| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 1237689 = | 73 (0.780) | 4 (0.040) | 4/256 | NT | 5.5% | coding (119/1299 nt) | dadA | D‑amino acid dehydrogenase |
| ? | NC_000913 | 1237731 = | 67 (0.740) | coding (161/1299 nt) | dadA | D‑amino acid dehydrogenase | |||||
TACTGGGAAGTGGTGTGGTAGGCGTTGCCAGCGCCTGGTACTTAAATCAGGCAGGACATGAGGTCACCGTCATTGATCGGGAGCCGGGGGCCGCCCTGGAAACCAGTGCCGCGAATGCCGGGCAAATCTCCCCCGGATATGCTGCACCG‑‑‑T‑‑‑GGGCGGCACCAGGTGTGCCTTTAAAAGCGATTAAATGGATGTTCCAGCGCCATGCGCCGCTGGCGGTTCGTCTCGACGGTACGCAGTTCCAGTTGAAATGGATGTGGCAAATGTTACGTAACTGCGACACCAGCCACTACATGGA > NC_000913/1237584‑1237878 | tACTGGGAAGTGGTGTGGTAGGCGTTGCCAGCGCCTGGTACTTAAATCAGGCAGGACATGAGGTCACCGTCATTGATCGGGAGCCGGGGGCCGCCCTGGAAACCAGTGCCGCGAATGCCGGGCAAATCTCCCCCGGATATGCTGCACCg > 2:104050/1‑149 (MQ=255) tGGGAAGTGGTGTGGTAGGCGTTGCCAGCGCCTGGTACTTAAATCAGGCAGGACATGAGGTCACCGTCATTGATCGGGAGCCGGGGGCCGCCCTGGAAACCAGTGCCGCGAATGCCGGGCAAATCTCCCCCGGATATGCTGCCCCG‑‑‑T‑‑‑gg > 7:80670/1‑149 (MQ=255) tGGGAAGTGGTGTGGTAGGCGTTGCCAGCGCCTGGTACTTAAATCAGGCAGGACATGAGGTCACCGTCATTGATCGGGAGCCGGGGGCCGCCCTGGAAACCAGTGCCGCGAATGCCGGGCAAATCTCCCCCGGATATGCTGCACCG‑‑‑T‑‑‑gg > 3:147377/1‑149 (MQ=255) tcaatttcatctggaactgcgtaccgtcgagacgaaccgccagcggcgcatggcgctggaacatccatttaatcgcttttaaaggcacacctggtgccgc‑‑‑‑‑‑‑GAATGCCGGGCAAATCTCCCCCGGATATGCTGCACCG‑‑‑T‑‑‑GGGCGGCACCa > 1:163767‑M1/101‑149 (MQ=255) ggAAGTGGTGTGGTAGGCGTTGCCAGCGCCTGGTACTTAAATCAGGCAGGACATGAGGTCACCGTCATTGATCGGGAGCCGGGGGCCGCCCTGGAAACCAGTGCCGCGAATGCCGGGCAAATCTCCCCCGGATATGCTGCACCG‑‑‑T‑‑‑gg < 5:56101/147‑1 (MQ=255) ggAAGTGGTGTGGTAGGCGTTGCCAGCGCCTGGTACTTAAATCAGGCAGGACATGAGGTCACCGTCATTGATCGGGAGCCGGGGGCCGCCCTGGAAACCAGTGCCGCGAATGCCGGGCAAATCTCCCCCGGATATGCTGCACCG‑‑‑T‑‑‑Gggc > 6:12953/1‑149 (MQ=255) ggAAGTGGGGGGGTAGGCGTTGCCAGCGCCTGGTACTTAAATCAGGCAGGACATGAGGTCACCGTCATTGATCGGGAGCCGGGGGCCGCCCTGGAAACCAGTGCCGCGAATGCCGGGCAAATCTCCCCCGGATATGCTGCACCG‑‑‑T‑‑‑gg < 6:26270/147‑1 (MQ=255) gAAGTGGTGTGGTAGGCGTTGCCAGCGCCTGGTACTTAAATCAGGCAGGACATGAGGTCACCGTCATTGATCGGGAGCCGGGGGCCGCCCTGGAAACCAGTGCCGCGAATGCCGGGCAAATCTCCCCCGGATATGCTGCACCG‑‑‑T‑‑‑Gggcg > 1:402894/1‑149 (MQ=255) gtggtgtggtAGGCGTTGCCAGCGCCTGGTACGTAAATCAGGCAGGACATGAGGTCACCGTCAGTGATCGGGAGCCGGGGGCCGCCCTGGAAACCAGTGCCGCGAATGCCGGGCAAATCTCCCCCGGATATGCTGCACCG‑‑‑T‑‑‑GGGCGGCa > 7:56247/1‑149 (MQ=255) gtggtgaggtAGGCGTTGCCACCGCCTGGTACTTAAATCACGCAGGACATCTGGTCACCGTCATTGTTCGGCAGCCGGCGCCCGCCCTGGTAACCACTGCCGCGAATGCCGGGCAAATCTCCCCCGGATATGCTGCACCG‑‑‑T‑‑‑Cggcggct > 7:49558/1‑148 (MQ=255) ctggaactgcgtaccgtcgagacgaaccgccagcggcgcatggcgctggaacatccatttaatcgcttttaaaggcacacctggtgccgcccacgGTGCCGCGAATGCCGGGCAAATCTCCCCCGGATATGCTGCACCG‑‑‑t > 7:411853‑M1/96‑140 (MQ=255) ctggaactgcgtaccgtcgagacgaaccgccagcggcgcatggcgctggaacatccatttaatcgcttttaaaggcacacctggtgccgcccacgGTGCCGCGAATGCCGGGCAAATCTCCCCCGGATATGCTGCACCG‑‑‑t < 8:411853‑M1/45‑1 (MQ=255) tgtggtAGGCGTTGCCAGCGCCTGGTACTTAAATCAGGCAGGACATGAGGTCACCGTCATTGATCGGGAGCCGGGGGCCGCCCTGGAAACCAGTGCCGCGAATGCCGGGCAAATCTCCCCCGGATATGCTGCACCG‑‑‑T‑‑‑GGGCGGCACCAg > 8:405307/1‑149 (MQ=255) cgtaccgtcgagacgaaccgccagcggcgcatggcgctggaacatccatttaaacgcttttaaaggcacacctggtgccgccctggaaaccaGTGCCGCGAATGCCGGGCAAATCTCCCCCGGATATGCTGCACCG‑‑‑T‑‑‑GGGCGGCACCAg > 7:337810‑M1/93‑149 (MQ=255) taccaGGCGCTGGCAACGCCTGGTACTTAAATCAGGCAGGACATGAGGTCACCGTCATTGATCGGGAGCCGGGGGCCGCCCTGGAAACCAGTGCCGCGAATGCCGGGCAAATCTCCCCCGGATATGCTGCACCG‑‑‑T‑‑‑GGGCGGCACCAGgt > 2:145226/5‑149 (MQ=255) gtAGGCGTTGCCAGCGCCTGGTACTTAAATCAGGCAGGACATGAGGTCACCGTCATTGATCGGGAGCCGGGGGCCGCCCTGGAAACCAGTGCCGCGAATGCCGGGCAAATCTCCCCCGGATATGCTGCACCG‑‑‑T‑‑‑GGGCGGCACCAGgtgt > 1:371910/1‑149 (MQ=255) gtAGGCGTTGCCAGCGCCTGGTACTTAAATCAGGCAGGACATGAGGTCACCGTCATTGATCGGGAGCCGGGGGCCGCCCTGGAAACCAGTGCCGCGAATGCCGGGCAAATCTCCCCCGGATATGCTGCACCG‑‑‑T‑‑‑GGGCGGCACCAGgtgt > 5:409762/1‑149 (MQ=255) tAGGCGTTGCCAGCGCCTGGTACTTAAATCAGGCAGGACATGAGGTCACCGTCATTGATCGGGAGCCGGGGGCCGCCCTGGAAACCAGTGCCGCGAATGCCGGGCAAATCTCCCCCGGATATGCTGCACCG‑‑‑T‑‑‑GGGCGGCACCAGGtgtg < 8:371831/149‑1 (MQ=255) 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cTTAAATCAGGCAGGACATGAGGTCACCGTCATTGATCGGGAGCCGGGGGCCGCCCTGGAAACCAGTGCCGCGAATGCCGGGCAAATCTCCCCCGGATATGCTGCACCG‑‑‑T‑‑‑GGGCGGCACCAGGTGTGCCTTTAAAAGCGATTAAATgg < 8:10401/148‑1 (MQ=255) tAAATCAGGCAGGACATGAGGTCACCGTCATTGATCGGGAGCCGGGGGCCGCCCTGGAAACCAGTGCCGCGAATGCCGGGCAAATCTCCCCCGGATATGCTGCACCG‑‑‑T‑‑‑GGGCGGCACCAGGTGTGCCTTTAAAAGCGATTAAATGGATg > 3:51599/1‑149 (MQ=255) aaaTCAGGCAGGACATGAGGTCACCGTCATTGATCGGGAGCCGGGGGCCGCCCTGGAAACCAGTGCCGCGAATGCCGGGCAAATCTCCCCCGGATATGCTGCACCG‑‑‑T‑‑‑GGGCGGCACCAGGTGTGCCTTTAAAAGCGATTAAATGGATGt > 4:218175/1‑149 (MQ=255) aTGAGGTCACCGTCATTGATCGGGAGCCGGGGGCCGCCCTGGAAACCAGTGCCGCGAATGCCGGGCAAATCTCCCCCGGATATGCTTCACCG‑‑‑T‑‑‑GGGCGGCACCAGGTGTGCCTTTAAAAGCGATTAAATGGATGTTCCAGCGCCATgcg > 2:431217/1‑149 (MQ=255) aTGAGGTCACCGTCATTGATCGGGAGCCGGGGGCCGCCCTGGAAACCAGTGCCGCGAATGCCGGGCAAATCTCCCCCGGATATGCTGCACCG‑‑‑T‑‑‑GGGCGGCACCAGGTGTGCCTTTAAAAGCGATTAAATGGATGTTCCAGCGCCATgcg > 1:215164/1‑149 (MQ=255) 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ccGGGCAAATCTCCCCCGGATATGCTGCACCG‑‑‑T‑‑‑GGGCGGCACCAGGTGTGCCTTTAAAAGCGATTAAATGGATGTTCCAGCGCCATGCGCCGCTGGCGGTTCGTCTCGACGGTACGCAGTTCCAGTTGAAATGGATGTGGCAAATGtt < 4:51599/148‑1 (MQ=255) ccGGGCAAATCTCCCCCGGATATGCTGCACCG‑‑‑T‑‑‑GGGCGGCACCAGGTGTGCCTTTAAAAGCGATTAAATGGATGTTCCAGCGCCATGCGCCGCTGGCGGTTCGTCTCGACGGTACGCAGTTCCAGTTGAAATGGATGTGGCAAATGtt < 2:215164/148‑1 (MQ=255) cGGGCAAATCTCCCCCGGATATGCTGCACCG‑‑‑T‑‑‑GGGCGGCACCAGGTGTGCCTTTAAAAGCGATTAAATGGATGTTCCAGCGCCATGCGCCGCTGGCGGTTCGTCTCGACGGTACGCAGTTCCAGTTGAAATGGATGGGGCAAATGTTAc < 2:35510/149‑1 (MQ=255) ccccGGATATGCTGCACCG‑‑‑T‑‑‑GGGCGGCACCAGGTGTGCCTTTAAAAGCGATTAAATGGATGTTCCAGCGCCATGCGCCGCTGGCGGTTCGTCTCGACGGTACGCAGTTCCAGTTGAAATGGATGTGGCAAATGTTACGTAACTGCGaca > 5:224674/1‑149 (MQ=255) ccccGGATATGCTGCACCG‑‑‑T‑‑‑GGGCGGCACCAGGTGTGCCTTTAAAAGCGATTAAATGGATGTTCCAGCGCCATGCGCCGCTGGCGGTTCGTCTCGACGGTACGCAGTTCCAGTTGAAATGGATGTGGCAAATGTTACGTAACTGCGaca > 8:23927/1‑149 (MQ=255) ccccGGATATGCTGCACCG‑‑‑T‑‑‑GGGCGGCACCAGGTGTGCCTTTAAAAGCGATTAAATGGATGTTCCAGCGCCATGCGCCGCTGGCGGTTCGTCTCGACGGTACGCAGTTCCAGTTGAAATGGATGTGGCAAATGTTACGTAACTGCGac < 4:226554/148‑1 (MQ=255) ccccGGATATGCTGCACCG‑‑‑T‑‑‑GGGCGGCACCAGGTGTGCCCTTAAAAGCGATTAAATGGATGTTCCAGCGCCATGCGCCGCTGGCGGTTCGTCTCGACGGTACGCAGTTCCAGTTGAAATGGATGTGGCAAATGTTACGTAACTGc < 1:104050/145‑1 (MQ=255) ccGGATATGCTGCACCG‑‑‑T‑‑‑GGGCGGCACCAGGTGTGCCTTTAAAAGCGATTAAATGGATGTTCCAGCGCCATGCGCCGCTGGCGGTTCGTCTCGACGGTACGCAGTTCCAGTTGAAATGGATGTGGCAAATGTTACGTAACTGCGACAcc < 5:131995/149‑1 (MQ=255) cGGATATGCTGCACCG‑‑‑T‑‑‑GGGCGGCACCAGGTGTGCCTTTAAAAGCGATTAAATGGATGTTCCAGCGCCATGCGCCGCTGGCGGTTCGTCTCGACGGTACGCAGTTCCAGTTGAAATGGATGTGGCAAATGTTACGTAACTGCGACACCa < 8:385180/149‑1 (MQ=255) cGGATATGCTGCACCG‑‑‑T‑‑‑GGGCGGCACCAGGGGTGCCTTTAAAAGCGATTAAATGGATGTTCCAGCGCCATGCGCCGCTGGCGGTTCGTCTCGACGGTACGCAGTTCCAGTTGAAATGGATGTGGCAAATGTTACGTAACTGCGACACCa < 6:307851/149‑1 (MQ=255) gATATGCTGCACCG‑‑‑T‑‑‑GGGCGGCACCAGGTGTGCCTTTAAAAGCGATTAAATGGATGTTCCAGCGCCATGCGCCGCTGGCGGTTCGTCTCGACGGTACGCAGTTCCAGTTGAAATGGATGTGGCAAATGTTACGTAACTGCGACACCAGc > 3:122200/1‑149 (MQ=255) ctgcACCG‑‑‑T‑‑‑GGGCGGCACCAGGTGTGCCTTTAAAAGCGATTAAATGGATGTTCCAGCGCCATGCGCCGCTGGCGGTTCGTCTCGACGGTACGCAGTTCCAGTTGAAATGGATGTGGCAAATGTTACGTAACTGCGACACCAGCCACTa > 5:127986/1‑148 (MQ=255) ctgcACCG‑‑‑T‑‑‑GGGCGGCACCAGGTGTGCCTTTAAAAGCGATTAAATGGATGTTCCAGCGCCATGCGCCGCTGGCGGTTCGTCTCGACGGTACGCAGTTCCAGTTGAAATGGATGTGGCAAATGTTACGTAACTGCGACACCAGCCACTa < 4:122200/148‑1 (MQ=255) tgcACCG‑‑‑T‑‑‑GGGCGGCACCAGGTGTGCCTTTAAAAGCGATTAAATGGATGTTCCAGCGCCATGCGCCGCTGGCGGTTCGTCTCGACGGTACGCAGTTCCAGTTGAAATGGATGTGGCAAATGTTACGTAACTGCGACACCAGCCACTACa > 4:132202/1‑149 (MQ=255) cacCG‑‑‑T‑‑‑GGGCGGCACCAGGTGTGCCTTTAAAAGCGATTAAATGGATGTTCCAGCGCCATGCGCCGCTGGCGGTTCGTCTCGACGGTACGCAGTTCCAGTTGAAATGGATGTGGCAAATGTTACGTAACTGCGACACCAGCCACTACATg < 2:287570‑M2/146‑1 (MQ=255) acCG‑‑‑T‑‑‑GGGCGGCACCAGGTGTGCCTTTAAAAGCGATTAAATGGATGTTCCAGCGCCATGCGCCGCTGGCGGTTCGTCTCGACGGTACGCAGTTCCAGTTGAAATGGATGTGGCAAACGTTACGTAACTGCGACACCAGCCACTACATgg < 8:80670‑M2/147‑1 (MQ=255) cG‑‑‑T‑‑‑GGGCGGCACCAGGTGTGCCTTTAAAAGCGATTAAATGGATGTTCCAGCGCCATGCGCCGCTGGCGGTTCGTCTCGACGGTACGCAGTTCCAGTTGAAATGGATGTGGCAAATGTTACGTAACTGCGACACCAGCCACTACATGGa > 7:213457/1‑148 (MQ=255) | TACTGGGAAGTGGTGTGGTAGGCGTTGCCAGCGCCTGGTACTTAAATCAGGCAGGACATGAGGTCACCGTCATTGATCGGGAGCCGGGGGCCGCCCTGGAAACCAGTGCCGCGAATGCCGGGCAAATCTCCCCCGGATATGCTGCACCG‑‑‑T‑‑‑GGGCGGCACCAGGTGTGCCTTTAAAAGCGATTAAATGGATGTTCCAGCGCCATGCGCCGCTGGCGGTTCGTCTCGACGGTACGCAGTTCCAGTTGAAATGGATGTGGCAAATGTTACGTAACTGCGACACCAGCCACTACATGGA > NC_000913/1237584‑1237878 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |