| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 2508432 | 108 (1.150) | 6 (0.070) | 6/236 | NT | 5.7% | intergenic (‑190/+29) | fryB/glk | putative enzyme IIB component of PTS/glucokinase |
| ? | NC_000913 | = 2508438 | 99 (1.130) | intergenic (‑196/+23) | fryB/glk | putative enzyme IIB component of PTS/glucokinase | |||||
Only 100 of 123 total aligned reads displayed.
CAAAACAAATCGCCGTTACCAGACAAATAATGCATTTACTGGAGAATTAATCCCGCTGTACGGAAGTGTGACGCAGGTCGACCTTGTGAGGGGACACAAAGAAAAATTGAATAAACTGTATGATTTAAAAGATTATCGGGAGAGTTAC‑CTCCCGATATAAAAGGAAGGATTTACAGAATGTGACCTAAGGTCTGGCGTAAATGTGCACCGGAACCGAGAAGGCCCGGATTGTCATGGACGATGAGATACACCGGAATATCATGGACATATTCTTTAAAGCGCCCTTT > NC_000913/2508291‑2508577 | cAAAACAAATCGCCGTTACCAGACAAATAATGCATTTACTGGAGAATTAATCCCGCTGTACGGAAGTGTGACGCAGGTCGAACTTGTGAGGGGACACAAAGAAAAATTGAATAAACTGTATGATTTAAAAGATTATCGGGAGAGTTAca > 1:271932/1‑148 (MQ=255) aaaCAAATCGCCGTTACCAGACAAATAATGCATTTACTGGAGAATTAATCCCGCTGTACGGAAGTGTGACGCAGGTCGACCTTGTGAGGGGACACAAAGAAAAATTGAATAAACTGTATGATTTAAAAGATTATCGGGAGAGTTACctc < 2:369224‑M2/149‑4 (MQ=255) tCGCCGTTACCAGACAAATAATGCATTTACTGGAGAATTAATCCCGCTGTACGGAAGTGTGACGCAGGTCGACCTTGTGAGGGGACACAAAGAAAAATTGAATAAACTGTATGATTTAAAAGATTATCGGGAGAGTTACctcccgata < 2:261215‑M2/148‑10 (MQ=255) cGTTACCAGACAAATAATGCATTTACTGGAGAATTAATCCCGCTGTACGGAAGTGTGACGCAGGTCGACCTTGTGAGGGGACACAAAGAAAAATTGAATAAACTGTATGATTTAAAAGATTATCGGGAGAGTTAC‑CTCCCGATATaaaa < 8:397176/149‑1 (MQ=255) cGTTACCAGACAAATAATGCATTTACTGGAGAATTAATCCCGCTGTACGGAAGTGTGACGCAGGTCGACCTTGTGAGGGGACACAAAGAAAAATTGAATAAACTGTATGATTTAAAAGATTATCGGGAGAGTTAC‑CTCCCGATATaaaa < 2:293161/149‑1 (MQ=255) cGTTACCAGACAAATAATGCATTTACTGGAGAATTAATCCCGCTGTACGGAAGTGTGACGCAGGTCGACCTTGTGAGGGGACACAAAGAAAAATTGAATAAACTGTATGATTTAAAAGATTATCGGGAGAGTTAC‑CTCCCGATATaaaa < 4:274494/149‑1 (MQ=255) ttACCAGACAAATAATGCATTTACTGGAGAATTAATCCCGCTGTACGGAAGTGTGACGCAGGTCGACCTTGTGAGGGGACACAAAGAAAAATTGAATAAACTGTATGATTTAAAAGATTATCGGGAGAGTTAC‑CTCCCGATATAAaagg < 7:389914/149‑1 (MQ=255) aCCAGACAAATAATGCATTTACTGGAGAATTAATCCCGCTGTACGGAAGTGTGACGCAGGTCGACCTTGTGAGGGGACACAAAGAAAAATTGAATAAACTGTATGATTTAAAAGATTATCGGGAGAGTTAC‑CTCCCGATATaaaa > 5:225271/1‑145 (MQ=255) aCCAGACAAATAATGCATTTACTGGAGAATTAATCCCGCTGTACGGAAGTGTGACGCAGGTCGACCTTGTGAGGGGACACAAAGAAAAATTGAATAAACTGTATGATTTAAAAGATTATCGGGAGAGTTAC‑CTCCCGATATaaaa < 6:225271/145‑1 (MQ=255) ccAGACAAATAATGCATTTACTGGAGAATTAATCCCGCTGTACGGAAGTGTGACGCAGGTCGACCTTGTGAGGGGACACAAAGAAAAATTGAATAAACTGTATGATTTAAAAGATTATCGGGAGAGTTAC‑CTCCCGATATAAaaggaa < 1:261215/148‑1 (MQ=255) cAGACAAATAATGCATTTACTGGAGAATTAATCCCGCTGTACGGAAGTGTGACGCAGGTCGACCTTGTGAGGGGACACAAAGAAAAATTGAATAAACTGTATGATTTAAAAGATTATCGGGAGAGTTAC‑CTCCCGATATAAaaggaagg < 2:428647/149‑1 (MQ=255) cAGACAAATAATGCATTTACTGGAGAATTAATCCCGCTGTACGGAAGTGTGACGCAGGTCGACCTTGTGAGGGGACACAAAGAAAAATTGAATAAACTGTATGATTTAAAAGATTATCGGGAGAGTTAC‑CTCCCGATATAAaaggaag > 5:350242/1‑148 (MQ=255) cAGACAAATAATGCATTTACTGGAGAATTAATCCCGCTGTACGGAAGTGTGACGCAGGTCGACCTTGTGAGGGGACACAAAGAAAAATTGAATAAACTGTATGATTTAAAAGATTATCGGGAGAGTTAC‑CTCCCGATATAAaaggaag > 5:356559/1‑148 (MQ=255) aGACAAATAATGCATTTACTGGAGAATTAATCCCGCTGTACGGAAGTGTGACGCAGGTCGACCTTGTGAGGGGACACAAAGAAAAATTGAATAAACTGTATGATTTAAAAGATTATCGGGAGAGTTAC‑CTCCCGATATaaa < 3:173924/141‑1 (MQ=255) aGACAAATAATGCATTTACTGGAGAATTAATCCCGCTGTACGGAAGTGTGACGCAGGTCGACCTTGTGAGGGGACACAAAGAAAAATTGAATAAACTGTATGATTTAAAAGATTATCGGGAGAGTTAC‑CTCCCGATATAAAaggaagga > 7:90106/1‑149 (MQ=255) gACAAATAATGCATTTACTGGAGAATTAATCCCGCTGTACGGAAGTGTGACGCAGGTCGACCTTGTGAGGGGACACAAAGAAAAATTGAATAAACTGTATGATTTAAAAGATTATCGGGAGAGTTAC‑CTCCCGATATaaaa < 6:96132/141‑1 (MQ=255) gACAAATAATGCATTTACTGGAGAATTAATCCCGCTGTACGGAAGTGTGACGCAGGTCGACCTTGTGAGGGGACACAAAGAAAAATTGAATAAACTGTATGATTTAAAAGATTATCGGGAGAGTTAC‑CTCCCGATATAAAAGGAAGGAt < 6:332364/149‑1 (MQ=255) gACAAATAATGCAGTTACTGGAGAATTAATCCCGCTGTACGGAAGTGTGACGCAGGTCGACCTTGTGAGGGGACACAAAGAAAAATTGAATAAACTGTATGATTTAAAAGATTATCGGGAGAGTTAC‑CTCCCGATATaaaa > 5:96132/1‑141 (MQ=255) 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tACTGGAGAATTAATCCCGCTGTACGGAAGTGTGACGCAGGTCGACCTTGTGAGGGGACACAAAGAAAAATTGAATAAACTGTATGATTTAAAAGATTATCGGGAGAGTTAC‑CTCCCGATATAAAAGGAAGGATTTACAGAATGTGAc < 7:459893/148‑1 (MQ=255) tgtagaATTAATCCCGCTGTACGGAAGTGTGACGCAGGTCGACCTTGTGAGGGGACACAAAGAAAAATTGAATAAACTGTATGATTTAAAAGATTATCGGGAGAGTTAC‑CTCCCGATATAAAAGGAAGGATTTACAGAATGTGACCt > 2:129476/4‑147 (MQ=255) tGGAGAATTAATCCCGCTGTACGGAAGTGTGACGCAGGTCGACCTTGTGAGGGGACACAAAGAAAAATTGAATAAACTGTATGATTTAAAAGATTATCGGGAGAGTTAC‑CTCCCGATATAAAAGGAAGGATTTACAGAATGTGACCt > 4:343517/1‑147 (MQ=255) ggAGAATTAATCCCGCTGTACGGAAGTGTGACGCAGGTCGACCTTGTGAGGGGACACAAAGAAAAATTGAATAAACTGTATGATTTAAAAGATTATCGGGAGAGTTAC‑CTCCCGATATAAAAGGAAGGATTTACAGAATGTGACCTAAg > 2:249499/1‑149 (MQ=255) ggAGAATTAATCCCGCTGTACGGAAGTGTGACGCAGGTCGACCTTGTGAGGGGACACAAAGAAAAATTGAATAAACTGTATGATTTAAAAGATTATCGGGAGAGTTAC‑CTCCCGATATAAAAGGAAGGATTTACAGAATGTGACCTAAg > 3:154680/1‑149 (MQ=255) gagaATTAATCCCGCTGTACGGAAGTGTGACGCAGGTCGACCTTGTGAGGGGACACAAAGAAAAATTGAATAAACTGTATGATTTAAAAGATTATCGGGAGAGTTAC‑CTCCCGATATAAAAGGAAGGATTTACAGAATGTGACCTAAgg > 6:260563/1‑149 (MQ=255) gagaATTAATCCCGCTGTACGGAAGTGTGACGCAGGTCGACCTTGTGAGGGGACACAAAGAAAAATTGAATAAACTGTATGATTTAAAAGATTATCGGGAGAGTTAC‑CTCCCGATATAAAAGGAAGGATTTACAGAATGTGACCTAAg < 6:350242/148‑1 (MQ=255) gagaATTAATCCCGCTGTACGGAAGTGTGACGCAGGTCGACCTTGTGAGGGGACACAAAGAAAAATTGAATAAACTGTATGATTTAAAAGATTATCGGGAGAGTTAC‑CTCCCGATATAAAAGGAAGGATTTACAGAATGTGACCTAAg < 6:356559/148‑1 (MQ=255) aaTTAATCCCGCTGTACGGAAGTGTGACGCAGGTCGACCTTGTGAGGGGACACAAAGAAAAATTGAATAAACTGTATGATTTAAAAGATTATCGGGAG‑GTAACtctcccgataatcttttaaatcatacagtttattcaatttttcttt > 2:333900‑M2/1‑103 (MQ=255) aTTAATCCCGCTGTACGGAAGTGTGACGCAGGTCGACCTTGTGAGGGGACACAAAGAAAAATTGAATAAACTGTATGATTTAAAAGATTATCGGGAGAGTTAC‑CTCCCGATATAAAAGGAAGGATTTACAGAATGTGACCTAAGGTCTg < 5:260563/149‑1 (MQ=255) 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aaaGATTATCGGGAGAGTTAC‑CTCCCGATATAAAAGGAAGGATTTACAGAATGTGACCTAAGGTCTGGCGTAAATGTGCACCGGAACCGAGAAGGCCCGGATTGTCATGGACGATGAGATACACCGGAATATCAGGGACTTATTCttt > 1:382139/1‑148 (MQ=255) ttttatATCGGGAG‑GTAACTCTCCCGATATAAAAGGAAGGATTTACAGAATGTGACCTAAGGTCTGGCGTAAATGTGCACCGGAACCGAGAAGGCCCGGATTGTCATGGACGATGAGATACACCGGAATATCATGGACATATTCtt > 6:435447/6‑146 (MQ=255) ttttatATCGGGAG‑GTAACTCTCCCGATATAAAAGGAAGGATTTACAGAATGTGACCTAAGGTCTGGCGTAAATGTGCACCGGAACCGAGAAGGCCCGGATTGTCATGGACGATGAGATACACCGGAATATCATGGACATATTCtt < 5:435447/141‑1 (MQ=255) aaGATTATCGGGAGAGTTAC‑CTCCCGATATAAAAGGAAGGATTTACAGAATGTGACCTAAGGTCTGGCGTAAATGTGCACCGGAACCGAGAAGGCCCGGATTGTCATGGACGATGAGATACACCGGAATATCATGGACATATTCTTTaa < 7:350595/149‑1 (MQ=255) aaGATTATCGGGAGAGTTAC‑CTCCCGATATAAAAGGAAGGATTTACAGAATGTGACCTAAGGTCTGGCGTAAATGTGCACCGGAACCGAGAAGGCCCGGATTGTCATGGACGATGAGATACACCGGAATATCATGGACATATTCTTTa > 8:362921/1‑148 (MQ=255) tATCGGGAG‑GTAACTCTCCCGATATAAAAGGAAGGATTTACAGAATGTGACCTAAGGTCTGGCGTAAATGTGCACCGGAACCGAGAAGGCCCGGATTGTCATGGACGATGAGATACACCGGAATATCATGGACATATTCTTTAAAgcgc > 3:310542/1‑149 (MQ=255) tCGGGAGAGTTACctcccgataatcttttaaatcatacagtttattcaatttttctttgtgtcccctcacaaggtcgacctgcgtcacacttccgtacagcgggattaa > 5:136517‑M2/1‑13 (MQ=255) tCGGGAGAGTTACctcccgataatcttttaaatcatacagtttattcaatttttctttgtgtcccctcacaaggtcgacctgcgtcacacttccgtacagcgggattaa < 6:136517‑M2/109‑97 (MQ=255) tCGGGAGAGTTAC‑CTCCCGATATAAAAGGAAGGATTTACAGAATGTGACCTAAGGTCTGGCGTAAATGTGCACCGGAACCGAGAAGGCCCGGATTGTCATGGACGATGAGATACACCGGAATATCATGGACATATTCTTTAAAGCGcc < 1:178531/148‑1 (MQ=255) gggAGAGTTAC‑CTCCCGATATAAAAGGAAGGATTTACAGAATGTGACCTAAGGTCTGGCGTAAATGTGCACCGGAACCGAGAAGGCCCGGATTGTCATGGACGATGAGATACACCGGAATATCATGGACATATTCTTTAAAGCGCCCt < 8:295549/148‑1 (MQ=255) ggAGAGTTAC‑CTCCCGATATAAAAGGAAGGATTTACAGAATGTGACCTAAGGTCTGGCGTAAATGTGCACCGGAACCGAGAAGGCCCGGATTGTCATGGACGATGAGATACACCGGAATATCATGGACATATTCTTTAAAGCGCCCtt > 2:95070/1‑148 (MQ=255) gagaGTTACctcccgataatcttttaaatcatacagtttattcaatttttctttgtgtcccctcacaaggtcgacctgcgtcacacttccgtacagcgggattaattctccagtaaatgcattatttgtctggtaacggcgatttgttt > 1:82903‑M2/1‑9 (MQ=255) aC‑CTCCCGATATAAAAGGAAGGATTTACAGAATGTGACCTAAGGTCTGGCGTAAATGTGCACCGGAACCGTGAAGGCCCGGATTGTCATGGACGATGAGATACACCGGAATATCATGGACATATTCtt < 3:188897/128‑1 (MQ=255) aC‑CTCCCGATATAAAAGGAAGGATTTACAGAATGTGACCTAAGGTCTGGCGTAAATGTGCACCGGAACCGAGAAGGCCCGGATTGTCATGGACGATGAGATACACCGGAATATCATGGACATATTCtt > 4:188897/1‑128 (MQ=255) | CAAAACAAATCGCCGTTACCAGACAAATAATGCATTTACTGGAGAATTAATCCCGCTGTACGGAAGTGTGACGCAGGTCGACCTTGTGAGGGGACACAAAGAAAAATTGAATAAACTGTATGATTTAAAAGATTATCGGGAGAGTTAC‑CTCCCGATATAAAAGGAAGGATTTACAGAATGTGACCTAAGGTCTGGCGTAAATGTGCACCGGAACCGAGAAGGCCCGGATTGTCATGGACGATGAGATACACCGGAATATCATGGACATATTCTTTAAAGCGCCCTTT > NC_000913/2508291‑2508577 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |