| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,211,610 | A→G | 6.4% | intergenic (+33/+70) | icdC → / ← iraM | pseudogene, isocitrate dehydrogenase C‑terminal gene fragment; idcC' is a 54 codon 3' gene fragment created during e14 prophage insertion/RpoS stabilzer during Mg starvation, anti‑RssB factor |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,211,610 | 0 | A | G | 6.4% | 391.6 / 12.1 | 125 | intergenic (+33/+70) | icdC/iraM | pseudogene, isocitrate dehydrogenase C‑terminal gene fragment; idcC' is a 54 codon 3' gene fragment created during e14 prophage insertion/RpoS stabilzer during Mg starvation, anti‑RssB factor |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (62/55); new base G (3/5); total (65/60) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.79e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 | |||||||||||
Only 100 of 129 total aligned reads displayed.
ATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTATTAATAGCATATCGAGCATATTTATATGAAGCCCATTACTTGAGCCCATATGGGCATATTTTTATAATGCAACTATTATGTAAACATTTATTTGTTATTTTGCTTTCTCCTG > NC_000913/1211464‑1211756 | aTGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGCTGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTGTGGTGAAGCGAGGATCGAAAACATGTAATCTCGCCATGTGTTTAATATTGAAACGGGGGtat > 6:74289/1‑148 (MQ=255) gAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTTGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAaca > 4:295062/1‑149 (MQ=255) ggCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGc > 4:71631/1‑149 (MQ=255) cgcAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTGTTATACGccc < 7:379280/149‑1 (MQ=255) gcAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCg > 1:23334/1‑149 (MQ=255) gcAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCg > 3:219600/1‑149 (MQ=255) gcAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCg > 7:217151/1‑149 (MQ=255) gcAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCAATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCg > 5:145563/1‑149 (MQ=255) tcaatGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCgctgt < 3:30388/149‑1 (MQ=255) aatGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGttt < 7:209598/149‑1 (MQ=255) aatGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGAGCATCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGttt < 2:104580/149‑1 (MQ=255) atGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGtttt < 3:71631/149‑1 (MQ=255) aaGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTtttattta > 8:312120/1‑149 (MQ=255) gACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTAtg > 6:333841/1‑149 (MQ=255) aCCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCTCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTAtgt < 7:424847/149‑1 (MQ=255) aCCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTAtgt < 3:335279/149‑1 (MQ=255) ttATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTAtgt < 7:86764/141‑1 (MQ=255) ttATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGAtatta > 2:213060/1‑149 (MQ=255) tGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATattatt < 1:58635/148‑1 (MQ=255) tGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATattatt > 5:24672/1‑148 (MQ=255) aCTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTATTAAt > 2:109994/1‑149 (MQ=255) cTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTttta > 6:398519/1‑128 (MQ=255) cTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTttta < 5:398519/128‑1 (MQ=255) cTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTATTaa > 2:72308/1‑147 (MQ=255) cTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTATTaa > 6:41576/1‑147 (MQ=255) ttCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTATTAATAg > 5:122957/1‑149 (MQ=255) ttCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTATTAATAg > 2:40332/1‑149 (MQ=255) ttCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTATTAATAg > 5:111139/1‑149 (MQ=255) ttCGAACGTCTGAT‑GAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTATTAATAg > 5:344263/1‑148 (MQ=255) gAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTATTAATAGCa > 3:319669/1‑148 (MQ=255) gAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGAGCATCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTATTAATAGCat < 6:270973/149‑1 (MQ=255) aaCGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTATTAATAGCata < 3:392182/149‑1 (MQ=255) aaCGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTATTAATAGCata < 8:217151/149‑1 (MQ=255) gATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTtttatt > 3:91069/1‑118 (MQ=255) gATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTtttatt < 4:91069/118‑1 (MQ=255) gATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCATCTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGGGTTATTTATGTGGATATTATTAATAGCATAACGAGc > 8:307003/1‑148 (MQ=255) tGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTATTAATAGCATATCGAGCata > 7:109672/1‑149 (MQ=255) tGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTATTAATAGCATATCGAGCata > 7:115779/1‑149 (MQ=255) gAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGATAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTAATGTGGATATTATTAATAGCATATCGAGCatat < 8:183086/148‑1 (MQ=255) gAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTATTAATAGCATATCGAGCATAtt > 3:213877/1‑149 (MQ=255) gcTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTATTAATAGCATATCGAg < 1:10257/137‑1 (MQ=255) gcTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTATTAATAGCATATCGAGCATATTTatat > 3:302412/1‑148 (MQ=255) aGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGTAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTATCCATGTTTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTATTAATAGCATATCGAGCATATTTATATGaa < 5:387282/147‑1 (MQ=255) aGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCgttg < 3:36819/97‑1 (MQ=255) tgctgAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTATTAATAGCATATCGAGCATATTTATATGAAGCCCa > 1:134816/1‑149 (MQ=255) cttaaaTGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTATTAATAGCATATCGAGCATATTTATATGAAGCCCAt < 1:199560/145‑1 (MQ=255) tgAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTATTAATAGCATATCGAGCATATTTATATGAAGCCCATTa > 8:71891/1‑149 (MQ=255) aaaTGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTATTAATAGCATATCGAGCATATTTATATGaa < 8:109824/139‑1 (MQ=255) aaaTGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTATTAATAGCATATCGAGCATATTTATATGaa > 7:109824/1‑139 (MQ=255) aaaTGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTATTAATAGCATATCGAGCATATTTATATGAAGCCCATTa < 3:184214/147‑1 (MQ=255) aaTGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTATTAATAGCATATCGAGCATATTTATATGAAGCCCATTACtt > 2:30470/1‑149 (MQ=255) ttCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTATTAATAGCATATCGAGCATATTTATATGAAGCCCATTACTTGAGc < 4:178188/149‑1 (MQ=255) ttCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTCTATTTATGTGGATATTATTAATAGCATATCGAGCATATTTATATGAAGCCCATTACTTGAGc < 5:309149/149‑1 (MQ=255) cAGAGTTTTGTTCAGAGATCATAGAAAACATGTAATCTCTCCATTTGTTAAAAATTGCAAAGGGCGTATAACACGCCCGGTTTTTTATTTATGTGTATATTATTAATAGCATATCGATCATATTTATATTAAGCCCATTACTTGAGcc < 2:27605/148‑1 (MQ=255) agagTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTATTAATAGCATATCGAGCATATTTATATGAAGCCCATTACTTGAGCCCa > 7:48024/1‑149 (MQ=255) tGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTATTAATAGCATATCGAGCATATTTATATGAAGCCCATTACTTGAGCCCATATgg < 7:424175/148‑1 (MQ=255) ggTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTATTAATAGCATATCGAGCATATTTATATGAAGCCCATTACTTGAGCCCATATggg < 5:333841/148‑1 (MQ=255) tGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTATTAATAGCATATCGAGCATATTTATATGAAGCCCATTACTTGAGCCCATATGGGCat < 3:375232/149‑1 (MQ=255) tGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTATTAATAGCATATCGAGCATATTTATATGAAGCCCATTACTTGAGCCCATATGGGCa > 8:43607/1‑148 (MQ=255) gCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTATTAATAGCATATCGAGCATATTTATATGAAGCCCATTACTTGAGCCCATATGGGCATAttt > 5:24931/1‑149 (MQ=255) gATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTATTAATAGCATATCGAGCATATTTATATGAAGCCCATTACTTGAGCCCATATGGGCATAttttt < 8:115779/149‑1 (MQ=255) gATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTATTAATAGCATATCGAGCATATTTATATGAAGCCCATTACTTGAGCCCATATGGGCATAttttt < 3:350073/149‑1 (MQ=255) gATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTATTAATAGCATATCGAGCATATTTATATGAAGCCCATTACTTGAGCCCATATGGGCATAttttt < 1:72308/149‑1 (MQ=255) gATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTATTAATAGCATATCGAGCATATTTATATGAAGCCCATTACTTGAGCCCATATGGGCATAtttt > 7:268094/1‑148 (MQ=255) tcatcGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTATTAATAGCATATCGAGCATATTTATATGAAGCCCATTACTTGAGCCCATATGGGCATATTTTtat < 6:344263/149‑1 (MQ=255) tcatcGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTATTAATAGCATATCGAGCATATTTATATGAAGCCCATTACTTGAGCCCATATGGGCATATTTTta > 6:340915/1‑148 (MQ=255) atcGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGAtattat > 8:44696/1‑83 (MQ=255) tcGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTAtgt < 2:20645/73‑1 (MQ=255) tcGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTATTAATAGCATATCGAGCATATTTATATGAAGCCCATTACTTGAGCCCATATGGGCATATTTTTATAAt < 2:411780/149‑1 (MQ=255) tcGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTATTAATAGCATATCGAGCATATTTATATGAAGCCCATTACTTGAGCCCATATGGGCATATTTTTATAAt < 7:200097/149‑1 (MQ=255) cGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTATTAATAGCATATCGAGCATATTTATATGAAGCCCATTACTTGAGCCCATATGGGCATATTTTTATAATg > 5:340856/1‑149 (MQ=255) aaaaCATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTATTAATAGCATATCGAGCATATTTATATGAAGCCCATTACTTGAGCCCATATGGGCATATTTTTATAATGc > 2:168810/1‑148 (MQ=255) aaaCATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTATTAATAGCATATCGAGCATATTTATATGAAGCCCATTACTTGAGCCCATATGGGCATATTTTTATAATGCaa < 1:40332/149‑1 (MQ=255) aTGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCTCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTATTAATAGCATATCGAGCATATTTATATGAAGCCCATTACTTGAGCCCATATGGGCATATTTTTATAATGCAACtat > 4:374642/1‑149 (MQ=255) tttAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGGGTATAAAACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGTATATTATTAATAGCATATCGAGCATATTTATATGAAGCCCATTACTTGAGCCCATATGGGCATATTTTTATAATGCATCtatt < 4:319669/147‑1 (MQ=255) tAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTATTAATAGCATATCGAGCATATTTATATGAAGCCCATTACTTGAGCCCATATGGGCATATTTTTATAATGCAACtattat < 5:41576/149‑1 (MQ=255) tatccacataaataaaacAACGGGCGTGTTATACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTATTAATAGCata < 5:71975‑M1/55‑1 (MQ=255) tatccacataaataaaacAACGGGCGTGTTATACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTATTAATAGCata > 6:71975‑M1/19‑73 (MQ=255) ccATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTATTAATAGCATATCGAGCATATTTATATGAAGCCCATTACTTGAGCCCATATGGGCATATTTTTATAATGCAACTATTATGTAAACat > 6:110914/1‑149 (MQ=255) cATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTATTAATAGCATATCGAGCATATTTATATGAAGCCCATTACTTGAGCCCATATGGGc > 1:42723/1‑116 (MQ=255) cATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTATTAATAGCATATCGAGCATATTTATATGAAGCCCATTACTTGAGCCCATATGGGc < 2:42723/116‑1 (MQ=255) aTGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTATTAATAGCATATCGAGCATATTTATATGAAGCCCATTACTTGAGCCCATATGGGCATATTTTTATAATGCAACTATTATGTAAACatt > 6:297991/1‑148 (MQ=255) acataaataaaacAACGGGCGTGTTATACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTATTAATAGCATATCGAGCATATTTATATGAAGCCCATTACTTGAGCCCATATGGGCATATTTTTATAATGCAACTATTATGTAAACatttatt < 4:297198‑M1/136‑1 (MQ=255) ttAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTATTAATAGCATATCGAGCATATTTATATGAAGCCCATTACTTGAGCCCATATGGGCATATTTTTATAATGCAACtatt < 8:350272/132‑1 (MQ=255) ttAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTATTAATAGCATATCGAGCATATTTATATGAAGCCCATTACTTGAGCCCATATGGGCATATTTTTATAATGCAACTATTATGTAAACATTTATTTg > 3:46129/1‑149 (MQ=255) tatTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTATTAATAGCATATCGAGCATATTTATATGAAGCCCATTACTTGAGCCCATATGGGCATATTTTTATAATGCAACTATTATGTAAACATTTATTTGTTAtt < 6:24931/149‑1 (MQ=255) tatTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTATTAATAGCATATCGAGCATATTTATATGAAGCACATTACTTGAGCCCATATGGGCATATTTTTATAATGCAACTATTATGTAAACATTTATTTGTTAtt > 5:140109/1‑149 (MQ=255) ttGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTATTAATAGCATATCGAGCATATTTATATGAAGCCCATTACTTGAGCCCATATGGGCATATTTTTATAATGCAACTATTATGTAAACATTTATTTGTTAtttt > 5:260051/1‑149 (MQ=255) gAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTATTAATAGCATATCGAGCATATTTATATGAAGCCCATTACTTGAGCCCATATGGGCATATTTTTATAATGCAACTATTATGTAAACATTTATTTGTTATTTTg < 2:23334/148‑1 (MQ=255) gAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTATTAATAGCATATCGAGCATATTTATATGAAGCCCATTACTTGAGCCCATATGGGCATATTTTTATAATGCAACTATTATGTAAACATTTATTTGTTATTTTGc > 4:2011/1‑149 (MQ=255) aaaCGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTATTAATAGCATATCGAGCATATTTATATGAAGCCCATTACTTGAGCCCATATGGGCATATTTTTATAATGCAACTATTATGTAAACATTTATTTGTTATTTTGc < 6:145563/148‑1 (MQ=255) aaaCGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTATTAATAGCATATCGAGCATATTTATATGAAGCCCATTACTTGAGCCCATATGGGCATATTTTTATAATGCAACTATTATGTAAACATTTATTTGTTATTTTGCt > 2:129946/1‑149 (MQ=255) aaaCGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTATTAATAGCATATCGAGCATATTTATATGAAGCCCATTACTTGAGCCCATATGGGCATATTTTTATAATGCAACTATTATGTAAACATTTATTTGTTATTTTGCt < 6:122957/149‑1 (MQ=255) ACGGGCGTGTTATACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTATTAATAGCATATCGAGCATATTTATATGAAGCCCATTACTTGAGCCCATATGGGCATATTTTTATAATGCAACTATTATGTAAACATTTATTTGTTATTTTGCtt < 2:279865‑M1/148‑1 (MQ=255) CGGGCGTGTTATACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTATTAATAGCATATCGAGCATATTTATATGAAGCCCATTACTTGAGCCCATATGGGCATATTTTTATAATGCAACTATTATGTAAACATTTATTTGTTATTTTGCTTtc > 3:297198‑M1/1‑149 (MQ=255) CGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTATTAATAGCATATCGAGCATATTTATATGAAGCCCATTACTTGAGCCCATATGGGCATATTTTTATAATGCAACTATTATGTAAACATTTATTTGTTATTTTGCTTtc > 7:47261‑M1/1‑149 (MQ=255) GTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTATTAATAGCATATCGAGCATATTTATATGAAGCCCATTACTTGAGCCCATATGGGCATATTTTTATAATGCAACTATTATGTAAACATTTATTTGTTATTTTGCTTTCTCCTg > 1:30470‑M1/1‑149 (MQ=255) GTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTATTAATAGCATATCGAGCATATTTATATGAAGCCCATTACTTGAGCCCATATGGGCATATTTTTATAATGCAACTATTATGTAAACATTTATTTGTTATTTTGCTTTCTCCTg > 1:251651‑M1/1‑149 (MQ=255) GTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTATTAATAGCATATCGAGCATATTTATATGAAGCCCATTACTTGAGCCCATATGGGCATATTTTTATAATGCAACTATTATGTAAACATTTATTTGTTATTTTGCTTTCTCCTg > 1:168810‑M1/1‑149 (MQ=255) ataACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTATTAATAGCATATCGAGCATATTTATATGAAGCCCATTACTTGAGCCCATATGGGCATATTTTTATAATGCAACTATTATGTAAACATTTATTTGTTATTTTGCTTTCTCCTg > 6:373613/1‑147 (MQ=255) | ATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTATTAATAGCATATCGAGCATATTTATATGAAGCCCATTACTTGAGCCCATATGGGCATATTTTTATAATGCAACTATTATGTAAACATTTATTTGTTATTTTGCTTTCTCCTG > NC_000913/1211464‑1211756 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |