| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,205,650:1 | +A | 5.8% | coding (102/183 nt) | ymfR → | e14 prophage; uncharacterized protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,205,650 | 1 | . | A | 5.8% | 271.3 / 12.1 | 69 | coding (102/183 nt) | ymfR | e14 prophage; uncharacterized protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (32/33); new base A (2/2); total (34/35) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
GATCACATTGAGTCCTACGGGATCCGCTCGCTTTAACTGAGGTAATTATGATCATGCTGATTCTCGCGCCTCTGGTGGGCGTGCTGGGTGCGCTTTTGCTGGCGTATGGTGCCTGGCTGATTTATCCCCCGGCGGGTTTTGTTGTTGCC‑GGGGCGCTGTGCCTGTTCTGGTCGTGGCTGGTGGCGCGATATCTCGACCGTACACAGTCGTCTGTCGGCGGAGGTAAATAGTGTTCTTTTCGGGATTATTTCAACGAAAAAGTGACGCACCGGTGACCACGCCAGCAGAGCTGGCG > NC_000913/1205502‑1205796 | gATCACATTGAGTCCTACGGGATCCGCTCGCTTTAACTGAGGTAATTATGATCATGCTGATTCTCGCGCCTCTGGTGGGCGTGCTGGGTGCGCTTTTGCTGGCGTATGGTGCCTGGCTGATTTATCCCCCGGCGGGTTTTGTTGTTGcc > 8:206925/1‑149 (MQ=255) aTCACATTGAGTCCTACGGGATCCGCTCGCTTTAACTGAGGTAATTATGATCATGCTGATTCTCGCGCCACTGGTGGGCGTGCTGGGTGCGCTTTTGCTGGCGTATGGTGCCTGGCTGATTTATCCCCCGGCGGGTTTAGTTGTTGCC‑g > 3:85863/1‑149 (MQ=255) tCACATTGAGTCCTACGGGATCCGCTCGCTTTAACTGAGGTAATTATGATCATGCTGATTCTCGCGCCTCTGGTGGGCGTGCTGGGTGCGCTTTTGCTGGCGTATGGTGCCTGGCTGATTTATCCCCCGGCGGGTTTTGTTGTTGCC‑gg < 8:297798/149‑1 (MQ=255) tCACATTGAGTCCTACGGGATCCGCTCGCTTTAACTGAGGTAATTATGATCATGCTGATTCTCGCGCCGCTGGTGGGCGTGCTGGGTGCGCTTTTGCTGGCGTATGGTGCCTGGCTGATTTATCCCCCGGCGGGTTTTGTTGTTGCC‑gg < 6:66823/149‑1 (MQ=255) aGTCCTACGGGATCCGCTCGCTTTAACTGAGGTAATTATGATCATGCTGATTCTCGCGCCTCTGGTGGGCGTGCTGGGTGCGCTTTTGCTGGCGTATGGTGCCTGGCTGATTTATCCCCCGGCGGGTTTTGTTGTTGCC‑GGGGCGCtgt < 8:330044/149‑1 (MQ=255) tACGGGATCCGCTCGCTTTAACTGAGGTAATTATGATCATGCTGATTCTCGCGCCTCTGGTGGGCGTGCTGGGTCCGCTTATTCTGGCGTATGGTGCCTGGCTGCTTTATCCCCCGGCGGCGTTTGTTGTTGCC‑GGGGCGCTGTGCCTg > 6:384786/1‑149 (MQ=255) cGGGATCCGCTCGCTTTAACTGAGGTAATTATGATCATGCTGATTCTCGCGCCTCTGGTGGGCGTGCTGGGTGCGCTTTTGCTGGCGTATGGTGCCTGGCTGATTTATCCCCCGGCGGGTTTTGTTGTTGCC‑GGGGCGCTGTGCCTGtt < 6:381476/149‑1 (MQ=255) ggATCCGCTCGCTGTAACTGAGGTAATTATGATCATGCTGATTCTCGCGCCTCTGGTGGGCGTGCTGGGTGCGCTTTTGCTGGCGTATGGTGCCTGGCTGATTTATCCCCCGGCGGGTTTTGTTGTTGCC‑GGGGCGCTGTGCCTGTTCt < 5:143662/149‑1 (MQ=255) gATCCGCTCGCTTTAACTGAGGTAATTATGATCATGCTGATTCTCGCGCCTCTGGTGGGCGTGCTGGGTGCGCTTTTGCTGGCGTATGGTGCCTGGCTGATTTATCCCCCGGCGGGTTTTGTTGTTGCCAGGGGCGCTGTGCCTGTTCt > 4:86912/1‑149 (MQ=255) gATCCGCTCGCTTTAACTGAGGTAATTATGATCATGCTGATTCTCGCGCCTCTGGTGGGCGTGCTGGGTGCGCTTTTGCTGGCGTATGGTGCCTGGCTGATTTATCCCCCGGCGGGTTTTGTTGTTGCCAGGGGCGCTGTGCCTGTTCt > 4:81559/1‑149 (MQ=255) cgctcgctTTAACTGAGGTAATTATGATCATGCTGATTCTCGCGCCTCTGGTGGGCGTGCTGGGTGCGCTTTTGCTGGCGTATGGTGCCTGGCTGATTTATCCCCCGGCGGGTTTTGTTGTTGCC‑GGGGCGCTGTGCCTGTTCTGGTCg > 4:18124/1‑149 (MQ=255) gctcgctTTAACTGAGGTAATTATGATCATGCTGATTCTCGCGCCTCTGGTGGGCGTGCTGGGTGCGCTTTTGCTGGCGTATGGTGCCTGGCTGATTTATCCCCCGGCGGGTTTTGTTGTTGCC‑GGGGCGCTGTGCCTGTTCTGGTCg < 8:288214/148‑1 (MQ=255) gctTTAACGGAGGTAATTATGATCATGCTGATGCTCGCGCCTCTGGGGGGCGTGCTGGGTGCGCGTTTGCTGGCGTATGGTGCCTGGCTGATTTATCCCCCGGCGGGTTTTGTTGTTGCC‑GGGGCGCTGTGCCTGTTCTGGTCGTGGCt < 1:290505/149‑1 (MQ=255) ctTTAACTGAGGTAATTATGATCATGCTGATTCTCGCGCCTCTGGTGGGCGTGCTGGGTGCGCTTTTGCTGGCGTATGGTGCCTGGCTGATTTATCCCCCGGCGGGTTTTGTTGTTGCC‑GGGGCGCTGTGCCTGTTCTGGTCGTGGCtg < 3:18570/149‑1 (MQ=255) tttAACTGAGGTAATTATGATCATGCTGATTCTCGCGCCTCTGGTGGGCGTGCTGGGTGCGCTTTTGCTGGCGTATGGTGCCTGGCTGATTTATCCCCCGGCGGGTTTTGTTGTTGCC‑GGGGCGCTGTGCCTGTTCTGGTCGTGGCtgg > 4:204754/1‑149 (MQ=255) tttAACTGAGGTAATTATGATCATGCTGATTCTCGCGCCTCTGGTGGGCGTGCTGGGTGCGCTTTTGCTGGCGTATGGTGCCTGGCTGATTTATCCCCCGGCGGGTTTTGTTGTTGCC‑GGGGCGCTGTGCCTGTTCTGGTCGTGGCtgg > 1:143565/1‑149 (MQ=255) aaCTGAGGTAATTATGATCATGCTGATTCTCGCGCCTCTGGTGGGCGTGCTGGGTGCGCTTTTGCTGGCGTATGGTGCCTGGCTGATTTATCCCCCGGCGGGTTTTGTTGTTGCC‑GGGGCGCTGTGCCTGTTCTGGTCGTGGCtggtg < 8:61767/148‑1 (MQ=255) aaCTGAGGTAATTATGATCATGCTGATTCTCGCGCCTCTGGTGGGCGTGCTGGGTGCGCTTTTGCTGGCGTATGGTGCCTGGCTGATTTATCCCCCGGCGGGTTTTGTTGTTGCC‑GGGGCGCTGTGCCTGTTCTGGTCGTGGCtggtg < 8:68758/148‑1 (MQ=255) atGAGGTAATTATGATCATGCTGATTCTCGCGCCGCTGGTGGGCGTGCTGGGTGCGCGTTTGCTGGCGTATGGTGGCTGGCTGATTTATCCCCCGGCGGGTTTTGTTGTTGCC‑GGGGCGCTGTGCCTGTTCTGGTCGTGGCTGGTGgcg < 5:213163/148‑1 (MQ=255) aGGTAATTATGATCATGCTGATTCTCGCGCCTCTGGTGGGCGTGCTGGGTGCGCTTTTGCTGGCGTATGGTGCCTGGCTGATTTATCCCCCGGCGGGTTTTGTTGTTGCC‑GGGGCGCTGTGCCTGTTCTGGTCGTGGCTGGTGGCGCGa < 7:21878/149‑1 (MQ=255) gTAATTATGATCATGCTGATTCTCGCGCCTCTGGTGGGCGTGCTGGGTGCGCTTTTGCTGGCGTATGGTGCCTGGCTGATTTATCCCCCGGCGGGTTTTGTTGTTGCCAGGGGCGCTGTGCCTGTTCTGGTCGTGGCTGGTGGCGCGat < 3:81559/149‑1 (MQ=255) gTAATTATGATCATGCTGATTCTCGCGCCTCTGGTGGGCGTGCTGGGTGCGCTTTTGCTGGCGTATGGTGCCTGGCTGATTTATCCCCCGGCGGGTTTTGTTGTTGCCAGGGGCGCTGTGCCTGTTCTGGTCGTGGCTGGTGGCGCGat < 3:86912/149‑1 (MQ=255) gTAATTATGATCATGCTGATTCTCGCGCCTCTGGTGGGCGTGCTGGGTGCGCTTTTGCTGGCGTATGGTGCCTGGCTGATTTATCCCCCGGCGGGTTTTGTTGTTGCC‑GGGGCGCTGTGCCTGTTCTGGTCGTGGCTGGTGGCGCGata > 7:115410/1‑149 (MQ=255) aaTTATGATCATGCTGATTCTCGCGCCTCTGGTGGGCGTGCTGGGTGCGCTTTTGCTGGCGTATGGTGCCTGGCTGATTTATCCCCCGGCGGGTTTTGTTGTTGCC‑GGGGCGCTGTGCCTGTTCTGGTCGTGGCTGGTGGCGCGATAtc > 2:300787/1‑149 (MQ=255) aTTATGATCATGCTGATTCTCGCGCCTCTGGTGGGCGTGCTGGGTGCGCTTTTGCTGGCGTATGGTGCCTGGCTGATTTATCCCCCGGCGGGTTTTGTTGTTGCC‑GGGGCGCTCTGCCTGTTCTGGTCGTGGCTGGTCGCTCGATAtct > 2:140587/1‑149 (MQ=255) tGATCATGCTGATTCTCGCGCCTCTGGTGGGCGTGCTGGGTGCGCTTTTGCTGGCGTATGGTGCCTGGCTGATTTATCCCCCGGCGGGTTTTGTTGTTGCC‑GGGGCGCTGTGCCTGTTCTGGTCGTGGCTGGTGGCGCGATATCTCGAc < 1:127901/149‑1 (MQ=255) tCATGCTGATTCTCGCGCCTCTGGTGGGCGTGCTGGGTGCGCTTTTGCTGGCGTATGGTGCCTGGCTGATTTATCCCCCGGCGGGTTTTGTTGTTGCC‑GGGGCGCTGTGCCTGTTCTGGTCGTGGCTGGTGGCGCGATATCTCGACCg > 3:143310/1‑148 (MQ=255) tGATTCTCGCGCCTCTGGTGGGCGTGCTGGGTGCGCTTTTGCTGGCGTATGGTGCCTGGCTGATTTATCCCCCGGCGGGTTTTGTTGTTGCC‑GGGGCGCTGTGCCTGTTCTGGTCGTGGCTGGTGGCGCGATATCTCGACCGTACACAg > 7:303633/1‑149 (MQ=255) tcGCGCCTCTGGTGGGCGTGCTGGGTGCGCTTTTGCTGGCGTATGGTGCCTGGCTGATTTATCCCCCGGCGGGTTTTGTTGTTGCC‑GGGGCGCTGTGCCTGTTCTGGTCGTGGCTGGTGGCGCGATATCTCGACCGTACACAGTCGTCt > 5:171014/1‑149 (MQ=255) gcgcCTCTGGTGGGCGTGCTGGGTGCGCTTTTGCTGGCGTATGGTGCCTGGCTGATTTATCCCCCGGCGGGTTTTGTTGTTGCC‑GGGGCGCTGTGCCTGTTCTGGTCGTGGCTGGTGGCGCGATATCTCGACCGTACACAGTCGTCTg < 8:115410/148‑1 (MQ=255) cgcCTATGGTGGGCGTGCTGGGTGCGCTTTTGCTGGCGTATGGTGCCTGGCTGATTTATCCCCCGGCGGGTTTTGTTGTTGCC‑GGGGCGCTGTGCCTGTTCTGGTCGTGGCTGGTGGCGCGATATCTCGACCGTACACAGTCGTCTGTc > 8:318252/1‑149 (MQ=255) gcCTCTGGTGGGCGTGCTGGGTGCGCTTTTGCTGGCGTATGGTGCCTGGCTGATTTATCCCCCGGCGGGTTTTGTTGTTGCC‑GGGGCGCTGTGCCTGTTCTGGTCGTGGCTGGTGGCGCGATATCTCGACCGTACACAGTCGTCTGTcg > 8:60580/1‑149 (MQ=255) tctGGTGGGCGTGCTGGGTGCGCTTTTGCTGGCGTATGGTGCCTGGCTGATTTATCCCCCGGCGGGGTTTGATGTTGCC‑GGGGCGCTGTGCCTGTTCTGGTCGTGGCTGGTGGCGCGATATCTCGACCGTACACAGTCGTCTGTcggcg > 6:381491/1‑149 (MQ=255) gtggTCGTGCTGGGTGCGCTTTTGCTGGCGTATGGTGCCTGGCTGATTTATCCCCCGGCGGGTTTTGTTGTTGCC‑GGGGCGCTGTGCCTGTTCTGGTCGTGGCTGGTGGCGCGATATCTCGACCGTACACAGTCGTCTGTCGGCGGAg < 4:85863/148‑1 (MQ=255) gtggGCGTGCTGGGTGCGCTTTTGCTGGCGTATGGTGCCTGGCTGATTTATCCCCCGGCGGGTTTTGTTGTTGCC‑GGGGCGCTGTGCCTGTTCTGGTCGTGGCTGGTGGCGCGATATCTCGACCGTACACAGTCGTCTGTCGGCGGAgg > 2:68674/1‑149 (MQ=255) gtggGCGTGCTGGGTGCGCTTTTGCTGGCGTATGGTGCCTGGCTGATTTATCCCCCGGCGGGTTTTGTTGTTGCC‑GGGGCGCTGTGCCTGTTCTGGTCGTGGCTGGTGGCGCGATATCTCGACCGTACACAGTCGTCTGTCGGCGGAgg > 2:86918/1‑149 (MQ=255) gggCGTGCTGGGTGCGCTTTTGCTGGCGTATGGTGCCTGGCTGATTTATCCCCCGGCGGGTTTTGTTGTTGCC‑GGGGCGCTGTGCCTGTTCTGGTCGTGGCTGGTGGCGCGATATCTCGACCGTACACAGTCGTCTGTCGGCGGAGGTa < 2:143565/149‑1 (MQ=255) gcggggTGCGCTTTTGCTGGCGTATGGGGCCTGGCTGATTTATCCCCCGGCGGGTTTTGTTGTTGCC‑GGGGCGCTGTGCCTGTTCTGGTCGTGGCTGGTGGCGCGATATCTCGACCGTACACAGTCGTCTGTCGGCGGAGGTAAATAgt < 4:281151/146‑1 (MQ=255) tGGGTGCGCTTTTGCTGGCGTATGGTGCCTGGCTGATTTATCCCCCGGCGGGTTTTGTTGTTGCC‑GGGGCGCTGTGCCTGTTCTGGTCGTGGCTGGTGGCGCGATATCTCGACCGTACACAGTCGTCTGTCGGCGGAGGTAAATAgtgt > 8:402587/1‑149 (MQ=255) ggTGCGCGTTTGCTGGCGTATGGTGCCTGGCTGATTTATCCCCCGGCGGGTTTTGTTGTTGCC‑GGGGCGCTGTGCCTGTTCTGGTCGTGGCTGGTGGCGCGATATCTCGACCGTACACAGTCGTCTGTCGGCGGAGGTAAATAGTGTTc < 8:337331/149‑1 (MQ=255) tGCGCTTTTGCTGGCGGATGGTGCCTGGCTGATTTATCCCCCGGCGGGGTTTGTTGTTGCC‑GGGGCGCTGTGCCTGTTCTGGGCGTGGCTGGTGGCGCGATATCTCGACCGTACACAGTCGTCTGTCGGCGGAGGTAAATAGTGTTCtt < 3:296461/149‑1 (MQ=255) gcTTTTGCTGGCGTATGGTGCCTGGCTGATTTATCCCCCGGCGGGTTTTGTTGTTGCC‑GGGGCGCTGTGCCTGTTCTGGTCGTGGCTGGTGGCGCGATATCTCGACCGTACACAGTCGTCTGTCGGCGGAGGTAAATAGTGTTCTTTTc < 2:239319/149‑1 (MQ=255) gcTTTTGCTGGCGTATGGTGCCTGGCTGATTTATCCCCCGGCGGGTTTTGTTGTTGCC‑GGGGCGCTGTGCCTGTTCTGGTCGTGGCTGGTGGCGCGATATCTCGACCGTACACAGTCGTCTGTCGGCGGAGGTAAATAGTGTTCTTTTc > 3:178850/1‑149 (MQ=255) tGCTGGCGTATGGTGCCTGGCTGATTTATCCCCCGGCGGGTTTTGTTGTTGCC‑GGGGCGCTGTGCCTGTTCTGGTCGTGGCTGGTGGCGCGATATCTCGACCGTACACAGTCGTCTGTCGGCGGAGGTAAATAGTGTTCTTTTCGGGa < 4:143310/148‑1 (MQ=255) tGCTGGCGGATGGTGCCTGTCTGATTTATCCCCCGGCGGGTTTTGTTGTTGCC‑GGGGCGCTGTGCCTGTTCTGGTCGTGGCTGGTGGCGCGATATCTCGACCGTACACAGTCGTCTGTCGGCGGAGGTAAATAGTGTTCTTTTCGGGa < 8:233556/148‑1 (MQ=255) cTGGCGTATGGTGCCTGGCTGATTTATCCCCCGGCGGGTTTTGTTGTTGCC‑GGGGCGCTGTGCCTGTTCTGGTCGTGGCTGGTGGCGCGATATCTCGACCGTACACAGTCGTCTGTCGGCGGAgg < 2:361843/125‑1 (MQ=255) cTGGCGTATGGTGCCTGGCTGATTTATCCCCCGGCGGGTTTTGTTGTTGCC‑GGGGCGCTGTGCCTGTTCTGGTCGTGGCTGGTGGCGCGATATCTCGACCGTACACAGTCGTCTGTCGGCGGAgg > 1:361843/1‑125 (MQ=255) gCGTATGGTGCCTGGCTGATTTATCCCCCGGCGGGTTTTGTTGTTGCC‑GGGGCGCTGTGCCTGTTCTGGTCGTGGCTGGTGGCGCGATATCTCGACCGTACACAGTCGTCTGTCGGCGGAGGTAAATAGTGTTCTTTTCGGGattatt > 6:94673/1‑148 (MQ=255) aTGGTGCCTGGCTGATTTATCCCCCGGCGGGTTTTGTTGTTGCC‑GGGGCGCTGTGCCTGTTCTGGTCGTGGCTGGTGGCGCGATATCTCGACCGTACACAGTCGTCTGTCGGCGGAGGTAAATAGTGTTCTTTTCGGGATTATTTCAAc > 5:21267/1‑149 (MQ=255) tGGTGCCTGGCTGATTTATCCCCCGGCGGGTTTTGTTGTTGCC‑GGGGCGCTGTGCCTGTTCTGGTCGTGGCTGGTGGCGCGATATCTCGACCGTACACAGTCGTCTGTCGGCGGAGGTAAATAGTGTTCTTTTCGGGATTATTTCAAc < 6:171014/148‑1 (MQ=255) ccTGGCTGATTTATCCCCCGGCGGGTTTTGTTGTTGCC‑GGGGCGCTGTGCCTGTTCTGGTCGTGGCTGGTGGCGCGATATCTCGACCGTACACAGTCGTCTGTCGGCGGAGGTAAATAGTGTTCTTTTCGGGATTATTTCAACGaaaaa < 1:86918/149‑1 (MQ=255) tGGCTGATTTATCCCCCGGCGGGTTTTGTTGTTGCC‑GGGGCGCTGTGCCTGTTCTGGTCGTGGCTGGTGGCGCGATATCTCGACCGTACACAGTCGTCTGTCGGCGGAGGTAAATAGTGTTCTTTTCGGGATTATTTCAACGAAAAAGt > 8:371774/1‑149 (MQ=255) cTGATTTATCCCCCGGCGGGTTTTGTTGTTGCC‑GGGGCGCTGTGCCTGTTCTGGTCGTGGCTGGTGGCGCGATATCTCGACCGTACACAGTCGTCTGTCGGCGGAGGTAAATAGTGTTCTTTTCGGGATTATTTCAACGAAAAAGTGAc < 3:383264/149‑1 (MQ=255) cTGATTTATCCCCCGGCGGGTTTTGTTGTTGCC‑GGGGCGCTGTGCCTGTTCTGGTCGTGGCTGGTGGCGCGATATCTCGACCGTACACAGTCGTCTGTCGGCGGAGGTAAATAGTGTTCTTTTCGGGATTATTTCAACGAAAAAGTGAc > 4:383264/1‑149 (MQ=255) tGATTTATCCCCCGGCGGGTTTTGTTGTTGCC‑GGGGCGCTGTGCCTGTTCTGGTCGTGGCTGGTGGCGCGATATCTCGACCGTACACAGTCGTCTGTCGGCGGAGGTAAATAGTGTTCTTTTCGGGattatt > 7:372372/1‑132 (MQ=255) tGATTTATCCCCCGGCGGGTTTTGTTGTTGCC‑GGGGCGCTGTGCCTGTTCTGGTCGTGGCTGGTGGCGCGATATCTCGACCGTACACAGTCGTCTGTCGGCGGAGGTAAATAGTGTTCTTTTCGGGattatt < 8:372372/132‑1 (MQ=255) gATTTATCCCCCGGCGGGTTTTGTTGTTGCC‑GGGGCGCTGTGCCTGTTCTGGTCGTGGCTGGTGGCGCGATATCTCGACCGTACACAGTCGTCTGTCGGCGGAGGTAAATAGTGTTCTTTTCGGGATTATTTCAACGAAAAAGTGACGc > 7:210470/1‑149 (MQ=255) aTTTATCCCCCGGCGGGTTTTGTTGTTGCC‑GGGGCGCTGTGCCTGTTCTGGTCGTGGCTGGTGGCGCGATATCTCGACCGTACACAGTCGTCTGTCGGCGGAGGTAAATAGTGTTCTTTTCGGGATTATTTCaa < 3:232854/134‑1 (MQ=255) aTTTATCCCCCGGCGGGTTTTGTTGTTGCC‑GGGGCGCTGTGCCTGTTCTGGTCGTGGCTGGTGGCGCGATATCTCGACCGTACACAGTCGTCTGTCGGCGGAGGTAAATAGTGTTCTTTTCGGGATTATTTCAACGAAAAAGTGACGCa > 7:271113/1‑149 (MQ=255) aTTTATCCCCCGGCGGGTTTTGTTGTTGCC‑GGGGCGCTGTGCCTGTTCTGGTCGTGGCTGGTGGCGCGATATCTCGACCGTACACAGTCGTCTGTCGGCGGAGGTAAATAGTGTTCTTTTAGGGATTATTTCaa > 4:232854/1‑134 (MQ=255) aTCCCCCGGCGGGTTTTGTTGTTGCC‑GGGGCGCTGTGCCTGTTCTGGTCGTGGCTGGTGGCGCGATATCTCGACCGTACACAGTCGTCTGTCGGCGGAGGTAAATAGTGTTCTTTTCGGGATTATTTCAACGAAAAAGTGACGCACCg < 7:60580/148‑1 (MQ=255) cccccGGCGGGTTTTGTTGTTGCC‑GGGGCGCTGTGCCTGTTCTGGTCGTGGCTGGTGGCGCGATATCTCGACCGTACACAGTCGTCTGACGGCGGAGGTAAATAGTGTTCTTTTCGGGATTATTTCAACGAAAAAGTGACGCACCGGt > 7:377672/1‑148 (MQ=255) cccGGCGGGTTTTGTTGTTGCC‑GGGGCGCTGTGCCTGTTCTGGTCGTGGCTGGTGGCGCGATATCTCGACCGTACACAGTCGTCTGTCGGCGGAGGTAAATAGTGTTCTTTTCGGGATTATTTCAACGAAAAAGTGACGCACCGGTGAc < 5:94673/149‑1 (MQ=255) cccGGCGGGTTTTGTTGTTGCC‑GGGGCGCTGTGCCTGTTCTGGTCGTGGCTGGTGGCGCGATATCTCGACCGTACACAGTCGTCTGTCGGCGGAGGTAAATAGTGTTCTTTTCGGGATTATTTCAACGAAAAAGTGACGCACCGGTGAc > 8:121767/1‑149 (MQ=255) cggGTTTTGTTGTTGCC‑GGGGCGCTGTGCCTGTTCTGGTCGTGGCTGGTGGCGCGATATCTCGACCGTACACAGTCGTCTGTCGGCGGAGGTAAATAGTGTTCTTTTCGGGATTATTTCAACGAAAAAGTGACGCGCCGGTGACCACGc < 1:300787/149‑1 (MQ=255) gggTTTTGTTGTTGCC‑GGGGCGCTGTGCCTGTTCTGGTCGTGGCTGGTGGCGCGATATCTCGACCGTACACAGTCGTCTGTCGGCGGAGGTAAATAGTGTTCTTTTCGGGATTATTTCAACGAAAAAGTGACGCACCGGTGACCACGcc < 7:206925/149‑1 (MQ=255) ggTTGTGTTGTTGCC‑GTGGCTCTGTGCCTGTTCTGGTCGTGGCTGGTGGCGCGATATCTCGACCGTACACAGTCGTCTGTCGGCGGAGGTAAATAGTGGTCTTTTCGGGATTATTTCAACGAAAAAGTGACGCACCGGTGACCACGCca < 1:140587/149‑1 (MQ=255) ttttGTTGTTGCC‑GGGGCGCTGTGCCTGTTCTGGTCGTGGCTGGTGGCGCGATATCTCGACCGTATACAGTCGTCTGTCGGCGCAGGTAAATAGTGATCTTTTCGGGAATATTTCAACGAAAAAGTTCCGCACCGGTGCCCACGCcag > 2:200139/1‑148 (MQ=255) ttttGTTGTTGCC‑GGGGCGCTGTGCCTGTTCTGGTCGTGGCTGGTGGCGCGATATCTCGACCGTACACAGTCGTCTGTCGGCGGAGGTAAATAGTGTTCTTTTCGGGATTATTTCAACGAAAAAGTGACGCACCGGTGACCACGCcag > 5:323909/1‑148 (MQ=255) ttgttgCC‑GGGGCGCTGTGCCTGTTCTGGTCGTGGCTGGTGGCGCGATATCTCGACCGTACACAGTCGTCTGTCGGCGGAGGTAAATAGTGTTCTTTTCGGGATTATTTCAACGAAAAAGTGACGCACCGGTGACCACGCCAGCAGAGc > 7:69159/1‑149 (MQ=255) ttgttgCC‑GGGGCGCAGTGCCTGTTCTGGGCGTGGCTGGTGGCGCGATATCTCGACCGTACACAGTCGTCTGTCGGCGGAGGTAAATAGTGTTCTTTTCGGGATTATTTCAACGAAAAAGTGACGCACCGGTGACCACGCcagctctg < 4:202185/148‑5 (MQ=255) gttgCC‑GGGGCGCTGTGCCTGTTCTGGTCGTGGCTGGTGGCGCGATATCTCGACCGTACACAGTCGTCTGTCGGCGGAGGTAAATAGTGTTCTTTTCGGGATTATTTCAACGAAAAAGTGACGCACCGGTGACCACGCCAGCAGAGCTg > 1:315665/1‑149 (MQ=255) gCC‑GGGGCGCTGTGCCTGTTCTGGTCGTGGCTGGTGGCGCGATATCTCGACCGTACACAGTCGTCTGTCGGCGGAGGTAAATAGTGTTCTTTTCGGGATTATTTCAACGAAAAAGTGACGCACCGGTGACCACGCCAGCAGAGCTGGc < 7:318252/148‑1 (MQ=255) cc‑GGGGCGCTGTGCCTGTTCTGGTCGTGGCTGGTGGCGCGATATCTCGACCGTACACAGTCGTCTGTCGGCGGAGGTAAATAGTGTTCTTTTCGGGATTATTTCAACGAAAAAGTGACGCACCGGTGACCACGCCAGCAGAGCTGGCg > 8:61801/1‑148 (MQ=255) | GATCACATTGAGTCCTACGGGATCCGCTCGCTTTAACTGAGGTAATTATGATCATGCTGATTCTCGCGCCTCTGGTGGGCGTGCTGGGTGCGCTTTTGCTGGCGTATGGTGCCTGGCTGATTTATCCCCCGGCGGGTTTTGTTGTTGCC‑GGGGCGCTGTGCCTGTTCTGGTCGTGGCTGGTGGCGCGATATCTCGACCGTACACAGTCGTCTGTCGGCGGAGGTAAATAGTGTTCTTTTCGGGATTATTTCAACGAAAAAGTGACGCACCGGTGACCACGCCAGCAGAGCTGGCG > NC_000913/1205502‑1205796 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |