCTAGCGTTACCGTCCGCTATCGTCTATGTTCAAGTTGTCTTAATTGCCAGAATCTAACGGCTTTCGGCAATTACTCCAAAAGGGGGCGCTCTCTTTTATTGATCTTACGCATCCTGTat > 4:124416/1‑135 (MQ=255) ttATAACCCTTAATGCTAGCGTTACCGTCCGCTATCGTCTATGTTCAAGTTGTCTTAATTGCCAGAATCTAACGGCTTTCGGCAATTACTCCAAAAGGGGGCGCTCTCTTTTATTGATCTTACGCATCCTGTATGATGCAAg > 7:327349/1‑142 (MQ=255) ttATAACCCTTAATGCTAGCGTTACCGTCCGCTATCGTCTATGTTCAAGTTGTCTTAATTGCCAGAATCTAACGGCTTTCGGCAATTACTCCAAAAGGGGGCGCTCTCTTTTATTGATCTTACGCATCCTGTATGATGCAAg < 8:327349/142‑1 (MQ=255) ccTTAATGCTAGCGTTACCGTCCGCTATCGTCTATGTTCAAGTTGTCTTAATTGCCAGAATCTAACGGCTTTCGGCAATTACTCCAAAAGGGGGCGCTCTCTTTTATTGATCTTACGCATCCTGTATGATGCAAGCAGACTAACCCTAt > 2:3938/1‑149 (MQ=255) ccTTAATGCTAGCGTTACCGTCCGCTATCGTCTATGTTCAAGTTGTCTTAATTGCCAGAATCTAACGGCTTTCGGCAATTACTCCAAAAGGGGGCGCTCTCTTTTATTGATCTTACGCATCCTGTATGATGCAAGCAGACTAACCCTAt > 4:225280/1‑149 (MQ=255) | ATCCGGGCTTTTGCCAGGACCTTTGGGCGTGGTAACGGAACAGGCAGTGAGCACAAGAGCAGCCAGCGGTAGCAGGCGGATAAGACGAAAATCGGGCAGGGGCATAGTGATGACAAGTCCTTGAGATACGTTGCAGTTATAACCCTTAATGCTAGCGTTACCGTCCGCTATCGTCTATGTTCAAGTTGTCTTAATTGCCAGAATCTAACGGCTTTCGGCAATTACTCCAAAAGGGGGCGCTCTCTTTTATTGATCTTACGCATCCTGTATGATGCAAGCAGACTAACCCTAT > NC_000913/1263396‑1263687 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |