Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
JC JC | NC_000913 | 169,091 | IS2 (–) +5 bp | 55.7% | coding (1608‑1612/2244 nt) | fhuA → | ferrichrome outer membrane transporter |
New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 169091 = | 41 (0.400) | 55 (0.510) | 44/260 | NT | 56.3% | coding (1608/2244 nt) | fhuA | ferrichrome outer membrane transporter |
? | NC_000913 | 381260 = | NA (NA) | noncoding (1/1331 nt) | IS2 | repeat region | |||||
* | ? | NC_000913 | = 169095 | 41 (0.400) | 48 (0.450) | 42/260 | NT | 52.9% | coding (1612/2244 nt) | fhuA | ferrichrome outer membrane transporter |
? | NC_000913 | = 382590 | NA (NA) | noncoding (1331/1331 nt) | IS2 | repeat region |
ATCAAGAATCTCTTAACCGCGTTGCCGGGACGACCGATAAACGTGATGACAAACAGTTTACCTGGCGTGGTGGTGTTAACTACCTGTTTGATAATGGTGTAACACCTTACTTCAGCTATAGCGAATCGTTTGAACCTTCTTCGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/168952‑169095 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTG < NC_000913/382590‑382443 ATCAAGAATCTCTTAACCGCGTTGCCGGGACGACCGATAAACGTGATGACAAACAGTTTACCTGGCGTGGTGGTGTTAACTACCTGTTTGATAATGGTGTAACACCTTACTTCAGCTATAGCGAATCGTTTGAACCTTCTTCGCTGGAT > 3:69647/1‑149 TCAAGAATCTCTTAACCGCGTTGCCGGGACGACCGATAAACGTGATGACAAACAGTTTACCTGGCGTGGTGGTGTTAACTACCTGTTTGATAATGGTGTAACACCTTACTTCAGCTATAGCGAATCGTTTGAACCTTCTTCGCTGGATT > 6:208364/1‑149 AAGAATCTCTTAACCGCGTTGCCGGGACGACCGATAAACGTGATGACAAACAGTTTACCTGGCGTGGTGGTGTTAACTACCTGTTTGATAATGGTGTAACACCTTACTTCAGCTATAGCGAATCGTTTGAACCTTCTTCGCTGGATTTG > 3:164562/1‑149 ATCTCTTAACCGCGTTGCCGGGACGACCGATAAACGTGATGACAAACAGTTTACCTGGCGTGGTGGTGTTAACTACCTGTTTGATAATGGTGTAACACCTTACTTCAGCTATAGCGAATCGTTTGAACCTTCTTCGCTGGATTTGCCCC < 4:87976/149‑1 CTTAACCGCGTTGCCGGGACGACCGATAAACGTGATGACAAACAGTTTACCTGGCGTGGTGGTGTTAACTACCTGTTTGATAATGGTGTAACACCTTACTTCAGCTATAGCGAATCGTTTGAACCTTCTTCGCTGGATTTGCCCCTATA > 3:417763/1‑149 GCGTTGCCGGGACGACCGATAAACGTGATGACAAACAGTTTACCTGGCGTGGTGGTGTTAACTACCTGTTTGATAATGGTGTAACACCTTACTTCAGCTATAGCGAATCGTTTGAACCTTCTTCGCTGGATTTGCCCCTATATTTC > 2:243959/1‑146 GCCGGGACGACCGATAAACGTGATGACAAACAGTTTACCTGGCGTGGTGGTGTTAACTACGTGTTTGATAATGGTGTAACACCTTACTTCAGCTATAGCGAATCGTTTGAACCTTCTTCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACAT < 1:324808/148‑1 CCGGGACGACCGATAAACGTGATGACAAACAGTTTACCTGGCGTGGTGGTGTTAACTACCTGTTTGATAATGGTGTAACACCTTACTTCAGCTATAGCGAATCGTTTGAACCTTCTTCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCT < 4:417763/149‑1 GGACGACCGATAAACGTGATGACAAACAGTTTACCTGGCGTGGTGGTGTTAACTACCTGTTTGATAATGGTGTAACACCTTACTTCAGCTATAGCGAATCGTTTGAACCTTCTTCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTT < 4:214937/149‑1 CGTGATGACAAACAGTTTACCTGGCGTGGTGGTGTTAACTACCTGTTTGATAATGGTGTAACACCTTACTTCAGCTATAGCGAATCGTTTGAACCTTCTTCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCAT < 1:381890/149‑1 GTGATGACAAACAGTTTACCTGGCGTGGTGGTGTTAACTACCTGTTTGATAATGGTGTAACACCTTACTTCAGCTATAGCGAATCGTTTGAACCTTCTTCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATT < 4:69647/149‑1 ATGACAAACAGTTTACCTGGCGTGGTGGTGTTAACTACCTGTTTGATAATGGTGTAACACCTTACTTCAGCTATAGCGAATCGTTTGAACCTTCTTCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTAC < 4:164562/148‑1 TGACAAACAGTTTACCTGGCGTGGTGGTGTTAACTACCTGTTTGATAATGGTGTAACACCTTACTTCAGCTATAGCGAATCGTTTGAACCTTCTTCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAA < 5:208364/149‑1 TGACAAACAGTTTACCTGGCGTGGTGGTGTTAACTACCTGTTTGATAATGGTGTAACACCTTACTTCAGCTATAGCGAATCGTTTGAACCTTCTTCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTAC > 7:227705/1‑147 AAACAGTTTACCTGGCGTGGTGGTGTTAACTACCTGTTTGATAATGGTGTAACACCTTACTTCAGCTATAGCGAATCGTTTGAACCTTCTTCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCC > 7:378213/1‑149 AAACAGTTTACCTGGCGTGGTGGTGTTAACTACCTGTTTGATAATGGTGTAACACCTTACTTCAGCTATAGCGAATCGTTTGAACCTTCTTCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCC > 6:131429/1‑149 TACCTGGCGTGGTGGTGTTAACTACCTGTTTGATAATGGTGTAACACCTTACTTCAGCTATAGCGAATCGTTTGAACCTTCTTCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCG < 7:145311/148‑1 CCTGGCGTGGTGGTGTTAACTACCTGTTTGATAATGGTGTAACACCTTACTTCAGCTATAGCGAATCGTTTGAACCTTCTTCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCAC < 2:89659/121‑1 CCTGGCGTGGTGGTGTTAACTACCTGTTTGATAATGGTGTAACACCTTACTTCAGCTATAGCGAATCGTTTGAACCTTCTTCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCAC > 1:89659/1‑121 CTGGCGTGGTGGTGTTAACTACCTGTTTGATAATGGTGTAACACCTTACTTCAGCTATAGCGAATCGTTTGAACCTTCTTCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCG > 2:295241/1‑145 TGTTAACTACCTGTTTGATAATGGTGTAACACCTTACTTCAGCTATAGCGAATCGTTTGAACCTTCTTCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGC < 5:469152/149‑1 TTAACTACCTGTTTGATAATGGTGTAACACCTTACTTCAGCTATAGCGAATCGTTTGAACCTTCTTCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGC > 2:242858/1‑147 CCTGTTTGATAATGGTGTAACACCTTACTTCAGCTATAGCGAATCGTTTGAACCTTCTTCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCTATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAA < 1:243959/149‑1 CTGTTTGATAATGGTGTAACACCTTACTTCAGCTATAGCGAATCGTTTGAACCTTCTTCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAAC > 1:482166/1‑149 CTGTTTGATAATGGTGTAACACCTTACTTCAGCTATAGCGAATCGTTTGAACCTTCTTCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATA < 7:326483/129‑1 CTGTTTGATAATGGTGTAACACCTTACTTCAGCTATAGCGAATCGTTTGAACCTTCTTCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATA > 8:326483/1‑129 CTGTTTGATAATGGTGTAACACCTTACTTCAGCTATAGCGAATCGTTTGAACCTTCTTCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCA < 8:209332/83‑1 GATAATGGTGTAACACCTTACTTCAGCTATAGCGAATCGTTTGAACCTTCTTAGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAATCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCG > 8:10522/1‑149 TAACACCTTACTTCAGCTATAGCGAATCGTTTGAACCTTCTTCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCG > 4:290390/1‑148 TAACACCTTACTTCAGCTATAGCGAATCGTTTGAACCTTCTTCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCG < 8:477460/128‑1 TAACACCTTACTTCAGCTATAGCGAATCGTTTGAACCTTCTTCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCG > 7:477460/1‑128 ACACCTTACTTCAGCTATAGCGAATCGTTTGAACCTTCTTCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGCCATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGACGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGAT > 5:181768/1‑149 CCTTACTTCAGCTATAGCGAATCGTTTGAACCTTCTTCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCATCGCACTATGCGGATGC > 5:247149/1‑148 CTTACTTCAGCTATAGCGAATCGTTTGAACCTTCTTCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCA > 8:239531/1‑149 AGCTATAGCGAATCGTTTGAACCTTCTTCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTA < 8:227705/148‑1 CTATAGCGAATCGTTTGAACCTTCTTCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAA < 2:482166/149‑1 AATCGTTTGAACCTTCTTCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAA > 8:418148/1‑149 ATCGTTTGAACCTTCTTCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAAC > 5:426251/1‑149 ATCGTTTGAACCTTCTTCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAAC < 1:242858/149‑1 GTTTGAACCTTCTTCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCC > 2:52915/1‑149 TTTGAACCTTCTTCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTACCCCATTACAAGCACGCTGCAGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCAATCGTTATAATGGTCGAACGCCT > 1:408382/1‑149 TTTGAACCTTCTTCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCT < 7:418148/149‑1 TTTGAACCTTCTTCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCT < 7:10522/149‑1 TTTGAACCTTCTTCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATG > 4:221349/1‑123 TTTGAACCTTCTTCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATG < 3:221349/123‑1 TTTGAACCTTCTTCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCA > 4:106498/1‑107 TTTGAACCTTCTTCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCA < 3:106498/107‑1 CTTCTTCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAG > 4:195135/1‑149 TCTTCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGT > 4:292369/1‑149 TTCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTC > 2:83689/1‑149 GCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTACCCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTT > 1:271046/1‑149 GCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTT < 8:202065/149‑1 GCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTT < 1:83689/148‑1 GCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTT < 2:450434/148‑1 CTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCTAGAGATACCCCAGCGCACTGTGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTG > 2:143525/1‑149 CTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGTTGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTG > 4:151528/1‑149 CTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGAAATCTGATAAAACTTCACCCATTACAAGCCAGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTAAGCGGATTCCATTCGTTATAATGCTCTAACCCATCTGCAAGGTTCTTTG > 2:46444/1‑149 ATCAAGAATCTCTTAACCGCGTTGCCGGGACGACCGATAAACGTGATGACAAACAGTTTACCTGGCGTGGTGGTGTTAACTACCTGTTTGATAATGGTGTAACACCTTACTTCAGCTATAGCGAATCGTTTGAACCTTCTTCGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/168952‑169095 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTG < NC_000913/382590‑382443 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |