| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,952,594 | C→T | 6.0% | A110V (GCG→GTG) | yecN → | MAPEG family inner membrane protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,952,594 | 0 | C | T | 6.0% | 262.1 / 4.5 | 84 | A110V (GCG→GTG) | yecN | MAPEG family inner membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (37/41); new base T (2/3); total (40/44) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.52e-01 | |||||||||||
GCTGTTTATGGAAATGAATGGCGCAGAAACCTGGATGGTGCATATTTGCGGCATCGTTTTGCTTGCTGGTCGTCTGATGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGCCACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTCCCTGCGTTAGCGCACAATACGCCACTTTCTTTTTCCCGGATTTTTACGTTATGTCTCACCGCGACACGCTATTTTCTGCCCCTATCGC > NC_000913/1952448‑1952739 | gCTGTTTATGGAAATGAATGGCGCAGAAACCTGGATGGTGCATATTTGCGGCATCGTTTTGCTTGCTGGTCGTCTGATGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGCCACCTGGTGTgcgc > 7:181563/1‑149 (MQ=255) gTTTATGGAAATGAATGGCGCAGAAACCTGGATGGTGCATATTTGCGGCATCGTTTTGCTTGCTGGTCGTCTGATGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGCCACCTGGTGTGCGCTGt > 8:186978/1‑149 (MQ=255) tttATGGAAATGAATGGCGCAGAAACCTGGATGGTGCATATTTGCGGCATCGTTTTGCTTGCTGGTCGTCTGATGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGCCACCTGGTGTGCGCTGtt < 8:142559/149‑1 (MQ=255) aTGGAAATGAATGGCGCAGAAACCTGGATGGTGCATATTTGCGGCATCGTTTTGCTTGCTGGTCGTCTGATGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGCCACCTGGTGTGCGCTGTTGCt > 3:164504/1‑149 (MQ=255) aTGGAAATGAATGGCGCAGAAACCTGGATGGTGCATATTTGCGGCATCGTTTTGCTTGCTGGTAGTCTGATGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGCAACCTGTTGTGAGATGTTGCt > 4:223994/1‑149 (MQ=255) aaaTGAATGGCGCAGAAACCTGGATGGTGCATATTTGCGGCATCGTTTTGCTTGCTGGTCGTCTGATGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGCCACCTGGTGTGTGCTGTTGCTGATg < 1:64193/149‑1 (MQ=255) aatgGCGCAGAAACCTGGATGGTGCATATTTGCGGCATCGTTTTGCTTGCTGGTCGTCTGATGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGCCCCCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCt > 6:116584/1‑149 (MQ=255) tgGCGCAGAAACCTGGATGGTGCATATTTGCGGCATCGTTTTGCTTGCTGGTCGTCTGATGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGCCACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTgg < 3:350258/149‑1 (MQ=255) tgGCGCAGAAACCTGGATGGTGCATATTTGCGGCATCGTTTTGCTTGCTGGTCGTCTGATGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGCCACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTgg > 8:165448/1‑149 (MQ=255) tgGCGCAGAAACCTGGATGGTGCATATTTGCGGCATCGTTTTGCTTGCTGGTCGTCTGATGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGCCACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTgg < 3:156803/149‑1 (MQ=255) gcgcAGAAACCTGGATGGTGCATATTTGCGGCATCGTTTTGCTTGCTGGTCGTCTGATGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGCCACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGc < 2:126787/148‑1 (MQ=255) ccTGGATGGTGCATATTTGCGGCATCGTTTTGCTTGCTGGTCGTCTGATGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGCCACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTgg < 2:8890/149‑1 (MQ=255) cTGGATGGTGCATATTTGCGGCATCGTTTTGCTTGCTGGTCGTCTGATGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGCCACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTgg > 4:180782/1‑148 (MQ=255) cTGGATGGTGCATATTTGCGGCATCGTTTTGCTTGCTGGTCGTCTGATGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGCCACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGt < 3:317780/149‑1 (MQ=255) cTGGATGGTGCATATTTGCGGCATCGTTTTGCTTGCTGGTCGTCTGATGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGCCACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGt < 3:180782/149‑1 (MQ=255) cTGGATGGTGCATATTTGCGGCATCGTTTTGCTTGCTGGTCGTCTGATGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGCCACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGt < 8:181563/149‑1 (MQ=255) tGGATGGTGCATATTTGCGGCATCGTTTTGCTTGCTGGTCGTCTGATTCATTATTACGGTTTTCATAACACTCTGTTACGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGCCACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGta > 3:40824/1‑149 (MQ=255) ggATGGTGCATATTTGCGGCATCGTTTTGCTTGCTGGTCGTCTGATGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGCCACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGta > 2:279268/1‑148 (MQ=255) gATGGTGCATATTTGCGGCATCGTTTTGCTTGCTGGTCGTCTGATGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGCCACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGta < 4:275514/147‑1 (MQ=255) gATGGTGCATATTTGCGGCAGCGTTTTGCTTGCTGGTCGTCTGATGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGCCACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGtata > 7:382534/1‑149 (MQ=255) gTGCATATTTGCGGCATCGTTTTGCTTGCTGGTCGTCTGAGGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGCCACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGcc > 1:6128/1‑149 (MQ=255) tGCATATTTGCGGCATCGTTTTGCTTGCTGGTCGTCTGATGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGCCACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGccc > 4:187528/1‑149 (MQ=255) gCATTTTTGCGGCATCGTTTTGCTTGCTGGTCGTCTGATGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGCCACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTgg < 4:222592/139‑1 (MQ=255) gCATATTTGCGGCATCGTTTTGCTTGCTGGTCGTCTGATGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGCCACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTgg > 3:222592/1‑139 (MQ=255) cATATTTGCGGCATCGTTTTGCTTGCTGGTCGTCTGATGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGCCACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCt < 4:240935/148‑1 (MQ=255) atatTTGCGGCATCGTTTTGCTTGCTGGTCGTCTGATGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGCCACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGc > 3:154467/1‑144 (MQ=255) atatTTGCGGCATCGTTTTGCTTGCTGGTCGTCTGATGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGCCACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGc < 4:154467/144‑1 (MQ=255) atatTTGCGGCATCGTTTTGCTTGCTGGTCGTCTGATGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGCCACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTgg > 3:216295/1‑149 (MQ=255) atatTTGCGGCATCGTTTTGCTTGCTGGTCGTCTGATGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGCCACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGCGCTGGCGAATCTTTGGTATATGTCCTgg < 7:346801/149‑1 (MQ=255) tttGCGGCATCGTTTTGCTTGCTGGTCGTCTGATGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGCCACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGa < 4:284457/148‑1 (MQ=255) cGGCATCGTTTTGCTTGCTGGTCGTCTGATGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGCCACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGtgg < 3:171997/148‑3 (MQ=255) cGGCATCGTTTTGCTTGCTGGTCGTCTGATGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGCCACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTg < 7:49248/148‑1 (MQ=255) ggCATCGTTTTGCTTGCTGGTCGTCTGATGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGCCACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGt > 2:65863/1‑149 (MQ=255) cATCGTTTTGCTTGCTGGTCGTCTGATGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGCCACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGttt < 8:233414/149‑1 (MQ=255) gTTTTGCTTGCTGGTCGTCTGATGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCTGCATGAGCGCCACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTtct < 7:285537/148‑1 (MQ=255) ttttGCTTGCTGGTCGTCTGATGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGCCACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTTGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTcc > 3:257946/1‑149 (MQ=255) ttttGCTTGCTGGTCGTCTGATGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGCCACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTcc > 2:22933/1‑149 (MQ=255) ttttGCTTGCTGGTCGTCTGATGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGCCACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTcc > 7:95358/1‑149 (MQ=255) tgcttgctGGTCGTCTGATGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGCCACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATAGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTCCCt < 1:207628/148‑1 (MQ=255) cttgctGGTCGTCTGATGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGCCACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCGGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTCCCTGc < 3:276824/148‑1 (MQ=255) tGGTCGTCTGATGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTGTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGCCACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGGATATGCCCGGGGAGTTGGTTTTCTCCCTGCGTTAgc > 4:302308/1‑149 (MQ=255) gtcgtcTGATGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGCCACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTATTCTCCCTGCGTTAgcg > 8:108132/1‑148 (MQ=255) tGATGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGCCACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTCCCTGCGTTAGCGCACAATa > 2:288667/1‑149 (MQ=255) tGATGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGCCACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTCCCTGCGTTAGCGCACAATa > 7:179392/1‑149 (MQ=255) aTGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGCCACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTCCCTGCGTTAGCGCACAATAc < 4:269904/148‑1 (MQ=255) aTGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGCCACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTCCCTGCGTTAGCGCACAATACg > 5:304068/1‑149 (MQ=255) cATTATTACGGTTTTCATCACGGTCTGGTCCGCTGGCGTCGTTCCTGCATGAGCGCCACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGAGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTCCCTGCGTTAGCGCGCAATACGCCa < 4:40824/149‑1 (MQ=255) cATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGCCACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTCCCTGCGTTAGCGCACAATACGCCa < 7:165448/149‑1 (MQ=255) attattACGGTTTTCATAACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGCCACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCGGGCGAATCTTGGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTCCCTGCGTTAGCGCACAATACGCCAc < 6:155170/149‑1 (MQ=255) ttaCGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGCCACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTCCCTGCGTTAGCGCACAATACGCCActttc > 1:164920/1‑149 (MQ=255) cGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGCCACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTCCCTGCGTTAGCGCACAATACGCCActttctt < 8:179392/148‑1 (MQ=255) ggTGTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGCCTCCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTCCCTGCGTTAGCGCACAATACGCCACTTTCtttt < 3:223994/149‑1 (MQ=255) gTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGCCACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTCCCTGCGTTAGCGCACAATACGCCACTTTCttttt > 5:61503/1‑149 (MQ=255) ttttCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGCCACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTCCCTGCGTTAGCGCACAATACGCCACTTTCTTTTTc < 1:288667/149‑1 (MQ=255) catcaCCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGCCACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTCCCTGCGTTAGCGCACAATACGCCACTTTCTTTTTCCCg > 6:58589/1‑148 (MQ=255) atcaCCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGCCACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTtct > 1:329645/1‑108 (MQ=255) atcaCCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGCCACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTtct < 2:329645/108‑1 (MQ=255) atcaCCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGCCACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTCCCTGCGTTAGCGCACAATACGCCACTTTCTTTTTCCCGGa > 3:52129/1‑149 (MQ=255) atcaCCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGCCACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTCCCTGCGTTAGCGCACAATACGCCACTTTCTTTTTCCCGGa > 7:201867/1‑149 (MQ=255) cGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGCCACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTCCCTGCGTTAGCGCACAATACGCCACTTTCTTTTTCCCGGAtttt > 2:6721/1‑148 (MQ=255) ttCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGCCACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTCCCTGCGTTAGCGCACAATACGCCACTTTCTTTTTCCCGGATTTTTACGtt < 1:65863/148‑1 (MQ=255) ccGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGCCACCTGGTGTGCGCTGTTTCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGTGTGGGTTTTCTCCCTGCGTTAGCGCACAATACGCCACTTTCTTTTTCCCGGATTTTTACGTTAt < 1:279268/148‑1 (MQ=255) cGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGCCACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTCCCTGCGTTAGCGCACAATACGCCACTTTCTTTTTCCCGGATTTTTACGTTATGt < 6:304068/149‑1 (MQ=255) cGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGCCACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTCCCTGCGTTAGCGCACAATACGCCACTTTCTTTTTCCCGGATTTTTACGTTATGt > 1:386211/1‑149 (MQ=255) tGGCGACGTTCCGGCATGAGCGCCACCTGGTGTGTGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTCCCTGCGTTAGCGCACAATACGCCAc < 4:132694/117‑1 (MQ=255) tGGCGACGTTCCGGCATGAGCGCCACCTGGTGTGTGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTCCCTGCGTTAGCGCACAATACGCCAc < 4:127359/117‑1 (MQ=255) tGGCGACGTTCCGGCATGAGCGCCACCTGGTGTGTGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTCCCTGCGTTAGCGCACAATACGCCAc > 3:127359/1‑117 (MQ=255) tGGCGACGTTCCGGCATGAGCGCCACCTGGTGTGTGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTCCCTGCGTTAGCGCACAATACGCCAc > 3:132694/1‑117 (MQ=255) cGACGTTCCGGCATGAGCGCCACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTCCCTGCGTTAGCGCACAATACGCCACTTTCTTTTTCCCGGATTTTTACGTTATGTCTCAcc < 7:186978/149‑1 (MQ=255) gTTCCGGCATGAGCGCCACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTCCCTGCGTTAGCGCACAATACGCCACTTTCTTTTTCCCGGATTTTTACGTTATGTCTCACCGCGa > 1:300882/1‑149 (MQ=255) cGGCATGAGCGCCACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTCCCTGCGTTAGCGCACAATACGCCACTTTCTTTTTCCCGGATTTTTACGTTATGTCTCACCGCGacac < 3:187528/148‑1 (MQ=255) ggCATGAGCGCCACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTCCCTGCGTTAGCGCACAATACGCCACTTTCTTTTTCCCGGATTTTTACGTTATGTCTCACCGCGACACGc > 1:61678/1‑149 (MQ=255) 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cgcCACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTCCCTGCGTTAGCGCACAATACGCCACTTTCTTTTTCCCGGATTTTTACGTTATGTCTCACCGCGACACGCTATTTTCt > 3:306896/1‑149 (MQ=255) ccACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTCCCTGCGTTAGCGCACAATACGCCACTTTCTTTTTCCCGGATTTTTACGTTATGTCTCACCGCGACACGCTATTTTCTGc < 5:58589/149‑1 (MQ=255) cACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTCCCTGCGTTAGCGCACAATACGCCACTTTCTTTTTCCCGGATTTTTACGTTATGTCTCACCGCGACACGCTATTTTCTGcc > 3:2729/1‑149 (MQ=255) aCCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTCCCTGCGTTAGCGCACAATACGCCACTTTCTTTTTCCCGGATTTTTACGTTATGTCTCACCGCGACACGCTATTTTCTGccc < 2:164920/149‑1 (MQ=255) aCCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTCCCTGCGTTAGCGCACAATACGCCACTTTCTTTTTCCCGGATTTTTACGTTATGTCTCACCGCGACACGCTATTTTCTGccc > 1:37032/1‑149 (MQ=255) aCCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTCCCTGCGTTAGCGCACAATACGCCACTTTCTTTTTCCCGGATTTTTACGTTATGTCTCACCGCGACACGCTATTTTCTGccc > 3:161746/1‑149 (MQ=255) aCCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTCCCTGCGTTAGCGCACAATACGCCACTTTCTTTTTCCCGGATTTTTACGTTATGTCTCACCGCGACACGCTATTTTCTGccc < 4:2729/149‑1 (MQ=255) gtgCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTCCCTGCGTTAGCGCACAATACGCCACTTTCTTTTTCCCGGATTTTTACGTTATGTCTCACCGCGACACGCTATTTTCTGCCCCTATCGc < 7:354185/149‑1 (MQ=255) | GCTGTTTATGGAAATGAATGGCGCAGAAACCTGGATGGTGCATATTTGCGGCATCGTTTTGCTTGCTGGTCGTCTGATGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGCCACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTCCCTGCGTTAGCGCACAATACGCCACTTTCTTTTTCCCGGATTTTTACGTTATGTCTCACCGCGACACGCTATTTTCTGCCCCTATCGC > NC_000913/1952448‑1952739 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |