| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,204,241 | A→G | 6.9% | pseudogene (72/234 nt) | oweE → | pseudogene, lambda replication protein O homolog; CPS‑53/KpLE1 prophage;Phage or Prophage Related |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,204,241 | 0 | A | G | 6.9% | 262.9 / 7.1 | 87 | pseudogene (72/234 nt) | oweE | pseudogene, lambda replication protein O homolog; CPS‑53/KpLE1 prophage;Phage or Prophage Related |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (41/40); new base G (3/3); total (44/43) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
AGGTTATGAGCATGAATGCTTCAGCCCGCTCGAACAGTTTCGTCGTAAATTCAGGGAAATAGAGGTCGGTCATGAGCACTAAATTAACCGGCTATGTATGGGATGGTTGCGCTGCATCAGGCATGAAGTTATCCAGCGTGGCAATTATGGCCCGCCTGGCTGATTTCAGTAATGACGAAGGTGTGTGCTGGCCATCAATTGAAACCATTGCCCGTCAGATTGGCGCGGGGATGAGTACCGTCAGAACGGCTATCGCACGGCTGGAAGCAGAAGGCTGGTTAACGCGTAAG > NC_000913/1204099‑1204388 | aGGGTATGAGCATGAATGCTTCAGCCCGCTCGAACAGTTTCGTCGTAAATTCAGGGAAATAGAGGTCGGTCATGAGCACTAAATTAACCGGCTATGTATGGGATGGTTGCGCTGCATCAGGCATGAAGTTATCCAGCGTGGCAATTATg < 8:344815/149‑1 (MQ=255) gCATGAATGCTTCAGCCCGCTCGAACAGTTTCGTCGTAAATTCAGGGAAATAGAGGTCGGTCATGAGCACTAAATTAACCGGCTATGTATGGGATGGTTGCGCTGCATCAGGCATGAAGTTATCCAGCGTGGCAATTATGGCCCGCCTg > 1:238124/1‑149 (MQ=255) gCATGAATGCTTCAGCCCGCTCGAACAGTTTCGTCGTAAATTCAGGGAAATAGAGGTCGGTCATGAGCACTAAATTAACCGGCTATGTATGGGATGGTTGCGCTGCATCAGGCATGAAGTTATCCAGCGTGGCAATTATGGCCCGCCTg > 1:73681/1‑149 (MQ=255) cATGAATGCTTCAGCCCGCTCGAACAGTTTCGTCGTAAATTCAGGGAAATAGCGGTCGGTCATGAGCACTAAATTAATCGGCTATGTATGGGATGGTTGCGCTGCATCAGGCATGAAGTTATCCAGCGTGGCAATTATGGCCCGCCTgg < 4:110313/149‑1 (MQ=255) cATGAATGCTTCAGCCCGCTCGAACAGTTTCGTCGTAAATTCAGGGAAATAGAGGTCGGTCATGAGCACTAAATTAACCGGCTATGTATGGGATGGTTGCGCTGCATCAGGCATGAAGTTATCCAGCGTGGCAATTATGGCCCGCCTgt > 6:338559/1‑148 (MQ=255) aTGAATGCTTCAGCCCGCTCGAACAGTTTCGTCGTAAATTCAGGGAAATAGAGGTCGGTCATGAGCACTAAATTAACCGGCTATGTATGGGATGGTTTCGCTGCATCAGGCATGAAGTAATCCATCGTGGCAATTATGGCACGCCTGGc > 5:42157/1‑149 (MQ=255) aTGCTTCAGCCCGCTCGAACAGTTTCGTCGTAAATTCAGGGAAATAGAGGTCGGTCATGAGCACTAAATTAGCCGGCTATGTATGGGATGGTTGCGCTGCATCAGGCATGAAGTTATCCAGCGTGGCAATTATGGCCCGCCTGGCTGAt > 3:10482/1‑149 (MQ=255) aTGCTTCAGCCCGCTCGAACAGTTTCGTCGTAAATTCAGGGAAATAGAGGTCGGTCATGAGCACTAAATTAACCGGCTATGTATGGGATGGTTGCGCTGCATCAGGCATGAAGTTATCCAGCGTGGCaa < 8:393003/129‑1 (MQ=255) aTGCTTCAGCCCGCTCGAACAGTTTCGTCGTAAATTCAGGGAAATAGAGGTCGGTCATGAGCACTAAATTAACCGGCTATGTATGGGATGGTTGCGCTGCATCAGGCATGAAGTTATCCAGCGTGGCaa > 7:393003/1‑129 (MQ=255) cTTCAGCCCGCTCGAACAGTTTCGTCGTAAATTCAGGGAAATAGAGGTCGGTCATGAGCACTAAATTAACCCGCTATGTATGGGATGGTTGCGCTGCATCAGGCATGAAGTTATCCAGCGTGGCAATTATGGCCCGCCTGGCTGAttt < 2:380056/148‑1 (MQ=255) ttCAGCCCGCTCGAACAGTTTCGTCGTAAATTCAGGGAAATAGAGGTCGGTCATGAGCACTAAATTAACCGGCTATGTATGGGATGGTTGCGCTGCATCAGGCATGAAGTTATCCAGCGTGGCAATTATGGCCCGCCTGGCTGAttt > 5:320343/1‑147 (MQ=255) cAGCCCGCTCGAACAGTTTCGTCGTAAATTCAGGGAAATAGAGGTCGGTCATGAGCACTAAATTAACCGGCTATGTATGGGATGGTTGCGCTGCATCAGGCATGAAGTTATCCAGCGTGGCAATTATGGCCCGCCTGGCTGATTTCa < 2:73681/147‑1 (MQ=255) cAGCCCGCTCGAACAGTTTCGTCGTAAATACAGGCAAATAGACGTCGGTCATGAGCACTAAATTAACCGGCTATGTATCGGATGGTGGCGCTGCATCAGGCATGAAGTTATCCAGCGTGGCAATTATGGCCCGCCTGGCTGATTTCAg < 4:112560/148‑1 (MQ=255) aGCCCGCTCGAACAGTGTCGTCGGAAATGCAGGGAAATAGAGGGCGGTCATGAGCACTAAATTAACCGGCTATGTATGGGATGGTTGCGCTGCATCAGGCATGAAGTTATCCAGCGTGGCAATTATGGCCCGCCTGGCTGATTTCAGTa < 7:403511/149‑1 (MQ=255) gCCCGCTCGAACAGTTTCGTCGTAAATTCAGGGAAATAGAGGTCGGTCATGAGCACTAAATTAACCGGCTATGTATGGGATGGTTGCGCTGCATCAGGCATGAAGTTATCCAGCGTGGCAATTATGGCCCGCCTGGCTGATTTCAGTaa < 2:387473/149‑1 (MQ=255) gCCCGCTCGAACAGTCTCGTCGTAAATTCAGGGAAATAGAGGTCGGTCATGAGCACTAAATTAACCGGCTATGTATGGGATGGTTGCGCTGCATCAGGCATGAAGTTATCCAGCGTGGCAATTATGGCCCGCCTGGCTGATTTCAGTaa > 1:141815/1‑149 (MQ=255) cccGCTCGAACAGTTTCGTCGTAAATTCAGGGAAATAGAGGTCGGTCATGAGCACTAAATTAACCGGCTATGTATGGGATGGTTGCGCTGCATCAGGCATGAAGTTATCCAGCGTGGCAATTATGGCCCGCCTGGCTGATTTCGGTAAt < 6:122115/149‑1 (MQ=255) tCGAACAGTTTCGTCGTAAATTCAGGGAAATAGAGGTCGGTCATGAGCACTAAATTAACCGGCTATGTATGGGATGGTTGCGCTGCATCAGGCATGAAGTTATCCAGCGTGGCAATTATGGCCCGCCTGGCTGATTTCAGTAATGACg > 1:275409/1‑148 (MQ=255) tCGAACAGTTTCGTCGTAAATTCAGGGAAATAGAGGTCGGTCATGAGCACTAAATTAACCGGCTATGTATGGGATGGTTGCGCTGCATCAGGCATGAAGTTATCCAGCGTGGCAATTATGGCACGCCTGGCTGATTTCAGTAATGACg > 2:326253/1‑148 (MQ=255) gAACAGTTTCGTCGTAAATTCAGGGAAATAGAGGTCGGTCATGAGCACTAAATTAACCGGCTATGTATGGGATGGTTGCGCTGCATCAGGCATGAAGTTATCCAGCGTGGCAATTATGGCCCGCCTGGCTGATTTCAGTAATGACGaa < 1:90845/148‑1 (MQ=255) gAACAGTTTCGTCGTAAATTCAGGGAAATAGAGGTCGGTCATGAGCACTAAATTAACCGGCTATGTATGGGATGGTTGCGCTGCATCAGGCATGAAGTTATCCAGCGTGGCAATTATGGCCCGCCTGGCTGATTTCAGTAATGACGAAg > 6:222688/1‑149 (MQ=255) gAACAGTTTCGTCGTAAATTCAGGGAAATAGAGGTCGGTCATGAGCACTAAATTAACCGGCTATGTATGGGATGGTTGCGCTGCATCAGGCATGAAGTTATCCAGCGTGGCAATTATGGCCCGCCTGGCTGATTTCAGTAATGACGAAg < 2:275409/149‑1 (MQ=255) gAACAGTTTCGTCGTAAATTCAGGGAAATAGAGGTCGGTCATGAGCACTAAATTAACCGGCTATGTATGGGATGGTTGCGCTGCATCAGGCATGAAGTTATCCAGCGTGGCAATTATGGCCCGCCTGGCTGATTTCAGTAATGACGAAg > 1:74744/1‑149 (MQ=255) aCAGTTTCGTCGTAAATTCAGGGAAATAGAGGTCGGTCATGAGCACTAAATTAACCGGCTATGTATGGGATGGTTGCGCTGCATCAGGCATGAAGTTATCCAGCGTGGCAATTATGGCCCGCCTGGCTGATTTCAGTAATGACGAAGgt > 4:251760/1‑149 (MQ=255) aCAGTTTCGTCGTAAATTCAGGGAAATAGAGGTCGGTCATGAGCACTAAATTAACCGGCTATGTATGGGATGGTTGCGCTGCATCAGGCATGAAGTTATCCAGCGTGGCAATTATGGCCCGCCTGGCTGATTTCAGTAATGACGAAGgt < 3:241339/149‑1 (MQ=255) aGTTTCGTCGTAAATTCAGGGAAATAGAGGTCGGTCATGAGCACTAAATTAACCGGCTATGTATGGGATGGTTGCGCTGCATCAGGCATGAAGTTATCCAGCGTGGCAATTATGGCCCGCCTGGCTGATTTCAGTAATGACGAAGgtgt < 2:201974/149‑1 (MQ=255) cgtcgtAAATTCAGGGAAATAGAGGTCGGTCATGAGCACTAAATTAACCGGCTATGTATGGGATGGTTGCGCTGCATCAGGCATGAAGTTATCCAGCGTGGCAATTATGGCCCGCCTGGCTGATTTCAGTAATGACGAAGGTGTGTGc < 2:74744/148‑1 (MQ=255) gtcgtAAATTCAGGGAAATAGAGGTCGGTCATGAGCACTAAATTAACCGGCTATGTATGGGATGGTTGCGCTGCATCAGGCATGAAGTTATCCAGCGTGGCAATTATGGCCCGCCTGGCTGATTTCAGTAATGACGAAGGTGTGTGCt < 5:287921/148‑1 (MQ=255) gtcgtAAATTCAGGGAAATAGAGGTCGGTCATGAGCACTAAATTAACCGGCTATGTATGGGATGGTTGCGCTGCATCAGGCATGAAGTTATCCAGCGTGGCAATTATGGCCCGCCTGGCTGATTTCAGTAATGACGAAGGTGTGTGCTg < 5:99398/149‑1 (MQ=255) tcgtAAATTCAGGGAAATAGAGGTCGGTCATGAGCACTAAATTAACCGGCTATGTATGGGATGGTTGCGCTGCATCAGGCATGAAGTTATCCAGCGTGGCAATTATGGCCCGCCTGGCTGATTTCAGTAATGACGAAGGTGTGTGCTgg > 5:239330/1‑149 (MQ=255) tcgtAAATTCAGGGAAATAGAGGTCGGTCATGAGCACTAAATTAACCGGCTATGTATGGGATGGTTGCGCTGCATCAGGCATGAAGTTATCCAGCGTGGCAATTATGGCCCGCCTGGCTGATTTCAGTAATGACGAAGGTGTGTGCTgg > 4:359912/1‑149 (MQ=255) gtAAATTCAGGGAAATAGAGGTCGGTCATGAGCACGAAATTAACCGGCTATGTATGGGATGGTTGCGCTGCATCAGGCTTGAAGTTATCCAGCGTGGCAATTATGGCCCGCCTGGCTGATTTCAGTAATGACGAAGGTGTGTGCTGGc > 5:170741/1‑148 (MQ=255) tAAATTCAGGGAAATAGAGGTCGGTCATGAGCACTAAATTAACCGGCTATGTATGGGATGGTTGCGCTGCATCAGGCATGAAGTTATCCAGCGTGGCAATTATGGCCCGCCTGGCTGATTTCAGTAATGACGAAGGTGTGTGCTGGCCa < 2:141815/149‑1 (MQ=255) aaaTTCAGGGAAATAGAGGTCGGTCATGAGCACTAAATTAACCGGCTATGTATGGGATGGTTGCGCTGCATCAGGCATGAAGTTATCCAGCGTGGCAATTATGGCCCGCCTGGCTGATTTTAGTAATGACGAAGGTGTGTGCTGGCCAt > 7:206724/1‑149 (MQ=255) ggAAATAGAGGTCGGTCATGAGCACTAAATTAACCGGCTATGTATGGGATGGTTGCGCTGCATCAGGCATGAAGTTATCCAGCGTGGCAATTATGGCCCGCCTGGCTGATTTCAGTAATGACGAAGGTGTGTGCTGGCCATCAATTGa > 2:20/1‑148 (MQ=255) aTAGAGGTCGGTCATGAGCACTAAATTAACCGGCTATGTATGGGATGGTTGCGCTGCATCAGGCATGAAGTTATCCAGCGTGGCAATTATGGCCCGCCTGGCTGATTTCAGTAATGACGAAGGTGTGTGCTGGCCATCAATTGAAACCa < 3:119620/149‑1 (MQ=255) gagGTCGGTCATGAGCACTAAATTAACCGGCTATGTATGGGATGGTTGCGCTGCATCAGGCATGAAGTTATCCAGCGTGGCAATTATGGCCCGCCTGGCTGATTTCAGTAATGACGAAGGTGTGTGCTGGCCATCAATTGAAACCAtt < 6:320343/148‑1 (MQ=255) ggtcggtcATGAGCACTAAATTATCCGGCTATGTATGGGTTGGTTGCGCTGCATGAGGCATGAAGTTATCCAGCGTTGCAATTATGGCCCGCCTGGCTGATTTCAGTAATGACGAAGGTGTGTGCTGGCCATCAATTGAAACCATTGc < 6:117882/148‑1 (MQ=255) gtcgggcATGAGCACTAAATTAACCCGCTATGTATGGGATGGTTGCGCTGCATCAGGGATGAAGTTATCCAGCGTGGCAATTATGGCCCGCCTGGCTGATTTCAGTAATGACGAAGGTTTGTGCTGGCCATCAATTGAAACCATTGccc < 2:192763/149‑1 (MQ=255) ggtcATGAGCACTAAATTAACCGGCTATGTATGGGATGGTTGCGCTGCATCAGGCATGAAGTTATCCAGCGTGGCAATTATGGCCCGCCTGGCTGATTTCAGTAATGACGAAGGTGTGTGCTGGCCATCAATTGAAACCATTGCCCGt > 5:86437/1‑148 (MQ=255) tGATCACTAAATTAAACGGCTATGTATGGCAAGGTTGCGCTGCATAAGGCATGAACTTATCCAGCGTCGCAATTATGGCCCGCCTGGCAGATTTCAGTAATGACGAACGTGTGTGCTGCCCATCAATTGAAACCATTGCCCGTCAGAtt > 2:101949/1‑149 (MQ=255) gAGCACTAAATTAACCGGCTATGTATGGGATGGTTGCGCTGCATCAGGCATGAAGTTATCCAGCGTGGCAATTATGGCCCGCCTGGCTGATTTCAGTAATGACGAAGGTGTGTGCTGGCCATCAATTGAAACCATTGCCCGTCAGATTg > 2:172166/1‑149 (MQ=255) cTAAATTAACCGGCTATGTATGGGATGGTTGCGCTGCATCAGGCATGACGTTATCCAGCGTGGCAATTATGGCCCGCCTGGCTGATTTCAGTAATGACGAAGGTGTGTGCTGGCCATCAATTGAAACCATTGCCCGTCAGATTGGcgcg > 2:156399/1‑149 (MQ=255) cTAAATTAACCGGCTATGTATGGGATGGTTGCGCTGCATCAGGCATGAAGTTATCCAGCGTGGCGATTATGGCCCGCCTGGCTGATTTCAGTAATGACGAAGGTGTGTGCTGGCCATCAATTGAAACCATTGCCCGTCAGATTGGcgcg > 3:347116/1‑149 (MQ=255) cTAAATTAACCGGCTATGTATGGGATGGTTGCGCTGCATCAGGCATGAAGTTATCCAGCGTGGCGATTATGGCCCGCCTGGCTGATTTCAGTAATGACGAAGGTGTGTGCTGGCCATCAATTGAAACCATTGCCCGTCAGATTGGcgcg > 7:392145/1‑149 (MQ=255) cTAAATTAACCGGCTATGTATGGGATGGTTGCGCTGCATCAGGCATGAAGTTATCCAGCGTGGCGATTATGGCCCGCCTGGCTGATTTCAGTAATGACGAAGGTGTGTGCTGGCCATCAATTGAAACCATTGCCCGTCAGATTGGcgcg > 3:341650/1‑149 (MQ=255) aTTAACCGGCTATGTATGGGATGGTTGCGCTGCATCAGGCATGAAGTTATCCAGCGTGGCAATTATGGCCCGCCTGGCTGATTTCAGTAATGACGAAGGTGTGTGCTGGCCATCAATTGAAACCATTGCCCGTCAGATTGGCGCGGGGa > 5:338014/1‑149 (MQ=255) ttAACCGGCTATGTATGGGATGGTTGCGCTGCCTCAGGCATGAAGTTATCCAGCGTGGCAATTATGGCCCGCCTGGCTGATTTCAGTAATGACGAAGGTGTGTGCTGGCCATCAATTGAAACCATTCCCCGTCAGATTGGCGCGGGGAt > 8:291194/1‑149 (MQ=255) ttAACCGGCTATGTATGGGATGGTTGCGCTGCATCAGGCATGAAGTTATCCAGCGTGGCAATTATGGCCCGCCTGGCTGATTTTAGTAATGACGAAGGTGTTTGCTGGCCATCAATTGAAACCATTGCCCGTCAGATTGGCGCGGGGAt < 8:206724/149‑1 (MQ=255) ttAACCGGCTATGTATGGGATGGTTGCGCTGCATCAGGCATGAAGTTATCCAGCGTGGCAATTATGGCCCGCCTGGCTGATTTCAGTAATGACGAAGGTGTGTGCTGGCCATCAATTGAAACCATTGCCCGTCAGATTGGCGCGGGGAt > 1:82004/1‑149 (MQ=255) ttAACCGGCTATGTATGGGATGGTTGCGCTGCATCAGGCATGAAGTTATCCAGCGTGGCAATTATGGCCCGCCTGGCTGATTTCAGTAATGACGAAGGTGTGTGCTGGCCATCAATTGAAACCATTGCCCGTCAGATTGGCGCGGGGAt < 8:274967/149‑1 (MQ=255) aCCGGCTATGTATGGGATGGTTGCGCTGCATCAGGCATGAAGTTATCCAGCGTGGCAATTATGGCCCGCCTGGCTGATTTCAGTAATGACGAAGGTGTGTGCTGGCCATCAATTGAAACCATTGCCCGTCAGATTGGCGCGGGGATGa < 3:251760/148‑1 (MQ=255) ccGGCTATGTATGGGATGGTTGCGCTGCATCAGGCATGAAGTTATCCAGCGTGGCAATTATGGCCCGCCTGGCTGATTTCAGTAATGACGAAGGTGTGTGCTGGCCATCAATTGAAACCATTGCCCGTCAGATTGGCGCGGGGATGAg > 7:47044/1‑148 (MQ=255) ggCTATGTATGGGATGGTTGCGCTGCATCAGGCATGAAGTTATCCAGCGTGGCAATTATGGCCCGCCTGGCTGATTTCAGTAATGACGAAGGTGTGTGCTGGCCATCAATTGAAACCATTGCCCGTCAGATTGGCGCGGGGATGAGTAc > 4:124071/1‑149 (MQ=255) gCTATGTATGGGATGGTTGCGCTGCATCAGGCATGAAGTTATCCAGCGTGGCAATTATGGCCCGCCTGGCTGATTTCAGTAATGACGAAGGTGTGGGCTGGCCATCAATTGAAACCATTGCCCGTCAGATTGGCGCGGGGATGAGTAcc < 6:239330/149‑1 (MQ=255) tgtatgGGATGGTTGCGCTGCATCAGGCATGAAGTTATCCAGCGTGGCAATTATGGCCCGCCTGGCTGATTTCAGTAATGACGAAGGTGTGTGCTGGCCATCAATTGAAACCATTGCCCGTCAGATTGGCGCGGGGATGAGTACCGt < 8:47044/147‑1 (MQ=255) taggggATGGTTGCGCTGCATCAGGCATGAAGTTATCCAGCGTGGCAATTATGGCCCGCCTGGCTGATTTCAGTAATGACGAAGGTGTGTGCTGGCCATCAATTGAAACCATTGCCCGTCAGATTGGCGCGGGGATGAGTACCGTc < 4:10482/143‑1 (MQ=255) atgGGATGGTTGCGCTGCATCAGGCAGGAAGTTATCCAGCGTGGCAATTATGGCCCGCCTGGCTGATTTCAGTAATGACGAAGGTGTGTGCTGGCCATCAATTGAAACCATTGCCCGTCAGATTGGAGCGGGGATGAGTACCGTCAGaa > 4:35471/1‑149 (MQ=255) gTTGCGCTGCATCAGGCATGAAGTTATCCAGCGTGGCAATTATGGCCCGCCTGGCTGATTTCAGTAATGACGAAGGTGTGTGCTGGCCATCAATTGAAACCATTGCCCGTCAGATTGGCGCGGGGATGAGTACCGTCAGAACGGCTATc < 6:86437/149‑1 (MQ=255) gcTGCATCAGGCATGAAGTTATCCAGCGTGGCAATTATGGCCCGCCTGGCTGATTTCAGTAATGACGAAGGTGTGTGCTGGCCATCAATTGAAACCATTGCCCGTCAGATTGGCGCGGGGATGAGTACCGt > 6:351483/1‑131 (MQ=255) gcTGCATCAGGCATGAAGTTATCCAGCGTGGCAATTATGGCCCGCCTGGCTGATTTCAGTAATGACGAAGGTGTGTGCTGGCCATCAATTGAAACCATTGCCCGTCAGATTGGCGCGGGGATGAGTACCGt < 5:351483/131‑1 (MQ=255) gcTGCATCAGGCATGAAGTTATCCAGCGTGGCAATTATGGCCCGCCTGGCTGATTTCAGTAATGACGAAGGTGTGTGCTGGCCATCAATTGAAACCATTGCCCGTCAGATTGGCGCGGGGATGAGTACCGTCAGAAc > 4:346845/1‑137 (MQ=255) gcTGCATCAGGCATGAAGTTATCCAGCGTGGCAATTATGGCCCGCCTGGCTGATTTCAGTAATGACGAAGGTGTGTGCTGGCCATCAATTGAAACCATTGCCCGTCAGATTGGCGCGGGGATGAGTACCGTCAGAAc < 3:346845/137‑1 (MQ=255) gcTGCATCAGGCATGAAGTTATCCAGCGTGGCAATTATGGCCCGCCTGGCTGATTTCAGTAATGACGAAGGTGTGTGCTGGCCATCAATTGAAACCATTGCCCGTCAGATTGGCGCGGGGATGAGTACCGTCAGAACGGCTATCGCACg > 7:202005/1‑149 (MQ=255) tGCATCAGGCATGAAGTTATCCAGCGTGGCAATTATGGCCCGCCTGGCTGATTTCAGTAATGACGAAGGTGTGTGCTGGCCATCAATTGAAACCATTGCCCGTCAGATTGGCGCGGGGATGAGTACCGTCAGAACGGCTATCGCACGGc > 7:53591/1‑149 (MQ=255) tGCATCAGGCATGAAGTTATCCAGCGTGGCAATTATGGCCCGCCTGGCTGATTTCAGTAATGACGAAGGTGTGTGCTGGCCATCAATTGAAACCATTGCCCGTCAGATTGGCGCGGGGATGAGTACCGTCAGAACGGCTATCGCACGGc > 1:131818/1‑149 (MQ=255) cATCAGGCATGAAGTTATCCAGCGTGGCAATTATGGCCCGCCTGGCTGATTTCAGTAATGACGAAGGTGTGTGCTGGCCATCAATTGAAACCATTGCCCGTCAGATTGGCGCGGGGATGAGTACCGTCAGAACGGCTATCGCACGGCTg < 6:338014/149‑1 (MQ=255) tCAGGCATGAAGTTATCCAGCGTGGCAATTATGGCCCGCCTGGCTGATTTCAGTAATGACGAAGGTGTGTGCTGGCCATCAATTGAAACCATTGCCCGTCAGATTGGCGCGGGGATGAGTACCGTCAGAACGGCTATCGCACGGCTgg > 6:364313/1‑148 (MQ=255) aGGCATGAAGTTATCCAGCGTGGCAATTATGGCCCGCCTGGCTGATTTCAGTAATGACGAAGgt > 8:97495/1‑64 (MQ=255) aGGCATGAAGTTATCCAGCGTGGCAATTATGGCCCGCCTGGCTGATTTCAGTAATGACGAAGgt < 7:97495/64‑1 (MQ=255) gCATGAAGTTATCCAGCGTGGCAATTATGGCCCGCCTGGCTGATTTCAGTAATGACGAAGGTGTGTGCTGGCCATCAATTGAAACCATTGCCCGTCAGATTGGCGCGGGGATGAGTACCGTCAGAACGGCTATCGCACGGCTGGAAg > 6:293443/1‑147 (MQ=255) aTGAAGTTATCCAGCGTGGCAATTATGGCCCGCCTGGCTGATTTCAGTAATGACGAAGGTGTGTGCTGGCCATCAATTGAAACCATTGCCCGTCAGATTGGCGCGGGGATGAGTACCGTCAGAACGGCTATCGCACGGCTGGAAGCAg > 3:287652/1‑148 (MQ=255) aaGTTATCCAGCGTGGCAATTATGGCCCGCCTGGCTGATTTCAGTAATGACGAAGGTGTGTGCTGGCCATCAATTGAAACCATTGCCCGTCAGATTGGCGCGGGGATGAGTACCGTCAGAACGGCTATCGCACGGCTGGAAGCAGAAgg > 3:87210/1‑149 (MQ=255) aaGTTATCCAGCGTGGCAATTATGGCCCGCCTGGCTGATTTCAGTAATGACGAAGGTGTGTGCTGGCCATCAATTGAAACCATTGCCCGTCAGATTGGCGCGGGGATGAGTACCGTCAGAACGGCTATCGCACGGCTGGAAGCAGAAgg < 5:222688/149‑1 (MQ=255) gTTATCCAGCGTGGCAATTATGGCCCGCCTGGCTGATTTCAGTAATGACGAAGGTGTGTGCTGGCCATCAATTGAAACCATTGCCCGTCAGATTGGCGCGGGGATGAGTACCGTCAGAACGGCTATCGCACGGCTGGAAGCAGAAGGCt < 1:156399/149‑1 (MQ=255) ttATCCAGCGTTTCAATTATGGCCCTCCTGGCTGATTTCAGTAATGACGAAGGTGTGTGCTGGCCATCAATTGAAACCATTGCCAGTCAGATTGGCGCGGGGATGAGTACCGTCAGAACGGCTATCGCACGTCTGGAAGCAGAAGGCTg < 3:109394/149‑1 (MQ=255) aTCCAGCGTGGCAATTATGGCCCGCCTGGCTGATTTCAGTAATGACGAAGGTGTGTGCTGGCCATCAATTGAAACCATTGCCCGTCAGATTGGCGCGGGGATGAGTACCGt < 8:344195/111‑1 (MQ=255) aTCCAGCGTGGCAATTATGGCCCGCCTGGCTGATTTCAGTAATGACGAAGGTGTGTGCTGGCCATCAATTGAAACCATTGCCCGTCAGATTGGCGCGGGGATGAGTACCGTCAGAACGGCTATCGCACGGCTGGAAGCAGAAGGCTGGt > 2:209115/1‑149 (MQ=255) cAGCGTGGCAATTATGGCCCGCCTGGCTGATTTCAGTAATGACGAAGGTGTGTGCTGGCCATCAATTGAAACCATTGCCCGTCAGATTGGCGCGGGGATGAGTACCGTCAGAACGGCTATCGCACGGCTGGAAGCAGAAGGCTGGTTaa < 4:287652/149‑1 (MQ=255) aGCGTGGCGATTATGGCCCGCCTGGCTGATTTCAGTAATGACGAAGGTGTGTGCTGGCCATCAATTGAAACCATTGCCCGTCAGATTGGCGCGGGGATGAGTACCGTCAGAACGGCTATGGCACGGCTGGAAGCAGAAGGCTGGTTAAc < 4:341650/149‑1 (MQ=255) aGCGTGGCGATTATGGCCCGCCTGGCTGATTTCAGTAATGACGAAGGTGTGTGCTGGCCATCAATTGAAACCATTGCCCGTCAGATTGGCGCGGGGATGAGTACCGTCAGAACGGCTATCGCACGGCTGGAAGCAGAAGGCTGGTTAAc < 4:347116/149‑1 (MQ=255) aGCGTGGCGATTATGGCCCGCCTGGCTGATTTCAGTAATGACGAAGGTGTGTGCTGGCCATCAATTGAAACCATTGCCCGTCAGATTGGCGCGGGGATGAGTACCGTCAGAACGGCTATCGCACGGCTGGAAGCAGAAGGCTGGTTAAc < 8:392145/149‑1 (MQ=255) gCGTGGCAATTATGGCCCGCCTGGCTGATTTCAGTAATGACGAAGGTGTGTGCTGGCCATCAATTGAAACCATTGCCCGTCAGATTGGCGCGGGGATGAGTACCGTCAGAACGGCTATCGCACGGCTGGAAGCAGAAGGCTGGTTAAcg > 3:68147/1‑149 (MQ=255) cGTGGCAATTATGGCCCGCCTGGCTGATTTCAGTAATGACGATGGTGTGTGCTGGCCATCAATTGAAACCATTGCCCGTCAGATTGGCGCGGGGATGAGTACCGTCAGAACGGCTATCGCACGGCTGGAAGCAGAAGGCTGGTTAAggc < 3:215217/149‑1 (MQ=255) cGTGGCAATTATGGCCCGCCTGGCTGATTTCAGTAATGACGAAGGTGTGTGCTGGCCATCAATTGAAACCATTGCCCGTCAGATTGGCGCGGGGATGAGTACCGTCAGAACGGCTATCGCACGGCTGGAAGCAGAAGGCTGGTTAAcgc < 1:20/149‑1 (MQ=255) gCAATTATGGCCCGCCTGGCTGATTTCAGTAATGACGAAGGTGTGTGCTGGCCATCAATTGAAACCATTGCCCGTCAGATTGGCGCGGGGATGAGTACCGTCa > 8:153695/1‑103 (MQ=255) gCAATTATGGCCCGCCTGGCTGATTTCAGTAATGACGAAGGTGTGTGCTGGCCATCAATTGAAACCATTGCCCGTCAGATTGGCGCGGGGATGAGTACCGTCa < 7:153695/103‑1 (MQ=255) gCAATTATGGCCCGCCTGGCTGATTTCAGTAATGACGAAGGTGTGTGCTGGCCATCAATTGAAACCATTGCCCGTCAGATTGGCGCGGGGATGAGTACCGTCAGAACGGCTATCGCACGGCTGGAAGCAGAAGGCTGGTTAACGCGTaa < 6:170741/149‑1 (MQ=255) cAATTATGGCCCGCCTGGCTGATTTCAGTAATGACGAAGGTGTGTGCTGGCCATCAATTGAAACCATTGCCCGTCAGATTGGCGCGGGGATGAGTACCGTCAGAACGGCTATCGCACGGCTGGAAGCAGAAGGCTGGTTAACGCGTAAg > 4:177377/1‑149 (MQ=255) | AGGTTATGAGCATGAATGCTTCAGCCCGCTCGAACAGTTTCGTCGTAAATTCAGGGAAATAGAGGTCGGTCATGAGCACTAAATTAACCGGCTATGTATGGGATGGTTGCGCTGCATCAGGCATGAAGTTATCCAGCGTGGCAATTATGGCCCGCCTGGCTGATTTCAGTAATGACGAAGGTGTGTGCTGGCCATCAATTGAAACCATTGCCCGTCAGATTGGCGCGGGGATGAGTACCGTCAGAACGGCTATCGCACGGCTGGAAGCAGAAGGCTGGTTAACGCGTAAG > NC_000913/1204099‑1204388 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |