New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_000913 | 3698459 = | 93 (0.990) | 4 (0.040) | 4/242 | NT | 4.2% | coding (246/1680 nt) | bcsG | DUF3260 family cellulose production inner membrane protein |
? | NC_000913 | 3698508 = | 92 (1.030) | coding (295/1680 nt) | bcsG | DUF3260 family cellulose production inner membrane protein | |||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 118 total aligned reads displayed.
GTTTGCCGCGTTTCTGCTGATGCCCCTTCCGCGCTACAGCCTGCATCGCTTGCGCCACTGGATTGCCCTGCCGATCGGCTTTGCTTTGTTCTGGCATGACACCTGGTTGCCTGGCCCGGAAAGCATAATGAGCCAGGGTTCGCAGGTGGCGGGGTTCAGTACCGATTATTTAATCGACCTTGTCACACGCTTTATTAACTGGCAGATGATTGGGGCCATTTTTGTTTTATTAGTGGCCTGGTTATTCCTGTCACAATGGATTCGCATTACCGTTTTTGTGGTTGCCATACTGCTAT > NC_000913/3698360‑3698655 | gtTTGCCGCGTTTCTGCTGATGCCCCTTCCGCGCTACAGCCTGCATCGCTTGCGCCACTGGATTGCCCTGCCGATCGGCTTTGCTTTGTTCTGGCATGACACCTGGTTGCCTGGCCCGGAAAGCATAATGAGCCAGGGTTCGCAGGTgg > 2:401974/1‑149 (MQ=255) gtTTGCCGCGTTTCTGCTGATGCCCCTTCCGCGCTACAGCCTGCATCGCTAGCGCCACTGGATTGCCCTGCCGATCGGCTTTGCTTTGTTCTGGCATGACACCTGGTTGCCTGGCCCGGAAAGCATAATGAGCCAGGGTTCGCAGGTgg > 6:186933/1‑149 (MQ=255) gaataaccaggccactaataaaacaaaaatggccccaatcatctgccagttaataaagcgtgtgacaaggtcgattaaataatcggtactgaaccccgcCACCTGGTTGCCTGGCCCGGAAAGCATAATGAGCCAGGGTTCGCAGGTgg < 1:365310‑M1/50‑1 (MQ=255) ccGCGTTTCTGCTGATGCCCCTTCCGCGCTACAGCCTGCATCGCTTGCGCCACTGGATTGCCCTGCCGATCGGCTTTGCTTTGTTCTGGCATGACACCTGGTTGCCTGGCCCGGAAAGCATAATGAGCCAGGGTTCGCAGGTGGCggg < 6:10981/148‑1 (MQ=255) accaggccactaataaaacaaaaatggccccaatcatctgccagttaataaagcgtgtgacaaggtcgattaaataatcggtactgaaccccgcCACCTGGTTGCCTGGCCCGGAAAGCATAATGAGCCAGGGTTCGCAGGTGGCggg > 8:474441‑M1/95‑148 (MQ=255) cgcgTTTCTGCTGATGCCCCTTCCGCGCTACAGCCTGCATCGCTTGCGCCACTGGATTGCCCTGCCGATCGGCTTTGCTTTGTTCTGGCATGACACCTGGTTGCCTGGCCCGGAAAGCATAATGAGCCAGGGTTCGCAGGTGGCGGGGt > 2:149685/1‑149 (MQ=255) gcgTTTCTGCTGATGCCCCTTCCGCGCTACAGCCTGCATCGCTTGCGCCACTGGATTGCCCTGCCGATCGGCTTTGCTTTGTTCTGGCATGACACCTGGTTGCCTGGCCCGGAAAGCATAATGAGCCAGGGTTCGCAGGTGGCGGGGtt > 2:289480/1‑149 (MQ=255) ggccactaataaaacaaaaatggccccaatcatctgccagttaataaagcgtgtgacaaggtcgattaaataatcggtactgaaccccgcCACCTGGTTGCCTGGCCCGGAAAGCATAATGAGCCAGGGTTCGCAGGTGGCGGGGTTCa > 2:365310‑M1/91‑149 (MQ=255) gTTTCTGCTGATGCCCCTTCCGCGCTACAGCCTGCATCGCTTGCGCCACTGGATTGCCCTGCCGATCGGCTTTGCTTTGTTCTGGCATGACACCTGGTTGCCTGGCCCGGAAAGCATAATGAGCCAGGGTTCGCAGGTGGCGGGGTTCa < 7:178421/149‑1 (MQ=255) gctgATGCCCCTTCCGCGCTACAGCCTGCATCGCTTGCGCCACTGGATTGCCCTGCCGATCGGCTTTGCTTTGTTCTGGCATGACACCTGGTTGCCTGGCCCGGAAAGCATAATGAGCCAGGGTTCGCAGGTGGCGGGGTTCAGTAcc > 6:255905/1‑148 (MQ=255) ctgATGCCCCTTCCGCGCTACAGCCTGCATCGCTTGCGCCACTGGATTGCCCTGCCGATCGGCTTTGCTTTGTTCTGGCATGACACCTGGTTGCCTGGCCCGGAAAGCCTAATGAGCCAGGGTTCGCAGGTGGCGGGGTTCAGTAc < 1:43292/146‑1 (MQ=255) gCCCCTTCCGCGCTACAGCCTGCATCGCTTGCGCCACTGGATTGCCCTGCCGATCGGCTTTGCTTTGTTCTGGCATGACACCTGGTTGCCTGGCCCGGAAAGCATAATGAGCCAGGGTTCGCAGGTGGCGGGGTTCAGTACCGattatt > 4:206170/1‑149 (MQ=255) cccTTCCGCGCTACAGCCTGCATCGCTTGCGCCACTGGATTGCCCTGCCGATCGGCTTTGCTTTGTTCTGGCATGACACCTGGTTGCCTGGCCCGGAAAGCATAATGAGCCAGGGTTCGCAGGTGGCGGGGTTCAGTACCGATTAttt > 3:205055/1‑148 (MQ=255) ccTTCCGCGCTACAGCCTGCATCGCTTGCGCCACTGGATTGCCCTGCCGATCGGCTTTGCTTTGTTCTGGCATGACACCTGGTTGCCTGGCCCGGAAAGCATAATGAGCCAGGGTTCGCAGGTGGCGGGGtt < 4:389182/132‑1 (MQ=255) ccTTCCGCGCTACAGCCTGCATCGCTTGCGCCACTGGATTGCCCTGCCGATCGGCTTTGCTTTGTTCTGGCATGACACCTGGTTGCCTGGCCCGGAAAGCATAATGAGCCAGGGTTCGCAGGTGGCGGGGtt > 3:389182/1‑132 (MQ=255) ccTTCCGCGCTACAGCCTGCATCGCTTGCGCCACTGGATTGCCCTGCCGATCGGCTTTGCTTTGTTCTGGCATGACACCTGGTTGCCTGGCCCGGAAAGCATAATGAGCCAGGGTTCGCAGGTGGCGGGGTTCAGTACCGATTATTTaa > 6:159113/1‑149 (MQ=255) ccTTCCGCGCTACAGCCTGCATCGCTTGCGCCACTGGATTGCCCTGCCGATCGGCTTTGCTTTGTTCTGGCATGACACCTGGTTGCCTGGCCCGGAAAGCATAATGAGCCAGGGTTCGCAGGTGGCGGGGTTCAGTACCGATTATTTaa > 5:376913/1‑149 (MQ=255) cTTCCGCGCTACAGCCTGCATCGCTTGCGCCACTGGATTGCCCTGCCGATCGGCTTTGCTTTGTTCTGGCATGACACCTGGTTGCCTGGCCCGGAAAGCATAATGAGCCAGGGTTCGCAGGTGGCGGGGTTCAGTACCGATTATTTAAt > 5:430574/1‑149 (MQ=255) gcgcTACAGCCTGCATCGCTTGCGCCACTGGATTGCCCTGCCGATCGGCTTTGCTTTGTTCTGGCATGACACCTGGTTGCCTGGCCCGGAAAGCATAATGAGCCAGGGTTCGCAGGTGGCGGGGTTCAGTACCGATTATTTAATCGAcc > 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ttGCGCCACTGGATTGCCCTGCCGATCGGCTTTGCTTTGTTCTGGCATGACACCTGGTTGCCTGGCCCGGAAAGCATAATGAGCCAGGGTTCGCAGGTGGCGGGGTTCAGTACCGATTATTTAATCGACCTTGTCACACGCTTTATTaa > 5:209421/1‑149 (MQ=255) ttGCGCCACTGGATTGCCCTGCCGATCGGCTTTGCTTTGTTCTGGCATGACACCTGGTTGCCTGGCCCGGAAAGCATAATGAGCCAGGGTTCGCAGGTGGCGGGGTTCAGTACCGATTATTTAATCGACCTTGTCACACGCTTTATTaa > 3:129465/1‑149 (MQ=255) cgcCACTGGATTGCCCTGCCGATCGGCTTTGCTTTGTTCTGGCATGACACCTGGTTGCCTGGCCCGGAAAGCATAATGAGCCAGGGTTCGCAGGTGGCGGGGTTCAGTACCGATTATTTAATCGACCTTGTCACACGCTTTATTAACt < 5:186933/148‑1 (MQ=255) gcCACTGGATTGCCCTGCCGATCGGCTTTGCTTTGTTCTGGCATGACACCTGGTTGCCTGGCCCGGAAAGCATAATGAGCCAGGGTTCGCAGGTGGCGGGGTTCAGTACCGATTATTTAATCGACCTTGTCACACGCTTTATTAACTgg > 8:6625/1‑149 (MQ=255) cTGGATTGCCCTGCCGATCGGCTTTGCTTTGTTCTGGCATGACACCTGGTTGCCTGGCCCGGAAAGCATAATGAGCCAGGGTTCGCAGGTGGCGGGGTTCAGTACCGATTATTTAATCGACCTTGTCACACGCTTTATTAACTGGCAga < 3:357884/149‑1 (MQ=255) 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tGGCATGACACCTGGTTGCCTGGCCCGGAAAGCATAATGAGCCAGGGTTCGCAGGGGGCGGGGTTCAGTACCGAGTATTTAATCGCCCTTGGCACACGCTTTATTAACTGGCAGATGATTGGGGCCTTTTTTGGTTGAGTAgagatcgg > 2:427618/1‑142 (MQ=255) gCATGACACCTGGTTGCCTGGCCCGGAAAGCATAATGAGCCAGGGTTCGCAGGTGGCGGGGTTCAGTACCGATTTTTTAATCGACCTTGTCCCACGCTTTATTAACTGGCAGATGATTGGGGCCATTTTTGTTTTATTAGTTGCCTGGt > 2:115954/1‑149 (MQ=255) gCATGACACCTGGTTGCCTGGCCCGGAAAGCATAATGAGCCAGGGTTCGCAGGTGGCGGGGTTCAGTACCGATTATTTAATCGACCTTGTCACACGCTTTATTAACTGGCAGATGATTGGGGCCATTTTTGTTTTATTAGTGGCCt < 6:209421/146‑1 (MQ=255) cccgccacctgcgaaccctggctcattatgctttccgggccaggcaaccaggtgGCGGGGTTCAGTACCGATTATTTAATCGACCTTGTCACACGCTTTATTAACTGGCAGATGATTGGGGCCATTTTTGTTTTATTAGTGGCCTGGt > 8:474441‑M2/55‑148 (MQ=255) aTGACACCTGGTTGCCTGGCCCGGAAAGCATAATGAGCCAGGGTTCGCAGGTGGCGGGGTTCAGTACCGATTATTTAATCGACCTTGTCACACGCTTTATTAACTGGCAGATGAtt < 2:294714/116‑1 (MQ=255) aTGACACCTGGTTGCCTGGCCCGGAAAGCATAATGAGCCAGGGTTCGCAGGTGGCGGGGTTCAGTACCGATTATTTAATCGACCTTGTCACACGCTTTATTAACTGGCAGATGAtt > 1:294714/1‑116 (MQ=255) 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cccGGAAAGCATAATGAGCCAGGGTGCGCAGGGGGCGGGGTGCAGTACCGATTATTTAATCGACCTTGGCACACGCTTTATTAACTGGCAGATGATTGGGGCCATTTTTGTTTTATTAGTGGCCTGGTTATTCCTGTCACAATGGATTc < 7:360046/149‑1 (MQ=255) ccGGAAAGCATAATGAGCCAGGGTTCGCAGGTGGCGGGGTTCAGTACCGATTATTTAATCGACCTTGTCACACGCTTTATTAACTGGCAGATGATTGGGGCCATTTTTGTTTTATTAGTGGCCTGGTTATTCCTGTCACAATGGATTCg > 7:384464/1‑149 (MQ=255) cGGAAAGCATAATGAGCCAGGGTTCGCAGGTGGCGGGGTTCAGTACCGATTATTTAATCGACCTTGTCACACGCTTTATTAACTGGCAGATGATTGGGGCCATTTTTGTTTTATTAGTGGCCTGGTTATTCCTGTCACAATGGATTCg > 1:97846/1‑148 (MQ=255) cGGAAAGCATAATGAGCCAGGGTTCGCAGGTGGCGGGGTTCAGTACCGATTATTTAATCGACCTTGTCACACGCTTTATTAACTGGCAGATGATTGGGGCCATTTTTGTTTTATTAGTGGCCTGGTTATTCCTGTCACAATGGATTCg > 5:406532/1‑148 (MQ=255) aaaGCATAATGAGCCAGGGTTCGCAGGTGGCGGGGTTCAGTACCGATTATTTAATCGACCTTGTCACACGCTTTATTAACTGGCAGATGATTGGGGCCATTTTTGTTTTATTAGTGGCCTGGTTATTCCTGTCACAATGGATTCGCAt > 1:247732/1‑148 (MQ=255) atgctttccgggccaggcaaccaggtgGCGGGGTTCAGTACCGATTATTTAATCGACCTTGTCACACGCTTTATTAACTGGCAGATGATTGGGGCCATTTTTGTTTTATTAGTGGCCTGGTTATTCCTGTCACAATGGATTCGCATTa < 7:474441‑M2/121‑1 (MQ=255) gCATAATGAGCCAGGGTTCGCAGGTGGCGGGGTTCAGTACCGATTATTTCATCGACCTTGTCACACGCTTTATTAACTGGCAGATGATTGGGGCCATTTTTGTTTTATTAGTGGCCTGGTTATTCCTGTCACAATGGATTCGCATTAcc < 8:108540/149‑1 (MQ=255) gCATAATGAGCCAGGGTTCGCAGGTGGCGGGGTTCAGTACCGATTATTTAATCGACCTTGTCACACGCTTTATTAACTGGCAGATGATTGGGGCCATTTTTGTTTTATTAGTGGCCTGGTTATTCCTGTCACAATGGATTCGCATTAcc < 4:40241/149‑1 (MQ=255) aTAATGAGCCAGGGTTCGCAGGTGGCGGGGTTCAGTACCGATTATTTAATCGACCTTGTCACACGCTTTATTAACTGGCAGATGATTGGGGCCATTTTTGTTTTATTAGTGGCCTGGTTATTCCTGTCACAATGGATTCGCATTACCGt > 8:359360/1‑149 (MQ=255) aaTGAGCCAGGGTTCGCAGGTGGCGGGGTTCAGTACCGATTATTTAATCGACCTTGTCACACGCTTTATTAACTGGCAGATGATTGGGGCCATTTTTGTTTTATTAGTGGCCTGGTTATTCCTGTCACAATGGATTCGCATTACCGttt > 6:214201/1‑149 (MQ=255) gCCAGGGTTCGCAGGTGGCGGGGTTCAGTACCGATTATTTAATCGACCTTGTCACACGCTTTATTAACTGGCAGATGATTGGGGCCATTTTTGtt < 5:413303/95‑1 (MQ=255) gCCAGGGTTCGCAGGTGGCGGGGTTCAGTACCGATTATTTAATCGACCTTGTCACACGCTTTATTAACTGGCAGATGATTGGGGCCATTTTTGtt > 6:413303/1‑95 (MQ=255) gCCAGGGTTCGCAGGTGGCGGGGTTCAGTACCGATTATTTAATCGACCTTGTCACACGCTTTATTAACTGGCAGATGATTGGGGCCATTTTTGTTTTATTAGTGGCCTGGTTATTCCTGTCACAATGGATTCGCATTACCGTTTTtgtg < 7:6625/149‑1 (MQ=255) ccAGGGTTCGCAGGTGGCGGGGTTCAGTACCGATTATTTAATCGACCTTGTCACACGCTTTATTAACTGGCAGATGATTGGGGCCATTTTTGTTTTATTAGTGGCCTGGTTATTCCTGTCACAATGGATTCGCATTACCGTTATTGTgg > 6:232605/1‑149 (MQ=255) ggTTCGCAGGTGGCGGGGTTCAGTACCGATTATTTAATCGGCCTTGTCACACGCTTTATTAACTGGCAGATGATTGGGGCCATTTTTGTTTTATTAGTGGCCTGGTTATTCCTGTCACAATGGATTCGCATTACCGTTTTTGTGGTTGc > 7:112615/1‑149 (MQ=255) ttCGCAGGTGGCGGGGTTCAGTACCGATTATTTAATCGACCTTGTCACACGCTTTATTAACTGGCAGATGATTggg > 1:93741/1‑76 (MQ=255) ttCGCAGGTGGCGGGGTTCAGTACCGATTATTTAATCGACCTTGTCACACGCTTTATTAACTGGCAGATGATTggg < 2:93741/76‑1 (MQ=255) caggtgGCGGGGTTCAGTACCGATTATTTAATCGACCTTGTCACACGCTTTATTAACTGGCAGATGATTGGGGCCATTTTTGTTTTATTAGTGGCCTGGTTATTCCTGTCACAAt < 1:312082‑M2/109‑1 (MQ=255) caggtgGCGGGGTTCAGTACCGATTATTTAATCGACCTTGTCACACGCTTTATTAACTGGCAGATGATTGGGGCCATTTTTGTTTTATTAGTGGCCTGGTTATTCCTGTCACAAt > 2:312082‑M2/7‑115 (MQ=255) gCGGGGTTCAGTACCGATTATTTAATCGACCTTGTCACACGCTTTATTAACTGGCAGATGATTGGGGCCATTTTTGTTTTATTAGTGGCCTGGTTATTCCTGTCACAATGGATTCGCATTACCGTTTTTGTGGTTGCCATACTGCTAt < 1:350529/148‑1 (MQ=255) | GTTTGCCGCGTTTCTGCTGATGCCCCTTCCGCGCTACAGCCTGCATCGCTTGCGCCACTGGATTGCCCTGCCGATCGGCTTTGCTTTGTTCTGGCATGACACCTGGTTGCCTGGCCCGGAAAGCATAATGAGCCAGGGTTCGCAGGTGGCGGGGTTCAGTACCGATTATTTAATCGACCTTGTCACACGCTTTATTAACTGGCAGATGATTGGGGCCATTTTTGTTTTATTAGTGGCCTGGTTATTCCTGTCACAATGGATTCGCATTACCGTTTTTGTGGTTGCCATACTGCTAT > NC_000913/3698360‑3698655 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |