| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,281,524 | C→T | 5.0% | pseudogene (454/555 nt) | agaA → | pseudogene, N‑acetylgalactosamine‑6‑phosphate deacetylase fragment; putative N‑acetylgalactosamine‑6‑phosphate deacetylase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,281,524 | 0 | C | T | 5.0% | 257.9 / 2.2 | 80 | pseudogene (454/555 nt) | agaA | pseudogene, N‑acetylgalactosamine‑6‑phosphate deacetylase fragment; putative N‑acetylgalactosamine‑6‑phosphate deacetylase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (34/41); new base T (2/2); total (37/43) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.17e-01 | |||||||||||
CGTACCGCGTCTGGTGGGCTGGCGGGCAGTACGCTGTCTGTTGATGCGGCAGTGCGCAATATGGTCGAGTTGACGGGCGTAACGCCTGCGGAAGCCATCCATATGGCGTCGCTGCATCCGGCGCGAATGCTGGGTGTTGATGGTGTTCTGGGATCGCTTAAACCGGGCAAACGCGCCAGCGTCGTTGCGCTGGATAGCGGGCTACATGTGCAACAAATCTGGATTCAGGGTCAATTAGCTTCGTTTTGATAGTTTGCTCCTTTATTGGGCCTTCACTTCCCCCGTAAGGCCTTTCT > NC_000913/3281377‑3281672 | cGTACCGCGTCTGGTGGGCTGGCGGGCAGTACGCTGTCTGTTGATGCGGCAGTGCGCAATATGGTCGAGTTGACGGGCGTAACGCCTGCGGAAGCCATCCATATGGCGTCGCTGCATCCGGCGCGAATGCTGGGTGTTGATTGTGTTc < 6:87233/148‑1 (MQ=255) cgcgTCTGGTGGGCTGGCGGGCAGTACGCTGTCTGTTGATGCGGCAGTGCGCAATATGGTCGAGTTGACGGGCGTAACGCCTGCGGAAGCCATCCATATGGCGTCGCTGCATCCGGCGCGAATGCTGGGTGTTGATGGTGTTCTGGGAt < 4:318181/149‑1 (MQ=255) gcgTCTGGTGGGCTGGCGGGCAGTACGCTGTCTGTTGATGCGGCAGTGCGCAATATGGTCGAGTTGACGGGCGTAACGCCTGCGGAAGCCATCCATATGGCGTCGCTGCATCCGGCGCGAATGCTGGGTGTTGATGGTGTTCTGGGATc < 1:195448/149‑1 (MQ=255) gttggCTGGCGGTCAGTTCGCTGGATGTTGCTGCGGCAGTGCGAAATATTGTCGAGTTGACGGTCGTAACGGCTGCGGAAGCGTTCCATATTGCGTCTCTGCATCCGTTGCGTATGCTGGTTGTTGATTGTGTTCTGGGATCGCTTaaa < 6:187525/146‑1 (MQ=255) tggGCTGGCGGGCAGTACGCTGTCTGTTGATGCGGCAGTGCGCAATATGGTCGAGTTGACGGGCGTAACGCCTGCGGAAGCCATCCATATGGCGTCGCTGCATCCGGCGCGAATGCTGGGTGTTGATGGTGTTCTGGGATCGCTTAAAc > 3:115387/1‑149 (MQ=255) gCTGGCGGGCAGTACGCTGTCTGTTGATGCGGCAGTGCGCAATATGGTCGAGTTGACGGGCGTAACGCCTGCGGAAGCCATCCATATGGCGTCGCTGCATCCGGCGCGAATGCTGGGTGTTGATGGTGTTCTGGGATCGCTTAAACCgg < 7:308438/149‑1 (MQ=255) gCTGGCGGGCAGTACGCTGTCTGTTGATGCGGCAGTGCGCAATATGGTCGAGTTGACGGGCGTAACGCCTGCGGAAGCCATCCATATGGCGTCGCTGCATCCGGCGCGAATGCTGGGTGTTGATGGTGTTCTGGGATCGCTTAAACCgg < 8:242920/149‑1 (MQ=255) cTGGCGGTCAGTTCGCTTGATGTTGATGCGGCAGTGCGCAATATGGTCGCGTTGCTGGGCGTAACGCCTGCGGAAGCTCTCCATATGGCGTAGCTGCATCCGGCGCGAATGCTGGGTGTTGATGGTGTTCTGGGATCGCTTAAACCggg < 8:397893/149‑1 (MQ=255) tGGCGGGCAGTACGCTGTCTGTTGATGCGGCAGTGCGCAATATGGTCGAGTTGACGGGCGTAACGCCTGCGGAAGCCATCCATATGGCGTCGCTGCATCCGGCGCGAATGCTGGGTGTTGATGGTGTTc > 1:122614/1‑129 (MQ=255) tGGCGGGCAGTACGCTGTCTGTTGATGCGGCAGTGCGCAATATGGTCGAGTTGACGGGCGTAACGCCTGCGGAAGCCATCCATATGGCGTCGCTGCATCCGGCGCGAATGCTGGGTGTTGATGGTGTTc < 2:122614/129‑1 (MQ=255) aGTACGCTGTCTGTTGATGCGGCAGTGCGCAATATGGTCGAGTTGACGGGCGTAACGCCTGCGGAAGCCATCCATATGGCGTCGCTGCATCCGGCGCGAATGCTGGGTGTTGATGGTGTTCTGGGATCGCTTAAACCGGGCAAACgcgc < 8:53475/149‑1 (MQ=255) tACGCTGTCTGTTGATGCGGCAGTGCGCAATATGGTCGAGTTGACGGGCGTAACGCCTGCGGAAGCCATCCATATGGCGTCGCTGCATCCGGCGCGAATGCTGGGTGTTGATGGTGTTCTGGGATCGCTTAAACCGGGCAAACgcgc > 7:229622/1‑147 (MQ=255) aCGCTGGCTGTTGATGCGGCAGTGCGCAATATGGTCGAGTTGACGGGCGTAACGCCTGCGGAAGCCATCCATATGGCGTCGCTGCATCCGGCGCGAATGCTGGGTGTTGATGGTGTTCTGGGATCGCTTAAACCGGGCAAACGCGCCa < 1:237005/148‑1 (MQ=255) gCTGTCTGTTGATGCGGCAGTGCGCAATATGGTCGAGTTGACGGGCGTAACGCCTGCGGAAGCCATCCATATGGCGTCGCTGCATCCGGCGCGAATGCTGGGTGTTGATGGTGTTTTGGGATCGCTTAAACCGGGCAAACGCGCCAGcg > 8:44682/1‑149 (MQ=255) gCTGTCTGTTGATGCGGCAGTGCGCAATATGGTCGAGTTGACGGGCGTAACGCCTGCGGAAGCCATCCATATGGCGTCGCTGCATCCGGCGCGAATGCTGGGTGTTGATGGTGTTTTGGGATCGCTTAAACCGGGCAAACGCGCCAGcg > 8:51210/1‑149 (MQ=255) ctgtctgtTGATGCGGCAGTGCGCAATATGGTCGAGTTGACGGGCGTAACGACTGCGGAAGCCATCCATATGGCGTCGCTGCATCCGGCGCGAATGCTGGGTGTTGATGGTGTTCTGGGATCGCTTAAACCGGGCAAACGCGCCAGcgt < 2:178736/149‑1 (MQ=255) gtTGATGCGGCAGTGCGCAGTATGGTCGAGTTGACGGGCGTAACGCCTGCGGAAGCCATCCATATGGCGTCGCTGCATCCGGCGCGAATGCTGGGTGTTGATGGTGTTCTGGGATCGCTTAAACCGGGCAAACGCGCCAGCGTCGTTgc > 8:78981/1‑149 (MQ=255) gtTGATGCGGCAGTGCGCAATATGGTCGAGTTGACGGGCGTAACGCCTGCGGAAGCCATCCATATGGCGTCGCTGCATCCGGCGCGAATGCTGGGTGTTGATGGTGTTCTGGGATCGCTTAAACCGGGCAAACGCGCCAGCGTCGTTgc > 5:252620/1‑149 (MQ=255) ttGATGCGGCAGTGCGCAATATGGTCGAGTTGACGGGCGTAACGCCTGCGGAAGCCATCCATATGGCGTCGCTGCATCCGGCGCGATTGCTGGGTGTTGATGGTGTTCTGGGATCGCTTAAACCGGGCAAACGCGCCAGCGTCGtt < 8:146406/146‑1 (MQ=255) ttGATGCGGCAGTGCGCAATATGGTCGAGTTGACGGGCGTAACGCCTGCGGAAGCCATCCATATGGCGTCGCTGCATCCGGCGCGAATGCTGGGTGTTGATGGTGTTCTGGGATCGCTTAAACCGGGCAAACGCGCCAGCGTCGTTgcg > 4:338261/1‑149 (MQ=255) tGCGGCAGTGCGCAATATGGTCGAGTTGACGGGCGTAACGCCTGCGGAAGCCATCCATATGGCGTCGCTGCATCCGGCGCGAATGCTGGGTGTTGATGGTGTTCTGGGATCGCTTAAACCGGGCAAACGCGCCAGCGTCGTTGCGCTg > 3:49045/1‑148 (MQ=255) tGCGGCAGTGCGCAATATGGTCGAGTTGACGGGCGTAACGCCTGCGGAAGCCATCCATATGGCGTCGCTGCATCCGGCGCGAATGCTGGGTGTTGATGGTGTTCTGGGAGCGCTTAAACCGGGCAAACGCGCCAGCGTCGTTGCGCTgg < 5:224660/149‑1 (MQ=255) gCGGCAGTGCGCAATATGGTCGAGTTGACGGGCGTAACGCCTGCGGAAGCCATCCATATGGCGTCGCTGCATCCGGCGCGAATGCTGGGTGTTGATGGTGTTCTGGGATCGCTTAAACCGGGCAAACGCGCCAGCGTCGTTGCGCTGGa > 7:32350/1‑149 (MQ=255) ggCAGTGCGCAATATGGTCGAGTTGACGGGCGTAACGCCTGCGGAAGCCATCCATATGGCGTCGCTGCATCCGGCGCGAATGCTGGGTGTTGATGGTGTTCTGGGATCGCTTAAACCGGGCAAACGCGCCAGCGTCGtt > 7:185940/1‑139 (MQ=255) ggCAGTGCGCAATATGGTCGAGTTGACGGGCGTAACGCCTGCGGAAGCCATCCATATGGCGTCGCTGCATCCGGCGCGAATGCTGGGTGTTGATGGTGTTCTGGGATCGCTTAAACCGGGCAAACGCGCCAGCGTCGtt < 8:185940/139‑1 (MQ=255) aGTGCGCAATATGGTCGAGTTGACGGGCGTAACGCCTGCGGAAGCCATCCATATGGCGTCGCGGCATCCGGCGCGAATGCTGGGTGTTGATGGTGTGCTGGGATCGCTTAAACCGGGCAAACGCGCCAGCGTCGTTGCGCTGGATAGCg < 6:96501/149‑1 (MQ=255) tGCGCAATATGGTCGAGTTGACGGGCGTAACGCCTGCGGAAGCCATCCATATGGCGTCGCTGCATCCGGCGCGAATGCTGGGTGTTGATGGTGTTCTGGGATCGCTTAAACCGGGCAAACGCGCCAGCGTCGTTGCGCTGGATAGCggg > 5:215762/1‑149 (MQ=255) tGCGCAATATGGTCGAGTTGACGGGCGTAACGCCTGCGGAAGCCATCCATATGGCGTCGCTGCATCCGGCGCGAATGCTGGGTGTTGATGGTGGTCTGGGATCGCTTAAACCGGGCAAACGCGCCAGCGTCGTTGCGCTGGATAGCggg < 2:278050/149‑1 (MQ=255) cgcAATATGGTCGAGTTGACGGGCGTAACGCCTGCGGAAGCCATCCATATGGCGTCGCTGCATCCGGCGCGAATGCTGGGTGTTGATGGTGTTCTGGGATCGCTTAAACCGGGCAAACGCGCCAGCGTCGTTGCGCTGGATAGCGGGc > 2:36734/1‑148 (MQ=255) cgcAATATGGTCGAGTTGACGGGCGTAACGCCTGCGGAAGCCATCCATATGGCGTCGCTGCATCCGGCGCGAATGCTGGGTGTTGATGGTGTTCTGGGATCGCTTAAACCGGGCAAACGCGCCAGCGTCGTTGCGCTGGATAGCGGGc > 8:146774/1‑148 (MQ=255) aaTATGGTCGAGTTGACGGGCGTAACGCCTGAGGAAGCCATCCATATTGCGTAGATGCATCCGTCGCGAATGCTGGGTGTTGATGGTGTTCTGTGATCGCGTAAACCGGGCAAACTAGACAGCGTCGTTGCGCTGGATAGAGGGCTaa < 2:99479/148‑2 (MQ=255) atatGGTCGAGTTGACGGGCGTAACGCCTGCGGAAGCCATCCATATGGCGTCGCTGCATCCGGCGCGAATGCTGGGTGTTGATGGTGTTCTGGGATCGCTTAAACCGGGCAAACGCGCCAGCGTCGTTGCGCTGGATAGCGGGCTACAt < 6:215762/149‑1 (MQ=255) tGGTCGAGTTGACGGGCGTAACGCCTGCGGAAGCCATCCATATGGCGTCGCTGCATCCGGCGCGAATGCTGGGTGTTGATGGTGTTTTGGGATCGCTTAAACCGGGCAAACGCGCCAGCGTCGTTGCGCTGGATAGCGGGCTACAtgt < 7:44682/148‑1 (MQ=255) tGGTCGAGTTGACGGGCGTAACGCCTGCGGAAGCCATCCATATGGCGTCGCTGCATCCGGCGCGAATGCTGGGTGTTGATGGTGTTTTGGGATCGCTTAAACCGGGCAAACGCGCCAGCGTCGTTGCGCTGGATAGCGGGCTACAtgt < 7:51210/148‑1 (MQ=255) tGGTCGAGTTGACGGGCGTAACGCCTGCGGAAGCCATCCATATGGCGTCGCTGCATCCGGCGCGAATGCTGGGTGTTGATGGTGTTCTGGGATCGCTTAAACCGGGCAAACGCGCCAGCGTCGTTGCGCTGGATAGCGGGCTACAtgt < 4:49045/148‑1 (MQ=255) gAGGTGACGGGCGTAACGCCTGCGGAAGCCATCCATATGGCGTCGCTGCATCCGGCGCGAATGCTGGGTGTTGATGGTGTTCTGGGATCGCTTAAACCGGGCAAACGCGCCAGCGTCGTTGCGCTGGATAGCGGGCTACATGTGcaac < 1:157249/148‑1 (MQ=255) aGTTGACGGGCGTAACGCCTGCGGAAGCCATCCATATGGCGTCGCTGCATCCGGCGCGAATGCTGGGTGTTGATGGTGTTCTGGGATCGCTTAAACCGGGCAAACGCGCCAGCGTCGTTGCGCTGGATAGCGGGCTACATGTGcaaca > 7:400568/1‑148 (MQ=255) ttGACGGGCGTAACGCCTGCGGAAGCCATCCATATGGCGTCGCTGCATCCGGCGCGAATGCTGGGTGTTGATGGTGTTCTGGGATCGCTTAAACCGGGCAAACGCGCCAGCGTCGTTGCGCTGGATAGCGGGCTACATGTGCAACAAAt < 6:310762/149‑1 (MQ=255) gggCGTAACGCCTGCGGAAGCCATCCATATGGCGTCGCTGCATCCGGCGCGAATGCTGGGTGTTGATGGTGTTCTGGGATCGCTTAAACCGGGCAAACGCGCCAGCGTCGTTGCGCTGGATAGCGGGCTACATGTGCAACAAATCTGGa > 3:98748/1‑149 (MQ=255) gTAACGCCTGCGGAAGCCATCCATATGGCGTCGCTGCATCCGGCGCGAATGCTGGGTGTTGATGGTGTTCTGGGATCGCTTAAACCGGGCAAACGCGCCAGCGTCGTTGCGCTGGATAGCGGGCTACATGTGCAACAAATCTGGATTCa < 4:98748/149‑1 (MQ=255) tAACGCCTGAGGAAGCTCTGCATATCTGGTCGCTGCATCCGGCGCGAATGCTGGGTGTTGATGGTGGTCTGGGATCGCTTACACCGGGCAAACGCGCCAGCGGCGTTGCGCTGGATAGCGGGCTACATGTGCAACAAATCTGGATTCAg < 4:46003/149‑1 (MQ=255) aCGCCTGCGGAAGCCATCCATATGGCGTCGCTGCATCCGGCGCGAATGCTGGGTGTTGATGGTGTTCTGGGATCGCTTAAACCGGGCAAACGCGCCAGCGTCGTTGCGCTGGATAGCGGGCTACATGTGCAACAAATCTGGATTCa < 6:192828/146‑1 (MQ=255) aCGCCTGCGGAAGCCATCCATATGGCGTCGCTGCATCCGGCGCGAATGCTGGGTGTTGATGGTGTTCTGGGATCGCTTAAACCGGGCAAACGCGCCAGCGTCGTTGCGCTGGATAGCGGGCTACATGTGCAACAAATCTGGATTCa > 5:192828/1‑146 (MQ=255) aCGCCTGCGGAAGCCATCCATATGGCGTCGCTGCATCCGGCGCGAATGCTGGGTGTTGATGGTGTTCTGGGATCGCTTAAACCGGGCAAACGCGCCAGCGTCGTTGCGCTGGATAGCGGGCTACATGTGCAACAAATCTGGATTCAgg < 8:49977/148‑1 (MQ=255) aCGCCTGCGGAAGCCATCCATATGGCGTCGCTGCATCCGGCGCGAATGCTGGGTGTTGATGGTGTTCTGGGATCGCTTAAACCGGGCAAACGCGCCAGCGTCGTTGCGCTGGATAGCGGGCTACATGTGCAACAAATCTGGATTCAgg < 6:279753/148‑1 (MQ=255) cGCCTGCGGATGCCATCCATATGGCGTCGCTGCATCCGGCGCGAATGCTGGGTGTTGATGGTGTTCTGGGATCGCTTAAACCGGGCAAACGCGCCAGCGTCGTTGCGCTGGATAGCGGGCTACATGTGCAACAAATCTGGATTCAGGGt < 2:211019/149‑1 (MQ=255) gCGGAAGCCATCCATATGGCGTCGCTGCATCCGGCGCGAATGCTGGGTGTTGATGGTGTTCTGGGATCGCTTAAACCGGGCAAACGCGCCAGCGTCGTTGCGCTGGATAGCGGGCTACATGTGCAACAAATCTGGATTCAGGGTCAAt > 2:131058/1‑148 (MQ=255) cGGAAGCCATCCATATGGCGTCGCTGCATCCGGCGCGAATGCTGGGTGTTGATGGTGTTCTGGGATCGCTTAAACCGGGCAAACGCGCCAGCGTCGTTGCGCTGGATAGCGGGCTACATGTGCAACAAATCTGGATTCAGGGTCAATTa < 8:400568/149‑1 (MQ=255) gAAGCCATCCATATGGCGTCGCTGCATCCGGCGCGAATGCTGGGTGTTGATGGTGTTCTGGGATCGc < 5:334235/67‑1 (MQ=255) gAAGCCATCCATATGGCGTCGCTGCATCCGGCGCGAATGCTGGGTGTTGATGGTGTTCTGGGATCGc > 6:334235/1‑67 (MQ=255) aGCCATCCATATGGCGTCGCTGCATCCGGCGCGAATGCTGGGTGTTGATGGTGTTCTGGGATCGCTTAAACCGGGCAAACGCGCCAGCGTCGTTGCGCTGGATAGCGGGCTACATGTGCAACAAATCTGGATTCAGGGTCAATTAGCtt < 2:354467/149‑1 (MQ=255) catccatATGGCGTCGCTGCATCCGGCGCGAATGCTGGGTGTTGATGGTGTTCTGGGATCGCTTAAACCGGGCAAACGCGCCAGCGTCGTTGCGCTGGATAGCGGGCTACATGTGCAACAAATCTGGa < 4:62409/128‑1 (MQ=255) atccatATGGCGTCGCTGCATCCGGCGCGAATGCTGGGTGTTGATGGTGTTCTGGGATCGCTTAAACCGGGCAAACGCGCCAGCGTCGTTGCGCTGGATAGCGGGCTACATGTGCAACAAATCTGGATTCAGGGTCAATTAGCTTCGtt > 5:298356/1‑149 (MQ=255) atccatATGGCGTCGCTGCATCCGGCGCGAATGCTGGGTGTTGATGGTGTTCTGGGATCGCTTAAACCGGGCAAACGCGCCAGCGTCGTTGCGCTGGATAGCGGGCTACATGTGCAACAAATCTGGATTCAGGGTCAATTAGCTTCGtt > 7:40778/1‑149 (MQ=255) tccatATGGCGTCGCTGCATCCGGCGCGAATGCTGGGTGTTGATGGTGTTCTGGGATCGCTTAAACCGGGCAAACGCGCCAGCGTCGTTGCGCTGGATAGCGGGCTACATGTGCAACAAATCTGGATTCAGGGTCAATTAGCTTCGttt > 3:175066/1‑149 (MQ=255) ggCGTCGCTGCATCCGGCGCGAATGCTGGGTGTTGATGGTGTTCTGGGATCGCTTAAACCGGGCAAACGCGCCAGCGTCGTTGCGCTGGATAGCGGGCTACATGTGCAACAAATCTGGATTCAGGGTCAATTAGCTTCGTTTTGATAGt > 6:60441/1‑149 (MQ=255) aTCCGGCGCGAATGCTGGGTGTTGATGGTGTTCTGGGATCGCTTAAACCGGGCAAACGCGCCAGCGTCGTTGCGCTGGATAGCGGGCTACATGTGCAACAAATCTGGATTCAGGGTCAATTAGCTTCGTTTTGa > 6:186746/1‑134 (MQ=255) aTCCGGCGCGAATGCTGGGTGTTGATGGTGTTCTGGGATCGCTTAAACCGGGCAAACGCGCCAGCGTCGTTGCGCTGGATAGCGGGCTACATGTGCAACAAATCTGGATTCAGGGTCAATTAGCTTCGTTTTGa < 5:186746/134‑1 (MQ=255) aTCCGGCGCGAATGCTGGGTGTTGATGGTGTTCTGGGATCGCTTAAACCGGGCAAACGCGCCAGCGTCGTTGCGCTGGATAGCGGGCTACATGTGCAACAAATCTGGATTCAGGGTCAATTAGCTTCGTTTTGATAGTTTGCTCCTTTa > 8:387603/1‑149 (MQ=255) aTCCGGCGCGAATGCTGGGTGTTGATGGTGTTCTGGGATCGCTTAAACCGGGCAAACGCGCCAGCGTCGTTGCGCTGGATAGCGGGCTACATGTGCAACAAATCTGGATTCAGGGTCAATTAGCTTCGTTTTGATAGTTTGCTCCTTTa < 7:387603/149‑1 (MQ=255) cGGCGCGAATGCTGGGTGTTTATGGTGTTCTGGGATCGCTTAAACCGGGCAAACGCGCCAGCGTCGTTGCGCTGGATAGCGGGCTAAATTTGCAACAAATCTGGATTCTGGGGCAATTAGCTTCGTTTTGATAGTTTGCTCCTTTAtt < 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gcgAATGCTGGGTGTTGATGGTGTTCTGGGATCGCTTAAACCGGGCAAACGCGCCAGCGTCGTTGCGCTGGATAGCGGGCTACATGTGCAACAAATCTGGATTCAGGGTCAATTAGCTTCGTTTTGATAGTTTGCTCCTTTATTGGGcc > 6:367392/1‑149 (MQ=255) gcgAATGCTGGGTGTTGATGGTGTTCTGGGATCGCTTAAACCGGGCAAACGCGCCAGCGTCGTTGCGCTGGATAGCGGGCTACATGTGCAACAAATCTCGATTCAGGGTCAATTAGCTTCGTTTTGATAGTTTGCTCCTTTATTGGGcc > 1:323460/1‑149 (MQ=255) gcgAATGCTGGGAGTACATGGTCTTCACGGATCGCTTAAACCGCGCAAACGCGCCAGCGTCGTTGCCCTCGATAGCGGCCTCCATCTGCAACAAATCTGGATTCAGGGTCAATTACCTTCCGTATGATAGTTTGCTCCTTTATTgcgc > 8:125325/1‑148 (MQ=255) tGGGTGTTGATGGTGTTATGGTATCGATTAAACCGGGCAAACGCGCCAGCTTCTTTGCGCTGGATAGATGGCTACATGTTCAACAAATATGGATTAAGTGTCAATTAGCTTCGTTATGATAGTTTGATCCTTTATTGGGCCTTCaagtc > 2:207469/1‑145 (MQ=255) ggTGTTGATGGTGTTCTGGGATCGCTTAAACCGGGCAAACGCGCCAGCGTCTTTGCGCTGGATAGCGGGCTACATGTGCAACAAATCTGGATTCAGGGTCAATTAGCTTCGTTTTGATAGTTTGCTCCTTTATTGGGCCTTCACTTcc < 4:115387/148‑1 (MQ=255) 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gATGGTGTTCTGGGATCGCTTAAACCGGGCAAACGCGCCAGCGTCGTTGCGCTGGATAGCGGGCTACATGTGCAACAAATCTGGATTCAGGGTCAATTAGCTTCGTTTTGATAGTTTGCTCCTTTATTGGGCCTTCACTTCCCCCGt > 6:115415/1‑147 (MQ=255) aTGGTGTTCTGGGATCGCTTAAACCGGGCAAACGCGCCAGCGTCGTTGCGCTGGATAGCGGGCTACATGTGCAACAAATCt < 5:103742/81‑1 (MQ=255) aTGGTGTTCTGGGATCGCTTAAACCGGGCAAACGCGCCAGCGTCGTTGCGCTGGATAGCGGGCTACATGTGCAACAAATCTGGATTCAGGGTCAATTAGCTTCGTTTTGATAGTTTGCTCCTTTATTGGGCCTTCACTTCCCCCGTAAg > 7:183267/1‑149 (MQ=255) aTGGTGTTCTGGGATCGCTTAAACCGGGCAAACGCGCCAGCGTCGTTGCGCTGCATAGCGGGCTACATGTGCAACAAATCt > 6:103742/1‑81 (MQ=255) ttCTGGGATCGCTTAAACCGGGCAAACGCGCCAGCGTCGTTGCGCTGGATAGCGGGCTACATGTGCAACAAATCTGGATTCAGGGTCAATTAGCTTCGTTTTGATAGTTTGCTCCTTTATTGGGCCTTCACTTCCCCCGTAAGGCcttt < 7:2748/149‑1 (MQ=255) ttCTGGGATCGCTTAAACCGGGCAAACGCGCCAGCGTCGTTGCGCTGGATAGCGGGCTACATGTGCAACAAATCTGGATTCAGGGTCAATTAGCTTCGTTTTGATAGTTTGCTCCTTTATTGGGCCTTCACTTCCCCCGTAAGGCctt > 4:361061/1‑148 (MQ=255) cTGGGATCGCTTAAACCGGGCAAACGCGCCAGCGTCGTTGCGCTGGATAGCGGGCTACATGTGCAACAAATCTGGATTCAGGGTCAATTAGCTTCGTTTTGATAGTTTGCTCCTTTATTGGGCCTTCACTTCCCCCGTAAGGCctttct > 6:33190/1‑149 (MQ=255) cTGGGATCGCTTAAACCGGGCAAACGCGCCAGCGTCGTTGCGCTGGATAGCGGGCTACATGTGCAACAAATCTGGATTCAGGGTCAATTAGCTTCGTTTTGATAGTTTGCTCCTTTATTGGGCCTTCACTTCCCCCGTAAGGCctttct > 7:302568/1‑149 (MQ=255) cTGGGATCGCTTAAACCGGGCAAACGCGCCAGCGTCGTTGCGCTGGATAGCGGGCTACATGTGCAACAAATCTGGATTCAGGGTCAATTAGCTTCGTTTTGATAGTTTGCTCCTTTATTGGGCCTTCACTTCCCCCGTAAGGCctttc < 5:367392/148‑1 (MQ=255) | CGTACCGCGTCTGGTGGGCTGGCGGGCAGTACGCTGTCTGTTGATGCGGCAGTGCGCAATATGGTCGAGTTGACGGGCGTAACGCCTGCGGAAGCCATCCATATGGCGTCGCTGCATCCGGCGCGAATGCTGGGTGTTGATGGTGTTCTGGGATCGCTTAAACCGGGCAAACGCGCCAGCGTCGTTGCGCTGGATAGCGGGCTACATGTGCAACAAATCTGGATTCAGGGTCAATTAGCTTCGTTTTGATAGTTTGCTCCTTTATTGGGCCTTCACTTCCCCCGTAAGGCCTTTCT > NC_000913/3281377‑3281672 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |