| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 1,530,505 | 0 | G | A | 5.7% | 385.0 / 8.5 | 123 | intergenic (+101/‑81) | ydcD/yncI | putative immunity protein for RhsE/pseudogene |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (55/61); new base A (4/3); total (59/64) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.09e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.35e-02 | |||||||||||
Only 100 of 125 total aligned reads displayed.
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |