| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,323,783 | Δ1 bp | 5.3% | coding (337/663 nt) | atoD → | acetyl‑CoA:acetoacetyl‑CoA transferase, alpha subunit |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,323,783 | 0 | G | . | 5.3% | 251.9 / 6.9 | 75 | coding (337/663 nt) | atoD | acetyl‑CoA:acetoacetyl‑CoA transferase, alpha subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (35/35); new base . (2/2); total (37/38) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.82e-01 | |||||||||||
TCATCGTCAATGGTCGAGTCCGCAAAGTGATTGCTTCACATATCGGCACCAACCCGGAAACAGGTCGGCGCATGATATCTGGTGAGATGGACGTCGTTCTGGTGCCGCAAGGTACGCTAATCGAGCAAATTCGCTGTGGTGGAGCTGGACTTGGTGGTTTTCTCACCCCAACGGGTGTCGGCACCGTCGTAGAGGAAGGCAAACAGACACTGACACTCGACGGTAAAACCTGGCTGCTCGAACGCCCACTGCGCGCCGACCTGGCGCTAATTCGCGCTCATCGTTGCGACACAC > NC_000913/2323637‑2323930 | tCATCGTCAATGGTCGAGTCCGCAAAGTGATTGCTTCACATATCGGCACCAACCCGGAAACAGGTCGGCGCATGATATCTGGTGAGATGGACGTCGTTCTGGTGCCGCAAGGTACGCTAATCGAGCAAATTCGCTGTGGTGGAGCTGGa > 7:77906/1‑149 (MQ=255) cATCGTCAATGGTCGAGTCCGCAAAGTGATTGCTTCACATATCGGCACCAACCCGGAAACAGGTCGGCGCATGATATCTGGTGAGATGGACGTCGTTCTGGTGCCGCAAGGTACGCTAATCGAGCAAATTCGCTGTGGTGGAGCTGGAc > 2:266801/1‑149 (MQ=255) tGGTCGAGTCCGCAAAGTGATTGCTTCACATATCGGCACCAACCCGGAAACAGGTCGGCGCATGATATCTGGTGAGATGGACGTCGTTCTGGTGCCGCAAGGTACGCTAATCGAGCAAATTCGCTGTGGTGGAGCTGGACTTGGTGGtt < 1:180356/149‑1 (MQ=255) tCGAGTCCGCAAAGTGATTTCTTCACATATCGGCACCAACCCGGAAACAGGTCGGCGCATGATATCTGGTGAGATGGACGTCGTTCTGGTGCCGCAAGGTACGCTAATCGAGCAAATTCGCTGTGGTGGAGCTGGACTTGGTGGTTTtc < 5:269380/149‑1 (MQ=255) tCGAGTCCGC‑‑AGTGATTGCTTCACATATCGGCACCAACCAGGAAACAGGTCGGCGCATGATATCTGGTGAGATGGACGTCGTTCTGGTGCCGCAAGGTACGCTAATCGAGCAAATTCGCTGTGGTGGAGCTGGACTTGGTGGTTTtct > 7:373446/1‑148 (MQ=255) gTCCGCAAAGTGATTGCTTCACATATCGGCACCAACCCGGAAACAGGTCGGCGCATGATATCTGGTGAGATGGACGTCGTTCTGGTGCCGCAAGGTACACTAATCGAGCAAATTCGCTGTGGTGGAGCTGGACTTGGTGGTTTtct > 8:104587/1‑146 (MQ=255) gTCCGCAAAGTGATTGCTTCACATATCGGCACCAACCCGGAAACAGGTCGGCGCATGATATCTGGTGAGATGGACGTCGTTCTGGTGCCGCAAGGTACACTAATCGAGCAAATTCGCTGTGGTGGAGCTGGACTTGGTGGTTTtct < 7:104587/146‑1 (MQ=255) cGCAAAGTGATTCCTTCACATATCGGCACCAACCCGGAAACAGCTCGGCGCATGATATCTCGAGACAAGGACGTCGATCTGGTGCCGCAAGCTACGCTAATCGAGCAAATTCGCTGAGGTGGAGCTGGACTTGGTGGTTTTCTCAccc > 3:157930/1‑148 (MQ=255) 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gCACCAACCCGGAAACAGGTCGGCGCATGATATCTGGTGAGATGGACGTCGTTCTGGTGCCGCAAGGTACGCTAATCGAGCAAATTCGCTGTGGTGGAGCTGGACTTGGTGGTTTTCTCACCCCAACGGGTGTCGGCACCGTCGTagag > 7:243096/1‑149 (MQ=255) gCACCAACAACGAAACAGGTCGGCGCATGATATCAGGTGAGATAGACGTCGTTCTGGTGCCGCAAGGTACCCTAATCGAGAAAATTCGCTGTGGTGGAGCAGGACTTGGTCGTTTTCTCACCCCAACGGGTGGCGGCACCGTCGTa > 6:139910/1‑146 (MQ=255) ccAACCCGGAAACAGGTCGGCGCATGATATCTGGTGAGATGGACGTCGTTCTGGTGCCGCAAGGTACGCTAATCGAGCAAATTCGCTGTGGTGGAGCTGGACTTGGTGGTTTTCTCACCCCAACGGGTGTCGGCACCGTCGTAGAGGaa < 1:266801/149‑1 (MQ=255) ccAACCCGGAAACAGGTCGGCGCATGATATCTGGTGAGATGGACGTCGTTCTGGTGCCGCAAGGTACGCTAATCGAGCAAATTCGCTGTGGTGGAGCTGGACTTGGTGGTTTTCTCACCCCAACGGGTGTCGGCACCGGCGTAGAGGaa < 3:287141/149‑1 (MQ=255) cAACCCGGACACTGGTCGGCCAATCATCCCGGCGGCGATGGACGCCGGTCTGGGCCCGCAAGGTACGCTAATCGACCAAATTCGCCGGGGTGCAGCTGGACGAGGTGGATTGCGCACCCCAACCGGTGTCGGCACCGTCGTAGAGCaac < 4:183488/149‑2 (MQ=255) aCCCGGAAACAGGTCGGCGCATGATATCTGGTGAGATGGACGTCGTTCTGGTGCCGCAAGGTACGCTAATCGAGCAAATTCGCTGTGGTGGAGCTGGACTTGGTGGTTTTCTCACCCCAACGGGTGTCGGCACCGTCGTAGAGGAAGGc < 8:373446/149‑1 (MQ=255) ccGGAAACAGGTCGGCGCATGATATCTGGTGAGATGGACGTCGTTCTGGTGCCGCAAGGTACGCTAATCGAGCAAATTCGCTGTGGTGGAGCTGGACTTGGTGGTTTTCTCACCCCAACGGGTGTCGGCACCGTCGTAGAGGAAGGCa > 2:19276/1‑148 (MQ=255) gataCAGGTCGGCGCATGATATCTGGTGAGATGGACGTCGTTCTGGTGCCGCAAGGTAGGCTAATCGAGCAAATTCGCTGTGGTGGAGCTGGACTTGGTGGTTTTCTCACCCCAACGGGTGTCGGCACCGTCGTAGAGTAAGGCATACa < 8:76395/146‑1 (MQ=255) aGGTCGGCGCATGATATCTGGTGAGATGGACGTCGTTCTGGTGCCGCAAGGTACGCTAATCGAGCAAATTCGCTGTGGTGGAGCTGGACTTGGTGGTTTTCTCACCCCAACGGGTGTCGGCACCGTCGTAGAGGCAGGCAAACAgccac > 5:306885/1‑149 (MQ=255) aGGTCGGCGCATGATATCTGGTGAGATGGACGTCGTTCTGGTGCCGCAAGGTACGCTAATCGAGCAAATTCGCTGTGGTGGAGCTGGACTTGGTGGTTTTCTCACCCCAACGGGTGTCGGCACCGTCGTAGAGGAAGGCAAACAgacac < 4:354489/149‑1 (MQ=255) tCGGCGCATGATATCTGGTGAGATGGACGTCGTTCTGGTGCCGCAAGGTACGCTAATCGAGCAAATTCGCTGTGGTGGAGCTGGACTTGGTGGTTTTCTCACCCCAACGGGTGTCGGCACCGTCGTAGAGGAAGGCAAACAgacactga < 8:45076/149‑1 (MQ=255) gcATGATATCTGGTGAGATGGACGTCGTTCTGGTGCCGCAAGGTACGCTAATCGAGCAAATTCGCTGTGGTGGAGCTGGACTTGGTGGTTTTCTCACCCCAACGGGTGTTGGCACCGTCGTAGAGGAAGGCAAACAGACACTGACACTc > 7:205544/1‑149 (MQ=255) aTGATACCTGGTGAGATGGACGTCGTTCTGGTGCCGCAAGGTACGCTAATCGAGCAAATTCGCTGTGGTGGAGCTGGACTTGGTGGTTTTCTCACCCCAACGGGTGTCGGCACCGTCGTAGAGGAAGGCAAACAGACACTGACACTCGa > 6:37777/1‑149 (MQ=255) atatCTGGTGAGATGGACGGCGTTCTGGTGCCGCAAGGTACGCTAAGCGAGCAAATTCGCGGTGGTGGAGCTCGACTGGGTGGTTTTCTCACCCCAACGGGTGTCGGCACCGTCGTAGAGGAAGGCAAACAGACACTGACACTCGACgg < 4:157930/149‑1 (MQ=255) tatCTGGTGAGATGGACGTCGTTCTGGTGCCGCAAGGTACGCTAATCGAGCAAATTCGCTGTGGTGGAGCTGGACTtggt < 8:143044/80‑1 (MQ=255) tatCTGGTGAGATGGACGTCGTTCTGGTGCCGCAAGGTACGCTAATCGAGCAAATTCGCTGTGGTGGAGCTGGACTtggt > 7:143044/1‑80 (MQ=255) ggTGAGATGGACGTCGTTCTGGTGCCGCAAGGTACGCTAATCGAGCAAATTCGCTGTGGTGGAGCTGGACTtg < 2:228591/73‑1 (MQ=255) ggTGAGATGGACGTCGTTCTGGTGCCGCAAGGTACGCTAATCGAGCAAATTCGCTGTGGTGGAGCTGGACTtg > 1:228591/1‑73 (MQ=255) gTGAGATGGACGTCGTTCTGGTGCCGCAAGGTACGCTAATCGAGCAAATTCGCTGTGGTGGAGCTGGACTTGGTGGTTTTCTCACCCCAACGGGTGTCGGCACCGTCGTAGAGGAAGGCAAACAGACACTGACACTCGACGGTAAAAc < 8:243096/148‑1 (MQ=255) gagaTGGACGTCGTTCTGGTGCCGCAAGGTACGCTAATCGAGCAAATTCGCTGTGGTGGAGCTGGACTTGGTGGTTTTCTCACCCCAACGGGTGTTGGCACCGTCGTAGAGGAAGGCAAACAGACACTGACACTCGACGGTAAAACCTg < 8:205544/149‑1 (MQ=255) aCGTCGTTCTGGTGCCGCAAGGTACGCTAATCGCGCAAATTCGCTGTGGTGGAGCTGGACTTGGTGGTTTTCTCACCCCAACGGGTGTCGGCACCGTCGGAGAGGAAGGCAAACAGACACTGACACTCGACGGTAAAACCTGGCTGCTc > 1:293353/1‑149 (MQ=255) aCGTCGTTCTGGTGCCGCAAGGTACGCTAATCGAGCAAATTCGCTGTGGTGGAGCTGGACTTGGTGGTTTTCTCACCCCAACGGGTGTCGGCACCGTCGTAGAGGAAGGCAAACAGACACTGACACTCGACGGTAAAACCTGGCTGCTc < 1:19276/149‑1 (MQ=255) gCAAGGTACGCTAATCGAGCAAATTCGCTGTGGTGGAGCTGGACTTGGTGGTTTTCTCACCCCAACGGGTGTCGGCACCGTCGTAGAGGAAGGCAAACAGACACTGACACTCGACGGTAAAACCTGGCTGCTCGAACGCCCa > 1:23638/1‑142 (MQ=255) gCAAGGTACGCTAATCGAGCAAATTCGCTGTGGTGGAGCTGGACTTGGTGGTTTTCTCACCCCAACGGGTGTCGGCACCGTCGTAGAGGAAGGCAAACAGACACTGACACTCGACGGTAAAACCTGGCTGCTCGAACGCCCa < 2:23638/142‑1 (MQ=255) gCAAGGTACGCTAATCGAGCAAATTCGCTGTGGTGGAGCTGGACTTGGTGGTTTTCTCACCCCAACGGGTGTCGGCACCGTCGTAGAGGAAGGCAAACAGACACTGACACTCGACGGTAAAACCTGGCTGCTCGAACGCCCACTgcgcg > 1:237924/1‑149 (MQ=255) ggTACGCTAATCGAGCAAATTCGCTGTGGTGGAGCTGGACTTGGTGGTTTTCTCACCCCAACGGGTGTCGGCACCGTCGTAGAGGAAGGCAAACAGACACTGACACTCGACGGTAAAACCTGGCTGCTCGAACGCCCACTGCGCGCCGa > 7:344097/1‑149 (MQ=255) aCGCTAATCGAGCAAATTCGCTGTGGTGGAGCTGGACTTGGTGGTTTTCTCACCCCAACGGGTGTCGGCACCGTCGTAGAGGAAGGCAAACAGACACTGACACTCGACGGTAAAACCTGGCTGCTCGAACGCCCACTGCGCGCCGACCt > 8:110023/1‑149 (MQ=255) cGCTAATCGATCAAATTCGCTGTGGTGGAGCTGGACTTGGTGGTTTTCTCACCCCAACGGGTGTCGGCACCGTCGTAGAGGAAGGCAAACAGACACTGACACTCGACGGTAAAACCTGGCTGCTCGAACGCCCACTGCGCGCCGACCt < 5:37777/148‑1 (MQ=255) tAATCGAGCAAATTCGCTGTGGTGGAGCTGGACTTGGTGGTTTTCTCACCCCAACGGGTGTCGGCACCGTCGTAGAGGAAGGCAAGCAGACACTGACACTCGACGGTAAAACCTGGCTGCTCGAAc > 4:180831/1‑126 (MQ=255) tAATCGAGCAAATTCGCTGTGGTGGAGCTGGACTTGGTGGTTTTCTCACCCCAACGGGTGTCGGCACCGTCGTAGAGGAAGGCAAGCAGACACTGACACTCGACGGTAAAACCTGGCTGCTCGAAc < 3:180831/126‑1 (MQ=255) tAATCGAGCAAATTCGCTGTGGTGGAGCTGGACTTGGTGGTTTTCTCACCCCAACGGGTGTCGGCACCGTCGTAGAGGAAGGCAAACAGACACTGACACTCGCCGGTAAAACCTGGCTGCTCGAACGCCCACTGCGCGCCGACCTGgcg > 3:354043/1‑149 (MQ=255) aaTCGAGCAAATTCGCTGTGGTGGAGCTGGACTTGGTGGTTTTCTCACCCCAACGGGTGTCGGCACCGTCGTAGAGGAAGGCAAACAGACACTGACACTCGACGGTTAAACCTGGCTGCTCGAACGCCCACTGCGCGCCGACCTGgcgc > 4:91934/1‑149 (MQ=255) tCGAGCAAATTCGCTGTGGTGGAGCTGGACTTGGTGGTTTTCTCACCCCAACGGGTGTCGGCACCGTCGTAGAGGAAGGCAAACAGACACTGACACTCGACGGTAAAACCTGGCTGCTCGAACGCCCACTGCGCGCCGACCTGGCGCt > 5:125795/1‑148 (MQ=255) gAGCAAATTCGCTGTGGTGGAGCTGGACTTGGTGGTTTTCTCACCCCAACGGGTGTCGGCACCGTCGTAGAGGAAGGCAAACAGACACTGACACTCGACGGTAAAACCTg < 2:272637/110‑1 (MQ=255) gAGCAAATTCGCTGTGGTGGAGCTGGACTTGGTGGTTTTCTCACCCCAACGGGTGTCGGCACCGTCGTAGAGGAAGGCAAACAGACACTGACACTCGACGGTAAAACCTg > 1:272637/1‑110 (MQ=255) aGCAAATTCGCTGTGGTGGAGCTGGACTTGGTGGTATTCTCACACCAACGGGTGTCGGCACCGTCGTAGAGGAAGGCAAACAGACACTGACACTCGACGGTAAAACCAGGCTGCTCGAACGCCCACTGCGCCCCGACCTGGCGCTAAtt > 3:267994/1‑149 (MQ=255) aGCAAATTCGCTGTGGTGGAGCTGGACTTGGTGGGTTTCTCACCCCAACGGGGGTCGGCACCGTCGTAGAGGAAGGCAAACAGTCACTGACACTCGACGGTAAAACCTGGCTGCTCGAACGCCCACTGCGCGCCGACCTGGCGCTAAtt < 4:47026/149‑1 (MQ=255) gCAAATTCGCTGTGGTGGAGCTGGACTTGGTGGTTTTCTCACCCCAACGGGTGTCGGCACCGTCGTAGAGGAAGGCAAACAGACACTGACACTCGTCGGTAAAACCTGGCTGCTCGAACGCCCACTGCGCGCCGACCTGGCGCTAATTc < 4:354043/149‑1 (MQ=255) aaaTTCGCTGTGGTGGAGCTGGACTTGGTGGTTTTCTCACCCCAACGGGTGTCGGCACCGTCGTAGAGGAAGGCAAACAGACACTGACACTCGACGGTAAAACCTGGCTGCTCGAACGCCCACTGCGCGCCGACCTGGCGCTAATTcgc < 6:214520/149‑1 (MQ=255) aaaTTCGCTGTGGTGGAGCTGGACTTGGTGGTTTTCTCACCCCAACGGGTGTCGGCACCGTCGTAGAGGAAGGCAAACAGACACTGACACTCGACGGTAAAACCTGGCTGCTCGAACGCCCACTGCGCGCCGACCTGGCGCAAATTcgc > 8:35294/1‑149 (MQ=255) gCTGTGGTGGAGCTGGACTTGGTGGTTTTCTCACCCCAACGGGTGTCGGCACCGTCGTAGAGGAAGGCAAACAGACACTGACACTCGACGGTAAAACCTGGCTGCTCGAACGCCCACTGCGCGCCGACCTGGCGCTAATTCGCGCTCAt < 8:344097/149‑1 (MQ=255) tggtggAGCTGGACTTGGTGGTTTTCTCACCCCAACGGGTGTCGGCACCGTCGTAGAGGAAGGCAAACAGACACTGACACTCGACGGTAAAACCTGGCTGCTCGAACGCCCACTGCGCGCCGACCTGGCGCTAATTCGCGCTCATCGtt < 2:237924/149‑1 (MQ=255) tggaggAGCTGGACTTGGTGGTTTTCTCACCCCAACGGGGGTCGGCACCTTCGTAGAGGAAGGCAAACAGACACTGACACTCGACGGTAAAACCTGGCTGCTCGAACGCCCACTGCGCGCCGACCTGGCGCTAATTCGCGCTCATCGtt < 6:306885/149‑1 (MQ=255) gtggAGCTGGACTTGGTGGGTTTCTCACCCCAACGGGTGTCGGCACCGTCGTAGAGGAAGGCAAACAGACACTGACACTCGACGGTAAAACCTGGCTGCTCGTACGCCCACTGCGCGCCGACCTGGCGCTAATTCGCGCTCATCGTTGc < 4:267994/149‑1 (MQ=255) ggAGCT‑GACTTGGTGTTGTTCTCACCCCAACGGGTGTCGGCACCGTCGTAGAGGAAGGCAAACAGACACTGACACTCGACGGTAAAACCTGGCTGCTCGAACGCCCACTGCGCGCCGACCTGGCGCTAATTCGCGCTCATCGTTga < 5:110147/146‑2 (MQ=255) ggAGCT‑GACTTGGTGGTTTTCTCACCCCAACGGGTGTCGGCACCGTCGTAGAGGAAGGCAAACAGCCACTGACACTCGACGGTAAAACCTGGCTGCTCGAACGCCCCATGCGAGCCTCCCTGGCGCTAATTCGCGCTCATCGTTGc > 6:110147/1‑146 (MQ=255) ggAGCT‑GACTTGGTGGTTTTCTCACCCCAACGGGTGTCGGCACCGTCGTAGAGGAAGGCAAACAGACACTGACACTCGACGGTAAAACCTGGCTGCTCGAACGCCCACTGCGCGCCGACCTGGCGCTAATTCGCGCTCATCGTTGc > 6:110145/1‑146 (MQ=255) ggAGCT‑GACTTGGTGGTTTTCTCACCCCAACGGGTGTCGGCACCGTCGTAGAGGAAGGCAAACAGACACTGACACTCGACGGTAAAACCTGGCTGCTCGAACGCCCACTGCGCGCCGACCTGGCGCTAATTCGCGCTCATCGTTGc < 5:110145/146‑1 (MQ=255) gAGCTGGACTTGGTGGTTTTCTCACCCCAACGGGTGTCGGCACCGTCGTAGAGGAAGGCAAAc < 6:317350/63‑1 (MQ=255) gAGCTGGACTTGGTGGTTTTCTCACCCCAACGGGTGTCGGCACCGTCGTAGAGGAAGGCAAAc > 5:317350/1‑63 (MQ=255) gCTGGACTTGGTGGTTTTCTCACCCCAACGGGTGTCGGCACCGTCGTAGAGGAAGGCAAACAGACACTGACACTCGACGGTAAAACCTGGCTGCTCGAACGCCCACTGCGCGCCGACCTGGCGCTAATTCGCGCTCATCGTTGCGaca > 5:230407/1‑148 (MQ=255) cTGGACTTGGTGGTTTTCTCACCCCAACGGGTGTCGGCACCGTCGTAGAGGAAGGCAAACAGACACTGACACTCGACGGTAAAACCTGGCTGCTCGAAc > 6:229006/1‑99 (MQ=255) cTGGACTTGGTGGTTTTCTCACCCCAACGGGTGTCGGCACCGTCGTAGAGGAAGGCAAACAGACACTGACACTCGACGGTAAAACCTGGCTGCTCGAAc < 5:229006/99‑1 (MQ=255) tGGACTTGGTGGTTTTCTCACCCCAACGGGTGTCGTCACCGTCGTAGAGGAAGGCATTCAGACACTGAGTCTCGACGGTAAAACCTGGCTGCTCGAACTCCCACTGCGCGCCGACCTGGCGCTAATTCTCGCTCATCGTTGCGacacac < 7:35294/149‑1 (MQ=255) tGGACTTGGTGGTTTTCTCACCCCAACGGGTGTCGGCACCGTCGTAGAGGAAGGCAAACAGACACTGACACTCGACGGTAAAACCTGGCTGCTCGAACGCCCACTGCGCGCCGACCTGGCGCTAATTCGCGCTCATCGTTGc < 2:145429/142‑1 (MQ=255) tGGACTTGGTGGTTTTCTCACCCCAACGGGTGTCGGCACCGTCGTAGAGGAAGGCAAACAGACACTGACACTCGACGGTAAAACCTGGCTGCTCGAACGCCCACTGCGCGCCGACCTGGCGCTAATTCGCGCTCATCGTTGc > 1:145429/1‑142 (MQ=255) | TCATCGTCAATGGTCGAGTCCGCAAAGTGATTGCTTCACATATCGGCACCAACCCGGAAACAGGTCGGCGCATGATATCTGGTGAGATGGACGTCGTTCTGGTGCCGCAAGGTACGCTAATCGAGCAAATTCGCTGTGGTGGAGCTGGACTTGGTGGTTTTCTCACCCCAACGGGTGTCGGCACCGTCGTAGAGGAAGGCAAACAGACACTGACACTCGACGGTAAAACCTGGCTGCTCGAACGCCCACTGCGCGCCGACCTGGCGCTAATTCGCGCTCATCGTTGCGACACAC > NC_000913/2323637‑2323930 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |