| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 3068921 | 74 (0.730) | 4 (0.040) | 5/240 | NT | 5.2% | intergenic (‑113/+26) | argO/mscS | arginine transporter/mechanosensitive channel protein, small conductance |
| ? | NC_000913 | = 3068929 | 76 (0.810) | intergenic (‑121/+18) | argO/mscS | arginine transporter/mechanosensitive channel protein, small conductance | |||||
Only 100 of 113 total aligned reads displayed.
AGTGCAAGACCTTGAAAGTAATAAGAAAACACGTTGGATATTCCGAATTAAGTATCTGATGCAGAGACTATATCGCGGGATTGTTATTAGCGGAAATTGATAATATTAATTGGCAATCAGAAAAACTAATAAGAGAGAGGCCAGAGAGTATTATCTGGCCTCAGCGTTGATTACGCAGCTTTGTCTTCTTTCACCCGCTTAAAGTTCACATCCATTTGCGGGTACGGGAAGCTGATACCGGCGGCATCAAATTCACGTTTAATACGCTCCAGCACATCCCAGTACACGTTT > NC_000913/3068777‑3069067 | aGTGCAAGACCTTGAAAGTAATAAGAAAACACGTTGGATATTCCGAATTAAGTATCTGATGCAGAGACTATATCGCGGGATTGTTATTAGCGGAAATTGATAATATTAATTGGCAATCAGAAAAACTAATAAGAGAGAGGCCAGAGAGt < 5:63220/149‑1 (MQ=255) gTGCAAGACCTTGAAAGTAATAAGAAAACACGTTGGATATTCCGAATTAAGTATCTGATGCAGAGACTATATCGCGGGATTGTTATTAGCGGAAATTGATAATATTAATTGGCAATCAGAAAAACTAATAAGAGAGAGGCCAGAGAGta < 1:425704/149‑1 (MQ=255) tGCAAGACCTTGAAAGTAATAAGAAAACACGTTGGATATTCCGAATTAAGTATCTGATGCAGAGACTATATCGCGGGATTGTTATTAGCGGAAATAGATAATATTAATTGGCAATCAGAAAAACTAATAAGAGAGAGGCCAGAGAGt > 1:74063/1‑147 (MQ=255) cAAGACCTTGAAAGTAATAAGAAAACACGTTGGATATTCCGAATTAAGTATCTGATGCAGAGACTATATCGCGGGATTGTTATTAGCGGAAATTGATAATATTAATTGGCAATCAGAAAAACTAATAAGAGAGAGGCCAGAGAGtatta < 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aGTATCTGCTGCAGAGACTAAATCGCGGGATTGTTATTCGCGGAAATTGATAATATTAATTGGCAATCAGAAAAACTAATAAGAGAGAGGCCAGATAATACTCtctggcctctctcttattagtttttctgattgccaattaatattat > 3:326604‑M2/1‑103 (MQ=255) aGTATCTGATGCAGAGACTATATCGCGGGATTGTTATTAGCGGAAATTGATAATATTAATTGGCAATCAGAAAAACTAATAAGAGAGAGGCCAGAGAGTATTATCTGGCCTCAGCGTTGATTACGCAGCTTTGTCTTCTTTCACCCGCt > 1:3556/1‑149 (MQ=255) tATCTGATGCAGAGACTATATCGCGGGATTGTTATTAGCGGAAATTGATAATATTAATTGGCAATCAGAAAAACTAATAAGAGAGAGGCCAGAGAGTATTATCTGGCCTCAGCGTTGATTACGCAGCt < 2:369183/128‑1 (MQ=255) tATCTGATGCAGAGACTATATCGCGGGATTGTTATTAGCGGAAATTGATAATATTAATTGGCAATCAGAAAAACTAATAAGAGAGAGGCCAGAGAGTATTATCTGGCCTCAGCGTTGATTACGCAGCt > 1:369183/1‑128 (MQ=255) tCTGATGCAGAGACTATATCGCGGGATTGTTATTAGCGGAAATTGATAATATTAATTGGCAATCAGAAAAACTAATAAGAGAGAGGCCAGAGAGTATTATCTGGCCTCAGCGTTGATTACGCAGCTTTGTCTTCTTTCACACGCTTa > 5:359124/1‑147 (MQ=255) cTGATGCAGAGACTATATCGCGGGATTGTTATTAGCGGAAATTGATAATATTAATTGGCAATCAGAAAAACTAATAAGAGAGAGGCCAGAGAGTATTATCTGGCCTCAGCGTTGATTACGCAGCTTTGTCTTCTTTCACCCGCTTAAAg > 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ttGGCAATCAGAAAAACTAATAAGAGAGAGGCCAGAGAGTATTATCTGGCCTCAGCGTTGATTACGCAGCTTTGTCTTCTTTCACCCGCTTAAAGTTCACATCCATTTGCGGGTACGGGAAGCTGATACCGGCGGCATCAAATTCACGt > 1:384945/1‑149 (MQ=255) cAATCAGAAAAACTAATAAGAGAGAGGCCAGAGAGTATTATCTGGCCTCAGCGTTGATTACGCAGCTTTGTCTTCTTTCACCCGCTTAAAGTTCACATCCATTTGCGGGTACGGGAAGCTGATACCGGCGGCATCAAATTCACGTTTaa < 2:55426/149‑1 (MQ=255) aTCAGAAAAACTAATAAGAGAGAGGCCAGAGAGTATTATCTGGCCTCAGCGTTGATTACGCAGCTTTGTCTTCTTTCACCCGCTTAAAGTTCACATCCATTTGCGGGTACGGGAAGCTGATACCGGCGGCATCAAATTCACGTTTAATa < 2:84781/149‑1 (MQ=255) tCAGAAAAACTAATAAGAGAGAGGCCAGAGAGTATTATCTGGCCTCAGCGTTGATTACGCAGCTTTGTCTTCTTTCACCCGCTTAAAGTTCACATCCATTTGCGGGTACGGGAAGc > 8:66285/1‑116 (MQ=255) tCAGAAAAACTAATAAGAGAGAGGCCAGAGAGTATTATCTGGCCTCAGCGTTGATTACGCAGCTTTGTCTTCTTTCACCCGCTTAAAGTTCACATCCATTTGCGGGTACGGGAAGc < 7:66285/116‑1 (MQ=255) tCAGAAAAACTAAAAAGAGAGAGGCCAGAGAGTATTATATGTACACATCGTTAATTAAGCAGCTTTGTCTTCTTTCACCCGCTTAAAGTTCACAACCATTTGCGGGTACGGGAAGCAGATACCGGCGGAATCAAATTCACGTTTAATaa > 4:242129/1‑148 (MQ=255) aaCTAATAAGAGAGAGGCCAGAGAGTATTATCTGGCCTCAGCGTTGATTACGCAGCTTTGTCTTCTTTCACCCGCTTAAAGTTCACATCCATTTGCGGGTACGGGAAGCTGATACCGGCGGCATCAAATTCACGTTTAATACGCTCCAg < 2:220181/149‑1 (MQ=255) gagagagGCCAGAGAGTATTATCTGGCCTCAGCGTTGATTACGCAGCTTTGTCTTCTTTCACCCGCTTAAAGTTCACATCCATTTGCGGGTACGGGAAGCTGATACCGGCGGCATCAAATTCACGTTTAATACGCTCCAGCACATCCCa < 7:184074/149‑1 (MQ=255) agagagGCCAGAGAGTATTATCTGGCCTCAGCGTTGATTACGCAGCTTTGTCTTCTTTCACCCGCTTAAAGTTCACATCCATTTGCGGGTACGGGAAGCTGATACCGGCGGCATCAAATTCACGTTTAATACGCTCCAGCACATCCCAg < 5:453788/149‑1 (MQ=255) gagagGCCAGAGAGTATTATCTGGCCTCAGCGTTGATTACGCAGCTTTGTCTTCTTTCACCCGCTTAAAGTTCACATCCATTTGCGGGTACGGGAAGCTGATACCGGCGGCATCAAATTCACGTTTAATACGCTCCAGCACATCCCAGt < 2:100977/149‑1 (MQ=255) agGCCAGAtaatactctctggcctctctcttattagtttttctgattgccaattaatattatcaatttccgctaataacaatcccgcgatatagtctctgcatcagatacttaattcggaatatccaacgtgttttcttattactttc < 7:230194‑M1/148‑141 (MQ=255) agGCCAGAGAGTATTATCTGGCCTCAGCGTTGATTACGCAGCTTTGTCTTCTTTCACCCGCTTAAAGTTCACATCCATTTGCGGGTACGGGAAGCTGATACCGGCGGCATCAAATTCACGTTTAATACGCTCCAGCACATCCCAGTaca > 8:146665/1‑149 (MQ=255) ggCCAGAtaatactctctggcctctctcttattagtttttctgattgccaattaatattatcaatttccgctaataacaatcccgcgatatagtctctgcatcagatacttaattcggaatatccaacgtgttttcttattactttcaa < 8:248591‑M1/149‑143 (MQ=255) ggCCAGAgagtattatctggcctctctcttattagtttttctgattgccaattaatattatcaatttccgctaataacaatcccgcgatatagtctctgcatcagatacttaattcggaatatccaacgtgttttcttattactttc > 3:137716‑M1/1‑7 (MQ=255) gCCAGAtaatactctctggcctctctcttattagtttttctgattgccaattaatattatcaatttccgctaataacaatcccgcgatatagtctctgcatcagatacttaattcggaatatccaacgtgttttcttattactttcaag > 1:276565‑M1/1‑6 (MQ=255) gCCAGAtaatactctctggcctctctcttattagtttttctgattgccaattaatattatcaatttccgctaataacaatcccgcgatatagtctctgcatcagatacttaattcggaatatccaacgtgttttcttattaatatcgt > 5:36710‑M1/1‑6 (MQ=255) gCCAGAtaatactctctggcctctctcttattagtttttctgattgccaattaatattatcaatttccgctaataacaatcccgcgatatagtctctgcatcagatacttaattcggaatatccaacgtgttttcttatt < 6:36710‑M1/140‑135 (MQ=255) cAGAtaatactctctggcctctctctaattagtttttctgattgccaattaatattatcaatttccgctaataacaatcccgcgatatagtctctgcatcagatactttaatcggaatttccaacgtgttttcttattactttcaaggt > 2:445683‑M1/1‑4 (MQ=255) cAGAGAGTATTATCTGGCCTCAGCGTTGATTACGCAGCTTTGTCTTCTTTCACCCGCTTAAAGTTCACATCCATTTGCGGGTACGGGAAGCTGATACCGGCGGCATCAAATTCACGTTTAATACGCTCCAGCACATCCCAGTACACGtt > 3:52596/1‑149 (MQ=255) cAGAGAGTATTATCTGGCCTCAGCGTTGATTACGCAGCTTTGTCTTCTTTCACCCGCTTAAAGTTCACATCCATTTGCGGGTACGGGAAGCTGATACCGGCGGCATCAAATTCACGTTTAATACGCTCCAGCACATCCCAGTACACGtt > 7:349362/1‑149 (MQ=255) agagagTATTATCTGGCCTCAGCGTTGATTACGCAGCTTTGTCTTCTTTCACCCGCTTAAAGTTCACATCCATTTGCGGGTACGGGAAGCTGATACCGGCGGCATCAAATTCACGTTTAATACGCTCCAGCACATCCCAGTACACGttt > 7:278852/1‑149 (MQ=255) agagTATTATCTGGCCTCAGCGTTGATTACGCAGCTTTGTCTTCTTTCACCCGCTTAAAGTTCACATCCATTTGCGGGTACGGGAAGCTGATACCGGCGGCATCAAATTCACGt > 4:313370/1‑114 (MQ=255) agagTATTATCTGGCCTCAGCGTTGATTACGCAGCTTTGTCTTCTTTCACCCGCTTAAAGTTCACATCCATTTGCGGGTACGGGAAGCTGATACCGGCGGCATCAAATTCACGt < 3:313370/114‑1 (MQ=255) | AGTGCAAGACCTTGAAAGTAATAAGAAAACACGTTGGATATTCCGAATTAAGTATCTGATGCAGAGACTATATCGCGGGATTGTTATTAGCGGAAATTGATAATATTAATTGGCAATCAGAAAAACTAATAAGAGAGAGGCCAGAGAGTATTATCTGGCCTCAGCGTTGATTACGCAGCTTTGTCTTCTTTCACCCGCTTAAAGTTCACATCCATTTGCGGGTACGGGAAGCTGATACCGGCGGCATCAAATTCACGTTTAATACGCTCCAGCACATCCCAGTACACGTTT > NC_000913/3068777‑3069067 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |