| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | NC_000913 | = 859197 | 76 (0.760) | intergenic (‑136/+16) | ybiU/ybiV | DUF1479 family protein/sugar phosphatase; fructose‑1‑P/ribose‑5‑P/glucose‑6‑P phosphatase | |||||
Only 100 of 104 total aligned reads displayed.
GTAAAAGTAGAAGCCATAACCACCTCTCATTAACTTTCATTCGAAACCATTCTGATTTGCATGTGACAATATAAGTTATAAATAAGTTAATGCAAGTTTAATGATTTGATGTGATGTACAGGATGTAAAAAGAAGGGAAAACCGGAGCGCACGGCTCCGGTAGAGAGGTCAGCTGTTAAAAGGGGATGTGTTATCCAGCACCGCCTGAATCACATTCAGCGCGCCTTCATGATTATTATCATCGGTAGCGTAACGGGCGATTTGTTTAATGTTTTCCGCAGCATTGCCCATCG > NC_000913/859045‑859337 | gTAAAAGTAGAAGCCATAACCACCTCTCATTAACTTTCATTCGAAACCATTCTGATTTGCATGTGACAATATAAGTTATAAATAAGTTAATGCAAGTTTAATGATTTGATGTGATGTACAGGATGTATAAAGAAGGGAAAACCGGAgcg > 6:480769/1‑149 (MQ=255)gTAAAAGTAGAAGCCATAACCACCTCTCATTAACTTTCATTCGAAACCATTCTGATTTGCATGTGACAATATAAGTTATAAATAAGTTAATGCAAGTTTAATGATTTGATGTGATGTACAGGATGTAAAAAGAAGGGAAAACCGGAgcg > 1:248997/1‑149 (MQ=255) aaaaGTAGAAGCCATAACCACCTCTCATTAACTTTCATTCGAAACCATTCTGATTTGCATGTGACAATATAAGTTATAAATAAGTTAATGCAAGTTTAATGATTTGATGTGATGTACAGGATGTAAAAAGAAGGGAAAACCGGAGCcgt > 7:383407‑M1/1‑146 (MQ=255) 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accaccTCTCATTAACTTTCATTCGAAACCATTCTGATTTGCATGTGACAATATAAGTTATAAATAAGTTAATGCAAGTTTAATGATTTGATGTGATGTACAGGATGTAAAAAGAAGGGAAAACCGGAGCGCACGGCTCCGGTagagag < 2:456877/149‑1 (MQ=255) accaccTCTCATTAACTTTCATTCGAAACCATTCTGATTTGCATGTGACAATATAAGTTATAAATAAGTTAATGCAAGTTTAATGATTTGATGTGATGTACAGGATGTAAAAAGAAGGGAAAACCGGAGCGCACGGCTCCGGTagagag < 6:152778/149‑1 (MQ=255) ccaccTCTCATTAACTTTCATTCGAAACCATTCTGATTTGCATGTGACAATATAAGTTATAAATAAGTTAATGCAAGTTTAATGATTTGATGTGATGTACAGGATGTAAAAAGAAGGGAAAACCGGAGCGCACGGCTCCGGTAGAGAgg > 5:203648/1‑149 (MQ=255) caccTCTCATTAACTTTCATTCGAAACCATTCTGATTTGCATGTGACAATATAAGTTATAAATAAGTTAATGCAAGTTTAATGATTTGATGTGATGTACAGGATGTAAAAAGAAGGGAAAACCGGAGCGCACGGCTCCGGTAGAGAGGt > 7:48102/1‑149 (MQ=255) tctcATTAACTTTCATTCGAAACCATTCTGATTTGCATGTGACAATATAAGTTATAAATAAGTTAATGCAAGTTTAATGATTTGATGTGATGTACAGGATGTAAAAAGAAGGGAAAACCGGAGCGCACGGCTCCGGTAGAGAGGTCAGc > 4:237129/1‑149 (MQ=255) 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ccGGAGCcgtgcgctccggttttcccttctttttacatcctgtacatcacatcaaatcattaaacttgcattaacttatttataacttatattgtcacatgcaaatcagaatggtttcgaatgaaagttaatgagaggtggttatggct < 3:384232‑M1/149‑143 (MQ=255) ccGGAGCcgtgcgctccggttttcccttctttttacatcctgtacatcacatcaaatcattaaacttgcattaacttatttataacttatattgtcacatgcaaatcagaatggtttcgaatgaaagttaatgagaggtggttatggc < 7:339270‑M1/148‑142 (MQ=255) ccGGAGCcgtgcgctccggttttcccttctttttacatcctgtacatcacatcaaatcattaaacttgcattaacttatttataacttatattgtcacatgcaaatcagaatggtt < 7:35482‑M1/116‑110 (MQ=255) ccGGAGCcgtgcgctccggttttcccttctttttacatcctgtacatcacatcaaatcattaaacttgcattaacttatttataacttatattgtcacatgcaaatcagaatggtt > 8:35482‑M1/1‑7 (MQ=255) ccGGAGCcgtgcgctccggttttcccttcattttacatcctgtacatcacatcaaatcattaaacttgcattaacttatttataacttatattgtcacatgcaaatcagaatggtttcgaatgaaa < 4:7989‑M1/126‑120 (MQ=255) cGGAGCGCACGGCTCCGGTAGAGAGGTCAGCTGTTAAAAGGGGATGTGTTATCCAGCACCGCCTGAATCACATTCAGCGCGCCTTCATGATTATTATCATCGGTAGCGTAACGGGCGATTTGTTTAATGTTTTCCGCAGCATTGCCCAt < 2:259876/149‑1 (MQ=255) ggAGCGCACGGCTCCGGTAGAGAGGTCAGCTGTTAAAAGGGGATGTGTTATCCAGCACCGCCTGAATCACATTCAGCGCGCCTTCATGATTATTATCATCGGTAGCGTAACGGGCGATTTGTTTAATGTTTTCCGCAGCATTGCCCATc < 6:113984/149‑1 (MQ=255) ggAGCGCACGGCTCCGGTAGAGAGGTCAGCTGTTAAAAGGGGATGTGTTATCCAGCACCGCCTGAATCACATTCAGCGCGCCTTCATGATTATTATCATCGGTAGCGTAACGGGCGATTTGTTTAATGTTTTCCGCAGCATTGCCCATc < 2:248997/149‑1 (MQ=255) gAGCGCACGGCTCCGGTAGAGAGGTCAGCTGTTAAAAGGGGATGTGTTATCCAGCAACGCCTGAATCACATTCAGCGCGCCTTCATGATTATTATCATCGGTAGCGTAACGGGCGATTTGTTTAATGTTTTCCGCAGCATTGCCCATCg < 6:254370/149‑1 (MQ=255) ccgtgcgctccgggtttcccttctttttacatcctgtacatcacatcaaatcattaaacttgcattaacttatttataacttatattgtcacatgcaaatcagaatggtttcgaatgaaagttaat < 1:436217‑M1/126‑126 (MQ=255) | GTAAAAGTAGAAGCCATAACCACCTCTCATTAACTTTCATTCGAAACCATTCTGATTTGCATGTGACAATATAAGTTATAAATAAGTTAATGCAAGTTTAATGATTTGATGTGATGTACAGGATGTAAAAAGAAGGGAAAACCGGAGCGCACGGCTCCGGTAGAGAGGTCAGCTGTTAAAAGGGGATGTGTTATCCAGCACCGCCTGAATCACATTCAGCGCGCCTTCATGATTATTATCATCGGTAGCGTAACGGGCGATTTGTTTAATGTTTTCCGCAGCATTGCCCATCG > NC_000913/859045‑859337 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |