| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 4431564 | 111 (1.190) | 3 (0.030) | 3/256 | NT | 2.6% | coding (420/663 nt) | ytfE | iron‑sulfur cluster repair protein RIC |
| ? | NC_000913 | = 4431575 | 117 (1.290) | coding (409/663 nt) | ytfE | iron‑sulfur cluster repair protein RIC | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 135 total aligned reads displayed.
TCGCTTTCCAGGTGGTGCAGGCTTCTGGCGGCGGTGTGACGTTATTGGTGGTGTGTTTAATCACTTCCAGCAGTTCGCCCGCTTCATCGTGCTCGCTTTCCATTACGCTGATTGGCCCCATTGCCTGGCTGCCCATGCCTTGTTTGATCATCGGGAAGAGGATCTGCTCTTCTTTCATCATGTGGCTGGAAAGCTCTTCATGCAGCATGGTCAGGTATTTTGTCAGCCCTTTTGGCACGCTCGGTTTGTCGGCGTGAACGCGCTCGACTTTAGTCGCTTGCAGAATCAGCTCCGGCA > NC_000913/4431416‑4431712 | tCGCTTTCCAGGTGGTGCAGGCTTCTGGCGGCGGTGTGACGTTATTGGTGGTGTGTTTAATCACTTCCAGCAGTTCGCCCGCTTCATCGTGCTCGCTTTCCATTACGCTGATTGGCCCCATTGCCTGGCTGCCCATGCCTTGTTTGATC < 3:193756‑M1/149‑1 (MQ=255) cTTTCCAGGTGGTGCAGGCTTCTGGCGGCGGTGTGACGTTATTGGTGGTGTGTTTAATCACTTCCAGCAGTTCGCCCGCTTCATCGTGCTCGCTTTCCATTACGCTGATTGGCCCCATTGCCTGGCTGCCCATGCCTTGTTTGatcatc < 5:221450/149‑1 (MQ=255) cTTTCCAGGTGGTGCAGGCTTCTGGCGGCGGTGTGACGTTATTGGTGGTGTGTTTAATCACTTCCAGCAGTTCGCCCGCTTCATCGTGCTCGCTTTCCATTACGCTGATTGGCCCCATTGCCTGGCTGCCCATGCCTTGTTTGatcatc < 6:152983/149‑1 (MQ=255) tCCAGGTGGTGCAGGCTTCTGGCGGCGGTGTGACGTTATTGGTGGTGTGTTTAATCACTTCCAGCAGTTCGCCCGCTTCATCGTGCTCGCTTTCCATTACGCTGATTGGCCCCATTGCCTGGCTGCCCATGCCTTGTTTGATCATCgg < 5:259937/148‑1 (MQ=255) ccAGGTGGTGCAGGCTTCTGGCGGCGGTGTGACGTTATTGGTGGTGTGTTTAATCACTTCCAGCAGTTCGCCCGCTTCATCGTGCTCGCTTTCCATTACGCTGATTGGCCCCATTGCCTGGCTGCGCATGCCTTGTTTGATCATCggg > 3:38617/1‑148 (MQ=255) cAGGTGGTGCAGGCTTCTGGCGGCGGTGTGACGTTATTGGTGGTGTGTTTAATCACTTCCAGCAGTTCGCCCGCTTCATCGTGCTCGCTTTCCATTACGCTGATTGGCCCCATTGCCTGGCTGCCCATGCCTTGTTTGATCATCGGGaa < 1:108962/149‑1 (MQ=255) aGGTGGTGCAGGCTTCTGGCGGCGGTGTGACGTTATTGGTGGTGTGTTTAATCACTTCCAGCAGTTCGCCCGCTTCATCGTGCTCGCTTTCCATTACGCTGATTGGCCCCATTGCCTGGCTGCCCATGCCTTGTTTGATC < 8:8756‑M1/140‑1 (MQ=255) aGGTGGTGCAGGCTTCTGGCGGCGGTGTGACGTTATTGGTGGTGTGTTTAATCACTTCCAGCAGTTCGCCCGCTTCATCGTGCTCGCTTTCCATTACGCTGATTGGCCCCATTGCCTGGCTGCCCATGCCTTGTTTGATC > 7:8756‑M1/1‑140 (MQ=255) gtggtgCAGGCTTCTGGCGGCGGTGTGACGTTATTGGTGGTGTGTTTAATCACTTCCAGCAGTTCGCCCGCTTCATCGTGCTCGCTTTCCATTACGCTGATTGGCCCCATTGCCTGGCTGCCCATGCCTTGTTTGATCATCgg < 7:311655/143‑1 (MQ=255) gtggtgCAGGCTTCTGGCGGCGGTGTGACGTTATTGGTGGTGTGTTTAATCACTTCCAGCAGTTCGCCCGCTTCATCGTGCTCGCTTTCCATTACGCTGATTGGCCCCATTGCCTGGCTGCCCATGCCTTGTTTGATCATCgg > 8:311655/1‑143 (MQ=255) tggtgCAGGCTTCTGGCGGCGGTGTGACGTTATTGGTGGTGTGTTTAATCACTTCCAGCAGTTCGCCCGCTTCATCGTGCTCGCTTTCCATTACGCTGATTGGCCCCATTGCCTGGCTGCCCATGCCTTGTTTGATCATCGGGAAGAGg > 7:128673‑M2/1‑148 (MQ=255) tggtgCAGGCTTCTGGCGGCGGTGTGACGTTATTGGTGGTGTGTTTAATCACTTCCAGCAGTTCGCCCGCTTCATCGTGCTCGCTTTCCATTACGCTGATTGGCCCCATTGCCTGGCTGCCCATGCCTTGTTTGATCATCGGGAAGAGg > 6:230124‑M2/1‑148 (MQ=255) tgCAGGCTTCTGGCGGCGGTGTGACGTTATTGGTGGTGTGTTTAATCACTTCCAGCAGTTCGCCCGCTTCATCGTGCTCGCTTTCCATTACGCTGATTGGCCCCATTGCCTGGCTGCCCATGCCTTGTTTGATCATCGGGAAGAGgatc > 2:30312‑M2/1‑145 (MQ=255) aGGCTTCTGGCGGCGGTGTGACGTTATTGGTGGTGTGTTTAATCACTTCCAGCAGTTCGCCCGCTTCATCGTGCTCGCTTTCCATTACGCTGATTGGCCCCATTTCCTGGCTGCCCATGCCTTGTTTGATCctcttcccgatgatcaaa < 1:180460‑M1/149‑19 (MQ=255) ggCTTCTGGCGGCGGTGTGACGTTATTGGTGGTGTGTTTAATCACTTCCAGCAGTTCGCCCGCTTCATCGTGCTCGCTTTCCATTACGCTGATTGGCCCCATTGCCTGGCTGCCCATGCCTTGTTTGATCATCGGGAAGAGGATCTGct < 3:233647/149‑1 (MQ=255) ttCTGGCGGCGGTGTGACGTTATTGGTGGTGTGTTTAATCACTTCCAGCAGTTCGCCCGCTTCATCGTGCTCGCTTTCCATTACGCTGATTGGCCCCATTGCCTGGCTGCCCATGCCTTGTTTGATCATCGGGAAGAGGATCTGCtctt > 4:397900/1‑149 (MQ=255) ttCTGGCGGCGGTGTGACGTTATTGGTGGTGTGTTTAATCACTTCCAGCAGTTCGCCCGCTTCATCGTGCTCGCTTTCCATTACGCTGATTGGCCCCATTGCCTGGCTGCCCATGCCTTGTTTGATCATCGGGAAGAGGATCTGCtctt > 3:327070/1‑149 (MQ=255) tGGCGGCAGTCAGACGTTATTGGTGGTGTGTTTAATCACTTCCACCACTTCGCCCGCTTCATCGTGCTCGCTTTCCATTACGCTGATTGGCCCCATTGCCTGGCTGCCCATGCCTTGTTTGATCATCGGGAAGAGCATCTGCTcttctt > 2:363848/1‑149 (MQ=255) 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gtttgACGTTATTGGTTGTGGGTTTAATCACTTCCAGCAGTTCGCCCGCTTCATCGTGCTCGCTTTCCATTACTCTGATTGGCCCCATTGCCTGGCTGCCCATGCCTTGTTTGATCATCGGGAAGAGGATCTGCTCTTCTTTCATCAtg < 2:135197/146‑1 (MQ=255) tgACGTTATTGGTGGTGTGTTTAATCACTTCCAGCAGTTCGCCCGCTTCATCGTGCTCGCTTTCCATTACGCTGATTGGCCCCATTGCCTGGCTGCCCATGCCTTGTTTGATCATCGGGAAGAGGATCTGCTCTTCTTTCATCATGTgg > 1:305011/1‑149 (MQ=255) aCGTTATTGGTGGTGTGTTTAATCACTTCCAGCAGTTCGCCCGCTTCATCGTGCTCGCTTTCCATTACGCTGAGTGGCACCATTGCCTGGCTGCCCATGCCTTGTTTGATCATCGGGAAGAGGATCTGCTCTGCTTTCATCATGTGGCt > 1:344011/1‑149 (MQ=255) tggtgTGTTTAATCACTTCCAGCAGTTCGCCCGCTTCATCGTGCTCGCTTTCCATTACGCTGATTGGCCCCATTGCCTGGCTGCCCATGCCTTGTTTGATCATCGGGAAGAGGATCTGCTCTTCTTTCATCATGTGGCTGGAAAGctct < 4:325346/149‑1 (MQ=255) gtgtgtTTAATCACTTCCAGCAGTTCGCCCGCTTCATCGTGCTCGCTTTCCATTACGCTGATTGGCCCCATTGCCTGGCTGCCCATGCCTTGTTTGATCATCGGGAAGAGGATCTGCTCTTCTTTCATCATGTGGCTGGAAAGCTCTTc < 2:353606/149‑1 (MQ=255) gtgtgtTTAATCACTTCCAGCAGTTCGCCCGCTTCATCGTGCTCGCTTTCCATTACGCTGATTGGCCCCATTGCCTGGCTGCCCATGCCTTGTTTGATCATCGGGAAGAGGATCTGCTCTTCTTTCATCATGTGGCTGGAAAGCACtt > 8:181256/1‑148 (MQ=255) tgtgtTTAATCACTTCCAGCAGTTCGCACGCTTCATCGTGCTCGCTTTCCATTACGCTGATTGGCCCCATTGCCTGGCTGCCCTTGCCTTGTTTGATCATCGGCAAGAGGATCTGCTCTTCTTTCATCATGTGGCTGGAAAGCTCTTCa < 3:250138/149‑1 (MQ=255) gtTTAATCACTTCCAGCAGTTCGCCCGCTTCATCGTGCTCGCTTTCCATTACGCTGATTGGCCCCATTGCCTGGCTGCCCATGCCTTGTTTGATCATCGGGAAGAGGATCTGCTCTTCTTTCATCATGTGGCTGGAAAGCTCTTCATgc > 5:145108/1‑149 (MQ=255) tttAATCACTTCCAGCAGTTCGCCCGCTTCATCGTGCTCGCTTTCCATTACGCTGATTGGCCCCATTGCCTGGCTGCCTATGCCTTGTTTGATCATCGGGAAGAGGATCTGCTCTTCTTTCATCATGTGGCTGGAAAGCTCTTCATg > 8:281004/1‑147 (MQ=255) tttAATCACTTCCAGCAGTTCGCCCGCTTCATCGTGCTCGCTTTCCATTACGCTGATTGGCCCCATTGCCTGGCTGCCCATGCCTTGTTTGATCATCGGGAAGAGGATCTGCTCTTCTTTCATCATGTGGCTGGAAAGCTCTTCATg > 1:359650/1‑147 (MQ=255) 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cccATTGCCTGGCTGCCCATGCCTTGTTTGATCATCGGGAAGAGGATCTGCTCTTCTTTCATCATGTGGCTGGAAAGCTCTTCATGCAGCATGGTCAGGTATTTTGTCAGCCCGTTTGGCACGCTCGGTTTGTCGGCGTGAACGCGCTc > 4:92105/1‑149 (MQ=255) aTTGCCTGGCTGCCCATGCCTTGTTTGATCATCGGGAAGAGGATCTGCTCTTCTTTCATCATGTGGCTGGAAAGCTCTTCATg > 4:85698/1‑83 (MQ=255) aTTGCCTGGCTGCCCATGCCTTGTTTGATCATCGGGAAGAGGATCTGCTCTTCTTTCATCATGTGGCTGGAAAGCTCTTCATg < 3:85698/83‑1 (MQ=255) ccTGGCTGCCCATGCCTTGTTGGATCATCGGGAAGAGGATCTGCTCTTCTTTCCTCATGTGGCTGGAAAGCTCTTCATGCAGCATGGTCAGGTATTTTGTCAGCCCTTTTGGCACGCTCGGTTTGTCGGCGTGAACGCGCTCGACTTTa < 3:255448/149‑1 (MQ=255) cTGGCTGCCCATGCCTTGTTTGATCATCGGGAAGAGGATCTGCTCTTCTTTCATCATGTGGCTGGAAAGCTCTTCATGCAGCATGGTCAGGTATTTTGTCAGCCCTTTTGGCACGCTCGGTTTGTCGGc > 2:415022/1‑129 (MQ=255) cTGGCTGCCCATGCCTTGTTTGATCATCGGGAAGAGGATCTGCTCTTCTTTCATCATGTGGCTGGAAAGCTCTTCATGCAGCATGGTCAGGTATTTTGTCAGCCCTTTTGGCACGCTCGGTTTGTCGGc < 1:415022/129‑1 (MQ=255) cTGGCTGCCCATGCCTTGTTTGATCATCGGGAAGAGGATCTGCTCTTC‑TTCATCATGTGGCTGGAAAGCTCTTCATGCAGCATGGTCAGGTATTTTGTCAGCCCTTTTGGCACGCTCGGTTTGTCGGCGTGAACGCGCTCGACTTTAGt > 1:271469/1‑149 (MQ=255) tGGCTGCCCATGCCTTGTTTGATCATCGGGAAGAGGATCTGCTCTTCTTTCATCATGTGGCTGGAAAGCTCTTCATGCAGCATGGTCAGGTATTTTGTCAGCCCTTTTGGCACGCTCGGTTTGTCGGCGTGAACGCGCTCGACTTTAGt > 7:307196/1‑149 (MQ=255) cTGCCCATGCCTTGTTTGATCATCGGGAAGAGGATCTGCTCTTCTTTCATCATGTGGCTGGAAAGCTCTTCATGCAGCATGGTCAGGTATTTTGTCAGCCCTTTTGGCACGCTCGGTTTGTCGGCGTGAACGCGCTCGACTTTAGTCGc > 2:340689/1‑149 (MQ=255) cccATGCCTTGTTTGATCATCGGGAAGAGGATCTGCTCTTCTTTCATCATGTGGCTGGAAAGCTCTTCATGCAGCATGGTCAGGTATTTTGTCAGCCCTTTTGGCACGCTCGGTTTGTCGGCGTGAACGCGCTCGACTTTAGTCGCtt < 3:202303/148‑1 (MQ=255) cccATGCCTTGTTTGATCATCGGGAAGAGGATCTGCTCTTCTTTCATCATGTGGCTGGAAAGCTCTTCATGCAGCATGGTCAGGTATTTTGTCAGCCCTTTTGGCACGCTCGGTTTGTCGGCGTGAACGCGCTCGACTTTAGTCGCtt < 7:65300/148‑1 (MQ=255) cccATGCCTTGTTTGATCATCGGGAAGAGGATCTGCTCTTCTTTCATCATGTGGCTGGAAAGCTCTTCATGCAGCATGGTCAGGTATTTTGTCAGCCCTTTTGGCACGCTCGGTTTGTCGGCGTGAACGCGCGCGACTTTAGTCGCTTg < 6:40793/149‑1 (MQ=255) gCCTTGTTTGATCATCGGGAAGAGGATCTGCTCTTCTTTCATCATGTGGCTGGAAAGCTCTTCATGCAGCATGGTCAGGTATTTTGTCAGCCCTTTTGGCACGCTCGGTTTGTCGGCGTGAACGCGCTCGACTTTAGTCGCtt < 6:24130/143‑1 (MQ=255) ccTTGTTTGATCATCGGGAAGAGGATCTGCTCTTCTTTCATCATGTGGCTGGAAAGCTCTTCATGCAGCATGGTCAGGTATTTTGTCAGCCCTTTTGGCACGCTCGGTTTGTCGGCGTGAACGCGCTCGACTTTAGTCGCTTGCAGAAt > 5:222748/1‑149 (MQ=255) ccTTGTTTGATCATCGGGAAGAGGATCTGCTCTTCTTTCATCATGTGGCTGGAAAGCTCTTCATGCAGCATGGTCAGGTATTTTGTCAGCCCTTTTGGCACGCTCGGTTTGTCGGCGTGAACGCGCTCGACTTTAGTCGCTTGCAGAAt > 1:413379/1‑149 (MQ=255) cTTGTTTGATCATCGGGAAGAGgatcaaacaaggcatgggcagccaggcaatggggccaatcagcgtaatggaaagcgagcacgatgaagcg < 7:191617‑M2/92‑71 (MQ=255) cTTGTTTGATCATCGGGAAGAGgatcaaacaaggcatgggcagccaggcaatggggccaatcagcgtaatggaaagcgagcacgatgaagcg > 8:191617‑M2/1‑22 (MQ=255) cTTGTTTGATCATCGGGAAGAGGATCTGCTCTTCTTTCATCATGTGGCTGGAAAGCTCTTCATGCAGCATGGTCAGGTATTTTGTCAGCCCTTTTGGCACGCTCGGTTTGTCGGCGTGAACGCGCTCGACTTTAGTCGCTTGCAGAATc < 1:340689/149‑1 (MQ=255) tttGATCATCGGGAAGAGgatcaaacaaggcatgggcagccaggaaatggggccaatcagcgtaatggaaagcgagcacgatgaagcgggcgaactgctggaagtgattaaacacaccaccaataacgtcacaccgccgccagaagcct < 1:180460‑M2/149‑132 (MQ=255) tttGATCATCGGGAAGAGGATCTGCTCTTCTTTCATCATGTGGCTGGAAAGCTCTTCATGCAGCATGGTCAGGTATTTTGTCAGCCCTTTTGGCACGCTCGGTTTGTCGGCGTGAACGCGCTCGACTTTAGTCGCTTGCAGAATCAGCt > 1:127018/1‑149 (MQ=255) tttGATCATCGGGAAGAGGATCTGCTCTTCTTTCATCATGTGGCTGGAAAGCTCTTCATGCAGCATGGTCAGGTATTTTGTCAGCCCTTTTGGCACGCTCGGTTTGTCGGCGTGAACGCGCTCGACTTTAGTCGCTTGCAGAATCAGCt > 1:12671/1‑149 (MQ=255) gATCctcttcccgatgatcaaacaaggcatgggcagccaggcaatggggccaatcagcgtaatggaaagcgagcacgatgaagcgggcgaactgctggaagtgattaaacacaccaccaataacgtcacaccgccgccagaagcctgca > 2:30312‑M1/1‑4 (MQ=255) gATCATAGGGAAGAGGAACTGCTATTCTATCATCATGTGGCTGGAAAGCTCTTCATGCAGCATGCTAATGTATTTTGTCATCCCTTTTGGCAGGCTCGCTTTGTCGGCGTCAACGCGCTCGACATTAGTCGCTTGCAGAATCAGCTCCg > 4:322840/1‑149 (MQ=255) tcatcGGGAAGAGGATCTGCTCTTCTTTCATCATGTGGCTGGAAAGCTCTTCATGCAGCATGGTCAGGTATTTTGTCAGCCCTTTTGGCACGCTCGGTTTGTCGGCGTGAACGCGCTCGACTTTAGTCGCTTGCAGAATCAGCTCCgg > 6:25508/1‑148 (MQ=255) cctcttcccgatgatcaaacaaggcatgggcagccaggcaatggggccaatcagcgtaatggaaagcgagcacgatgaagcgggcgaactgctggaagtgattaaacacaccaccaataacgtcacaccgccgccagaagcctgcacca > 7:128673‑M1/1‑1 (MQ=255) | TCGCTTTCCAGGTGGTGCAGGCTTCTGGCGGCGGTGTGACGTTATTGGTGGTGTGTTTAATCACTTCCAGCAGTTCGCCCGCTTCATCGTGCTCGCTTTCCATTACGCTGATTGGCCCCATTGCCTGGCTGCCCATGCCTTGTTTGATCATCGGGAAGAGGATCTGCTCTTCTTTCATCATGTGGCTGGAAAGCTCTTCATGCAGCATGGTCAGGTATTTTGTCAGCCCTTTTGGCACGCTCGGTTTGTCGGCGTGAACGCGCTCGACTTTAGTCGCTTGCAGAATCAGCTCCGGCA > NC_000913/4431416‑4431712 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |