| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 1,570,610 | 0 | G | A | 5.4% | 414.1 / 7.5 | 130 | intergenic (‑121/+35) | gadC/gadB | glutamate:gamma‑aminobutyric acid antiporter/glutamate decarboxylase B, PLP‑dependent |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (59/62); new base A (2/5); total (62/68) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.44e-01 | |||||||||||
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Only 100 of 134 total aligned reads displayed.
CTTTACCTGTCTGTACTGATGTAGCCATATTATCCCCCTAAAACGGTATTCCTGTCGGAACCGCACCTGTTTTGTTCTGAAGCGTATTCAGAACAATATTTTCCGTTGCTAATGCCAGTGAACAGACTTTGGAAATTGTCCCGAAACGGGTTCGTTTCGGGACACCGTTACCGTTAAACGTTATCAGGTATGTTTAAAGCTGTTCTGTTGGGCAATACCCTGCAGTTTCGGGTGATCGCTGAGATATTTCAGGGAGGCTTTGTAGTCTTCCAGCAACAGTTCAGCAAAGTCCATT > NC_000913/1570462‑1570756 | ttcgaaatggactttgctgaactgttgctggaagactacaaagcctccctgaaatatctcagcgatcacccgaaactgcagggtattgcccaacagaacagctttaaacatacctgataacgtttaacggtaacggTGTCCCGAAACgg < 8:102831‑M1/13‑1 (MQ=255)ttcgaaatggactttgctgaactgttgctggaagactacaaagcctccctgaaatatctcagcgatcacccgaaactgcagggtattgcccaacagaacagctttaaacatacctgataacgtttaacggtaacggTGTCCCGAAACgg < 8:388920‑M1/13‑1 (MQ=255) tttACCTGTCTGTACTGATGTAGCCATATTATCCCCCTAAAACGGTATTCCTGTCGGAACCGCACCTGTTTTGTTCTGAAGCGTATTCAGAACAATATTTTCCGTTGCTAATGCCAGTGAACAGACTTTGGAAATTGTCCCGAAACggg > 4:191480/1‑149 (MQ=255) 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GAAACGGGTTCGTTTCGGGACACCGTTACCGTTAAACGTTATCAGGTATGTTTAAAGCTGTTCTGTTGGGCAATACCCTGCAGTTTCGGGTGATCGCTGAGATATTTCAGGGAGGCTTTGTAGTCTTCCAGCAACAGTTCAGCAAAGTc < 5:440224‑M1/149‑1 (MQ=255) CGGGTTCGTTTCGGGACACCGTTACCGTTAAACGTTATCAGGTATGTTTAAAGCTGTTCTGTTGGGCAATACCCTGCAGTTTCGGGTGATCGCTGAGATATTTCAGGGAGGCTTTGTAGTCTTCCAGCAACAGTTCAGCAAAGTCCAtt > 5:326249‑M1/1‑149 (MQ=255) | CTTTACCTGTCTGTACTGATGTAGCCATATTATCCCCCTAAAACGGTATTCCTGTCGGAACCGCACCTGTTTTGTTCTGAAGCGTATTCAGAACAATATTTTCCGTTGCTAATGCCAGTGAACAGACTTTGGAAATTGTCCCGAAACGGGTTCGTTTCGGGACACCGTTACCGTTAAACGTTATCAGGTATGTTTAAAGCTGTTCTGTTGGGCAATACCCTGCAGTTTCGGGTGATCGCTGAGATATTTCAGGGAGGCTTTGTAGTCTTCCAGCAACAGTTCAGCAAAGTCCATT > NC_000913/1570462‑1570756 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |