| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,130,410 | T→C | 5.5% | S157G (AGC→GGC) | wcaD ← | putative colanic acid polymerase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,130,410 | 0 | T | C | 5.5% | 225.5 / 2.9 | 74 | S157G (AGC→GGC) | wcaD | putative colanic acid polymerase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (33/36); new base C (2/2); total (36/38) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.79e-01 | |||||||||||
TCATAGCATCTGTTTTAGGCGTTTTGATACCAAACTGTTTGATGCTGAGCCAAATTGAGATTAATGCCAGAGCGAAAAATGCCGGTTCGAAATAAAGTGCTGTCGTGCGCTTGCCGCCGAATTTAATGAAATTCAGCACATAGCTGTTGCTGTAAATCAGATATTTCGAAATCGACTCCATAATACTGCTGCCACCGGTGAGGATAATTTGTGCCATCTCCACCGCCGCCAGCGCCACCACCAGCCCGACCACCAGATAAAAGAAACGTAATATCTTGCGATGGTTGTGTGG > NC_000913/2130266‑2130557 | tCATAGCATCTGTTTTAGGCGTTTTGATACCAAACTGTTTGATGCTGAGCCAAATTGAGATTAATGCCAGAGCGAAAAATGCCGGTTCGAAATAAAGTGCTGTCGTGCGCTTGCCGCCGAATTTAATGAAATTCAGCACATAGCTGTTg < 1:348895/149‑1 (MQ=255) cATAGCATCTGTTTTAGGCGTTTTGATACCAAACTGTTTGATGCTGAGCCAAATTGAGATTAATGCCAGAGCGAAAAATGCCGGTTCGAAATAAATTGATGTCGTGCGCTTGCCGCCGAATTTAATGAAATTCATCACATAGCTGTTGc > 1:76858/1‑149 (MQ=255) aTAGCATCTGTTTTAGGCGTTTTGATACCAAACTGTTTGATGCTGAGCCAAATTGAGATTAATGCCAGAGCGAAAAATGCCGGTTCGAAATAAAGTGCTGTCGTGCGCTTGCCGCCGAATTTAATGAAATTCAGCACATAGCTGTTGCt > 1:192059/1‑149 (MQ=255) tGTTTTAGGCGTTTTGATACCAAACTGTTTGATGCTGAGCCAAATTGAGATTAATGCCAGAGCGAAAAATGCCGGTTCGAAATAAAGTCCTGTCTTGCGCTTGCCGCCGAATTTAATGAAATTCAGCACATAGCTGATGATCTAAAt > 4:19837/1‑147 (MQ=255) ttttAGGCGTTTTGATACCAAACTGTTTGATGCTGAGCCAAATTGAGATTAATGCCAGAGCGAAAAATGCCGGTTCGAAATAAAGTGCTGTCGTGCGCTTGCCGCCGAATTTAATGAAATTCAGCACATAGCTGTTGCTGTAAATCa < 8:102100/147‑1 (MQ=255) ttAGGCGTTTTGATACCAAACTGTTTGATGCTGAGCCAAATTGAGATTAATGCCAGAGCGAAAAATGCCGGTTCGAAATAAAGTGCTGTCGTGCGCTTGCCGCCGAATTTAATGAAATTCAGCACATAGCTGTTGCTGTAAATCAGata > 4:346212/1‑149 (MQ=255) ttGCTACCAAACTGTTTGATGCTGAGCCAAATTGAGATTAATGCCAGAGCGAAAAATGCCGGTTCGAAATAAAGTGCTGTCGTGCGCTTGCCGCCGAATTTAATGAAATTCAGCACATAGCTGTTGCTGTAAATCAGATATTTCGaaa < 5:110939/148‑1 (MQ=255) ttGATACCAAACTGTTTGATGCTGAGCCAAATTGAGATTAATGCCAGAGCGAAAAATGCCGGTTCGAAATAAAGTGCTGTCGTGCGCTTGCCGCCGAATTTAATGAAATTCAGCACATAGCTGTTGCTGTAAATCAGATATTTCGaaa < 2:33295/148‑1 (MQ=255) tGATACCAAACTGTTTGATGCTGAGCCAAATTGAGATTAATGCCAGAGCGAAAAATGCCGGTTCGAAATAAAGTGCTGTCGTGCGCTTGCCGCCGAATTTAATGAAATTCAGCACATAGCTGTTGCTGTAAATCAGATATTTCGAAAt < 7:35519/148‑1 (MQ=255) aTACCAAACTGTTTGATGCTGAGCCAAATTGAGATTAATGCCAGAGCGAAAAATGCCGGTTCGAAATAAAGTGCTGTCGTGCGCTTGCCGCCGAATTTAATGAAATTGAGCACATAGCTGt > 6:163857/1‑121 (MQ=255) aTACCAAACTGTTTGATGCTGAGCCAAATTGAGATTAATGCCAGAGCGAAAAATGCCGGTTCGAAATAAAGTGCTGTCGTGCGCTTGCCGCCGAATTTAATGAAATTGAGCACATAGCTGt < 5:163857/121‑1 (MQ=255) aCCAAACTGTTTGATGCTGAGCCAAATTGAGATTAATGCCAGAGAGAAAAATGCCGGTTCGAAATAAAGTGCTGTCGTGCGCTTGCCGCCGAATTTAATGAAATTCAGCACATAGCTGTTGCTGTAAATCAGATATTTCGAAATCGACt > 1:168949/1‑149 (MQ=255) aCCAAACTGTTTGATGCTGAGCCAAATTGAGATTAATGCAAGAGCGAAAAATGCCGGTTCGAAATAAAGTGCTGTCGTGCGCTTGCCGCCGAATTTAATGAAATTCAGCACATAGCTGTTGCTGTAAATCAGATATTTCGAAATCGACt > 8:172916/1‑149 (MQ=255) cAAACTGTTTGATGCTGAGCCAAATTGAGATTAATGCCAGAGCGAAAAATGCCGGTTCGAAATAAAGTGCTGTCGTGCGCTTGCCGCCGAATTTAATGAAATTCAGCACATAGCTGTTGCTGTAAATCAGATATTTCGAAATCGACTc < 1:171871/148‑1 (MQ=255) cAAACTGTTTGATGCTGAGCCAAATTGAGATTAATGCCAGAGCGAAAAATGCCGGTTCGAAATAAAGTGCTGTCGTGCGCTTGCCGCCGAATTTAATGAAATTCAGCACATAGCTGTTGCTGTAAATCAGATATTTCGAAATCGACTc > 2:237082/1‑148 (MQ=255) cAAACTGTTTGATGCTGAGCCAAATTGAGATTAATGCCAGAGCGAAAAATGCCGGTTCGAAATAAAGTGCTGTCGTGCGCTTGCCGCCGAATTTAATGAAATTCAGCACATAGCTGTTGCTGTAAATCAGATATTTCGAAATCGACTc > 2:171871/1‑148 (MQ=255) cAAACTGTTTGATGCTGAGCCAAATTGAGATTAATGCCAGAGCGAAAAATGCCGGTTCGAAATAAAGTGCTGTCGTGCGCTTGCCGCCGAATTTAATGAAATTCAGCACATAGCTGTTGCTGTAAATCAGATATTTCGAAATCGACTc > 5:146896/1‑148 (MQ=255) aaaCTGTTTGATGCTGAGCCAAATTGAGATTAATGCCAGAGCGAAAAATGGCGGTTCGAAATAAAGTGCTGTCGTGCGCTTGCCGCCGAATTTAATGAAATTCAGCACATAGCTGTTGCTGTAAATCAGATATTTCGAAATCGACTCCa < 4:323204/149‑1 (MQ=255) aaaCTGTTTGATGCTGAGCCAAATTGAGATTAATGCCAGAGCGAAAAATGCCGGTTCGAAATAAAGTGCTGTCGTGCGCTTGCCGCCGAATTTAATGAAATTCAGCACATAGCTGTTGCTGTAAATCAGATATTTCGaaa > 4:124483/1‑140 (MQ=255) aaaCTGTTTGATGCTGAGCCAAATTGAGATTAATGCCAGAGCGAAAAATGCCGGTTCGAAATAAAGTGCTGTCGTGCGCTTGCCGCCGAATTTAATGAAATTCAGCACATAGCTGTTGCTGTAAATCAGATATTTCGaaa < 3:124483/140‑1 (MQ=255) aaCTGTTTGATGCTGAGCCAAATTGAGATTAATGCCAGAGCGAAAAATGCCGGTTCGAAGTAAAGTGCTGTCGTGCGCTTGCCGCCGAATTTAATGAAATTCAGCACATAGCTGTTGCTGTAAATCAGATATTTCGAAATCGACTCCa > 3:369360/1‑148 (MQ=255) aaCTGTTTGATGCTGAGCCAAATTGAGATTAATGCCAGAGCGAAAAATGCCGGTTCGAAATAAAGTGCTGTCGTGCGCTTGCCGCCGAATTTAATGAAATTCAGCACATAGCTGTTGCTGTAAATCAGATATTTc > 3:265148/1‑135 (MQ=255) aaCTGTTTGATGCTGAGCCAAATTGAGATTAATGCCAGAGCGAAAAATGCCGGTTCGAAATAAAGTGCTGTCGTGCGCTTGCCGCCGAATTTAATGAAATTCAGCACATAGCTGTTGCTGTAAATCAGATATTTc < 4:265148/135‑1 (MQ=255) aaCTGTTTGATGCTGAGCCAAATTGAGATTAATGCCAGAGCGAAAAATGCCGGTTCGAAATAAAGTGCTGTCGTGCGCTTGCCGACGAATTTAATGAAATTCAGCACATAGCTGTTGCTGTAAATCAGATATTTCGAAATCGACTCCat < 1:302265/149‑1 (MQ=255) gTTTGATGCTGAGCCAAATTGAGATTAATGCCAGAGCGAAAAATGCCGGTTCGAAATAAAGTGCTGTCGCGCGCTTGCCGCCGAATTTAATGAAATTCAGCACATAGCTGTTGCTGTAAATCAGATATTTCGAAATCGACTCCa < 4:285281/144‑1 (MQ=255) gTTTGATGCTGAGCCAAATTGAGATTAATGCCAGAGCGAAAAATGCCGGTTCGAAATAAAGTGCTGTCGAGCGCTTGCCGCCGAATTTAATGAAATTCAGCACATAGCTGTTGCTGTAAATCAGATATTTCGAAATCGACTCCa > 3:285281/1‑144 (MQ=255) tGATGCTGAGCCAAATTGAGATTAATGCCAGAGCGAAAAATGCCGGTTCGAAGTAAAGTGCTGTCGTGCGCTTGCCGCCGAATTTAATGAAATTCAGCACATAGCTGTTGCTGTAAATCAGATATTTCGAAATCGACTCCATAATAct < 4:369360/148‑1 (MQ=255) tGATGCTGAGCCAAATTGAGATTAATGCCAGAGCGAAAAATGCCGGTTCGAAATAAAGTGCTGTCGTGCGCTTGCCGCCGAATTTAATGAAATTCAGCACATAGCTGTTGCTGTAAATCAGATATTTCGAAATCGACTCCATAATAct < 5:140498/148‑1 (MQ=255) aTGCTGAGCCAAATTGAGATTAATGCCAGAGCGAAAAATGCCGGTTCGAAATAAAGTGCTGTCGTGCGCTTGCCGCCGAATTTAATGAAATTCAGCACATAGCTGTTGCTGTAAATCAGATATTTCGAAATCGACTCCATAATActgct < 8:16625/149‑1 (MQ=255) aTGCTGAGCCAAATTGAGATTAATGCCAGAGCGAAAAATGCCGGTTCGAAATAAAGTGCTGTCGTGCGCTTGCCGCCGAATTTAATGAAATTCAGCACATAGCTGTTGCTGAAAATCAGATATTTCGAAATCGACTCCATAATActgct < 1:237082/149‑1 (MQ=255) aaTTGAGATTAATGCCAGAGCGAAAAATGCCGGTTCGAAATAAAGTGCTGTCGTGCGCTTGCCGCCGAATTTAATGAAATTCAGCACATAGCTGTTGCTGTAAATCAGATATTTCGAAATCGACTCCATAATACTGCTGCCACCGGTGa < 2:168949/149‑1 (MQ=255) ttGAGATTAATGCCAGAGCGAAAAATGCCGGTTCGAAATAAAGTGCTGTCGTGCGCTTGCCGCCGAATTTAATGAAATTCAGCACATAGCTGTTGCTGTAAATCAGATATTTCGAAATAGACTCCATAATACTGCTGCCACCGGTGAg > 4:10464/1‑148 (MQ=255) agaTTAATGCCAGAGCGAAAAATGCCGGTTCGAAATAAAGTGCTGTCGTGCGCTTGCCGCCGAATTTAATGAAATTCAGCACATAGCTGTTGCTGTAAATCAGATATTTCGAAATCGACTCCATAATACTGCTGCCACCGGTGAGGAt > 3:251693/1‑148 (MQ=255) gaTTAATGCCAGAGCGAAAAATGCCGGTTCGAAATAAAGTGCTGTCGTGCGCTTGCCGCCGAATTTAATGAAATTCAGCACATAGCTGTTGCTGTAAATCAGATATTTCGAAATCGACTCCATAATACTGCTGCCACCGGTGAGGATaa > 5:111094/1‑149 (MQ=255) aTGCCAGAGAGAAAAATGCCGGTTCGAAATAAAGTGCTGTCGTGCGCTTGCCGCCGAATTTAATGAAATTCAGCACTTAGCTGTTGCTGTAAATCAGATATTTCGAAATCGACTCCATAATACTGCTGCCACCGGTGAGGATAATTtgt < 3:19837/149‑1 (MQ=255) tGCCAGAGCGAAAAATGCCGGTTCGAAATAAAGTGCTGTCGTGCGCTTGCCGCCGAATTTAATGAAATTCAGCACATAGCTGTTGCTGTAAATCAGATATTTCGAAATCGACTCCATAATACTGCTGCCACCGGTGAGGATAATTtgtg > 6:218118/1‑149 (MQ=255) ccAGAGCGAAAAATGCCGGTTCGAAATAAAGTGCTGTCGTGCGCTTGCCGCCGAATTTAATGAAATTCAGCACATAGCTGTTGCTGTAAATCAGATATTTCGAAATCGACTCCATAATACTGCTGCCACCGGTGAGGATAATTTGTGc < 6:111094/148‑1 (MQ=255) agagCGAAAAATGCCGGTTCGAAATAAAGTGCTGTCGTGCGCTTGCCGCCGAATTTAATGAAATTCAGCACATAGCCGTTGCTGTAAATCAGATATTTCGAAATCGACTCCATAATACTGCTGCCACCGGTGAGGATAAttt < 3:242400/142‑1 (MQ=255) agagCGAAAAATGCCGGTTCGAAATAAAGTGCTGTCGTGCGCTTGCCGCCGAATTTAATGAAATTCAGCACATAGCCGTTGCTGTAAATCAGATATTTCGAAATCGACTCCATAATACTGCTGCCACCGGTGAGGATAAttt > 4:242400/1‑142 (MQ=255) aaaaaTGGCGGTTCGAAATAAAGTGCTGACGTGCGCGTGCCGCCGAATTTAATGAAATTCAGCACATAGCTGTTGCTGTAAATCAGATATTTAGAAATCGACTCCATAATACTGCTGCCACCGGTGATGATAATTTGTGCCATCTCCAc > 2:267707/1‑149 (MQ=255) aaaTGCCGGTTCGAAATAAAGTGCTGTCGTGCGCTTGCCGCCGAATTTAATGAAATTCAGCACATAGCTGTTGCTGTAAATCAGATATTTCGAAATCGACTCCATAATACTGCTGCCACCGGTGAGGATAATTTGTGCCATCTCCAccg > 5:272748/1‑149 (MQ=255) tGCCGGTTCGAAATAAAGTGCTGTCGTGCGCTTTCCGCCGAATTTAATGAAATTCAGCACATAGCTGTTGCTGTAAATCAGATATTTCGAAATCGACTCCATAATACTGCTGCCACCGGTGAGGATAATTTGTGCCATCTCCAccgccg < 2:76858/149‑1 (MQ=255) gTTCGAAATAAAGTGCTGTCGTGCGCTTGCCGCCGAATTTAATGAAATTCAGCACATAGCTGTTGCTGTAAATCAGATATTTCGAAATCGACTCCATAATACTGCTGCCACCGGTGAGGATAATTTGTGCCATCTCCACCGCCGCCAgc < 1:182564/149‑1 (MQ=255) gTTCGAAATAAAGTGCTGTCGTGCGCTTGCCGCCGAATTTAATGAAATTCAGCACATAGCTGTTGCTGTAAATCAGATATTTCGAAATCGACTCCATAATACTGCTGCCACCGGTGAGGATAATTTGTGCCATCTCCACCGCCGCCAgc > 1:56880/1‑149 (MQ=255) gTTCGAAATAAAGTGCTGTCGTGCGCATCCCGCCGAATTTAATGAAATTCAGCACATAGCAGTTGCTGAAAATCAGATATTTCGAAATCGACTCCATAATACAGCTGCCACCGGAGAGGATAATTTGTGCCATCTCCACCGCCGCCAgc > 6:228127/1‑149 (MQ=255) tGCTGTCGTGCGCTTGCCGCCGAATTTAATGAAATTCAGCACATAGCTGTTGCTGTAAATCAGATATTTCGAAATCGACTCCATAATACTGCTGCCACCGGTGAGGATAATTTGTGCCATCTCCACCGCCGCCAGCGCCACCACCAGcc < 1:301844/149‑1 (MQ=255) tGCTGTCGTGCGCTTGCCGCCGAATTTAATGAAATTCAGCACATAGCTGTTGCTGTAAATCAGATATTTCGAAATCGACTCCATAATACTGCTGCCACCGGTGAGGATAATTTGTGCCATCTCCACCGCCGCCAGCGCCACCACCAGcc < 1:226097/149‑1 (MQ=255) cTGTCGTGCGCTTGCCGCCGAATTTAATGAAATTCAGCACATAGCTGTTGCTGTAAATCAGATATTTCGAAATCGACTCCATAATACTGCTGCCACCGGTGa > 8:209719/1‑102 (MQ=255) cTGTCGTGCGCTTGCCGCCGAATTTAATGAAATTCAGCACATAGCTGTTGCTGTAAATCAGATATTTCGAAATCGACTCCATAATACTGCTGCCACCGGTGa < 7:209719/102‑1 (MQ=255) gTGCGCTTGCCGCCGAATTTAATGAAATTCAGCACATAGCTGTTGCTGTAAATCAGATATTTCGAAATCGACTCCATAATACTGCTGCCACCGGTGAGGATAATTTGTGCCATCTCCACCGCCGCCAGCGCCACCACCAGCCCGaccac < 3:346212/149‑1 (MQ=255) gTGCGCTTGCCGCCGAATTTAATGAAATTCAGCACATAGCTGTTGCTGTAAATCAGATATTTCGAAATCGACTCCATAATACTGCAGCCACCGGTGAGGATAATTTGTGCCATCTCCACCGCCGCCAGCGCCACCACCAGCCCGaccac > 1:359234/1‑149 (MQ=255) cgcTTGCCGCCGAATTTAATGAAATTCAGCACATAGCTGTTGCTGTAAATCAGATATTTCGAAATCGACTCCATAATACTGCTGCCACCGGTGAGGATAATTTGTGCCATCTCCACCGCCGCCAGCGCCACCACCAGCCCGAccacca < 7:172916/148‑1 (MQ=255) cgcTTGCCGCCGAATTTAATGAAATTCAGCACATAGCTGTTGCTGTAAATCAGATATTTCGAAATCGACTCCATAATACTGCTGCCACCGGTGAGGATAATTTGTGCCATCTCCACCGCCGCCAGCGCCACCACCAGCCCGAccacca < 7:126174/148‑1 (MQ=255) cgcTTGCCGCCGAATTTAATGAAATTCAGCACATAGCTGTTGCTGTAAATCAGATATTTCGAAATAGACTCCATAATACTGCTGCCACCGGTGAGGATAATTTGTGCCATCTCCACCGCCGCCAGCGCCACCACCAGCCCGAccacca < 3:10464/148‑1 (MQ=255) gcTTGCCGCCGAATTTAATGAAATTCAGCACATAGCTGTTGCTGTAAATCAGATATTTCGAAATCGACTCCATAATACTGCTGCCACCGGTGAGGATAATTTGTGCCATCTCCACCGCCGCCAGCGCCACCACCAGCCCGaccac > 6:150695/1‑145 (MQ=255) ttGCCGCCGAATTTAATGAAATTCAGCACATAGCTGTTGCTGTAAATCAGATATTTCGAAATCGACTCCATAATACTGCTGCCACCGGTGAGGATAATTTGTGCCATCTCCACCGCCGCCAGCGCCACCACCAGCCCGACCACCAGAt > 2:106539/1‑148 (MQ=255) ccgccgAATTTAATGAAATTCAGCACATAGCTGTTGCTGTAAATCAGATATTTCGAAATCGACTCCATAATACTGCTGCCACCGGTGAGGATAATTTGTGCCATCTCCACCGCCGCCAGCGCCACCACCAGCCCGACCACCAGATaaaa < 8:213854/149‑1 (MQ=255) cgccgAATTTAATGAAATTCAGCACATAGCTGTTGCTGTAAATCAGATATTTCGAAATCGACTCCATAATACTGCTGCCACCGGTGAGGATAATTTGTGCCATCTCCACCGCCGCCAGCGCCACCACCAGCCCGACCACCAGATAAAAg < 2:56880/149‑1 (MQ=255) cgAATTTAATGAAATTCAGCACATAGCTGTTGCTGTAAATCAGATATTTCGAAATCGACTCCATAATACTGCTGCCACCGGTGAGGATAATTTGTGCCATCTCCACCGCCGCCAGCGCCACCACCAGCCCGACCACCAGAt > 1:237422/1‑141 (MQ=255) cgAATTTAATGAAATTCAGCACATAGCTGTTGCTGTAAATCAGATATTTCGAAATCGACTCCATAATACTGCTGCCACCGGTGAGGATAATTTGTGCCATCTCCACCGCCGCCAGCGCCACCACCAGCCCGACCACCAGAt < 2:237422/141‑1 (MQ=255) tAATGAAATTCAGCACATAGCTGTTGCTGTAAATCAGATATTTCGAAATCGACTCCATAATACTGCTGCCACCGGTGAGGATAATTTGTGCCATCTCCACCGCCGCCAGCGCCACCACCAGCCCGACCACCAGATAAAAGaa > 7:305256/1‑142 (MQ=255) tAATGAAATTCAGCACATAGCTGTTGCTGTAAATCAGATATTTCGAAATCGACTCCATAATACTGCTGCCACCGGTGAGGATAATTTGTGCCATCTCCACCGCCGCCAGCGCCACCACCAGCCCGACCACCAGATAAAAGaa < 8:305256/142‑1 (MQ=255) tGAAATTCAGCACATAGCTGTTGCTGTAAATCAGATATTTCGAAATCGACTCCATAATACTGCTGCCACCGGTGAGGATAATTTGTGCCATCTCCACCGCCGCCAGCGCCACCACCAGCCCGACCACCAGATAAAAGAAACGTAATATc > 3:248602/1‑149 (MQ=255) gAAATTCAGCACATAGCTGTTGCTGTAAATCAGATATTTCGAAATCGACTCCATAATACTGCTGCCACCGGTGAGGATAATTTGTGCCATCTCCACCGCCGCCAGCGCCACCACCAGCCCGACCACCAGATAAAAGAAACGTAATATCt > 6:324937/1‑149 (MQ=255) ttCAGCACATAGCTGTTGCTGTAAATCAGATATTTCGAAATCGACTCCATAATACTGCTGCCACCGGTGAGGATAATTTGTGCCATCTCCACCGCCGCCAgc < 1:312363/102‑1 (MQ=255) ttCAGCACATAGCTGTTGCTGTAAATCAGATATTTCGAAATCGACTCCATAATACTGCTGCCACCGGTGAGGATAATTTGTGCCATCTCCACCGCCGCCAgc > 2:312363/1‑102 (MQ=255) gCACATAGCTGTTGCTGTAAATCAGATATTTCGAAATCGACTCCATAATACTGCTGCCACCGGTGAGGATAATTTGTGCCATCTCCACCGCCGCCAGCGCCACCACCAGCCCGACCACCAGATAAAAGAAACGTAATATCTTGCGATgg < 5:218118/149‑1 (MQ=255) gCACATAGCTGTTGCTGTAAATCAGATATTTCGAAATCGACTCCATAATACTGCTGCCACCGGTGAGGATAATTTGTGCCATCTCCACCGCCGCCAGCGCCACCACCAGCCCGACCACCAGATAAAAGAAACGTAATATCTTGCGATgg < 2:192059/149‑1 (MQ=255) cacaTAGCTGTTGCTGTAAATCAGATATTTCGAAATCGACTCCATAATACTGCTGCCACCGGTGAGGATAATTTGTGCCATCTCCACCGCCGCCAGCGCCCCCACCAGCCCGACCCCCAGATAAAAGAAACGTAATATCTTGCGATGGt > 2:320804/1‑149 (MQ=255) cacaTAGCTGTTGCTGTAAATCAGATATTTCGAAATCGACTCCATAATACTGCTGCCACCGGTGAGGATAATTTGTGCCATCTCCACCGCCGCCAGCGCCACCACCAGCCCGACCACCAGATAAAAGAAACGTAATATCTTGCGATGGt > 4:149634/1‑149 (MQ=255) acaTAGCTGTTGCTGTAAATCAGATATTTCGAAATCGACTCCATAATACTGCTGCCACCGGTGAGGATAATTTGTGCCATCTCCACCGCCGCCAGCGCCACCACCAGCCCGACCACCAGATAAAAGAAACGTAATATCTTGCGATGGtt < 5:324937/149‑1 (MQ=255) aTAGCCGTTGCTGTAAATCAGATATTTCGAAATCGACTCCATAATACTGCTGCCACCGGTGAGGATAATTTGTGCCATCTCCACCGCCGCCAGCGCCACCACCAGCCCGACCACCAGATAAAAGaaa < 7:82253/127‑1 (MQ=255) aTAGCCGTTGCTGTAAATCAGATATTTCGAAATCGACTCCATAATACTGCTGCCACCGGTGAGGATAATTTGTGCCATCTCCACCGCCGCCAGCGCCACCACCAGCCCGACCACCAGATAAAAGaaa > 8:82253/1‑127 (MQ=255) cTGTTGCTGTAAATCAGATATTTCGAAATCGACTCCATAATACTGCTGCCACCAGTGAGGATAATTTGTGCCATCTCCACCGCCGCCAGCGCCACCACCAGCCCGACCACCAGATAAAAGAAACGTAATATCTTGCGATGGTTGTGTgg > 1:363221/1‑149 (MQ=255) | TCATAGCATCTGTTTTAGGCGTTTTGATACCAAACTGTTTGATGCTGAGCCAAATTGAGATTAATGCCAGAGCGAAAAATGCCGGTTCGAAATAAAGTGCTGTCGTGCGCTTGCCGCCGAATTTAATGAAATTCAGCACATAGCTGTTGCTGTAAATCAGATATTTCGAAATCGACTCCATAATACTGCTGCCACCGGTGAGGATAATTTGTGCCATCTCCACCGCCGCCAGCGCCACCACCAGCCCGACCACCAGATAAAAGAAACGTAATATCTTGCGATGGTTGTGTGG > NC_000913/2130266‑2130557 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |