| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 4155023 | 137 (1.370) | 4 (0.040) | 4/282 | 9.6 | 2.9% | coding (23/1005 nt) | argC | N‑acetyl‑gamma‑glutamylphosphate reductase, NAD(P)‑binding |
| ? | NC_000913 | = 4155043 | 132 (1.330) | coding (43/1005 nt) | argC | N‑acetyl‑gamma‑glutamylphosphate reductase, NAD(P)‑binding | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 137 total aligned reads displayed.
TCAATATTCATGCAGTATTTATGAATAAAAATACACTAACGTTGAGCGTAATAAAACCCACCAGCCGTAAGGTGAATGTTTTACGTTTAACCTGGCAACCAGACATAAGAAGGTGAATAGCCCCGATGTTGAATACGCTGATTGTGGGTGCCAGCGGCTACGCTGGCGCAGAGCTAGTGACCTATGTAAATCGCCATCCGCATATGAACATAACCGCTTTGACTGTTTCAGCGCAAAGCAATGATGCGGGAAAGTTAATCTCCGATTTGCATCCGCAGCTAAAAGGCATCGTTGAT > NC_000913/4154876‑4155171 | tCAATATTCATGCAGTATTTATGAATAAAAATACACTAACGTTGAGCGTAATAAACCCCACCAGCCGTAAGGTGAATGTTTTACGTTTAACCTGGCAACCAGACATAAGAAGGTGAATAGCCCCGATGTTGAATACGCTGATTGTGGGt < 7:406339/149‑1 (MQ=255)tCAATATTCATGCAGTATTTATGAATAAAAATACACTAACGTTGAGCGTAATAAAACCCACCAGCCGTAAGGTGAATGTTTTACGTTTAACCTGGCAACCAGACATAAGAAGGTGAATAGCCCCGATGTTGAATACGCTGATTGTGGGt < 6:18268/149‑1 (MQ=255)tCAATATTCATGCAGTATTTATGAATAAAAATACACTAACGTTGAGCGTAATAAAACCCACCAGCCCTAAGGTGAATGTTTTACGTTTAACCTGGCAACCAGACATAAGAAGGTGAATAGCCCCGATGTTGAATACGCTGATTGTGGGt > 4:168708/1‑149 (MQ=255) atatTCATGCAGTATTTATGAATAAAAATACACTAACGTTGAGCGTAATAAAACCCACCAGCCGTAAGGTGAATGTTTTACGTTTAACCTGGCAACCAGACATAAGAAGGTCAATAGCCCCGATGATGAATACGCTGATTGTGGGTGc > 6:280658/1‑148 (MQ=255) tatTCATGCAGTATTTATGAATAAAAATACACTAACGTTGAGCGTAATAAAACCCACCAGCCGTAAGGTGAATGTTTTACGTTTAACCTGGCAACCAGACATAAGAAGGTGAATAGCCCCGATGTTGAATACGCTGATTGTGGGTGc > 4:312515/1‑147 (MQ=255) ttCATGCAGTATTTATGAATAAAAATACACTAACGTTGAGCGTAATAAAACAGAACATCCGTAAGTTTAATTTTTTACGTTTAACCTTTCAACAAGACATAAGAATGTGAATAGCCCCGATGTTGAATACGCTTATTGTGGGTGCCAg < 7:291048/148‑1 (MQ=255) cATGCAGTATTTATGAATAAAAATACACTAACGTTGAGCGTAATAAAACCCACCAGCCGTAAGGTGAATGTTTTACGTTTAACCTGGCAACCAGACATAAGAAGGTGAATAGCCCCGATGTTGAATACGCTGATTGTGGGTGCCAGCg < 2:294211/148‑1 (MQ=255) aTGCAGTATTTATGAATAAAAATACACTAACGTTGAGCGTAATAAAACCCACCAGCCGTAAGGTGAATGTTTTACGTTTAACCTGGTAACCAGACATAAGAAGGTGAATAGCCCCGATGTTGAATACGCTGATTGTGGGTGCCAGCGGc > 1:128527/1‑149 (MQ=255) cAGTATTTATGAATAAAAATACACTAACGTTGAGCGTAATAAAACCCACCAGCCGTAAGGTGAATGTTTTACGTTTAACCTGGCAACCAGACATAAGAAGGTGAATAGCCCCGATGTTGAATACGCTGATTGTGGGTGCCAGCGGCTAc > 2:119827/1‑149 (MQ=255) tttATGAATAAAAATACACTAACGTTGAGCGTAATAAAACCCACCAGCCGTAAGGTGAATGTTTTACGTTTAACCTGGCAACCAGACATAAGAAGGTGAATAGCCCCGATGTTGAATACGCTGATTGTGGGTGCCAGCGGCTACGCTg < 3:358220/148‑1 (MQ=255) taaTGAATAAAAATACACTAACGTCGAGCGTAATCACACCCACCCGCCGTAAGGTGAATGATTTACGTTAACCCTGGCAACCAGACATAAGAAGGTGAATAGCCCCGATGTGGAATACGCTGATTGTGGGTGCCAGCGGCTACGCTGgc < 7:377286/147‑1 (MQ=255) tATGAATAAAAATACACTAACGTTGAGCGTAATAAACCCCCCCAGCAGTAAGGTGAATGTTTTACGTTTAACCTGGAAACCAGACATAAGAAGGTGAATAGCCCCTATGTTGAATACGATGATTGTGGGTGCCAGCGGCTACGCTGgcg > 6:47319/1‑149 (MQ=255) aTGAATAAAAATACACTAACGTTGAGCGTAATAAAACCCACCAGCCGTAAGGTGAATGTTTTACGTTTAACCTGGCAACCAGACATAAGAAGGTGAATAGCCCCGATGTTGAATACGCTGATTGTGGGTGCCAGCGGCTACGCTGgcg > 1:21110/1‑148 (MQ=255) gAATAAAAATACACTAACGTTGAGCGTAATAAAACCCACCAGCCGTAAGGTGAATGTTTTACGTTTAACCTGGCAACCAGACATAAGAAGGTGAATAGCCCCGATGTTGAATACGCTGATTGTGGGTGCCAGCGGCTACGCTGgcg > 7:264250/1‑146 (MQ=255) aaTAAAAATACACTAACGTTGAGCGTAATAAAACCCACCAGCCGTAAGGTGAATGTTTTACGTTTAACCTGGCAACCAGACATAAGAAGGTGAATAGCCCCGATGTTGAATACGCTGATTGTGGGTGCCAGCGGCTACGCTGGCGCag < 2:21110/148‑1 (MQ=255) aTAAAAATACACTAACGTTGAGCGTAATAAAACCCACCAGCCGTAAGGTGAATGTTTTACGTTTAACCTGGCAACCAGACATAAGAAGGTGAATAGCCCCGATGTTGAATACGCTGATTGTGGGTGc > 1:64703/1‑127 (MQ=255) aTAAAAATACACTAACGTTGAGCGTAATAAAACCCACCAGCCGTAAGGTGAATGTTTTACGTTTAACCTGGCAACCAGACATAAGAAGGTGAATAGCCCCGATGTTGAATACGCTGATTGTGGGTGc < 2:64703/127‑1 (MQ=255) tAAAACTACACTAACGTTGAGCGGAATACAACCCCCCAGCCGTAAGGTGAATGTTTTACGTTTAACCTGGCAACCAGACATAAGAAGGTGAATAGCCCCGATGTTGAATACGCTGATTGTGGGTGCCAGCGGCTACGCTGGCGCAGAGc < 2:268838/149‑1 (MQ=255) cacTAACGTTGAGCGTAATAAAACCCACCAGCCGTAAGGTGAATGTTTTACGTTTAACCTGGCAACCAGACATAAGAAGGTGAATAGCCCCGATGTTGAATACGCTGATTGTGGGTGCCAGCgg > 1:207829/1‑124 (MQ=255) cacTAACGTTGAGCGTAATAAAACCCACCAGCCGTAAGGTGAATGTTTTACGTTTAACCTGGCAACCAGACATAAGAAGGTGAATAGCCCCGATGTTGAATACGCTGATTGTGGGTGCCAGCgg < 2:207829/124‑1 (MQ=255) tAACGTTGAGCGTAATAAAACCCACCAGCCGTAAGGTGAATGTTTTACGTTTAACCTGGCAACCAGACATAAGAAGGTGAATAGCCCCGATGTTGAATACGCTGATTGTGGGTGCCAGCGGCTACGCTGGCGCAGAGCTAGTGACCTAt < 8:378077/149‑1 (MQ=255) tAACGTTGAGCGTAATAAAACCCACCAGCCGTAAGGTGAATGTTTTACGTTTAACCTGGCAACCAGACATAAGAAGGTGAATAGCCCCGATGTTGAATACGCTGATTGTGGGTGCCAGCGGCTACGCTGGCGCAGAGCTAGTGACCTAt > 5:248598/1‑149 (MQ=255) tAACGTTGAGCGTAATAAAACCCACCAGCCGTAAGGTGAATGTTTTACGTTTAACCTGGCAACCAGACATAAGAAGGTGAATAGCCCCGATGTTGAATACGCTGATTGTGGGTGCCAGCGGCTACGCTGGCGCAGAGCTAGTGACCTAt > 2:180490/1‑149 (MQ=255) aCGTTGAGCGTAATAAAACCCACCAGCCGTAAGGTGAATGTTTTACGTTTAACCTGGCAACCAGACATAAGAAGGTGAATAGCCCCGATGTTGAATACGCTGATTGTGGGTGCCAGCGGCTACGCTGGCGCAGAGCTAGTGACCTAt < 8:192532/147‑1 (MQ=255) aCGTTGAGCGTAATAAAACCCACCAGCCGTAAGGTGAATGTTTTACGTTTAACCTGGCAACCAGACATAAGAAGGTGAATAGCCCCGATGTTGAATACGCTGATTGTGGGTGCCAGCGGCTACGCTGGCGCAGAGCTAGTGACCTATGt < 1:417277/149‑1 (MQ=255) 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taataaAACCCACCAGCCGTAAGGTGAATGTTTTACGTTTAACCTGGCAACCAGACATAAGAAGGTGAATAGCCCCGATGTTGAATACGCTGATTGTGGGTGCCAGCGGCTACGCTGGCGCAGAGCTAGTGACCTATGTAAATCGCCAt > 5:253181/1‑149 (MQ=255) aaCCCACCAGCCGTAAGGTGAATGTTTTACGTTTAACCTGGCAACCAGACATAAGAAGGTGAATAGCCCCGATGTTGAATACGCTGATTGTGGGTGCCAGCGGCTACGCTGGCGCAGAGCTAGTGACCTATGTAAATCGCCATCCGCa > 1:393369/1‑148 (MQ=255) aaCCCACCAGCCGTAAGGTGAATGTTTTACGTTTAACCTGGCAACCAGACATAAGAAGGTGAATAGCCCCGATGTTGAATACGCTGATTGTGGGTGCCAGCGGCTACGCTGGCGCAGAGCTAGTGACCTATGTAAATCGCCATCCGCa > 6:412760/1‑148 (MQ=255) aCCCACCAGCCGTAAGGTGAATGTTTTACGTTTAACCTGGCAACCAGACATAAGAAGGTGAATAGCCCCGATGTTGAATACGCTGATTGTGGGTGCCAGCGGCTACGCTGGCGCAGAGCTAGTGACCTATGTAAATCGCCATCCGCata < 6:334236/149‑1 (MQ=255) cccACCAGCCGTAAGGTGAATGTTTTACGTTTAACCTGGCAACCAGACATAAGAAGGTGAATAGCCCCGATGTTGAATACGCTGATTGTGGGTGCCAGCGGCTACGCTGGCGCAGAGCTAGTGAGCTATGTAAATCGCCATCCGCatat < 8:264250/149‑1 (MQ=255) cccACCAGCCGTAAGGTGAATGTTTTACGTTTAACCTGGCAACCAGACATAAGAAGGTGAATAGCCCCGATGTTGAATACGCTGATTGTGGGTGCCAGCGGCTACGCTGGCGCAGAGCTAGTGACCTATGTAAATCGCCATCCGCatat < 6:253181/149‑1 (MQ=255) acaccaGCAGGAAGCTGAATGTTTTACGTTTAACCTGGCAACCAGCCATAAGAAGGGGAATAGCCCCGATGTGCAATAAGCAGATTGTGGTTGAAAGAGGCTACGCTGGCGATGAGATATTGACCTATGTAAATAGCCATCCGCATATg > 8:107025/2‑149 (MQ=255) ccaGCCGTAAGGTGAATGTTTTACGTTTAACCTGGCAACCAGACATAAGAAGGTGAATAGCCCCGATGTTGAATACGCTGATTGTGGGTGCCAGCGGCTACGCTGGCGCAGAGCTAGTGACCTATGTAAATCGCCATCCGCATATGaa > 5:310194/1‑148 (MQ=255) caGCCGTAAGGTGAATGTTTTACGTTTAACCTGGCAACCAGACATAAGAAGGTGAATAGCCCCGATGTTGAATACGCTGATTGTGGGTGCCAGCGGCTACGCTGGCGCAGAGCTAGTGACCTATGTAAATCGCCATCCGCATATGAACa > 3:82096/1‑149 (MQ=255) cGTAAGGTGAATGTTTTACGTTTAACCTGGCAACCAGACATAAGAAGGTGAATAGCCCCGATGTTGAATACGCTGATTGTGGGTGCCAGCGGCTACGCTGGCGCAGAGCTAGTGACCTATGTAAATCGCCATCCGCATATGAACATAAc < 6:291124/149‑1 (MQ=255) 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cccGATGTTGAATACGCTGATTGTGGGTGCCAGCGGCTACGCTGGCGCAGAGCTAGTGACCGATGTAAATCGCCATCCGCATATGACCATAACCGCTTTGACTGTTTCAGCGCAAAGCAATGATGCGGGAAAGTTAATCTCCGATTTg > 6:359619/1‑148 (MQ=255) ccGATGTTGAATACGCTGATTGTGGGTGCCAGCGGCTACGCTGGCGCAGAGCTAGTGACCTATGTAAATCGCCATCCGCATATGAACATAACCGCTTTGACTGTTTCAGCGCAAAGCAATGATGCGGGAAAGTTAATCTCCGATTTGCa > 4:338193/1‑149 (MQ=255) cGATGTTGAATACGCTGATTGTGGGTGCCAGCGGCTACGCTGGCGCAGAGCTAGTGACCTATGTAAATCGCCATCCGCATATGAACATAACCGCTTTGACTGTTTCAGCGCAAAGCAATGATGCGGGAAAGTTAATCTCCGATTTGCAt < 3:77872/149‑1 (MQ=255) aTGTTGAATACGCTGATTGTGGGTGCCAGCGGCTACGCTGGCGCAGAGCTAGTGACCTATGTAAATCGCCATCCGCATATGAACATAACCGCTTTGACTGTTTCAGCGCAAAGCAATGATGCGGGAAAGTTAATCTCCGATTTGCATcc > 2:64970/1‑149 (MQ=255) ttGAATACGCTGATTGTGGGTGCCAGCGGCTACGCTGGCGCAGAGCTAGTGACCTATGTAAATCGCCATCCGCATATGAACATAACCGCTTTGACTGTTTCAGCGCAAAGCAATGATGCGGGAAAGTTAATCTCCGATTTGCATCCg > 1:212200/1‑147 (MQ=255) ttGAATACGCTGATTGTGGGTGCCAGCGGCTACGCTGGCGCAGAGCTAGTGACCTATGTAAATCGCCATCCGCATATGAACATAACCGCTTTGACTGTTTCAGCGCAAAGCAATGATGCGGGAAAGTTAATCTCCGATTTGCATCCg > 7:347845/1‑147 (MQ=255) ttGAATACGCTGATTGTGGGTGCCAGCGGCTACGCTGGCGCAGAGCTAGTGACCTATGTAAATCGCCATCCGCATATGAACATAACCGCTTTGACTGTTTCAGCGCAAAGCAATGATGCGGGAAAGTTAATCTCCGATTTGCATCCGc < 7:369372/148‑1 (MQ=255) aTACGCTGATTGTGGGTGCCAGCGGCTACGCTGGCGCAGAGCTAGTGACCTATGTAAATCGCCATCCGCATATGAACATAACCGCTTTGACTGTTTCAGCGCAAAGCAATGATGCGGGAAAGTTAATCTCCGATTTGCATCCGCAGCt > 6:128743/1‑148 (MQ=255) gCTGATTGTGGGTGCCAGCGGCTACGCTGGCGCAGAGCTAGTGACCTATGTAAATCGCCATCCGCATATGAACATAACCGCTTTGACTGTTTCAGCGCAAAGCAATGATGCGGGAAAGTTAATCTCCGATTTGCATCCGCAGCTAAAAg > 1:256817/1‑149 (MQ=255) gCTGATTGTGGGTGCCAGCGGCTACGCTGGCGCAGAGCTAGTGACCTATGTAAATCGCCATCCGCATATGAACATAACCGCTTTGACTGTTTCAGCGCAAAGCAATGATGCGGGAAAGTTAATCTCCGATTTGCATCCGCAGCTAAAAg > 1:356270/1‑149 (MQ=255) gATTGTGGGTGCCAGCGGCTACGCTGGCGCAGAGCTAGTGACCTATGTAAATCGCCATCCGCATATGAACATAACCGCTTTGACTGTTTCAGCGCAAAGCAATGATGCGGGAAAGTTAATCTCCGATTTGCATCCGCAGCTAAAAg < 8:119284/146‑1 (MQ=255) gATTGTGGGTGCCAGCGGCTACGCTGGCGCAGAGCTAGTGACCTATGTAAATCGCCATCCGCATATGAACATAACCGCTTTGACTGTTTCAGCGCAAAGCAATGATGCGGGAAAGTTAATCTCCGATTTGCATCCGCAGCTAAAAg > 7:119284/1‑146 (MQ=255) aTTGTGGGTGCCAGCGGCTACGCTGGCGCAGAGCTAGTGACCTATGTAAATCGCCATCCGCATATGAACATAACCGCTTTGACTGTTTCAGCGCAAAGCAATGATGCGGGAAAGTTAATCTCCGATTTGCATCCGCAGCTAAAAGGc < 3:221679/147‑1 (MQ=255) aTTGTGGGTGCCAGCGGCTACGCTGGCGCAGAGCTAGTGACCTATGTAAATCGCCATCCGCATATGAACATAACCGCTTTGACTGTTTCAGCGCAAAGCAATGATGCGGGAAAGATAATCTCCGATTTGCATCCGCAGCTAAAAGGCag > 6:142444/1‑148 (MQ=255) tgGGTGCCAGCGGCTACGCTGGCGCAGAGCTAGTGACCTATGTAAATCGCCATCCGCATATGCACATAACCCCTTTGACTGTTTCAGCGCAAAGCAATGATGCGGGAAAGTTAATCTCCGATTTGCATCCGCAGCTAAAAGGCATCGt < 2:287836/148‑1 (MQ=255) tgGGTGCCAGCGGCTACGCTGGCGCAGAGCTAGTGACCTATGTAAATCGCCATCCGCATATGAACATAACCGCTTTGACTGTTTCAGCGCAAAGCAATGATGCGGGAAAGTTAATCTCCGATTTGCATCCGCAGCTAAAAGGCATCGt < 3:312515/148‑1 (MQ=255) gTGCCAGCGGCTACGCTGGCGCAGAGCTAGTGACCTATGTAAATCGCCATCCGCATATGAACATAACCGCTTTGACTGTTTCAGCGCAAAGCAATGATGCGGGAAAGTTAATCTCCGATTTGCATCCGCAGCTAAAAGGCATCGTTGAt < 4:115945/149‑1 (MQ=255) gTGCCAGCGGCTACGCTGGCGCAGAGCTAGTGACCTATGTAAATCGCCATCCGCATATGAACATAACCGCTTTGACTGTTTCAGCGCAAAGCAATGATGCGGGAAAGTTAATCTCCGATTTGCATCCGCAGCTAAAAGGCATCGTTGAt > 8:7054/1‑149 (MQ=255) | TCAATATTCATGCAGTATTTATGAATAAAAATACACTAACGTTGAGCGTAATAAAACCCACCAGCCGTAAGGTGAATGTTTTACGTTTAACCTGGCAACCAGACATAAGAAGGTGAATAGCCCCGATGTTGAATACGCTGATTGTGGGTGCCAGCGGCTACGCTGGCGCAGAGCTAGTGACCTATGTAAATCGCCATCCGCATATGAACATAACCGCTTTGACTGTTTCAGCGCAAAGCAATGATGCGGGAAAGTTAATCTCCGATTTGCATCCGCAGCTAAAAGGCATCGTTGAT > NC_000913/4154876‑4155171 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |