| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 420,361 | C→T | 5.6% | V257V (GTC→GTT) | brnQ → | branched‑chain amino acid transport system 2 carrier protein; LIV‑II transport system for Ile, Leu, and Val |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 420,361 | 0 | C | T | 5.6% | 226.8 / 2.7 | 71 | V257V (GTC→GTT) | brnQ | branched‑chain amino acid transport system 2 carrier protein; LIV‑II transport system for Ile, Leu, and Val |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (30/37); new base T (2/2); total (32/39) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.41e-01 | |||||||||||
TTATTGTTAACGCGGCGCGTTCTCGTGGCGTTACCGAAGCGCGTCTGCTGACCCGTTATACCGTCTGGGCTGGCCTGATGGCGGGTGTTGGTCTGACTCTGCTGTACCTGGCGCTGTTCCGTCTGGGGTCAGACAGCGCGTCGCTGGTCGATCAGTCTGCAAACGGCGCTGCTATTCTGCATGCTTACGTTCAGCACACCTTTGGCGGCGGCGGTAGCTTCCTGCTGGCGGCGTTAATCTTCATCGCCTGCCTGGTAACGGCAGTTGGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTT > NC_000913/420213‑420508 | ttATTGTTAACGCGGCGCGTTCTCGTGGCGTTACCGAAGCGCGTCTGCTGACCCGTTATACCGTCTGGGCTGGCCTGATGGCGGGTGTTGGTCTGACTCTGCTGTACCTGGCGCTGTTCCGTCTGGGGTCAGACGGCGCGTCGCTGGTc > 7:208213/1‑149 (MQ=255) ttGTTAACGCGGCGCGTTCTCGTGGCGTTACCGAAGCGCGTCTGCTGACCCGTTATACCGTCTGGGCTGGCCTGATGGCGGGTGTTGGTCTGACTCTGCTGTACCTGGCGCTGTTCCGTCTGGGGTCAGACAGCGCGTCGCTGGTCGa < 6:305975/148‑1 (MQ=255) ttGTTAACGCGGCGCGTTCTCGTGGCGTTACCGAAGCGCGTCTGCTGACCCGTTATACCGTCTGGGCTGGCCTGATGGCGGGTGGTGGTCTGACTCTGCTGTACCTGGCGCTGTTCCGTCTGGGGTCAGACAGCGCGTCGCTGGTCGAt < 4:48788/149‑1 (MQ=255) tGTTAACGCGGCGCGTTCTCGTGGCGTTACCGAAGCGCGTCTGCTGACCCGTTATACCGTCTGGGCTGGCCTGATGGCGGGTGTTGGTCTGACTCTGCTGTACCTGGCGCTGTTCCGTCTGGGGTCAGACAGCGCGTCGCTGGTCGAt > 5:308577/1‑148 (MQ=255) gTTAACGCGGCGCGTTCTCGTGGCGTTACCGAAGCGCGTCTGCTGACCCGTTATACCGTCTGGGCTGGCCTGATGGCGGGTGTTGGTCTGACTCTGCTGTACCTGGCGCTGTTCCGTCTGGGGTCAGACAGCGCGTCGCTGGTCGATc < 2:217304/148‑1 (MQ=255) tAACGCGGCGCGTTCTCGTGGCGTTAACGAAGCGCGTCTGCTGACCCGTTATACAGTCTGGGCTGGCCTGATGGCGGGTGTTGGTCTGACTCTGCTGTACCTGGCGCTGTTCCGTCTGGGGTCAGACAGCGCGTCTCTGGTCGCTCAGt > 1:361883/1‑149 (MQ=255) aaCGCGGCGCGTTCTCGTGGCGTTACCGAAGCGCGTCTGCTGACCCGTTATACCGTCTGGGCTGGCCTGATGGCGGGTGTTGGTCTGACTCTGCTGTACCTGGCGCTGTTCCGTCTGGGGTCAGACGGCGCGTCGCTGGTCGATCAGt < 8:208213/148‑1 (MQ=255) aaCGCGGCGCGTTCTCGTGGCGTTACCGAAGCGCGTCTGCTGACCCGTTATACCGTCTGGGCTGGCCTGATGGCGGGTGTTGGTCTGACTCTGCTGTACCTGGCGCTGTTCCGTCTGGGGTCAGACAGCGCGTCGCTGGTCGATCAGTc > 3:339272/1‑149 (MQ=255) aCGCGGCGCGTTCTCGTGGCGTTACCGAAGCGCGTCTGCTGACCCGTTATACCGTCTGGGCTGGCCTGATGGCGGGTGTTGGTCTGACTCTGCTGTACCTGGCGCTGTTCCGTCTGGGGTCAGACAGCGCGTCGCTGGTCGATCAGTCt > 2:169712/1‑149 (MQ=255) cgcgGCGCGTTCTCGTGGCGTTACCGAAGCGCGTCTGCTGACCCGTTATACCGTCTGGGCTGGCCTGATGGCGGGTGTTGGTCTGACTCTGCTGTACCTGGCGCTGTTCCGTCTGGGGTCAGACAGCGCGTCGCTGGTCGATCAGTCTg > 1:393911/1‑149 (MQ=255) gcgcGTTCTCGTGGCGTTACCGAAGCGCGTCTGCTGACCCGTTATACCGTCTGGGCTGGCCTGATGGCGGGTGTTGGTCTGACTCTGCTGTACCTGGCGCTGTTCCGTCTGGGGTCAGACAGCGCGTCGCTGGTCGATCAGTCTGCaaa < 5:199081/149‑1 (MQ=255) cgcgTTCTCGTGGCGTTACCGAAGCGCGTCTGCTGACCCGTTATACCGTCTGGGCTGGCCTGATGGCGGGTGTTGGTCTGACTCTGCTGTACCTGGCGCTGTTCCGTCTGGGGTCAGACAGCGCGTCGCTGGTTGATCAGTCTGCAAAc > 5:18774/1‑149 (MQ=255) cgTTCTCGTGGCGTTACCGAAGCGCGTCTGCTGACCCGTTATACCGTCTGGGCTGGCCTGATGGCGGGTGTTGGTCTGACTCTGCTGTACCTGGCGCTGTTCCGTCTGGGGTCAGACAGCGCGTCGCTGGTCGATCAGTCTGCAAACgg < 4:93287/149‑1 (MQ=255) gTGGCGTTACCGAAGCGCGTCTGCTGACCCGTTATACCGTCTGGGCTGGCCTGATGGCGGGTGTTGGTCTGACTCTGCTGTACCTGGCGCTGTTCCGTCTGGGGTCAGACAGCGCGTCGCTGGTCGATCAGTCTGCAAACGGCgctgct > 2:44225/1‑149 (MQ=255) gTTACCGAAGCGCGTCTGCTGACCCGTTTTACCGTCTGGGCTGGCCTGATGGCGGGTGTGGGTCTGACTCTGCTGTACCTGGCGCTGTTCCGTCTGGGGGCAGACAGCGCGTCGCTGGTCGATCAGGCTGCAAACGGCGCTGCTATTCt < 2:240490/149‑1 (MQ=255) gTTACCGAAGCGCGTCTGCTGACCCGTTATACCGTCTGGGCTGGCCTGATGGCGGGTGTTGGTCTGACTCTGCTGTACCTGGCGCTGTTCCGTCTGGGGTCAGACAGCGCGTCGCTGGTCGATCAGTCTGCAAACGGCGCTGCTATTCt < 1:156466/149‑1 (MQ=255) gTTACCGAAGCGCGTCTGCTGACCCGTTATACCGTCTGGGCTGGCCTGATGGCGGGTGTTGGTCTGACTCTGCTGTACCTGGCGCTGTTCCGTCTGGGGTCAGACAGCGCGTCGCTGGTCGATCAGTCTGCAAACGGCGCTGCTATTCt < 8:204524/149‑1 (MQ=255) ttACCGAAGCGCGTCTGCTGACCCGTTATACCGTCTGGGCTGGCCTGATGGCGGGTGTTGGTCTGACTCTGCTGTACCTGGCGCTGTTCCGTCTGGGGTCAGACAGCGCGTCGCTGGTCGATCAGTCTGCAAACGGCGCTGCTATTCTg > 5:37246/1‑149 (MQ=255) aCCGAAGCGCGTCTGCTGACCCGTTATACCGTCTGGGCTGGCCTGATGGCGGGTGTTGGTCTGACTCTGCTGTACCTGGCGCTGTTCCGTCTGGGGTCAGACAGCGCGTCGCTGGTCGATCAGTCTGCAAACGGCGCTGCTATTCTGCa > 4:166165/1‑149 (MQ=255) ccGAAGCGCGTCTGCTGACCCGTTATACCGTCTGGGCTGGCCTGATGGCGGGTGTTGGTCTGACTCTGCTGTACCTGGCGCTGTTCCGTCTGGGGTCAGACAGCGCGTCGCTGGTCGATCAGTCTGCAAACGGCGCTGCTATTCTGCAt < 6:37246/149‑1 (MQ=255) ccGAAGCGCGTCTGCTGACCCGTTATACCGTCTGGGCTGGCCTGATGGCGGGTGTTGGTCTGACTCTGCTGTACCTGGCGCTGTTCCGTCTGGGGTCAGACAGCGCGTCGCTGGTCGATCAGTCTGCAAACGGCGCTGCTATTCTGCAt < 2:283342/149‑1 (MQ=255) cGAAGCGCGTCTGCTGACCCGTTATACCGTCTGGGCTGGCCTGATGGCGGGTGTTGGTCTGACTCTGCTGTACCTGGCGCTGTTCCGTCTGGGGTCAGACAGCGCGTCGCTGGTCGATCAGTCTGCAAACGGCGCTGCTACTCTGCATg < 7:214309/149‑1 (MQ=255) gAAGCGCGTCTGCTGAGCCGTTATACCGTCTGGGCTGGCCTGCTGTCGGGTGTTGGTCTGACTCTGCTGTACCTGGCGCTGTTCCGTCTGTGGTCAGACAGCGCGTCGCTGGTCGATCAGTCTGCAAACGGCGCTGCTATTCTGCATGc < 2:361883/149‑1 (MQ=255) aaGCGCGTCTGCTGACCCGTTATACCGTCTGGGCTGGCCTGATGGCGGGTGTTGGTCTGACTCTGCTGTACCTGGCGCTGTTCCGTCTGGGGTCAGACAGCGCGTCGCTGGTCGATCAGTCTGCAAACGGCGCTGCTATTCTGc > 8:173736/1‑144 (MQ=255) aaGCGCGTCTGCTGACCCGTTATACCGTCTGGGCTGGCCTGATGGCGGGTGTTGGTCTGACTCTGCTGTACCTGGCGCTGTTCCGTCTGGGGTCAGACAGCGCGTCGCTGGTCGATCAGTCTGCAAACGGCGCTGCTATTCTGc < 7:173736/144‑1 (MQ=255) ctgctgACCCGTTATACCGTCTGGGCTGGCCTGATGGCGGGTGTTGGTCTGACTCTGCTGTACCTGGCGCTGTTCCGTCTGGGGTCAGACAGCGCGTCGCTGGTCGATCAGTCTGCAAACGGCGCTGCTATTCTGCATGCTTACGTTCa < 6:308577/149‑1 (MQ=255) ctgACCCGTTATACCGTCTGGGCTGGCCTGATGGCGGGTGTTGGTCTGACTCTGCTGTACCTGGCGCTGTTCCGTCTGGGGTCAGACAGCGCGTCGCTGGTCGATCAGTCTGCAAACGGCGCTGCTATTCTGCATGCTTACGTTCAg < 1:169712/147‑1 (MQ=255) aCCCGTTATACCGTCTGGGCTGGCCTGATGGCGGGTGTTGGTCTGACTCTGCTGTACCTGGCGCTGTTCCGTCTGGGGTCAGACAGCGCGTCGCTGGTCGATCAGTCTGCAAACGGCGCTGCTATTCTGCATGCTTACGTTCAGCacac < 6:321667/149‑1 (MQ=255) ccGTTATACCGTCTGGGCTGGCCTGATGGCGGGTGTTGGTCTGACTCTGCTGCACCTGGCGCTGTTCCGTCTGGGGTCAGACAGCGCGTCGCTGGTCGATCAGTCTGCAAACGGCGCTGCTATTCTGCATGCTTACGTTCAGCACACCt > 1:254018/1‑149 (MQ=255) gTTATACCGTCTGGGCTGGCCTGATGGCGGGTGTTGGTCTGACTCTGCTGTACCTGGCGCTGTTCCGTCTGGGGTCAGACAGCGCGTCGCTGGTCGATCAGTCTGCAAACGGCGCTGCTATTCTGCATGCTTACGTTCAGCACACCttt > 3:300007/1‑149 (MQ=255) taCCGTCTGGGCTGGCCTGATGGCGGGTGTTGGTCTGACTCTGCTGTACCTGGCGCTGTTCCGTCTGGGGTCAGACAGCGCGTCGCTGGTCGATCAGTCTGCAAACGGCGCTGCTATTCTGCATGCTTACGTTCAGCACACCTTTggcg > 1:340704/1‑149 (MQ=255) taCCGTCT‑GGCTGGCCTGATGGCGGGTGTTGGTCTGACTCTGCTGTCCCTGGCGCTGTTCCGGCTGGGGTCAGACAGCGCGTCGCTGGTCGATCAGTCTGCAAACGGCGCTGCTATTCTGCATGCTTACGTTCAGCCCACCTTTggcgg > 6:255601/1‑149 (MQ=255) gaCCGTCTGGGCTGGCCTGATGGCGGGTGTTGGTCTGACTCTGCTGTACCTGGCGCTGTTCCGTCTGGGGTCAGCCAGCGCGTCGCTGGTCGAGCAGTCTGCAAACGGCGCTGCTATTCGGCATGCTTACGTTCAGCACACCTTTggcg > 4:224122/2‑149 (MQ=255) aCCGTCTGGGCTGGCCTGATGGCGGGTGTTGGTCTGACTCTGCTGTACCTGGCGCTGTTCCGTCTGGGGTCAGACAGCGCGTCGCTGGTCGATCAGTCTGCAAACGGCGCTGCTATTCTGCATGCTTACGTTCAGCACACCTTTggcgg > 5:128880/1‑149 (MQ=255) ggCTGGCCTGATGGCGGGTGTGGGTCTGACTCTGCTGTACCTGGCGCTGTTCCGTCTGGGGTCAGACAGCGCGTCGCTGGTCGATCAGTCTGCAAACGGCGCTGCTATTCTGCATGCTTACGTTCAGCACACCTTTGGCGGCGGCGGTa < 7:287119/149‑1 (MQ=255) cTGGCCTGATGGCGGGTGTTGGTCTGACTCTGCTGCACCTGGCGCTGTTCCGTCTGGGGTCAGACAGCGCGTCGCTGGTCGATCAGTCTGCAAACGGCGCTGCTATTCTGCATGCTTACGTTCAGCACACCTTTGGCGGCGGCGGTAGc < 2:254018/149‑1 (MQ=255) tGGCGGGTGTTGGTCTGACTCTGCTGTACCTGGCGCTGTTCCGTCTGGGGTCAGACAGCGCGTCGCTGGTTGATCAGTCTGCAAACGGCGCTGCTATTCTGCATGCTTACGTTCAGCACACCTTTGGCGGCGGCGGTAGCTTCctgctg < 6:18774/149‑1 (MQ=255) ggCGGGTGTTGGTCTGACTCTGCTGTACCTGGCGCTGTTCCGTCTGGGGTCAGACAGCGCGTCGCTGGTCGATCAGTCTGCAAACGGCGCTGCTATTCTGCATGCTTACGTTCAGCACACCTTTGGCGGCGGCGGTAGCTTCCTGCTgg > 8:209134/1‑149 (MQ=255) gggTGTTGGTCTGACTCTGCTGTACCTGGCGCTGTTCCGTCTGGGGTCAGACAGCGCGTCGCTGGTCGATCAGTCTGCAAACGGCGCTGCTATTCTGCATGCTTACGTTCAGCACACCTTTGGCGGCGGCGGTAGCTTCCTGCTggcgg > 6:220930/1‑149 (MQ=255) gtgtTGGTCTGACTCTGCTGTACCTGGCGCTGTTCCGTCTGGGGTCAGACAGCGCGTCGCTGGTCGATCAGTCTGCAAACGGCGCTGCTATTCTGCATGCTTACGTTCAGCACACCTTTGGCGGCGGCGGTAGCTTCCTGCTGgcggcg > 5:145042/1‑149 (MQ=255) tgtTGGTCTGACTCTGCTGTACCTGGCGCTGTTCCGTCTGGGGTCAGACAGCGCGTCGCTGGTCGATCAGTCTGCAAACGGCGCTGCTATTCTGCATGCTTACGTTCAGCACACCTTTGGCGGCGGCGGTAGCTTCCTGCTGGCGGCGt > 8:258921/1‑149 (MQ=255) gtTGGTCTGACTCTGCTGTACCTGGCGCTGTTCCGTCTGGGGTCAGACAGCGCGTCGCTGGTCGATCAGTCTGCAAACGGCGCTGCTATTCTGCATGCTTACGTTCAGCACACCTTTGGCGGCGGCGGTAGCTTCCTGCTGGCGGCGt > 8:346645/1‑148 (MQ=255) ggTCTGACTCTGCTGTACCTGGCGCTGTTCCGTCTGGGGTCAGACAGCGCGTCGCTGGTCGATCAGTCTGCAAACGGCGCTGCTATTCTGCATGCTTACGTTCAGCACACCTTTGGCGGCGGCGGTAGCTTCCTGCTGGCGGCGTTAAt > 6:227822/1‑149 (MQ=255) gTCTGACTCTGCTGTACCTGGCGCTGTTCCGTCTGGGGTCAGACAGCGCGTCGCTGGTCGATCAGTCTGCAAACGGCGCTGCTATTCTGCATGCTTACGTTCAGCACACCTTTGGCGGCGGCGGTAGCTTCCTGCTGGCGGCGTTAATc < 7:4034/149‑1 (MQ=255) gTCTGACTCTGCTGTACCTGGCGCTGTTCCGTCTGGGGTCAGACAGCGCGTCGCTGGTCGATCAGTCTGCAAACGGCGCTGCTATTCTGCATGCTTACGTTCAGCACACCTTTGGCGGCGGCGGTAGCTTCCTGCTGGCGGCGTTAATc > 7:249151/1‑149 (MQ=255) tGACTCTGCTGTACCTGGCGCTGTTCCGTCTGGGGTCAGACAGCGCGTCGCTGGTCGATCAGTCTGCAAACGGCGCTGCTATTCTGCATGCTTACGTTCAGCACACCTTTGGCGGCGGCGGTAGCTTCCTGCTGGCGGCGTTAATCtt > 2:169900/1‑148 (MQ=255) tGACTCTGCTGTACCTGGCGCTGTTCCGTCTGGGGTCAGACAGCGCGTCGCTGGTCGATCAGTCTGCAAACGGCGCTGCTATTCTGCATGCTTACGTTCAGCACACCTTTGGCGGCGGCGGTAGCTTCCTGCTGGCGGCGTTAATCtt > 7:327252/1‑148 (MQ=255) aCTCTGCTGTACCTGGCGCTGTTCCGTCTGGGGTCAGACAGCGCGTCGCTGGTCGATCAGTCTGCAAACGGCGCTGCTATTCTGCATGCTTACGTTCAGCACACCTTTGGCGGCGGCGGTAGCTTCCTGCTGGCGGCGTTAATCTTCa < 4:339272/148‑1 (MQ=255) aCTCTGCTGTACCTGGCGCTGTTCCGTCTGGGGTCAGACAGCGCGTCGCTGGTCGATCAGTCTGCAAACGGCGCTGCTATTCTGCATGCTTACGTTCAGCACACCTTTGGCGGCGGCGGTAGCTTCCTGCTGGCGGCGTTAATCTTCAt < 5:265618/149‑1 (MQ=255) tgctgTACCTGGCGCTGTTCCGTCTGGGGTCAGACAGCGCGTCGCTGGTCGATCAGTCTGCAAACGGCGCTGCTATTCTGCATGCTTACGTTCAGCACACCTTTGGCGGCGGCGGTAGCTTCCTGCTGGCGGCGTTAATCTTCATCgcc > 5:47616/1‑149 (MQ=255) ccTGGCGCTGTTCCGTCTGGGGTCAGACAGCGCGTCGCTGGTCGATCAGTCTGCAAACGGCGCTGCTATTCTGCATGCTTACGTTCAGCACACCTTTGGCGGCGGCGGTAGCTTCCTGCTGGCGGCGTTAATCTTCATCGcctgcctg < 2:211294/148‑1 (MQ=255) ccTGGCGCTGTTCCGTCTGGGGTCAGACAGCGCGTCGCTGGTCGATCAGTCTGCAAACGGCGCTGCTATTCTGCATGCTTACGTTCAGCACACCTTTGGCGGCGGCGGTAGCTTCCTGCTGGCGGCGTTAATCTTCATCGcctgcctg < 2:393911/148‑1 (MQ=255) ccTGGCGCTGTTCCGTCTGGGGTCAGACAGCGCGTCGCTGGTCGATCAGTCTGCAAACGGCGCTGCTATTCTGCATGCTTACGTTCAGCACACCTTTGGCGGCGGCGGTAGCTTCCTGCTGGCGGCGTTAATCTTCATCGCCTGCCTgg < 1:44225/149‑1 (MQ=255) ccTGGCGCTGTTCCGTCTGGGGTCAGACAGCGCGTCGCTGGTCGATCAGTCTGCAAACGGCGCTGCTATTCTGCATGCTTACGTTCAGCACACCTTTGGCGGCGGCGGTAGCTTCCTGCTGGCGGCGTTAATCTTCATCGCCTGCCTgg > 1:7994/1‑149 (MQ=255) ccTGGCGCTGTTCCGTCTGGGGTCAGACAGCGCGTCGCTGGTCGATCAGTCTGCAAACGGCGCTGCTATTCTGCATGCTTACGTTCAGCACACCTTTGGCGGCGGCGGTAGCTTCCTGCTGGCGGCGTTAATCTTCATCGCCTGCCTgg < 2:25249/149‑1 (MQ=255) cTGGCGCTGTTCCGTCTGGGGTCAGACAGCGCGTCGCTGGTCGATCAGTCTGCAAACGGCGCTGCTATTCTGCATGCTTACGTTCAGCACACCTTTGGCGGCGGCGGTAGCTTCct < 6:7115/116‑1 (MQ=255) gcgcTGTTCCGTCTGGGGTCAGACAGCGCGTCGCTGGTCGATCAGTCTGCAAACGGCGCTGCTATTCTGCATGCTTACGTTCAGCACACCTTTGGCGGCGGCGGTAGCTTCCTGCTGGCGGCGTTAATCTTCATCGCCTGCCTGGTaa < 7:346645/148‑1 (MQ=255) gcTGTTCCGTCTGGGGTCAGACAGCGCGTCGCTGGTCGATCAGTCTGCAAACGGCGCTGCTATTCTGCATGCTTACGTTCAGCACACCTTTGGCGGCGGCGGTAGCTTCCTGCTGGCGGCGTTAATCTTCATCGCCTGCCTGGTAACgg < 7:174253/149‑1 (MQ=255) tGTTCCGTCTGGGGTCAGACAGCGCGTCGCTGGTTGATCAGTCTGCAAACGGCGCTGCTATTCTGCATGCTTACGTTCAGCACACCTTTGGCGGCGGCGGTAGCTTCCTGCTGGCGGCGTTAATCTTCATCGCCTGCCTGGTAACgg > 4:257042/1‑147 (MQ=255) ccGTCTGGGGTCAGACAGCGCGTCGCTGGTCGATCAGTCTGCAAACGGCGCTGCTATTCTGCATGCTTACGTTCAGCACACCTTTGGCGGCGGCGGTAGCTTCCTGCTGGCGGCGTTAATCTTCATCGCCTGCCTGGTAACGGCAGtt < 1:103972/148‑1 (MQ=255) ccGTCTGGGGTCAGACAGCGCGTCGCTGGTCGATCAGTCTGCAAACGGCGCTGCTATTCTGCATGCTTACGTTCAGCACACCTTTGGCGGCGGCGGTAGCTTCCTGCTGGCGGCGTTAATCTTCATCGCCTGCCTGGTAACGGCAGtt < 6:47616/148‑1 (MQ=255) gggTCAGACAGCGCGTCGCTGGTTGATCAGTCTGCAAACGGCGCTGCTATTCTGCATGCTTACGTTCAGCACACCTTTGGCGGCGGCGGTAGCTTCCTGCTGGCGGCGTTAATCTTCATCGCCTGCCTGGTAACGGCAGTTGGCCTGAc < 3:257042/149‑1 (MQ=255) tCAGACAGCGCGTCGCTGGTCGATCAGTCTGCAAACGGCGCTGCTATTCTGCATGCTTACGTTCAGCACACCTTTGGCGGCGGCGGTAGCTTCCTGCTGGCGGCGTTAATCTTCATCGCCTGCCTGGTAACGGCAGTTGGCCTGACCtg > 2:311130/1‑149 (MQ=255) cAGACAGCGCGTCGCTGGTCGATCAGTCTGCAAACGGCGCTGCTATTCTGCATGCTTACGTTCAGCACACCTTTGGCGGCGGCGGTAGCTTCCTGCTGGCGGCGTTAATCTTCATCGCCTGCCTGGTAACGGCAGTTGGCCTGACCtgt < 7:73117/149‑1 (MQ=255) aGACAGCGCGTCGCTGGTCGATCACTCTCCAAACGGCGCTGCTATTCTGCATGCTTACGTTCAGCACACCTTTGGCGGCGGCGGTAGCTTCCTGCTGGCGGCGTTAATCTTCATCGCCTGCCTGGTAACGGCAGTTGGCCTGACCtctg > 7:371905/1‑149 (MQ=255) gACAGCGCGTCGCTGGTCGATCAGTCTGCAAACGGCGCTGCTATTCTGCATGCTTACGTTCAGCACACCTGTGGCGGCGGCGGTAGCTTCCTGCTGGCGGCGTTAATCTTCATCGCCTGCCTGGTAACGGCAGTTGGCCTGACCTGTGc < 4:86641/149‑1 (MQ=255) gcgcGTCGCTGGTCGATCAGTCTGCAAACGGCGCTGCTATTCTGCATGCTTACGTTCAGCACACCTTTGGCGGCGGCGGTAGCTTCCTGCTGGCGGCGTTAATCTTCATCGCCTGCCTGGTAACGGCAGTTGGCCTGACCTGTGCTtgt < 7:23934/149‑1 (MQ=255) cgcgTCGCTGGTCGATCAGTCTGCAAACGGCGCTGCTATTCTGCATGCTTACGTTCAGCACACCTTTGGCGGCGGCGGTAGCTTCCTGCTGGCGGCGTTAATCTTCATCGCCTGCCTGGTAACGGCAGTTGGCCTGACCTGTGCTtgtg < 4:43733/149‑1 (MQ=255) ggTCGATCAGTCTGCAAACGGCGCTGCTATTCTGCATGCTTACGTTCAGCACACCTTTGGCGGCGGCGGTAGCTTCCTGCTGGCGGCGTTAATCTTCATCGCCTGCCTGGTAACGGCAGTTGGCCTGACCTGTGc > 6:383923/1‑135 (MQ=255) ggTCGATCAGTCTGCAAACGGCGCTGCTATTCTGCATGCTTACGTTCAGCACACCTTTGGCGGCGGCGGTAGCTTCCTGCTGGCGGCGTTAATCTTCATCGCCTGCCTGGTAACGGCAGTTGGCCTGACCTGTGc < 5:383923/135‑1 (MQ=255) gTCGATCAGTCTGCAAACGGCGCTGCTATTCTGCATGCTTACGTTCAGCACACCTTTGGCGGCGGCGGTAGCTTCCTGCTGGCGGCGTTAATCTTCATCGCCTGCCTGGTAACGGCAGTTGGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCtt > 3:345958/1‑149 (MQ=255) tCGATCAGTCTGCAAACGGCGCTGCTATTCTGCATGCTTACGTTCAGCACACCTTTGGCGGCGGCGGTAGCTTCCTGCTGGCGGCGTTAATCTTCATCGCCTGCCTGGTAACGGCAGTTGGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCttt < 7:258921/149‑1 (MQ=255) | TTATTGTTAACGCGGCGCGTTCTCGTGGCGTTACCGAAGCGCGTCTGCTGACCCGTTATACCGTCTGGGCTGGCCTGATGGCGGGTGTTGGTCTGACTCTGCTGTACCTGGCGCTGTTCCGTCTGGGGTCAGACAGCGCGTCGCTGGTCGATCAGTCTGCAAACGGCGCTGCTATTCTGCATGCTTACGTTCAGCACACCTTTGGCGGCGGCGGTAGCTTCCTGCTGGCGGCGTTAATCTTCATCGCCTGCCTGGTAACGGCAGTTGGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTT > NC_000913/420213‑420508 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |