| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 946,028 | G→A | 5.5% | G53D (GGC→GAC) | ycaD → | putative MFS transporter, inner membrane protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 946,028 | 0 | G | A | 5.5% | 225.2 / 2.3 | 72 | G53D (GGC→GAC) | ycaD | putative MFS transporter, inner membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (40/28); new base A (2/2); total (42/30) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.01e-01 | |||||||||||
CCCAGCCTGTCATGCTTTTGCTGTCTGGCCTGCTTTTGTTGACTCTGGCGATTGCGGTGTTAAATACACTCGTGCCGCTTTGGCTCGCCCAGGAACACATGTCCACATGGCAGGTAGGCGTTGTCAGCTCATCCTATTTTACCGGCAACCTTGTCGGTACATTGCTGACAGGGTATGTCATTAAGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGCCTCCTTCATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGTTGGCTTGGCGTTT > NC_000913/945884‑946175 | cccAGCCTGTCATGCTTTTGCTGTCTGGCCTGCTTTTGTTGACTCTGGCGATTGCGGTGTTAAATACACTCTTGCCGCTTTGGCTCGCCCAGGAACACATGTCCACATGGCAGGTAGGCGTTGTCAGCTCATCCTATTTTACCGGCAAc > 6:444059/1‑149 (MQ=255)cccAGCCTGTCATGCTTTTGCTGTCTGGCCTGCTTTTGTTGACTCTGGCGATTGCGGTGTTAAATACACTCGTGCCGCTTTGGCTCGCCCAGGAACACATGTCCACATGGCAGGTAGGCGTTGTCAGCTCATCCTATTTTACCGGCaa < 1:250985/148‑1 (MQ=255)cccAGCCTGTCATGCTTTTGCTGTCTGGCCTGCTTTTGTTGACTCTGGCGATTGCGGTGTTAAATACACTCGTGCCGCTTTGGCTCGCCCAGGAACACATGTCCACATGGCAGGTAGGCGTTGTCAGCTCATCCTATTTTACCGGCAAc > 4:129604/1‑149 (MQ=255) ccAGCCTGTCATGCTTTTGCTGTATGGCCTGCTTTTGTTGACTCTGGCGATTGCGGTGTTAAATACACTCGTGCCGCTTTGGCTCGCCCAGGAACACATGTCCACATGGCAGGTAGGCGTTGTCAGCTCATCCTATTTTACCGGCAAcc > 8:139105/1‑149 (MQ=255) cTGTCATGCTTTTGCTGTCTGGCCTGCTTTTGTTGACTCTGGCGATTGCGGTGTTAAATACACTCGTGCCGCTTTGGCTCGCCCAGGAACACATGTCCACATGGCAGGTAGGCGTTGTCAGCTCATCCTATTTTACCGGCAACCTTGTc < 3:129604/149‑1 (MQ=255) tCATGCTTTTGCTGTCTGGCCTGCTTTTGTTGACTCTGGCGATTGCGGTGTTAAATACACTCGTGCCGCTTTGGCTCGCCCAGGAACACATGTCCACATGGCAGGTAGGCGTTGTCAGCTCATCCTATTTTACCGGCAACCTTGTCgg > 2:323960/1‑148 (MQ=255) tCATGCTTTTGCTGTCTGGCCTGCTTTTGTTGACTCTGGCGATTGCGGTGTTAAATACACTCGTGCCGCTTTGGCTCGCCCAGGAACACATGTCCACATGGCAGGTAGGCGTTGTCAGCTCATCCTATTTTACCGGCAACCTTGTCgg > 5:259780/1‑148 (MQ=255) gCTGTCTGGCCTGCTTTTGTTGACTCTGGCGATTGCGGTGTTAAATACACTCGTGCCGCTTTGGCTCGCCCAGGAACACATGTCCACATGGCAGGTAGGCGTTGTCAGCTCATCCTATTTTACCGGCAACCTTGTCGGTACATTGCTGa > 2:151419/1‑149 (MQ=255) gCTGTCTGGCCTGCTTTTGTTGACTCTGGCGATTGCGGTGTTAAATACACTCGTGCCGCTTTGGCTCGCACAGGCCCACATGTCCACATGGCAGTTAGGCGTTGTCAGATCATCCTATTTTACCGGCAACCTTGTCGGTACATTGCTGa > 5:302330/1‑149 (MQ=255) cTGTCTGGCCTGCTTTTGTTGACTCGGGCGATTGCGGTGTTAAATACACTCGTGCCGCTTTGGCTCGCCCAGGAACACATGTCCACATGGCAGGTAGGCGTTGTCAGCTCATCGTATTTTACCGGCACCCTTGTCGGTACATTGCTGa > 4:284551/1‑148 (MQ=255) gTCTGGCCTGCTTTTGTTGACTCTGGCGATTGCGGTGTTAAATACACTCGTGCCGCTTTGGCTCGCCCAGGAACACATGTCCACATGGCAGGTAGGCGTTGTCAGCTCATCCTATTTTACCGACAAGGTTGCCGGTaaaata > 6:291286/1‑137 (MQ=255) gTCTGGCCTGCTTTTGTTGACTCTGGCGATTGCGGTGTTAAATACACTCGTGCCGCTTTGGCTCGCCCAGGAACACATGTCCACATGGCAGGTAGGCGTTGTCAGCTCATCCTATTTTACCGACAAGGTTGCCGGTaaaata < 5:291286/142‑6 (MQ=255) tCTGGCCTGCTTTTGTTGACTCTGGCGATTGCGGTGTTAAATACACTCGTGCCGCTTTGGCTCGCCCAGGAACACATGTCCACATGGCAGGTAGGCGTTGTCAGCTCATCCTATTTTACCGGCAACCTTGTCGGTACATTGCTGACa < 6:259780/147‑1 (MQ=255) tCTGGCCTGCTTTTGTTGACTCTGGCGATTGCGGTGTTAAATACACTCGTGCCGCTTTGGCTCGCCCAGGAACACATGTCCACATGGCAGGTAGGCGTTGTCAGCTCATCCTATTTTACCGGCAACCTTGTCGGTACATTGCTGACAgg > 3:262548/1‑149 (MQ=255) tCTGGCCTGCTTTTGTTGACTCTGGCGATTGCGGTGTTAAATACACTCGTGCCGCTTTGGCTCGCCCAGGAACACATGTCCACATGGCAGGTAGGCGTTGTCAGCTCATCCTATTTTACCGGCAACCTTGTCGGTACATTGCTGACAg < 6:185090/148‑1 (MQ=255) cTGGCCTGCTTTTGTTGACTCTGGCGATTGCGGTGTTAAATACACTCGTGCCGCTTTGGCTCGCCCAGGAACACATGTCCACATGGCAGGTAGGCGTTGTCAGCTCATCCTATTTTACCGGCAACCTTGTCGGTACATTGCTGACAggg < 3:302280/149‑1 (MQ=255) gCCTGCTTTTGTTGACTCTGGCGATTGCGGTGTTAAATACACTCGTGCCGCTTTGGCTCGCCCAGGAACACATGTCCACATGGCAGGTAGGCGTTGTCAGCTCATCCTATTTTACCGGCAACCTTGTCGGTACATTGCTGACAGGGt < 1:151419/147‑1 (MQ=255) gCCTGCTTTTGTTGACTCTGGCGATTGCGGTGTTAAATACACTCGTGCCGCTTTGGCTCGCCCAGGAACACATGTCCACATGGCAGGTAGGCGTTGTCAGCTCATCCTATTTTACCGGCAACCTTGTCGGTACATTGCTGACAGGGTAt < 3:387719/149‑1 (MQ=255) cTGCTTTTGTTGACTCTGGCGATTGCGGTGTTAAATACACTCGTGCCGCTTTGGCTCGCCCAGGAACACATGTCCACATGGCAGGTAGGCGTTGTCAGCTCATCCTATTTTACCGGCAAcc > 4:130547/1‑121 (MQ=255) cTGCTTTTGTTGACTCTGGCGATTGCGGTGTTAAATACACTCGTGCCGCTTTGGCTCGCCCAGGAACACATGTCCACATGGCAGGTAGGCGTTGTCAGCTCATCCTATTTTACCGGCAAcc < 3:130547/121‑1 (MQ=255) cTGCTTTTGTTGACTCTGGCGATTGCGGTGTTAAATACACTCGTGCCGCTTTGGCTCGCCCAGGAACACATGTCCACATGGCAGGTAGGCGTTGTCAGCTCATCCTATTTTACCGACaaggttgc < 5:355945/125‑7 (MQ=255) cTGCTTTTGTTGACTCTGGCGATTGCGGTGTTAAATACACTCGTGCCGCTTTGGCTCGCCCAGGAACACATGTCCACATGGCAGGTAGGCGTTGTCAGCTCATCCTATTTTACCGACaaggttgc > 6:355945/1‑119 (MQ=255) cTTTTGTTGACTCTGGCGATTGCGGTGTTAAATACACTCGTGCCGCTTTGGCTCGCCCAGGAACACATGTCCACATGGCAGGTAGGCGTTGTCAGCTCATCCTATTTTACCGGCAACCTTGTCGGTACATTGCTGACAGGGTATGTCAt > 5:96578/1‑149 (MQ=255) ttgACTCTGGCGATTGCGGTGTTAAATACACTCGTGCCGCTTTGGCTCGCCCAGGAACACATGTCCACATGGCAGGTAGGCGTTGTCAGCTCATCCTATTTTACCGGCAACCTTGTCGGTACATTGCTGACAGGGTATGTCATTAAgc < 7:488431/148‑1 (MQ=255) tctGGCGATTGCGGTGTTAAATACACTCGTGCCGCTTTGGCTCGCCCAGGAACACATGTCCACATGGCAGGTAGGCGTTGTCAGCTCATCCTATTTTACCGGCAACCTTGTCGGTACATTGCTGACAGGGTATGt > 4:268086/1‑135 (MQ=255) tctGGCGATTGCGGTGTTAAATACACTCGTGCCGCTTTGGCTCGCCCAGGAACACATGTCCACATGGCAGGTAGGCGTTGTCAGCTCATCCTATTTTACCGGCAACCTTGTCGGTACATTGCTGACAGGGTATGt < 3:268086/135‑1 (MQ=255) tctGGCGATTGCGGTGTTAAATACACTCGTGCCGCTTTGGCTCGCCCAGGAACACATGTCCACATGGCAGGTAGGCGTTGTCAGCTCATCCTATTTTACCGGCAACCTTGTCGGTACATTGCTGACAGGGTATGTCATTAAGCGCATTg > 1:135547/1‑149 (MQ=255) gCGATTGCGGTGTTAAATACACTCGTGCCGCTTTGGCTCGCCCAGGAACACATGTCCACATGGCAGGTAGGCGTTGTCAGCTCATCCTATTTTACCGGCAACCTTGTCGGTACATTGCTGACAGTGTATGTCATTAAGCGCATTGGCtt > 1:150542/1‑149 (MQ=255) gCGATTGCGGTGTTAAATACACTCGTGCCGCTTTGGCTCGCCCAGGAACACATGTCCACATGGCAGGTAGGCGTTGTCAGCTCATCCTATTTTACCGGCAACCTTGTCGGTACATTGCTGACAGGGTATGTCATTAAGCGCATTgg < 7:139105/146‑1 (MQ=255) aaaTACACTCGTGCCGCTTTGGCTCGCCCAGGAACACATGTCCACATGGCAGGTAGGCGTTGTCAGCTCATCCTATTTTACCGGCAACCTTGTCGGTACATTGCTGACAGGGTATGTCATTAAGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCtat > 4:173475/1‑148 (MQ=255) aaTACACTCGTGCCGCTTTGGCTCGCCCAGGAACACATGTCCACATGGCAGGTAGGCGTTGTCAGCTCATCCTATTTTACCGGCAACCTTGTCGGTACATTGCTGACAGGGTATGTCATTAAGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCtatta > 1:259350/1‑149 (MQ=255) aaTACACTCGTGCCGCTTTGGCTCGCCCAGGAACACATGTCCACATGGCAGGTAGGCGTTGTCAGCTCATCCTATTTTACCGGCAACCTTGTCGGTACATTGCTGACAGGGTATGTCATTAAGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCtatt < 6:96578/148‑1 (MQ=255) aaTACACTCGTGCCGCTTTGGCTCGCCCAGGAACACATGTCCACATGGCAGGTAGGCGTTGTCAGCTCATCCTATTTTACCGGCAACCTTGTCGGTACATTGCTGACAGGGTATGTCATTAAGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCtatt < 2:297656/148‑1 (MQ=255) cacTCGTGCCGCTTTGGCTCGCCCAGGAACACATGTCCACATGGCAGGTAGGCGTTGTCAGCTCATCCTATTTTACCGGCAACCTTGTCGGTACATTGCTGACAGGGTATGTCATTAAGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTg < 4:262548/149‑1 (MQ=255) acTCGTGCCGCTTTGGCTCGCCCAGGAACACATGTCCACATGGCAGGTAGGCGTTGTCAGCTCATCCTATTTTACCGGCAACCTTGTCGGTACATTGCTGACAGGGTATGTCATTAAGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTgg > 1:64936/1‑149 (MQ=255) acTCGTGCCGCTTTGGCTCGCCCAGGAACACATGTCCACATGGCAGGTAGGCGTTGTCAGCTCATCCTATTTTACCGGCAACCTTGTCGGTACATTGCTGACAGGGTATGTCATTAAGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTgg > 2:479671/1‑149 (MQ=255) cTCGTGCCGCTTTGGCTCGCCCAGGAACACATGTCCACATGGCAGGTAGGCGTTGTAAGCTCATCCTATTTTACCGGCAACCTTGTCGGTACATTGCTGACAGGGTATGTCATTAAGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGc > 1:208265/1‑149 (MQ=255) tCGTGCCGCTTTGGCTCGCCCAGGAACACATGTCCACATGGCAGGTAGGCGTTGTCAGCTCATCCTATTTTACCGGCAACCTTGTCGGTACATTGCTGACAGGGTATGTCATTAAGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGcc > 5:447689/1‑149 (MQ=255) gTGCCGCTTTGGCTCGCCCAGGAACACATGTCCACATGGCAGGTAGGCGTTGTCAGCTCATCCTATTTTACCGGCAACCTTGTCGGTACATTGCTGACAGGGTATGTCATTAAGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGcctc > 8:351559/1‑149 (MQ=255) gCCGCTTTGGCTCGCCCAGGAACACATGTCCACATGGCAGGTAGGCGTTGTCAGCTCATCCTATTTTACCGGCAACCTTGTCGGTACATTGCTGACAGGGTATGTCATTAAGCGCATTGCCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGcctcct > 1:495378/1‑149 (MQ=255) gCTTTGGCTCGCCCGGGAACACATGTCCACATGGCAGGTAGGCGTTGTCAGCTCATCCTATTTTACCGGCAACCTTGTCGGTACATTGCTGACAGGGTATGTCATTAAGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGCCTCCTTCa > 2:488520/1‑149 (MQ=255) cTTTGGCTCGCCCAGGAACACATGTCCACATGGCAGGTAGGCGTTGTCAGCTCATCCTATTTTACCGGCAACCTTGTCGGTACATTGCTGACAGGGTATGTCATTAAGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGCCTCCTTCAt > 3:67773/1‑149 (MQ=255) ggCTCGCCCAGGAACACATGTCCACATGGCAGGTAGGCGTTGTCAGCTCATCCTATTTTACCGGCAACCTTGTCGGTACATTGCTGACAGGGTATGTCATTAAGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGCCTCCTTCAtttt < 2:259350/148‑1 (MQ=255) ggCTCGCCCAGGAACACATGTCCACATGGCAGGTAGGCGTTGTCAGCTCATCCTATTTTACCGGCAACCTTGTCGGTACATTGCTGACAGGGTATGTCATTAAGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGCCTCCTTCAtttt < 2:135547/148‑1 (MQ=255) cccAGGAACACATGTCCACATGGCAGGTAGGCGTTGTCAGCTCATCCTATTTTACCGGCAACCTTGTCGGTACATTGCTGACAGGGTATGTCATTAAGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGCCTCCTTCATTTTTGCCgct > 2:33408/1‑149 (MQ=255) cAGGAACACATGTCCACATGGCAGGTAGGCGTTGTCAGCTCATCCTATTTTACCGGCAACCTTGTCGGTACATTGCTGACAGGGTATGTCATTAAGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGCCTCCTTCATTTTTGCCgctgg > 4:159217/1‑149 (MQ=255) cAGGAACACATGTCCACATGGCAGGTAGGCGTTGTCAGCTCATCCTATTTTACCGGCAACCTTGTCGGTACATTGCTGACAGGGTATGTCATTAAGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGCCTCCTTCATTTTTGCCgctgg < 2:150542/149‑1 (MQ=255) cAGGAACACATGTCCACATGGCAGGTAGGCGTTGTCAGCTCATCCTATTTTACCGGCAACCTTGTCGGTACATTGCTGACAGGGTATGTCATTAAGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGCCTCCTTCATTTTTGCCgctgg < 7:39471/149‑1 (MQ=255) aGGAACACATGTCCACATGGCAGGTAGGCGTTGTCAGCTCATCCTATTTTACCGGCAACCTTGTCGGTACATTGCTGACAGGGTATGTCATTAAGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGCATCCTTGATTTTTGCCgctggc > 1:361852/1‑149 (MQ=255) ggAACACATGTCCACATGGCAGGTAGGCGTTGTCAGCTCATCCTATTTTACCGGCAACCTTGTCGGTACATTGCTGACAGGGTATGTCATTAAGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGCCTCCTTCATTTTTGCCgctggct < 3:159217/149‑1 (MQ=255) cacaTGTCCACATGGCAGGTAGGCGTTGTCAGCTCATCCTATTTTACCGGCAACCTTGTCGGTACATTGCTGACAGGGTATGGCATTAAGCGCAGTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGCCTCCTTCATTTTTGCCGCTGGCTGTGc < 7:351559/149‑1 (MQ=255) tCCACATGGCAGGTAGGCGTTGTCAGCTCATCCTATTTTACCGGCAACCTTGTCGGTACATTGCTGACAGGGTATGTCATTAAGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGCCTCCTTCATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCt > 4:221560/1‑149 (MQ=255) cacaTGGCAGGTAGGCGTTGTCAGCTCATCCTATTTTACCGGCAACCTTGTCGGTACATTGCTGACAGGGTATGTCATTAAGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGCCTCCTTCATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTg > 7:159806/1‑149 (MQ=255) cacaTGGCAGGTAGGCGTTGTCAGCTCATCCTATTTTACCGGCAACCTTGTCGGTACATTGCTGACAGGGTATGTCATTAAGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGCCTCCTTCATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTg < 1:488520/149‑1 (MQ=255) cacaTGGCAGGTAGGCGTTGTCAGCTCATCCTATTTTACCGGCAACCTTGTCGGTACATTGCTGACAGGGTATGTCATTAAGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGCCTCCTTCATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTg < 1:323960/149‑1 (MQ=255) acaTGGCAGGTAGGCGTTGTCAGCTCATCCTATTTTACCGGCAACCTTGTCGGTACATTGCTGACAGGGTATGTCATTAAGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGCCTCCTTCATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTgg > 6:96351/1‑149 (MQ=255) tGGCAGGTAGGCGTTGTCAGCTCATCCTATTTTACCGGCAACCTTGTCGGTACATTGCTGACAGGGTATGTCATTAAGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGCCTCCTTCATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCt < 1:479671/149‑1 (MQ=255) gCAGGTAGGCGTTGTCAGCTCATCCTATTTTACCGGCAACCTTGTCGGTACATTGCTGACAGGGTATGTCATTAAGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGCCTCCTTCATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCtga < 8:159806/149‑1 (MQ=255) gTAGGCGTTGTCAGCTCATCCTATTTTACCGGCAACCTTGTCGGTACATTGCTGACAGGGTATGTCATTAAGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGCCTCCTTCATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTgatgat > 4:323279/1‑149 (MQ=255) tAGGCGTTGTCAGCTCATCCTATTTTACCGGCAACCTTGTCGGTACATTGCTGACAGGGTATGTCATTAAGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGCCTCCTTCATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGAtt < 5:444059/149‑1 (MQ=255) ggCGTTGTCAGCTCATCCTATTTTACCGGCAACCTTGTCGGTACATTGCTGACAGGGTATGTCATTAAGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGCCTCCTTCATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTg < 5:96351/148‑1 (MQ=255) ggCGTTGTCAGCTCATCCTATTTTACCGGCAACCTTGTCGGTACATTGCTGACAGGGTATGTCATTAAGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGCCTCCTTCATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGACTTGGCCTGATGATTg > 5:147428/1‑148 (MQ=255) gCGTTGTCAGCTCATCCTATTTTACCGGCAACCTTGTCGGTACATTGCTGCCAGGGTATGTCATTAAGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGCCTCCTTCATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGa > 3:25242/1‑149 (MQ=255) gTTGTCAGCTCATCCTATTTTACCGGCAACCTTGTCGGTACATTGCTGACAGGGTATGTCATTAAGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGCCTCCTTCATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGAtt > 1:263600/1‑149 (MQ=255) aTCCTATTTTACCGGCAACCTTGTCGGTACATTGCTGACAGGGTATGTCATTAAGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGCCTCCTTCATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGt > 4:128092/1‑149 (MQ=255) tCCTATTTTACCGGCAACCTTGTCGGTACATTGCTGACAGGGTATGTCATTAAGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGCCTCCTTCATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGtt > 6:267490/1‑149 (MQ=255) tATTTTACCGGCAACCTTGTCGGTACATTGCTGACAGGGTATGTCATTAAGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGCCTCCTTCAGTTTTGCCGCTGTCTGTGCCGGCCTTGGcc > 3:370012/1‑121 (MQ=255) tATTTTACCGGCAACCTCGTCGGTACATTGCTGACAGGGTATGTCATTAAGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGCCTCCTTCATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGttggc > 1:286815/1‑149 (MQ=255) tATTTTAACTGCAACCTTGTAGGTACATTTCTGACAGGGTATGTCATTAAGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGCCTCCTTCATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGcc < 4:370012/121‑1 (MQ=255) tACCGGCAACCTTGTCGGTACATTGCTGACAGGGTATGTCATTAAGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGCCTCCTTCATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGttggcttggc > 7:163496/1‑149 (MQ=255) aCCGGCAACCTTGTCGGTACATTGCTGACAGGGTATGTCATTAAGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGCCTCCTTCATTTTTGCAGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGTTGGCTTGGCg > 8:157629/1‑149 (MQ=255) cGGCAACCTTGTCGGTACATTGCTGACAGGGTATGTCATTAAGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGCCTCCTTCATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGTTGGCTTGGCGtt < 3:284551/149‑1 (MQ=255) ggCAACCTTGTCGGTACATTGCTGACAGGGTATGTCATTAAGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGCCTCCTTCATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGTTGGCTTGGCGttt > 7:373621/1‑149 (MQ=255) | CCCAGCCTGTCATGCTTTTGCTGTCTGGCCTGCTTTTGTTGACTCTGGCGATTGCGGTGTTAAATACACTCGTGCCGCTTTGGCTCGCCCAGGAACACATGTCCACATGGCAGGTAGGCGTTGTCAGCTCATCCTATTTTACCGGCAACCTTGTCGGTACATTGCTGACAGGGTATGTCATTAAGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGCCTCCTTCATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGTTGGCTTGGCGTTT > NC_000913/945884‑946175 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |